BIOCHIPS

Lorena Oliveros Vargas

Andrs C Mndez A
Jerson J. Basto
Inicios
Definicin
Tipos de Biochips
Funcionamiento General
Fabricacin
Aplicaciones
Inicios
Inicios
A finales de los aos 80, la tecnologa que
desembocara en la plataforma GeneChip fue
desarrollada por cuatro cientficos, en Affymax:
Stephen Fodor, Michael Pirrung, Leighton Read y
Lubert Stryer. El proyecto original estaba destinado
a la construccin de secuencias de aminoacidos
sobre chips, pero desemboc en la capacidad para
construir secuencias de DNA sobre chips. La
aplicacin prctica de esta idea se llev a cabo por
la empresa Affymetrix, que comenz a actuar como
una compaa independiente en el ao 1993.

no es lo que se puede medir sino la cantidad de
mediciones simultaneas que se pueden realizar
Definicin
Definicin
biochip se descompone en Bio (vida) y
Chip (dispositivo de tamao muy pequeo
construido mediante tcnicas de fotolitografa o
robots piezoelctricos)
Un biochip es un dispositivo de un tamao muy
reducido (varios micrmetros, un micrmetro
1m=10-6 es la millonsima parte de un metro)
compuestos por un material biolgico conocido
dispuesto sobre una matriz de silicio, plstico o
cristal, que se emplea para obtener informacin
sobre determinadas secuencias genticas.
Es una superficie slida a la cual se une una coleccin de
fragmentos de ADN. Las superficies empleadas para fijar el
ADN son muy variables y pueden ser de vidrio, plstico e
incluso de silicio. Los chips de ADN se usan para analizar
la expresin diferencial de genes, monitorizndose los
niveles de miles de ellos de forma simultnea
En teora un biochip es un pequeo mecanismo
construido de grandes molculas orgnicas, tales como
las protenas, capaz de desempear las funciones de
una computadora (almacenamiento de datos,
procesamiento).
Los biochips son dispositivos similares a los microchips
de computadores, aunque con una amplia variedad de
funciones para la medicina y la agricultura.
Igual que sucede con los circuitos de las computadoras,
que son capaces de calcular millones de operaciones
matemticas en un solo segundo, los biochips realizan
millones de reacciones biolgicas, como decodificar
genes en cuestin de segundos.
Funcionamiento
Funcionamiento general de
un Biochip
Se toma una muestra de
material gentico de un
paciente o de un experimento
que sea complementaria a la
secuencia dispuesta en el chip,
de tal forma que se hibriden y
eliminen todas las cadenas de
ADN que no sean
complementarias al chip, que
posteriormente sern ledas por
un escner arrojando como
resultado un patrn de luz
caracterstico, que luego ser
interpretado por un
computador
Funcionamiento general de
un Biochip
Esta interpretacin se efecta mediante
un complicado software diseado para
tal fin, en la que se puede conocer las
posibles deficiencias o mutaciones que
hay en un individuo o una clula
especfica en su material gentico.

El patrn de colores indica las
caractersticas afines del material
gentico de la muestra con la dispuesta
sobre el biochip, los colores tenues,
indican deficiencias o incompatibilidades
genticas atribuidas a algn tipo de
enfermedad.
Funcionamiento general de
un Biochip Sonda
El diseo de las sondas y su
produccin son elementos
clave a la hora de hacer
posible la hibridacin en el
biochip. Sin la riqueza de
conocimiento y datos de
secuencias disponibles en
diversas bases de datos y
proyectos genmicos la
generacin de estas sondas
seria imposible
La metodologa fundamental de trabajo en un ensayo con biochips
es la misma independientemente del tipo de biochip que se emplee;
las diferencias se pueden encontrar nicamente en los dos primeros
pasos, en el diseo y en la fabricacin ya que en un caso es el
investigador el encargado de llevarlos a cabo, mientras que si se
usan los biochips "comerciales" estos pasos son realizados por la
empresa fabricante. Los pasos a seguir son los siguientes:
Funcionamiento general de
un Biochip
Fabricacin
Hibridacin y lavado:
Revelado
Almacenamiento de resultados
Anlisis de resultados
Tipos
Tipos de Biochips
Microarrays de dos canales
En este tipo de chips de
ADN las pruebas
son oligonucletidos, ADN
complementario (ADNc) o
pequeos fragmentos
de Reaccin en cadena de
la polimerasa, que
corresponden con ARN
mensajero (ARNm).
Tipos de Biochips
En los chips de ADN de
oligonuletidos o
micromarreglos de canal
nico, las pruebas son
designadas a partes de una
secuencia conocida o un
ARNm predicho. Estos chips
de ADNs dan estimaciones
del nivel de expresin, pero
distintas condiciones no
pueden ser observadas en
una misma matriz, por lo que
por cada condicin se ha de
utilizar un chip.
Chips de ADN de oligonucletidos
Tipos de Biochips
GeneChips de Affymetrix
Affymetrix es la compaa lder en este tipo de chips. Se
denominan genricamente "GeneChips". Cada gen
representado por un conjunto de secuencias cortas que lo
caracterizan. Algunos chips: genomas completos con ms de
50.000 grupos de sondas.
Chips de ADN para Genotipado
Los chips de ADN pueden ser utilizadas para "leer" las
secuencias de un genoma particular en determinadas
posiciones
Clasificacin de Biochips
Fabricacin
Fabricacin de biochip
Fabricacin de biochip
Fabricacin de biochip
Fabricacin de biochip
Aplicaciones
Aplicaciones
Los chips de ADN se han aplicado al
estudio de casi cualquier tipo de problema
biolgico. El numero de publicaciones
anuales es muy alto y contina creciendo.
Algunas de sus aplicaciones ms
frecuentes son :
Estudio de genes que se expresan
diferencialmente entre varias condiciones
(sanos/enfermos, mutantes/salvajes,
tratados/no tratados).
Clasificacin molecular en enfermedades
complejas identificacin de genes
caractersticos de una patologa (firma o
signature).
Prediccin de respuesta a un tratamiento.
Deteccin de mutaciones y polimorfismos
de un nico gen (SNP).
Conclusiones
Conclusiones
Como se puede apreciar, las ingentes aplicaciones de los
biochips van en creciente aumento, conforme la
industria farmacutica e industria en general exigen nuevas
herramientas y aplicaciones para el tratamiento de
mltiples enfermedades de origen molecular, gentico,
bacteriano o viral. Donde las ventajas de estos dispositivos son
mayores que sus desventajas, como son: alto rendimiento y
capacidad de procesamiento de material gentico, alta
especificidad y sensibilidad en el momento del anlisis, los
ensayos son fcilmente reproducibles y transportables, poseen
alto paralelismo a la hora de efectuar mediciones simultneas de
muestras diferentes, el coste de reactivos no es muy elevado,
permite la posibilidad de almacenamiento de la informacin en
sistemas de computo confiables y no se precisa de controles
biolgicos especiales para el manejo de residuos.