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Introduction lenzymologie

Des rappels, encore des rappels??

Dfinition dune enzyme :


Biomolcule de nature protique ayant un pouvoir catalytique
lev et doue de spcificit.

Protines globulaires de poids molculaire lev .


Existence de protines enzymatiques de structures tertiaires,
Dautres de structures quaternaires.
Dans tous les cas grande importance de la structure spatiale
Native (notion de site actif).

Dfinition dune enzyme :


Biomolcule de nature protique ayant un pouvoir catalytique
lev et doue de spcificit.

3 effets des catalyseurs:

Augmente la vitesse des ractions thermodynamiquement possibles


Activit faible dose
Intact en fin de raction

Dfinition dune enzyme :


Biomolcule de nature protique ayant un pouvoir catalytique
lev et doue de spcificit.

Spcificit ractionnelle : chaque enzyme ne catalyse quune seule


raction (ou un groupe de ractions du mme type).
Spcificit de substrat : reconnaissance du substrat par
larchitecture spatiale de lenzyme.

Notion de site actif :

Notion de site actif :

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

DG = DE - T DS

Variation
temprature
dnergie libre
Variation
Variation
dnergie interne dentropie

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

DG = DH - T DS

Variation
denthalpie
Variation dnergie sous forme de chaleur
pression constante

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

Soit une raction enzymatique :

Mesure de la variation denthalpie :


DH = HP - HS

Si HP > HS , alors
DH > 0
La raction ncessite de la chaleur

Raction ENDOTHERMIQUE

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

Soit une raction enzymatique :

Mesure de la variation denthalpie :


DH = HP - HS

Si HP < HS , alors
DH < 0
La raction libre de la chaleur

Raction EXOTHERMIQUE

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

Soit une raction enzymatique :

Mesure de la variation denthalpie :


DH = HP - HS

Si HP = HS , alors
DH =0
La raction en quilibre

Raction ATHERMIQUE

2partie: Notion de bionergtique :


pourquoi une raction est-elle possible ?
Comment agit lenzyme ?

Soit une raction enzymatique :


S

En Biochimie on mesure de la variation dnergie libre :


DG = GP - GS

DG > 0 : Raction ENERGONIQUE


DG < 0 : Raction EXERGONIQUE
DG = 0 : Raction lEQUILIBRE

2partie: Notion de bionergtique :


DG et constante dquilibre dune raction

A +

k1

C +

k2

DG = DG + R T Ln Keq
Constante des
Gaz parfaits
temprature
Variation dnergie libre standard
(25C;1atm;[]=1M)

Keq = k1/k2 = [C][D]/[A][B]

2partie: Notion de bionergtique :


DG et constante dquilibre dune raction

A +

k1

C +

k2

DG = DG + R T Ln Keq
lquilibre la raction devient

2partie: Notion de bionergtique :


DG et constante dquilibre dune raction

A +

k1

C +

k2

A lquilibre DG = 0
alors
DG = - R T Ln Keq

2partie: Notion de bionergtique :


Catalyse et nergie dactivation
S

La raction passe par un tat de transition S* qui possde une


nergie intrinsque plus leve que celle de S ou de P

2partie: Notion de bionergtique :


Catalyse et nergie dactivation

2partie: Notion de bionergtique :


Catalyse et nergie dactivation

V = k . [S] = A [S]

k=A.e

Ea
e- RT

Ea
RT

La vitesse augmente si k augmente.


k
quand Ea
Les enzymes acclrent les ractions en abaissant
lnergie dactivation

2partie: Notion de bionergtique :


Schma tableau variation nergtique avec catalyseur chimique,
Sans catalyseur et avec catalyseur enzymatique.
Sauter une rivire.

Enzyme de nature tertiaire

Enzyme de nature quaternaire