jfupuy@usat.edu.pe Perfil energtico de una reaccin espontnea Perfil energtico de una reaccin catalizada Las enzimas son protenas altamente especializadas que tienen como funcin la catlisis o regulacin de la velocidad de las reacciones qumicas que se llevan a cabo en los seres vivos. E + P E + S [ES] Las enzimas son protenas Catalizan reacciones qumicas necesarias para la sobrevivencia celular Sin las enzimas los procesos biolgicos seran tan lentos que las clulas no podran existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la clula , fuera de sta, y en el tubo de ensayo. E + S ESEP E + P E E E E Las enzimas son protenas* que catalizan reacciones qumicas
Nos hacen factibles las reacciones imposibles Son sustancias que, sin consumirse en una reaccin, aumentan notablemente su velocidad. Ello hace posible que en condiciones fisiolgicas tengan lugar reacciones que sin catalizador requeriran condiciones extremas de presin, temperatura o pH. Prcticamente todas las reacciones qumicas que tienen lugar en los seres vivos estn catalizadas por enzimas. * En su mayora son protenas, hay ARN con capacidad cataltica (ribozimas) Enzima y su sustrato Unin al centro activo Formacin de productos E + S ES E + P Complejo enzima-sustrato Reaccin catalizada por una enzima:
centro activo regin concreta de la enzima donde el sustrato se une un sitio de unin formado por los aminocidos que estn en contacto directo con el sustrato y un sitio cataltico, formado por los aminocidos directamente implicados en el mecanismo de la reaccin El centro activo comprende Sitio de unin: es el que le da la especificidad a la enzima Sitio cataltico El sustrato se une a la enzima luego se inicia la catlisis Enzimas, protenas catalizadoras. Muchas son protenas conjugadas, contienen componentes no proteicos cofactores- (inorgnicos = metales, orgnicos = coenzimas) Los reactantes deben absorber una energa de activacin (EA) para iniciar una reaccin Las enzimas NO agregan energa sino que disminuyen la EA aumentando la velocidad de una reaccin Las enzimas (gr. en levaduras) La enzima disminuye la energa de activacin Tiempo de la reaccin E + S E + P Sin enzima Con enzima La Ea de la hidrlisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la accin de las enzimas, acelerando la reaccin 10 14 x El aumento de temperatura necesario para producir la reaccin no catalizada seria de 529C MODO DE ACCIN DE LAS ENZIMAS Enzima - Catalizador Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reaccin qumica. Una enzima puede transformar 1000 molculas de sustrato/ segundo Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen Especificidad por el sustrato Se inactivan por desnaturacin Pueden ser reguladas
1. Solo se precisan en pequeas cantidades 2. No sufren cambios irreversibles durante la reaccin participa de manera repetida en la reaccin- 3. No tienen efecto en la termodinmica de la reaccin 4. Aceleran reacciones especficas qumicas(10 3 -10 20 ) 5. Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos Pepsina 1.5 Tripsina 7.7 Catalasa 7.6 Arginasa 9.7 Fumarasa 7.8 Ribonucleasa 7.8 Enzima pH ptimo PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS: Sitio activo y especificidad molecular Sitio activo Enlaces no covalentes (inicos, de H, interac. Hidrfobas) Formacin de un complejo enzima sustrato. Representacin esquemtica de la reaccin que cataliza la cinasa de piruvato en la que dos sustratos, el fosfoenolpiruvato (PEP) y el ADP, se unen con la enzima para formar un complejo enzima-ssustrato (ES), que conduce a la formacin de productos , ATP y piruvato Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energa de activacin
Cada enzima tiene una forma nica con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato
Despus de la reaccin, enzimas y productos se separan.
Las molculas enzimticas no han cambiado despus de participar en la reaccin
La unin del sustrato es muy especfica Complementariedad geomtrica Complementariedad de cargas, uniones inicas Modelos: Encaje inducido Llave cerradura. Estado de transicin Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo Nomenclatura Hay varias formas de nombrar una enzima: nombres particulares nombre sistemtico cdigo de la comisin enzimtica (enzyme comission)
Nomenclatura: nombres particulares Antiguamente, los enzimas reciban nombres particulares, asignados por su descubridor.
Ejemplos: amilasa (hidrolisa el almidn) glucoquinasa Glc + ATP Glc-6P + ADP
Al ir aumentando el nmero de enzimas conocidos, se hizo necesaria una nomenclatura sistemtica que informara sobre la accin especfica de cada enzima y los sustratos sobre los que actuaba.
Nomenclatura: nombre sistemtico Consta actualmente de 3 partes: el sustrato preferente el tipo de reaccin realizado terminacin "asa" ejemplo: la glucoquinasa ATP:glucosa fosfo transferasa Glc + ATP Glc-6P + ADP Nomenclatura: Comisin de Enzimas El nombre es identificado por un cdigo numrico:
encabezado por las letras EC (enzyme commission)
seguidas de cuatro nmeros separados por puntos. el primer nmero indica a cual de las seis clases pertenece la enzima, el segundo se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo, el tercero y el cuarto se refieren a los grupos qumicos especficos que intervienen en la reaccin. EC 1.x Oxidorreductasas EC 2.x Transferasas EC 3.x Hidrolasas EC 4.x Liasas EC 5.x Isomerasas EC 6.x Ligasas Clasificacin y nomenclatura EC 2.7.1.1 Nmero Enzyme Commission: Enzyme Comission Grupo Subgrupo Nombre comn (sustrato+asa): Hexokinasa Clasificacin y nomenclatura ATP: hexosa fosfotransferasa Nombre sistemtico: Donador Aceptor Grupo transferido Tipo de reaccin catalizada Grupos qumicos Grupos qumicos especficos Ej.: la ATP:glucosa fosfotransferasa (glucoquinasa) Glc + ATP Glc-6P + ADP EC 2.7.1.2. 2: transferasa 7: fosfotransferasa 1: el aceptor es un grupo OH 2: es un OH de la D-glucosa el que acepta el grupo fosfato. Nomenclatura: Comisin de Enzimas Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreduccin, en que tomos de oxigeno hidrogeno son trasladados entre molculas: En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrnico. AH 2 + B A + BH 2
Clasificacin y nomenclatura A red + B ox A ox + B red
cido succnico + FAD cido fumrico + FADH2 Succinato deshidrogenasa Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1.1.x - Deshidrogenasas EC 1.2.x - Oxidasas EC 1.3.x - Peroxidasas EC 1.4.x - Oxigenasas EC 1.5.x - Hidroxilasas EC 1.6.x - Reductasas etc. Grupo 1: Oxidorreductasas Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clnico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa)
A-B + C A + C-B Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de tomos grupo de tomos (distinto del hidrgeno) entre molculas: Clasificacin y nomenclatura ATP + glucosa ADP + Glucosa 6 fosfato Glucoquinasa Clasificacin de subgrupo de las transferasas: EC 2.1.x - Grupos monocarbonados EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto EC 2.3.x - Aciltransferasas EC 2.4.x - Glicosiltransferasas EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas EC 2.6.x - Grupos nitrogenados EC 2.7.x - Grupos fosfato EC 2.8.x - Grupos sulfato EC 2.9.x - Grupos selenio Grupo 2: Transferasas Aplicaciones: Sntesis de oligosacridos Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrlisis y tambin su reverso. Son las ms comunes en el dominio de la tecnologa enzimtica: A-B + H 2 O A-H + B-OH No se suelen utilizar nombres sistemticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4. Lactosa + H2O Galactosa + glucosa Lactasaa Clasificacin de las hidrolasas: 3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) 3.2.-.- Glicosidasas 3.3.-.- ter hidrolasas 3.4.-.- Pptido hidrolasas 3.5.-.- Acil anhdrido hidrolasas etc. Grupo 3: Hidrolasas Aplicaciones: Lipasas Sntesis de tensoactivos Proteasas Fbrica de quesos Glicosidasas Clarificacin de jugos; liberacin de aromas en los vinos; aplicaciones textiles Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de ruptura o soldadura de sustratos (remocin de grupo de tomos del sustrato - este grupo no incluye las hidrolasas):
A-B A + B cido acetoactico CO2 + Acetona Acetacetato descarboxilasa Clasificacin de las liasas: 4.1.x - Actan sobre enlaces C-C 4.2.x - Actan sobre enlaces C-O 4.3.x - Actan sobre enlaces C-N 4.4.x - Actan sobre enlaces C-S 4.5.x - Actan sobre enlaces C-Haluro (S - , Cl - , Br - , I - At - ) 4.6.x - Actan sobre enlaces P-O 4.99.x - Otras liases Aplicaciones: Pectato liasa Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, protenas) en fibras en la industria textil Grupo 4: Liasas Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerizacin moleculares A B Gliceraldehdo 3 fosfato Dihidroxiacetona fosfato Fosfotriosa isomerasa 5.1.x - Rasemasas y Epimerasas 5.2.x - cis-Trans-Isomerasas 5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular 5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5.5.x - Liasas Intramoleculares 5.99.x - Otras Isomerasas Grupo 5: Isomerasas Clasificacin de las isomerasas: Grupo 6: Ligasas Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas de la hidrlisis de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.). A + B + ATP A-B + ADP + P i
Ejemplo: Glutation sintasa (EC 6.2.2.3)
Nombre sistmico: G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
Grupo 6: Ligasas Clasificacin de las ligasas: 6.1.x - Forman enlaces C-O 6.2.x - Forman enlaces C-S 6.3.x - Forman enlaces C-N 6.4.x - Forman enlaces C-C 6.5.x - Forman enlaces steres fosfricos 6.6.x - Actan sobre enlaces N-metal Coenzimas Las coenzimas son pequeas molculas orgnicas, que se unen a la enzima. Las coenzimas colaboran en la reaccin enzimtica recibiendo transitoriamente algn grupo qumico: H + , OH, CH 3 . La enzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA Tres grupos principales: 1. implicadas en reacciones de transferencia de grupos fosfato: AMP, ADP y ATP 2. Derivadas de vitaminas: piridoxal fosfato, coenzima A 3. implicadas en reacciones de oxidoreduccin: NAD+ y FMN Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimtica, a travs de interacciones con el centro activo u otros centros especficos (alostricos).
Esta definicin excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a travs de desnaturalizacin de la molcula enzimtica
De esta forma, habr dos tipos de inhibidores:
I. Isostricos: ejercen su accin sobre el centro activo
II. Alostricos: ejercen su accin sobre otra parte de la molcula, causando un cambio conformacional con repercusin negativa en la actividad enzimtica. Los inhibidores isostricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E + I EI 2. Inhibidor irreversible: modifica qumicamente a la enzima: E + I E ES + I ESI Inhibidores enzimticos Los inhibidores enzimticos son molculas que pueden unirse con una enzima y disminuir su actividad. La clula depende de inhibidores para regular la actividad de muchas de sus enzimas Pueden dividirse en reversibles (competitivos o no competitivos) o irreversibles Los reversibles se unen en forma dbil con la enzima, por lo que son fciles de desplazar. Los competitivos compiten con el sustrato por el sitio activo, esta tipo de inhibicin es la base de la actividad de mltiples frmacos de uso frecuente (La enzima conversora de la angiotensina ECA: Angiotensina I Angiotensina II, factor de riesgo mayor para la elevacin de la presin sangunea. Factor Inhibidor de ECA: Teprtido, posteriormente se sintetiz el CAPTOPRIL, primer antihipertensivo. En la inhibicin no competitiva, el sustrato y el inhibidor no compiten por el mismo sitio de unin Los irreversibles, son los que se unen con gran firmeza a las enzimas. Gases nerviosos como el diisopropilfosfofluoridato y los pesticidas organofosforados, actuan como inhibidores irreversibles de acetilcolinaesterasa, una enzima que tiene un papel crucial en la destruccin de acetilcolina, el neurotrasmisor encargado de producir contraccin muscular
Inhibicin reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijacin del substrato: Inhibicin Competitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijacin del substrato a la enzima, pero s impide la accin cataltica: Inhibicin No Competitiva
(c) El inhibidor se fija nicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la accin cataltica; este tipo se conoce como Inhibicin Anticompetitiva Inhibicin competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y se forma producto Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio activo E ES EI I S E + P I ESI S Inhibicin No Competitiva El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibicin el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo despus de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato est saturando la enzima y toda la enzima est como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI.