O Genoma Humano

Dra. Giselle Maria Araujo Felix Adjuto

Mdica Geneticista SES/DF
Fevereiro 2014

PROJETO GENOMA HUMANO
Projeto Epigenoma -2005

1953 1990
Farmacogenmica
Nutrigenmica
GENOMA
Conjunto de genes???
Nmero total de genes???
Conjunto haplide de
cromossomos (DNA).
Informao gentica total
nas clulas humanas
(contedo de DNA): 25
diferentes molculas de DNA.
todo o material gentico da
clula de um organismo!
EPIGENOMA
Constitui a cromatina com
suas modificaes e
associaes de protenas que
fornece regulao
epigentica.
EPIGENTICA: so
alteraes herdveis na
expresso gnica sem
modificaes na seqncia
de bases do DNA.
Reversveis!

DNA METILAO PROMOTOR
(ilhas CpG)
Silenciamento



HISTONAS ACETILAO
METILAO
Compactao
da cromatina
Cdigo de
histonas
ONDE OS PROCESSOS
EPIGENTICOS OCORREM?

Como ocorre:
- Adio covalente de um grupo metil no carbono 5 da citosina
na molcula de DNA 5-metilcitosina








- Doador: S-adenosilmetionina (SAM)
- Catalisador: DNA-metiltransferases DNMTs (vrios
tipos e isoformas)
METILAO DO DNA

Resultado da metilao do DNA: silenciamento dos genes
atravs da inibio direta ou indireta da ligao dos fatores de
transcrio devido ao processo de metilao
METILAO DO DNA
GENOMA
EPIGENOMA
O silenciamento dos genes atravs de fenmenos
epigenticos nem sempre acarreta problemas.
Exemplos de eventos em que isso ocorre:
1. Regulao da expresso gnica:
- Inativao do X.
- Imprinting genmico.
2. Proteo do genoma contra invaso de seqncias de
fora do organismo, por exemplo DNA viral (inativado
por adio de metila).
3. Processos neoplsicos.

CONSEQUNCIA DOS PROCESSOS
EPIGENTICOS
PROJETO EPIGENOMA
HUMANO
Parceria do Instituto Sanger (britnico) e
empresa Epigenomics (alem) - 2005
Pretende esclarecer como fatores ambientais (dieta
e estresse) podem interferir no funcionamento dos
genes.
Como o estilo de vida aciona ou silencia os genes?
Como gmeos idnticos (mesmo genoma)
manifestam doenas diversas, como
esquizofrenia, diabetes ou cncer?

A metilao do DNA influenciada pela
alimentao suplementao de vit B12,
cido flico e betana ricos em grupo
metil desativao gnica
http://www.vmr.ro/pg3-1307.htm
Nutrigentica: analisa as caractersticas genticas individuais
que podem influenciar a sua resposta aos alimentos.

Nutrigenmica permite estudar ao longo do tempo a influncia
da dieta na expresso dos genes (relacionar dados genticos entre
indivduos saudveis e doentes com a sua dieta).
Farmacogentica: estuda a variabilidade gentica dos
indivduos em relao aos frmacos.

Farmacogenmica: estudo do genoma humano com o
objetivo de identificar genes relevantes que influenciam na
resposta aos frmacos.
FARMACOGENMICA
(99,995%)
30cm
(0,005%)
1-5% genoma
~3mm
A maior parte do genoma consiste em DNA repetitivo
MOLCULAS DE
DNA E RNA
A-DNA: hlice gira p/direita; dupla hlice mais
curta e mais grossa; 11pb p/completar uma
volta na hlice (conformao A: pouca gua).

B-DNA: hlice gira p/direita; dupla hlice mais
longa e mais fina; 10pb p/completar uma volta
na hlice (conformao B: DNA em soluo).

Z-DNA: rotao p/esquerda; mais alongado e
fino que o B-DNA; 12 pb p/completar uma volta
na hlice; em eucariotos assume a conformao
Z-DNA devido metilao.

FORMAS DE DNA
Giro Dextrgiro Sinistrgiro Dextrgiro
pb por giro 11 12 10,4
Dimetro 25,5 A 18,4 A 23,7 A
Umidade 75% Pu/Py - CH
3
92%
Observada In vitro/vivo? In vitro/vivo In vitro/vivo
CONFORMAES DO DNA

CLASSES DE RNA
RNA
codificador
Codifica protenas:
mRNA (3%)
RNA
funcionais
No traduzidos:
-tRNA (15%)
-rRNA (70%)
RNA no codificadores
(ncRNA)
-snRNA(small nuclear):
processamento de RNA transcritos
(spliceossomo)
-snoRNA (small nucleolar):
modificao do rRNA
-miRNA (micro): regulao da
expresso gnica
-siRNA(small interfering): defesa do
genoma contra vrus e transposons
RNA pequenos
Cromatina: DNA + nucleoprotenas + RNA
Nucleoprotenas
-Histonas (H1, H2a, H2b, H3 e H4)
-No Histonas (cidas)
Empacotando o DNA
Como um filamento de 5cm de DNA (tamanho mdio do
cromossomo) empacotado numa cromtide de 5m ?
(Genoma total= 30 cm) empacotamento de 10.000x
Nucleossomo: 146pb de DNA + dmeros de histonas H2a,
H2b, H3 e H4
CROMOSSOMOS EUCARIOTOS
Cludio C. Silva
BIO / UCG

DNA


Nucleossomos



Solenide




Alas




Domnios



Cromtide do
cromossomo
metafsico


ORGANIZAO DO GENOMA
COMPACTAO DO DNA
Gene produto funcional (polipeptdeo ou RNA
funcional)
GENE EUCARIOTO
Organizao do Genoma Humano
Genoma humano: 3 bilhes pb
No. genes: ~25 mil genes
Cromossomo (mdia): 150 milhes pb
Gene (mdia): 30 mil pb
Sequencia codificante (mdia): 3 mil pb
Unidade do cdigo gentico: 3 pb
Densidade gnica: varivel










Gene: DNA RNA
-RNAm
-RNAt
-RNAr
Geralmente:
DNA

RNAm

Protena
5
5 3
3
5
5 3
3
DNA

RNAm

Protena
e i e i e
e i e i e
H CORRELAO ENTRE O TAMANHO DO
GENE E O TAMANHO DO PRODUTO?
5
5 3
3
5
5
3
3
DNA

RNAm

Protena
DNA

RNAm

Protena
e i e i e
e i e i e
Excees: genes aumentam de tamanho conforme nmero e
tamanho dos ntrons: Ex.: globina e molcula de HLA Classe I
~ interferon, mas seus genes so 2 a 4 vezes maiores.
xons: geralmente pequenos ~150 bases
ntrons: grandes 1000 100.000 bases
Comparao entre os genes humanos da beta-globina, do fator VIII
da coagulao e da HPRT (hipoxantina ribosil transferase): genes
tamanhos diferentes, mas protenas c/ tamanhos similares.
protenas de tamanhos similares
33%
3%
4%
Genes humanos: grande variao de tamanho e proporo relativa entre
exons e introns. Tamanho do gene: barra vermelha ; Contedo de exons:
porcentagem ao lado do nome do gene. (genes grandesintrons grandes)
3685aa
2,4MB
4563aa
45KB
80 exons
Protenas ~450aa variao 150-800aa
Diversidade da Estrutura do Gene
Cromossomos: variam de 55 a
250Mb (mdia 130 Mb).

No. cromossomos: no est
relacionado com o tamanho do
genoma.

Ex.: Salamandra: genoma 30x maior
que humano (90.000.000Kb), mas
metade do no. de cromossomos (12
cr.).





TAMANHO DO GENOMA
X
NMERO DE CROMOSSOMOS

No h correlao exata entre tamanho do
genoma (no. de genes) e complexidade do
organismo:
- Genoma humano
200x > levedura S. cerevisae (~12Mb -16 cr.)
30x < plantas e anfbios
200x < ameba

Diferenas devido maior nmero de
sequncias DNA repetidas nos genomas
maiores.

TAMANHO DO GENOMA
X
COMPLEXIDADE BIOLGICA
http://www.bioloja.com/info/info.asp?id=95

Tamanho do genoma: no tem relao com
o status evolutivo de um organismo
Amoeba dubia: 670 bilhes de pb 220
vezes maior que o ser humano
Plantas, insetos e animais com genomas
maiores que o do homem.

Genes: distribudos ao acaso nos
cromossomos variao na densidade gnica
Cromossomos 17, 19 e 22 - ricos em genes
Cromossomos 4 , 13, 18, Y - pobres em genes
Bandas G claras ( ricas em GC) - ricas em genes
6p21.3: Complexo HLA (70genes/0,9 Mb)
Bandas G escuras (ricas em AT) pobre em
genes Xp21 (2,4Mb): gene DM
DENSIDADE GNICA
Complexo HLA - vrios genes sobrepostos - 6p21
Xp21
Gene distrofina Xp21
DENSIDADE GENMICA DIFERENTES
NMERO GENES X PROTENAS
SPLICING ALTERNATIVO
Explica diferenas entre modesto tamanho do
genoma humano e elevado proteoma:
~25 mil genes 100 mil a 1 milho de protenas.

QUAL MECANISMO?
Maioria dos genes humanos Encadeamento
Alternativo ou Recomposio Alternativa
Alguns genes podem gerar milhares de isoformas
de protenas.
Conforme: sexo do organismo
estado de desenvolvimento
tecido
ambiente
Splicing alternativo: resulta em diferentes
combinaes da unio de xons resultando
em diferentes protenas sintetizadas do mesmo
pr-mRNA
60% genes humanos apresentam splicing alternativo
SPLICING ALTERNATIVO
SPLICING EDITORAO OU PROCESSAMENTO
Introns: sequncia consenso 5 GU
sequncia consenso 3 - AG
SPLICEOSSOMO
Complexo de snRNP (ribonucleoprotena nuclear pequena) e
precursor do mRNA: remoo dos introns
SPLICING ALTERNATIVO
Os genes se distribuem sobre uma das duas fitas do DNA
Como essa distribuio?
-Genes dentro de ntrons
-Genes sobrepostos
-Genes agrupados
DNA
genes regio intergnica
DISTRIBUIO DE GENES HUMANOS
Genes dentro de introns: intron 26 contem 3 genes internos
transcritos a partir da fita oposta
OGMP: glicoprotena mielnica do oligodendrcito;
EV12A e EV12B: genes humanos homlogos a genes murinos que
podem estar implicados na leucemognese
Genes intrnicos
GENE NF1 - Neurofibromatose
Uso indiscriminado de testes genticos para doenas
multifatoriais (SNPs).
Implicaes: validade analtica, validade clnica e
utilidade clnica.
Baixo nvel de validade clnica: riscos psicolgicos e de
sade, discriminao social e estigmatizao.
BENEFCIOS X DILEMAS
Se fosse acessvel os testes genticos para
risco de doenas como:
D. Alzheimer
Doena cardiovascular
Diabetes
Depresso
Alcoolismo
Cncer de mama
QUEM FARIA O TESTE??? POR QUE???
DESAFIO
Obrigada!