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Les constituants cellulaires sont

orients vers leur destination correcte:


interactions entre signaux de reconnaissance spcifique et rcepteurs

migration vers le compartiment


auquel ils sont destins.

(1) Transport travers


les pores nuclaires

(2) Transport par translocation


travers les membranes

(3) Transport par


des vsicules

Rf 2: ALBERTS (B) ,Lessentiel

3 mcanismes principaux par lesquels les organites


limits par une mb importent des protines.

Une Carte routire simplifie


de la circulation des protines.
voyage commence
par synthse protine
chaque station ,dcision:
retenir ou transporter plus loin
se termine quand destination
finale atteinte

Comment une protine peut elle


reconnaitre spcifiquement sa
destination souvent unique parmi les
autres destinations possibles?

I Compartimentation cellulaire
II- Adressage et repliement protines
III- Echanges nucloplasmiques
IV- Ciblage post traductionnel vers
les organites clos
V- Rticulum Endoplasmique

I Compartimentation
cellulaire

I-1[Avantages de compartimentation]
Le maintien de la compartimentation est la
cl de la permanence de lidentit cellulaire
Or
une cellule vit et interagit avec
un environnement
Il existe en plus des changes avec
lextrieur dpendant de mb , un trafic
mol entre les diffrents compartiments.

Les diverses fonctions de biosynthse, de


dgradation et de production dnergie
compartimentes dans cellules eucaryotes

zones privilgies dans volume


restreint :microenvironnement (enzymes,
cofacteurs ,substrats concentrs..)
squestration des activits risque
-enzymes de dgradation, lysosomes
-enzymes oxydatives ,peroxysomes.

Les compartiments de la cellule euc:


organites membranaires spcialiss
-Compartiments de traitement protines
(R E , A G, Vsicules de scrtion )
-Compartiment des acides nucliques
(noyau , nuclole)
-Compartiments clos (mitochondries,
chloroplastes , peroxysomes)
-Compartiment cytosolique.

I-2 [Origines des compartiments]


La compartimentation chez les cellules
procaryotes a permis aux 1ers eucaryotes
-

de taille;

-capter lnergie plus efficacement;


- rguler lexpression des gnes;
dune manire plus complexe.

Systme digestif
extracellulaire
Systme digestif
intracellulaire
Elaboration organite mb de
biosynthse
Compartimentation, quipement
de biosynthse et du gnome

Acquisition des
mitochondries

Modle hypothtique de lvolution des


compartiments intracellulaires.

Digestion des protines de


grande taille par les enzymes

A. Systme digestif
extracellulaire

Canal

Transporteur

B. Systme digestif
intracellulaire

Rf14:Pollard (T-D)

Procaryotes ancestraux
compartiments!
Biosynthse intracellulaire
Digestion extracellulaire

Exporter matriel de digestion


et
Capter produits de digestion (fig:A)

Internalisation
Enzymes dhydrolyse scrtes
+
nutriments de lenvironnement
=
Lysosome primitif (Fig:B)

lefficacit de la digestion et
labsorption des nutriments
macromolculaires

C- Elaboration dun
organite mb de
biosynthse

D-Compartimentation
de lquipement
de biosynthse
et du gnome

Rf14:Pollard (T-D)

Apparition de plusieurs destinations


possibles dans cellule
Signaux dadressage
pour distinguer les circuits
les uns des autres
Stratgie "diviser et spcialiser"
utilise grand nombre de fois:
voies dexportation , digestion ,
machinerie de synthse.(Fig:C,D)

Chaque tape de sparation:


Mise en place dun niveau supplmentaire de communication
rciproque entre les vsicules

Nouveau jeu de signaux dadressage

Oxygne apparu dans atmosphre

pour exploiter ce puissant oxydant ,


apparition peroxysomes (centre dgradation
oxydative)
Apparition mitochondries
(Sites dutilisation doxygne ,
de lextraction dnergie libre des
mtabolites, et de sa conversion en ATP)
(Fig:E)

E- Acquisition des mitochondries

Mitochondrie /
endosymbiose

Dveloppement du systme vacuolaire comprenant R E , AG


et systme des endosomes , lysosomes, mitochondries.
Rf14:Pollard (T-D)

Lapparition de lO2 dans lenvironnement


a permis synthse du cholestrol
et son intgration mb
paissit sans modifier fluidit mb ,
en absence de paroi cellulaire,
solide mais flexible
Facteur important pour volume
cellulaire au dbut de lvolution.

I Compartimentation cellulaire
II- Adressage et repliement protines
III- Echanges nucloplasmiques
IV- Ciblage post traductionnel vers
organites clos
V- Rticulum Endoplasmique

II- Adressage et
repliement protines

se replier
Structure
tridimensionnelle

trouver
destination finale
dans cellule

A - Adressage des protines


provenant de ribosomes libres

Rf14:Pollard (T-D)

B- Adressage des protines


provenant de ribosomes lis RE

Rf14:Pollard (T-D)

Protine cytosolique
(pas de squence signal)

Protine du RE dont la squence


signal a t enleve

Rle des squences


de signal dans le tri
des protines.
(B) Squences signal
(A) Normales

changes

[Rle des chaperons]


Facilitent le repliement ;
Inhibent lagrgation des protines;
ne librent polypeptides que si ltat de
repliement est favorable ;
2 classes de molcules :
- *HSP70 et leurs rgulateurs
-Chaperonines (cylindriques)
(*HSP:Heat Shock Protein)

Rcepteur
dhormone

Stabilisation des
rcepteurs des hormones
strodes (RSH) par
HSP70 , HSP90 et
diffrents facteurs
accessoires
( HOP, HIP, P23, GA , IP).

Hormone
stroide

Liaison lADN

La fixation de lhormone
libre les chaperons et
permet au RSH de migrer
vers le noyau.
Rf14:Pollard (T-D)

Liaison et hydrolyse ATP dterminent frquence de repliement

Liaison
7 ATP
7 sous
units
favorise
liaison
Gro ES

Le repliement par les chaperones de GroEL et GroES


A.Cycle de repliement.
B.Structure atomique
Rf14:Pollard (T-D)

I Compartimentation cellulaire
II- Adressage et repliement protines
III- Echanges nucloplasmiques
IV- Ciblage post traductionnel vers
organites clos
V- Rticulum Endoplasmique

III- Echanges
nucloplasmiques

[Echanges nunloplasmiques]
CYTOSOL
NOYAU
MITOCHONDRIES

PLASTES

Circulation
bidirectionnelle
Importes vers noyau:
Histones, ADN et
ARN polymrases,
protines rgulatrices ,
de maturation , protines
ribosomiques..
Exportes du noyau:
ARNm , ARNt ,sous
units ribosomiques..

30 nm

Aperu de lorganisation de lenveloppe nuclaire


Rf14:Pollard (T-D)

Lenveloppe nuclaire:
Barrire slective entre les compartiments
nuclaire et cytoplasmique;
garantit que seuls les ARNm matures
sont transports vers le cytoplasme;
Sa rupture est essentielle pour permettre
la libration des chromosomes au moment
de la mitose.

A. Modle tridimensionnel
dun pore nuclaire .
- Symtrie avec 1 canal
central et 8 canaux
priphriques.
- Les rseaux de filaments
permettent damarrer au
pore les lments
qui doivent transiter.
B. C.Reconstruction tridimentionnelle des pores nuclaires
de grenouille Xenopus laevis.
D: Levure
*AC: anneau cytoplasmique
*AN: anneau nuclaire
Rf14:Pollard (T-D)

III-2 [ Trafic noyau cytoplasme]

Les molcules de grande taille (suprieure


60kDa) ne passent pas de manire
passive travers les pores de diamtre de
9nm.
La taille des pores peut nanmoins voluer
jusqu 25-40 nm et certaines protines
plus grandes peuvent rentrer en se
dformant
Ex :comment est exporte RNP de 50 nm
de diam (ARN de 35 40 kB qui sassocie
500 protines)?

RNP en
25 x135 nm

Dformation dune volumineuse particule de RNP au


cours de son passage travers lenveloppe nuclaire.
Rf14:Pollard (T-D)

[La translocation nuclaire]


Le transport d'une protine nuclaire requiert
son interaction avec :
-des protines cytosoliques: les
importines, qui se lient aux signaux de
reconnaissance nuclaires NLS ou aux
exportines qui reconnaissent les signaux
dexportation NES des protines
transportes ;
-une protine G monomrique, la protine

Rcepteurs dimportation nuclaire.


A)Les cargaisons 1, 2, et 3 ont des signaux de localisation
nuclaire diffrents ,et se lient donc chacune sur un
rcepteur dimportation diffrent .
B)La cargaison protique 4 a besoin dune protine
adaptatrice pour se lier son rcepteur .
Ref 1: Alberts 5 ed

Compartimentalisation de Ran-GDP et de Ran-GTP.


Ref : Alberts 5 ed

La localisation de RanGDP dans cytosol


et Ran-GTP dans le noyau rsulte de la
localisation de 2 protines rgulatrices :
- (Ran GAP) dans cytosol
-(Ran-GEF) fix sur chromatine et donc
dans noyau
Ran-GTPase donne la fois la direction
du transport nuclaire et lnergie
ncessaire ce transport.

Complexe ternaire transite dans


pore le long de des rptitions FG
de certaines protines du CPN.

Cargaison
dlivre
dans le cytosol

Cargaison
dlivre
au noyau

Un complexe protine NES/Exportine/Ran-GTP


uniquement dans le noyau.
La dissociation de ce complexe se ralise uniquement
dans le cytoplasme lors de lhydrolyse du GTP en GDP
(favorise par Ran GAP).

Rcepteur
dimportation

Modle expliquant comment la liaison Ran-GTP peut


provoquer la libration de leur cargaison par les
rcepteurs dimportation nuclaire.
Ref : Alberts 5 ed

NF-AT
(Facteur Nuclaire
des lymphocytes T)
Au repos : phosphoryl

Signal dexportation
Nuclaire expos

Contrle de limportation nuclaire pendant


lactivation des lymphocytes T
Ref : Alberts 5 ed

I Compartimentation cellulaire
II- Adressage et repliement protines
III- Echanges nucloplasmiques
IV- Ciblage post traductionnel vers
organites clos
V- Rticulum endoplasmique

IV- Ciblage post traductionnel


vers les organites clos

Transport des protines


dans mitochondries,
chloroplastes,
Peroxysomes.

1-Fixation de la protine
sur rcepteur spcifique
2-Translocation
travers la mb externe
3 -Translocation travers la mb
interne vers la matrice ;
- translocation dans la bicouche
de la mb interne.

5C

25C
+protase

+protase

Rf 1: ALBERTS (B) ,

Protines traversent mb mitochondriales interne et


externe de faon transitoire pendant leur translocation
dans la matrice.

Cette exprience montre que le processus


dimportation a lieu en 2 tapes:
1. Pntration , par lintermdiaire du
gradient lectrochimique , du peptide
signal et des squences avoisinantes
travers les 2 mb mito.
2. Dplacement du reste de la chaine
polypeptidique vers la matrice qui ncessite
lhydrolyse de lATP et T physiologique.

[Translocation des protines]


La translocation dans les mitochondries
dpend de:
- squences signal
- protines de translocation.
Il existe plusieurs voies de transport
protique dans la mb mitochondriale interne
et dans lespace intermb.

aa chargs + (rouge)
regroups sur une face

aa non chargs
(bleu)

Ref : Alberts 5 ed

Squence signal dimportation des protines


Mitochondriales;
(A)Les 18 premiers acides amins de squence signal
de la cytochrome oxydase.
(B) Squence signal replie en hlice a .

Les protines de translocation des mb mitochondriales


( Les complexes TOM, TIM, SAM et OXA sont des
assemblages de protines travers mb mitochondriales.
Ref : Alberts 5 ed

Prcurseurs des protines mitochondriales importes


sous forme dune chaine polypeptidique dplie.
2.Insertion dans
membrane par
complexe *TOM

4.Clivage
par signal
peptidase

1.Reconnaissance
(liaison au recepteur)
3.Translocation
dans matrice

Ref : Alberts 5 ed

Importation des protines par les mitochondries .


N-terminal reconnu par rcepteur du complexe TOM;
Protine transloque travers TIM 23; squence
signal coup par peptidase.

Limportation des protines dans la matrice


mitochondriale ncessite la prsence de protines
HSP70 des 2 cts de la mb mitochondriale.
Rf 1: ALBERTS (B) ,

Intgration des porines dans la mb mitochondriale externe.


Translocation travers TOM; liaison des chaperons;
complexe SAM insre chaine dans mb externe.
Les bactries et les mitochondries utilisent les mmes
mcanismes pour insrer les porines dans leur mb externe.
Ref : Alberts 5 ed

Importation des protines du cytosol dans la mb


mitochondriale interne et dans lespace intermb.
Ref : Alberts 5 ed

[Aspect nergtique de la
translocation]
Libration des HSP70 cytosoliques et
mitochondriales de la protine
ATP
Translocation travers TIM

gradient H+

Deux conditions pour diriger l'import


des protines dans la mitochondrie:
- gradient lectrochimique
travers mb interne
- hydrolyse de l'ATP

Lhydrolyse de lATP et un potentiel de mb entrainent


limportation des protines dans lespace matriciel.

Rle de lnergie dans limportation protique


dans la matrice mitochondriale.
Ref : Alberts 5 ed

VI-2 [Transport des protines


vers les chloroplastes]

Voie dimportation des protines du chloroplaste


par les complexes TOC et TIC
Rf:18 Pollard (T-D)

Translocation de prcurseur
protique dans lespace
thylacode dun chloroplaste

(A) Prcurseur protique :


Squence signal pour
chloroplaste suivie de celle
du stroma.
(B) 4 voies de translocation
travers thylacoide ou
mb thylacoidale.

(bacterien)

(Twin arginine
Translocation)

(Sans
translocateur)

Ref : Alberts 5 ed

Peroxysomes
(vert)
Microtubules
(rouge)
ADN nuclaire
(bleu)
Rf 14: POLLARD (T-D) ,

Images de microscopie fluorescence dune cellule

Biognse des
peroxysomes par
bourgeonnement
partir du RE et
cycle de division
Nature Review .Dcembre 2013

Vsicule
prcurseur de
peroxysome

RE

Modle pour la prolifration des peroxysomes


et la production de nouveaux peroxysomes
Ref : Alberts 5 ed

PTS1 /2:Peroxysomal Targeting Signal

Modle de limportation dune protine avec


PTS1 dans la matrice du peroxysome.
Rf:18 Pollard (T-D)

I Compartimentation cellulaire
II- Adressage et repliement protines
III- Echanges nucloplasmiques
IV- Ciblage post traductionnel vers
organites clos
V- Rticulum Endoplasmique

V- Rticulum endoplasmique

Toutes les protines


destines :
la scrtion
RE lui-mme
AG
Lysosomes
Endosomes
Mb plasmique
sont initialement
importes dans
RE partir du
cytosol

[Rticulum endoplasmique (RE)]


Rseau de membranes internes
interconnectes issues des membranes
nuclaires;
Le plus grand organite de la majorit des
cell eucaryotes(50% des mb, 10% du volume )
Se prsente de 2 manires :
- REL: lisse
- RER: rugueux (dpourvu de ribosomes
certaines endroits lorigine des
vsicules de transitions)

Le rticulum endoplasmique:
sert dusine pour reproduire presque tous
les lipides cellulaires.
participe de nombreux processus
biochimiques vitaux comme la biosynthse
et la maturation post traductionnelle
des protines.

Cellule mammifre en culture qui


se fixe sur une protine retenue
dans RE.

Cellule vgtale vivante

Photographies en microscopie fluorescence de RE


Ref : Alberts 5 ed

V-1[Translocation dans le RE]


Protines destines au RE

pntrent entirement
dans la lumire RE

transloques dans mb
du RE mais pas libres

lumire RE, scrtion


autres organites

protines transmb du
RE ou dautres mb cellu

Ribosome

ARNm

Protine

Translocation co-traductionnelle et
post traductionnelle dun protine.
Ref : Alberts 5 ed

LARNm codant une protine cytosolique


reste libre dans cytosol

Cycle du ribosome libre

Cycle du ribosome li la mb

Mb du RE
Ref : Alberts 5 ed

Ribosomes du cytosol
dirigs vers RE
Si
protine en train dtre fabrique
porte squence signal, reconnue
par *SRP situ dans cytosol
Complexe ribosome SRP se lie
un rcepteur de mb du RE et
processus de translocation
*SRP: Particule de Reconnaissance du Signal

ARNt

ARNm

Cytosol
Lumire

La squence signal du RE et la SRP dirigent


les ribosomes vers la mb du RE
Ref : Alberts 5 ed

*SRP se lie la squence signal


et au ribosome et dirige le
ribosome vers rcepteur (RER)
le transfre vers un canal:
complexe de translocation
dissociation de SRP et de son
rcepteur du ribosome , reprise
de la synthse protique et
passage du polypeptide.

Les protines traversent mb RE par un canal


protique troitement ajust :complexe de
translocation.
Constituants du pore de translocation:
3 ou 4 copies du complexe Sec61p.
La liaison ribosome squence signal un
complexe de translocation ouvre un pore
transmb.

Ribosome li au translocateur
de protine eucaryote.
On pense que le translocateur
contient 4 copies du complexe
Sec61 qui participent activement
la translocation de la protin
Ref : Alberts 5 ed

3 modes dentrainement de la translocation


protique au travers de translocateurs de
structure similaire..
Ref : Alberts 5 ed

Intgration dans la mb
du RE dune protine
un seul passage
transmb porteuse
dune squence signal
interne.

Ref : Alberts 5 ed

V-2 [Modifications des protines


dans le RE]
Une protine subit des modifications
importantes dans le RE qui conduisent
lacquisition de conformation tridimentionnelle
Ces modifications peuvent tre:
et /ou

- co-traductionnelles
- post-traductionnelles.

[Glycosylation]
La principale modification chimique de la
majorit des protines qui deviennent
glycoprotines
oligosaccharide transfr en bloc
-

risque dagrgation

-rle dans repliement


-rle dans proprits fonctionnelles
dans les milieux extracellulaires

*ASN: asparagine

Rf 2: ALBERTS (B) ,Lessentiel

Glycosylation dune protine dans le RE rugueux


Copie de lenzyme associe chaque
protine de translocation dans mb du RE.

[Les ancres GPI]


Les protines mb peuvent tre ancres aux
bicouches mb par *GPI , cette liaison covalente
entre la protine et ce groupement se fait dans le RE.

(*GPI: Glycosyl-Phosphatidyl inositol.)

[Formation de ponts disulfure]


Ces liaisons covalentes sont formes par
liaisons oxydatives des groupes thiols de 2
rsidus cystine prsents dans la mme
protine.
La formation de ces ponts dpend de la
disulfure isomrase prsente dans la
lumire du RE de toutes les cellules
deucaryotes .

[Repliement des polypeptides


nouvellement synthtises]
Le repliement complet ne se produit
quaprs libration de la chaine polypeptidique
du ribosome.
Chaque polypeptide a un mcanisme de
repliement particulier , dicte par sa
squence.
Nanmoins ,les enzymes qui facilitent ces
processus sont gnralement les mmes.

[La sortie du RE ]
Etape importante de contrle de qualit:
protines replies incorrectement
ou
assembles partenaires anormaux

retenues dans le RE
et puis dgrades.

Ref : Alberts 5 ed

Exportation et dgradation protines du RE mal


replies.( elles sont transloques dans cytosol ou
elles sont dglycosyles , ubiquitinyles et
dgrades dans protasome.

Dgradation dans le protasome


des protines mal replies.

[Synthse lipidique]
La plupart des lipides cellulaires sont
synthtiss dans RE et dans lAG,
Cette synthse est indispensable aux
besoins de la voie dexocytose et aux
fonctions cellu qui dpendent des mb et des
molcules de signalisation lipidique.
La plupart des glycrophopspholipides
sont synthtiss dans RE ,les sphingolipides
essentiellement dans AG.

[Stockage du calcium]
Une autre fonction du RE dans la plupart
des cellu euc : squestration des Ca++
cytosoliques .
Le cycle libration/ rcupration des Ca++
du RE dans cytosol est responsable de la
mdiation dun grand nombre de rponses
rapides des signaux cellulaires.

Conclusion
Lorigine au cours de lvolution , des
organites entours dune mb permet
dinterprter leurs relations topologiques.
Les protines de chaque compartiment
lui confrent :
-ses caractristiques structurales
-ses proprits fonctionnelles

les protines sont modifies pendant et


aprs leur synthse : tri, repliement ou
protection contre les protases.
Les protines catalysent les ractions qui
sy produisent et transportent slectivement les petites molcules en les faisant
entrer ou sortir.
Comment conserver les diffrences entre
les compartiment face au transport
intracellulaire?

Quelles sont les composants de la


machinerie de fusion vsiculaire?
leur mise en jeu lors du transport?.
leur voies de destination?