Metabolismo de Procariotas

Bibliografa:
Brock. Cap 5. Nutricin, cultivo y metabolismo microbiano.
Brock. Cap 17. Diversidad Metablica.
La paciencia es la madre del xito
Estructura de la clase
Clases de metabolismo
por la fuente de Energa
por la fuente de Carbono
Relacin con el oxgeno
Quimioorgantrofos

- Respiracin aerobia
- Respiracin anaerobia
- Fermentacin
Potenciales de reduccin
El donador de e- es como una fuente de E, ya que en la reaccin de donacin de e-, se
libera energa.
Cunta mayor diferencia en Eo, mayor E liberada.
Compuestos
ceden e-
Energa
Almacenamiento
Fuente de E
El dador de e- es tan importante como el aceptor.
Sin uno de ellos, la reaccin REDOX no puede ocurrir.
Clases de Metabolismo
Por el tipo de fuente de Energa:

Fottrofos: luz
Quimiolittrofos: compuestos inorgnicos (H, H
2
S, Fe)
Quimioorgantrofos: compuestos orgnicos.

Todos las clulas requieren carbono (C) como nutriente principal.

Por el tipo de fuente de C:
Heterotrofos: compuestos orgnicos.
Ejemplos: todos los quimioorganotrofos.
Autotrofos: fijan CO
2
(Ciclo de Calvin o Inversin del Ciclo del cido
Ctrico u otras). Se necesita:
- ATP
- poder reductor (NADH o NADPH).
Ejemplo: mayora fottrofos y muchos quimiolittrofos.
Metabolismo en procariotas
Luz Compuestos
Inorgnicos
Compuestos
Orgnicos
CO2
Compuestos
orgnicos Hetertrofo
Auttrofo
Energa
Carbono
Fuente
Fottrofo Quimiolittrofo Quimioorgantrofo
Fotoauttrofo Autoquimiolittrofo
Fotohetertrofo
(pocos)
Mixtrofo (algunos)
Quimioorgantrofo
Mecanismos de conservacin de la energa:

- respiracin:
aerbica
anaerbica.

- fermentacin
Quimioorgantrofos
Todos sintetizan ATP con energa liberada de reacciones redox.
Obtienen Energa y C de compuestos orgnicos
Quimioorgantrofos
Respiracion anaerbica:
- nitratos (NO
3
-), hierro frrico (Fe
3+
),
sulfatos (SO
4
=
), carbonatos (CO
3
=
) y
compuestos orgnicos aceptan e- y se
libera CO
2
.
- La bomba de protones produce ATP por
fosforilacin oxidativa.

Fermentacin:
- Sntesis de ATP (menos) mediante
fosforilacin a nivel sustrato, en lugar de
bomba de H
+
.
- Ocurre en ausencia de oxgeno y de
aceptores de e- apropiados.
- ATP se forma durante los pasos de
catabolismo de un compuesto orgnico.
Respiracion aerbica:
- O
2
aceptor final de e- y se libera CO
2
.
- La bomba de protones produce ATP por
fosforilacin oxidativa.
Fermentacin
El O
2
no es muy soluble y ambientes se hacen anxicos fcilmente.
Entonces, la descomposicin de materia orgnica ocurre anaerbicamente.
Si no existen suficientes aceptores de e- (O
2
, SO
4
=, NO
3
-, Fe
+++
), el carbono
ser metabolizado por fermentacin.
La sustancia fermentada es el aceptor y dador de e-.
Sntesis de ATP mediante fosforilacin a nivel sustrato, en lugar de bomba de
H+. Ocurre en anaerobiosis.
Quimioorgantrofos
Uniones de P ricas en E son transferidas directamente a ADP para
formar ATP.
Gluclisis: ruptura de azcares
Primer paso en la respiracin y en la fermentacin.
Proceso anaerbico.
Produccin de ATP y piruvato
Fermentacin
Quimioorgantrofos
Un proceso conocido de fermentacin es la gluclisis.
La gluclisis en organismos fermentadores consiste en 3 etapas:
etapa 1: reacciones preparatorias
etapa 2: conservacin de energa
etapa 3: consumisin de NADH y produccin de productos de fermentacin.
Fermentacin: Gluclisis etapas 1 y 2
Etapa 1: Reacciones preparatorias
No son reacciones
redox
Necesitan energa.
Da 2 molculas de
gliceraldehdo 3P
Ocurren reacciones redox y produccin de ATP
Se forman 2 molculas de piruvato
Etapa 2: conservacin de energa
lisis
Fermentacin: Gluclisis
Etapa 3: fermentacin.
Ocurren reacciones redox
Oxidacin de NADH a NAD+.
Produccin de productos de fermentacin.
Se consideran productos de desecho en la regeneracin de NAD+ en
ausencia de O
2
.
Los productos de fermentacin contienen energa (no son oxidados
completamente).
Como consecuencia, la produccin de ATP por fosforilacin a nivel
sustrato es menos eficiente que la fosforilacin oxidativa.
Produccin neta de E: 2 ATP.
Mymicrobiologyplace.com: glycolisis: steps
Mymicrobiologyplace.com: fermentation
Homofermentativo: produccin nica de cido lctico de la
fermentacin de glucosa.
Heterofermentativo: produccin de varios productos, como
lactato, etanol, CO2 de la fermentacin de la glucosa.
Fermentacin
Quimioorgantrofos
Los productos de fermentacin difieren dependiendo el organismo.
Fermentacin de etanol:
- Importante en produccin de pan, cerveza y vino.
- Normalmente solo un producto es deseable: pan (alcohol se descarta), vino (CO
2
se elimina).
Fermentacin de cido lctico:
- ocurre en msculo animal cuando se necesita ms E y hay poco O
2
.
- ocurre en bacterias (en yogur) y hongo
Existen muchas otras vias de fermentacin (Captulo 17):

- a partir de protenas
- a partir de cidos nucleicos
- pero no a partir de cidos grasos
Productos de fermentacin y la industria alimenticia:
Captulo 25 (Brock 12va edicion)
Mecanismos de conservacin de la energa:

- respiracin:
aerbica
anaerbica.

- fermentacin
Quimioorgantrofos
Todos sintetizan ATP con energa liberada de reacciones redox.
Obtienen Energa y C de compuestos orgnicos
La respiracin celular, aerbica o anaerbica, ocurre en 4 etapas:

1- Gluclisis (etapas 1 y 2 de la gluclisis)

2- Ciclo del acido ctrico o de Krebs

3- Cadena transportadora de e-: NADH acarrea e-; el aceptor final de e- es el
oxgeno que produce agua (cuando la respiracin es aerbica) u otro compuesto
(respiracin anaerbica).

4- Sntesis de ATP con la ATPasa por fuerza protn motriz.

Respiracin celular
Es la oxidacin bioqumica de compuestos orgnicos y consecuente produccin
de ATP.

Luego el ATP es utilizada como la energia para procesos como biosntesis,
transporte, movimiento, etc.
Quimioorgantrofos
Dnde ocurren en Eucariotas? Y en Bacterias?
Mitocondria
Paso 1: Gluclisis: produccin de ATP, de NADH y acetil CoA, en anaerobiosis.
Respiracin aerbica
El aceptor final de e- es el O
2
.
Glucosa es oxidada hasta CO
2
. Gran produccin de ATP.
1- Gluclisis
Ciclo del cido ctrico o Krebs
Respiracin aerbica
Quimioorgantrofos
Los transportadores de
electrones reducidos (NADH y
FADH) van a generar una fuerza
protn motriz.
Implica la oxidacin completa
del piruvato a CO
2
, con una
gran liberacin de energa.

La E liberada es mucho mayor
a la liberada en la fermentacin.
Mymicrobiologyplace.com: krebs cycle
Fosforilacin oxidativa: Cadena transportadora de e-, gradiente de protones y sntesis de ATP.
Respiracin aerbica
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decompressor
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Quimioorgantrofos
La cadena transportadora de e- consiste en transportadores unidos a la
membrana plasmtica que intermedian el transporte de e- desde el donante
primario al O
2
, que es el aceptor final.
NADH es el donante de e- ms fuerte
O
2
es el aceptor de e- ms fuerte.

Cuando los e- son transportados, H
+
son separados de los e- y enviados afuera de
la membrana, formando la fuerza protn motriz.
Respiracin aerbica: Cadena transportadora de e-
Quimioorgantrofos
Complejo II (succinate dehydrogenase complex):
transfiere E de alta E del FADH a Q.
Complejo III (cytochrome bc1 complex):
transfiere e- de Q a citocromos (contiene heme),
proteinas Fe-S (e.g. ferrodoxin) y al citocromo c.
Complejo IV (terminal oxidase): transfiere e- del
citocromo c al citocromo a, al citocromo a3 y al
O
2
.
El O
2
cargado negativamente, se uno con H
2
y
forma H
2
0.

Complejo I (NADH quinone oxidoreductase):
transfiere e- de alta E del NADH a FMN (flavin
mononucleotido), a protenas Fe-S y a coenzima Q
(quinonas, transportador no proteico).
Mymicrobiologyplace.com: electron-transport chain: the process
La Torre Redox
Respiracin aerbica
Quimioorgantrofos
Fuerza protn motriz
La fuerza protn motriz consiste en un gradiente de pH y un potencial
electroqumico a traves de la membrana plasmtica.
Dentro de la membrana es electricamente negativo y alcalino.
- Esta fuerza permite que la ATP sintasa (ATPasa)
produzca ATP por fosforilacin oxidativa.
- ATPasa acta como un motor: movimiento
de H+ hace que roten las protenas c y la E
es transferida al complejo F1.
Preguntas
Cul es el rol de NAD+/NADH en la gluclisis?


Una poblacin de levaduras puede vivir con O
2
o sin
O
2
con suplemento de glucosa. En cul caso cree que
la poblacin de levaduras crecer con mayor
velocidad?


Disee un medio de cultivo para un organismo que
puede crecer en acetato como fuente de carbono y
energa. Incluya todos los componentes que pueda.


Quin es el aceptor de los e- derivados de la media
reaccin redox:
Succinato - fumarato? Por qu?
Mecanismos de conservacin de la energa:

- respiracin:
aerbica
anaerbica.

- fermentacin
Quimioorgantrofos
Todos sintetizan ATP con energa liberada de reacciones redox.
Obtienen Energa y C de compuestos orgnicos
Sistema de Vida Anaerbico
El metabolismo anaerbico es nico de los procariotas.
En eucariotas es muy raro.
En presencia de O
2
se favorece la respiracin aerbica
hasta que se agota el O
2
.
Algunos procariotas son anaerobios estrictos, incapaces
de usar el O
2
.
Quimioorgantrofos
Aceptores de e-: nitratos (NO
3
-), hierro frrico (Fe
3
+), sulfatos (SO
4
=),
carbonatos (CO
3
=) y compuestos orgnicos.
Metabolismo quimioorganotrofo
Gluclisis Respiracin anaerbica
Fosforilacin oxidativa: Cadena transportadora
de e-, gradiente de protones y sntesis de ATP.
QuickTime and a
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Aceptor de e- distinto de O
2

Quimioorgantrofos
Ciclo del cido ctrico o Krebs
La Torre Redox
Ninguno de estos aceptores de e- es
tan electropositivo como el par O
2
/H
2
O .

Menor cantidad de E es liberada en la
respiracin anaerbica.
Respiracin anaerbica
Quimioorgantrofos
Aceptores de e-
Respiracin anaerbica
Quimioorgantrofos
Distintas formas de respiracin
anaerbica
Reduccin de nitrato
Compuestos nitrogenados son aceptores de e-
comunes en la respiracin anaerbica.

Ej. el nitrato es reducido a nitrito.
El nitrito puede reducirse an ms.

Respiracin anaerobia
Todas las enzimas son inhibidas por el O
2
.

La mayora son proteobacterias y aerobios
facultativos y usan otros aceptores
anaerobicamente.
Ej. Pseudomonas stutzeri.
Muchos de los productos son gaseosos y se
pierden (desnitrificacin).

Proceso perjudicial para la agricultura pero
beneficiosa para tratamiento de aguas.


Desnitrificacin
Respiracin anaerobia: reduccin del nitrato a nitrito
Video:
http://www.sp.uconn.edu/~terry/Common/respiration.html
Flavoproteina
Quinonas
Cytocromo b
Cules transportadores de e- se utilizan en la
respiracin de nitrato?
Reduccin de sulfato
Varios compuestos de S son aceptores de e-
en la respiracin anaerbica.

El sulfato es la forma ms oxidada de S y
existe en grandes cantidades en agua de mar.

Bacterias sulfato reductoras, reducen el
sulfato a H
2
S (sulfuro).
Respiracin anaerobia
Anaerobios estrictos
Ej. Desulfovibrio.
Una sola Archaea reduce el sulfato: Archaeoglobus

Reduccin de S
0
a H
2
S tambin ocurre en varias bacteris.
Ej.: Desulfuromonas acetoxidans
CO
2
como aceptor de e-
En ambientes anxicos, procariotas anaerobios
estrictos usan CO
2
(carbonato) como aceptor de e.
No es un buen aceptor pero est presente en gral.
Ejemplos:
- Homoacetgenos
- Metangenos.
El H
2
es un donante importante de e-.
Respiracin anaerobia
Asimilacin versus Respiracin
Tanto el nitrato, sulfato y carbonato se asimilan mediante una
reduccin y son las fuentes de N, S y C.
Asimilacin es la reduccin de un compuesto inorgnico para usar en
la biosntesis.
Disasimilacin es la reduccin de un compuesto inorgnico como
aceptor en la respiracin, en el metabolismo energtico.
En la asimilacin, solo se reduce el compuesto lo necesario para
satisfacer las necesidades de biosntesis.
En la respiracin, una gran cantidad de compuesto se reduce y el
producto reducido se excreta al ambiente.
En qu se diferencian la respiracin y la fermentacin?



Escherichia coli es capaz de fermentar glucosa. Adems, crecen ms rpido
si se les da NO
3
- (y se produce NO
2
) y crecen aun ms rpido si se aerea el
cultivo. Por qu?
Pregunta
Indique cul podra ser la relacin con el oxgeno
de un Quimioorganotrofo?
Proximo miercoles:

8.30 clase teorica

14.30 Trabajo Practico obligatorio en CICUNC