Regulacindelaexpresin

genticaenEucariotas

 En procariotas las actividades de

interruptores genticos (genetic switches)
son gobernados por una sola protena
activadoraorepresora
Ademselcontroldeungrupodegeneses
lograda por su organizacin en operones o
por la actividad especfica de factores
sigmas

 En eucariotas la mayora de los genes no estn

agrupadosenoperones
LasprotenasysecuenciasdeDNAqueparticipan
enlaregulacinsonmsnumerosas
Muchas protenas (DNAbinding proteins) actan
sobre un solo switch, con muchos switches
separados por gen y las regiones reguladoras de
estosestnseparadas,lejosdelpromotor
Clave es el acceso a los promotores eucariticos,
que es restringido por la cromatina y requiere de
complejosdeprotenasparapromoverorestringir
elaccesoalaRNApolimerasa

Resumen
Las propiedades biolgicas de cada clula
eucaritica esta grandemente determinada por
cualesprotenassonexpresadasdentrodeesta.
Lasprotenasexpresadasdeterminanlaarquitecturade
laclula,susactividadesenzimticas,susinteracciones
conelambienteyotraspropiedadesfisiolgicas
Sin embargo en cualquier tiempo en la historia de la
vida de la clula, slo una fraccin de RNAs y
protenascodificadaensusgenomasesexpresada
atiemposdiferenteselperfildelosproductosdelaexpresin
gentica pueden diferir dramticamente ya sea en cuales
protenassonexpresadasyaquenveles.
Cmosegeneranestosperfiles.

 Sielproductofinalesunaprotena,laregulacinocurrir
medianteelcontroldelatranscripcinoenlatraduccin
Laregulacinsedaavariosnveles,incluyendoanivel
delmRNA(alteracionesenelsplicingoestabilidaddel
mRNA)ydespusdelatraduccin(modificacionesde
lasprotenas)
Lamayoraocurreaniveldelatranscripcin
Elmecanismobsicoesquesealesmolecularesde
fuera o dentro de la clula llevan al enlace de
protenasreguladorasasitiosespecficosenelDNA
fuera de la regin codificadora para modular la
velocidaddelatranscripcin
Estas protenas pueden asistir directamente o
indirectamente a la RNA polimerasa a en el
promotor
opuedenreprimirlainiciacindelatranscripcinal
nopermitirenlazaralaRNApol

Diferenciasenregulacindeeucariotasy
procariotas
Aunque ambos procariotas y eucariotas utilizan
protenas (DNAbinding proteins) para regular el
nivel de la transcripcin, los genomas eucariticos
son ms grandes y su rango de propiedades es
mayor
Su regulacin es ms compleja, requiere de ms
tiposdeprotenasymstiposdeinteraccionescon
regionesreguladorasadyacentesenelDNA
La diferencia ms importante es que el DNA
eucaritico es empaquetado en los nucleosomas,
que forman la cromatina, la cual es dinmica y
esencialingredienteparalaregulacin

Engeneralelestadonormaldeungenbacterialesactivo(on)
RNApolenlazaalpromotorcuandonohayotrasprotenasreguladoras
Represor
Activador
Encontrasteelestadonormaldeungeneucariticoesinactivo(off)
La RNA pol II y los factores de transcripcin no pueden enlazar al
promotorenlaausenciadeotrasprotenasreguladoras
Laposicindelosnucleosomascercadelpromotor.afectaelenlacedel
aparatotranscripcional.Usualmentelaestructuradelacromatinatieneque
sercambiadaparaactivarlatranscripcin
Laestructuradelacromatinacercadegenesactivosoreprimidosdentro
delasclulasesheredadodemaneraestableporlasclulashijasyqueno
dependedelasecuenciadeDNA

Otrasdiferenciasenlaregulacintranscripcional
yahansidoestudiadas
1.
2.
3.

Solo una RNA pol en bacterias mientras que 3

funcionaneneucariotas
Los transcritos primarios son extensivamente
procesados.Extremos5y3,intronessonremovidos
RNApolIIesmscompleja,debesintetizarelRNA
y coordinar los eventos de procesamiento nicos a
eucariotas

 Los eucariotas multicelulares pueden tener hasta

25000 genes muchas veces ms que una bacteria
promedio
Los patrones de expresin gentica son ms
complejos
Hayunagranvariacinentrelosgenesen:cundoun
gen es transcrito (on) o no (off) y cunto transcrito
necesitaserhecho
Ej. Un gen puede ser transcrito solo durante el estado
temprano de desarrollo y otro solo en presencia de una
infeccinviral

La mayora de los genes en clulas eucariticas estn

inactivos(off)encualquiertiempo.

En base a estas consideraciones, la

regulacin gentica eucaritica debe ser
capazde
1. Asegurar que la expresin de la mayora de
losgenesenelgenomaqueesteinactiva(off)
en cualquier tiempo mientras se activa un
subsetdegenesy
2. Generar miles de patrones de expresin
gentica

 Nosenfocaremosenelpunto2
La maquinaria para generar diferentes
patrones de transcripcin in vivo tiene
muchoscomponentes,incluyendoprotenas
reguladoras y secuencias reguladoras cis
actuantes
El primer grupo de protenas comprende el
complejo de la RNApol II y los factores de
transcripcingeneralizada
Interactan con secuencias de DNA llamadas
elementos proximales del promotor (promoter
proximalelements)cercadelpromotor

 Un segundo grupo de protenas consiste de factores

de transcripcin especfico que enlazan a secuencias
cis actuantes denominadas mejoradores (enhancers,
upstreamactivatingsequences(UASs))
Pueden estar ubicados a una distancia considerable de los
promotores

Generalmente los promotores y los promoter

proximal elements son enlazados por factores de
transcripcin que afectan la expresin de muchos
genes(mayoradeclulas)
Losenhancersonblancodefactoresdetranscripcin
especficosquecontrolanlaregulacindeunsubset
mspequeodegenes,frecuentementeactuarnsolo
enunaopocostiposdeclulaseneucariotas

 Para modular la transcripcin, las protenas

reguladorasposeenunomsdominiosfuncionales:
1dominio:
Que reconoce lasecuencia de DNA regulatoria (DNA
bindingsite)
Que interacta con una o ms protenas del aparato
transcripcional (RNA pol o otra protena asociada a
esta)
Queinteractaconprotenasenlazadasasecuenciasde
regulacin cercana de manera que puedan actuar
cooperativamentepararegularlatranscripcin
Que influencia la condensacin de la cromatina ya sea
directamenteoindirectamente
Queactacomosensordecondicionesfisiolgicasenla
clula

 Mucha de la estrategia del control

transcripcional eucaritico depende de
como
factores de transcripcin
especficos controlan el acceso de los
factores de transcripcin generales y la
RNA pol.

Elcontroltranscripcionalde
eucariotas utiliza como
modelo a la levadura entre
otrosorganismos
12MbpLevadura
6000 genes
cromosomas

en

16

3000Mbphumanos
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ElsistemaGALdelevaduras
Para utilizar la galactosa la levadura importa el
azcarylaconvierteenunaformadeglucosaque
puedesermetabolizada
Genes: GAl1, GAL2, GAL 7 y GAL 10 convierten
galactosaenglucosa(enzimas)
Genes adicionales GAL3, GAL4 y GAL80 codifican
protenas que regulan la expresin de los genes que
codificanlasenzimasprevias
La abundancia del azcar determina el nivel de
expresingenticaenlavabioqumica
Genessilenciados
Genesinducidos

La protena reguladora es Gal 4 que enlaza

especfcamenteelDNA

Gal4regulamltiplesgenesatravsdeUASs
En presencia de galactosa los genes GAL1,2,7 y
10soninducidos1000vecesoms.
Cadaunodeestosgenestienedosomssitiosde
enlace para Gal4 (Gal4binding sites) localizado
enlaregin5corrientearribadelpromotor
EntrelossitiosdeiniciacindetranscripcindeGAL1
y GAL10 hay una regin de 118 bp que contienen 4
sitos de enlace para Gal4. Cada sitio es de 17 bp y es
enlazadoporundimerodeGal4.
Hay dos sitios para Gal4 corriente arriba de GAL10,
GAL2yGAL7

 Gal4tienedominiosseparados:
DNAbindingdomain
Activationdomainparasuactividadreguladora
Su identificacin fue posible gracias a mutantes por
mediodedelecionesofusionesaotrasprotenas
La expresin de los genes GAL y otros factores de
transcripcinsemonitoreacongenesreporteros(reportergene)
Ej.lacZyGFP(greenfluorescenceprotein)
Laregincodificadorayunpromotorsoncolocadosdownstream
deUASsdelgenGAL
Mutacionessineldominiodeactivacinnosoninducidos
Cuando el dominio de activacin es aadido a un represor
bacterialcomoLexA(DNAbindingdomain)hayinduccin
Eldominiodeactivacinescercade50100a.a.

 La actividad de
fisiolgicamente

Gal4

es

regulada

Mutaciones en Gal80 y Gal3 han indicado como

Gal4 es regulada
Mutaciones en Gal80 activan los genes estructurales
inclusive en ausencia de galactosa, lo que indica que su
rol es reprimir la expresin de los genes GAL
Al contrario de las mutaciones en la protena Gal3 donde
los genes no son activos en presencia de galactosa
sugiriendo que Gal3 promueve la expresin de los genes
GAL. Gal3 requiere de ATP

Gal3, Gal80 y Gal4 son parte de un switch cuyo

estado es determinado por la presencia
o
ausencia de galactosa
No el dominio de enlace al DNA
Ms bien el dominio de activacin es regulado
fisiolgicamente

 Gal4 funciona en la mayora de los eucariotas

Gal4 activa la transcripcin en clulas de insectos,
humanos y otras sp de eucariotas
Esta versatilidad sugiere que la maquinaria
bioqumica y los mecanismos de activacin
gentica son comunes en un rango amplio de
eucariotas y las caractersticas reveladas en la
levadura generalmente estn presentes en otros
eucariotas y viceversa

 Activadores
transcripcional

reclutan

la

maquinaria

En bacterias los activadores estimulan la

transcripcin al interactuar con el DNA y con la RNA
polimerasa
En eucariotas los activadores reclutan la RNApolII a
los promotores a travs de dos mecanismos
principales
Interactan con subunidades de complejos de protenas
para iniciar la transcripcin
Pueden reclutar protenas para modificar la estructura de la
cromatina para que la RNApolII y otras protenas tengan
acceso al DNA

 Gal4 enlaza a TBP en el sitio de activacin

(dominio), lo que permite reclutar al complejo
TFIID y a la RNApolII al promotor
Gal4 tambin interacta con un complejo
mediador que interacta directamente con la
RNApolII para reclutarla a sus promotores
El complejo mediador es un ejemplo de coactivador,
termino aplicado a una protena o complejo de
protenas que facilita la activacin de genes por
un factor de transcripcin
El enlace del mediador a secuencias de DNA (upstream) e
interactuar con protenas que enlazan directa o indirecta con
el promotor explica como la activacin de la transcripcin
puede ser estimulada por secuencias reguladoras distantes

Mecanismo de accin de los

Enhancers
El mecanismo de regulacin es ms como un
reostato ms que un on or off switch
En eucariotas los niveles transcripcin es
finamente ajustada mediante la agrupacin
de sitios de enlace en los enhancers
Varios factores de transcripcin o varias molculas
del mismo factor de transcripcin pueden enlazar
a sitios adyacentes
En el enlace a una distancia correcta lleva a una
amplificacin o efecto superaditivo de la activacin de
transcripcin. Cuando un efecto es mayor que aditivo el
efecto es sinergistico

 Una sinergia (del griego cooperacin)

es el resultado de la accin conjunta de
dos o ms causas, pero caracterizado
por tener un efecto superior al que
resulta de la simple suma de las dichas
causas.

 Elenlacedeprotenasreguladorasmltiples
amltiplessitiosdeenlaceenunmejorador
puede catalizar la formacin de un
enhanceosoma,ungrancomplejoprotenico
que acta sinergeticamente para activar la
transcripcin

El control de los tipo de apareamiento en

levaduras- interacciones combinatorias
En organismos multicelulares, distintos
tipos de clulas difieren en la expresin
de cientos de genes
Debe ser coordinada para hacer tipos de
clulas particulares
Ej. Mejor entendido son los tipos de clulas
de aparemiento (mating type) en levaduras
La levadura S. cerevisae puede existir en
tres tipos de clula, a, , y a/

 a y son haploides y contienen por lo tanto una copia

de cada cromosoma
No pueden distinguirse microscpicamente pero
pueden ser diferenciados por caractersticas celulares
principalmente su tipo de apareamiento
Una clula se apareara con a y secreta un
oligopeptido feromona o hormona sexual, llamado
factor que detiene a las clulas a en el ciclo celular.
Una clula a secreta un factor a y se aparea con la
clula y detiene a esta en el ciclo celular
La clula diploide a/ no se aparea y es mayor que
las haploides y no responde a feromonas
Mutaciones en el apareamiento demuestran que el
tipo celular es controlado por un slo locus gentico
llamado MAT
Dos alelos, MATa , MAT en clulas haploides y clulas
diploides tienen ambos alelos

DNA binding proteins regulan

combinatoriamente la expresin de genesclula especfica
Mutaciones que no se pueden aparear pueden han
identificado un nmero de genes estructurales que
son separados del locus MAT pero cuyos
productos son requeridos, expresados en cada tipo
de clula
Alelos diferentes del locus MAT codifican diferentes
protenas reguladoras que controlan que genes
estructurales sern expresados en cada tipo de
clula
En adicin una protena MCM1 no codificada por el
locus MAT juega un rol importante en regular el tipo
celular

La cromatina dinmica y la
regulacin gnica en eucariotas
Un segundo mecanismo que influye en la
transcripcin gnica en eucariotas consiste
en modificar la estructura local de la
cromatina alrededor de las secuencias
reguladoras del gen.
Hay que considerar primero la estructura de
la cromatina para despus ver como se
puede cambiar y cmo se afecta la expresin
gentica

Las molculas de DNA son

altamente condensadas en los
cromosomas
Cromosoma 22: 48 millones
de bp
1.5 cm
Mittico 2 m (10,000X)
llevado a cabo por
protenas
Cromosomas
interfsicos
tambin
estn
empaquetados aunque en
proporcin menor que un
mittico (500x)

Los
cromosomas
son
estructuras dinmicas
No slo se condensan
globalmente de acuerdo al
ciclo celular
Los cromosomas interfsicos
tienen regiones diferentes
que se condensan y se
descondensan para permitir
el acceso de secuencias
necesarias
para
la
expresin,
reparacin
y
duplicacin del gen y se
recondesan cuando estos
procesos son culminados

 Los Nucleosomas (1974) son la unidad bsica de

la estructura de los cromosomas eucariticos
Histonas y protenas no histnicas: Complejo
de ambas Cromatina
Histonas: 60 millones de cada tipo de estas
por clula humana, su masa total es igual al
del DNA
Responsables
del
nivel
de
empaquetamiento ms bsico de los
cromosomas:Nucleosomas
El genoma diploide humano (6.4 x109bp)
contiene 30 millones de nucleosomas

Figure 4-23. Nucleosomes as seen in the electron microscope. (A) Chromatin isolated directly from an interphase
nucleus appears in the electron microscope as a thread 30 nm thick. (B) This electron micrograph shows a length of
chromatin that has been experimentally unpacked, or decondensed, after isolation to show the nucleosomes. (A, courtesy of
Barbara Hamkalo; B, courtesy of Victoria Foe.)

Figure
4-24.
Structural
organization of the nucleosome. A
nucleosome contains a protein core
made of eight histone molecules. As
indicated, the nucleosome core
particle is released from chromatin by
digestion of the linker DNA with a
nuclease, an enzyme that breaks
down DNA. (The nuclease can
degrade the exposed linker DNA but
cannot attack the DNA wound tightly
around the nucleosome core.) After
dissociation
of
the
isolated
nucleosome into its protein core and
DNA, the length of the DNA that was
wound around the core can be
determined. This length of 146
nucleotide pairs is sufficient to wrap
1.65 times around the histone core.

La estructura del nucleosoma (1997, alta resolucin) revela

como el DNA es empaquetado
Histonas: 102-135 aa
Motivo estructural (histone fold):
3 hlices conectadas por segmentos de pptidos
Interacciones hidrofbicas, 142 puentes de hidrogeno mantienen
al DNA (esqueleto fosfodiester) asociado con las histonas. Otras
interacciones dbiles como hidrofbicas, enlaces ionicos
Histonas ricas en lisina y arginina (1/5 de a.a. del ncleo de
histonas), neutraliza la carga negativa del backbone de la
hlice
Estas numerosas interacciones explican porque DNA de
cualquier secuencia puede ser enlazado por los nucleosomas
Porcin amino terminal larga sujeta a modificaciones covalentes
que controlan la estructura y funcin de la cromatina
Debido a su rol fundamental en el empaquetamiento de DNA son
una de las protenas altamente conservadas en eucariotas, lo que
indica que para su funcin se requieren todos sus aminocidos
Ej. Histona H4 de guisante y de la vaca difieren slo en dos
aminocidos de las 102 posiciones en la secuencia de aminocidos
Casi todas las mutaciones son letales

Figure 4-25. The structure of a nucleosome core particle, as determined by x-ray diffraction analyses of crystals. Each histone is colored
according to the scheme of Figure 4-24, with the DNA double helix in light gray. (Reprinted by permission from K. Luger et al., Nature 389:251 260,
1997. Macmillan Magazines Ltd.)

Figure 4-26. The overall structural organization of the core histones. (A) Each of the core histones contains an N-terminal tail, which is subject
to several forms of covalent modification, and a histone fold region, as indicated. (B) The structure of the histone fold, which is formed by all four of
the core histones. (C) Histones 2A and 2B form a dimer through an interaction known as the "handshake." Histones H3 and H4 form a dimer through
the same type of interaction, as illustrated in Figure 4-27.

Figure 4-27. The assembly

of a histone octamer. The
histone H3 H4 dimer and the
H2A-H2B dimer are formed
from
the
handshake
interaction.
An
H3-H4
tetramer forms the scaffold of
the octamer onto which two
H2A-H2B dimers are added,
to complete the assembly.
The histones are colored as in
Figure 4-26. Note that all
eight N-terminal tails of the
histones protrude from the
disc-shaped core structure. In
the x-ray crystal (Figure 4-25),
most of the histone tails were
unstructured (and therefore
not visible in the structure),
suggesting
that
their
conformations
are
highly
flexible. (Adapted from figures
by J. Waterborg.)

dos factores que determina donde

se forman los nucleosomas en el
DNA
La posibilidad de poder doblar
el DNA en dos giros alrededor
de este
que requiere la
compresin del surco menor
Ciertos dinucletidos son
fciles de comprimir:Cada

nucleosoma
tiende
a
posicionarse en reas del
surco menor ricas en A-T
pues es mas fcil de
comprimir que G-C
Otros
dinucletidos
enlazan ms fuertes que
otros
La presencia y naturaleza de
protenas enlazas al DNA
La posicin exacta de los
nucleosomas en un segmento
de DNA depende entonces de
factores que incluyen la
secuencia de DNA y la
presencia y naturaleza de
otras protenas enlazadas a
este.

Figure 4-28. The bending of DNA in a nucleosome. The DNA helix

makes 1.7 tight turns around the histone octamer. The diagram illustrate
how minor groove is compressed on the inside of the turn. Owing to
certain structural features of the DNA molecule, the indicated dinocluotides
are preferentially accommodated in such a narrow minor groove, which
help to expalins why certain DNA sequences will bind more tightly than
others to the nucleosome core

Los nucleosomas tienen una estructura dinmica y estn sujetos

frecuentemente a cambios catalizados por complejos
remodeladores de cromatina dependientes de ATP
Se pensaba que una vez formados los nucleosomas en una
posicin particular de DNA permanecan all debido a la fuerte
asociacin entre el DNA e histonas
Lo cual presentara problemas para la ejecucin de los
diferentes mecanismos genticos. Ej transcripcin y replicacin
Experimentos cinticos muestran que el DNA arrollado a un
nucleosomas se desenrolla cerca de 4 veces por segundo y
permanece as de 10 a 50 mseg antes de que se reforme

 Para la cromatina en la clula, una separacin de DNA e

histonas se requiere porque las clulas eucariticas
contiene
una gran variedad de Complejos
Remodeladores de cromatina dependientes de ATP
La subunidad en estos complejos que hidroliza ATP es
evolutivamente relacionada a las helicasas de DNA y enlaza a
ambos a el ncleo de histonas y al DNA
Mediante varios ciclos de hidrlisis de ATP cataliza el deslizamiento
del nucleosoma (nucleosome sliding) y permite el acceso de otras
protenas al DNA nucleosomal

 En adicin por medio de chaperonas de

histonas, los complejos remodeladores
pueden intercambiar o bien el dmero
H2A-H2B o el ncleo octamrico completo
Estn formados de 10 o ms subunidades
y su actividad es controlada por la clula,
a medida que los genes son o no
activados los complejos son trados a
regiones especficas donde actan
localmente para influenciar la estructura
de la cromatina

Fibra de 30 nm:
La cromatina en las clulas no se extiende como en los nucleosomas,
sino que estos se empaquetan unos sobre otros, generando arreglos
regulares en donde el DNA es ms altamente condensado formando
la fibra de 30 nm
Modelo:
Esta pregunta no tiene una respuesta definitiva, pero informacin
sobre la estructura ha sido obtenida
Zigzag que puede tener variaciones debidas al tamao diferente
del segmento de DNA que une a los nucleosomas obtenida por
cristalografa de rayos x
Pero la microscopia crioelectrnica apoya la formacin de
solenoides
La presencia de otras protenas y secuencias de DNA que son
difciles de plegar confieren a la fibra de 30nm con caractersticas
irregulares

Figure 4-29. Variations on the Zigzag model for the 30-nm chromatin fiber. (A and B) Electron
microscopic evidence for the top and bottom-left model structures depicted in (C). (C) Zigzag variations. An
interconversion between these three variations is proposed to occur by an accordion-like expansion and
contraction of the fiber length. Differences in the length of the linker between adjacent nucleosome beads
can be accommodated by snaking or coiling of the linker DNA, or by small local changes in the width of the
fiber. Formation of the 30-nm fiber requires both histone H1 and the core histone tails; for simplicity, neither
is shown here, but see Figures 4-30 and 4-32. (From J. Bednar et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:14173
14178, 1998. National Academy of Sciences.)

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Figure 4-30. Irregularities in the 30-nm fiber. This schematic view of the 30-nm
fiber illustrates its interruption by sequence-specific DNA-binding proteins. How these
proteins bind tightly to DNA is explained in Chapter 7. The interruptions in the 30-nm
fiber may be due to regions of DNA that lack nucleosomes altogether or, more
probably, to regions that contain altered or remodeled nucleosomes. Regions of
chromatin that are nucleosome free or contain remodeled nucleosome can often be
detected experimentally by the unusually high susceptibility of their DNA to digestion
by nucleases as compared with the DNA in nucleosomes.

Varios mecanismos probablemente actan juntos para formar la fibra de

30 nm
H1, mayor que las protenas nucleosomales, menos conservada.
Colas en la porcin amino terminal, principalmente la cola de la H4

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Regulacin de la Estructura de la Cromatina

Otros mecanismos crean una estructura cromatnica diferente de

la fibra de 30 nm en regiones diferentes del genoma
Utilizados para controlar muchos genes en eucariotas
Ciertas estructuras cromatnicas pueden ser heredadas
La estructura puede pasar directamente de una clula a sus
descendientes
Debido a que la memoria celular que resulta es basada en la
herencia de una estructura protenica ms que un cambio en en
la secuencia de DNA se denomina herencia epigentica (del
griego en o sobre) trmino apropiado porque este tipo de
herencia es superpuesta sobre la herencia gentica basada en
el DNA
Tiene un rol en la regulacin de genes y adems juega un rol
en el crecimiento, desarrollo y mantenimiento de organismos
eucariticos

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La
Heterocromatina
es
altamente
organizada e inusualmente resistente a
la expresin gentica
Se ha identificado (microscopia de luz) dos
tipos de cromatina en el ncleo interfsico
en eucariotas superiores
Heterocromatina: altamente condensada
Presente a lo largo de los cromosomas, pero es
altamente concentrada en regiones especficas
como en centrmeros y telmeros

Eucromatina:
(Eu=verdadero)

menos

condensada

 El DNA en heterecromatina contiene pocos

genes y los que son empaquetados aqu son
inactivados: silenciados
Heterocromatina no debe ser encapsulada como
DNA muerto, ms bien como creadora de
distintos tipos de cromatina compactada con
diferentes caractersticas que la hacen resistente
a la expresin gentica
La diferencia en expresin de los genes
dependiendo de su posicin (eucromatina o
heterocromatina): efecto de posicin
en Drosophila y en otros eucariotas como levaduras,
plantas y humanos

Los efectos de posicin asociados con la heterocromatina exhiben

una caracterstica llamada amontonamiento de efecto de posicin
(position effect variegation)
En Drosophila eventos de ruptura en los cromosomas que
directamente conectan una regin de heterocromatina con la
eucromatina tiende a inactivar los genes de eucromatina
cercanos
La zona de inactivacin se esparce a diferentes distancias
en diferentes clulas embrionarias, pero una vez la
condicin es establecida en un gene esta tiende a ser
heredada establemente en todas la progenie celular
Ej. De ojo moteado en Drosophila

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 El ncleo de histonas es covalente

modificado en sitios diferentes (Cdigo
de Histonas)
Porcin amino terminal de las 4 histonas
sufren
modificaciones
tales
como
acetilaciones y metilaciones de las lisinas y
fosforilacin de las serinas
Tambin la porcin globular del ncleo de los
nucleosomas

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 Todas las modificaciones son reversibles

Catalizado por enzimas especficas
Ej. Acetil-transferasas y deacetilasas (igual para el
grupo metil)
Cada enzima es reclutada a un sitio especfico en
la cromatina en tiempos definidos en cada clula
Depende de protenas reguladoras que enlazan
especficamente el DNA a lo largo del cromosoma
y en diferentes tiempos en la vida de un organismo
Algunas modificaciones en los nucleosomas pueden
persistir despus que la protena reguladora deja el DNA
y por lo tanto llevan memoria en la clula en desarrollo.

 Efectos:
Acetilacin de lisinas tiende a soltar la estructura de la
cromatina ya que el grupo acetil remueve su carga positiva
reduciendo la afinidad de las colas por los nucleosomas
adyacentes.
El efecto mayor es la atraccin de protenas especficas a
segmentos de cromatina modificados.
Estas protenas determinan cmo y cuando los genes sern
expresados, como tambin otras funciones biolgicas

 El nmero de marcas distintas en nucleosoma

individual es enorme. Cientos de miles de
combinaciones pueden existir
Otra diversidad es creada por variantes de las
histonas
Las combinaciones tienen un significado
especfico para la clula porque determinan
cmo y cundo es accesible el DNA que es
empaquetado en nucleosoma, lo que lleva a la
Hiptesis del cdigo de histonas
Ej. Una serie de marcas sealan que el DNA se ha replicado,
o que necesita reparacin, o cmo y cuando la expresin
gentica debe ocurrir

 Pequeos mdulos de protenas enlazan

especficamente
a
las
marcas
(modificaciones
covalentes
en
las
histonas)
Ej. Reconocen especficamente lisinas
trimetiladas en la histona H3
Actan en conjunto con otros mdulos como
parte de un complejo de lectura de cdigo
(code reader complex) para atraer complejos
adicionales de protenas y ejecutar un funcin
biolgica

Estructura de Variantes histnicas

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ImprontaGenmica
Unelementoreguladorcomounmejorador
puedeinterferirconlaregulacindelos
genescercanos
Paraimpedirestaactivacinimprecisahay
aisladoresparabloquearlosmejoradores
cuandoestosestansituadosentreel
promotoryelmejorador

 En la impronta genmica el mecanismo de

activacindegenesdependedeestosaisladores.
Aquciertosgenesautosomalespresentanpatrones
deherenciainusuales
Igf2 solo se expresa en un ratn si es heredado del
padre (Impronta materna porque la copia del gen
derivadodelamadreesinactivo)
H19 solo se expresa si es heredado de la madre
(improntapaterna,lacopiadelgenderivadodelpadre
esinactivo

 Consecuencias:Losgenesimprontadossolo
seexpresancomosihubieraunaslacopia
gen pero en realidad hay dos: herencia
monoallica
No se observan cambios en la secuencia del
DNA,ungenpuedeseractivooinactivoenla
descendenciasegnseaheredadodelamadreo
elpadre
Metilacionesenlasregionesreguladoras.Enel
carbono5decitosina
Herenciaepigentica
Marcaepigentica

Puedeafectarelanlisisdelagenealoga

Mating-type switching and gene silencing

Las clulas haploides de levadura son capaces
de cambiar su tipo celular
Varios loci:
Gen HO y los genes HMRa y HML
HO codifica una endonucleasas requerida para la
iniciacin del cambio
HMR y HML contienen cassettess de informacin
gentica no expresadas en las clulas de
apareamiento a y , son referidos como cassettess
silenciadores