NUCLÉOTIDOS Y

ÁCIDOS NUCLEICOS

Q.F.B. Lénica R. Tecanhuey Fernández

 Clases y origen de los ácidos nucleicos

Ácido nucleico Origen

DNA
DNA nuclear Núcleo de los eucariontes
DNA celular Procariotes
DNA plasmidial Procariotes
DNA mitocondrial Mitocondria de los eucariotes
DNA de los cloroplastos Cloroplastos
DNA viral Virus animales, vegetales y bacterianos

RNA
RNA mensajero Procariotes y eucariotes
RNA ribosomal Procariotes y eucariotes
RNA de transferencia Procariotes y eucariotes
RNA nuclear pequeño Eucariotes
RNA viral Virus animales, vegetales y bacterianos
RNA subviral Moléculas de RNA libres

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 • RNA.-Ácido Ribonucleico
• DNA.-Ácido Desoxiribonucleico

• Funciones biológicas:
– Almacenamiento
– Replicación Información
genética
– Recombinación
– Transmisión
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991
 Nucleótidos
• Componentes monoméricos de
los ácidos nucleicos
• Ac. Nucleicos = polinuclétidos

• Formados:

• Enlace
éster
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991
 Cadena polinucleótida

Enlace
éster

Enlace
Fosfodiéster
3´ 5´

Unidades
monoméricas de
nucléotidos

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

Azúcares del DNA Y RNA
• RNA: β-D-ribosa
• DNA: β-D-2-desoxirribosa
Sistema anular
pentosas
de furanosas
Conf. D

Conf.β

Barahona. A y Piñero. D. Mirando dentro del gen.

http//:omega.ilce.edu.mx:3000/.../ 125/img/gen066.gif
 Purinas y Pirimidinas
-
+
Bases
-
Nitrogenada +
DNA:
A, G, C, T
RNA:
A, G, C, U
• UV

J. Sancho. Estructura de Macromoléculas. Lehninger. http://bifi.unizar.

es/jsancho/estructuramacromoleculas/12nucleotidos/bases3.JPG
?
modificadas
 Nucleósidos
• S-B (azúcar-base)
Puromicina
?
Pirimidinas:
C1 (β) N1
9 1
5
2

1 2
Purinas: 5
C1 (β) N9

Benvinguts a la Viquipèdia, l’enciclopèdia lliure. http://ca.wikipedia.org/wiki/Portada

 Nucleótidos
• Nucleósido + Fosfato en el azúcar
• Enlace éster (5´ de la pentosa)

Ribonucleótidos Desoxirribonucleótidos

5 5

Trifosfonucleótido
Difosfonucleótido
Monofosfonucleótido

Benvinguts a la Viquipèdia, l’enciclopèdia lliure. http://ca.wikipedia.org/wiki/Portada

 Nucleótidos cíclicos
• AMP cíclico
• GMP cíclico

ATP cAMP

AMP
Adenilato
ciclasa
Esterasa

Encilopedia wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Image:A-B-Z-DNA_Side_View.png

 Extracción y aislamiento de los ácidos nucleicos

• Propiedades del DNA

– Insolubles en sol. diluidas de NaCl
– Soluble en sol. concentradas NaCl
– Insoluble en alcohol
– Detergente o fenol disocia proteína

• Propiedades del RNA

– Soluble sol. diluidas NaCl
– Insoluble en alcohol
– Detergente o fenol disocia proteína

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 Composición del DNA
• Nucleasas o fosfodiesterasas
– Desintegrar las bases del DNA
• Hidrólisis de enlaces fosfodiéster de los ac.
Nucléicos
– Endonucleasas
– Exonucleasas
B B 1.- Actuar RNA, DNA o ambos
2.- Actuar cadena ss, ds o ambos
3.- Rompimiento a o b
4.- Exonucleasas: C terminal 3´o 5´
3´ 5.- Especificidad de bases (pur o pir)
P P 6.- Especificidad secuencial (sec. bases)
P
5´
Rompimiento tipo b
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit.
Rompimiento tipo a Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991
 Composición del DNA
• Reglas de Chargaff:
1.- (A+G)/(T+C)=1
2.- A/T=1 Equilibrio
3.- G/C=1
• Ligasas: Unión de dos extremos de una
cadena polinucléotida

Composición del RNA

• Cuantificar % de bases
•Degradación hidrolítica
•Cromatografía (intercambio iónico en columna)

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

ESTRUCTURA
PRIMARIA
DNA Y RNA
Cadena polinucleotídica
• Código genético

Universidad de la Laguna. Frías V,I. http://webpages.ull.es/users/jfrias/fotos.htm

Secuencia de bases
del cromosoma de
DNA del virus del
Sarcoma murino
de Harvey.

Codón

Bohinski, R. Bioquímica.
5a. Edición. Edit.
Addison-Wesley
Iberoamérica. EE.UU.
1991
 ESTRUCTURA
SECUNDARIA Y
TERCIARIA
DNA
 Watson y Crick: Estructura de doble hélice
• Cadenas alineadas con polaridad opuesta
• Giro hacia la derecha

3´ 5´

5´ 3´

Universidad de Alcala. DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

. http://www2.uah.es/biomolq/BM/Esquemas/Tema2.htm
 Pareamiento de bases
Puentes de hidrógeno
• Purinas y Pirimidinas

Pontificia Universidadjaveriana. Colombia. Dpto de Ciencias Fisiológicas

Farmaco web. med.javeriana.edu.co/.../ images/girasa1.gif
 Anillos Pu- Py: Hidrofóbicas
Fuerzas
Cadena doble: Van del Waals
Estabilizadoras
Fosfato-: Iones (Mg2+), histonas, poliaminas

Ө Ө
Ө Ө
Ө Ө
Ө
Ө

Ө Ө
12 bp
10 bp
34 Å Ө 45.6 Å
Ө
Ө Ө
Ө
Ө
Ө Ө
Ө
20 Å Humedad 18 Å
Polimorfismo
DNA B ↔Z Metilación Expresión
Residuos C de genes
 Secuencias repetitivas, Palíndromos, Repeticiones Inversas

3´-NGAATTCN-5´ Sitio restrictivo

*Secuencias repetitivas 5´-NCTTAAGN-3´ de la EcoR 1
– Cortas
(100-500 pb) 3´-NNGGCCNN-5´ Sitio restrictivo
– Largas 5´-NNCCGGNN-3´ de la Hae III
(5000 pb) de long.
– Moderadas: Doble hélice ordinaria
1000 a 10000 veces -NNNCTCGAGNNN-
– Muy repetitivas: -NNNGAGCTCNNN-
100000 a 1000000 veces

C ‫װ‬G
*Palíndromos T ‫װ‬A
– Enzimas restrictivas: C ‫װ‬G
-NNN NNN-
Enlace fosfodiéster -NNN NNN-
G‫ װ‬C
A‫װ‬T
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. G ‫װ‬C
Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. Estructuras cruciformes
EE.UU. 1991
 Secuencias repetitivas, Palíndromos, Repeticiones Inversas

•Patrones de rompimiento •Secuencias Repetidas inversas

de las enzimas restrictivas

5´-NGGCCN-
3´-NCCGGN-
Hae III

-NGG CCN-
-NCC GGN- Estructura
Extremos romos cruciforme

5´-NGAATTCN-
3´-NCTTAAGN- *Repeticiones
EcoR 1 Inversas
-NG AATTCN- Asas
-NCTTAA GN-
Extremos cohesivos transposones
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición.Edit. Addison-Wesley.Iberoamérica.EE.UU. 1991
 Superespiralización del DNA

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 Superespiralización del DNA

Microscopía electrónica

Girasas del DNA: Enzimas que se encargan de formarlo

Swivelasas del DNA:

Volverlo a convertir en
estructuras relajadas
Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991
 •Histonas son proteínas con contenido de lisina y arginina
•Policatiónicas
•Estabilizan al DNA
•Regula la expresión de los genes
•Racimos (octámero)
•Superespiralización positiva

DNA

Nucleosomas Unidad elemental de proteína

y DNA para organización de
o cuerpos v la cromatina

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

ESTRUCTURA
DEL RNA
 Productos génicos Producto génico
iniciales final

RNA ribosomal ribosomas

Genes RNA mensajero polipéptido
de DNA RNA de transferencia aminoacil-tRNA
a.a.

transcripción traducción

2% mRNA
E. coli 16% tRNA Estructuras de una sola cadena
82% rRNA

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 RNA mensajero
• Dirige el ensamblaje de polipéptidos
• Codificada en forma de tripletes o codones (secuencia
de tres bases)
• Eucariotes:
– Cada mRNA codifica un sólo polipéptido
• Procariotes y sistemas virales:
– Cada mRNA codifica uno, dos o tres
polipéptidos=TANDEM

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 RNA de transferencia
Estructura de trébol
• Pequeños (73 a 93
nuclétidos
• Anticodón
• Pareamiento
intracatenario de
bases GC y AU

I
D
Funciones dependiendo III TΨC
de la región:
1.- Extremo 3´: -CCA
2.- Asa TΨC (asa I)
3.- Asa D (asa III) II
T: ribosiltimidina
4.- Asa II.- Anticodón Ψ: pseudouridina
D: dihidrouracilo

Bohinski, R. Bioquímica. 5a. Edición. Edit. Addison-Wesley Iberoamérica. EE.UU. 1991

 RNA ribosomal
Ribosomas:
Conjuntos plurimoleculares de proteínas (35%)y RNA(65%)

40S 80S 60S

Ribonovix Inc. www.ribonovix.com/ ribosomal_rna_small.gif(ribosomal)

 RNA nucleares pequeños
Productos de
transcripción
de genes del DNA
+ proteínas

Partículas de
ribonucleoproteínas (RNP)

(Maduraciòn del RNA)

VIRUS, VIROIDES Y
PRIONES
 Virus
• Partículas nucleoproteínicas: ac. nucleico
(cromosoma viral) empacada en una vaina de
proteínas.
• Sólo pueden replicarse despúes de haber infectado
una celula hospedera.
 Viroides
• RNA desnudo: no necesita un virus auxiliar.
– Agente patógeno subviral
• Vegetales
• RNA circular de cadena sencilla
• RNA de los viroides cno funciona como mRNA para
la síntesis de proteínas.
 •Virosis neurotóxica ovina “scrapie”
Priones •Enfermedad neurológica degenerativa

Sustancia
proteínica
libre desnuda
Hibridación de Ác. Nucleicos

Cadenas sencillas
ds DNA
(1) Calentamiento +
(2) y temple
+ +

Detector Híbridos
DNA/RNA o
Unicaternario de
DNA o RNA
 TRANSCRIPCIÓN:
BIOSÍNTESIS DE RNA
 Procesamiento de información genética
DNA´

recombinación
transcripción
replicación traducción
DNA RNA polipéptido
Reverso
mutación transcripción replicación
reparación
DNA´
Sólo en algunos virus

1.- Replicación o duplicación del DNA: DNA DNA antes de la mitosis

2.- Reparación DNA: eliminación y resíntesis segmentos cortos DNA dañado
3.- Recombinación DNA: Intercambio de segmentos génicos
4.- Transposición DNA: Gen se desplaza de un lugar a otro en el cromosoma
5.- Reversotranscripción: Biosíntesis de DNA (RNA DNA)
6.- Replicación del RNA: Biosíntesis de duplicado del cromosoma viral
de RNA antes de la formación de nuevas partículas (RNA RNA)
Funciones catalíticas de algunos RNA

T. Cech (1982): Tetrahymena thermophila

RNA ribosomal
• Interferones
• Universidad de Alcala. DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA
MOLECULAR. http://www2.uah.es/biomolq/BM/Esquemas/Tema2.htm

• Encilopedia wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Image:A-B-Z-DNA_Side_View.png

• J. Sancho Estructuras del DNA .UNIZAR. Calladine

• Pontificia Universidadjaveriana. Colombia. Dpto de Ciencias Fisiológicas Farmaco

web. med.javeriana.edu.co/.../ images/girasa1.gif

• Beckman Institute for Advanced Science and Technology // National Institutes of

Health (dsDNA http://www.ks.uiuc.edu
• Dr. Arturo Panduro Cerda Universidad de Guadalajara Servicio De Biología
Molecular en Medicina http://www.invsalud.udg.mx/cromosomas.html (histonas)
• Ribonovix Inc. www.ribonovix.com/ ribosomal_rna_small.gif
(ribosomal)
>human AGCTTTCTTCTTTTCCCTGTTGCTCAAATAAATAGTGTTCTTTGCTCAAA 
CCCCCTTTCCCTCCTCCTTCTGCAATCTCAGCGCCTAGCGAAATCTGTTT
TCTTCATTGTAACCTCAGCTTCACCGCAATTAATTTTTTTTCCCTCTGGT 
CACAAGATAATTCCTGACGCCAGTGAGTCTGGAGGTCAGACGAACAGCAA 
ATTGGGGAACAAGGCGGCACTAATTCCTTACAAGTTCCTTGAAAAATCTT 
TCGCTTAAAAAAAACGGGGGGTGGGGGGAGCTTCTTTGCTGTTCAGGGAT 
TTATGCCTCGCGGAGCTGTGGCTCGAACCAGTGTTGGCTAAGGCGGACTG 
GCAGGGGCAGGGAAGCTCAAAGATCTGGGGTGCTGCCAGGAAAAAGCAAA 
TTCTGGAAGTTAATGGTTTTGAGTGATTTTTAAATCCTTGCTGGCGGAGA 
GGCCCGCCTCTCCCCGGTATCAGCGCTTCCTCATTCTTTGAATCCGCGGC 
TCCGCGGTCTTCGGCGTCAGACCAGCCGGAGGAAGCCTGTTTGCAATTTA 
AGCGGGCTGTGAACGCCCAGGGCCGGCGGGGGCAGGGCCGAGGCGGGCCA 
TTTTGAATAAAGAGGCGTGCCTTCCAGGCAGGCTCTATAAGTGACCGCCG 
CGGCGAGCGTGCGCGCGTTGCAGGTCACTGTAGCGGACTTCTTTTGGTTT 
TCTTTCTCTTTGGGGCACCTCTGGACTCACTCCCCAGCATGAAGGCGCTG 
AGCCCGGTGCGCGGCTGCTACGAGGCGGTGTGCTGCCTGTCGGAACGCAG 
TCTGGCCATCGCCCGGGGCCGAGGGAAGGGCCCGGCAGCTGAGGAGCCGC 
TGAGCTTGCTGGACGACATGAACCACTGCTACTCCCGCCTGCGGGAACTG 
GTACCCGGAGTCCCGAGAGGCACTCAGCTTAGCCAGGTGGAAATCCTACA 
GCGCGTCATCGACTACATTCTCGACCTGCAGGTAGTCCTGGCCGAGCCAG 
CCCCTGGACCCCCTGATGGCCCCCACCTTCCCATCCAGGTAAGCCTCGAA 
GTCGGGACAGGGCTGAACACCCAGGCAAGGATGCTGCGGGACCCTCGGAG 
CTCCCGATTGCCTCGCGTAACTCTTCCCTCTTTTCCTCTAATCAGACAGC 
CGAGCTCGCTCCGGAACTTGTCATCTCCAACGACAAAAGGAGCTTTTGCC 
ACTGACTCGGCCGTGTCCTGACACCTCCAGGTGAGTATCTCCTCTCTTGG 
AGAGGGAGGTTTAAACGGCAAGTCCTGGAGTTGGCAGACGTTTTGAAAAA 
TTGCCACTCACTCGGTTTAGGGAAACTGAGGCCAGAGAGGGACAAGTGAC 
TTGCCCATGGTTGCATCAAATGAATGGCAGAGTCAGTTTCCATGTGATGT 
GCATTTAAGCCTTAATGCGCCTGGCCCTGCCTCCGCAGTGGCCGAGGTCT 
GGCAAGTAGACATGGTCCGACTAAATACAAGTCTTTCTGTTCCATGTTGT 
ATAGGAGCTGTCTTCGGCAGCCCCCTCCCAGCTAGTGTCAATTCCAAGTA 
GGAGGGGTAGCGCAACGTCCGCCTGTGGTCTTTGGCGCCAACTGGGTGGG 
GGCAGCGTGGGGGGCGGAGTTATCAGGCTGGAGGTACAGACCAAGTTTCC 
TCCCTGGCGCCGGCCAGTCTGCGGACGGCCCCCGCCTCGGCACGCTCGGC 
GGAAACTGACTGCTCCTTGGTCTTCTTTCCTCCCCCGCCCAGAACGCAGG 
TGCTGGCGCCCGTTCTGCCTGGGACCCCGGGAACCTCTCCTGCCGGAAGC 
CGGACGGCAGGGATGGGCCCCAACTTCGCCCTGCCCACTTGACTTCACCA 
AATCCCTTCCTGGAGACTAAACCTGGTGCTCAGGAGCGAAGGACTGTGAA 
CTTGTGGCCTGAAGAGCCAGAGCTAGCTCTGGCCACCAGCTGGGCGACGT 
CACCCTGCTCCCACCCCACCCCCAAGTTCTAAGGTCTTTTCAGAGCGTGG 
AGGTGTGGAAGGAGTGGCTGCTCTCCAAACTATGCCAAGGCGGCGGCAGA 
GCTGGTCTTCTGGTCTCCTTGGAGAAAGGTTCTGTTGCCCTGATTTATGA 
ACTCTATAATAGAGTATATAGGTTTTGTACCTTTTTTACAGGAAGGTGAC 
TTTCTGTAACAATGCGATGTATATTAAACTTTTTATAAAAGTTAACATTT 
TGCATAATAAACGATTTTTAAACACTTGTGTATATGATGACACCCGTCTC 
CATTAAGTACTAATGATGCTTTCTCGCACATGGCCGAATTTTGGGAGCTT 
TGGGAAAGTGAACTTGCTTATTCTACGAGAGGGAAATGAAAAACTGCCTG 
GTTGAGAGGGGATGGGGTGGAGAGAGAAGGGTTCATGATGGGAGTCTCAT 
GTCCATTGAGGGATGGGTGCAGAGAAAAGTTCTGGCTCTGCCTCATTATT 
TCAGAGATGAAACCAGAGACTGGTGCAAGCT