que es Bioqumica?

Pablo Araujo Granda Ph.D.

paaraujo@uce.edu.ec
 Introduccin

Avances en medicina = Bioqumicos

3 ejemplos:
Inhibicin de replicacin controlada del DNA en pacientes
de leucemia

Frmaco antineoplsico - HIV

Emular las acciones de la adrenalina

Bloqueo sntesis cidos nucleicos

Hipoxantina 6-mercaptopurina
Frmaco Antineoplsico - HIV

Timidina
3-azido-2,3-didesoxitimidina
Anlogo de la Adrenalina

Adrenalina
Isorpterenol
en que aport la bioqumica?

Estructura y funcin de protenas

Sntesis de cidos nucleicos

Mecanismos enzimticos

Receptores y control metablico

Vitaminas y coenzimas
 Ideas centrales

Materia Viva = Sustancias Qumicas

Funcin biolgica = Estructura y reacciones de

sustancias.

Para comprender cualquier proceso vital, es necesario

comprender su qumica.

Bioqumica = conocer la vida en trminos moelculares

Preguntas .. 1/2

Cules son las estructuras qumicas de los

componentes de la materia viva?

De qu manera interactan estos componentes?

Cmo extrae energa de su entorno la materia viva?

Cmo se almacena y transporta la informacin

gentica?
Preguntas .. 2/2

qu cambios qumicos acompaan a la

reproduccin, envejecimiento y muerte de las clulas
(organismos)?

cmo se controlan las reacciones en el interior de las

clulas vivas?
Bioqumica

Qumica
estructural

Gentica
Metabolismo
molecular
 Un poco de historia
Fuerza vital = vitalismo

(1828) Friedrich Whler Sntesis Urea

(1869) Friedrich Miescher Aislar cidos nucleicos

(1897) Eduard y Hans Buchner Fermentacin

extractos celulares

(1926) J.B. Sumner Cristalizacin Ureasa

(1930 1950) Microscopa electrnica

 Un poco de historia
Primera Mitad del Siglo XX
Grandes rasgos estructuras qumicas
Reacciones de rutas metablicas
Poco conocimiento sobre:
Control reacciones en tejido vivo
Manera de almacenar, transmitir y procesar la informacin

(1940 1950) DNA Portador Informacin Gentica

(1953) Watson y Crick Estructura de doble hlice

 Terminologa

Bioqumica

Biologa
Molecular
 Ciencia interdisciplinar
Qumica
Orgnica

Biologa
Biofsica
Celular

Investigacin
Fisiologa
mdica

Microbiologa Nutricin
 Ciencia nica
Estructura biomolculas

Reacciones biomolculas

Enzimas y catlisis biolgica

Rutas metablicas y su control

Procesos vitales = leyes de la qumica

Bioqumica
desde la Qumica
 Desde la Qumica .
Elementos qumicos de la materia viva

Estructuras compuestos biolgicos

Aminocidos

Azcares

Lpiodos

Nucleticos

Vitaminas

Hormonas
 Desde la Qumica .

Comportamiento durante las reacciones metablicas

Estequiometra

Mecanismos de reacciones

Termodinmica = energa
Elementos Qumicos
 Elementos Qumicos
Primer Nivel
C, H, O y N

Segundo Nivel
Ca, Cl, Mg, P, K, Na, S

Tercer Nivel
Co, Cu, Fe, Mn, Zn

Cuarto Nivel
Al, As, B, Br, Cr. F, Ga, I, Mo, Ni, Se, Si, W V
Molculas Biolgicas

Complejidad de la vida = Molculas enormes

Dalton (Da) = 1/12 del tomo de carbono

DNA = 20.000 millones daltons

DNA (e.coli) = 2000 millones Da.

Proteinas = 50.000 Daltons

Azcares
Homopolmeros
Azcares Hidrato de Carbono
Sacarosa
Amilosa
Amilopectina
Azcares Hidrato de Carbono
DNA - RNA
Heteropolmeros
ADN
Protenas
Heteropolmeros
Aminocidos
Lpidos
 Lpidos
Grasas

Ceras

Aceites

Colesterol

Fosfolpidos

Eicosanoides

Terpenoides

Esteroides
Aceites
 Ceras
CERAS
steres de cidos carboxlicos de cadena larga con alcoholes de
cadena larga.

Acidos = 16 a 36 C (nmero par).

Alcoholes = 24 a 36 C (nmero par)

Recubrimientos cerosos de frutas, hojas y pieles de

animales.
 Grasas

Qumicamente qu son?
Triglicridos o triacilgliuceroles

Tristeres de Glicerol con tres cidos carboxlicos de

cadena larga.
 Fosfolpidos

Dos tipos fundamentales:

Glicerofosfolpidos
Esfingomielinas

Tejidos de plantas y animales Membrana celular

 Clasificacin Eicosanoides

Eicosanoides

Prostaglandinas Tromboxanos Leucotrienos

 Esteroides

Derivados del lanosterol

Ciclohexanos en cis trans

Anillos CyD son trans

Los A-B Trans son mas comunes.
Los A-B cis estn en la bilis heptica.
Bioqumica
.. Desde la Biologa
Desde la Biologa

que distingue a la materia viva de la que no tiene

vida?
Complejidad

Motilidad

Renovacin de estructura ordenada

Entorno catico = orden interno (clula vs. entorno)

Continuo gasto de energa = captar energa del entorno

 Desde la biologa ..
La vida se autoreproduce

Informacin = de una generacin a la siguiente

como surgi la vida?

4.5 miles de millones de aos (Tierra)
3.8 miles de millones de aos (trazos de microbios)
Trazas de aminoacidos en meteoritos (abitico)
Primeros anaerobicos = 1 a 2 miles de millones de aos (O2
actual)
La clula
Unidad fundamental de la vida
 Ideas iniciales
(1665) Robert Hooke Minsculos compartimentos

(1840) Theodor Schwann cluls nicas o agregados.

Tamao similar, as:

Bacterias promedio = 1-2 um (chicas 0.2 um)

Clulas organismos superiores = 10 20 um (grandes 1 m)

Ideas generales
Tamao celular no relacionado con tamao organismo
(elefante y pulga).

Proporcin superficie / volumen

Reacciones bioquimicas = volumen considerable

Intercambio de molculas con su entorno

Clula grande = poca superficie

Clula pequea = mucha superficie

qu es?

Es el bloque fundamental de la vida

Entidad separada de otras clulas y del medio

ambiente.

Un complejo sistema de reacciones qumicas

cmo se diferencia?

Capacidad de crecer y reproducirse

Solas pueden producir otra clula identica a si mismas.

Son altamente organizadas y muy selectivas de lo

que cruza por su membrana.
Son de baja entropia comparada con el medio ambiente.
cmo se diferencia?
Estn compuestas por los elementos qumicos
principales (C, N, O, H y S).

Se auto-alimentan.
Toman elementos, electrones y energia del medio
ambiente para crear, reproducirse y mantenerse a si
mismas.
Reacciones = Metabolismo
como esta organizada?
Fsicamente organizada = Procesos vida
Componentes esenciales:
La membrana celular
La pared celular
El citoplasma
Los cromosomas
Los ribosomas
Las enzimas
rbol filogentico de la vida
Filogenia .. Clasificacin

cromosomas dentro o fuera del ncleo?

Fuera (sin ncleo) = Procariotas

Dentro (con ncleo) = Eucariotas

Unicelulares = Bacteria y Arquea (procariotas)

Uni y Policelulares = Eucariotas (plantas y

animales)
 .. Seguimos clasificando

Procariotas = microorganismos (microscopio)

Eucariotas = algunos si y otros no

microorganismos (algas microscpicas y
protozooarios) hasta (mamferos, plantas, rboles)
Algunas diferencias
Animal vs. vegetal
Algunos organelos comunes

Mitocondria = Metabolismo oxidativo

Retculo endoplasmtico = Sntesis de protenas

Complejo de Golgi = Secretan y desplazan nuevas

protenas

Ncleo = Gentica DNA - Cromosomas

Algunos organelos no comunes

(animales) = Lisosomas = cuerpos digestivos

(vegetales) = cloroplastos = fotosntesis

(vegetal) = vacuola (llena de agua)

(animales) = membrana plasmtica

(vegetales) = pared celular

Diferenciacin

Cambios en la forma y su funcin

Humano = actan diferente depende de su funcin.

Pueden interactuar con otras = seales qumicas.

Ls hijas pueden actuar diferente que los padres.

Desarrolla rnuevas habilidades

La gran ayuda de los virus

No son celulares = entidades biolgicas

Parsitos intracelulares = invaden clulas

Una molcula de (DNA/RNA) / envoltura (proteina)

No maquinaria metablica propia

Mas fcilaislamiento y estudio

Mecanismos de regulacin gentica

 Concluyendo un poco .
Ciencia mas experimental que terica

Explicar observaciones de laboratorio.

Entender experimentos esenciales y tcnicas

experimentales.

4 ltimas dcadas = Metodologa de

investigacin potente.

Aislar, leer y manipular informacin gentica

 Hacia el primer taller

Herramientas de la BioQumica

Introduccin de istopos radioactivos (rutas metablicas).

Cristalografa de rayos X (localizacin atmica).

Electroforesis (vizualizar y cuantificar proteinas)

Informtica y procesameinto de datos.