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AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS

IMPORTANCIA MÉDICA
- Los L-α-aminoácidos y sus derivados participan en funciones celulares tan diversas como la
transmisión nerviosa y la biosíntesis de porfirinas, purinas, pirimidinas y urea.

- Los polímeros cortos de aminoácidos llamados péptidos desempeñan funciones importantes en el


sistema neuroendocrino como hormonas, factores liberadores de hormona, neuromoduladores o
neurotransmisores.

- Carecemos de la capacidad para sintetizar 10 de los 20 L-α-aminoácidos comunes en cantidades


adecuadas para apoyar el crecimiento de lactantes o para mantener la salud en adultos.

- La dieta del ser humano debe contener cantidades adecuadas de estos aminoácidos esenciales .
IMPORTANCIA MÉDICA
D-a- aminoácidos encontrados en microorganismos:

- Bacillus subtilis secreta una mezcla de d-metionina, d-tirosina, d-leucina y d-triptófano para
desencadenar el desmontaje de biopelícula.

- Vibrio cholerae incorpora d-leucina y d-metionina en el componente peptídico de su capa de


peptidoglucano.

- Algunos poseen valor terapéutico, entre ellos los antibióticos bacitracina y gramicidina, y el agente
antitumoral bleomicina.

- Los péptidos cianobacterianos microcistina y nodularina son mortales en dosis grandes, mientras
que las cantidades pequeñas promueven la formación de tumores hepáticos.

¿Significado de D y L? ¿Significado de a?
PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS
• EL CÓDIGO GENÉTICO ESPECIFICA 20 L-Α-AMINOÁCIDOS.
• Diversos AA son especificados por múltiples codones.
• Su redundancia limita los codones disponibles a los 20 l-α-aminoácidos.
• Algunas proteínas contienen aminoácidos adicionales que surgen por modificación de un
aminoácido ya presente en un péptido.
• Ejemplos :
• conversión de peptidil prolina y lisina en 4-hidroxiprolina y 5-hidroxilisina
• la conversión de peptidil glutamato en γ-carboxiglutamato.
• la metilación, formilación, acetilación, prenilación y fosforilación de ciertos residuos amino-acilo.
MODIFICACIONES POST-
TRADUCCIONALES

• diversidad biológica de las proteínas al alterar su solubilidad, estabilidad e interacción con otras
proteínas
• Selenocisteína, el vigésimo primer l-α-aminoácido.
MODIFICACIÓN DURANTE LA
• REEMPLAZO DE ÁTOMO DE AZUFRE POR SELENIO.
TRADUCCIÓN

• peroxidasas y reductasas, selenoproteína P que circula en el plasma, y las yodotironina


desyodasas conversión de la prohormona tiroxina (T4) en la hormona tiroidea 3,3'5-
triyodotironina (T3).

• En las proteínas solo existen l-a-aminoácidos.


• Varios l-α-aminoácidos libres desempeñan importantes funciones en procesos metabólicos.
Ejemplos:
• ornitina, citrulina y argininosuccinato en la síntesis de la urea
• la tirosina en la formación de hormonas tiroideas
• glutamato en la biosíntesis de neurotransmisor
• LOS AMINOÁCIDOS PUEDEN TENER CARGA NETA POSITIVA, NEGATIVA O DE CERO.

REPRESENTACIÓN
ZWITTERION A pH 7.4
ESQUEMÁTICA DE AA
• Los valores de pKa expresan las potencias de ácidos débiles.
Grupos funcionales pH circundante
Modificar el pH para
separar AA, péptidos
y proteínas

La carga neta de un aminoácido es la suma algebraica de todos los grupos con carga positiva y
negativa presentes

• A su pH isoeléctrico (pI) un aminoácido no porta carga neta. (¿Cómo se llaman?)


El pH isoeléctrico, también llamado pI, es el pH a la mitad entre valores de pKa para las
ionizaciones a ambos lados de las especies isoeléctricas.
• Para un aminoácido como la alanina que solo tiene dos grupos que se disocian, no hay
ambigüedad. La primera pKa (R—COOH) es 2.35, y la segunda (R—NH3+) es 9.69; de este
modo, el pH isoeléctrico (pI) de la alanina es:

• En el laboratorio clínico, el conocimiento del pI guía la selección de condiciones para separaciones


electroforéticas.
por ejemplo:
• electroforesis a pH de 7.0 separará dos moléculas con valores de pI de 6.0 y 8.0, porque a pH
de 7.0 la molécula con un pI de 6.0 tendrá una carga positiva neta (base débil), en tanto que
aquella con un pI de 8.0 posee una carga negativa neta (ácido débil).
• LOS VALORES DE PKA VARIAN CON EL AMBIENTE.
La presencia de grupos cargados adyacentes en los AA puede reforzar o contrarrestar efectos
solventes, de manera que la pKa de un grupo funcional dependerá de su localización dentro de una
proteína dada.

• LOS GRUPOS Α-R DETERMINAN LAS PROPIEDADES DE AMINOÁCIDOS.


En sistemas de “relevo de
Los grupos R cargados de interacciones
Mediante Por ejemplo carga” durante catalisis
aminoácidos básicos y ácidos iónicas o
enzimatica y transporte
estabilizan conformaciones puentes
de electrones en
proteínicas. salinos.
mitocondrias

El grupo alcohol primario de la serina Otro ejemplo


y el grupo tioalcohol primario (—SH)
de la cisteína son excelentes nucleófilos
y pueden funcionar como tales durante
la catálisis enzimática.
• LOS GRUPOS FUNCIONALES DICTAN LAS REACCIONES QUÍMICAS DE LOS AMINOÁCIDOS.

• Grupo ácido carboxílico: formación de Ésteres, amidas y anhídridos ácidos


• grupos amino: acilación, amidación y esterificación
• Grupos —OH y —SH: oxidación y esterificación.
• La reacción de mayor importancia de los aminoacidos es la formacion de un enlace péptido
• LA SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS DETERMINA LA ESTRUCTURA PRIMARIA.
• El numero y el orden de todos los residuos aminoácidos en un polipéptido constituyen su estructura
primaria.
• Los aminoácidos presentes en péptidos reciben el nombre de residuos aminoacilo y obtienen su
denominación mediante remplazar los sufijos –ato o -ina de Aminoácidos libres por –il
Por ejmplo: alanil, aspartil, tirosil

• La nomenclatura de los péptidos esta en función de los derivados del residuo aminoacilo carboxilo
terminal.
por ejemplo: Lis-Leu-Tir-Gln se llama lisil-leucil-tirosil-glutamina.
• la terminación -ina en la glutamina indica que su grupo carboxilo α no participa en la formación
del enlace peptídico.
• Las estructuras peptídicas.
• Los prefijos como tri- u octa- denotan péptidos con tres u ocho residuos.
• Los péptidos se escriben con el residuo que porta el grupo amino α libre a la izquierda.
Pasos para dibujar una cadena peptídica:
1) se usa un zigzag para representar la cadena principal o esqueleto.
2) Se añaden los principales átomos de la cadena, mismos que se presentan en el orden de
repetición: nitrógeno a, carbono α, carbono carbonilo.
3) se adiciona un átomo de hidrogeno a cada carbono α, y a cada nitrógeno péptido, y un
oxigeno al carbono carbonilo.
4) se añaden los grupos R apropiados.
• OTRA REPRESENTACIÓN:
• Las abreviaturas de tres letras enlazadas por lineas rectas representan una estructura primaria no
ambigua. Las lineas se omiten para abreviaturas de una sola letra.

• ALGUNOS PÉPTIDOS CONTIENEN AMINOÁCIDOS POCO COMUNES.


En mamíferos, las hormonas
peptídicas en forma típica solo otros péptidos pueden contener
Pero a veces
contienen los veinte aminoácidos no proteínicos, derivados de
aminoácidos α genéticamente los aminoácidos proteínicos, o
codificados enlazados aminoácidos ligados por un enlace
por enlaces peptídicos estándar. peptídico atípico.
• POR EJEMPLO:
• el glutamato amino terminal del glutatión, un tripéptido que participa en el plegado de proteína
y en el metabolismo de xenobióticos, esta ligado a la cisteína mediante un enlace peptídico no α
• OTROS EJEMPLOS:
• Los aminoácidos no proteínicos d-fenilalanina y ornitina están presentes en los antibióticos
peptídicos cíclicos tirocidina y gramicidina S.
• los opioides heptapeptídicos dermorfina y deltoforina en la piel de ranas arborícolas (plataneras)
sudamericanas contienen D-tirosina y D-alanina.

• LOS PÉPTIDOS SON POLIELECTRÓLITOS.


• A pH fisiológico enlace peptídico no cargado.
• La formación de péptidos a partir de aminoácidos está acompañada de pérdida neta de una
carga positiva y una negativa por cada enlace peptídico formado.
• Sin embargo, los péptidos si están cargados a pH fisiológico.
¿De donde se obtiene esa carga?
Grupos carboxilo y amino terminales Grupos R acídicos y básicos.

• Al igual que para aminoácidos, la carga neta sobre un péptido depende del pH de su ambiente y
de los valores de pKa de sus grupos en disociación.
• EL ENLACE PEPTÍDICO TIENE CARÁCTER DE DOBLE ENLACE PARCIAL.
• Aunque los péptidos se escriben como si un enlace único enlazara los átomos carboxilo α y
nitrógeno α, este enlace de hecho muestra carácter de doble enlace parcial:
• Este doble enlace parcial nos lleva a:
No hay libertad de rotación alrededor del enlace que conecta el carbono carbonilo y el nitrógeno
de un enlace peptídico.
Por lo tanto:

• Los átomos de O, C, N y H de un enlace peptídico son coplanares.

Esto influye en:


• La manera en la cual los péptidos y las proteínas se pliegan para generar ordenes de estructura
superiores.
• DIMENSIONES DE UNA CADENA POLIPEPTÍDICA EXTENDIDA POR COMPLETO.
• LAS FUERZAS NO COVALENTES RESTRINGEN LAS CONFORMACIONES DE PÉPTIDOS.
• El plegado de un péptido probablemente ocurre de manera coincidente con su biosíntesis.
• ¿Cuáles son las interacciones no covalentes?
• formación de enlaces de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas
• Sumando:
• Las características químicas de la secuencia de AA, el impedimento estérico y las fuerzas no
covalentes.

Determinan las conformaciones peptídicas

Las conformaciones frecuentes comprenden hélices α y hojas plegadas β


• ANÁLISIS DEL CONTENIDO DE AMINOÁCIDOS DE MATERIALES BIOLÓGICOS.
• Para determinar la identidad de cada aminoácido presente en una proteína, primero se trata con
acido clorhídrico caliente para hidrolizar los enlaces peptídicos.
• Hay varios métodos para separar, y para identificar, aminoácidos derivados de un hidrolizado de
proteína o de orina u otros líquidos biológicos.
• 1) Hacer reaccionar los aminoácidos con 6-amino-Nhidroxisuccinimidil carbonato para formar
derivados fluorescentes que pueden separarse mediante cromatografía liquida de alta presión.
• 2) Cromatografía de partición sobre un soporte sólido. Los aminoácidos presentes son separados
mediante una fase móvil que contiene una mezcla de componentes polares y no polares miscibles.
Después de eliminar el solvente mediante secado con aire, los aminoácidos se visualizan usando
ninhidrina, que forma productos de color púrpura con los α-aminoácidos, pero un aducto de color
amarillo con prolina e hidroxiprolina.