INGENIERA CELULAR

PROPSITO GENERAL:
La unidad de aprendizaje Ingeniera Celular rene conocimientos relacionados
con la produccin de metabolitos mediante cultivos celulares, considerando la
aplicacin de la modelacin matemtica al crecimiento celular, al consumo de
sustratos y a la formacin de productos del metabolismo en distintos niveles:
cintica no estructurada, cintica estructurada y anlisis de velocidades de
reaccin en rutas metablicas. Tambin plantea las estrategias generales, tanto
en las condiciones del cultivo celular como a nivel gentico dentro de la clula,
que permiten modificar el metabolismo para incrementar la produccin celular
de algn compuesto con actividad biolgica.

El curso tiene como antecedente directo al Laboratorio de Bioconversiones,

donde se introduce al alumno con los aspectos tecnolgicos del cultivo celular.
Los aspectos tericos de la modificacin del metabolismo se abordan en la
presente unidad de aprendizaje. Adems, el curso se apoya en los contenidos
de Tecnologas de Recombinacin Gentica para el planteamiento de la
alteracin de las velocidades de reaccin metablicas por medios genticos.
 OBJETIVO GENERAL:
El alumno aplicar la modelacin
de la cintica de los cultivos celulares
en la modificacin del metabolismo
para la produccin de algn
compuesto con actividad biolgica.
DESCRIPCIN GENERAL DE CONTENIDOS:
La unidad de aprendizaje Ingeniera celular
consta de seis unidades temticas:
I. Introduccin a la Ingeniera Celular.
II. Cintica no estructurada.
III.Cintica estructurada.
IV. Velocidad de reaccin en redes
metablicas.
V. Control del metabolismo.
VI. Biologa sinttica y Bionanotecnologa.
ORIENTACIN DIDCTICA:
Exposicin de temas centrales por el
profesor, resolucin de problemas
paradigmticos, elaboracin de
resmenes escritos y ejercicios, bsqueda
de casos de aplicacin, induccin al
aprendizaje significativo.
EVALUACIN Y ACREDITACIN:
Se aplicar metodologa de evaluacin
continua: formativa y sumativa,
mediante las siguientes actividades:
Aplicacin de exmenes escritos,
resolucin de problemas en clase,
entrega de resmenes y cuadros
sinpticos y
presentaciones en Power Point.
BIBLIOGRAFA:
Bailey, J. E. y Ollis, D. F. Biochemical Engineering
Fundamentals. McGraw-Hill International. 1986.
Estados Unidos de Amrica. 928 pgs. ISBN-13 978-
0070666016.
Nielsen, J., Villadsen, J. y Lidn, G. Bioreaction
Engineering Principles. Springer. 2002. Alemania. 540
pgs. ISBN-13: 978-0306473494.
Stephanopoulos, G., Aristidou, A.A y Nielsen, J.
Metabolic Engineering. Academic Press. 1998. Estados
Unidos de Amrica. 725 pgs. ISBN 0-12-666260-6.
Collado-Vides, J. y Hofestadt, R. (editores). Gene
Regulation and Metabolism. MIT Press. 1997. Reino
Unido. 310 pgs. ISBN-13: 978-0262532686.
 UNIDAD I
INTRODUCCIN A LA
INGENIERA CELULAR
OBJETIVOS PARTICULARES
El alumno explicar el concepto de Ingeniera
Celular y describir en forma general los
fenmenos del metabolismo y del control
metablico.
Asimismo explicar en qu consiste la
modelacin del crecimiento celular.
No. CONTENIDOS
1.1 Acepciones de la Ingeniera Celular
1.2 Modelacin del crecimiento celular y del metabolismo
1.2.1 El concepto de modelacin del crecimiento
1.2.2 Tipos de modelos
1.2.3 Generalidades del metabolismo
1.2.4 Generalidades del control gentico
1.3 Estrategias de modificacin del metabolismo
1.3.1 Control metablico por condiciones de operacin
1.3.2 Tecnologas del ADN recombinante
ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE
El profesor har el encuadre del curso.
Expondr los conceptos de Ingeniera Celular.
Revisar los conceptos de modelacin y cintica
qumica.
El alumno realizar cuadros sinpticos de las
principales rutas metablicas.
Realizar exposiciones grupales en Power Point
acerca de metodologas generales de
modificacin del metabolismo y sern discutidas
en el saln de clases.
EVALUACIN DE LOS APRENDIZAJES
Examen escrito 70%
Entrega de cuadros sinpticos 10%
Presentacin en Power Point 10%.
Discusin de las presentaciones 10%
INTRODUCCIN
Clula:
Clula (del latn cella = cmara, espacio vaco): la ms
pequea unidad estructural de los seres vivos capaz
de funcionar independientemente.
 1.1
INGENIERA CELULAR
Ingeniera Celular & Ingeniera de Bioprocesos
Bioprocesos
Son las bases de las industrias alimentarias,
farmacuticas y ambiental.

Operacin
Microbios, clulas vegetales o de mamferos
o sus componentes:
Enzimas.

Fabricacin de nuevos productos,

o para la degradacin de residuos txicos.
Ingeniera Metablica & Ingeniera de Bioprocesos
La introduccin de modificaciones especficas a las redes
metablicas con el propsito de mejorar las propiedades
celulares.

rea de investigacin:
Desarrollo de las clulas racionalmente diseadas con capacidades
de biotransformacin especficas.

Crtico:
Un conocimiento riguroso de las interacciones entre las redes
metablicas y reguladoras.

Disciplina transdisciplinaria
Termodinmica, cintica enzimtica, biomatemticas, bioqumica,
gentica, biologa molecular, fisiologa microbiana y bioenergtica.
 Ingeniera Celular
nfasis de la regulacin de las reacciones
metablicas en todo el organismo.
Procesos
basados en clulas,
terapias gnicas, y
degradacin de los contaminantes recalcitrantes.

Prometen un gran impacto en muchas reas de la medicina

Temas investigados en Ingeniera Celular y Metablica
(Cameron y Tong, 1993; Lee y Papoutsakis, 1999; Stephanopoulos, 2008):

1. Herramientas experimentales y computacionales.

2. Produccin de productos farmacuticos.
3. Produccin de combustibles y productos qumicos.
4. Biomateriales.
5. Modificacin de microbios, plantas y clulas animales.
6. Produccin en gran escala de protenas.
7. Estrategias evolutivas para la mejora de cepas
8. Aplicaciones mdicas y terapia gentica.
9. Ingeniera Metablica a travs de genes reguladores.
10. Aplicaciones ambientales.
11. Nanotecnologa.
12. Clulas troncales para reparar tejidos u rganos daados.
 Logros especficos

Produccin de metabolitos y protenas heterlogas,

Introduccin de vas metablicas heterlogas dentro
de microorganismos para darles la habilidad de
degradar xenobiticos,
Modificacin de actividades enzimticas para
produccin de metabolitos.

nfasis de la regulacin de las reacciones metablicas en

la clula completa.

Procesos como terapia gnica, y degradacin de

contaminantes recalcitrantes.
Herramientas de biologa molecular:

1. Los sistemas de transformacin para los microorganismos

utilizados en la produccin industrial, o en bioprocesos
(herramientas genticas de expresin en bacterias).
2. Los promotores y vectores especiales que se utilizan en
este tipo de transformaciones.
3. Vectores de expresin multicistrnica para permitir la
ingeniera metablica multignica en un solo paso en
clulas de mamfero (Fussenegger et al., 1999).
4. Mtodos para la estabilizacin de genes clonados, por
ejemplo, por la integracin en los cromosomas de los
organismos husped.
5. Marcadores para buscar y analizar las vas metablicas.
 Evaluacin de la eficacia de la va metablica modificada
Usando herramientas microbiolgicas y analticas.

1. Cultivo del microorganismo 4. El etiquetado y el anlisis de

modificado. En un cultivo continuo mutantes bloqueados, as como la
ptimo; si el microorganismo determinacin de la actividad de las
modificado genticamente tiene baja enzimas y metabolitos, permiten la
estabilidad se utilizan sistemas de lotes determinacin de la eficacia de
o lotes alimentados. funcionamiento de una va metablica
para contribuir al consumo de un cierto
2. Optimizacin de medio de
sustrato, o la formacin de un producto
crecimiento para el funcionamiento de requerido.
la ruta metablica deseada.
5. El empleo de los mtodos no
3. Balance de masa. Esto permite el invasivos (resonancia magntica
clculo del rendimiento del producto
nuclear y la citometra de flujo), que
deseado con respecto a diversos
permiten una evaluacin directa del
sustratos, y por comparacin con
desempeo del microorganismo en
rendimientos tericos mximos se hace
condiciones similares o idnticas a las
la evaluacin de cun lejos del lmite
del bioproceso industrial.
termodinmico opera la va metablica.
 Herramientas matemticas y computacionales:

1. Bases de datos de ADN y software.

2. Bases de datos de Vas Metablicas, incluyendo datos
cinticos y termodinmicos de enzimas.
3. Herramientas diseadas para la estimacin de los
rendimientos tericos.
4. Reconstruccin de redes metablicas y de sealizacin a
partir de la estequiometra de la va.
5. Herramientas para el diseo de las rutas metablicas.
6. Herramientas cuantitativas para la simulacin y prediccin,
as como el anlisis del desempeo de los
microorganismos modificados (por ejemplo, Anlisis de control
metablico (ACM), Teora del sistema bioqumico (TSB) y Anlisis de
flujo metablico (AFM)).
Clulas de ingeniera para Biotransformaciones especficas.

La redireccin de los
flujos de sustrato, ya
sea a los productos
microbianos o a la
biomasa pueden
lograrse mediante la
modificacin de los
parmetros
ambientales o
actuando sobre el
propio
microorganismo
(Aon y Cortassa, 1997).
Ingeniera de Flujos Metablicos (Aproximacin transdisciplinaria)

(I) ESTUDIOS FISIOLGICOS, METABLICOS Y BIOENERGTICOS EN

CULTIVOS EN QUIMIOSTATO. Explorando el potencial real de una cepa
Crecimiento equilibrado
(II) ANLISIS DEL FLUJO METABLICO Y DEL CONTROL METABLICO DE LA
CEPA CRECIENDO EN CULTIVOS EN QUIMIOSTATO EN LAS CONDICIONES
ESTABLECIDAS EN EL PASO (I).
Coeficientes de elasticidad y de control
(III) INGENIERA GENTICA DE LA CEPA DE ACUERDO CON EL ANLISIS DE
LA ETAPA (II). Introduccin de las vas heterlogas, la sobreexpresin de
genes, etc.

Cepa recombinante obtenida segn los pasos (I) y (II)

(IV) ENSAYO DE LA CEPA RECOMBINANTE BAJO LAS CONDICIONES

FISIOLGICAS ESPECIFICADAS EN EL PASO (I).
Evaluacin de la mejora
Principales reas de trabajo:

i. Aumento de la produccin de metabolitos y otros

productos biolgicos ya producidos por el organismo
husped;
ii. Produccin de metabolitos nuevos o modificados y otros
productos biolgicos que son nuevos en el organismo
husped;
iii. Ampliacin de la gama de utilizacin de sustratos para el
crecimiento celular y la formacin de producto;
iv. Diseo de rutas metablicas mejoradas o nuevas para la
degradacin de diversos productos qumicos
especialmente xenobiticos;
v. Modificacin de las propiedades celulares que facilitan el
procesamiento biolgico (fermentacin y/o la
recuperacin del producto).
Rutas metablicas primarias y secundarias y sus conexiones con
las vas catablicas centrales a travs de metabolitos comunes
Temas principales de la Ingeniera de biorreaccin
 reas de metabolismo
y funciones celulares en ciernes
i. La produccin, modulacin del contenido, o
modificacin de la calidad (por ejemplo, grado de
ramificacin) de polisacridos de almacenamiento y
estructurales, por ejemplo, fructanos, glucanos, xilanos,
pectinas.

ii. Las funciones celulares de transporte (por ejemplo, de

protones, sodio, calcio).

iii. Los procesos celulares (por ejemplo, ciclo de divisin

celular, la represin catablica, diferenciacin celular).