dasar Virologi : definisi, morfologi, fisiologi, sifat kimia, biomolekuler virus, reproduksi dan klasifikasi virus. 2. Mahasiswa mampu memahami Aspek patogenitas dan respon terhadap infeksi virus 3. Mahasiswa mampu memahami Penyebaran virus 4. Mahasiswa memahami Jenis, cara koleksi, penanganan dan transportasi 5. Mahasiswa memahami Tehnik pembuatan kultur jaringan 6. Mahasiswa memahami Isolasi dan identifikasi virus 7. Mahasiswa memahami Pemeriksaan serologi terhadap Infeksi virus, rapid diagnostik, uji hambatan hemaglutinasi netralisasi dan fiksasi komplemen 8. Siswa memahami Sifat-sifat spesies virus dan jenis infeksi yang ditimbulkan 1. Mahasiswa mampu memahami dasar-dasar Virologi : definisi, morfologi, fisiologi, sifat kimia, biomolekuler virus, reproduksi dan klasifikasi virus. Definisi : • Merupakan suatu sub-mikroskopis, kecil (200-400nt), • partikel (virion) sendiri tidak 'tumbuh' dan tidak menjalani divisi / pembelahan Karena kurangnya informasi genetik yang mengkode aparatus diperlukan untuk pembangkitan energi metabolik atau untuk sintesis protein (ribosom). (tdk terdapatnya benda golgi) menjadikan virus sebagai parasit intraseluler obligat • Virus hanya dapat bereproduksi di dalam material hidup dengan menginvasi dan memanfaatkan sel makhluk hidup karena virus tidak memiliki perlengkapan selular untuk bereproduksi sendiri • viruses do not respire, • nor do they display irritability; • they do not move • and nor do they grow, • however, they do most certainly reproduce, and may adapt to new hosts. • Sedangkan mahluk lain: • Reproduction • Nutrition • Respiration • Irritability • Movement • Growth • Excretion • Morfologi / Struktur Virus ukuran dari 20 nanometer berdiameter, seperti Parvoviridae, untuk beberapa ratus nanometer panjang dalam kasus filoviridae • MorfologiFigure 1 Relative size of viruses and bacteria A. Components 1. Protein coat a. protection b. attachment c. identity d. immunity 2. Envelop a. lipid bilayer b. attachment spikes 3. Genome a. only DNA or RNA b. DNA - linear or circular, double or single stranded c. RNA single or double stranded Virus berenvelop atau tidak/naked • mengandung genom asam nukleat (RNA atau DNA) Kapsid (protein mantel pelindung) . FIVE BASIC STRUCTURAL FORMS OF VIRUSES IN NATURE • Naked icosahedral e.g. poliovirus, adenovirus, hepatitis A virus • Naked helical e.g. tobacco mosaic virus. So far no human viruses with this structure are known • Enveloped icosahedral e.g. herpes virus, yellow fever virus, rubella virus • Enveloped helical e.g. rabies virus, influenza virus, parainfluenza virus, mumps virus, measles virus • Complex e.g. poxvirus Nukleokapsid yang memiliki bentuk simetri icosahedral, heliks atau kompleks • Virus memiliki amplop atau tidak (telanjang) / naked virus • Virus terselubung mendapatkan amplop dengan tunas melalui membran sel inang. • kuncup virus melalui membran plasma atau amplop mungkin berasal dari membran sel internal seperti badan Golgi atau inti atau melalui bagian khusus dari membran plasma sel inang, misalnya, asosiasi virus Ebola dengan rakit lipid yang kaya sphingomyelin, kolesterol dan protein glypiated. • virus tidak harus membunuh sel tuan rumah untuk membuat envelop mereka untuk dirilis, mereka dapat keluar dari sel sebagai sebuah tunas (virus budding) yang dapat mengatur infeksi persisten.
• virus dapat segera menular hanya jika
amplop yang utuh ,ini berarti bahwa agen yang merusak amplop, seperti alkohol dan deterjen, mengurangi infektivitas. • Inkonvensional AGEN Ada juga kadang-kadang disebut dengan 'agen tidak konvensional' sebagai 'virus inkonvensional' atau 'virus atipikal' - Sampai saat ini, jenis utama yang telah diteliti adalah viroid dan prion dan HDV • Prions Types of prions: • Sheep version – scrapie (TSE) • Cow version – mad cow (BSE- a type of TSE) • Human version – Creutzfeldt-Jakob disease A disease-causing agent that is neither bacterial nor fungal nor viral and contains no genetic material. A prion is a protein that occurs normally in a harmless form. By folding into an aberrant shape, the normal prion turns into a rogue agent. It then coopts other normal prions to become rogue prions. Prion hanya mengandung protein (meskipun hal ini agak kontroversial). • Mereka adalah partikel protein kecil dan ada kontroversi apakah mereka mengandung asam nukleat, tetapi jika ada, sangat sedikit, dan hampir pasti tidak cukup untuk kode untuk protein: Contoh prion-menyebabkan penyakit manusia Kuru, Creutzfeldt-Jakob penyakit dan sindrom Gerstmann-Straussler. Prion juga menyebabkan scrapie pada domba. Prion • Viroid
Viroid mengandung RNA saja. Ukuran
kecil kecil (kurang dari 400 nukleotida), beruntai tunggal, RNA melingkar. tidak dikemas, tidak tampak kode untuk setiap protein, dan sejauh ini hanya telah terbukti berhubungan dengan penyakit tanaman. Beberapa terlibatpada penyakit manusia. Contoh Viroid • viroid hepatitis delta virus (HDV). • HDV memiliki genom RNA yang sangat kecil (~ 1700 nukleotida) dibandingkan dengan kebanyakan virus, meskipun agak lebih besar dari viroid. • HDV berbeda dari viroid dalam kode untuk protein. • B. Klasifikasi Taksonomi Virus • Bagaimana virus diklasifikasikan? Dua sistem klasifikasi ada: Sistem Klasifikasi virus hirarkis dan Sistem Klasifikasi Baltimore. • Virus biasanya tidak digolongkan ke dalam kelompok taksonomi konvensional tapi biasanya dikelompokkan menurut sifat seperti ukuran, jenis asam nukleat mengandung, struktur kapsid dan jumlah subunit protein di dalamnya, spesies inang, dan karakteristik imunologi • Classification of Viruses There are two different types of virus classification. The two different types of virus classification are as follows: · The Baltimore’s System for Classification · The Lwoff’s Scheme for Classification Baltimore’s System for Classification In the Baltimore’s System for Classification, there are seven groups of viruses. The seven groups of viruses are as follows: · Group I: dsDNA Viruses · Group II: ssDNA Viruses · Group III: dsRNA Viruses · Group IV: (+) sense RNA Viruses · Group V: (-) sense RNA Viruses · Group VI: RNA Reverse Transcribing Viruses · Group VII: DNA Reverse Transcribing Viruses • Sistem Klasifikasi virus hirarkis • Pada tahun 1962 Lwoff, RW Horne, dan P. Tournier klasifikasi dari seluruh virus yang terdiri dari filum - kelas - order - Keluarga - subfamili - genus - spesies - strain / jenis. Prinsip terkandung adalah bahwa virus harus dikelompokkan menurut sifat protperties dari sel atau organisme terinfeksi. Empat karakteristik utama :
1. Sifat asam nukleat: RNA atau DNA
2. Simetri dari kapsid 3. Ada atau tidaknya amplop 4. Dimensi dari virion dan kapsid • Famili : akhiran-viridae Caliciviridae, Picornaviridae, Reoviridae. • Genera memiliki akhiran virus. Dalam Picornaviridae ada 5 genera: Enterovirus, cardiovirus, rhinovirus, apthovirus dan hepatovirus. • Definisi `spesies 'adalah tugas yang paling penting namun sulit untuk virus. Ada unsur subjektivitas tentang hal itu. Klasifikasi David Baltimore • Tema sentral di sini adalah bahwa semua virus harus menghasilkan mRNA untai positif dari genom mereka, dalam rangka untuk memproduksi protein dan mereplikasi dirinya sendiri. • Mekanisme yang tepat dimana ini dicapai berbeda untuk setiap keluarga virus. • Berbagai jenis genom virus dapat dipecah menjadi tujuh kelompok fundamental yang berbeda, yang jelas memerlukan strategi dasar yang berbeda untuk replikasi mereka. • Dengan konvensi atas untai DNA coding yang ditulis dalam 5 '- 3' arah adalah + sense. urutan mRNA juga + replikasi strategi sense Klasifikasi virus Baltimore • Peranan Virus dalam Kehidupan • Beberapa virus ada yang dapat dimanfaatkan dalam rekombinasi genetika. Melalui terapi gen, gen jahat (penyebab infeksi) yang terdapat dalam virus diubah menjadi gen baik (penyembuh) disebut vaksin. Contohnya pembuatan vaksin polio, rabies, hepatitis B, influenza, cacar, dan vaksin MMR (Measles, Mumps, Rubella) untuk cacar gondong, dan campak. • Pada umumnya virus bersifat rnerugikan. Virus sangat dikenal sebagai penyebab penyakit infeksi pada manusia, hewan, dan tumbuhan. Sejauh ini tidak ada makhluk hidup yang tahan terhadap virus. Tiap virus secara khusus menyerang sel-sel tertentu dari inangnya. Virus dapat menginfeksi tumbuhan, hewan, dan manusia sehingga menimbulkan penyakit. • a. Penyakit pada tumbuhan yang disebabkan oleh virus c. Penyakit pada manusia yang disebabkan oleh virus lnfluenza Penyebab influenza adalah virus orthomyxovirus yang berbentuk seperti bola. Campak Campak disebabkan oleh virus paramyxovirus yang tidak rnengandung enzim Cacar air Cacar air disebabkan oleh virus Herpesvirus varicellae. Virus ini mempunvai DNA ganda dan menyerang sel diploid manusia. Hepatitis Hepatitis (pembengkakan hati) disebabkan oleh virus hepatitis. Ada 3 macam virus hepatitis yaitu hepatitis A, B, dau C (non-A,non-B). Gejalanya adalah demam, mual, dan muntah, serta perubahan warna kulit dan selaput lendir menjadi kuning. Polio Polio disebabkan oleh poliovirus. Serangan poliovirus menyebabkan lumpuh bila virus menginfeksi selaput otak (meninges) dan merusak sel saraf yang berhubungan dengan saraf tepi. ondong Penyakit gondong disebabkan oleh paramyxovirus AIDS AIDS (Acquired Immune Deficiency Syndrome) adalah penurunan sistem kekebalan tubuh yang disebabkan oleh virus HIV (Human Immunodeficiency Virus). Virus HIV adalah virus kompleks yang rnempunvai 2 molekul RNA di dalam intinya. Virus tersebut diduga kuat berasal dari virus kera afrika yang telah mengalami mutasi. Walaupun AIDS sangat mematikan, penularannya tidak semudah penularan virus lain. Virus HIV tidak ditularkan melalui kontak biasa seperti jabat tangan, pelukan, batuk, bersin, peralatan makan dan mandi, asalkan tidak ada luka di kulit. hewan dilakukan dengan cara vaksinasi.