CAPITULO 8

METABOLISMO
MICROBIANO

Introduccin
EL METABOLISMO.
Los seres vivos dirigen las
reacciones qumicas hacia la
sntesis de macromolculas que
formarn parte de la biomasa, que en
ltimo trmino dar el crecimiento de
los microorganismos.
Conjunto de reacciones qumicas que se
dan dentro de una clula.
Es un flujo energtico.

Reacciones catablicas y
anablicas
ANABOLISMO: Formacin o
sntesis de compuestos qumicos
(Biosntesis)
CATABOLISMO: Degradacin o
descomposicin de compuestos

Productos de
desecho
Nutriente
s

Energa
Energa

Anabolism
o
Componente
s celulares

para el
desarrollo

para el
movimiento,
transporte
de
nutrientes,e
tc

Catabolism
o

Fuente de
energa

MECANISMOS DE PRODUCCIN DE
ENERGA
Oxido-reduccin
Generacin de ATP: tipos de
fosforilacin
Modelos nutricionales de los
organismos
a)
Fotoauttrofos
b)
Fotohetertrofos
c)
Quimioauttrofos
d)
Quimiohetertrofos

EntrminosdelafuentedeenergaydeCarbonoparalaformacinde
componentescelulareslosorganismosseclasificanen:
Todoslosorganismos

Quimitrofos

Fottrofos

Compuestosqumicoscomofuentedeenerga

Luzcomofuentedeenerga

Quimiolittrofos

Quimioorgantrofos

Qumicosinorgnicos

Qumicosorgnicos

Quimiolitoauttrofos

Mixtrofos

C=CO2

C=orgnico

Hetertrofos

Fotoauttrofos
C=CO2

Fotohetertrofos
C=orgnico

Fottrofos

Hetertrofo . - (Quimitrofo)
Organismo que utiliza un compuesto orgnico
como
fuente de carbono y energa. La clula oxida los
compuestos orgnicos para producir energa
(catabolismo)
y despus utiliza esta energa para sintetizar material
celular
(anabolismo).
Muchas bacterias pero slo pocas arqueas son
hetertrofos.
Las bacterias son las maestras de la degradacin en el
medio ambiente.
El metabolismo hetertrofo es llevado
a cabo principalmente por dos procesos:

Hetertrofos
Fermentacin alcohlica
Fermentacin lctica
Fermentaciones nicas (A partir del
patrn de Embden-Meyerhof )
Otros tipos de fermentacin (EntnerDoudoroff )
Respiracin aerobia
Respiracin Anaerobia

QUIMOTROFOS
(quimiorgantrofos)
1) Fermentacin
En la cual el proceso redox ocurre en ausencia de
aceptores de electrones terminales.
La obtencin de energa es poca, ya que el piruvato
no est oxidado totalmente.
2) Respiracin (en general)
En la cual hay un aceptor terminal de electrones.
La glucosa est totalmente oxidada a CO2 por lo tanto
se obtiene ms energa

Rutas bioqumicas de
produccin de energa
Catabolismo de hidratos de carbono
a)
Gluclisis
Ruta de las pentosas-fosfato
Ruta de Entner-Doudorof
b) Respiracin
c)
Respiracin aerbica
El ciclo de Krebs.
Cadena de transporte de electrones.
Fermentacin lctica
Fermentacin alcohlica

Fermentacin
Metabolismo antiguo HETERTROFO
Energa de la oxidacin parcial de un
compuesto
orgnico
usando
intermediarios
orgnicos
como
donadores y aceptores de electrones
(NAD/NADH2).
No existen aceptores externos (como O 2)
ni sistemas membranales de transporte.
Todo el ATP se forma por fosforilacin de
substrato

Modelodefermentacin
Agenteoxidante(tomaelectrones)

Pierdeelectrones
laenergaliberadaseusa
paraformarATP

Ganaelectrones

Agentereductor(donaelectrones)

Fermentacin
Gluclisis + Reduccin del sustrato
final.
En procariontes 3 tipos de gluclisis:
Embden-Meyerhof (bacteria y
eucariontes como Saccharomyces).
Va Heterolctica
Entner-Doudorof
El resultado de la fermentacin
depende de la reduccin del sustrato
final de la gluclisis.

Embden-Meyerhof
Estas fermentaciones pueden
llevar a un amplio espectro de
productos dependiendo de los
pasos de reduccin despus de la
formacin de piruvato.

Tipos:
a) Fermentacin alcohlica:
a partir de piruvato se obtiene
alcohol.

b) Fermentacin del cido

lctico: ocurre en clulas de
msculo humano faltas de
oxgeno en donde el lactato es un
producto de deshecho.

Calambre
muscular

Fermentaciones tipo
Embden-Meyerhof

Alcohlica = etanol (levadura). Cerveza, pan

Homolctica = ac. Lctico (Lactobacillus y estreptococos)
yogurt, crema cida, queso cottage
De cidos mixtos = Lactato, acetato, formato, succinato,
etanol + (CO2 y H2 si hay formato deshidrogenasa)
Entricas fecales: E. coli, Salmonella, Shigella.
De butadienol = Lactato, acetato, formato, succinato,
etanol + 2,3-butadienol Entricas no fecales: Klebsiella,
Enterobacter.
Del cido butrico = ac. Butrico + acetato + CO2 + H2 +
etanol + isopropanol. Clostridia (grandes fermentadores)
Butanol-Acetona = butanol + acetona . Clostridium
acetylobutylicum produccin de acetona, necesaria
para plvora
Del cido propinico = ac. Propinico. Tipo de
fermentacin rara. Propionibacter. Fabricacin de queso
suizo.

EmbdenMeyerhof
alcohlica

Gluclisis

piruvato

Piruvato
descarboxilasa

Reduccin

Etanol

EmbdenMeyerhof
DeButadienol

Homolctica

Delcido
propinico
Decidosmixtos

Butanolacetona

Heterolctica
Eficiencia1/2deEmbdenMeyerhof

cidoLctico
Etanol
Lactobacillus
Leuconostoc

Fosfoquetolasa
Rompelapentosaen
uncompuestode3Cy
otrode2C

EntnerDoudoroff
Eficiencia1/2deEmbdenMeyerhof

Etanol

Zymomonasvive
ensuculentascomo
magueyygracias
alafermentacinse
producepulquey
derivadosalcohlicos

La diferencia entre EM,

Heterolctica y ED es que:
1) La oxidacin por NAD de los compuestos
orgnicosas asociada a la formacin de ATP en
Heterolctica y ED ocurre en una sola de las
molculas de C y en EM en dos. La formacin de ATP
est asociada a la oxidacin del sustrato (mov. De
Pathway
Ethanol
Lactate
electrones).
CO2
ATP
2) EM logra 2 ATP y ED y Heterolctica logran 1ATP
Embden-Meyerhof
Saccharomyces

Embden-Meyerhof
Lactobacillus

Heterolactic
Streptococcus

Entner-Doudorof
Zymomonas

Respiracin
Aerobia: el aceptor final de electrones
es O2 (se reduce y se forma H2O).
Anaerobia: el aceptor final de
electrones no es O2.

Compuesto
orgnico

ADP ATP
Fosforilacin oxidativa

Flujo de e- y generacin
de protones (H+)

Oxidacin

Ciclo de Krebs

CO2

O2 (aceptor
Final de electrones)

Reduccin
Transportador
deelectrones

Oxidacin

Reduccin

Respiracin
Gluclisis + Ciclo de Krebs o del
cido Tricarboxlico (TCA)

Gluclisis

TCA

Algunosejemplosderespiracinen
procariontes

Electron
Aceptor

reduced end
product
name of process

O2
H 2O
Escherichia, Streptomyces
NO2, NH3
o N2
Bacillus, Pseudomonas

organism

aerobic respiration

NO3

SO4
S o H2S
Desulfovibrio

denitrification
sulfate reduction

Respiracin anaerobia
Denitrificacin
Los nitratos (NO3) son aprovechados para la
construccin de material celular por las
plantas.
El uso de nitratos como aceptores de
electrones en la cadena respiratoria es
normalmente una alternativa al uso de O2.
Si bacterias del suelo como Pseudomonas o
Bacillus usan O2 como aceptor de electrones
dejan disponible los nitratos del suelo y los
cultivos pueden aprovecharlos. Por ello es
necesario mantener bien aireados los cultivos.

CiclodelNitrgeno

Pseudomonas
Bacillus

Descomponedores

Nitrobacter

Nitrosomonas

Reduccin de sulfatos
No es alternativo al uso de O2 es un
proceso obligado de condiciones
anaerobias.
SO4 ----- S o H2S (ac. Sulfhdrico)
Los metangenos y reductores de
sulfato pueden compartir el
hbitat.

Ciclodelazufre

Desulfovibrio

Thiobacillus

Reduccin de carbonatos
Utilizan al carbonato (CO2) como
aceptor terminal de e-.
A pesar de que el poder reductivo del
CO2 es muy bajo, este anin es uno
de los ms comunes en la
naturaleza.
Los metangenas
y arqueas.
HC0 + 4H + H CH + 3H O
3

Importancia de respiracin
anaerobia
Metangenos y Bacterias de
respiracin anaerobia juegan
papeles importantes en los
ciclos del carbono, nitrgeno
y azufre.
Convierten las formas

Litotrofa
Uso de un compuesto inorgnico como
fuente de energa.
La mayora de las bacterias littrofas
son respiradoras aerobias (oxidadoras
de compuestos inorgnicos):
Remueven electrones de un substrato y los
ponen en un sistema de transporte de
electrones que producir ATP.

Grupos fisiolgicos de littrofos

grupo fisiolgico

Fuente de
energa

producto final oxidado

organismo

bacterias del
hidrgeno

H2

H2O

Alcaligenes, Pseudomonas

methanogens

CO2

CH4

Methanobacterium

carboxydobacteria

CO

CO2

Rhodospirillum, Azotobacter

nitrifying
bacteria*

NH3

NO2

Nitrosomonas

nitrifying
bacteria*

NO2

NO3

Nitrobacter

sulfur oxidizers

H2S or S
Ac.Sufhidrico

SO4

Thiobacillus, Sulfolobus

iron bacteria

Fe

Fe+++

Gallionella, Thiobacillus

++

Los littrofos anaerobios metabolizan las formas reducidas de nitrgeno (NO2,

NH3, N2) a sus estados oxidados (NO3) para producir energa, contribuyendo as al
reciclaje de nutrientes.

Oxidaciones litotrficas

Fottrofos
Los organismos fottrofos utilizan la luz
como
fuente de energa. Es decir, convierten la
energa
luminosa en energa qumica utilizable
para la
clula.
OBTENCIN DE ENERGA QUMICA (ATP)
A PARTIR DE LUZ PARA LA INTEGRACIN

Lasplantasyalgasverdes,ascomobacteriasverdesy
cianobacteriasabsorbenrojoyazulreflejandoelverde,de
ahsucolor

Unodelospigmentosfotosintticosms
famososeslaclorofila,peronoeselnico

Otrospigmentosinvolucradosenlafotosntesis:

Modelogeneraldefotosntesis

Fotosntesis oxignica
2 fotosistemas
Produccin de oxgeno por la
fotlisis de agua
Plantas, Algas, Cianobacterias
Clorofila a principalmente

Enplantas,algasy
cianobacteriasexistendos
fotosistemas
Involucradosenfotosntesis
(FSIyFSII).
Enelrestodelasbacterias
fotosintticassloexisteFSI
FOTOSNTESISOXIGNICA
FSIyFSII
H2Ocomodonadordeelectrones
FSI+FSII=ATP+NADPH
FSI=ATP

Fotosntesis anoxignica
La realizan todas las bacterias
fotosintticas salvo
cianobacterias.
Un fotosistema sloexisteFSI
No hay produccin de oxgeno
Bacterioclorofilas, carotenos.

Fotosntesis anoxignica

PMF: fuerza protn-motriz).

Bacterioclorofila
Las bacterioclorofilas son unos pigmentos fotosintticos que se
encuentran en varias bacterias fototrofas.
Estn relacionadas con las clorofilas, que son los pigmentos
primarios en plantas, algas, y cyanobacterias.
Los grupos que contienen bacterioclorofila realizan la fotosntesis
pero no producen oxgeno. Usan longitudes de onda de luz que no
son absorbidas por las plantas.
Los diferentes grupos contienen diferentes tipos de
bacterioclorofila:
Bacterioclorofila a, Bacteria prpura, Chloracidobacterium
thermophilum
Bacterioclorofila b, Bacteria prpura.
Bacterioclorofila c, Bacteria verde del azufre, Chloroflexi,
Chloracidobacterium thermophilum.
Bacterioclorofila d, Bacteria verde del azufre.
Bacterioclorofila e, Bacteria verde del azufre.

Las bacterias prpuras del azufre o bacterias

rojas del azufre,
son capaces de realizar la fotosntesis.
Son organismos anaerobios o microaerfilos, se encuentran
principalmente en manantiale sulfurosos o en agua estancada.
A diferencia de las plantas y algas, ellas no usan agua como
agente reductor, as que no producen oxgeno. En lugar de H2O
usan H2S ( sulfuro de hidrgeno), que al oxidarse produce
grnulos de sulfuro, y se puede volver a oxidar
produciendo cido sulfrico.
Su fotosntesis anoxignica (y cclica) utiliza bacterioclorofila,
bacteriofeofitina (sin Mg+2), coenzima Q (el N.A.D.H+H entra en
un flujo inverso de electrones), citocromo bc1, citocromo c2
hasta P870, que se excita con fotones infrarrojos y rojos.
Viven tambin en la columna de agua y en el metalimnion.
Adems poseen carotenoides y no tienen ficobiliprotenas.

Diferencias entre la fotosntesis bacteriana y la d

fotosntesis
planta

organismo

cyanobacteria

purple and green bacteria

Tipo de clorofila

chlorophyll a
absorbs 650-750nm

bacteriochlorophyll
absorbs 800-1000nm

Photosystem I
(fotofosforilacin cclica)

de

la

fotosntesis bacteriana

Presente
presente (no cclico)

Fotosistema I I
(noncyclic
photophosphorylation)

Presente

produce O2

si

no

H2O

H2S, other sulfur compounds or

ciertos compuestos orgnicos

Donante de electrn fotosinttico

ausente

Catabolismo lipdico

cido
graso

Glicerin
a

cido
graso

cido
graso
Lpido

Glicerina
3 cidos
grasos

Catabolismo proteico
Las protenas son demasiado grandes para
atravesar las membranas
Los microorganismos excretan proteasas que
hidrolizan las protenas exgenas a pptidos.
Proteasas
Peptidasas
Protenas----- Pptidos-------
Aminocidos

Los esqueletos carbonados de los

aminocidos entran en el ciclo ATC para
sufrir una mayor oxidacin va acetil CoA,
cido cetoglutrico, cido succnico, cido
fumrico o cido oxaloactico

UTILIZACIN DE LA
ENERGA POR LOS
MICROORGANISMOS

LA CLULA MICROBIANA
ENERGA PARA:
El movimiento.
La produccin de calor.
La electricidad.
Biolumniscencia.

UTILIZA

LA

LA CLULA MICROBIANA UTILIZA LA ENERGA

QUMICA PARA:
Sintetizar grandes
molculas a partir
de otras ms
pequeas.

Transportar sustancias
hacia la clula
microbiana y
organizarlas en su
interior.
Sacar las sustancias de
desecho de la clula
microbiana o para
El trabajo mecnico
realizar la secrecin
de las clula
microbianas.

RUTAS BIOQUMICAS QUE

UTILIZAN ENERGA
(ANABOLISMO)

Biosntesis de
Biosntesis de
Biosntesis de
Biosntesis de
pirimidinas

polisacridos
lpidos
aminocidos
purinas y

Metabolismo Primario
Implica producir la energa, y las
molculas que la clula necesita para sus
acciones vitales de supervivencia y
reproduccin.
Componentes esenciales y productos
formados
por
los
microorganismos:
protenas, cidos nucleicos, polisacridos
(dextranos, alginatos, gelanos, xantanos)
y poliesteres (PHB y plsticos), cidos
grasos
(saturados e insaturados),
esteroles (ergosterol)

(a). Metabolismo primario: la formacin de alcohol a partir

del azcar, por la levadura.

Metabolismo Secundario

La formacin de productos es
consecuencia de una serie de
reacciones internas que la clula
realiza como una forma de defensa
contra condiciones adversas.

(b) Metabolismo secundario: la formacin de penicilina por el hongo

Penicillium chrysogenum, mostrando la separacin entre la fase de
crecimiento (trofofase) y la fase de produccin (idiofase). Observe que,
en la mayora del producto se produce despus de que el crecimiento ha
entrado en fase estacionaria.

RELACIN ENTRE TIPO DE METABOLISMO Y

CONSUMO DE SUSTRATO
Sustratode
crecimiento

Sustratode
crecimiento

Clulas
Clulas

Metabolito
Primario

Lasclulasyelmetabolitoseproducen
msomenossimultneamente

Metabolito
Primario

Metabolito
Secundario

Despusdeproducidaslasclulasyel
metabolitoprimario,lasclulas
conviertenelmetabolitoprimarioen
unosecundario

Sustratode
crecimiento

Clulas

Metabolito
Primario

Metabolito
Secundario

Despusdeproducidaslasclulasel
sustratoseconvierteenunmetabolito
secundarioduranteunposterior
crecimiento

TROFOFASE E IDIOFASE
Trofofase.

Fase de rpido crecimiento celular o

de crecimiento exponencial, en la que la clula usa
un sustrato principal y se producen los procesos
metablicos primarios que suceden con una rapidez
suficiente para permitir la reproduccin celular (el
prefijo trofos significa crecimiento).
Idiofase. Fase de no crecimiento celular, en ella
se dan procesos propios de la idiosincrasia de cada
clula, y en la que esta puede usar los metabolitos
primarios u otras molculas inductoras del medio
para producir molculas (metabolitos secundarios)
que parecen servir para favorecer su subsistencia
en condiciones desfavorables (de stress).
La idiofase generalmente esta asociada a la fase
estacionaria del ciclo de crecimiento celular en un
proceso batch

METABOLITOS PRIMARIOS Y
SECUNDARIOS
Metabolito Primario

Formacindealcohol
apartirdeazcarporlalevadura

Metabolito secundario

Formacindepenicilinaporel
hongoPenicilliumchrysogenum
Trofofase

Idiofase

Clulas
Penicilina

Alcohol

Azcar

Clulas

Azcar

Caractersticas de metabolitos
secundarios
No parecen ser esenciales para el crecimiento y
reproduccin del microorganismo.
Se producen en la idiofase celular. Por esta razn
su produccin se hace generalmente en la fase
estacionaria del desarrollo celular
La formacin de metabolitos secundarios es
extremadamente dependiente de las condiciones
ambientales, especialmente de la composicin
del medio.
Se producen paralelamente con procesos de
diferenciacin celular, como la formacin de
esporas bacterianas

Causas del metabolismo

secundario

Los factores que ponen en marcha la produccin de metabolitos

secundarios al final de la trofofase no se conocen.
Unicamente se sabe que el mecanismo se dispara cuando algn
nutriente del medio se ha agotado.
En algunas ocasiones el nutriente responsable es una fuente de
Carbono, el Nitrgeno o el Fsforo.
Cualquiera que sea el mecanismo general por el que se dispara el
metabolismo secundario al final de la trofofase, es un hecho que
en este punto hay unos cambios muy fuertes en la composicin
enzimtica de las clulas, apareciendo los enzimas que estn
especficamente relacionados con la formacin de metabolitos
secundarios.
Sin embargo, e independientemente de este aspecto general del
metabolismo secundario, se ha puesto de manifiesto la existencia
de sistemas de regulacin que juegan un papel importante en la
sntesis de determinados productos industriales.

Ejemplos: metabolitos secundarios

Antibiticos : Penicilina, cefalosporina,
griseofulvina
Micotoxinas : Aflatoxinas, deoxinivalenol,
patulina, alcaloides del ergot
Melaninas
Hormonas sexuales