Aminocidos, Pptidos y

Protenas
Descripcin, funcin, clasificacin
Importancia en la medicina y en la industria
Samuel Vizcano Pez

AMINOCIDOS
Son las unidades fundamentales (monmeros) de las cuales estn conformadas
las protenas (polmeros).
Existen 20 de ellos que se consideran principales por ser los que se encuentran
comnmente en casi todas las protenas.
Poseen nombres comunes o derivados de las fuentes de donde fueron aislados
por primera vez. e.g. Asparagina por Asparagus (esprragos); Tirosina por Tyros
(Queso en griego); Glicina por Glykos (dulce en griego, debido a su sabor).

AMINOCIDOS
Son -Aminocidos

El Carbono es un centro quiral*

Se diferencian entre ellos

por el sustituyente o grupo
R que poseen
Estructuras 3D y representaciones de Fisher
para los enantimeros de la Alanina

*A excepcin de la glicina que posee dos sustituyentes iguales (H)

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS
Con cadenas laterales cargadas

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS
Con cadenas polares no cargadas

Casos especiales

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS
Con cadenas laterales hidrofbicas

Con anillos aromticos

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS

CLASIFICACIN DE LOS
AMINOCIDOS

PROPIEDADES QUMICAS DE
LOS AA
Formacin de puentes disulfuro

Se comportan como anfolitos

PROPIEDADES QUMICAS
DE LOS AA

El Punto Isoelctrico o PI

PROPIEDADES QUMICAS
DE LOS AA

PPTIDOS Y PROTENAS
Estn compuestos por uniones de dos o ms aminocidos.
Estas uniones son llamadas enlaces peptdicos, y son
formadas covalentemente entre el grupo amino de un AA y el
carboxilo del otro.
Cuando se trata de pocos AA unidos se habla de
Oligopptidos, pero cuando se pasa de 100 de ellos ya se
habla de Polipptidos. Las protenas por lo general tienen
masas molares mayores a 10000 g/mol.

PPTIDOS Y PROTENAS

SGYAL

Por convencin se escribe a mano izquierda el extremo amino terminal y a mano derecha el
carboxilo terminal. Y as mismo se lee el pptido de izquierda a derecha

PPTIDOS Y PROTENAS
Jerarqua de
estructuras

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
De Defensa

Estructura de la inmunoglobulina
que detecta la presencia de
molculas forneas en el organismo

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
De Comunicacin

Estructura de la insulina
que viaja por el cuerpo
regulando los niveles de
azcar.

De Catlisis

Estructura de la alfa amilasa,

que inicia la ruptura de los
carbohidratos en nuestra
saliva.

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
De Transporte

Estructura de la Bomba de
Calcio, que mueve estos
iones a travs de la
membrana celular
sincronizando as la
contraccin muscular

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
De Almacenamiento

Estructura de la Ferritina
que almacena los iones
hierro de los alimentos

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
De Estructura

Estructura del Colgeno,

que forma fuertes y
flexibles hlices triples que
sirven de soporte para la
estructura de un cuerpo

CLASIFICACIN
SEGN SU FUNCIN
Ejemplo

Estructuras de ARN
Polimerasa que sintetiza
el mARN y la inhibicin de
esta protena por efecto
del oligopptido amanitina
que producen los hongos
del gnero Amanita

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS
Linus Pauling y Robert Corey investigaron a fondo la
geometra de las protenas, partiendo de las caractersticas
de los enlaces peptdicos.

CONFORMACIONES

Los ngulos de los

enlaces y se
denominan 0 cuando
se encuentran en el
mismo plano

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS
William Astbury descubri que la protena que constituya las pas
del puercoespn y del cabello tienen una estructura regular que se
repite cada 5.15 a 5.2 . stas corresponden a hlices alfa.

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS
Algunos aminocidos no contribuyen
a la formacin de una hlice alfa.
Entre ellos la prolina, glicinas
sucesivas, AA con cadenas cargadas
sucesivos, entre otros.

La hlice constituye un dipolo, por lo

cual se encuentran a menudo grupos
cargados negativamente cerca del
amino terminal, y grupos cargados
positivamente cerca del carboxilo
terminal.

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS
Lmina Antiparalela

Lmina Paralela

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS
Giro Tipo I

Giro Tipo II

REPRESENTACIONES DE
RAMACHANDRAN
Por convencin representa el
ngulo del enlace N-C el el del
enlace C C.
En un grfico se observan los
ngulos encontrados en una protena:
En azul oscuro los ngulos de
enlace que reflejan
conformaciones sin solapamiento
estrico.
El azul intermedio refleja
conformaciones permitidas en los
lmites extremos de contactos
atmicos desfavorables.
En azul claro conformaciones
permitidas si se permite cierta
flexibilidad en los ngulos de
enlace.

Representacin de
Ramachandran

REPRESENTACIONES DE
RAMACHANDRAN
Representaciones de Ramachandran de diferentes
estructuras

Estructuras
permitidas

Representacin de los ngulos de

los diferentes residuos de la
piruvato quinasa aislada de conejo

ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES
DE LAS PROTENAS

Probabilidades relativas de que un aminocido

concreto se halle en cada tipo de estructura
secundaria

ESTRUCTURAS TERCIARIAS DE LAS

PROTENAS
Protenas
Fibrosas

Estructura del cabello

ESTRUCTURAS TERCIARIAS DE LAS

PROTENAS

Estructura del colgeno

ESTRUCTURAS TERCIARIAS DE LAS

PROTENAS

Estructura de la Fibrona

ESTRUCTURAS TERCIARIAS DE LAS

PROTENAS
Protenas
Globulares

Estructura de la hemoglobina
de un pez antrtico

Estructura de la carboxil
esterasa

ESTRUCTURAS CUATERNARIAS DE
LAS PROTENAS

Estructura de la
desoxihemoglobina

Geometra de
mltiples dominios

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS
Electroforesis en gel
de Poliacrilamida

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS
Determinacin de
la masa molar de
una protena
desconocida

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS
Separacin
mediante el punto
Isoelctrico

CARACTERIZACIN Y
PURIFICACIN DE
PROTENAS
Separacin mediante
el punto Isoelctrico

SECUENCIACIN DE UN POLIPPTIDO
MEDIANTE EL MTODO DE EDMAN

SECUENCIACIN DE UN
POLIPPTIDO MEDIANTE EL
MTODO DE EDMAN

SECUENCIACIN DE UN POLIPPTIDO
MEDIANTE EL MTODO DE EDMAN
Ruptura de los
enlaces disulfuro

SECUENCIACIN DE UN
POLIPPTIDO MEDIANTE EL
MTODO DE EDMAN

SECUENCIACIN DE UN POLIPPTIDO
MEDIANTE EL MTODO DE EDMAN

SECUENCIACIN DE UN POLIPPTIDO
MEDIANTE EL MTODO DE EDMAN

ESTIMACIN DEL NMERO DE

AMINOCIDOS DE UNA PROTENA

ESTIMACIN DEL NMERO DE

AMINOCIDOS DE UNA PROTENA

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Preguntas?