Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Dr.Angela Antonescu
Pentru prima dată ca termen a fost întrodus in 1903 de
către Carl Neiberg.
“bios” - din greacă înseamnă viaţă este ştiinţa despre
structura şi transformarea substanţelor chimice în
organism, care intră în componenţa materiei vii,
proceselor fizico-chimice care stau la baza activităţii
vitale .
Ca disciplină biochimia este înrudită cu:
- chimia organică – ce studiază structura şi proprietăţile
substanţelor componente ale materiei vii;
- fiziologia – ce studiază funcţiile organismelor vii;
-fizica – în ce priveşte metodele de studiu ale
substanţelor organice.
Scopul biochimiei
• studiul legăturii reciproce a substanţelor şi
funcţiilor acestora;
• modificările compuşilor chimici din organismul
viu;
• modul de transformare a energiei în sistemele vii;
• mecanismele de reglare ale transformărilor
chimice şi ale proceselor fizico-chimice în celule,
ţesuturi şi organe;
• mecanismele moleculare de transmitere a
informaţiei genetice în organism.
Deosebim:
• Biochimia discriptivă - studiază componenţa
chimică a materiei vii şi proprietăţile
compuşilor biologici separaţi.
• Biochimia dinamică – studiază complexitatea
modificărilor de substanţe în organism.
• Biochimia metabolică – cercetează procesele
biochimice ce stau la baza diferitelor
manifestări ale proceselor metabolice din
organism.
Rolul biochimiei în practica medicală:
- promovează progresul cercetărilor medicale;
- oferă cunoştinţele necesare înţelegerii stării de
sănătate şi a mecanismelor patogenetice în orice
boală;
- stabilirea diagnosticului clinic de laborator;
- explică modul de acţiune al medicamentelor, ca
modulatori ai activităţii enzimatice, oferind datele
necesare pentru sinteza de substanţe cu acţiune
farmacologică dorită;
- permite tratarea cu succes a avitaminozelor; a
insuficienţei sau hiperfuncţiei endocrine;
Rolul biochimiei în practica medicală:
- progresele biochimiei au evidenţiat cauza unor
boli numite “erori înăscute de metabolism”
(oligofrenia fenilpiruvică)
- este ştiinţa care explică “bolile moleculare”
(anemia falciformă – sinteza unei Hb anormale
Hb-S (Hb-seceră) care cristalizează în eritrocite
ducînd la hemoliză şi în final la moarte;
- analizele biochimice efectuate pe lichide
biologice sau pe celule permit evidenţierea
precoce a numeroase boli, evoluţia lor şi
eficacitatea tratamentului.
Cele mai importante descoperiri în
Biochimie în sec. XX
• 1. Fischer (1902) – a efectuat sinteza artificială a
peptidelor şi a elaborat teoria polipeptidică a structurii
proteinelor.
• a fost descifrată structura primară a insulinei
(Sanger,1953); vasopresinei şi oxitocinei (Viniu, 1953) ;
structura tridimensională a mioglobinei (Kendrew,
1960), structura Hb (Perutz), lizozimei (Filips).
• 2. Au fost separate enzimele în stare cristalină,
stabilindu-se structura lor, mecanismele reacţiilor
enzimatice şi reglarea activităţii acestora (Sumner;
Severin, Orehovici, Michaelis, Koshland).
3. 1953 – Crick şi Watson au descoperit
structura secundară a DNA, fapt ce a permis
înţelegerea principiilor transmiterii informaţiei
genetice
1961 Nirenberg şi Matei au descoperit codul
genetic, iar Jacob şi Monod– mecanismul de
reglare a sintezei proteinelor (teoria “lac-
operonului”).
1970 – biologia moleculară a pus bazele
ingineriei genetice, care studiază compoziţia
chimică a genelor, inserarea lor în celulă şi
repararea defectelor genetice
Cele mai importante descoperiri în
Biochimie în sec. XX
• 4.La începutul sec. XX se formează o nouă
direcţie în biochimie – bioenergetica (Bah,
Krebs, Lipman, Leninger, etc.)
• În 1931 Enghelhard a descoperit fenomenul
de fosforilare oxidativă, iar în 1961 Mitchell a
formulat ipoteza chimioosmotică.
5.Au fost studiate principalele căi ale metabolismului
glucidic, lipidic, proteic :
a. au fost create schemele diferitor căi de
transformare a glucidelor şi formarea în cursul acestor
transformări a ATP (Embden, Krebs, Dikens,
Engelhardt, Parnas) ;
b. s-a elucidat procesele de oxidare şi sinteză a acizilor
graşi şi ale altor lipide (Knoop, Lynen, Lipman) ;
c. s-au descoperit transaminazele aminoacizilor şi s-au
pus bazele studierii noilor căi de transformare a
substanţelor azotate în organism (Krebs; Henseleit).
6. Bayliss – a utilizat termenul de hormon
Particularităţile materiei vii:
• Gradul superior de organizare structurală
(caracterizat prin structura compusă şi
diversitatea de molecule)
• Funcţia strict determinată şi sensul său
specific pentru fiecare parte componentă.
• Capacitatea de a transforma şi a utiliza
energia
• Schimbul de substanţe cu mediul
înconjurător şi autoreglarea transformărilor
chimice.
• Capacitatea de autoreplicare sau transmitere
a informaţiei genetice.
Aminoacizi şi proteine
• Proteinele reprezintă partea principală a celulelor
oricărui organism viu
“protos” - primul, de prima importanţă
• Proteinele sunt substanţe organice azotate, alcătuite
din AA, legaţi în catene prin legături peptidice şi care
posedă organizare structurală complicată.
• Principalele caracteristici:
1. conţinutul de azot destul de constant (16% din masa
uscată);
2. prezenţa permanentă a componenţilor structurali –
ai AA;
3. legăturile peptidice între AA;
4. masa moleculară mare (4-5000 – pînă la milioane de
Da);
5. organizarea structurală complicată, care determină
proprietăţile fizico-chimice, biologice ale proteinelor.
Aminoacizii sunt unităţile structurale ale proteinelor
Aminoacizii se denumesc folosind cuvântul „acid“,
urmat de „amino“ şi numele acidului corespunzător
Prin prefixele „di“, „tri“ etc., se arată numărul de
grupe amino şi carboxil, iar poziția relativă a două
grupe funcţionale se precizează cu literele greceşti
„α“, „β“, „γ“, „δ“, „ε“, în care acidul este α dacă
grupările amino și carboxil se leagă de un acelaşi
carbon, β dacă grupările amino şi carboxil se leagă
la atomi de carbon alăturați, iar, pe măsură ce
creşte distanța, se vor numi γ, δ, ε
În cazul compuşilor aromatici, se folosesc prefixele
„orto“, „meta“, „para“.
Aminoacizii (AA)
• sunt derivaţii acizilor carboxilici la care un
atom de H a fost substituit de grupa aminică.
În funcţie de poziţia în care a avut loc
substituţia destingem alfa, beta, gama şi etc.
20 de aminoacizi fundamentali proteinogeni
sunt α AA şi sunt de linia L.
Când gruparea –NH2 a serinei se află în stânga
faţă de planul atomilor de carbon, aceasta
aparţine seriei L la fel ca toţi aminoacizii
“naturali”
Unităţile fundamentale ce participă la sinteza
unei proteine sunt aminoacizii „naturali”
(proteinogeni), de tip α- aminoacizi
β –alanina- component
al coenzimei A (CoASH)
PROPRIETĂŢILE FIZICE ALE
AMINOACIZILOR
PROPRIETĂŢILE CHIMICE ALE
AMINOACIZILOR
• 4 clase:
• 1. proprietăţi datorate funcţiunii –NH2
• 2. proprietăţi datorate funcţiunii -COOH
• 3. proprietăţi datorate ambelor funcţiuni
• 4. proprietăţi datorate radicalului R
• Importanţă:
• - analiza aminoacizilor într-un mediu biologic;
• - analiza aminoacizilor rezultaţi prin hidroliza unei
proteine;
• - stabilirea ordinii de înlănţuire într-un lanţ polipeptidic
Reacţiile datorate funcţiunii –NH2 permit:
A. Dozarea aminoacizilor
1. Reacţia cu aldehida formică SÖRENSEN
2. Reacţia cu acidul azotos. Metoda Van Slike
B. Identificarea aminoacizilor:
Reacţia cu reactivul Sanger (fluordinitrobenzen)
Reacţia cu clorura de dansyl
Reacţia cu reactivul Edmann (feniltioizocianat)
Prezenţa:
prolinei (atomul de N nu are H şi nu e capabil
să formeze legături de hidrogen intracatenar –
se formează o îndoire, o încovoiere în lanţ.
radicalilor voluminoşi (Val, Asp) conferă o
strângere sterică a elicei)
Ser, Tre – gr. OH pot forma punţi de H – pot
servi ca factori destabilizatori
Glu, Liz, His, Arg – apar forţe electrostatice de
respingere sau atragere
-structură
are configuraţia curbată, care se formează
cu ajutorul legăturilor de hidrogen
intercatenare în limită unor sectoare a
aceluiaşi lanţ polipeptidic sau a lanţurilor
alăturate. Această structură se mai numeşte
structură în straturi pliante.
-structură poate fi de 2 tipuri:
„cross formă” – participă un singur lanţ
-structură completă – participă 2 sau mai multe
catene, care poate fi:
paralelă (N-terminaţiile catenelor polipeptidice
sînt îndreptate în aceeaşi direcţie)
antiparalelă (N-terminaţiile sînt îndreptate în
diferite direcţii).
Deosebirile de alfa spirală :
-are formă plată
-distanţa între 2 resturi de AA este de 3,5 A
- punţile de H sunt intercatenare dar nu
intracatenare ca la spirală
-radicalii AA ies în ambele părţi ale
structurii beta/#
Structura terţiară
reprezintă modul de împachetare a lanţului
polipeptidic în spaţiu tridimensional.
proteinele se împart în globulare (Mb) şi fibrilare
(keratina, fibrina, miozina,elastina)
se formează datorită interacţiunii dintre radicalii
AA situaţi la distanta.
Structura terţiară
Legăturile ce stabilizează structura
terţiară:
Legăturile covalente:
- disulfidice,
- pseudopeptidice
- esterice
Legăturile polare
- de hidrogen,
- ionice,
- electrostatice
interacţiuni hidrofobe –
-forţele Van der Waals
O anume organizarea în structură tridimensională conferă
proteinelor activitate biologică.
Radicalii AA, care posedă rotaţie liberă interacţionează,
catena ciudat se curbează în diferite locuri. Radicalii
hidrofobi evitând apa se concentrează în interior pe când
grupele hidrofile se situiază la suprafaţa moleculei şi
interacţionează cu apa, de aceia molecula gigantă de
proteină se dizolvă bine în apă. În procesul stabilirii
structurii terţiare se formează centrele de legătură (active)
unde se leagă o anumită substanţă numită la general
ligand.
Ligandul este steric şi electrostatic complementar CA (de
ex. substratul cu centrul activ al enzimei respective).
În componenţa CA întră radicalii AA (Tir; Glu; His, etc.)
situaţi de regulă departe unul de altul în lanţ, dar care se
pomenesc învecinaţi în acest centru în procesul formării
conformaţiei moleculei la interacţiunea cu ligandul.
Domeniu:
reprezintă regiuni compacte cu organizarea
terţiară , relativ rigidă, separate între ele de
segmente mai puţin organizate care permit
mişcarea unui domeniu faţă de altul.
- sunt responsabile de anumite funcţii
- cu structuri şi proprietăţi similare sunt
prezente în diferite proteine, avînd roluri
asemănătoare.
Structura cuaternară a proteinelor
1. Nucleoproteine
2. Cromoproteine
3. Fosfoproteine
4. Lipoproteine
5. Metaloproteine
6. Glicoproteine
Cromoproteinele – compuse din proteină şi
partea neproteică colorată.
1. - cromoproteide porfirinice
2. - cromoproteide neporfirinice
• Reprezentanţii: clorofila, hemoproteidele
(Hb), sistemul de citocromi, catalaza,
peroxidaza.
• Rolul:
1. participă în fotosinteză
2. transportul oxigenului şi CO2
3. reacţiile de oxido-reducere
4. senzaţiile de lumină şi culoare
Fosfoproteinele: proteine + acidul fosforic (legate prin
legături esterice- de hidroxiaminoacizi Ser, Tre )
• Rolul:
1. Reprezintă constituienţi structurali ai celulelor
2. intervin în permeabilitatea biomembranelor
3. participă la transportul prin sânge şi limfă a unor
substanţe liposolubile (vitaminelor liposolubile A, D,
E, K, unor hormoni, medicamente)
4. furnizează energia
• în plasma sanguină lipoproteinele se diferenţiază în 4
fracţiuni pe baza densităţii lor:
1. - chilomicronii (d mai mică ca 0,95)
2. - cu densitate foarte mică (VLDL) (d mai mică ca
1,006)
3. - cu densitate mică (LDL) (d mai mică ca 1,065)
4. - cu densitate mare (HDL) (d mai mică ca 1,2)
Glicoproteinele – proteine + glucidică (glucozamină,
galactozamină, a. hialuronic, glucozaminglicani
• Rolul:
1. sunt constituienţi plastici ai celulei, intră în
componenţa membranelor biologice.
2. au rol de protecţie a mucoaselor
gastrointestinale, ale aparatului respirator şi
urogenital faţă de acţiunea enzimelor
proteolitice, a unor compuşi chimici sau agenţi
mecanici.
3. sunt inhibitori ai aglutinării hematiilor
4. sunt componente specifice de grup sanguin
5. participă în reacţiile imunologice.
Metaloproteine: proteină +metal (Fe, Cu, Zn, Mg)