Organização Gênica dos Seres Vivos

Genes e Genomas de Procariotos e Eucariotos

Prof. Henrique Santana Costa, M.Sc.

OS SERES VIVOS

OS SERES VIVOS

• Todo genoma (eucarioto ou procarioto) possui a função de servir como repositório replicativo da informação codificada pelo DNA que o constitui.

• Genomas procarióticos, contudo, são relativamente mais simples que genomas eucarióticos.

PROCARIOTO X EUCARIOTO
 Tamanho do genoma.  Estrutura molecular.  Distribuição de genes.

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Cromossomo único → dsDNA circular Replicon Exceções Lineares Streptomyces lividans Rhodococcus fasciens Espiroquetas (Borrelia) .

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Tamanho do Genoma ~9.6x106pb ~13x106pb Myxococcus xanthus .5x106pb Mycoplasma genitalium Saccharomyces cerevisiae ~0.

• Por ser capaz de se auto-duplicar.2 X 10³ pb. . • Sua estrutura compacta dedica-se quase que exclusivamente à codificação de proteínas (genes estruturais).PROCARIOTO ◙ Cromossomo de E. coli • Molécula de DNA fita dupla circular de 4. o cromossomo bacteriano é considerado um replicon.

bactérias e organelas celulares (mitocôndrias). • Fenômeno freqüente em vírus.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Superposição de genes • Organização gênica que permite que uma mesma seqüência codifique duas proteínas diferentes. .

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Códon de Iniciação → (Start Codon) Alternativo. .

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Alteração do Quadro de Leitura. .

interrupções em suas seqüências . • Eucariotos possuem nucleotídicas.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Colinearidade • Equivalência entre a seqüência nucleotídica do gene e a seqüência de aminoácidos da proteína.

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Colinearidade: Gene  Proteína 3n nucleotídeos → n aminoácidos .

GENES → EUCARIOTO X PROCARIOTO 5’ 3’ .

GENOMA → EUCARIOTO X PROCARIOTO .

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO  Ausência diplóide. genéticas  Seqüências codificantes em ambas as fitas. . sem Genoma E. • Unidades acessórias. coli • Colinearidade entre genes e produtos protéicos.  Quase todo genoma → codificação e regulação. de complemento  Praticamente seqüências redundantes.

• Seus produtos são regulados pela presença de substrato.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Organização dos genes em operons • Genes que codificam produtos com funções (componentes de uma mesma rota metabólica). • Mostram-se presentes apenas em procariotos. relacionadas • Responsáveis pelo controle da expressão gênica. .

 Regiões intercistrônicas → 1 a 30 pb (até 40 pb) .CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO  Unidades transcricionais policistrônicas (Operons).

• Replicação bidirecional → avançam em direções opostas ao longo do cromossomo (encontrando-se num sítio de terminação).CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Coorientação da transcrição e da replicação de genes • A fim de evitar colisões entre a RNA-polimerase e o aparato protéico da replicação. . as unidades transcricionais mais ativas estão orientadas em relação à origem de replicação.

. • Genes que codificam proteínas envolvidas numa mesma rota metabólica.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Posicionamento de genes evolutivamente relacionados em sítios opostos do mapa genético • Padrão de organização explicado (supostamente) por uma prévia duplicação do genoma.

.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Localização preferencial dos genes em sítios próximos à origem de replicação • Maior concentração de genes próxima ao ponto no qual a replicação do DNA inicia do que próxima ao término da mesma. • Aumento do nível de expressão gênica.

.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Elementos genéticos móveis • Todo genoma de procarioto está contido num único cromossomo. • Exceção → elementos genéticos móveis.

. Transposons. 3. 2. Bacteriófagos.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO 1. Plasmídeos.

) .CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Plasmídeos • Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicação constituídos por uma molécula de DNA fita dupla circular. autônoma • Sua seqüência nucleotídica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo da célula hospedeira (elemento estranho a bactéria). • Conferem vantagens adaptativas às bactérias que os possuem. → produção de toxinas → produção de pilinas → produção de adesinas ■ Conferem resistência a múltiplos antibióticos (tornam problemático o tratamento quimioterápico de determinadas infecções.

autônoma • Sua seqüência nucleotídica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo da célula hospedeira (elemento estranho a bactéria). → produção de toxinas → produção de pilinas → produção de adesinas ■ Conferem resistência a múltiplos antibióticos (tornam problemático o tratamento quimioterápico de determinadas infecções. • Conferem vantagens adaptativas às bactérias que os possuem.) .CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Plasmídeos • Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicação constituídos por uma molécula de DNA fita dupla circular.

. • • Virulentos → multiplicam-se dentro da célula hospedeira dando origem a outros que são liberados após a lise celular (ciclo lítico). ssDNA circular ou dsDNA linear (colifagos). ou entrar em ciclo lítico. Elementos extra-cromossomais que ganharam a capacidade de sintetizar um capsídeo protéico.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Bacteriófagos • Não possuem uma maquinaria própria (incapazes de se multiplicarem na ausência de um hospedeiro). Temperados → podem se integrar no genoma bacteriano (linhagem lisogênica). Podem apresentar genomas de RNA.

◙ Plasmídeos → replicons não letais (dentro de suas células hospedeiras). O genoma do fago pode eventualmente ser liberado (sendo capaz de iniciar um ciclo lítico). Ciclo lítico → O genoma do fago é expressado. # Lisógena → Bactéria que carrega uma cópia do genoma viral integrada ao seu cromossomo.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Bacteriófagos → replicons potencialmente letais. adsorção e injeção do ácido nucléico. Proteínas estruturais são sintetizadas e o genoma viral é encapsidado (produção de novas partículas virais). no genoma bacteriano. . •Etapas da infecção → colisão. Ciclo lisogênico → O genoma do fago se integra. por recombinação.

1. → envolvem processos de recombinação e replicação gerando 2 novas cópias do elemento genético transponível original. deleções. . inversões e fusões cromossômicas * Conferem significativa plasticidade genética nos genomas que as possuem. # outra que aparece num determinado sítio alvo.transponsases).CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Transposons → seqüências de DNA inseridas em novos sítios genômicos (catalisadas a partir de enzimas específicas . ativação de genes inativos 2. • Alteração da integridade de seus sítios-alvo. # uma que permanece no sítio parental.

informações não relacionadas a transposição .CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO ◙ Classificação Transposons simples (IS)→ carregam apenas a informação genética essencial para a transposição. Transposons complexos → carregam. # resistência a antibióticos # capacidade de movimentação entre bactérias . também.

CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Cromossomo único → dsDNA circular Replicon Exceções Lineares Streptomyces lividans Rhodococcus fasciens Espiroquetas (Borrelia) .

6x106pb ~13x106pb Myxococcus xanthus .5x106pb Mycoplasma genitalium Saccharomyces cerevisiae ~0.CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO Tamanho do Genoma ~9.

• 3% dos genes são de regulação. • 3% São seqüências não codantes • 97% São (inter-espaçadores gênicos). codantes gênicos).PROCARIOTO X EUCARIOTO • 97% dos genes são de regulação. seqüências não (inter-espaçadores → cópia única (0 – 30 pb) .

GENOMA → EUCARIOTO X PROCARIOTO .

PROCARIOTO X EUCARIOTO .

COMPARAÇÕES → EUCARIOTO Número de Genes 70000 60000 50000 50000 Número de Genes 45000 40000 30000 30000 19000 13600 10000 4288 517 0 Mycoplama E. coli Levedura Drosofila Ascaris Humano Arroz Milho 6340 20000 .

Genes não interrompidos X interrompidos COMPARAÇÕES → EUCARIOTO .

COMPARAÇÕES → EUCARIOTO Tamanho dos genes em kb .

PARADOXO DO VALOR DE “C” .

CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Existência de múltiplas cópias de algumas seqüências. Raramente apresenta unidades genéticas acessórias. Seqüências codificantes em apenas uma das fitas. Abundância de seqüências redundantes. Quase todo genoma: não codificação e regulação. Presença de complemento diplóide. .

CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Não há Colinearidade: Gene  Proteína 3n nucleotídeos  n aminoácidos .

Exceção Caenorhabditis elegans Nematódeo: 25% dos genes .CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO  Não há Operons.

DNA Moderadamente Repetitivo (30%). . 3. DNA Altamente Repetitivo (25%). DNA de (45%).CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO 1. cópia única 2.

 Genoma Linear.GENOMA NUCLEAR HUMANO Características  dsDNA.  23 cópias (46 Cromossomos). .

GENOMA DE ORGANELAS Características  dsDNA.  Várias cópias por organela. .  Genoma Circular.

seqüências nãotraduzidas etc.6kb 37 genes Dois genes de rRNA ~60% 22 genes de tRNA 13 genes codificadores de polipeptídeos ~40% Único ou baixo número de cópias Moderado a altamente repetitivo Pseudogenes Fragmentos de genes Íntrons.50. Repetido em tandem ou repetições agrupadas Repetições dispersas .GENOMA HUMANO Genoma Humano Genoma Nuclear 3300Mb 30.000 genes ~25% Genes e seqüências gene-relacionadas Únicas ou moderadamente repetitivas ~10% ~90% DNA codificador DNA nãocodificador ~75% DNA extragênico Genoma Mitocondrial 16.000 .

CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias Funcionalmente Similares  Relacionados mas não idênticos → Globina .

 Genes de snRNA → grande família dispersa.CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias gênicas codificadoras de RNA  Genes de rRNA → 5 agrupamentos de 50 repetições em tandem.  Genes de Trna → grande família dispersa (40 subfamílias). .

 Replicação tecido-específico.CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO Famílias Funcionalmente Idênticas → Histonas  Replicação dependente → restrito a fase S.  Replicação independente → nível basal em todo CC. H1 H1 .

circulares.CONCLUSÃO  Existem diferenças significativas entre genomas procariotos e eucariotos.  Eucariotos apresentam procariotos. operons e unidades genéticas acessórias.  Procariotos → genomas pequenos. sem operons e sem unidades genéticas acessórias. genomas mais complexos que os . muitos genes. lineares.  Eucariotos → genomas grandes. poucos genes.

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