cidos nucleicos: Introduccin

Bases, nuclesidos y nucletidos

F. Miescher (1865)
- Estudia la composicin qumica del pus: encuentra
una fraccin precipitable por cido diludo que denomina
nuclena
- Encuentra un material parecido a la nuclena en la
esperma de salmn, y lo fracciona en una componente
proteico (protamina) y un componente que contiene P,
de carcter cido, que Altmann denomina cido nucleico

- Estudios posteriores a Miescher demuestran la existencia

de dos tipos de cido nucleico: uno abundante en la levadura,
que recibe el nombre de cido zimonucleico y otro, abundante
en el timo, llamado cido timonucleico.
- Posteriormente se comprueba que en la composicin del
llamado zimonucleico entra la ribosa, y por eso pasa a llamarse
cido ribonucleico (RNA, ARN), mientras que el timonucleico
contiene desoxirribosa, por lo que pasa a llamarse cido
desoxirribonucleico (DNA, ADN)

Experimento de Avery (1944)

El neumococo tipo R (rough, rugoso) (colonias a la izda.) puede

ser transformado en neumococo tipo S (smooth, liso) (colonias
a la dcha.) por el DNA del neumococo S. Esta transformacin
se transmite a la descendencia.

La hidrlisis qumica completa de un cido nucleico da lugar a

una mezcla equimolar de:
A. Una base nitrogenada heterocclica, purina o pirimidina
B. Una pentosa, ribosa o desoxirribosa
C. Ortofosfato
La hidrlisis enzimtica completa de un cido nucleico da lugar
a una mezcla de nucletidos
Los cidos nucleicos son polmeros (de altsimo peso molecular)
cuyos monmeros son los nucletidos.

DNA de Escherichia coli

Una sola molcula circular
cuya circunferencia mide
1 mm
Tiene un peso molecular de
aproximadamente 109

NH2
N

O
-

O P O CH2
O-

OH

OH

Pentosa
Fosfato

Base

Nuclesido
Nucletido

NH2
N
O P O CH2
-

Polinucletido

N
NH2
N

OH
O P O CH2
-

N
NH2
N

Enlace
fosfodister

OH
O P O CH2
-

OH

N
N

Enlace
-glicosdico

Purinas
6
1

Pirimidinas
4

3
8

N
3

NH
9

N
N
1

NH2
N

N
N

NH

Adenina: 6-amino purina

O
N

HN
H2 N

NH

Guanina: 2-amino 6-oxo purina

O
N

HN
N

Hipoxantina:
6-oxo purina

NH

O
N

HN
O

NH

NH

OH
N

N
HO

Xantina:
2,6 dioxo purina

cido rico:
2,6,8 trioxo purina
OH

NH

NH2
Citosina:
2-oxo 4-amino
pirimidina

N
O

N
O

Uracilo:
2,4-dioxo
pirimidina

HN
O

N
O
CH3

HN
O

Timina:
2,4-dioxo
5-metil
pirimidina

Propiedades de las bases

1. Carcter levemente bsico

2. Solubilidad escasa en agua
3. Espectro de absorcin con mximo a 260 nm
4. Posibilidad de formas tautomricas
5. Todos los reactivos de las bases son potencialmente
mutagnicos

Forma
ceto

O
HN

NH

Formas tautomricas
del uracilo
OH

Forma
enol
N
HO

NH2
N

N
N

NH

HNO2

HN

+
N

NH

NH3

Reaccin de desaminacin por cido nitroso:

Adenina se desamina a hipoxantina; por ello todos los
nitrosocompuestos son mutgenos qumicos potentes.

O
NH2
H3C

NH

1-Metiladenina
H2C
H

H3C

NH

CH3
2-Dimetilaminoguanina

CH2

HN

HN
O

Bases
modificadas

CH2 CH3

HN

NH

Isopenteniladenina

4-Tiouracilo

2-Tiouracilo

Productos naturales: metilxantinas

O
H 3C
O

CH3

N
N

H 3C

NH

OH
N

N
N

NH

CH3

CH3
Cafena

Teofilina

N
O

CH3

NH

CH3
Teobromina

Inhibidores de la cAMP fosfodiesterasa

Anlogos sintticos de bases: antimetabolitos

O

SH
N

N
N

NH

6-Mercaptopurina

Br

HN
O

5-Bromouracilo
O

N
H 2N

NH

2-Aminopurina

HN
H 2N

N
NH

8-Azaguanina

Nuclesidos, 1
Unin de una base a una pentosa a travs de un enlace de tipo
-N-glicosdico:
H 2N
N

N
HOCH2

OH

OH

Adenosina
(pentosa es ribosa)

Enlace
-N-glicosdico

H 2N
N

N
N
HOCH2

OH

Desoxiadenosina
(pentosa es desoxirribosa)

Purinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N9 de la base

Nuclesidos, 2

NH2

NH2

N
HOCH2

OH

N
N

OH

Citidina

HOCH2

OH

Desoxicitidina

Pirimidinas: enlace entre carbono anomrico (1) y N1 de la base

Numeracin

Nomenclatura

H2N
7N
5'
HOCH2
4'

5
4

8
N9

3'

2'

OH

OH

1'

N1
2

N
3

Base

Nuclesido

Adenina
Guanina
Hipoxantina

Adenosina
Guanosina
Inosina

Citosina
Uracilo
Timina

Citidina
Uridina
Timidina

Numeracin de tomos en los nuclesidos

O
HN
O

5'
HOCH2

4'

1'
3'
OH

Uridina

2'
OH

4
3

Propiedades qumicas de los nuclesidos

1. Incremento marcado en solubilidad con respecto a la de la base

2. Reacciones propias de la pentosa: Reaccin del orcinol (ribo-)
y de la difenilamina (desoxirribo-)
3. Absorcin a 260 nm como las bases aisladas

Conformacin de nuclesidos

Adenosina (anti-)

Adenosina (syn-)

O
HN
O
HOCH2

OH

NH

OH

Pseudouridina

Enlace C-C en lugar

del C-N habitual

Antibiticos nucleosdicos
NH2

Cordicepina

N
N

N
N

NH2
N

HOCH2

OH

HOCH2

NH
H 3C O

CH2

N
N

OH

CH C O
NH2

Puromicina

Antivirales
NH2
N
O
HOCH2

N
OH

OH

Citosin arabinsido
(Vidarabin)

Antirretrovirales
O
CH3

HN
HOCH2

O
O

O
CH3

HN
N

N3
AZT, Zidovudina

HOCH2
C

O
O

N
C

D4T, Estavudina

Nucletidos
(ribonucletidos)
NH2

NH2
N

N
O
-

O-

OH

OH

HOCH2

O
N

OH
-

O P O
O-

5-nucletido
(5-CMP)

O P O CH2

NH2

3-nucletido
(3-CMP)

HOCH2

OH

O
O P OO-

2-nucletido
(2-CMP)

Nucletidos (desoxirribonucletidos)
O

HN
O

O P O CH2
OOH

HN
CH3

O
HOCH2

O
O P O-

5-dTMP

O-

3-dCMP

Nucletidos cclicos
NH2
N
O
O O
-

N
N

OH

3,5 Adenosin monofosfato cclico, cAMP

NH2
N

O
-

O P O CH2
-

OH
O

5-Adenosina
difosfato, ADP

NH2

OH
N

O P O P O P O CH2
-

OH
O

NH2

OH

O P O P O CH2

5-Adenosina
monofosfato, AMP

OH

N
N

5-Adenosina
trifosfato, ATP

OH

Nuclesido polifosfatos

Propiedades de los nucletidos

1. Carcter cido debido al fosfato

2. Solubilidad incrementada respecto al nuclesido
3. Mximo de absorbancia UV a 260 nm
4. Misma reactividad que bases y nuclesidos

NH2
O

O P O P O P O CH2
-

ATP

OH

N
N

OH
H2O

G = -7.6 kcal/mol
Pi
O

O P O P O CH2
-

NH2
N
N

ADP

OH

OH

N
N

ATP como
donador de energa

NH2

O P O P O P O CH2
O

N
N
ATP

OH

O P O P O
O-

OH

Configuracin de alta energa (anhdrido)

O-

O
O P O CH2
O-

Configuracin de baja energa (ster)

HOCH2

O
HN

OH

O P O P O CH2

OH

O-

OH

O-

Uridindifosfato glucosa (UDPG)

OH

OH

NH2
N
CH3
H3C N+
CH3

O
CH2

CH2

O P O P O CH2
O-

O-

Citidindifosfato colina (CDP-colina)

OH

OH

NH2
O

O S O P O CH2

N
N

O
-

3-Fosfoadenosina
5-fosfosulfato, PAPS

OH

O P O
ONH2
N

OOC CH CH2
NH3

CH2

S+

CH2

CH3
OH

OH

N
N

S-adenosil
metionina, SAM

NH2
O
N+

CH2
OH

OH

O P O P O CH2
O

N
N

O
OH

O
H3C

H3C

Nicotinamido
adenin dinucletido,
NAD+

OH

NH
N

CH2
HCOH

NH2

HCOH
HCOH
CH2

O P O P O CH2
O-

OOH

OH

N
N

Flavin adenin
dinucletido,
FAD

Pantetena
H
HS

C
O

ADP

H HO H
O
O
N
C
O P O P O CH2
OOO H3C CH3
H
H

NH2

N
O

OH

Coenzima A

N
N

H
H
OH