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Las proteínas son los instrumentos moleculares mediante los que se expresa
la información genética.
Debido a que cada uno de estos aminoácidos tiene una cadena lateral propia
que determina sus propiedades químicas, se puede considerar este grupo de
20 moléculas precursoras como el alfabeto en el que está escrito el lenguaje
de la estructura proteica.
Las células pueden producir proteínas con propiedades y actividades muy
diferentes uniendo los mismos 20 aminoácidos en multitud de
combinaciones y secuencias diferentes.
Entre estos productos proteicos, los enzimas son los más variados y
especializados. Prácticamente todas las reacciones celulares están
catalizadas por enzimas.
Asparagina Espárrago
Ácido glutámico Gluten del trigo
Tirosina Queso (tyros = “queso”)
Glicina glykos = “dulce”
Los 20 aa estándares encontrados en las proteínas son α-aminoácidos.
Glicina
Al ser imágenes especulares no superponibles entre si, las dos formas
constituyen un tipo de estereoisómeros denominados enantiómeros.
Todas las moléculas con un centro quiral son también ópticamente activas, es
decir, hacen girar el plano de luz polarizada.
Para especificar la configuración absoluta de los cuatro sustituyentes de los
átomos de carbono asimétricos se ha desarrollado una nomenclatura
especial.
Los L-aminoácidos son los que tienen el grupo α-amino a la izquierda y los D-
aminoácidos los que tienen el grupo α-amino a la derecha.
Para todos los compuestos quirales, los estereoisómeros que tienen
configuración relacionada con la del L-gliceraldehido se designan L y los
estereoisómeros relacionados con el D-gliceraldehido se designan D.
Casi todos los compuestos biológicos con un centro quiral se presentan en la
naturaleza en una sola de sus formad estereoisoméricas, la D o la L.
La polaridad de la serina y
la treonina proviene de sus
grupos hidroxilo;
la polaridad de la cisteína de su grupo
sulfhidrilo;
y la polaridad de la asparagina y
glutamina de sus grupos amina.
La asparagina y la glutamina son las amidas de otro dos aminoácidos que
también se encuentran en las proteínas, aspartato y glutamato,
respectivamente, a los que se hidrolizan fácilmente por ácido o base.
La cisteína se oxida fácilmente formando un aminoácido dimérico unido
covalentemente llamado cistina, en el que dos moléculas de cisteína o
sus residuos están unidos a través de un enlace disulfuro.
Formación reversible
de un puente
disulfuro por
oxidación de dos
moléculas de cisteína.
Los grupos R más hidrofílicos son los que están cargados, sea positivamente o
negativamente.
Los dos aminoácidos que tienen grupos R con una carga neta negativa a pH
7,0 son el aspartato y glutamato, cada uno de los cuales tiene un segundo
grupo carboxilo.
Los aminoácidos pueden actuar como ácidos y como bases
En primer lugar, todos los aminoácidos con un solo grupo α-amino, un solo
grupo α-carboxilo y un grupo R no ionizable tienen curvas de titulación
parecidas a la de la glicina.
Estos aminoácidos
tienen valores de pKa
muy similares aunque
no idénticos; el pKa del
grupo —COOH en el
intervalo de 1,8 a 2,4 y
el pKa del grupo —NH3+
en el intervalo de 8,8 a
11,0.
En segundo lugar, los aminoácidos con un grupo R ionizable tienen curvas de
titulación más complejas, con tres etapas correspondientes a los tres pasos
de ionización posibles; tienen por tanto tres valores de pKa.
En la figura se
muestran las curvas
de titulación de dos
aminoácidos de este
tipo, el glutamato y
la histidina.
Los puntos
isoeléctricos reflejan
la naturaleza de los
grupo R ionizables
presentes.
Curvas de titulación de glutamato (anterior) y histidina. El pKa del grupo R se
designa como pKR.
Los 20 aminoácidos que se encuentran normalmente como residuos
en las proteínas contienen un grupo α-carboxilo, un grupo α-amino y
un grupo R característico unido al carbono α.
El grupo α-amino de un
aminoácido ( con el grupo R2)
actúa como nucleófilo
desplazando el grupo
hidroxilo de otro aminoácido
(con el grupo R1) para formar
un enlace peptídico.
Se pueden unir tres aminoácidos mediante dos enlaces peptídicos para formar
un tripéptido, de manera similar se pueden unir aminoácidos para dar
tetrapéptidos, pentapéptidos y así sucesivamente.
¿qué es lo que hace que una proteína sea un enzima, otra una
hormona, otra una proteína estructural y otra un anticuerpo? ¿Cómo se
diferencias químicamente? Las diferencias más obvias son
estructurales.
El oxígeno tiene una carga negativa parcial y el nitrógeno una positiva parcial,
formando un pequeño dipolo eléctrico.
Los seis átomos del grupo peptídico se hallan en el mismo plano, de modo que
el átomo de oxígeno del grupo carbonilo y el átomo de hidrógeno del nitrógeno
amídico se hallan entre ellos en posición trans.