OPERON ARA

Codifica los 3 enzimas necesarias

para catalizar el metabolismo de
arabinosa
 El Operon Arabinosa
Arabinosa es un azúcar de 5 carbonos.
De manera similar al Operón Lac, el Operón Ara
codifica tres genes estructurales: AraBAD

que se encuentran bajo la regulación del

regulador general CRP y de la proteína Ara
C.
Los tres genes estructurales codifican para
proteínas requeridas para convertir
Arabinosa a D-xylulosa-5-Fosfato.

D-xylulosa-5-Fosfato puede entrar a la vía de las

Pentosas Fosfato para generar enegía en la
célula.
2
Arabinosa ribulosa
arabinosa isomerasa
(ara A)

Ribulosa+ ATP ribulosa-5-P

ribulosa cinasa
(ara B)

Ribulosa-5-P xylulosa-5-P
ribulosa-5-Pepimerasa
(ara D)

ciclo de las pentosas

E. coli puede crecer utilizando arabinosa como fuente de
carbono y energía.

En ausencia de arabinosa, el nivel basal de expresión de

las proteínas relacionadas con el “uptake” y metabolismo
de arabinosa, es de 1/300 del nivel inducido.

Aunque no pertenece al operón, el producto de uno de los

genes relacionados con la arabinosa, la proteína AraC,
induce la expresión de los genes que codifican para
proteínas específicas relacionadas con la arabinosa,
además de controlar su propia expresión y de actuar
como un sensor del azúcar.
 ENZIMAS
Arbinosa isomerasa. Codificada por ara A. convierte arabinosa a ribulosa

Ribulocinasa. Codificada por ara B. Fosforila ribulosa

Ribulosa-5-fosfatasa epimerasa. Codificada por araD. Convierte ribulosa-5-

fosfato a xilulosa-5-fosfato el cual puede ser metabolizado en la via de la
pentosa fosfato

Los 3 genes estructurales del operon son regulados

por la proteìna araC
El operón Arabinosa está bajo control
positivo y negativo
El gen araC codifica para la proteína reguladora C
(homodímero); se encuentra fuera del operón.

La proteína C:
-reprime la transcripción, pero al unirse a la
arabinosa se convierte en un activador (inducción
positiva)

-es capaz de autorregularse, inhibiendo su propia

síntesis cuando su concentración es alta.

-en presencia de arabinosa promueve la síntesis de

AraE, AraF, AraG y AraH, los cuales son requeridos
para el “uptake” de arabinosa, así como las proteínas
AraB, AraA y AraD (operon ara: BAD), las cuales se
requieren para su metabolismo.
 Dependiendo de su unión a arabinosa

+
araI: Sitio de unión AraC.
Pc:Promotor araC.
PBAD: Promotor operón Ara
Regulation of Gene Expression in Prokaryotes
AraO1 y O2: sitios operadores http://www.bioinfo.org.cn/book/biochemistry/chapt27/bio4.htm
El operón tiene 3 sitios regulatorios:
La interacción de AraC con los sitios operadores (O), determina dos sitios
reguladores de la transcripción del Operón ara y uno de autoregulación de
la proteína C.

Una cuarta regulación se da en el sitio CRP; en presencia de arabinosa,

la proteína CRP promueve el re-arreglo de AraC de un estado represor de
PABD a uno activador a partir del mismo promotor.
Entonces existen tres lugares de unión de AraC:

Operador ara O1 (R y L), operador araO2 y el sitio inductor

araI.

-araO1 (R y L). Es un sitio operador al cual se une AraC,

reprimiendo su propia transcripción desde el promotor PC
(promotor de Ara C).
-araO2. Operador al que se une Ara C para reprimir
transcripción.

AraI(I1e I2). Es el sitio inductor.

En presencia de arabinosa, …..

AraC-arabinosa se une en araI activando la expresión de PBAD.

La presencia de CRP ayuda a que se rompa el bucle y permite
unión de ara C con O1 y araI , permitiendo transcripción de BAD.
 Características principales de la Regulación del
Operón Ara:presencia de arabionosa

En presencia de arabinosa:

1. La arabinosa se une a AraC en su dominio N-terminal, liberando

los dominios de unión al DNA en O2 y promoviendo ahora la
unión de este complejo a I1 y I2.

2. En ausencia de glucosa (no hay represión catabólica), los

niveles de AMPc aumentan y el complejo AMPc-CRP se une
adyacente a I1.

La ocurrencia de ambos eventos, promueve la expresión del Operón

AraBAD.

13
 En presencia de arabinosa . La presencia de CRP
ayuda a que se rompa el bucle y permite unión de
ara C con O1 y araI . Permitiendo transcripción de
BAD
Activación

Si la arabinosa está presente, se forma un complejo AraC-arabinosa que se

une a araI.
Este complejo es necesario, junto con CRP-AMPc, para facilitar la unión de la
RNApol al promotor y transcribir el Operón ara
En ausencia de arabinosa,…

AraC se une a araI y simultáneamente a los

operadores, para regular al promotor BAD y
autoregularse; dependiendo del operador con el
cual interactué:

-Ara C se une simultáneamente al

sitio operador araO2 y a araI, formando un loop
y reprimiendo la transcripción desde el
promotor PBAD.

- Si hay exceso de Ara C, la proteína también

se une a araO1 y se evita la transcripción de la
proteína C, autoregulando su expresión.
 Glucosa a niveles altos
arabinosa a niveles bajos

araO2
Proteínas
AraC
araC
araO1
araBAD

araI PBAD
PC
Sitio de unión de CAP
Si no hay proteína C, se estimulará su propia síntesis.

Si no hay arabinosa, la proteína C se unirá a araI y a araO2, con lo que se

formará un bucle que impedirá que haya transcripción de los genes BAD.

La formación del bucle depende de la presencia de arabinosa.

 Características principales de la Regulación del
Operón Ara: ausencia de arabionosa

Arabinosa es un regulador positivo de la transcripción del

Operón.

En ausencia de arabinosa:

1. El dominio N-terminal de un dímero de AraC se une a

los sitios reguladores araI y araO2, formando un loop
entre ellos.

2. La transcripción tanto del gen araC como del Operón

AraBAD es reprimida (se bloquea el promotor ara, que
es débil).
 Control transcripcional de ara
1. Por Ara C: Represión y Activación
P P
t
t O2 O1 CRP

I1 I2
araC araB araA araD

-No L-arabinose
O2
O2
AraC dimer is flexible
P araC P araBAD
P araC P araBAD repressed
Active repressed
repressed
ara O1
ara (I1 I2)
O1 (I1 I2)
Excess AraC binds to O1 regulating
AraC binds to O2 and ara I1 repressing cellular levels of AraC protein
P araBAD 19
 Control transcripcional de ara
2. Por CAP
P P
t
t O2 O1 CRP

araC I1 I2 araB araA araD

2. + Inducer L-arabinose
+ cAMP-CRP

P P araBAD induced
t O2 O1 (activated)

I1 I2

AraC binds to I2 and I1 activating P araBAD

21
AraC actúa como dimero. El dominio terminal de una de las AraC
interactúa con una de las subunidades α de la RNApol; la otra
unidad α interactúa con CAP-AMPc
 Regulación del operón ara
Glucosa a niveles bajos
arabinosa a niveles altos

CAP-cAMP
RNA
Proteína AraC polimerasa
O1
araC araBAD
araO2
PBAD
araI
PC

araBAD mRNA
arabinosa

En resumen, para que haya transcripción debe haber arabinosa,

proteína C y Cap – AMPc.
Hay diferencias fundamentales entre los
Operones Lac y Ara:

1. AraC puede actuar tanto como represor

como activador de la expresión de
AraBAD, por lo que también es un
ejemplo de control positivo.

2. AraC regula su propia síntesis por

reprimir su propia transcripción. Esta
propiedad puede observarse en la
regulación de muchos genes.

3. El operón Ara es un ejemplo de la

regulación a distancia por formación de
un loop en el DNA.