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2006

Module de Gntique
Responsables P. Maury & R. Babil

Document de dmonstration
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Gntique des populations


PLAN du COURS
Introduction gnrale
Chapitre I : Variabilit gntique au sein des populations
Chapitre II : Modles danalyse de la variabilit gntique
Chapitre III : Evolution de la variabilit gntique
Conclusion gnrale
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CHAPITRE I

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La variabilit gntique au sein des populations


Introduction du chapitre I
Variations morphologique et chromosomique
Polymorphisme protique
Polymorphisme de l ADN
Conclusion du chapitre I

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Principe
Caractriser

des segments d ADN, c est


dire obtenir des marqueurs molculaires.
Deux types de marqueurs : Dominants et
codominants

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Phnotypes donns par le


marqueur

Principe (2)
A1

A1A1

A1A2

A2A2

A1
A1

3 Gnotypes
A2
A2

A2

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CODOMIMANT

DOMIMANT

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Mthodes
RFLP : Restriction Fragment length Polymorphism (1980)
RAPD : Random Amplified Polymorphic DNA (1990)
Microsatellites : Squences rptes en tandem (1992)
AFLP : Amplification Fragment length Polymorphism (1995)
SEQUENCAGE : caractrisation des diffrentes paires de bases

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Exemple de profil RAPD


T0 T PM

Gnotypes

PM

kpb
2027
1584

Marqueur

947

564

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Quelques remarques..
Par rapport au polymorphisme protique :
mise en vidence d un polymorphisme dans
les rgions non codantes de l ADN et moins
soumis la slection naturelle.
Le polymorphisme de l ADN n entrane pas
ncessairement des effets dcelables sur le
dveloppement
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I-5. Conclusion

Une importante variabilit - ou polymorphisme


-gntique (prsence de multiples allles pour de
nombreux gnes) existe au sein des espces

Comment apprcier cette variabilit? plusieurs


chelles..en rsum

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En rsum,

GENOTYPE

Polymorphisme
ADN

Polymorphisme
PROTEIQUE

PHENOTYPE

Variations
CHROMOSOMIQUES

Variations
MORPHOLOGIQUES

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Caractre
simple

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Caractre
complexe

Pour dcrire un gnotype


=> plus de marqueurs phnotypiques10

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Gnotype :
Description des allles aux diffrents loci..

Phnotype :
Expression physique d un gnotype..

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CHAPITRE II

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Modles d analyse de la variabilit gntique


Introduction du chapitre II
Le modle de HARDY - WEINBERG
Application du modle
Test de conformit du modle
Conclusion du chapitre II

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CHAPITRE III

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Evolution de la variabilit gntique dans diverses populations

Introduction du chapitre III


Croisements entre individus apparents
Effets de la migration et de la mutation
Effets de la slection
Conclusion du chapitre III

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Coefficient de parent1
Les individus I et J sont
apparents

Individu A

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Coefficient de parent2

Individu A
A

Les individus I et J sont


apparents
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gnes, copies issues
d un exemplaire ancestral
(prsent chez A)

Rplication
A A a a

Prcdent

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15

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Coefficient de parent3

Individu A
A

Les individus I et J sont


apparents
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gnes, copies issues
d un exemplaire ancestral
(prsent chez A)

Rplication
A A a a

Coefficient de parent entre I et J : RIJ


Coefficient
Probabilit 1 locus donn, pris sur I et sur J, d avoir deux allles identiques par ascendance

Prcdent

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Coefficient de parent4

Individu A
A

Les individus I et J sont


apparents
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gnes, copies issues
d un exemplaire ancestral
(prsent chez A)

Rplication
A A a a

B A

A D

Coefficient de parent entre I et J : RIJ


Coefficient
Probabilit 1 locus donn, pris sur I et sur J, d avoir deux allles identiques par ascendance

Prcdent

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Coefficient de parent5

Individu A
A

Les individus I et J sont


apparents
Ils peuvent partager des
exemplaires identiques de
certains gnes, copies issues
d un exemplaire ancestral
(prsent chez A)

Rplication
A A a a

Chane de parent

B A

A D

Coefficient de parent entre I et J : RIJ


Coefficient
Probabilit 1 locus donn, pris sur I et sur J, d avoir deux allles identiques par ascendance
Parent augmente avec le nombre d anctres communs et si nombre de gnrations (anctre
commun et individus IJ) sont faibles
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