LICENCE EN GESTION ET AMENAGEMENT

MINIER

COURS D’ECOLOGIE GENERALE

Dr TYANO Abdoulaye
 Ingénieur de conception des Eaux Forêts et Environnement
 Doctorat Unique en Production Forestière
Tel: 70643665/64185743
Email: tabdoulayemagloire@gmail.com
Plan
Introduction
I. Généralités
II. Principaux facteurs écologiques
III. Notions d’accommodation et d’adaptation
IV. Notions d’écosystème
V Notion de cycle biogéochimique
Conclusion
Introduction
Le terme écologie vient des deux mots grecs : oïkos qui veut
dire maison, habitat, et logos qui signifie science. C’est la
science de la maison, de l'habitat. Il fut inventé en 1866 par
Ernst HAECKEL, biologiste allemand
Écologie = Étude scientifique des interactions entre les êtres
vivants et leur milieu
Le mot « écologie » a été crée en 1866, par le biologiste
allemand Ernst Haeckel, à partir de deux mots grecs : oikos
qui veut dire : maison, habitat, et logos qui signifie science.
L’écologie apparaît donc comme la science de l’habitat,
étudiant les conditions d'existence des êtres vivants et les
interactions de toute nature qui existent entre ces êtres vivants
et leurs milieux.
Il s'agit de comprendre les mécanismes qui permettent aux
différentes espèces d'organismes de survivre et de coexister
en se partageant ou en se disputant les ressources
disponibles (espace, temps, énergie, matière).
Par extension, l’écologie s’appuie sur des sciences connexes
telles la climatologie, l'hydrologie, l'océanographie, la chimie,
la géologie, la pédologie, la physiologie, la génétique,
l’éthologie, ... etc. Ce qui fait de l’écologie, une science
pluridisciplinaire !
L’écologie, en tant que science de la nature, a pour objectif:
 L’analyse des processus biodémographiques qui interviennent dans la
dynamique des populations et des peuplements,
 L’étude des cycles biogéochimiques et des flux d’énergie qui animent les
écosystèmes et les paysages,
• Le milieu, au sens écologique du terme = environnement
biotique et abiotique des êtres vivants

Milieu biotique: Relations entre les individus de la même

espèce et entre individus d’espèces différentes.

Milieu abiotique: Température, eau, lumière, vent et sol,

humidité, etc.
I. Généralités
Les études écologiques portent conventionnellement sur trois niveaux :
l’individu, la population et la communauté.
Un individu est un spécimen d’une espèce donnée.
Une population est un groupe d’individus de la même espèce
occupant un territoire particulier à une période donnée.
Une communauté ou biocénose est l’ensemble des populations d’un
même milieu, peuplement animal (zoocénose) et peuplement végétal
(phytocénose) qui vivent dans les mêmes conditions de milieu et au
voisinage les uns des autres.
Chacun de ces trois niveaux fait l’objet d’une division de
l’écologie :
 l’individu concerne l’autoécologie : c’est la science qui
étudie les rapports d’une seule espèce avec son milieu.
Elle définit les limites de tolérances et les préférences de
l’espèce étudiée vis-à-vis des divers facteurs
écologiques et examine l’action du milieu sur la
morphologie, la physiologie et l’éthologie.
la population concerne l’écologie des populations ou la
dynamique des populations : c’est la science qui étudie les
caractéristiques qualitatives et quantitatives des populations :
elle analyse les variations d’abondance des diverses
espèces pour en rechercher les causes et si possible les
prévoir.
la biocénose concerne la synécologie : c’est la science qui
analyse les rapports entre les individus qui appartiennent
aux diverses espèces d’un même groupement et de ceux-ci
avec leurs milieux.
I. GENERALITES

I.1 La biosphère
Elle est la portion de l’espace terrestre occupé par les êtres vivants.

Elle s’étant depuis les horizons superficiels de la lithosphère (couche

externe solide de la Terre) jusqu’à la limite de la troposphère (Couche

la plus basse de l'atmosphère). C’est un système complexe caractérisé

par une grande biodiversité (plus d’un million d’espèces animales et

plus de 3 millions d’espèces végétales).

La biosphère peut se subdiviser en trois
compartiments de nature physique
différente:
La lithosphère: couches les plus
superficiels de l’écorce terrestre,
 L’hydrosphère ou Océan mondial:
milieu liquide
 L’atmosphère: couche gazeuse
homogène qui enveloppe les deux
précédents milieux.
I.2 Habitat
C’est le milieu concret
dans lequel se
trouvent les êtres
vivants. Il correspond
pour la plupart des
auteurs à une station ;
à un biotope.
I.3 Relation
C’est l’ensemble des interactions entre les êtres vivants et
leur milieu. Elles se traduisent par:
 les modifications qualitatives et quantitatives qu’un facteur
du milieu provoque chez un autre ou chez d’autres,
 une action du milieu extérieur sur les êtres vivants, une
réaction des êtres vivants qui adaptent leur
fonctionnement aux contraintes du milieu mais qui en
retour modifie ce milieu,
une coaction ou interaction des organismes qui agissent les
uns sur autres

I.4 Population
C’est l’ensemble des individus
de la même espèce vivant en
même temps dans le même
espace et s’y reproduisant
sexuellement.
I.5 Facteur
On appelle facteur écologique un élément quelconque du
milieu ayant une action sur les êtres vivants au moins pendant
une phase de leur développement.
II. Principaux facteurs écologiques
On distingue deux types de facteurs :
les facteurs abiotiques (climatiques et édaphiques),
les facteurs biotiques.
II.1 les facteurs abiotiques
II.1.1 Facteurs climatiques
Les différentes formations végétales du globe sont de
physionomies différentes et caractérisent les conditions du
milieu ou elles se trouvent.
Elles dépendent étroitement du climat (ensemble des conditions
atmosphériques et météorologiques propres à une région du globe) dont
les principaux éléments sont : l’énergie solaire, la température, l’eau et le
vent.

a)L’énergie solaire
La vie à la surface du globe dépend de l’énergie fournie par le soleil.
Malgré la dispersion du rayonnement solaire, la fraction qui arrive au
sommet de l’atmosphères terrestre est à peu près constante. Elle est
appelée constante solaire dont la valeur est d’environ 2 cal. par cm².
Cette énergie est la base de la production primaire des
végétaux chlorophylliens ou autotrophes sous forme de
synthèse chlorophyllienne ou photosynthèse. L’énergie solaire
agit sur les êtres vivants de par son intensité. Ainsi, selon les
périodes, les êtres vivants réagissent différemment par :
La synchronisation de leur cycle de développement selon la
bonne saison,
L’arrêt du développement durant la mauvaise saison,
Le changement de morphologie
Un ajustement de la croissance végétative et surtout la
floraison, pour laquelle on distingue des plantes à jour long
(d>8h), des plantes à jour court (d<8h), des plantes
indifférentes qui peuvent fleurir en toute saison (cas des
espèces tropicales).
Selon l’intensité, les végétaux vont se conformer soit à l’ombre
(plantes sciaphiles ou sciaphytes) soit à la lumière intense
(plantes héliophiles ou héliophytes).
b) La température
La température est un facteur climatique important qui
intervient différemment dans la répartition géographique des
êtres vivants. Elle est l’expression calorifique des effets du
rayonnement. La grande majorité des êtres vivants ne peut
subsister que dans un intervalle de températures comprise
entre 0 et 50°C en moyenne. Les températures trop basses ou
trop élevées déclenchent chez certains animaux un état de
dormance (quiescence) appelé estivation ou hibernation.
Dans les deux cas, le développement est quasiment arrêté.
Les limites des aires de répartition géographique sont souvent
déterminées par la température qui agit comme facteur limitant.
Très souvent ce sont les températures extrêmes plutôt que les
moyennes qui limitent l’installation d’une espèce dans un
milieu.
c) Le vent:
Le vent agit sur le biotope (évaporation de l'eau, érosion des
sols, déplacements des nuages).
Les effets du vent sur la flore sont importants: déracinements,
déformations, augmentation de la transpiration,
assèchement, mais il contribue aussi à la dissémination des
pollens et graines.
Pour les animaux, le vent agit par exemple en favorisant la
transmission d'odeurs.
d) L'eau:
L'eau est indispensable à tous les êtres vivants. Elle peut
prendre plusieurs formes: pluie, neige, grêle, ruissellement,
stagnation, infiltration, brouillards, humidité de l'air,....
- Les végétaux ont des besoins différents en eau selon les
espèces. De nombreuses adaptations existent pour les
espèces végétales
Exemples: une cuticule épaisse chez les cactus, ....
- L'eau modifie la physiologie et le comportement de
certains animaux.
Exemple: comportements de migration, modification du
métabolisme pour diminuer la transpiration,....
II.1.2 Les facteurs édaphiques
Ce sont les facteurs liés au substrat, sol ou eau. Ils peuvent
être chimiques (acidité, salinité, etc.) ou physiques (structure
et porosité du sol, vitesse du courant d'une rivière, etc.).
Les variations de la qualité des sols et des eaux influent sur
les êtres vivants, végétaux et animaux.
Le sol est un milieu vivant complexe et dynamique, définit comme
étant la formation naturelle de surface, à structure meuble et
d'épaisseur variable, résultant de la transformation de la roche mère
sous-jacente sous l'influence de divers processus : physiques,
chimiques et biologiques, au contact de l'atmosphère et des êtres
vivants.
La texture du sol est définie par la grosseur des particules qui le
composent : graviers, sables, limons, argiles (granulométrie : mesure
de la forme, de la dimension et de la répartition en différentes classes
des grains et des particules de la matière divisée) :
 Sur le plan biologique, la
granulométrie intervient dans
la répartition des animaux et
des eaux souterraines.

Nombreux organismes tels que les vers de terre préfèrent les sols limoneux ou
argilo-sableux, tout comme quelques espèces de coléoptères qui préfèrent les
sols argileux et/ou limoneux, présentant une teneur élevée en éléments fins et
qui ont la faculté de retenir l’eau nécessaire, contrairement aux éléments
grossiers qui permettent une dessiccation trop rapide du sol.
La structure est l'organisation du sol. Elle se définit également
comme étant l’arrangement spatial des particules de sables, de
limons et d’argiles.
II. 2. Les facteurs biotiques
Les facteurs biotiques sont l’ensemble des actions que les
organismes vivants exercent directement les uns sur les
autres. Ces interactions, appelées coactions, sont de deux
types :
 Homotypiques ou intraspécifiques, lorsqu’elles se
produisent entre individus de la même espèce.
 Hétérotypiques ou interspécifiques, lorsqu’elles ont lieu
entre individus d’espèces différentes.
Coactions homotypiques

 L’effet de groupe
On parle d’effet de groupe lorsque des modifications ont lieu
chez des animaux de la même espèce, quand ils sont groupés
par deux ou plus de deux. L’effet de groupe est connu chez de
nombreuses espèces d’insectes ou de vertébrés, qui ne
peuvent se reproduire normalement et survivre que
lorsqu’elles sont représentées par des populations assez
nombreuses.
Exemple : On estime qu’un troupeau d’éléphants d’Afrique doit
renfermer au moins 25 individus pour pouvoir survivre : la lutte
contre les ennemis et la recherche de la nourriture sont
facilitées par la vie en commun.
 L’effet de masse
A l’inverse de l’effet de groupe, l’effet de masse se produit, quand le
milieu, souvent surpeuplé, provoque une compétition sévère aux
conséquences néfastes pour les individus. Les effets néfastes de
ces compétitions ont des conséquences sur le métabolisme et la
physiologie des individus qui se traduisent par des perturbations,
comme la baisse du taux de fécondité, la diminution de la natalité,
l’augmentation de la mortalité. Chez certains organismes, le
surpeuplement entraine des phénomènes appelés phénomènes
La compétition intraspécifique
Ce type de compétition peut intervenir pour de très faibles densités
de population, et se manifeste de façons très diverses :
Apparaît dans les comportements territoriaux, c’est-à-dire lorsque
l’animal défend une certaine surface contre les incursions des
autres individus.
Le maintien d’une hiérarchie sociale avec des individus dominants
et des individus dominés.
La compétition alimentaire entre individus de la même espèce est
intense quand la densité de la population devient élevée. Sa
conséquence la plus fréquente est la baisse du taux de croissance des
populations. Chez les végétaux, la compétition intraspécifique, liée aux
fortes densités se fait surtout pour l’eau et la lumière. Elle a pour
conséquence une diminution du nombre de graines formées et/ou une
mortalité importante qui réduit fortement les effectifs.
Coactions hétérotypiques
La cohabitation de deux espèces peut avoir sur chacune d’entre
elles une influence nulle, favorable ou défavorable.

Le neutralisme
On parle de neutralisme lorsque les deux espèces sont
indépendantes : elles cohabitent sans avoir aucune influence
l’une sur l’autre.
 La compétition interspécifique
La compétition interspécifique peut être définit comme étant la
recherche active, par les membres de deux ou plusieurs espèces, d’une
même ressource du milieu (nourriture, abri, lieu de ponte, etc…).
Dans la compétition interspécifique, chaque espèce agit
défavorablement sur l’autre. La compétition est d’autant plus grande
entre deux espèces qu’elles sont plus voisines.
Cependant, deux espèces ayant exactement les mêmes besoins ne
peuvent cohabiter, l’une d’elle étant forcément éliminée au bout d’un
certain temps.
La prédation
Le prédateur est tout organisme libre qui se nourrit aux dépend
d’un autre. Il tue sa proie pour la manger. Les prédateurs
peuvent être polyphages (s’attaquant à un grand nombre
d’espèces), oligophages (se nourrissant de quelques espèces),
ou monophages (ne subsistant qu’au dépend d’une seule
espèce).
Le parasitisme
Le parasite est un organisme qui ne mène pas une vie libre : il
est au moins, à un stade de son développement, lié à la surface
(ectoparasite) ou à l’intérieur (endoparasite) de son hôte.
On peut considérer le parasitisme comme un cas particulier de
la prédation. Cependant, le parasite n'est pas vraiment un
prédateur car il n'a pas pour but de tuer l'hôte. Le parasite doit
s'adapter pour rencontrer l'hôte et survivre au détriment de ce
dernier.
L'hôte doit s'adapter pour ne pas rencontrer le parasite et s’en
débarrasser si la rencontre a eu lieu. Tout comme les prédateurs,
les parasites peuvent être polyphages, oligophages ou
monophages.
Le commensalisme
Interaction entre une espèce, dite commensale, qui en tire profit de l’association et
une espèce hôte qui n’en tire ni avantage ni nuisance. Les deux espèces exercent
l’une sur l’autre des coactions de tolérance réciproque.
Exemple : Les animaux qui s’installent et qui sont tolérés dans les gites des
autres espèces.
Le mutualisme
C’est une interaction dans laquelle les deux partenaires trouvent
un avantage, celui-ci pouvant être la protection contre les
ennemis, la dispersion, la pollinisation, l’apport de nutriments…
Exemple : L’association obligatoire et indispensable entre deux
espèces est une forme de mutualisme à laquelle on réserve le nom de
symbiose. Dans cette association, chaque espèce ne peut survivre,
croitre et se développer qu’en présence de l’autre.
Les lichens sont formés par l’association d’une algue et d’un champignon
L’amensalisme
C’est une interaction dans laquelle une espèce est éliminée par une
autre espèce qui secrète une substance toxique. Dans les
interactions entre végétaux, l’amensalisme est souvent appelé
allélopathie.
Exemple : Le Noyer rejette par ses racines, une substance volatile
toxique, qui explique la pauvreté de la végétation sous cet arbre.
III. Notions d’accommodation et d’adaptation
III.1 Accommodation
L'accommodation est la transformation de certaines caractéristiques
extérieures suite à des facteurs du milieu. Il n'y a pas de transmission
héréditaire de ces caractères.
Exemples:
- forme isolée et forme forestière d'un arbre; Un hêtre planté isolément
dans un espace découvert présentera une forme «en boule», les
branches se développant à tous les niveaux sur le tronc et s’étalant
largement à l’horizontale, de sorte que la projection au sol de la couronne
est d’un diamètre important par rapport à la hauteur totale de l’arbre. Au
contraire, lorsque cette même espèce croît en milieu forestier où règne
une intense compétition pour la lumière entre sujets voisins, elle prend un
port élancé, la couronne se développant en forme de houppe au sommet
d’un tronc de grande hauteur.
•III.2 Adaptation
•l'adaptation peut se définir d’une manière générale

comme l’ajustement fonctionnel de l’être vivant au

milieu, et, en particulier, comme l’appropriation de

l’organe à sa fonction.
•L’adaptation correspond à la mise en accord d'un
organisme vivant avec les conditions qui lui sont
extérieures. Elle perfectionne ses organes, les rend plus
aptes au rôle qu’ils semblent jouer dans la vie de
l’individu. Elle met l’organisme tout entier en cohérence
avec le milieu.
IV. Notions d’écosystème
IV. 1 Définition
L’écosystème est l’unité de base du champ d’étude
scientifique de la nature (l’écologie scientifique). Selon cette
discipline, l’écosystème un milieu physiquement délimité,
constitué de ses deux composantes indissociables :
 Le biotope : c’est-à-dire un environnement physique
particulier avec des caractéristiques physiques spécifiques
(température, humidité, climat)
La biocénose : c’est-à-dire un ensemble d’êtres vivants
(animaux, végétaux, micro-organismes) en interaction, et
donc en interdépendance.
IV.2 Constituants et organisation de l’écosystème
Le niveau le plus élémentaire d’organisation du vivant est la
cellule. Celle–ci est intégrée dans l’individu qui s’intègre dans
une population. La population fait partie d’une communauté ou
biocénose. La biocénose s’intègre à son tour dans
l’écosystème. L’ensemble des écosystèmes forment la
biosphère qui est le niveau le plus élevé du vivant.
Un écosystème est constitué par l’ensemble des êtres vivants
(biocénose) et du milieu dans lequel ils vivent (biotope).
Le biotope fournit l’énergie, la matière organique et inorganique
d’origine abiotique. La biocénose comporte trois catégories
d’organismes : de producteurs de matières organiques, des
consommateurs de cette matière et des décomposeurs qui
la recyclent.

Les végétaux captent l’énergie solaire et fabriquent des

glucides qui seront transformés en d’autres catégories de
produits, ils seront broutés par les herbivores qui seront
dévorés par des carnivores.
Les décomposeurs consomment les déchets et les cadavres
de tous et permettent ainsi le retour au milieu de diverses
substances. Par son unité, son organisation et son
fonctionnement, l’écosystème apparaît comme le maillon de
base de la biosphère.
IV.3 Fonctionnement d’un écosystème naturel
On dit souvent que les écosystèmes naturels sont des systèmes
“équilibrés”. Cela signifie que les interactions entre les différents
organismes qui constituent l’écosystème contribue à une
certaine stabilité. Par exemple, dans les écosystèmes des plaines
herbeuses, les herbivores consomment de l’herbe, mais nourrissent
aussi le sol avec leurs déjections, ce qui permet à l’herbe de repousser
et permet une sorte d’équilibre. Mais cela ne veut pas dire pour autant

qu’un écosystème, même sain, soit statique.

IV.4 Notions importantes liées au fonctionnement de
l’écosystème
IV.4.1 Notion de chaine alimentaire
Une chaîne alimentaire ou chaîne trophique représente une
suite d'organismes se nourrissant les uns des autres, chacun
se nourrit de l'organisme qui le précède dans la chaîne.
Tout écosystème comporte un ensemble d’espèces animales
et végétales qui peuvent êtres réparties en trois groupes : les
producteurs, les consommateurs et les décomposeurs
 Producteurs autotrophes
Constituent le 1er niveau trophique de l’écosystème
(Producteurs primaires). Ce sont les végétaux autotrophes
photosynthétiques (Phototrophes). Ex.: Plantes vertes,
phytoplanctons, cyanobactéries.
Grâce à la photosynthèse, ils élaborent la matière organique à
partir de matières strictement minérales fournies par le milieu
extérieur abiotique.
 Consommateurs (hétérotrophes)
Êtres vivants se nourrissant des matières organiques complexes déjà
élaborées qu’ils prélèvent sur d’autres êtres vivants. Il existe les
consommateurs de matière fraiche et les consommateurs de cadavres
d’animaux
 Les consommateurs de matières fraiche
 Consommateurs primaires (C1) : Ce sont les phytophages qui mangent les
producteurs. Ce sont en général des animaux, appelés herbivores
(mammifères herbivores, insectes, crustacés : crevette), mais aussi plus
rarement des parasites végétaux et animaux des plantes vertes.
 Consommateurs secondaires (C2) : Prédateurs de C1. Il s’agit
de carnivores se nourrissant d’herbivores (mammifères
carnassiers, rapaces, insectes,…).
 Consommateurs tertiaires (C3) : Prédateurs de C2. Ce sont
donc des carnivores qui se nourrissent de carnivores (oiseaux
insectivores, rapaces, insectes,…).
Le plus souvent, un consommateur est omnivore et appartient donc
à plusieurs niveaux trophiques.
Les C2 et les C3 sont soit des prédateurs (supraprédateurs) qui
capturent leurs proies, soit des parasites d’animaux.
 Consommateurs de cadavres d’animaux
 Les charognards ou nécrophages désignent les espèces qui se
nourrissent des cadavres d’animaux frais ou décomposés (matière
organique morte). Ils terminent souvent le travail des carnivores.
Ex. : Chacal, Vautour,…
Décomposeurs et détritivores
Différents organismes et microorganismes qui s’attaquent aux
cadavres et aux excrétas et les décomposent peu à peu en
assurant le retour progressif au monde minéral des éléments
contenus dans la matière organique.
Saprophyte : Organisme végétal se nourrissant de matières
organiques en cours de décomposition.
Exemple: Champignons.
Saprophage : Organisme animal qui se nourrit de matières
organiques en cours de décomposition
Exemple : Bactéries.

Détritivore : Invertébré qui se nourrit de détritus ou débris

d’animaux et/ou de végétaux.
Exemple : Protozoaires, lombrics, nématodes, cloportes.
Coprophage : Animal qui se nourrit d’excréments.
Exemple : Bousier
 Représentation graphique des chaînes trophiques
La schématisation de la structure des biocénoses est
généralement conçue à l’aide de pyramides écologiques, qui
correspondent à la superposition de rectangles horizontaux
de même hauteur, mais de longueurs proportionnelles au
nombre d’individus, à la biomasse ou à la quantité d’énergie
présentes dans chaque niveau trophique. On parle alors de
pyramide des nombres, des biomasses ou des énergies
• Schéma pyramide des nombre. Exemple de construction

Dans le cas d’un écosystème

constitué par un champ de luzerne
de 4ha qui sert à nourrir 4,5 veaux
Pyramide des nombres
eux-mêmes mangés pendant un an
par un enfant, les pyramides sont
les suivants :

Pyramide des Biomasses

 Le réseau trophique
Le réseau trophique se définit comme un ensemble de chaînes
alimentaires reliées entre elles au sein d’un écosystème et par
lesquelles l’énergie et la matière circulent. Il se définit également
comme étant l’ensemble des relations trophiques existant à
l’intérieur d’une biocénose entre les diverses catégories
écologiques d’êtres vivants constituants cette dernière
(producteurs, consommateurs et décomposeurs).
IV.5 Notion de cycle biogéochimique
Il existe une circulation de la matière dans chaque écosystème
où des molécules ou des éléments chimiques, reviennent sans
cesse à leur point de départ et que l’on peut qualifier de
cyclique, à la différence des transferts d’énergie. Le passage
alternatif des éléments, ou molécules, entre milieu inorganique
et matière vivante, est appelé cycle biogéochimique.
Celui-ci correspond à un cycle biologique (cycle interne à
l’écosystème qui correspond aux échanges entre les
organismes) auquel se greffe un cycle géochimique (cycle
de grandes dimensions, pouvant intéresser la biosphère
entière et qui concernent les transports dans le milieu non
vivant).
On peut distinguer trois principaux types de cycles
biogéochimiques :
Le cycle de l'eau.
Le cycle des éléments à phase gazeuse prédominante
(carbone, oxygène, azote).
Le cycle des éléments à phase sédimentaire prédominante
(phosphore, potassium etc.).
Le cycle de l'eau
Le cycle de l'eau consiste en un échange d'eau entre les
différents compartiments de la Terre : l'hydrosphère,
l'atmosphère et la lithosphère.
Sous l'effet de la chaleur du soleil, l'eau des mers, des fleuves
et des lacs s'évapore. L'évapotranspiration joue un rôle
également important dans le cycle de l'eau. Elle est accélérée
par les végétaux qui transpirent de grandes quantités d'eau
par leur système foliaire.
De plus, leurs racines, accélèrent ces mouvements ascendants
de l'eau dans le sens sol--atmosphère. Cette eau rejoint alors
l'atmosphère sous forme de vapeur d'eau (nuages). De plus,
leurs racines, accélèrent ces mouvements ascendants de l'eau
dans le sens sol--atmosphère. Cette eau rejoint alors
l'atmosphère sous forme de vapeur d'eau (nuages). Les
nuages sont poussés par le vent. Lorsqu'ils traversent des
régions froides, la vapeur d'eau se condense.
Elle retombe sur le sol, sous forme de pluie, de neige ou de
grêle. Les 7/9 du volume total de ces précipitations retombent à
la surface des océans et les 2/9 seulement sur les continents.
La circulation de l'eau dans la lithosphère emprunte trois voies :
 Le ruissellement : phénomène d'écoulement des eaux à la surface
des sols.
 L'infiltration : phénomène de pénétration des eaux dans le sol, à
travers les fissures naturelles des sols et des roches, assurant ainsi
l’alimentation des nappes phréatiques.
 La percolation : phénomène de migration de l’eau à travers
les sols (jusqu’à la nappe phréatique).
Ruissellement, infiltration et percolation assurent l'alimentation
des cours d'eau qui restituent en dernier lieu l'eau à
l'hydrosphère.
 Le cycle du carbone
Lors de la respiration, les êtres vivants consomment de
l'oxygène et rejettent du dioxyde de carbone (CO2) dans
l'atmosphère. De même, les industries, les véhicules de
transports rejettent du CO2 dans l'atmosphère après
combustion d'un carburant, en présence d'oxygène. Les
éruptions volcaniques sont également considérées comme
source naturelle de CO2. Le CO2 est absorbé par les plantes
(photosynthèse) et l'eau (dissolution).
Photosynthèse et dissolution sont les phénomènes permettant
le recyclage du gaz carbonique.
 Après la photosynthèse, le carbone se combine avec d'autres
éléments pour former des molécules complexes, qui après la
mort de la plante seront dégradées très lentement en
charbon. Lors de leur combustion, ces combustibles fossiles
formeront à nouveau du CO2.
 Le CO2 de l'air et celui dissous dans l'eau constituent la
seule source de carbone inorganique à partir de laquelle
s'élaborent toutes les substances biochimiques constituant
la cellule vivante (grâce à l'assimilation chlorophyllienne).
 Au cours de la respiration des autotrophes, des
hétérotrophes et de divers autres organismes, le gaz
carbonique est dégagé parallèlement à la consommation
d'oxygène.
Le dégagement de CO2 a lieu également au cours des
fermentations qui conduisent à une décomposition partielle des
substrats dans des conditions anaérobies.
Dans les sols, il se produit souvent un ralentissement du cycle
du carbone : les matières organiques ne sont pas entièrement
minéralisées mais transformées en un ensemble de composés
organiques acides (les acides humiques). Dans certains cas
les matières organiques ne sont pas entièrement minéralisées
et elles s'accumulent dans diverses formations sédimentaires.
II se produit une stagnation et même un blocage du cycle du
carbone. C'est le cas actuellement de la formation de tourbe ou
par le passé de la constitution de grands dépôts de houille, de
pétrole et d'autres hydrocarbures fossiles.
Cependant, nous produisons trop de dioxyde de carbone et
notre Terre n'arrive plus à le recycler.
Le taux de CO2 dans l'atmosphère augmente et le climat se
réchauffe. En effet, le CO2 présent dans l'atmosphère permet
de piéger la chaleur du soleil qui rend la vie possible sur
Terre. C'est ce qu'on appelle l'effet de serre. En augmentant la
concentration de CO2 dans l'atmosphère, l'équilibre de notre
écosystème est perturbé. Le climat se réchauffe et cela peut
avoir des conséquences graves sur la vie sur Terre :
les calottes glaciaires pourraient fondre et augmenter le niveau
des mers en certains points provoquant des inondations,
augmentation des conditions climatiques extrêmes comme les
tempêtes, les raz de marée, la sécheresse... etc.
Le cycle de l’Oxygène
L'oxygène est l'un des constituants essentiel à la vie sur terre. La
majeure partie de son cycle est un échange permanent entre
l'atmosphère et les êtres vivants : les végétaux libèrent du
dioxygène par photosynthèse et les animaux le consomment par la
respiration. D'autres composés interviennent, tels que l'ozone.
L'oxygène joue un rôle dans de nombreux cycles, du fait de son
importance dans les réactions d'oxydoréduction. Ainsi, le cycle de
l'oxygène est directement lié à ceux du carbone et de l'eau.
Le cycle de l’Azote
Le cycle de l'azote est un cycle biogéochimique qui décrit la succession
des modifications subies par les différentes formes de l'azote (diazote,
nitrate, nitrite, ammoniac, azote organique).
L'atmosphère est la principale source d'azote, sous forme de diazote,
puisqu'elle en contient 79 % en volume. L'azote, composé essentiel à de
nombreux processus biologiques, se retrouve entre autres dans les
acides aminés constituant les protéines, et dans les bases azotées
présentes dans l'ADN. Des processus sont nécessaires pour transformer
l'azote atmosphérique en une forme assimilable par les organismes.
L'azote atmosphérique est fixé par des bactéries présentes
dans le sol, telles que Azobacter vinelandii, grâce à une
enzyme, la nitrogénase. Celles-ci produisent de l'ammoniaque
(NH4OH) à partir de l'azote atmosphérique et de l'hydrogène de
l'eau. Certaines de ces bactéries, comme Rhizobium, vivent en
symbiose avec des plantes, produisant de l'ammoniaque
nécessaire aux plantes, en contrepartie des glucides de la
plante dans la rhizosphère.
L'ammoniaque peut aussi provenir de la décomposition
d'organismes morts par des bactéries saprophytes sous forme d'
ions ammonium (NH4+).
Dans les sols bien oxygénés, mais aussi en milieu aquatique oxygéné,
des bactéries transforment l'ammoniac en nitrite (NO2-), puis en nitrates

(NO3-), au cours du processus de nitrification. On peut décomposer

cette transformation en nitritation et nitratation.
Le Cycle du phosphore
Le phosphore est un élément important de la matière vivante. Il
est un constituant de l’ADN, de l’ARN et de l’ATP. Le phosphore
est plus rare que l’Azote dans la Biosphère et son réservoir
principal est constitué de divers roches qui cèdent peu à peu
leur phosphore aux écosystèmes. Dans le milieu terrestre, la
quantité de phosphore assimilable est généralement très faible
et joue de ce fait le rôle de facteur limitant.
Une partie importante des phosphates est entrainer en mer où
elle peut se retrouver immobiliser dans les sédiments profonds.
Le passage du phosphore de l’état organique à l’état
inorganique est assuré par des bactéries ( Eubacillus et
Bacillus) et des champignons (Penicillium). Le phosphore entre
dans la chaine alimentaire marine par l’intermédiaire du
plancton et des poissons.
Les oiseaux marins piscivores assurent son retour au moins
partiel dans le milieu terrestre. Les engrais phosphatés
excédentaires et les divers produits contenants du phosphate
comme les lessives sont entrainés dans les eaux de surface et
dans les eaux souterraines où ils contribuent à
l’eutrophisation.
Les végétaux absorbent grâce à leurs racines les ions nitrate
(NO3-) et, dans une moindre mesure, l'ammonium présent dans
le sol, et les incorporent dans les acides aminés et les
protéines. Les végétaux constituent ainsi la source primaire
d'azote assimilable par les animaux.