• Una reacción química es aquella en la que se crean o rompen
enlaces covalentes • Las células realizan numerosas reacciones químicas • Muchas reacciones son demasiado lentas para la vida • Esto se debe a la energía de activación LAS ENZIMAS
• Las enzimas aceleran las reacciones químicas
• Actúan como catalizadores • Gran parte de la historia de la bioquímica está basada en las enzimas • Los catalizadores biológicos se describieron a fines del siglo XVIII en estudios sobre la degradación de carne en el estómago • La mayoría de las enzimas son proteínas • La función depende de la conformación • Muchas enzimas tienen componentes no proteicos asociados • Un grupo unido covalentemente a la enzima se denomina prostético • La enzima completa con el grupo prostético se denomina holoenzima • La parte proteica se denomina apoenzima o apoproteína COFACTORES
• Muchas enzimas tienen cofactores,
que pueden ser orgánicos o inorgánicos • Si el cofactor es una molécula orgánica compleja se denomina coenzima • Algunas enzimas requieren tanto una coenzima, como uno o más cofactores FUNCIÓN DE LAS ENZIMAS
• Las enzimas no cambian el
equilibrio de las reacciones • Solo las aceleran • La enzimas disminuyen la energía del estado de transición • En el transcurso de reacción se pasa por este estado de mayor energía, y por ende inestable • El estado de transición es solo un momento molecular fugaz
𝑬 + 𝑺 ⇋ 𝑬𝑺 ⇋ 𝑬𝑷 ⇋ 𝑬 + 𝑷
• Los complejos enzima sustrato y
enzima producto ocupan valles en la coordenada de reacción, es Aunque una reacción tenga una decir, están estabilizados diferencia energética alta, no necesariamente va a ser rápida SITIO ACTIVO: COMPLEMENTARIO AL ESTADO DE ACTIVACIÓN VELOCIDAD DE REACCIÓN
• La velocidad de una reacción depende de la concentración de
reactivo (sustrato) y una constante Para 𝑆 → 𝑃, la ecuación de velocidad es 𝑉 = 𝑘[𝑆] • Si una constante de velocidad de primer orden es 0,03 s-1, se puede interpretar cualitatativamente como que el 3% del sustrato será convertido en producto en 1 s. FUNCIONAMIENTO DE LAS ENZIMAS (RESUMEN 6.2 LEHNINGER) CINÉTICA (ENZIMÁTICA)
• El estudio de la velocidad de reacción y
cómo ésta es afectada por el cambio de diversos parámetros es la manera más usual de estudiar las enzimas • La velocidad de la reacción depende de la concentración de sustrato • El problema es que la concentración disminuye con la reacción • Los bioquímicos “solucionaron” el problema midiendo el parámetro V0, la velocidad inicial, que se obtiene cuando [S] es mucho mayor que [E] • Normalmente la enzima se encuentra en concentraciones 5 o 6 órdenes de magnitud menor que el sustrato EFECTO DEL SUSTRATO
• A concentraciones bajas de sustrato la
velocidad aumenta de manera lineal • A mayores concentraciones de sustrato, la velocidad va aumentando cada vez menos • Finalmente se llega a una meseta • Esta velocidad se denomina Vmax, velocidad máxima • El comportamiento cinético de las enzimas fue estudiado por varios investigadores • Quienes pasaron a la historia fueron Michaelis y Menten, quienes en 1913 propusieron un modelo matemático de la reacción enzimática CINÉTICA DE MICHAELIS - MENTEN
• El paso de formación del complejo enzima – sustrato es reversible y
relativamente rápido, es seguido de un paso más lento en el que se forma el producto 𝒌𝟏 𝒌𝟐 𝑬 + 𝑺 ⇋ 𝑬𝑺 ⇋ 𝑬 + 𝑷 𝒌−𝟏 𝒌−𝟐 • Puesto que el segundo paso es más lento y por ende limitante, la velocidad global de la reacción es proporcional a [ES] • A baja [S], la mayor parte de la enzima está sin combinar (E), por lo que la velocidad depende de [S] • La Vmax se alcanzará cuando toda la enzima esté formando el complejo ES, y [E] sea cercano a 0. Esta situación se denomina saturación • Como en esta situación cualquier enzima libre se unirá inmediatamente al sustrato, [ES] prácticamente no cambia, alcanzándose lo que se denomina como estado estacionario ECUACIÓN DE MICHAELIS - MENTEN 𝑽𝒎𝒂𝒙 [𝑺] 𝑽𝟎 = 𝑲𝒎 + [𝑺]
• Describe la velocidad inicial respecto a
la concentración del sustrato • Km se conoce como la constante de Michaelis • Concentración de sustrato a la que se obtiene ½ Vmax • Km >> [S] • [S] ≈ 0 𝑽𝒎𝒂𝒙 [𝑺] 𝑽𝟎 = 𝑲𝒎 • [S]>>Km Cuando [S]=Km V0= ½ Vmax 𝑽𝟎 = 𝑽𝒎𝒂𝒙 • Los parámetros de la ecuación de Michaelis – Menten se usan para describir y comparar actividad enzimática CINÉTICA DE MICHAELIS - MENTEN
• Muchas enzimas siguen la cinética de Michaelis – Menten
• Todas ellas cumplen la regla que si [S] = Km, V0 es la mitad de Vmax • La principal excepción a la cinética de Michaelis – Menten son las enzimas reguladoras • La ecuación de Michaelis – Menten no depende del mecanismo de dos pasos propuesto por ellos • Hay enzimas con mecanismos muy complejos y que cumplen con la ecuación • Vmax y Km son los parámetros utilizados para caracterizar las enzimas • Sin embargo, no dan información sobre el número, naturaleza o velocidad de los pasos de la reacción involucrada GRÁFICA DE DOBLES RECÍPROCOS
• Una manera más clásica de representar
la ecuación de Michaelis – Menten es la gráfica de Lineweaver – Burk • Es “más útil” porque es lineal, lo que simplificaba la determinación de los parámetros cinéticos cuando no había computadores • La ecuación de esta recta es un reordenamiento de la de Michaelis – Menten 𝟏 𝑲𝒎 𝟏 = + 𝑽𝟎 𝑽𝒎𝒂𝒙[𝑺] 𝑽𝒎𝒂𝒙 OTROS PARÁMETROS CINÉTICOS Y COMPARACIÓN DE ENZIMAS
• Número de recambio: es una constante de velocidad de primer
orden llamada kcat • Es equivalente al número de moléculas de sustrato que se convierten en producto por unidad de tiempo, en una sola molécula de enzima saturada EFICIENCIA CATALÍTICA
• Cada enzima tiene valores característicos de kcat y Km, que reflejan
el ambiente celular, la concentración de sustrato y la química de la reacción • En general, Km suele ser igual a la concentración celular de sustrato • La mejor comparación de eficiencia catalítica es la relación kcat/Km, denominada constante de especificidad • El límite de este valor está determinado por la velocidad de difusión, que está entre 108 y 109 M-1s-1 • Muchas enzimas han alcanzado un valor muy cercano a ese, llegando a la “perfección catalítica” TAREA: AUTOESTUDIO
• Revise los siguientes conceptos en el libro
• Mecanismo de catálisis (Fig. 6-5, 6-8) • Tipos de catálisis (pg. 200-202: “Grupos catalíticos específicos contribuyen a la catálisis”; Fig. 6-10) • Resumen del capítulo 6.3 ¿PREGUNTAS? ¿IDEAS? ¿SUGERENCIAS?