Genética y Bioquímica I

Ricardo Fujita, Ph.D.

Centro de Genética y Biología Molecular
 Seres vivos
4,500 Millones Años
Moléculas: carbohidratos, lípidos, ácidos nucleicos, proteínas
Procesos: replicación, transcripción, traducción, regulación
Información Genética
 Información Genética
Fertilización

2 X 1014 células
adulto
2X1023 60 años
 Carbonos de la desoxi/oxi ribosa
• 1’ Base nitrogenada
• 2’ H (ADN) / OH (ARN)
• 3’ OH-Interaccion con P
(5’) de otro nucleotido
• 4’
• 5’ – PPP- interaccion
con OH (3’) de otro
nucleotido
 La formación de nucleótidos de DNA

fosfato + desoxirribosa + base nitrogenada = Deoxinucleótido

5’
1’

3’
 Bases Nitrogenadas
6
1 5 7
23 4 98

4
5
3
2 1 6
 Funciones de los nucleótidos

• Unidades monoméricas de ácidos nucleicos

• Metabolismo energético y componentes coenzimáticos: ATP, GTP, NAD,

FAD, CoA

• Mensajes intracelulares: AMPc, GMPc

 Síntesis de nucleótidos

• https://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.php

• Dos vías principales:

• Biosíntesis de novo: a partir de precursores ribosa, aminoácidos, THF, ATP

• Vías de recuperación/rescate/salvataje: reciclaje de ácido nucleicos

• Regulación: síntesis o catabolismo dependiendo de concentración y necesidad

• Intermedio común: purinas IMP; pirimidinas UDP

Precursor importante para todas las vías: PRPP

Activación de sitio 1´de la ribosa – 5-P

Síntesis de novo
Purinas
Intermediario IMP
Síntesis de AMP y GMP del precursor IMP
 Regulación de la síntesis de novo de las Purinas

Purinas

5-P-Ribosa PRPP PRA IMP AMP

GMP
PRP amido transferasa
ADP
GDP

Estimulación ATP
Inhibición GTP
Catabolismo

Insoluble excretado orina

 Salvamento de purinas
Conversión de base a nucleótido por transferencia de fosforibosa por PRPP
Síntésis de novo de las pirimidinas
 Síntesis de novo Pirimidinas

Mucho mas simple que

purinas
Intermediario UDP

TetraHidroFolato (THF)
Para generar deoxitimidina se necesita THF

Inhibidores de síntesis de DNA

Análogos ácido fólico atacan
DHFR
 Regulación de síntesis de novo de Pirimidinas
PRPP
ATP

THF – ácido fólico

Estimulación
Inhibición
DNA fibrilar
Chargaff: A=T; G=C
La única forma que sean 2 nm
Secuencia en un cromosoma: decenas-centenas de
millones de nucleótidos
…ACCTAGGGATACATACAGATACAGTACCC…
 Todo está escrito en secuencia de DNA:
información
• Gen

• Exon

• Promotor

• Espaciador

• Regulador
Secuencia Parcial del Gen de la Insulina
¿Cuáles son cadenas del DNA?
1) 5´AAGATTCCATGATCAGATCCCCA3´

2) 5´TTCTAAGGTACTAGTCTAGGGGT3´

3) 5´TGGGGATCTGATCATGGAATCTT3´
 Replicación
• Principio Universal procariotes eucariotes
• Reproducción individuo, preservación especie
• Objetivo: 2 copias exactas para 2 células hijas. De cigoto a
indivíduo (1014) vida (1023).
• Alta fidelidad, verificación y reparación: estabilidad genética
individuo y especie
• Fase S ciclo celular Semiconservativa, bidireccional
• Varias DNA polimerasas (varias: replicación, reparación, ambas)
• Otras proteínas reconocen DNA, estructura, mutaciones, proteínas
entorno celular, etc.)
• Una cadena continua y la otra discontinua (Okazaki en eucariotes
cada tira tiene distinta polimerasas y proteínas)
• Fallas en replicación: enfermedades degenerativas, cáncer
• http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Replicacion/Replicacion.h
 Replicación necesita:
• Deoxinucleótidos trifosfato (dNTPs): dATP, dCTP, dGTP,
dTTP
• Origen de replicación (secuencia específica). Reconocimiento
 200-300 bp una cadena rica en A yTs.
• DNA polimerasa: siempre sintetiza 5’ -> 3’ varias replicación,
reparación. Procariota/eucariota. Mitocondrial/nuclear.
• Primer (iniciador): necesita 3’OH para iniciar. RNA cebador,
DNA (virus), telomerasa, proteínas (virus).
• Complejo con otras proteínas: ligasas, helicasa, SSB, primasa,
topoisomerasa, etc.
Origen de Replicación
 Esquema general de la replicación

Dirección del
desenrrollamiento

topoisomerasas
helicasas
primer RNA

(cadena discontínua)
(cadena contínua)
 Esquema de las burbujas de
replicación en eucariotas
(E. coli) 1 sola horquilla de replicación 30’ Genoma 4.5 millones bp (4.5
Mb)
Genoma humano (3, 200 millones de pares de bases), cuanto tiempo?
500 horas (20 días?). Linfocitos en cultivo 20 horas => varios puntos a
la vez,  20,000 puntos,  150 kb c/u
 Antibióticos y replicación
• Actúan en precursores o maquinaria
• Sulfonamidas: inhibe ácido fólico bacteriano.
Metotrexato inhibe ácido fólico eucariota
• Hidroxiúrea inhibe ribosa => dribosa
• Arabinósidos: imita ribosa (no tiene 3’OH) en
nucleótido. Citarabina (antileucémicos), ara A
(antiviral). Primasa y DNA Polimerasa afectados
• Modificación: agentes alquilantes (ciclofosfamidas,
mitomicina), rayos X
• Inhibición topoisomerasas: quinolonas bacterianas,
ciprofloxacina, norfloxacina. Irinotecán eucariotas.
• Mitosis: Taxol, vinblastina, vincristina.
 Arabinósidos
Irinotecan
Topoisomerasa