Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Bioqumica aplicada
BASES DE LA CINETICA ENZIMATICA
1. Concentracin de Enzima
2. Concentracin de sustrato
3. pH
4. Temperatura
5. Presencia de activadores
1. Concentracin de Enzima
En presencia de exceso de sustrato, la actividad es
proporcional a la concentracin enzimtica
2. Concentracin de sustrato
Las reacciones enzimticas se saturan con el sustrato
Efecto autosaturante
3. Efecto del pH
La actividad enzimtica pasa por un mximo (pH ptimo).
El pH ptimo de las enzimas vara ampliamente; para la pepsina, del
estmago, es de 1,5, la arginasa tiene un pH ptimo de 9,7.
La gran mayora de enzimas tienen un ptimo alrededor del pH
fisiolgico de, ~7.0
Efecto del pH :Explicacin:
El sitio activo de la enzima esta frecuentemente compuesto de
grupos ionizables que deben estar en la forma inica para tener
actividad, unir los sustratos o catalizar la reaccin.
Una enzima que se someta a valores extremos de pH, se
desnaturaliza.
En el efecto de la temperatura hay dos
componentes:
4. Temperatura
1.Aceleracin de la reaccin segn la
ecuacin de Arrhenius. (dentro del
margen de actividad)
k = A exp (-Ea/RT)
Al aumentar la temperatura, la
velocidad de reaccin aumenta y, para
casi todas las enzimas, un incremento
de 10C duplica e incluso triplica la
velocidad de reaccin.
2. Desnaturalizacin trmica de la
protena.
Para muchas enzimas la regin de
inactivacin trmica est muy prxima
de la temperatura ptima.
CINETICA ENZIMATICA
Cintica de reacciones con un slo substrato
Michaelis y Menten propusieron un modelo para relacionar la velocidad
de reaccin con la concentracin de substrato. Suponiendo la existencia
de un solo complejo central, el esquema de reaccin sera:
Velocidad de reaccion VS concentracion
La ecuacin de Michaelis-
Menten describe como vara
la velocidad de las
reacciones catalizadas por
enzimas de acuerdo a la
concentracin de sustrato:
Parmetros enzimticos
Vmax = Km.vi + vi
[S]
Ordenando:
vi = Vmax - Km.vi
[S]
Vmax = vi + vi.Km
[S]
limitaciones de Cinetica Michaeliana
Para utilizar la ecuacin de Michaelis-Menten deben
asumirse:
Las concentraciones relativas de E y S: La concentracin de
sustrato [S] es mucho mayor que la concentracin de enzima
[E], de manera que la proporcin de ES es relativamente
pequea.
La reaccin esta en equilibrio: [ES] no cambia en el tiempo
(la velocidad de formacin de ES es igual a la velocidad de su
transformacin en E + S y en E + P).
Deben usarse velocidades iniciales (vo). Esto significa que la
velocidad de la reaccin debe determinarse tan pronto como
el sustrato y la enzima se mezclan. En dicho tiempo, la
concentracin de productos es despreciable y, por lo tanto, la
reaccin inversa de productos a sustratos puede ser ignorada
Enzimas con cintica no Michaeliana
Hay enzimas que no
obedecen la ecuacin
de Michaelis-Menten.
Su cintica no es
Michaeliana.
Esto ocurre con las
llamadas enzimas
alostricas, cuya
grfica v contra [S] no
es una hiprbola, sino
una sigmoide (en
forma de s)
Los enzimas alostricos son enzimas que cambian su
conformacin al unirse un efector, lo que conduce a un cambio
aparente en la afinidad de unin de otro ligando en un sitio
distinto de la molcula.
La mayora de los enzimas alostricos tienen varios dominios o
subunidades acoplados y muestran una unin cooperativa. En
general, la cooperatividad en los enzimas alostricos muestran
una dependencia sigmoidal con respecto a la concentracin de
sus sustratos en los sistemas positivamente cooperativos.
Los enzimas alostricos varan mucho su actividad cataltica en
respuesta a pequeos cambios en la concentracin del efector.
Los sitios de unin para los efectores heterotrpicos, llamados
sitios alostricos, son generalmente independientes del sitio
activo.
Actividad enzimatica
Organofosforados: Esteres de
fosfato con O sustituidos con S u
otros radicales.
Con enlace P-C fosfonato,
Con enlace P-N fosforamido,
Con enlace P-S fosfotiolato
Inhiben la acetilcolinesterasa
Neurotransmisin intoxicacin
Circuito elctrico de transmisin de seal entre una
sensacin (nervio sensitivo) y un movimiento muscular
(nervio motor).
Hay 3 tipos:
Competitiva
No Competitiva
Acompetitiva (Alostrica)
Inhibidores competitivos
Los inhibidores competitivos tienen gran parecido estructural con
el sustrato natural.
Compiten con el sustrato por ocupar el sitio activo de la enzima.
Esta unin es reversible y aumentando la concentracin de
sustrato aumentamos el nmero de molculas de enzima libre.
Sulfas (inhibe pasos metablicos en bacterias
Efecto antibiotico de las sulfas
Las bacterias sensibles Requieren del (para amino benzoico) PABA
para la produccin del cido dihidroflico, un paso esencial en la
produccin de las purinas y la sntesis de cidos nucleicos.
Las sulfamidas actan como anlogos estructurales del PABA,
inhibiendo competitivamente a la enzima dihidropteroato sintasa.
Al bloquear la sntesis del cido flico, se inhibe el crecimiento y
reproduccin del germen
Inhibidor competitivo del metanol
Competitiva
En la Inhibicin competitiva el sustrato (S) y el I compiten por la enzima libre,
pudiendo unirse uno o el otro, pero no ambos simultneamente, hay una
interaccin mutuamente excluyente del S y de I con la enzima. La unin de E
a I conduce a la formacin de un complejo no productivo.
INHIBICIN COMPETITIVA
+ Inhibidor
Unin del Inhibidor al
centro activo, compi6tindo
con S:
Aumenta Km.
No cambia Vmax.
No cambia Km.
Disminuye Vmax.
Sustrato
Sustrato
Inhibidor
no
competitivo
No competitiva
No se afecta la unin de S con E, pero se ve alterada Vmax. Hay dos
posibilidades:
a - EIS no se descompone en EI + P y la velocidad es la que corresponde a la
ruptura de ES (en este caso el efecto del inhibidor es reducir la cantidad de
enzima activa).
b - EIS se descompone a una velocidad menor y la velocidad es la resultante de
la suma de ambas reacciones
V = Vmax. S . .1.
Km se mantiene
Kmax+S (1+I/Ki)
Inhibicin acompetitiva
El inhibidor se une solo al complejo ES para dar un complejo
inactivo.
La Km se mantiene y la Vmax disminuye.
Diferenciacin de tipos de inhibiciones
reversibles.
APLICACIONES:
Muchos medicamentos son inhibidores enzimticos.
REACCIONES CON MS DE UN SUBSTRATO
Mecanismos para explicar este tipo de reacciones, la
mayora pueden clasificarse en dos tipos:
Mecanismos:
- Formacin de un compuesto ternario.
- Reacciones ping-pong.
a.- Reacciones mediante formacin de un complejo ternario.
El complejo ternario puede formarse independientemente del orden
de unin de los substratos (aleatorio), o bien nicamente en un orden
determinado (mecanismo ordenado).
Mecanismo aleatorio. Los substratos A y B forman un complejo con la
enzima. Cualquiera de ambos puede combinarse con el otro substrato
para formar el complejo ternario EAB, que conduce a los productos X
e Y y a regenerar la enzima:
Mecanismo ordenado. Un substrato (A) se une inicialmente con la enzima
formando el complejo EA. El segundo substrato slo se une al complejo
EA para conducir al complejo ternario EAB:
hexoquinasa
Glucosa + ATP -------> Glucosa-6-fosfato + ADP
_
El propio producto de la reaccin puede
inhibir competitivamente a la enzima
2.- Control por retroalimentacin (Negativa)
Un aumento de concentracin del producto final de una ruta
metablica inhibe una de las primeras reacciones de la ruta
(generalmente la primera)
v(g/l-min)
[S] (g/l)
Deduccin de los, coeficientes
S v (g/l-min) 1/S 1/v
1/S
Segn Linewaber-Burk
Interaccin.= 1/vmax=0.614
vmax = 1.628 g/l-min.
Pendiente: Km/vmax. = 5.387
Km = 8.776 g/l
El modelo ser.
V = Vmax.S/(Km+S)
V = 1.628S/(8.776+S)
Comprobar por Eadi-Hostie
Lienalizacion de Eadie-Hostfee
V = Vmax Km.V/S
Ejercicio 2
Se investig el efecto de un inhibidor I sobre la velocidad de una
reaccin catalizada enzimticamente sobre un solo sustrato,
obtenindose los siguientes resultados
esencial para su
actividad.
El biocatalizador se Reutilizacin
confina a una regin
determinada a travs de
la cual se pasa la
solucin del substrato,
que sale como un
Heterogneo: uso continuado
producto, libre de
catalizador.
Mtodos de Inmovilizacin
Agarosa
Celulosa
Quitina
Dextrano
cidos naturales
Almidn
Inmovilizacin de enzimas
Aplicaciones de inmovilizacin. Biosensores.
Generalmente, el biosensor
contiene enzimas inmovilizada
prxima a un traductor que, en
contacto con el analito,
transformar la seal qumica
producida en una seal elctrica o
de otro tipo (ptica, calorimtrica,
acstica, etc.)
Los mtodos de inmovilizacin ms
utilizados en el diseo de
biosensores son la inclusin en
membranas semipermeables y la
unin covalente a membranas.
Aplicaciones de inmovilizacin. Biosensores.
Biosensores: son de gran utilidad en el campo del
diagnstico clnico. Se determinan niveles sanguneos de
glucosa (electrodo de D-glucosa, lactato, urea, colesterol,
creatinina y cido rico.