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Chapter 5
Replicacin, reparacin
y recombinacin del DNA
Figura 5-1 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Replicacin
Eucariota vs Procariota
-E. coli un solo inicio de
replicacin.
-Eucariota (varios inicios de
replicacin.
-Fragmentos de okazaki en ambos
organismos
Figura 5-25 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Polimerizacin (5-3) al extremo OH de azcar nucleotdico 3, uniones de
desoxirribonuclesido trifosfato, eliminacin de pirofosfato fosfato
inorgnico
Polimerasa acta como guante.
Figura 5-4 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Polimerasa y sus sistema de correccin de errores
(fidelidad).
Exonucleasa en direccin 3-5.
Eliminacin de formas tautomricas.
Figura 5-8 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Fidelidad:
La importancia de la replicacin
y crecimiento de la cadena en
direccin 5-3.
Figura 5-10 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
DNA primasa: Enzima
formadora de pequeos
cebadores de RNA con extremo
OH3 listo para continuar con
la adicin de nucletidos.
Requerimiento especial por
fragmentos de Okazaki
Figura 5-12 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Sistema de eliminacin de cebador RNA y remplazado por DNA. Apoyado por
Ligasas.
Ligasa: enzima que ayudado por ATP para activar el extremo 5 en la hendidura y
formar el nuevo enlace (sellado de enlace fosfodister.
Figura 5-13 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Helicasas:
Lectura y separacin de cadenas en
sentido 5-3, pero tambin en
sentido 3-5
Figura 5-14 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Efecto de las protenas SSB (Protenas de unin a DNA de cadena sencilla).
Figura 5-16 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Abrazadera deslizante: Mantiene sujeto al DNA a la cadena
doble mientras adiciona nucletidos (hasta encontrar una
cadena doble).
Cargador de la abrazadera: Permite el unir a la abrazadera
(hidrlisis de ATP).
Figura 5-18c Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Replicacin y su complejo de protenas
Casi similar en Eucariotas y procaritas: En eucariotas la replicacin se
complica por los nucleosomas.
Figura 5-19a Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Correccin de errores de apareamiento:
Protenas Muts se unen al DNA.
y MutL elimina los pb mal apareados.
Adeninas no metiladas en regiones (GATC)
en E. coli.
Figura 5-20a Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
En la replicacin se evita el
superenrrollamiento:
Topoisomerasa: protena con una
tirosina en el sitio activo que acta
como nucleasa reversible que se une a
un fosfato del DNA y rompe enlaces
fosfodister.
Enlace roto se recupera al separarse la
topoisomerasa.
Figura 5-21 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Topisomerasa I = rompe el DNA durante la
replicacin y la restauracin del DNA no
necesita ligasas. El enlace fosfodister
mantiene energa.
Figura 5-24 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Bacterias controlan mejor su
inicio de replicacin:
Helicasa unida al cargador de
helicasa (similar a la abrazadera
eucariota).
Ambos sentidos se sintetizan
simultneamente:
Figura 5-27 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
ORC (complejos de reconocimiento de origen de replicacin). Tramo rico en A y T.
Figura 5-34 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Orgenes de Replicacin en otros organismos
eucariotas:
Mayor dificultad ( Se mantienen activos si se
trasladaran a otros cromosomas), mientras se
localicen en zonas desconectadas.
Figura 5-36 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Herencia de dmeros de nucleosomas al
azar. Chaperonas de histonas (NAP-1 y
CAF-1 restaurando los nucleosmas.
Estrategia de herencia de
modificaciones de histonas.
Se siembran en las nuevas cadenas y
por un complejo Lector-escritor se
reconstituyen.
Ejm. Complejo histona metilada
reconoce (N-terminal metilado
Figura 5-38b Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Replicacin del ultimo fragmento de
DNA en la cadena retrasada.
Figura 5-40 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
Replicacin del telmero
Alargamiento de la cadena patrn por
medio de la telomerasa.
Figura 5-41 Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
El extremo extendido de la cadena patrn formara el lazo T de proteccin en cromosomas
en la divisin.