Estructura y funcin del ADN

"u es un gen?
Es una secuencia de nucletidos en la
molcula de ADN, equivalente a una unidad
de transcripcin.
Contiene la informacin, a partir de la cual se
sintetiza un polipptido, una enzima, un cido
ribonucleico: mensajero, de transferencia o
ribosomal.
En el genoma humano la mayora de los
genes son nicos y se expresan en forma
independiente. Los genes segregan cuando
ocurre la meiosis.
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR
Hebra moIde Hebra moIde
Transcripcin Transcripcin
Traduccin Traduccin
NaturaIeza deI materiaI hereditario.
Los cidos nucIeicos y sus componentes
NaturaIeza deI materiaI hereditario.
Los cidos nucIeicos y sus componentes
Los cidos nucIeicos son macromoIcuIas con
estructura de poImero IineaI, donde Ios monmeros son
nucIetidos. Cada nucIetido est formado por un azcar
pentosa, un fosfato y una base nitrogenada. Las bases
pueden ser purinas (de dobIe aniIIo), como Ia Adenina y
Ia Guanina...
Los cidos nucIeicos son macromoIcuIas con
estructura de poImero IineaI, donde Ios monmeros son
nucIetidos. Cada nucIetido est formado por un azcar
pentosa, un fosfato y una base nitrogenada. Las bases
pueden ser purinas (de dobIe aniIIo), como Ia Adenina y
Ia Guanina...
ADENNA (A) ADENNA (A)
GUANNA (G) GUANNA (G)
Tambin pueden ser pirimidinas, de aniIIo
senciIIo, como Ia timina y Ia citosina, en eI
ADN; y Ia citosina y eI uraciIo en eI ARN
Tambin pueden ser pirimidinas, de aniIIo
senciIIo, como Ia timina y Ia citosina, en eI
ADN; y Ia citosina y eI uraciIo en eI ARN
TIMINA (T) TIMINA (T) URACLO (U) URACLO (U) CITOSINA (C) CITOSINA (C)
1
2
3
4
5
6
!entosa deI ADN: Desoxirribosa !entosa deI ADN: Desoxirribosa
ATENCIN: Un
hidrgeno en Ia
posicin 2'
ATENCIN: Un
hidrgeno en Ia
posicin 2'
3'
5'
DesoxirribunucIetido DesoxirribunucIetido
La moIcuIa de ADN es una dobIe hIice
antiparaIeIa (Watson y Crick 1953)
La moIcuIa de ADN es una dobIe hIice
antiparaIeIa (Watson y Crick 1953)
osfatos van
unidos aI azcar
en eI C-5' y eI C-3'
osfatos van
unidos aI azcar
en eI C-5' y eI C-3'
Hebras
antiparaIeIas
Hebras
antiparaIeIas
!unta 3' Iibre !unta 3' Iibre
!unta 5' Iibre !unta 5' Iibre
ACIDOS NUCLEICOS ACIDOS NUCLEICOS
La funcin codificante deI ADN est
determinada por Ia secuencia de sus
nucIetidos (bases)
La funcin codificante deI ADN est
determinada por Ia secuencia de sus
nucIetidos (bases)
Hebra moIde Hebra moIde
Hebra Ider Hebra Ider
Hebra retardada Hebra retardada
EL ADN es Ia moIcuIa que permite perpetuar Ia vida:
RE!LICACIN DEL ADN
EL ADN es Ia moIcuIa que permite perpetuar Ia vida:
RE!LICACIN DEL ADN
Replicacin
Las ADN polimerasas requieren como
sustrato la punta 3' hidroxilo libre de
una base apareada para catalizar la
unin de otro nucletido.
El OH libre se une al 5'-fosfrico del
deoxinuclesido 5' trifosfato,
liberndose un pirofosfato inorgnico
ADN polimerasas, ligasas..
ADN poIimerasas de aIta fideIidad dirigidas
por ADN: dos de ellas replican los
cromosomas, (-) especfica para la hebra
retardada porque tiene una subunidad primasa,
(0) lder y elongacin de la hebra retardada,
otras dos reparan el ADN (. y 1), y una de ellas
replica y repara el ADN mitocondrial ().
01tienen actividad 3' 5' exonucleasa
0 y 1tienen actividad de reparacin del ADN
de tipo excisin de nucletidos y de bases.
ADNpolimerasas...
ADN poIimerasas propensas a errores dirigidas
por ADN: un grupo grande que replica con muy baja
fidelidad. La tasa de error de la polimerasa (iota) es
20.000 veces mayor que la de 1. Se expresan en
cantidades altas en el sistema inmune, implicadas en
la hipermutabilidad en linfocitos B y T.
ADN poIimerasas dirigidas por ARN: usan como
molde una hebra de ARN: transcriptasas reversas.
Ej: Actividad polimerasa en la enzima telomerasa
(Tert) que replica la parte final de los extremos
lineales de los cromosomas.
Transcriptasa reversa endgena, que ocasionalmente
puede convertir ARN en ADNc e integrarlo al genoma.
!roteinas principales replicacin
Topoisomerasas: rompen una hebra y la tensin del
enrrollamiento de la hlice se relaja
HeIicasas: completan el desenrrollamiento
ADN poIimerasas: complejos agregados de
diferentes protenas.
!rimasas: sintetizan los iniciadores de ARN que se
necesitan para iniciar la replicacin
Ligasas: sellan las lagunas dejadas por las
ribonucleasas cuando remueven los primers, catalizan
la unin fosfodiester entre nucletidos adyacentes.
!roteinas de unin a Ia hebra senciIIa deI ADN:
estabilizan la horquilla de replicacin.
Estructura tridimensional de una helicasa: un hexmero con
seis sitios de enlace al AT!. La hidrlisis secuencial de
estos AT!s permite el desenrrollamiento de la doble hlice.
La ADN polimerasa
Sntesis del primer de ARN por una primasa
En eucariontes los
fragmentos
de Okasaki tienen 200
nucletidos,
los primers unos 10.
Los iniciadores de ARN se
eliminan mediante una
ARNasa
especfica que reconoce
dobles
hlices hbridas ARNADN
La laguna es llenada por una
polimerasa y la unin
finalmente
es realizada por una ligasa
La ligasa acopla la hidrlisis de un AT! para hacer
ms favorable la reaccin de unin entre el fosfato y el
hidroxilo libre, liberando al final un AM!.
Efecto de las protenas de enlace con la hebra sencilla del ADN
Estructura de las proteinas de enlace a la hebra sencilla
Modelo de la protena humana
Horquilla de replicacin en los mamferos: Dos polimerasas
diferentes en la hebra retardada, primero empieza la pol -
sintetizando el primer de ARN algo del ADN porque tiene una
subunidad primasa, luego sigue trabajando la pol 0en la
elongacin del fragmento
Reparacin del ADN
Tipos de dao al ADN
Mecanismos endgenos:
1. !rdida de bases tipo purinas por ruptura
espontnea del enlace con el azcar
5000/da/clula humana
2. Deaminacin espontnea de citosinas y
adeninas produce uracilo e hipoxantina
3. Molculas con oxgenos reactivos atacan los
anillos de las bases nitrogenadas
4. La ADN polimerasa puede incorporar bases
equivocadas en la replicacin
5. Errores en la replicacin o recombinacin
provocan fracturas en el ADN
Agentes extracelulares
1. Radiaciones ionizantes: rayos gamma y
rayos X causan rupturas en la doble hlice
2. Luz UV causa la formacin de los dmeros
de timina
3. Qumicos ambientaIes como agentes
alquilantes y otras sust qumicas forman
aductos con las bases del ADN:
hidrocarburos, productos naturales como las
aflatoxinas.
*5
**5
Mecanismos de deteccin y reparacin
de daos al ADN
Sistemas enzimticos para reconocer,
eliminar y reparar daos inducidos al
ADN se han descrito y estudiado bien
en bacterias
El estudio de los sndromes
hereditarios de predisposicin al cncer
ha permitido ampliar el conocimiento
en el ser humano
Capitulo 14: del ADN a las protenas
Transmisin de Ia informacin
La transmisin se IIeva a cabo
principaImente gracias a Ia existencia de Ios
cidos ribonucIeicos o ARNs
ARN mensajero (IineaI de hebra simpIe)
ARN de transferencia
ARN ribosomaI
Y a Ias ARNs poIimerasas
RibonucIetido RibonucIetido
ATENCION:
Grupo hidroxiIo
en Ia posicin 2'
ATENCION:
Grupo hidroxiIo
en Ia posicin 2'
URACILO sustituye a Ia TIMINA URACILO sustituye a Ia TIMINA
La secuencia correspondiente a una unidad de
transcripcin en eI ADN se transcribe en una hebra
compIementaria de ARN, IIamada transcrito
primario, a partir deI cuaI, por modificaciones post-
transcripcionaIes , se origina eI ARN mensajero
La secuencia correspondiente a una unidad de
transcripcin en eI ADN se transcribe en una hebra
compIementaria de ARN, IIamada transcrito
primario, a partir deI cuaI, por modificaciones post-
transcripcionaIes , se origina eI ARN mensajero
TRANSCR!CN TRANSCR!CN
La ARN poIimerasa
se activa cuando
forma un compIejo
con Ios factores de
transcripcin o
eIementos
trans. La interaccin
de estos entre s, y con
Ias secuencias
reguIadoras deI ADN
(Ios factores cis) es Ia
que determina donde,
cuando y con qu
rapidez ocurre Ia
transcripcin
Regin reguIadora EXON 1 EXON 2 EXON 3 EXON 4 EXON n Regin reguIadora
!ROMOTOR
5` 3`
Intrn 1 Intrn 2 Intrn 3
Unidad de transcripcin
Secuencia que no se traduce Secuencia que no se traduce
ModeIo simpIificado de un gen humano
Dra. !atricia Cuenca Berger
NSA
Despus deI procesamiento postranscripcionaI deI ARN
transcrito primario, Ia secuencia de ARNm corresponde a Ias
secuencias de Ios exones y Ias no codificantes (UTRs).
Despus deI procesamiento postranscripcionaI deI ARN
transcrito primario, Ia secuencia de ARNm corresponde a Ias
secuencias de Ios exones y Ias no codificantes (UTRs).
!rocesamiento postranscripcional del ARN
Corte en 5' y unin de un "cap(5metilguanosina),
para proteger del ataque de las exonucleasas,
facilitar el transporte ncleocitoplasma, y el
anclaje del ARNm al ribosoma
Corte en 3' y unin de una cola de poliA (200
AM!), confiere estabilidad y ayuda en la
traduccin
Eliminacin de los intrones, por formacin de un
complejo snARNsproteinas: "spliceosoma, el
cual es especfico. La especificidad de la reaccin
est dada por la complementaridad de las bases
entre los pequeos ARNs nucleares y el ARN
transcrito primario
ARN de transferencia activado:
cargado con eI aminocido
correspondiente
ARN de transferencia activado:
cargado con eI aminocido
correspondiente
CODIGO
GENETICO
ARNm
CODIGO
GENETICO
ARNm
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR
Hebra moIde Hebra moIde
Transcripcin Transcripcin
Traduccin Traduccin
TRADUCCIN
ARN --- !rotena
TRADUCCIN
ARN --- !rotena
Cuatro monmeros de aminocidos
Reaccin de
condensacin
!olipptido
Enlace peptdico catalizado por el complejo enzimtico localizado en el ribosoma
*5
Estructura general de un aminocido
!OLARES Cargados
Sus molculas estn parcialmente cargadas
**5
!olares neutros
En sus residuos tienen grupos aminos, hidroxilos o sulfidrilos
**5
No polares o hidrofbicos
Estructura primaria
(Secuencia IineaI)
Residuos de los distintos aminocidos
Estructura secundaria
(forma adoptada espontneamente)
Estructura terciaria
(orma tridimensionaI: gIobuIar,
tubuIar, como una rueda, etc.)
Las protenas sufren transformaciones posttraduccionales
Estructura cuaternaria: combinacin de monmeros
Anemia faIciforme:
Hemoglobina
HbA se transforma
en HbS
La mutacin es un
cambio del segundo
nucletido en el
codn 6 en la
subunidad beta
Adenina por timina
cido glutmico
por valina
HbS
Seleccin Natural
Ventaja heterocigoto
Malaria
Variaciones en Ia secuencia de bases deI ADN que no causan
aIteraciones funcionaIes patoIgicas, son aIeIos o
poIimorfismos deI gen existentes en Ia pobIacin (>1%)
Variaciones en Ia secuencia de bases deI ADN que no causan
aIteraciones funcionaIes patoIgicas, son aIeIos o
poIimorfismos deI gen existentes en Ia pobIacin (>1%)
AIteraciones en Ia secuencia de bases deI ADN que
aIteran Ia funcin normaI (produciendo patoIoga)
deI producto gnico son mutaciones
Mutaciones
GerminaIes o constitucionaIes:
El individuo las adquiere por herencia de sus padres, puede
ocurrir /e novo en una clula germinal de alguno de los
padres.
Todas las clulas del cuerpo llevan la misma mutacin
Ejemplo: enfermedades hereditarias
Somticas:
Se adquiere en el transcurso de la vida
Es portada nicamente por la clula afectada y sus clulas
hijas. El individuo es un mosaico.
Ejemplo: cncer
Clases de mutaciones:
Sustitucin de bases:
1 Sustituciones sinnimas (otro codn : mismo aa)
2 Mutaciones sin sentido (cambio a codn STO!)
3 Mutaciones de sentido equivocado:
sustitucin del aa en la proteina
4 Mutaciones en el sitio de corte y empalme del
ARN.
Otros tipos de mutaciones:
a Mutaciones de cambio en el marco de lectura
deleciones
duplicaciones o insersiones
b Mutaciones dinmicas
La patologa molecular intenta explicar porque un
cambio gentico dado podra resultar en un fenotipo
clnico particular.
*5
!rdida de funcin deI gen !AX3: Sndrome de Waardenburg tipo I,
sordera y anormaIidades pigmentarias
Diferentes tipos de mutaciones afectan aI gen, todas causan prdida de funcin
y eI mismo resuItado cInico
Cambio fenotpico por dos mecanismos:
1 prdida o reduccin de la funcin normal.
2 el producto podra adquirir una nueva funcin.
!or qu las mutaciones tienen diferentes tipos de
herencia, dominantes, recesivas, etc?
Las leyes de Mendel se cumplen en la herencia de algunos
rasgos y enfermedades humanas, las que son codificadas
por un solo gen.
Leyes de Mendel: redescubiertas 1900
Modelo de la doble hlice del ADN: 1953
Mutaciones hereditarias:
Dominante o recesiva?
Mutaciones recesivas llevan a un producto gnico con
funcin reducida o con prdida de funcin.
!ara la mayoria de los enes, es suIiciente el 5roducto de uno
de los alelos (la mitad) 5ara que se lleve a cabo la Iuncion
normal !or eso es que la mayoria de los errores innatos del
metabolismo son recesivos
Mutaciones dominantes llevan a un producto gnico con
ganancia de funcin.
a anancia de Iuncion causa Ienoti5os dominantes
5orque la 5resencia del 5roducto normal no 5reviene
que el 5roducto mutado se 'com5orte anormalmente
La adquisicin de una nueva funcin es un evento raro en
enfermedades hereditarias, pero muy comn en cncer
Clases de mutaciones:
Sustitucin de bases:
1 Sustituciones sinnimas (otro codn : mismo aa)
2 Mutaciones sin sentido (cambio a codn STO!)
3 Mutaciones de sentido equivocado:
sustitucin del aa en la proteina
4 Mutaciones en el sitio de corte y empalme del
ARN.
Otros tipos de mutaciones:
a Mutaciones de cambio en el marco de lectura
deleciones
duplicaciones o insersiones
b Mutaciones dinmicas
La patologa molecular intenta explicar porque un
cambio gentico dado podra resultar en un fenotipo
clnico particular.
*5
!rdida de funcin deI gen !AX3: Sndrome de Waardenburg tipo I,
sordera y anormaIidades pigmentarias
Diferentes tipos de mutaciones afectan aI gen, todas causan prdida de funcin
y eI mismo resuItado cInico
Cambio fenotpico por dos mecanismos:
1 prdida o reduccin de la funcin normal.
2 el producto podra adquirir una nueva funcin.
!or qu las mutaciones tienen diferentes tipos de
herencia, dominantes, recesivas, etc?
Las leyes de Mendel se cumplen en la herencia de algunos
rasgos y enfermedades humanas, las que son codificadas
por un solo gen.
Leyes de Mendel: redescubiertas 1900
Modelo de la doble hlice del ADN: 1953
Mutaciones hereditarias:
Dominante o recesiva?
Mutaciones recesivas IIevan a un producto gnico
con funcin reducida o con prdida de funcin.
!ara la mayora de los genes, es suficiente el producto
de uno de los alelos (la mitad) para que se lleve a cabo
la funcin normal. !or eso es que la mayora de los
errores innatos del metabolismo son recesivos.
Mutaciones dominantes IIevan a un producto gnico
con ganancia de funcin.
La ganancia de funcin causa fenotipos dominantes
porque la presencia del producto normal no previene
que el producto mutado se "comporte anormalmente.
La adquisicin de una nueva funcin es un evento raro en
enfermedades hereditarias, pero muy comn en cncer
Variabilidad de los genes
Gen Tamao N exones
ARNt 100 pb 2
.globina 1.600 pb 3
colgenoV 31.000 pb 118
Distrofina 2.400.000 pb 79
Genes dentro de genes:
Ej: el intrn 27 del gen NF1 contiene 3 genes
Genes que se sobreponen:
Ej: algunos genes mitocondriales
!roteoma
Es el set de genes que codifican para protenas
Distribucin por su funcin en eI GH:
!rocesos ADN (replic, trans, trad.) 22%
Metabolismo 17%
Divisin celular 12%
Defensa 12%
Regulacin y seales 12%
Estructura 8%
Funcin desconocida 17%