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Microbiologa

del suelo

El suelo:
Un biotopo,
prcticamente
ignorado

EL SUELO
Es el principal medio en el que

crecen las plantas.


Es el soporte fsico que

continuamente les proporciona:


Los nutrientes inorgnicos
El agua
El entorno gaseoso adecuado para
los sistemas radicales.

Los nutrientes inorgnicos

que utilizan las plantas


provienen de la atmsfera y
de la meteorizacin de las
rocas de la corteza terrestre.
terrestre

Meteorizacin de la corteza terrestre


Los minerales son compuestos

inorgnicos que normalmente estn


formados por dos o ms elementos en
proporciones de peso determinadas
Ejemplo:
El cuarzo( SiO2 )
La calcita (CaCO3).

Las rocas se dividen en tres grupos

segn su origen y formacin:


gneas
Granito, basalto, cuarzo, feldespato

Sedimentarias
esquistos, areniscas, piedra caliza

Metamrficas
Areniscascuarcita,
Esquisto pizarra
Piedra caliza mrmol

Procesos de meteorizacin

desintegracin fsica y descomposicin


qumica de los minerales y las rocas
superficiales

producen los materiales inorgnicos que


formarn los suelos

Los suelos tienen

diferente origen y
composicin
Por lo tanto la
microfauna
asociada a ellos
tambin

La meteorizacin implica procesos:


Mecnicos

congelamiento y descongelacin
calentamiento y enfriamiento,
Qumicos

El agua se introduce entre las


partculas, y los materiales solubles
se disuelven en ella.
Biolgicos

CO2 de la respiracin y otras


sustancias descomponen las rocas

Meteorizacin mecnica

El agua y el viento transportan fragmentos


de roca a grandes distancias desgaste que
las fracciona en partculas ms pequeas

Meteorizacin qumica (corrosin)

Disuelven
cidos materiales
H2O + NO2 (NO3)
menos solubles
H2O + SO2

Meteorizacin orgnica-biolgica

Los cidos producidos por

plantas y las bacterias pueden


afectar las rocas.

La formacin del suelo puede ocurrir en:


El mismo sitio donde la roca es

meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios

por :
La gravedad
El viento
El agua
Los glaciares.

Materia orgnica del suelo


Origen de la materia orgnica del suelo:
Bacterias, hongos, algas, lquenes,
musgos y plantas que crecen sobre o
entre los minerales y las rocas
erosionadas
Plantas y animales muertos

Los microbios en el suelo


Contribuyen a la
Controlan la
formacin de materia
disponibilidad de
orgnica
muchos

nutrientes
importantes para
la convierten en cido
las plantas
carbnico o cidos
orgnicos

disuelven rocas.

La actividad

microbiana es
limitada por el agua
(sequa,humedad ) y
estado de los
nutrientes

La actividad

microbiana es clave
en la productividad
de los suelos.

Los microbios pueden existir varios

cientos de metros por debajo de la


superficie de la Tierra

Los mecanismos de sobrevivencia

an no se conocen

Seccin vertical del suelo:


Variaciones en el color
Cantidad de materia orgnica viva o
muerta (incluye microorganismos)
Porosidad
Estructura
Grado de meteorizacin.

Horizontes del suelo


Horizonte A
Horizonte B
Horizonte C

Horizonte A:
Capa superior del

suelo
La regin ms
superficial y de
mayor actividad
fsica qumica y
biolgica.

Contiene la mayor

parte del material


orgnico del suelo,
vivo o muerto:
Grandes cantidades
de partes de plantas
y hojas muertas
Insectos y otros
artrpodos pequeos
Lombrices de tierra
Organismos
descomponedores
Nemtodos

O2, N2, CO2


Desechos
orgnicos

Lluvia O2, NH3,


CH4, H2S

Suelo: Horizonte A
Rocas, silicatos

Inorgnicos
granulados
Residuos
orgnicos, humus
Agua (inundado,
mojado)
Gases (disueltos y
difusos)

Capa de agua

Sistemas
biolgicos (races,
insectos,
microobios)

En un gramo de suelo del horizante A


pueden haber:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos

Horizonte B:

Regin de
acumulacin

El horizonte B:
Contiene mucho

menos material
orgnico y est
menos meteorizado
que el horizonte
superior.
Hay pocos
microorganismos

Algunos materiales

del horizonte A,
llegan al B por
filtracin del agua a
travs del suelo:
xido de hierro
Partculas arcillosas
Pequeas cantidades
de material orgnico

Horizonte C:

Compuesto por rocas y minerales

fragmentados y meteorizados de
los cuales se ha formado el suelo
verdadero de los horizontes
superiores.
Los microorganismos son
escasos.

Composicin del suelo


Los suelos estn

formados de
materia slida y
espacio poroso
El espacio poroso
es ocupado por
diferentes
proporciones de
aire y agua,
dependiendo de
las condiciones de
humedad.

Poro

Pelcula de Agua

Materia orgnica
O2

CO2,
H2S,
CH4

Arena

Arcilla

Hifa
Bacterias

Los fragmentos de roca y minerales en el

suelo varan en tamao:


Partcula

Dimetro
en micrmetros
Arena gruesa >200 - 2000
Arena fina
>20 - 200
Limo
2 - 20
Arcilla
<2

Los suelos estn divididos segn su

textura:
Arenoso arcillosos: 35% o ms de

arcilla y 45% o ms de arena


Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40%

o ms de limo
Margosos o francos: contienen igual

proporcin de arena, limo y arcilla.


Ideales para la agricultura.

La textura del

suelo influye en las


comunidades de
microorganismos
porque de ella
depende la
aireacin y la
disponibilidad de
agua

Intercambio de catinico
Los nutrientes

Cl
inorgnicos para
Cl
- HCO
3
microorganismos
+
NO
K
3
+
+
Na
Na
y plantas estn
SO4-2
OHpresentes en la
Ca+ + Arcilla - Na+
solucin del
OH
-2
+ +
suelo como
SO4 Na+
Ca
K+ H+
iones.
HCO3-

NO3- HCO 3

OH-

Intercambio catinico:
Los cationes apresados por
las partculas de arcilla
Partculas de
pueden:
arcilla:
Ser reemplazados por
componentes
otros cationes
Ser liberados a la solucin esenciales de
los suelos
del suelo para ser
productivos.
tomados por plantas y
microorganismos.

Los aniones (NO3-,

SO4-2, HCO3-, y OH-)


son lixiviados del
suelo ms
rpidamente que
los cationes ya que
no pueden fijarse a
las partculas de
arcilla.

El fosfato, no puede

ser arrastrado, ya
que:
Forma precipitados
insolubles
Es absorbido o
adsorbidoen
adsorbido la
superficie de
compuestos que
contienen hierro,
aluminio y calcio.

La acidez o

basicidad del suelo


est relacionada
con la
disponibilidad de
nutrientes
inorgnicos para el
crecimiento de
plantas y microbios.

Los suelos varan

mucho en su pH,
y muchos
microorganismos
tienen un
estrecho margen
de tolerancia.

La gente

desconoce que
cuando tiene un
gramo de tierra en
el hueco de la
mano, tiene entre
un milln y mil
millones de seres
vivos en esa mano.

Una muestra de
suelo contiene:
Insectos pteros
Arcnidos
Sobretodo
filamentos de
hongos y de
bacterias.

La cuenta de

grmenes por
suspensindilucin muestra
ms de un milln
de grmenes por
gramo de tierra
arable

La riqueza de

especies y la
complejidad de la
delgada capa
cultivable
condicionan la
vida sobre la tierra,
del mismo modo
que la fotosntesis.

Ciclo de la materia orgnica


CO2

Fotosntesis

Restos vegetales
desaparecen bajo
la accin de la
microfauna y la
Cada de ramas, microflora del
hojas, frutos..
suelo
Microfauna del suelo

Microorganismos del suelo


Mineralizacin

Humificacin

CO2

Fotosntesis

Amontonamiento de

acculas de varios
centmetros.

Cada de ramas,
hojas, frutos..
Acidez frena actividad
microbiana
Acumulacin

Mineralizacin

Microfauna del suelo

Descomponedores casi ausentes:


hongos y bacterias
Humificacin

Papel de la microfauna del suelo:


Disgregacin de la materia orgnica
Diseminacin de la microflora

http://www.aecientificos.es/ElSuelo.html

Reutilizacin
por otros
organimos

microfauna

Multiplicacin
de la
microflora
de las heces

Seleccionan
los alimentos
para los
microbios
Aumentar
las
superficies
de ataque
para los
microbios.

Heces

Diseminacin
pasiva Transporte
accidental en la
superficie del
cuerpo

Invasin por
los microbios
del suelo

Reincorporacin de microorganismos al suelo

Disgregacin de la materia orgnica

Diseminacin activa
ELECCIN
con las heces de la
TRFICA:
microflora
Rgimen
intestinal
alimentario

Plantas y

microflora:
organismos
complementarios,
en la
mineralizacin de
la materia
orgnica

Los residuos

orgnicos no
consumidos van a
ser degradados por
la microflora. Son los
hongos, en primer
lugar, los que van a
atacar a la materia
orgnica fresca, y en
el siguiente orden

Mineralizacin de la materia orgnica


Descomposicin de hojas (Sucesin)
Tiempo (las fases pueden ser simultneas)

Hongos:
Hongos
glucfilos
celulolticos:
utilizacin de metabolismo
las
de la celulosa
sustancias
hidrosolubles

Hongos
lignolticos :
degradacin
de la lignina

Bacterias: transforman residuos fngicos y


productos no consumidos por las hifas.

Plantas y

microorganismos son
complementarios: unos
fabrica materias
carbonadas, otros libera
minerales

CAPA VEGETAL DEL SUELO


Materia inorgnica
Materia orgnica

Microorganismos
CO2

Hojas de las
plantas

Fotosntesis

H2O

Material mineral
no utilizado por los
microorganismos

Races de las
plantas

Proteccin de los microorganismos ante


desequilibrios ambientales
Cuando se aade materia orgnica a

los suelos agrcolas, las bacterias


consumen todo el carbono disponible.
Consecuencia: rarefaccin, e incluso
desaparicin, de los microorganismos.

Para estos casos, la naturaleza ha

creado sistemas de proteccin para


que los microorganismos sobrevivan

Estructuras de proteccin de los hongos


Clamidospora: clula latente, con

pared gruesa y cuyo contenido es rico


en reservas
Esclerote: esfera cuyo envoltorio
externo est constituido de hifas
muertas de pared gruesa, y el centro
de filamentos vivos ricos en reservas,
en estado latente.

Estructuras de proteccin delas bacterias


Las (Gram+)

forman
endosporas.

Las Gram- estn

desprovistas de
mecanismos de resistencia

Susceptibles Forman agregados

de sobrevivir biolgicos cuando las


condiciones son
muchos aos
en condiciones desfavorables
desfavorables. La actividad celular y las
divisiones, se hacen ms
lentas.

Numerosos

Se forman cuando

procariotas para
las condiciones
protegerse exudan
ambientales llegan a
en su superficie
ser desfavorables
polisacridos que se
adhieren a lminas
de arcilla.
Desaparecen cuando
Son estructuras
las condiciones
pedolgicas vuelven
que permiten la
a ser adecuadas
supervivencia de las
bacterias

Estas formaciones

tienen un dimetro
que vara de 10 a
1000 mm y pueden
contener varios
miles de grmenes.

Los polisacridos tienen varias funciones:


La superficie de bacterias y arcillas tienen

cargas elctricas negativas, mientras que los


azcares son neutros, tienen por tanto un
papel aislante.

Los azcares tienen tendencia a retener

agua, evitan evaporacin en perodos


secos.

Constituyen reservas. En ausencia de


alimentos, las bacterias toman el carbono
necesario para el mantenimiento de las
funciones vitales esenciales.

Para los microorganismos del

suelo vivir en el espacio


interagregado (poros) y el
agregado mismo (granos)
tiene implicaciones
importantes

Este es el

En el espacio
interagregado las
condiciones son
drsticas:
La humedad y la
aireacin varan
muy rpidamente.

microhabitat
colonizado por las
bacterias Gram+,
que poseen la
facultad de
producir
endosporas.

Las esporas de los

hongos y las de los


actinomicetos, son
muy resistentes a
la desecacin.

Por el

Aparecern rpidamente

condiciones de
contrario, el
anaerobiosis.
agregado
En este medio tan estable
mismo es
viven o sobreviven las
recorrido slo
bacterias Gram-.
por finos
capilares de
Aunque sensibles a las
alrededor 2
modificaciones
mm de
ambientales, permanecen
dimetro, que
vivas en suelos secos
slo permiten
durante ms de un ao
una circulacin
gracias a la proteccin de
lenta de aire y
los agregados
de agua.

La composicin qumica y fsica de los


agregados es variable.
El suelo es un medio muy

heterogneo

Est constituido de un

mosaico de microhabitats
cuya composicin biolgica
vara cualitativa y
cuantitativamente en funcin
del tiempo, y de la fuente
trfica disponible.

Unos agregados

pueden formarse
alrededor de citina,
desarrrollndose en
su seno los llamados
citinolticos.
Otros encerrarn
residuos de lignina
permitiendo el
crecimiento de los
ligninolticos.

Los microorganismos

que colonizan estos


microhabitats
difieren igualmente
tanto por su
morfologa, como por
sus requerimientos
ecologicos.

Influencia del ambiente


del suelo en las
poblaciones de
microorganismos

Nunca se dan
condiciones
Aunque los
ambientales idnticas:
microorganismos
Las que favorecen la
son ubicuos, en
reproduccin de un
pocas situaciones
microorganismo, o
existen poblaciones
permiten la
iguales.
sobrevivencia de otro,
pueden ser
desfavorables para la
existencia continuada
de un tercero.

El suelo de un pinar

Los suelos

cultivados y de
jardn tienen
abundancia de
oxgeno y agua y
son ricos en
nutrientes
aportados por
las fertilizaciones

suele ser muy cido y


su contenido en
principios nutritivos es
bajo
Los terrenos
pantanosos estn
inundados, tienen poco
oxgeno y contienen
abundante materia
orgnica en
descomposicin.

Estas diferencias se reflejan en la microflora

Para comprender la influencia de

los factores que afectan la


microflora del suelo es necesario:
Conocer las condiciones
normales de crecimiento de los
microorganismos
Los efectos que las condiciones
extremas ejercen sobre los
distintos grupos.

Factores que afectan en mayor grado a las


poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO
AcidezAlcalinidad

TEMPERATURA

POBLACIONES DE MICROORGANISMOS

DISPONIBILIDAD DE
OXGENO, AGUA Y
SUSTANCIAS
NUTRITIVAS

TCNICAS DE
MANEJO DEL
SUELO

Consideremos estos
factores
separadamente,
pero deberemos tener
en cuenta que de
ordinario son
interdependientes.

Temperatura (Psicrfilos, Mesfilos y Termfilos).


TEMPERATURA DE CRECIMIENTO DE LOS
MICROORGANISMOS
Tipo de
micro-

Temperatura Temperatura
ptima
s lmite

Ejemplo de
microorganismo

organismo
Psicrfilas

Alrededor
20o C

5a30o C

Mesfilas

25 a 37o C

5 a 45o C

Termfilas

Superior a
45o C

40 a 80o C

Achromobacter

Staphylococcus ,
Mayora de los
hongos.

Desulfovibrio,
Thermoactinomyce
Algunas algas
s,
verdes azules

Fermentacin del estircol:


La temperatura puede elevarse
hasta 65 o C, destruyendo todos
los microorganismos, excepto a
los termfilos, como el Bacillus
calfactor , Thermoactinomyces
spp y los hongos termfilos.

En suelos del piso trmico tropical y

premontano son ms frecuentes:


Fusarium, Aspergillus y Rhizopus

Penicillium crece mejor en suelos ms

fros.

REQUERIMIENTOS
NUTRITIVOS
Utilizacin de energa lumnica
Oxidacin quimioautotrfica de

materias inorgnicas
Respiracin hetertrofa de materia
orgnica
Fermentacin de materia orgnica

Existe competencia entre

los microorganismos por


utilizacin de los
nutrientes orgnicos e
inorgnicos.

En el suelo la

materia orgnica
fcilmente
utilizable por los
microorganismos
es ordinariamente
reducida, lo que
limita su
velocidad de
multiplicacin.

Al aadir al suelo materiales


frescos, estircol o desechos
vegetales

el nmero de microorganismos aumenta


rpidamente

los nutrientes se agotan

poblacin de microorganismos vuelva


nivel anterior.

Como un microorganismo
determinado no puede
utilizar igualmente todos los
substratos

su incidencia y proporcin
varan de acuerdo con las
situaciones

Opionibacterium

acta como
barrendero de
medios nutritivos
parcialmente
degradados por
microorganismos.

En el rumen utiliza

cido lctico y
glucosa producidos
por las bacterias
celulticas y las del
cido lctico.

Lactobacillus

compite eficazmente
cuando existen
Crece bien en la
carbohidratos
leche y en el rumen
simples pero es
pero no en el suelo.
incapaz de
metabolizar
sustancias como
lignina.

Otros
microorganismos
degradan lignina y
Pero no en leche,
celulosa
donde compiten con

microorganismos
sobrevivien en el suelo
como Bacillus y
y en el manto en
Lactobacillus
descomposicin de
los bosques

En una poblacin mixta solo unos

pocos microorganismos son


capaces de metabolizar una
sustancia determinada, como
insecticidas y herbicidas, estos
microbios se ven libres de
competencia.

Los auttrofos no

compiten por
nutrientes
orgnicos con otros
microorganismos.
Slo compiten por
luz.

Desarrollo de

Nitrosomonas y
Nitrosobacter es
limitado por
compuestos
nitrogenados
apropiados.

OXGENO
Los requerimientos de oxgeno de los
microorganismos varan:
Aerobios
Anaerobios
Microanaerobios
Anaerobios

facultativos

El oxgeno

determina el
desarrollo de
poblaciones de
microorganismos
en detrimento de
otras.

En el ensilado, los forrajes son

comprimidos y recubiertos para:


Establecer condiciones de
anaerobiosis con el fin de promover
el crecimiento de microorganismos
anaerobios tiles o microaerfilos
como Lactobacillus
Mientras se impide el desarrollo de
los que tienden a descomponer el
forraje (pudricin).

En suelos poco aireados

hay competencia por el


uso del oxgeno
El oxgeno es
disponible y ello puede
esencial para
llevar a un descenso en la
muchos
microorganismos proporcin de
microorganismos aerobios
fijadores de
En consecuencia
nitrgeno.
disminuye la fijacin de
nitrgeno y tambin de la
velocidad de degradacin
de la materia orgnica.

El nivel de aporte de oxgeno

tambin determina la forma de


metabolizacin de los nutrientes.
Los anaerobios facultativos metabolizan los

polisacridos aerobicamente en presencia de


oxgeno, descomponiendolos hasta dixido
de carbono y agua con alta liberacin de
energa.
Cuando no hay oxgeno lo hacen
anaerobicamente, mediante el proceso de
fermentacin, en el cual la degradacin slo
es parcial y con poca liberacin de energa.

pH
El pH ptimo para la

mayora de las
bacterias, algas y
protozoos est
alrededor de 7.

Con pocas

excepciones estos
microorganismos no
crecen por debajo
de un pH de 4 o por
encima de un pH 9.

Los

actinomicetos
y las algas son
sensibles a los
cidos y su pH
ptimo est
entre 7.5 y 8.

Thiobacillus,

Acetobacter y la
bacteria fijadora de
nitrgeno
Beijerinckia, son
capaces de crecer y
multiplicarse a pH
entre 2.5 y 3.5.

El pH ptimo para

os hongos son

las levaduras y los


resistentes a los
hongos vara entre
cidos
3.1 y 6.0, mientras
Algunas especies de
sus pH extremos de
hongos crecen a pH
crecimiento son 1.6
entre 1.6 y 2.0
y 9.5.

En suelos con pH

mayores a 7
predominan las
bacterias, en
especial los
actinomicetos, y en
menor proporcin
los hongos.
micorrizas.

El efecto del pH afecta el desarrollo de


los microorganismos:
Cuando el pH baja:
Declina el nmero de bacterias
Mientras sube el de levaduras, hongos y
bacterias resistentes a la acidez.
A pH extremadamente bajos la

proporcin de bacterias puede disminuir


hasta el 60%.

La acidez del

suelo
influencia las
bacterias de
los ndulos
de la raz de
las
leguminosas

En suelos cidos suele

envolverse la semilla en
una capa de cal, que
neutraliza la acidez
circundante, promueve la
multiplicacin de
Rhizobium y permite
buena nodulacin de la
leguminosa husped.

AGUA
Todos los

microorganismos
necesitan agua,
aunque sus
requerimientos
varan.

Las formas

vegetativas de las
bacterias son
menos resistentes a
la desecacin que
los hongos o los
actinomicetos.

Las endosporas

termoestables
producidas por las
bacterias, como
Bacillus y
Clostridium, son
resistentes a la
desecacin.

Las bacterias

esporuladas, los
actinomicetos y
los hongos son los
contaminantes ms
frecuentes del aire
porque son
resistentes a la
desecacin.

En los materiales de

potencial osmtico
alto el agua es poco
asequible a los
microorganismos.

Los suelos

salinizados suelen
tener presiones
osmticas altas que
inhiben el
crecimiento de la
mayora de los
microorganismos y
races, exceptuando
los halfilos.

El exceso de agua en el suelo

suele causar encharcamiento y


prdida de oxgeno en los
capilares del suelo lo cual hace
que disminuyan los
microorganismos aerobios y
aumenten los anaerobios.

Tcnicas de manejo del suelo

Las poblaciones de microorganismos del


suelo, se pueden:
Disminuir o erradicar por perturbaciones

importantes del suelo


Favorecer con prcticas adecuadas.

FACTORES LIMITANTES DE LA

MICROBIOTA DEL SUELO

Erosin y baja disponibilidad de nutrientes


Fertilizacin mineral y correctivos
Presencia de antagonistas, parsitos y

depredadores
Temperatura y pH extremos
Extremos en los contenidos de aire y
humedad

Textura del suelo y concentraciones

txicas de metales pesados


Uso de plaguicidas, especialmente los
de amplio espectro. Desinfeccin,
fumigacin y esterilizacin del suelo
Inundaciones y malos drenajes

Aradas profundas, volteo del suelo y

solarizacin.
Sistemas de produccin y explotacin
del suelo (monocultivo, cultivos
intesivos sin manejo adecuado, minera
a cielo abierto).

PRCTICAS QUE FAVORECEN LA DENSIDAD


Y LA ACTIVIDAD DE LOS
MICROORGANISMOS
Mantenimiento de la biodiversidad

dentro de los cultivos y en las


fincas.
Coberturas
vegetales,
abonos
verdes y alcolchados
Inoculacin de suelos y semillas
con microorganismos y eliminacin
de competidores.

Incorporacin de compost,

fracciones lquidas y slidas de


biodigestores, humos, excretas,
restos de cosechas y otros
residuos vegetales
Agentes naturales de control:
control biolgico, plaguicidas
botnicos, control cultural.