1-Dfinition 2-Rles biologiques A- Les acides amins 1- Formule gnrale 2- Proprits physico-chimique et ioniques B- Les peptides 1- Liaisons peptidiques 2- Nomenclature 3-Dtermination de la structure des peptides 4- Rles biologiques C- Les protines 1- Structure primaire 2- Structure secondaire 3-Structure tertiaire 4- Structure quaternaire 3- Techniques de dosage des protines
Dtermination de la squence dun peptide
La dtermination de la structure primaire dun peptide obeit en gnral la stratgie suivante : 1-Identification des aminoacides terminaux -Lextremit N: on utilise le chlorure de dansyl et aprs hydrolyse chimique complte du peptide on identifie le dansyl aminoacide
Rq: La prsence de lysine dans le peptide va perturber cette mthode puisque la chaine latrale de ce rsidu porte un groupe NH2
-Lextremit C:on utilise une dgradation limite laide des carboxypeptidases
Dtermination de la squence dun peptide (suite)
2-Rsolution des problmes -Labsence damino acide terminal indiquera que ceux-ci ont t modifis et sont surement cycliques ou semi cycliques -La prsence des ponts disulfure intra-chaine posera des problmes quant la composition en aminoacide. La rduction de ceux-ci par un thiol, suivie dune alkylation supprimera les problmes La prsence de plusieurs groupement N et C terminaux indiquera que le peptide est form de plusieurs chaines lies des ponts disulfure. La rduction de ceux-ci par un thiol suivie dune alkylation sparera les diffrentes chaines
3-Dgradation des peptides en fragment
En utilisant les diffrentes mthodes de coupure de liaisons peptidiques qui fragmentent le peptide et en rptant ltape 1 (identification des aminoacides terminaux) on peut positionner les AA dans la squences
Dtermination de la squence : la dgradation rcurrente
En prsence du phenylisothiocyanate (PTC) , un pH basique , lAA donne de
absorbent dans lUV et facilement sparable par chromatographie
Chromatogra mme
Injecteur
Agitateur
mAU
Pomp e Colonne (phase stationnaire)
Injection
temp
Detecteur
Dtermination de la squence : la dgradation rcurrente
Par un changement de pH ( lgrement acide), il y a cyclisation et libration PTH aminoacide et dun peptide amput de son aminoacide N terminal.
En rptant ces cycles:
-Action du PTC pH 9 pour donner un PTC-peptide -puis libration du PTH aminoacide par passage un pH acide
Dtermination de la squence : la dgradation rcurrente
Dtermination de la squence : technique rcente
La spectromtrie de masse
Dviation dune particule charge dans un champ lectrique.
Cette technique est capable de mesurer avec grande prcision le rapport mas lectrique de molcule.
Dtermination de la squence : technique rcente
Cette technique comporte 2 tapes -Le bombardement dun peptide par des atomes dun gaz rare ( argon ou xron) produit lespece peptidique ionique (P,H)+ isole du milieu par un premier spectromtrie Lion peptidique est ensuite bombard par des atomes neutres dhelium qui provoquent des ruptures partir des deux extrmits. Une srie de fragments est obtenue et ces derniers sont soumis une analyse par seconde spectromtrie de masse
Les rsultats sont analyss et un traitement informatique reconstitue la squence primaire
Les peptides dintrt biologique
Peptides rle physico-chimique Le gluthathion (Glu-Cys-Gly) joue un rle central dans la dfense cellulaire contre le dioxygne et ses drivs actifs. Cest un couple Red-ox tres efficace contre les peroxydases
Les peptides dintrt biologique
Peptides activit de mdiateur Cette famille de peptide se retrouve dans les glandes de fonctions de communication dans le systme endocrine , la transmission et la modulation nerveuse, la motricit des vaisseaux sanguins, les ractions inflammatoires. Peptides hormonaux Locytocine: dclenche les contractions des muscles lisses (utrus pour laccouchement, glande mammaire pour la rjection du lait) L'ocytocine est un polypeptide comportant neuf acides amins, dont les deux groupements cystine sont relis par un pont disulfure (Cys1 - Cys6).
La squence des acides amins est prsente ci-dessous:
H3N+CysTyrIleGlnAsnCysProLeuGlyCOO-.
Les peptides dintrt biologique
Peptides activit de mdiateur Peptides hormonaux Vasopressine effet antidiuritique au niveau du rien provoque une rabsorption d'eau via une action sur le segment distal du nphron lors d'une dshydratation corporelle. (action hypertensive comme mdicament). La vasopressine est un polypeptide comportant neuf AA, dont les deux groupements cystine sont relis par un pont disulfure (Cys1 - Cys6). La squence des acides amins est prsente ci-dessous. H3N+CysTyrPheGlnAsnCysPro ArgGlyCOO(-)
Les peptides dintrt biologique
Non du peptide (hormones)
Nombre dAA
Lieux de scrtions
Rles biologiques
ACTH
39
Lobe antrieur de lhypophyse
Insuline
Bi catnaire (21 et 30)
pancras
Rgule le mtabolisme du glucose (hypoglycmie)
Glucagon
29
pancras
Augmente la glycmie (hyperglycmie)
scrtine
27
Muqueuse duodnale
Stimule le pancras exocrine au cours de la digestion
Les neuropeptides Ce sont deux famille de molcules, ligands de rcepteurs crbraux
Famille des enkphalines
Famille des endorphines
Ces deux molcules participent au contrle de la douleur
Elle contiennent le meme tetra peptides N terminal (Tyr-Gly-Gly-Phe)
Famille des enkphalines
Les peptides dintrt biologique
Les molcules de linflammation Une agression tissulaire dclenche une raction de dfense dabord locale: cest la raction inflammatoire dont les manifestations sont douleur , chaleur, rougeur et dme provoqus par des molcules vasodilatatrices
Histidine
Hydroxytryptophane dcarboxylation
Histamine
Srotonine
Les peptides dintrt biologique
Peptides antibiotiques
Certains microorganismes synthtisent des peptides, inhibiteurs de la synthse protique,
Qui sont des armes de dfense et de colonisation Peptides bactriens
Tyrocidine
Les peptides dintrt biologique
Peptides bactriens
Bacitracine A
Peptides fongiques
Penicilline
Les peptides dintrt biologique
Peptides immunomodulateurs Cyclosporines: mtabolites secondaires secrter par le champignon micromycte Tolypocladium : peptides antifongiques qui sont immunosuppresseurs utiliss dans la transplantations dorganes.
![Phytothérapie Volume 7 issue 1 2009 [doi 10.1007_s10298-008-0358-3] F. Joanny Menvielle-Bourg; Fabienne Joanny -- L’extrait huileux au CO2 supercritique de baies et de graines d’argousier ( Hippopha](https://imgv2-2-f.scribdassets.com/img/document/343017790/149x198/2f831838cf/1490467139?v=1)
