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Enzimas

ENZIMAS
Son protenas especializadas en la catlisis de
reacciones biolgicas.
permiten que las reacciones metablicas ocurran a
gran velocidad en condiciones compatibles con la
vida.
Protenas altamente especializadas que tienen como
funcin la catlisis o regulacin de la velocidad de las
reacciones qumicas que se llevan a cabo en los seres
vivos.
Hace posible que en condiciones fisiolgicas tengan
lugar reacciones que sin catalizador requeriran
condiciones extremas de presin, temperatura ,etc.

IMPORTANCIA DE LOS ENZIMAS


Cada paso de una va metablica est
catalizado por un enzima.
La medida de la actividad enzimtica en
udos biolgicos o tejidos es importante para
el diagnstico de muchas enfermedades.
Muchas frmacos son inhibidores de la
actividad enzimtica.
Importancia en la industria de alimentacin y
agricultura.

Modo de accin
de las enzimas

La accin de los catalizadores consiste en disminuir la


Energa de activacin
Por ejm, la descomposicin del agua oxigenada (H2O2) puede
ocurrir
sin catalizador
E a= 18
Kcal/mol
con un catalizador inorgnico (platino) Ea= 12
Kcal/mol
con una enzima especfico (catalasa)
Ea= 6 Kcal/mol
As, el platino acelera la reaccin 20.000 veces, mientras que la
catalasa la acelera 370.000 veces.

Modo de accin de las enzimas


Para que puedan reaccionar, las molculas deben contener
suficiente energa para sobrepasar la barrera que impone el
alcanzar el estado de transicin.
En ausencia de un catalizador, en nuestro caso en ausencia
de una enzima, la cantidad de molculas en una poblacin
de reactivos que pueden poseer esta energa es muy
pequea y la capacidad de formar producto es igualmente
demasiado pequea.
Por lo tanto la velocidad de la reaccin esta determinada
por el nmero de molculas con energa suficiente para
alcanzar el estado de transicin.
En general, mientras menor sea la energa de activacin y
ms molculas puedan alcanzarla, la velocidad de la
reaccin ser mayor. De esto depende el enorme valor que
tienen las enzimas en los sistemas biolgicos.

PROPIEDADES GENERALES
ESTRUCTURA GLOBULAR.
AUMENTAN LA VELOCIDAD DE REACCIN
De 106 to 1012 veces vs sin enzima.
An ms rpido que los catalizadores qumicos.
CONDICIONES DE REACCIN
Temperatura 25-40 oC (algunas hasta 75 oC)
pH neutro (5-9), la mayora 6.5 7.5
Presin atmosfrica normal
CAPACIDAD DE REGULACIN
Por concentracin de sustrato
Por concentracin de enzima
Por inhibidores competitivos (semejantes al sustrato)
Por inhibidores no competitivos (modificacin covalente de
la enzima)
Por regulacin alostrica
ALTA ESPECIFICIDAD DE REACCIN
Interaccin estereoespecfica con el sustrato
No hay productos colaterales
CAPACIDAD DE REGULACION

a.- Estructura globular

b.- Alto poder cataltico


Catalizadores inorgnicos. 102-103
veces
Enzimas. 106-1020
Ejm. catalasa (hidratacin del
CO2) CO3NH2.
107 veces

Actividad in-vitro

c.- Accin a condiciones


ambientales

Produccin de NH3

Proceso enzimtico

Temperatura 25-40 oC (algunas hasta 75 oC)


pH neutro (5-9), la mayora 6.5 7.5
Presin atmosfrica normal

d.- Especificidad.
Solo catalizan reacciones especficas.
Ejm. Accin de enzimas amilasas.
La regin de la enzima que se une al sustrato recibe el
nombre de centro activo.
Las enzimas poseen uno o ms sitios especficos
donde se une el o los sustratos de una reaccin.
En l se encuentran los residuos catalticos que
participan en la reaccin enzimtica.

Accin del sitio activo

Caractersticas del centro activo


Es una parte muy pequea del volumen total de la
enzima.
Tienen una estructura tridimensional en forma de
hueco que facilita encajar al sustrato.
Estn formados por aminocidos lejanos en la
secuencia polipeptdica, que debido a los repliegues
de sta, quedan prximos.
Los radicales de estos aminocidos presentan
afinidad por el sustrato, lo atraen y establecen
enlaces dbiles con l.
Esto facilita que, una vez roto alguno de sus
enlaces, los productos resultantes se puedan
separar con facilidad del centro activo.

Aminocidos comunes, en sitios activos de


enzimas

MODO DE ACCIN
DE LAS ENZIMAS

Para que una reaccin qumica tenga lugar, las


molculas de los reactantes deben
chocar con una energa y una orientacin adecuadas.
La actuacin de la enzima
aumenta la concentracin efectiva de los sustratos
(aumenta la probabilidad de choque)
permite que los reactantes (sustratos) se unan a su
centro activo con una orientacin ptima para que
la reaccin se produzca .
modifica las propiedades qumicas del sustrato
unido a su centro activo, debilitando los enlaces
existentes y facilitando la formacin de otros nuevos

REACCIN CATALIZADA POR UNA ENZIMA

En una enzima se pueden distinguir tres tipos de


aminocidos
Aminocidos estructurales.
Son los ms abundantes y los
responsables de la forma de la enzima.
Por ejemplo, en la lisozima de 129
aminocidos, 124 son estructurales y slo
5 no lo son.
Aminocidos de fijacin.
Son los que establecen enlaces dbiles
con el sustrato y lo fijan.
Se encuentran en el centro activo de la
enzima
Aminocidos catalizadores.
Son los que al establecer enlaces, con el
sustrato, provocan la reaccin.
Son
los
responsables
de
su
transformacin.
Tambin estn en el centro activo

Centro activo

MODELOS DE INTERACCION
(Especificidad)
Hay dos modelos
sobre la forma en que
el sustrato se une al
centro activo del
enzima:
el modelo llavecerradura
el modelo del ajuste
inducido

Modelo llave-cerradura
La estructura del sustrato y la del centro activo son
complementarias
Este modelo es vlido en muchos casos, pero no es
siempre correcto

MODELO LLAVE-CERRADURA

Modelo del ajuste inducido


el centro activo adopta la conformacin idnea slo en presencia
del sustrato.
La unin del sustrato al centro activo del enzima desencadena un
cambio conformacional que da lugar a la formacin del producto.

Encaje
inducido

Modelo del Ajuste Inducido

e.- Capacidad de regulacin


Por inhibidores competitivos (semejantes al
sustrato)
Por inhibidores no competitivos
(modificacin covalente de la enzima)
Por regulacin alostrica

Reguladores alostricos
Es un modo de regulacin de las enzimas por el que la
unin de una molcula en una ubicacin (sitio alostrico)
modifica las condiciones de unin de otra molcula, en
otra ubicacin distante (sitio cataltico) de la enzima.

Cofactores - coenzimas
Muchas coenzimas se sintetizan a partir de vitaminas.
La forma catalticamente activa del enzima, es decir, el
enzima unida a su grupo prosttico, se llama
holoenzima.
La parte proteica de un holoenzima (inactiva) se llama
apoenzima, de forma que:
apoenzima + grupo prosttico= holoenzima
A veces, un enzima requiere para su funcin la presencia
de sustancias no proteicas que colaboran en la
catlisis:
los cofactores. Pueden ser iones inorgnicos como el
Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc. Casi un tercio de los
enzimas conocidos requieren cofactores.
Cuando el cofactor es una molcula orgnica se
llama coenzima.

Cofactores enzimticos

HOLOENZIMA: Enzima completa activa junto con su cofactor o


coenzima.

APOENZIMA O APOPROTENA: parte proteica de una enzima

MUCHAS VITAMINAS SON


COFACTORES O
PRECURSORES DE COFACTORES DE
ENZIMAS

Coenzima: NAD+
Deriva de la Vitamina B5
(cido nicotnico)

Coenzima:

FAD
Es grupo prosttico

Deriva de la Vitamina B2 (flavina)

FAD

forma oxidada

FADH2 forma reducida

NOMENCLATURA
Hay varias formas de nombrar una enzima:
Nombres particulares
Nombre sistemtico
Cdigo de la comisin de enzimas
NOMBRES PARTICULARES.
Antiguamente, los enzimas reciban nombres
particulares, asignados por su descubridor.
Ejemplos:

amilasa, pepsina.

Nomenclatura: nombre sistemtico


Consta de 3 partes:
el sustrato preferente
el tipo de reaccin realizado
terminacin "asa"
ejemplo: la glucoquinasa
ATP: glucosa fosfo transferasa
Glc + ATP Glc-6P + ADP

Nomenclatura: Comisin de enzimas


El nombre es identificado por un cdigo numrico:
Encabezado por las letras EC (enzyme commission)
Seguidas de cuatro nmeros separados por puntos.
el primer nmero indica a cual de las seis clases
pertenece la enzima,
el segundo se refiere a distintas subclases.
el tercero se refiere al grupo qumico especfico que
interviene en la reaccin.
El cuarto al orden de descubrimiento.

Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Catalizan reacciones de oxidorreduccin, es decir,
transferencia de hidrgeno (H) o electrones (e -) de un
sustrato a otro, segn la reaccin general:
AH2 + B

Ared + Box

A + BH2

Aox + Bred

Ejemplos son la succinato deshidrogenasa o la


citocromo c oxidasa.

1. OXIDO-REDUCTASAS

( Reacciones de oxido-reduccin).

Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide

Enzimas:
No.

Clase

Tipo de reaccin
que catalizan

Oxidorreductasas De xido reduccin


(transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa
Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Reduccin: ganancia de electrones (hidrgeno o prdida de


oxgeno)
Oxidacin: prdida de electrones (hidrgeno o ganancia de
oxgeno).
La Oxidacin y la Reduccin son reacciones acopladas (REDOX)

CLASE 2: TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de un grupo qumico (distinto del
hidrgeno) de un sustrato a otro, segn la reaccin:
A-B + C

A + C-B

Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la reaccin


siguiente:
glucosa + ATP

ADP + glucosa-6-fosfato
grupos aldehdos
gupos acilos
grupos glucosilos
grupos fosfatos
(kinasas)

Ejemplo de la glucoquinasa

Enzimas:
No.

Clase

Tipo de reaccin que


catalizan

Oxidorreductasas

De xido reduccin (transferencia de


e-)

Transferasas

Transferencia de grupos

Ejemplo

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Kinasas
Transaminasas

CLASE 3: HIDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrlisis:
A-B + H2O
AH + B-OH
Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reaccin:
lactosa + agua
glucosa + galactosa
Transforman polmeros en monmeros.
Actan sobre:
enlace ster
enlace glucosdico
enlace peptdico
enlace C-N

ENZIMAS:
No.

Clase

Oxidorreductasas

Transferasas

Hidrolasas

Tipo de reaccin que


catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Transferencia de grupos

Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Kinasas
Transaminasas

Hidrlisis, con transferencia Pirofosfatasa


de grupos funcionales del
Tripsina
agua
Aldolasa

CLASE 4. LIASAS
(adicin o ruptura de dobles enlaces)

Entre C y C
Entre C y O
Entre C y N

Enzimas:
No. Clase

Oxidorreductasas

Transferasas

Hidrolasas

Liasas

Tipo de reaccin que


catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Transferencia de grupos

Kinasas
Transaminasas

Hidrlisis, con transferencia de grupos


funcionales del agua

Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa

Lisis de un substrato,
(Sintasas)
generando un doble enlace, o
Adicin de un substrato a un
Descarboxilasa
doble enlace de un 2o.
pirvica
substrato

CLASE 5: ISOMERASAS
Catalizan la interconversin de ismeros:
A
B
Un ejemplo, la fosfotriosa isomerasa que
cataliza las reaccin representada:
gliceraldehdo-3-fosfato
dihidroxiacetona-fosfato

Enzimas:
No.

Clase

Oxidorreductasas

Transferasas

Hidrolasas

Liasas

Isomerasas

Tipo de reaccin que


catalizan
De xido reduccin (transferencia de
e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Transferencia de grupos

Kinasas
Transaminasas

Hidrlisis, con transferencia de grupos


funcionales del agua

Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa

Lisis de un substrato, generando un


doble enlace, o
Adicin de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)

(Sintasas)
Descarboxilasa
pirvica

Transferencia de grupos en
el interior de las molculas
para dar formas ismeras

Mutasas
Epimerasas
Racemasas

CLASE 6: LIGASAS
Catalizan la unin de dos sustratos con hidrlisis
simultnea de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.):
A + B + XTP

A-B + XDP + Pi

Un ejemplo es la piruvato carboxilasa

Enzimas:
No.

Clase

Oxidorreductasas

Transferasas

Hidrolasas

Liasas

Tipo de reaccin que


catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

Transferencia de grupos

Kinasas
Transaminasas

Hidrlisis, con transferencia de grupos


funcionales del agua

Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa

Lisis de un substrato, generando un


doble enlace, o
Adicin de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)

(Sintasas)
Descarboxilasa pirvica

Isomerasas

Transferencia de grupos en el
interior de las molculas para
dar formas ismeras

Mutasas
Epimerasas
Racemasas

Ligasas

Formacin de enlaces C-C,


C-S, C-O y C-N. Mediante
reacciones de condensacin,
acopladas a la ruptura del ATP

Sintetasas

Clases E. C. para
enzimas

1. XIDORREDUCTASAS
(Reacciones de oxidacin-reduccin)
1. Actan sobre CH-OH
2. Actan sobre C=O
3. Actan sobre CH=CH
4. Actan sobre CH-NH2
5. Actan sobre CH-NH
6. Actan sobre NADH o NADPH
7. Actan sobre otros compuestos nitrogenados
8. Actan sobre un grupo sulfuro
9. Actan sobre un grupo hemo
10. Actan sobre difenoles
11. Actan sobre perxido de hidrgeno
12. Actan sobre hidrgeno
13. Actan sobre donadores sencillos con incorporacin de 0, (oxigenasas)
14. Actan sobre donadores complejos con incorporacin de 02
15. Actan sobre radicales superxido
16. Oxidan iones metlicos
17. Actan sobre CH2
18. Actan sobre ferredoxina reducida
19. Actan sobre flavodoxina reducida Otras xidorreductasas

2.TRANSFERASAS
(Transferencia de grupos
funcionales)
1. Grupos con un
carbono
2. Grupos aldehdo o
cetona
3. Grupos acilo
4. Grupos glicoxilo
5. Grupos alquilo o arilo
6. Grupos nitrogenados
7. Grupos que contienen
fsforo
8. Grupos que contienen
azufre

3.HIDROLASAS
(Reacciones de hidrlisis)
1. steres
2. Enlaces glucosdicos
3. Enlaces ter
4. Enlaces peptdicos
5. Otros enlaces C-N
(diferentes del peptdico)
6. Anhdridos de cido
7. Enlaces C-C
8. Enlaces haluro
9. Enlaces P-N
10.Enlaces S-N
11.Enlaces C-P

4.LIASAS
(Adicin a dobles enlaces)
1.Liasas C-C
2.Liasas C-O
3.Liasas C-N
4.Liasas C-S
5.Liasas C-haluro
6.Liasas P-O
5.ISOMERASAS
1.Racemosas y
epimerasas
2.Isomerasas cis-trans
3.Oxidorreductasas
intramoleculares
4.Transferasas
intramoleculares
5.Liasas intramoleculares

6. LIGASAS
(Formacin de enlaces
acoplados con la
transformacin de
substancias como ATP o
nuclesidos)
Enlaces C-O
Enlaces C-S
Enlaces C-N
Enlaces C-C
Enlaces ster fosfrico

Nomenclatura: Comisin de enzimas


Ej.: la ATP:glucosa fosfotransferasa (glucoquinasa)
Glc + ATP Glc-6P + ADP

EC. 2..7..1..2.
2: transferasa
7: fosfotransferasa
1: el aceptor es un grupo OH
2: es un OH de la D-glucosa el que acepta el grupo
fosfato.

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