Componente curricular: Biologia Molecular Prof Marlia Scopel Andrighetti

ESTRUTURA DOS CIDOS NUCLICOS E CROMOSSOMOS

ESTRUTURA DOS CIDOS NUCLICOS -

NUCLEOTDEOS

Tanto o DNA como o RNA so formados pelo encadeamento de grande nmero de molculas menores, os nucleotdeos, formados por trs tipos de substncias qumicas:
Base nitrogenada, composto por uma cadeia fechada de carbonos que contm nitrognio; Uma pentose; Um fosfato.

A unio da base nitrogenada com o acar chamada nucleosdeo.

NUCLEOTDEOS X NUCLEOSDEOS

Nucleosdeo

ESTRUTURA DOS CIDOS NUCLICOS -

NUCLEOTDEOS

Cinco tipos: Adenina, Guanina, Citosina, Timina e Uracila. Adenina e Guanina: Duplo anel de tomos de carbono (anis aromticos); chamadas de purinas ou bases pricas. Citosina, Timina e Uracila: Um anel de carbono; chamadas pirimidinas ou bases pirimdicas.
DNA: Adenina Timina; Citosina Guanina RNA: Adenina Uracila; Citosina - Guanina

BASES NITROGENADAS

PURINAS adenina guanina

PIRIMIDINAS citosina timina DNA uracila RNA

PENTOSES

DNA: possui uma desoxirribose.

cido desoxirribonuclico

RNA: possui uma ribose.

cido ribonuclico

A ligao de um nucleotdeo com outro entre o fosfato de uma unidade e a pentose da outra.

PENTOSES

LIGAO ENTRE A PENTOSE E A BASE NITROGENADA

Ligao N- glicosdica covalente; Hidroxila ligada ao carbono 1 da pentose.

LIGAO ENTRE NUCLEOTDEOS

Atravs de seus grupamentos fosfatos

Nucleosdeo

Nucleotdeo

Ligao Fosfodister

LIGAO ENTRE BASES NITROGENADAS

A ligao feita por pontes de hidrognio: Timina (T) liga-se Adenina (A) - duas pontes de hidrognio; Citosina (C) liga-se Guanina (G) - trs pontes de hidrognio.

LIGAO ENTRE BASES NITROGENADAS

Tais pontes de hidrognio so formadas em decorrncia da presena de grupos ceto (C=O) e amino (C-NH2) nas bases;

TeU
ceto

A
amino

G
grupo ceto
e amino

C
grupo ceto
e amino

LIGAO ENTRE BASES NITROGENADAS

Pirimidina < Purina Logo, AT e CG tem, aproximadamente, o mesmo tamanho; Isso proporciona uma dimenso proporcional ao longo da molcula de DNA.

LIGAO ENTRE DUAS FITAS DE DNA

DUPLA HLICE DO DNA

Duas fitas se enrolam em torno de um eixo imaginrio; Desoxirriboses ficam externas (expostas ao meio aquoso) e bases ficam internas (anis so hidrofbicos); Fitas em direes opostas: 5-3 e 3-5 = FITAS

ANTIPARALELAS;

As bases ficam pareadas entre as duas fitas, mantendo a estrutura da molcula.

DUPLA HLICE DO DNA

Devido ao pareamento das bases, as fitas de DNA so ditas COMPLEMENTARES; Isso assegura uma replicao mais precisa; Ligao glicosdica entre a pentose e a base no esto diretamente opostas na dupla-hlice; Tal fato gera duas cavidades: maior e menor; Na cavidade maior, as bases ficam expostas ao solvente, interagindo com molculas sem precisar romper a estrutura do DNA.

CAVIDADES MAIOR E MENOR DO DNA

FORAS QUE ESTABILIZAM A DUPLAHLICE

Ligaes covalentes unem os tomos;

Foras hidrofbicas foram as bases a se esconderem

dentro da dupla hlice;

Foras de Van der Walls entre os anis aromticos de bases adjacentes (ao lado);

Pontes de hidrognio entre as bases adjacentes.

REFLEXO

Qual a ligao mais difcil de ser quebrada? Adenina Timina ou Guanina Citosina? Se uma sequncia de uma fita de polinucleotdeos fosse AATCCATGT, qual seria o filamento complementar?

DESNATURAO E RENATURAO

So processos importantssimos para a replicao, recombinao e transcrio do material gentico; Desnaturao: pontes de hidrognio entre as fitas complementares so rompidas; Renaturao: inverso da desnaturao.

DESNATURAO

Pode ocorrer por aumento de temperatura, tratamento com cidos ou bases, agentes desnaturantes e concentrao de sal; Pareamento entre as bases no apresenta a mesma estabilidade separao de GC exige temperaturas mais altas, ou concentrao de agentes desnaturantes, devido diferenas do nmero de pontes de hidrognio.

DESNATURAO

Tm: Temperatura na qual 50% do DNA encontra-se desnaturado; A Tm depende da proporo de bases AT em relao GC;

[ ] GC

Temperatura

Tm

RENATURAO

Ocorre atravs do resfriamento; O anelamento ocorre a uma temperatura de 25C abaixo da Tm; medida que algumas bases se associam, a velocidade de renaturao aumenta;

Caso ocorra um resfriamento abrupto, as fitas de DNA podem colapsar e no renaturar.

RENATURAO

A velocidade de renaturao do genoma depende do seu tamanho e da sua complexidade

TIPOS DE DNA
Sinttico

Oligonucleotdeos: sequncias determinadas de DNA sinttico;

curtas

pr-

Fisiolgicos (in vivo)

Tipo B, A e Z: Diferem quanto conformao e podem facilitar ou dificultar a interao da molcula com protenas.

DNA TIPO B

Forma clssica descrita por Watson e Crick e mais abundante; Dupla-hlice gira para a direita; Conclui uma volta a cada 10pb (pares de base).

Obs: Em soluo, geralmente o DNA assume a conformao B. Quando h pouca gua disponvel para interagir com a dupla hlice, o DNA assume a conformao A.

DNA TIPO A

Dupla-hlice gira para a direita;

Forma desidratada do tipo B;

Conclui uma volta a cada 11pb (pares de base); Apresenta estrutura mais curta e larga; Forma presente nas regies hbridas de DNA:RNA e em RNA dupla fita.

DNA TIPO Z

Dupla-hlice gira para a esquerda; Ocorre quando o acar e a base nitrogenada ficam do mesmo lado da ligao glicosdica; Cadeia aparece na forma de zigue-zague; Apresenta estrutura mais longa e fina; Conclui uma volta a cada 12pb (pares de base);

Em eucariotos o DNA tende a assumir a conformao Z-DNA devido metilao do DNA.

TOPOISOMERASES

Enzimas que promovem a quebra de ligaes fosfodister;

As fitas de DNA podem, assim, passarem uma sobre a outra e alterarem o superenrolamento da molcula;
So importantes nos eventos de replicao, transcrio e recombinao; Enzimas alvos de drogas antimicrobianas e anticancergenas.

ESTRUTURA DO RNA
Polmero linear de nucleotdeos unidos por ligaes fosfodister 53; Ribose - acar presente; Timina (T) substituda pela Uracila (U); Normalmente fita simples, embora possa apresentar pareamento intracadeia (estrutura similar ao DNA tipo A); Alguns vrus apresentam RNA fita dupla como genoma; Hbridos DNA:RNA (estrutura tipo A) so formados na transcrio.

TIPO DE RNA: LOCALIZAO E FUNO

mRNA (mensageiro): transfere a informao do DNA ao ribossomo para a sntese de protenas;

rRNA (ribossomal): componente dos ribossomos. Representa 75% do RNA total da clula; tRNA (transportador): carrega os resduos de aminocidos at os ribossomos para a sntese de protenas.

mRNA

rRNA e tRNA

CDIGO GENTICO

TIPO DE RNA: LOCALIZAO E FUNO

Eucariotos ainda contm:

hnRNA (heterogneos nucleares): precursores de mRNA;

snRNA (pequenos nucleares): ligados a protenas formando as ribonucleoprotenas (snRNP) que tem funo de produzir mRNA funcionais; Ribozimas: pequenos RNAs presentes no ncleo e citoplasma com funes estruturais e catalticas.

INTERAES DNA/PROTENAS

Protenas: organizam, replicam e transcrevem as informaes do DNA; No especficas: empacotam estabilidade da molcula; e mantm a

Especficas: ligam-se a sequncias definidas de nucleotdeos. Auxiliam o incio da transcrio e controlam esse processo.

INTERAES DNA/PROTENAS

Para o reconhecimento do DNA por protenas, as fitas no precisam estar abertas; Bases expostas so reconhecidas por aminocidos na cavidade maior (principalmente) e menor do DNA;

Os aminocidos ligam-se s bases por pontes de hidrognio.

INTERAES DNA/PROTENAS

Competio: duas protenas reconhecem o mesmo stio. A ligao depende da [ ] de cada uma e da intensidade da ligao; Cooperao: protenas s se ligam conjuntamente. Ocorre tambm com protenas que s se ligam aps a ligao de uma primeira que reconhece a sequncia do DNA; Autocooperao: quando protenas iguais se ligam adjacentes e a primeira facilita a ligao das demais.