UNIVERSITE MOHAMED PREMIERE

FACULTE DES SCIENCES

DEPARTEMENT DE BIOLOGIE

Champignons Phytopathogènes = Mycoses

Réalisé par :
Encadré par :
ELYOUSSOUFI Imad
Pr CHAFIK Z
CHNAFI Zakariae
21/10/2019
I-Introduction

II-classification

III-Écologie Biologie des champignons:

A) Morphologie

B) condition du milieu

C) Mode de multiplication

IV- Les mycose

V- L’identification et l ’Isolement des mycètes

VI- Méthode de lutte

VII- résume
  Plus de 8000 espèces, présentant une très
grande variété taxonomique du fait de
l’organisation complexe de l’appareil végétatif
et de leur mode reproduction.
 Ils affectent les plantes et semblent responsables de
plus de 50 % des maladies connues chez les végétaux.
Ils sont donc très fréquents et probablement les plus
dommageables
 Classification selon l mode de vie :


les champignons saprophytes

se nourissent de la amatiére organique morte(conserve, pains

humide,fromage, feille mortes,… )
Exemple;
Mucor mucedo
saccharomyces
penicillium
boletus
Penicillium sp Mucor et Rhizopus
 les champignons parasite:

se développent aux dépens d’organisme vivant qu’ils soient

animaux ou végétaux . Ce type de champignons peut causer des
dégâts considérables
exemple
A) Ergot du seigle
B) Rouille du blé
C) charbon de blé
D) charbon de mais
E) pourriture grise du raisin
F) feuille d’Erable infestée
G) sucoirs de champignons parasites
 Biotrophes:
parasites vivant uniquement sur des tissus vivants. C’est le cas des
agents de mildious, de rouilles, d’oïdium.

Tranzschelia pruni-spinosae : rouille du prunier

taches nécrotiques entourées d'un halo jaune

Les taches roux noirâtre et pulvérulentes

Peronospora sparsa 
(mildiou du rosier) :

a) les haustoria filamenteux de

permettent au parasite
d'utiliser le contenu de la
cellule de l'hôte parasité ;
b) la sporulation produit des
sporanges à la face inférieure
des feuilles.
 
 Nécrotrophes:
parasites non obligatoire vivant sur des débris végétaux. Leur
principe est de tuer les cellules végétales avant de s’en prendre
pour si nourrir

. Exemple: Ascochyta pisi

lésions sur les feuilles et les fruits du petit

pois
 Hémibiotrophes
biotrophes en début de leur cycles de développement et
nécrotrophes à la fin du cycle. Ex. Colletotrichum coccodes 

plages nécrotiques brunes couvertes de

points noirs

microsclérotes formés sur les racines 

 Exemple: Botrytis cinerea

Chancre beige au collet

Pourriture molle, gris

Lésion nécrotique à la
beige
périphérie du limbe
 Conditions du milieu

Éléments nutritifs Ce sont principalement le carbone, l’azote,

le potassium, le calcium, le soufre, mais également quelques ions
métalliques comme le Fe, Cu, Mn, Zn. Certains éléments vont pouvoir
passer directement dans la cellule (vitamines), d’autres comme l’amidon
ou la cellulose seront transformés avant ce passage. L’arsenal
enzymatique des champignons va déterminer les exigences nutritives de
chaque espèce.
Température:
 la majorité se développe autour de 20°C = (mésophiles).
 Certaines peuvent croitre en dessous de 0°C = (psychrotolérantes).
 D’autre acceptent des températures > à 40°C = (thermotoléranres)
  Humidité:
 en général des champignons ont besoin d’une atmosphère très humide.

les agents de mildiou, les agents de fonte de semis et les agents de

pourritures nécessitent une humidité > ou = à 90% et l'eau liquide
 Oxygène:
 les champignons sont aérobies mais peu exigeants et les spores peuvent se
former dans des conditions très pauvres en O2
 Les ambiances anaérobiques ou pauvres en O2 sont très favorables à la
germination des spores.
 pH:
les champignons peu sensible au pH du milieu mais peuvent tolérer des pH
acides, dans ce cas le développement des champignons entraine une
alcalinisation du milieu
 Lumière:
Il n’y a pas d’action directe de la lumière sur la croissance végétative, mais
elle peut avoir une influence sur la sporulation ???
 Multiplication des champignons
 La grande majorité se reproduisent de manière:
 Sexuée
 Asexuée
 Leur cycle de multiplication intègre ces deux processus à des moments précis.
   Multiplication végétative

Reproduction asexuée: imparfaite

Certaines champignons produisent des spores végétatives
nues, mobiles dans L’eau grâce à un ou deux flagelles
(zoospores) qui se forment à l'intérieur de sporanges
D’autres produisent des conidies. Certaines champignons
produisent des spores végétatives nues, mobiles dans L’eau
grâce à un ou deux flagelles (zoospores) qui se forment à
l'intérieur de sporanges. D’autres produisent des conidies

Fragmentation du mycélium (sclérote)

Production de stolons (ex : Mucorales, Mucor)
  Mode de reproduction asexuée (végétative) qui assure:

 production de spores en grandes quantité

 une grande capacités de prolifération
 La spore : forme de résistance aux conditions
défavorables du milieu
 Reproduction sexuée: parfaite
 Les spores sexuée sont au nombre de quatre:
 Oospore (Oomycètes)
 Zygospore (Zygomycètes)
 Ascospore (Ascomycètes)
 Basidiospore (Basidiomycètes)

Le cycle de Multiplication des champignons: pénétration,

infection, dissémination, peut s’étendre sur quelques
semaines ou plusieurs années
 Symptomatologie

Les symptômes des mycoses végétales observés sont

multiples, variés et atteignent tous les organes du végétal. Elles
sont non spécifiques et spécifiques.

 Symptômes non spécifiques: pourritures, nécroses, brulures,

taches foliaires, chancres sur les tissus de protection,
dépérissement, flétrissement des vaisseaux du bois, fanaison…

 Symptômes spécifiques: rouille, oïdium, mildiou, cloque,

tavelure…
 Classification des champignons

MASTIGOMYCOTINA :
Plasmodiophoromycètes
Phycomycètes
Zygomycètes
AMASTIGOMYCOTINA :
Ascomycètes
Basidiomycètes
Deutéromycètes
 MASTIGOMYCOTINA :
(zoospores uni ou bi
flagellées, thalle non cloisonnée)
 Talle de type plasmode : Myxomycètes (plasmode libre),
Plasmodiophoromycètes (plasmode endocellulaire).
 Absence de plasmode, thalle non cloisonnée: Chytridiomycètes
(zoides uni flagellées), Oomycètes (zoide bi flagellées)
phytophthora infestans
 Plasmodiophoromycètes

 Ces champignons se présentent généralement sous forme de plasmodes qui se

développe dans les cellules de la plante hôte.
Ex. Plasmodiophora brassicae est responsable de la gale ou Hernie du
chou, maladie qui se traduit sur la plante par des boursouflures au collet
.
Les feuilles jaunissent, lors des journées
chaudes le plant flétrit et il dépérit peu à peu
les racines présentent des boursouflures de
couleur blanche. Elles continuent à enfler et
pourrissent peu à peu
 Phycomycètes

 Représentés surtout par les Mildious.

 Possèdent des filaments mycéliens peu développés, non cloisonnés (siphons), les
phycomycètes ont été appelés siphomycètes.
 Ils ont besoin d’eau pour la reproduction.
 La classification se fait sur la base de leurs cellules flagellées (zoïdes); les Oomycètes
comprennent:
 Les péronosporales: champignons responsables des graves
maladies (Mildiou et Rouilles blanches)
 Les mildious terrestres: agents de pourriture et de
dépérissement.
Ex. Phytophthora capsici
Il attaque à tous les organes des cucurbitacées.
Ex : Phytophthora infestans
Ex: pythim sp
 Une pourriture humide et brune,
recouverte d'un discret velouté
blanc, s'est développée sur la
partie de ce fruit de melon au
contact du sol

 le feuillage a flétri partiellement et

s'est desséché présente une
altération brun sombre au collet.
Les racines se sont décomposées et
ont disparu
 Les mildious aériens:
 le mildiou du rosier: Ex. Peronospora sparsa :
responsable du mildiou sur la plupart des variétés de rosiers cultivés
(Rosa alba, canina, centifolia, cinnamomea, pimpinellifolia, rubiginosa…) et plus
particulièrement les rosiers de serre.

Jaunissement du limbe suite au

développement de Peronospora sparsa

les taches en forme de points de tapisserie

caractéristiques. Mildiou du rosier (downy
mildew of rose)
 Les mildious aériens:
 le mildiou de la vigne: Ex. Plasmopara viticola

se développe exclusivement sur les organes aériens herbacés de

la vigne, et plus particulièrement sur les plus jeunes en phase de

croissance et gorgés d'eau.

 Les taches translucides, d'aspect un duvet blanc à l'envers des 'tâches d'huile'
huileux. observables sur la face supérieure.

 petites lésions chlorotiques, souvent

délimitées par les nervures Mildiou mosaïque bien évolué
Le faciès nommé 'rot gris' peut également se Aspect du rot gris finissant, voire rot brun
rencontrer sur vrille débutant sur baies de raisin

Détail des fructifications sur

baies présentant un symptôme Sur certaines baies, des taches brunes à
de rot brun. noirâtres, déprimées 
 Les mildious aériens:
 Les mildious des solanaceae. Ex. Phytophthora infestans :
Le mildiou sévit avec gravité dans de nombreuses zones de
production du monde.
Il est particulièrement redoutable et destructeur dans
les régions au climat humide, et ses dégâts peuvent être très
importants lors d'épidémies fulgurantes mal contrôlées.
 vert sombre à brune, recouvertes d'un
une teinte vert pale et quelles se nécrosent
duvet blanchâtre
progressivement par la suite 

Une lésions brunâtres à noires la ceinture tache brune, légèrement festonnée et plus
sur plusieurs centimètres claire en périphérie.
 Zygomycètes

Champignons ayant un mycélium

non cloisonné et produisant des
spores non mobiles produites dans
un sporange .
.

Ces spores sont très volatiles et sont

aisément dispersées par l'air
 Zygomycètes
 Rhizopus stolonifer: Pourriture à Rhizopus
  

pourriture humide et molle. Fruit de tomate pourri et recouvert par la

Une moisissure aérienne blanche commence à caractéristique moisissure en têtes
se développer
 Zygomycètes
 Choanephora cucurbitarum: Pourritures à Choanephora

De nombreuses fructifications en forme de

Une large lésion altère l'extrémité de ce melon.
petites têtes épingles noires sont bien visibles à
Les tissus pourris sont en partie effondrés
la surface des tissus lésés.
 Classification des champignons
 AMASTIGOMYCOTINA: (jamais de zoospores)
 Talle en forme de filaments non cloisonnées: Zygomycètes, reproduction sexuée par
conjugaison de deux gamétange semblable aboutissant à la formation d’une zygospore.
 Filaments généralement cloisonnée: Ascomycètes, Basidiomycètes, Deutéromycètes…
 Ascomycètes
 Cloque du pêcher: Taphrina deformans: est un champignon parasite qui se développe
essentiellement sur pêcher (Prunus persica) mais peut aussi s'attaquer aux brugnoniers et
plus rarement à l'amandier (Prunus dulcis).
Déformation et coloration rouge d'une déformations des tissus foliaires dues au
jeune feuille  développement intercellulaire

les bouquets de
feuilles du pêcher
se développent mal
et le rameau reste
court donnant un
aspect chétif à
l'arbre
 Ascomycètes
 L’Oïdium de la vigne: Uncinula necator ou Erysiphe necator: est un ectoparasite de la
vigne qui se développe en grande partie à la surface des organes aériens verts. Sa présence
sur ces derniers est matérialisée par un feutrage conidien plus ou moins poudreux à
l'origine de l'appellation anglo-saxonne de la maladie powdery mildew (mildiou
poudreux) et caractérisant ces symptômes.
 très difficilement détectable en début après installé sur la face supérieure de la
d'attaque. Quelques rares taches feuille (taches poudreuses blanches)
visibles à la face inférieure des feuilles

Le mycélium couvre tout le limbe de la feuille

qui a tendance à se déformer. feuille oïdiée est plutôt enroulée 
Sur ce rameau des lésions nécrotiques
Lésions brunâtres sur rameau aouté
engendrées
Ces baies de raisin sont plus ou mois
recouvertes par le duvet blanchâtre et
poudreux 

Les baies de cette grappe sont entièrement

couvertes par l'oïdium. Certaines d'entre-elles
ont éclaté
 Ascomycètes
 La Fumagine: la maladie sans gravité se manifeste par un dépôt noir sur les feuilles. Il est
du à un champignon qui se développe souvent sur le miellat (substance collante et
incolore) sécrété par les pucerons, les aleurodes et les cochenilles . Il bloque la
photosynthèse et peut affaiblir atteint.
 plusieurs champignons à l'origine de
la fumagine (sooty mold) sont en train de
former des colonies sur la quasi-totalité du
limbe. De nombreuses colonies sont encore De nombreuses colonies de moisissures
claires, certaines ont pris une teinte brun couvrent superficiellement le limbe de
olivâtre. plusieurs folioles, perturbant la
photosynthèse. Fumagine (sooty mold)
 La moisissure responsable de
la Fumagine sur cette foliole forme des
colonies superficielles vert olivâtre. (sooty
mold)
Lorsque les pullulations d'insectes sont
importantes, il n'est pas rare d'observer de
la fumagine sur les tiges de tomate.
Sur ces fruits couverts de miellat De nombreuses colonies vert sombre parsèment
ce fruit.
 Ascomycètes
 Tavelure du pommier: Venturia inaequalis

taches translucides puis elles prennent une couleur  brun olivâtre

avec un aspect velouté 
  la formation de croûtes noirâtres liégeuses,
La déformation du limbe est fréquente plus ou moins crevassées
 Basidiomycètes
 Les Basidiomycota (club fungi)
ou basidiomycètes

 comprennent les champignons dont les spores

sont formées sur des basides
 Basidiomycètes
 La rouille des ornementales:
Phramidium mucronatum responsable de la rouille de rosier
 des sores orangées produisant des
urédospores.
 petites taches anguleuses jaunes.

En fin de saison, on observe souvent la

production concomitante de téleutosores et
d'urédosores sur les feuilles.
 Basidiomycètes
 Rouille du prunier: Tranzschelia pruni-spinosae
Peut provoquer des dégâts importants sur la production des fruits.
 Son cycle s’étend généralement de fin avril à mi-juillet environ.
des taches angulaires décolorées jaune-orangé des taches sont présents des amas de spores soit
réparties au hasard sur le limbe bruns et pulvérulents soit noirâtres 
 Basidiomycètes
 Charbons des céréales:
Ustilago sp: Le charbon nu 
Favorisé par un climat frais et humide.
 Véhiculé par les semences et par le sol, il couvert contamine la plantule lors de la
germination.
 Les symptômes sont visible uniquement à l’épiaison.
Sur les épis : Les pièces florales deviennent brun noirâtre , elles se recouvrent
d'une enveloppe gris blanchâtre .
Les grains sont poudreuse et noire.  
 Deutéromycètes
 La Fusariose
Les fusarioses sont dommageables, en culture protégées, pour de nombreuses plantes
maraichères (tomate, cucurbitacées,…) et ornementales (œillet, glaieul), ainsi que pour des
cultures en plein champ telles que le coton, le bananier ( la maladie de Panama) et le palmier
dattier ( maladie du Bayoud). Malgré leur importance, ces deux dernières fusarioses ne font
pas l’objet de lutte chimique
 Deutéromycètes
 Les Fusarioses de la tomate (FORL et FOL)
 La Fusariose racinaire: (FORL) Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici.
 L’agent responsable est dans tous les cas, un Fusarium oxysporum mais strictement
inféodé à une culture donnée; il s’agit alors de forme spéciale: Lycopersici (tomate),
melonis (melon), asparagi (asperge)…, car incapable d’attaquer une autre culture
Détail d'un chancre au collet
occasionné par  Ce chancre brun très foncé
ceinture ce pied de tomate ; il
progresse longitudinalement sur la
tige et confère à la lésion la
forme d'une flamme.

Système racinaire réduit, brun et pourri, vaisseaux

brun chocolat dans les parties basses de la tige.
 Deutéromycètes
 Les Fusarioses de la tomate FORL et FOL
 La Fusariose racinaire ou fusariose vasculaire (FOL)
 La chlorose est manifeste, et son caractère
unilatéral est typique d'une maladie
vasculaire
jaunissement des folioles
situées sur un même côté de la
feuille. +nervures sont encore
vertes
 Les tissus corticaux sont bien nécrosés et ont
pris une teinte brunâtre. Ils sont légèrement
déprimés et confèrent à la lésion longitudinale de
la tige une apparence plutôt chancreuse Une bande jaune assez marquée . Les tissus du
cortex commencent à se nécroser au centre
 Deutéromycètes
 La Verticilliose des plantes maraichères: due à Verticillium dahliae et Verticilum albo-
atrum: Un grande nombre de plantes maraichères, de rosaceae à noyaux, l’olivier et
d’ornement sont concernées.
Jaunissement et léger flétrissement d'une partie du
limbe (en forme de V par rapport au pétiole).  Jaunissement unilatéral
du limbe

Plusieurs folioles de cette feuille présentent Les vaisseaux de la tige du haut sont plus ou
les mêmes lésions nécrotiques en forme de V moins brun pâle et contrastent avec ceux,
qui sont auréolées d'une marge chlorotique. sains, de celle du bas.
 Deutéromycètes
 Moniliose - Pourriture à Monilia - Rot-brun: maladies des arbres fruitiers provoquées par
deux espèces du genre ‘Monilia’: Monilia fructigena qui s’attaque principalement aux fruits
à pépins et Monilia laxa aux fruits à noyaux.
 Elle touche les fruits blessés ( par la grêle, les piqures de guêpes, les coups de bec des
oiseaux ou les morsures d’insectes divers).
Les baies pourries ont une teinte sombre et sont plus ou moins ratatinées
des coussinets conidifères bruns en cercles La pourriture est ferme, marron foncé, à
concentriques contour régulier 

Dessèchement des fleurs dû

à Monilia laxa 
Les fruits présentent des taches brunes et circulaires sur lesquelles des coussinets de spores
grisâtres se forment en cercles concentriques

Attaque de moniliose sur

rameau de cerisier, celui ci a
bruni et s'est desséché.
Monilia fructigena
 Deutéromycètes
 La pourriture grise ou Moisissure grise:
Botrytis cinerea: est l’agents responsable de la pourriture grise sur plusieurs cultures. Il est
particulièrement fréquent chez la tomate, la fraise, le pois, le haricot, et certains arbustes et
plantes d’ornement.
Il se développe entre 18 et 20°C en présence d’humidité, une mauvaise aération est un
facteur favorisant

 
Tache nécrotique rougeâtre se développant à la De caractéristiques motifs concentriques
périphérie d'une feuille de vigne et festonnés sont plus ou moins visibles
sur ces deux taches positionnées à la
périphérie de feuille

cette inflorescence pourri et s'est desséchée.

Certaines fleurs nécrosées sont tombées.
Le pédoncule de cette grappe est entièrement
ceinturé par une pourriture

Sur cépage blanc, les baies  brunissent et prennent une teinte beige à violacée ; une
moisissure grise s'étend à leur surface.
 Deutéromycètes
 Anthracnose: maladie cryptogamique relativement courante, et qui atteint de nombreux
végétaux, notamment des arbres , des arbustes et des plantes potagères.
 Les champignons responsables sont : Apiognomonia, Colletotrichum, Discula,
Gloeosporium, Glomerella, Gnomonia, Pseudopeziza

taches nécrotiques ,  irrégulières
et auréolées d'un halo jaune assez
marqués sur certaines feuilles
Tache circulaire très évoluée sur fruit tournant
de piment. Une large portion centrale de la
lésion est couverte de microsclérotes noirs du
champignon et d'acervules encore peu
fructifères. Colletotrichum sp. (anthracnose)
 Deutéromycètes
 Le cycloconium ou Œil de paon:
 Cyclonium oleaginum attaque les feuilles de l’arbre ainsi que les fruits sous forme de
taches circulaires, jaunes ou brunes, marquées de cercles concentriques, sont
caractéristiques et ont valu à cette maladie le nom ‘d’Œil de paon ’.
 Elle peut entrainer la chute des feuilles atteintes , ce qui affaiblit l’olivier.
 petites taches, de forme arrondie (cercles
concentriques), avec un centre gris ou brunâtre et une
marge régulière se manifestent
 Deutéromycètes
 Cladosporiose ou nuile grise du melon Cladosporium cucumerinum
 Elle se manifeste sur les feuilles par des taches vitreuse, puis nécrosées à bordure jaune.
Sur les fruits des lésions de forme ovale
Taches et Lésions irrégulières, brunes et
nécrotiques sur feuille de melon. une lésion chancreuse, nécrotique et
longitudinale, couverte par une moisissure vert
sombre à noire sur le rameau

plusieurs taches plutôt circulaires, grisâtres et

légèrement liégeuses
 Deutéromycètes
 Sclérotiniose: Sclerotinia sclerotiorum provoque des symptômes de pourriture, très
nuisibles à la culture. Le pathogène pénètre par des tissus morts. La maladie apparait sous
la forme d’une pourriture molle du collet, associée à un feutrage blanc cotonneux.
 Lésion humide, brunâtre ceinturant la tige sur
plusieurs centimètres de ce pied d'aubergine.

Lésion humide, gris beige sur tige de poivron.

le développement du dense mycélium blanc notamment

à l'une des extrémité de cette aubergine.
 Deutéromycètes
 L’alternariose ou brulure alternarienne : due à divers champignons du genres
Alternaria. Cette maladie peut toucher les tournesols, les crucifères, les tomates, les
carottes.
 Sur feuilles des taches brunâtres entourées de jaune puis du feuillage qui prend un aspect
de brulures. S’attaque aux pétioles.
 Elle se développe surtout pendant l’été.
 Sur cette lésion sur cette feuille de chou, on
distingue mieux les discrets motifs
concentriques présents sur les tissus nécrosés. 
Détail de lésions d'alternariose sur feuille de  
chou. Notez la présence d'un halo jaune, et de
motifs concentriques sur les tissus
nécrosés. Alternaria brassicicola 

taches sporulées
d'alternariose sur
feuille de
navet. Alternaria
brassicicola
 Deutéromycètes
 La cercosporiose: Cercospora beticola. Apparition, sur le limbe des feuilles de
nombreuses petites taches grisâtres arrondies et bordées d’un liseré rouge ou brun. Au fur
et à mesure de la progression de l’attaque, les taches se multiplient et entrainent le
dessèchement complet des feuilles atteintes.
des petites taches (1 à 4 mm) circulaires grisâtres , brun rouge, déprimées en leur centre, et
couvertes d’un duvet gris. Les multiples taches deviennent confluentes qui provoquent le
dessèchement du feuillage et donnent un aspect brûlé au champ.
 Deutéromycètes
 La criblure des arbres à noyaux: Coryneum bejerinckii. Attaque les feuilles, les fruits,
les jeunes rameau.
 Sur les feuilles, il provoque dès le printemps, l’apparition de petites taches cerclées d’une
zone brun-rouge. Les tissus atteints meurent, puis se détachent, laissant les feuilles
criblées de trou.
Des taches de couleur orange, rouge ou pourpre apparaissent sur les feuilles.
Le centre de la tache est gris clair et sa zone marginale violacée. Le centre de la
tache finit par se nécroser et tomber. Une criblure des feuilles est alors observée
 Mode
Usage Dose Stade Culture Période DAR (j)
Traitement

conditions
favorables à
Carotte Alternariose 200 g/hl préventif Parties aériennes 30
l'apparition de la
maladie

conditions
favorables à
Haricot vert Rouille 200 g/hl préventif Parties aériennes 21
l'apparition de la
maladie

conditions
favorables à
Pommier Tavelure 200 g/hl préventif Parties aériennes 45
l'apparition de la
maladie

conditions
favorables à
Tomate Mildiou 2,5 kg/ha préventif Parties aériennes 3
l'apparition de la
maladie

conditions
favorables à
Vigne Mildiou 2 kg/ha préventif Parties aériennes 56
l'apparition de la
maladie