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Fibrinogen and Fibrin

Russell F. Doolittle
proteasa
Fribrinógeno

Trombina

Fibrina

Plasmina

Degradación
1949 Cecil E. Hall and Henry S. Slayter

C:

Shadowing technique
Negative Staining
X-ray-diffraction

Shadowing technique
1951 W. T. Astbury and Kenneth Bailey
Massachusetts Institute of Technology,

 Diferencias entre Fibrina y Fibrinógeno


 Mismo patrón de difracción entre ellas y
con proteínas fibrosas como queratina
y miosina
 Se clasifican en proteínas con coiled
coils donde 2 o mas alfa hélices están
enrolladas juntas
1952 John D. Ferry

 La liberación de los fibrinopéptidos con carga negativa permite a


los monómeros polimerizar
 230 Å
Fibrinógeno Humano
-4 -8 -4
 Fibrinógeno: -8
 Fibrinopéptido: A -1
 Fibrinopéptido: B 5 +5
-1
 Fragmento D = -A
Estudios fisicoquímicos entre 1940-1950

340,000 Da
3, 000 amino acids.
1961 Nussenzweig Instituto Pasteur

 Romperla con plasmina


 Los fragmentos mas grandes que se obtuvieron se llamaron A, B, C, D y E
 Encontraron el doble de D en comparación de E

1963 Elemer Mihalyi of the National


Heart, Lung, and Blood Institute  Degradaron con tripsina
 Vulnerabilidad (linked globules)
 Los glóbulos rotan independientemente
1968 Víctor J . Marder of the National
Institute of Arthritis and Metabolic
Diseases

Pathway degradación por plasmina


Resultados consistentes con la situación en donde una
enzima corta los enlaces entre dominios de una molécula
tri globular
No secuencia de AA

 Determinación de secuencia amino terminal


 3 grupos identificados con 2 copias = 340 000 Da
 Purificación de las 3 cadenas = 170 000 Da
 2 sets de 3 cadenas (aβγ) diferentes interconectadas con puentes
disulfuro (cisteínas)
1971 Blomback at Karolinska Institute

 Bromuro de cianógeno (c terminal M)


 Aislamiento de fragmentos N terminal de las 3 cadenas
 S-S dímeros
 6 Amino terminal cerca
 Secuenciación 247aa
1974 John W. Donovan and Mihalyi

Melting point
2 diferentes (D y E)
2 dominios no en intimo
contacto
1975 VictorMarder

 Disulfide knot similar al fragmento E


 Hay 2 fragmentos D por cada fragmento E
 Fragmento E es el dominio central del fibrinógeno
 Los 2 fragmentos D son los dominios terminales
1977 Nancy M. Tooney and Carolyn
Cohen

 Microcristales de fibrinógeno parcialmente digerida


 Microscopia electrónica y patrones de difracción
 450 Å
knobs

holes
1980 Andrew P. Laidano and Doolittle
β
 Knobs Sintéticos A se unieron inhibiendo la polimerización de la
fibrina
 Knobs sintéticos B se unieron a fibrina pero no impidieron
polimerización
 Pilimerizacion depende de los knobs alpha
1983 Agnes Henschen’s at Max Planck
Institute for Biochemistry and Russell F.
Doolittle at the University of California at
San Diego.
 Secuenciaron la proteína completa (independiente)
 Cadena 610 aa
 Cadena β 461 aa
 Cadena γ 411 aa
 Total 1,482 aa en cada mitad del dímero.
 329,842 Da (10,000Da se agregan por 2 clusters de carbohidratos)
1983 Robley Williams at California
University
Consideraciones especiales

Las 3 hélices son homologas (localización de S-S)


Todas incorporan un set de cisteínas CXYZC
Hay un segundo set a 111aa ( γ) y 112aa (β)
Disulfide bonds
 Los extremos carboxilo terminal
beta y gama están
empaquetados, formando el
fragmento D
 El extremo carboxilo terminal
Alpha no esta empaquetado
porque es polar
 Fibrinógeno sin el C terminal Alpha
= fragmento x
1999 Haverkate University of Leiden

 Fragmento D iones de calcio


 Sin calcio se digiere la cadena gamma y no se unen los knobs
 El carboxilo terminal de la cadena gamma contribuye a la
formación de los holes para los Alpha knobs
Estabilización

 Las fibras de fibrina se estabiliza con con los enlaces covalentes


que forman entre monómeros
 Enzima factor XIII forma
enlaces peptídicos
entre cadenas gamma de dos
monómeros
 La plasmina corta estos
links forma el fragmento D
Gracias c:
 https://oncohemakey.com/fibrinogen-structure-and-function/
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/936108

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/13729934

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