Genes ZEB1-Responsive en células no pequeñas

Cáncer de pulmón
ZEB1-Responsive Genes in Non-Small Cell Lung
Cancer
OBJETIVO:

 identificar los genes que respondieron a ZEB1 en líneas celulares de cáncer de

pulmón

Cuadro 6.1 - Moléculas de Adhesión calcio dependientes

Tipo de Cadherina Localización Estructura Proteina intracelular de Filamento citoplasmático
unión
E-Cadherina Células Cinturón Cateninas, a-actinina Actina
P-Cadherina epiteliales adhesivo
Cadherina Epidermis Desmosomas Desmoplaquinas I, II; Keratina; desmina
desmosomal Placenta Placoglobina
N-Cadherina Nervio, Cinturón Cateninas, a-actinina, Actina.
músculo adhesivo vinculina.
 El factor de transcripción Slug, proteína zinc finger que
pertenece a la familia Snail, se expresa en la región dorsal
del tubo neural en el momento en que se inicia la
migración de la cresta neural. Snail es fuerte represor de
la expresión de caderina-E. Dorsalina, gen que codifica
para un miembro de la familia TGF-ß, se expresa
específicamente en la región dorsal del tubo neural, en el
momento en que se inicia la migración de la cresta
neural. TGF-ß provoca migración prematura
 La transición epitelio mesénquima (EMT)) es un
proceso clave en la remodelación de los tejidos y en
la malignización de los tumores (metástasis y
recurrencia tumoral). Existen diferentes factores de
transcripción que lo controlan, siendo el gen ZEB1,
factor clave del proceso.
 que convierte las células epiteliales en un fenotipo
alargado, móviles e invasivas, se piensa que es un
paso crítico en la diseminación de las células
tumorales.
MATERIALES Y MÉTODOS

 Líneas celulares y los tejidos tumorales

primarias
 Aislamiento 2,2 ARN y análisis en tiempo real
RT-PCR cuantitativa
 El análisis de transferencia Western
 La transfección de corto ARN de interferencia
 TGF-β y EGF tratamiento línea celular
 tinción de actina
 pulmón análisis de microarrays de tejidos
Identificación de genes ZEB1
correlacionados en líneas celulares de
cáncer
 utilizado los datos de Affymetrix obtenidos de 38 líneas celulares de
cáncer. que fueron examinadas usando el rango de correlación de
Spearman.
 identificaron 324 genes significativamente correlacionados
negativamente con ZEB1, mientras que 141 genes se correlacionaron
significativamente positiva. Los 50 mejores genes de cada grupo
 Top 50 genes correlacionados negativamente con ZEB1 en 38 líneas
celulares de cáncer.
 Top 50 genes correlacionados positivamente con ZEB1 en 38 líneas
celulares de cáncer.
 EpCAM fue el gen más significativa correlación negativa (R = -0,85), seguido
de cerca por sintetasa CDP-diacilglicerol (CDS1), tetraspanin 1 (TSPAN1),
proteína reguladora de empalme epitelial 1 (ESRP1), y supresor de
tumorigenicidad 14 (ST14). E-cadherina, un gen diana ZEB1 conocido, ocupó
el 31 con un valor R de -0,75. Entre los mejores genes correlacionados
positivamente, Vimentina tuvo la mayor correlación (R = 0,76), mientras que
ZEB2 (R = 0,71) y FGFR1 (R = 0.70) ocupa
el 5º y 6º, respectivamente. Curiosamente, la correlación entre ZEB1 y N-
cadherina, otro marcador de EMT, era considerablemente más débil (R =
0.395), muy por debajo del 5% de tasa de falso descubrimiento de
corte. Muchos de los genes que se correlacionaron negativamente o
positivamente con ZEB1 también se correlacionaron significativamente con
ZEB2, pero con valores de R inferiores. Sin embargo, hubo una notable
ausencia de correlaciones significativas para estos genes específicos con
caracol, barra, TWIST1 y Giro 2, aunque cada uno de los factores de
transcripción se ha informado a reprimir la E-cadherina [ 4 ]. Estos
resultados sugieren que tanto ZEB1 y ZEB2 juegan un papel en aspectos
específicos de la EMT fenotipo en el cáncer de pulmón.