Efecto de un gene sobre un rasgo 

cuantitativo

Modelo teórico y datos

   
 Efecto de un solo gene
• Genotipos para un gene 
– distribuciones fenotípicas diferenciables para 
rasgo cuantitativo

• Representan genes principales para rasgo 
cuantitativo

• Permiten entender modelo general de efectos 
de un gene sobre un rasgo cuantitativo
   
 Gene “pigmeo” en ratones

Genotipos
++ +pg pgpg
Peso en gramos
14 12 6
a las 6 semanas

   
   
 Gráfico general de la actividad de la fosfatasa ácida

   
 Gene para serotonina y enfermedades mentales

   
 Diferentes posibilidades para la distribución 
fenotípica para los genotipos de un gene

Niveles de 
colesterol en 
poblaciones 
fenilcetonuria
con variación en 
el receptor LDL

   
 A2A2 A1A2 A1A1

-a 0 +d +a

Ejemplo gene “pigmeo”
pgpg +pg ++

-a 0 +d +a
6 grs                                 10 grs    12 grs                        14 grs

a= 4, d=2

   
 Valor Genotípico

0                        1                        2
Número de copias del alelo

   
 Promedio de la población ?

Genotipo Frecuencia Valor fenotípico 

(fi) (xi) xifi
A1A1 p2 +a p2a

A1A2 2pq d 2pqd

A2A2 q2 ­a q2a

Suma=         a(p­q)+2pqd

  M =∑ai ( p −
  q) +2∑d i pi qi
i i
 El efecto de un gene depende de las diferencias entre los 
genotipos y de su heterocigosidad

En el caso del gene pigmeo, a=4, d=2
En el caso de una población donde la frecuencia (q) del gene pg es 0.1

M= a(p­q)+2dpq = 4(0.9­0.1)+2(2)(0.9)(0.1)=3.56,  10+3.56=13,56
α=a+d(q­p)= 4+2(0.1­0.9)= 2.4

En el caso de una población donde q=0.4
M=1.76, 10+1.76=11.76
α=3.6

   
 Componentes de varianza en función de las frecuencias 
génicas y valores genotípicos

   
 Efecto de un gene dentro de una complejo 
fenotípico: el caso del nivel de colesterol sanguíneo

   
 Efectos promedios sobre el colesterol de 
diferentes alelos de apo­E

   
 Componentes de varianza debido a diferentes genes de la red 
de transporte de colesterol

   
 Efecto Promedio
• ¿Cómo se transmiten valores fenotípicos de 
padres a hijos?

• Padres transmiten alelos
– Valor genotípico no es útil
– Se usa Valor Reproductivo

   
 Valor Reproductivo
• “Breeding Value”
– Valor según alelos heredados

• Efecto promedio:
“Efecto promedio de un alelo es la desviación 
promedio de los individiuos que reciben ese 
alelo de un padre y otro alelo al azar”

   
Padre Hijos M Efecto 
Promedio αi
A1A1 pa + qd a(p­q)+2dpq  q[ a + d(q­p)]

A2A2 pd ­ qa a(p­q)+2dpq ­p[ a + d(q­p)]

   
 Efecto promedio de un Gen

α = α1 − α 2 = a + d ( q − p )

α1 = qα

α 2 = − pα

   
 Valor Genotípico

0                        1                        2
Número de copias del alelo 
(N)
   
 Efecto promedio por regresión

Gij = µ + αΝ − δ ij

cov(G; N )
α = bGN =
σΝ2

cov(G; N ) = E (GN ) − µ Ν µG

 
s = E ( N ) −  µ
2
N
2 2
N
 Genotipo Frecuecia G N GN N2
A1A1 p2 a 2 2a 4
A1A2 2pq d 1 d 1
A2A2 Q2 ­a 0 0 0

µN =
µG =a ( p −q ) +2dpq
E (GN ) =
E(N 2 ) =
σN2 =E ( N 2 ) −µN2 =
cov(G; N ) =
cov(G; N )
b =α=
  σN
2  
   
Para dos alelos
Gij = µG + α1 N1 + α 2 N 2 − δ ij
E (Gij ) = E ( µG ) + E (α1 N1 ) + E (α 2 N 2 ) − E (δ ij )

µ G = µ G + α 1 E ( N1 ) + α 2 E ( N 2 ) − 0 |
n
0 = α1 p + α 2 q

α = α1 − α 2 ∧ p + q = 1
∴
α 1 = qα
α  2 = − pα  
 Valor Reproductivo
• Efecto o valor promedio de los alelos 
paternos que determinan el valor genotípico 
de progenie
• Valor asignado a padre por promedio 
fenotípico de su progenie
2[E(xo) – µ]

• Suma de efectos aditivos de sus genes
   
 A1A1 = 2α1 = 2qα

A1A 2 = (α1 + α 2 ) = (q − p )α

A 2 A 2 = 2α 2 = −2 pα
   
 Valor Genotípico 2qα

a
d
(q­p)α
α
­2pα
­a

0                        1                        2
Número de copias del alelo 
(N)
   
 Extensión múltiples alelos
• Para cada alelo Ai se  n
puede definir un efecto  α i = ∑ p j Gij − µG
promedio αi j =1

• Los Valores 
reproductivos de cada  Gij son valores de cada 
genotipo, son  genotipo sin transformar
simplemente la suma 
de los αi
   
 Ejercicio
Apolipoproteína 22 23 24 33 34 44
sColesterol  184.4 164.5 207.6 184.3 189.5 192.4
(mg/dL)
N 6 54 5 355 128 15

Calcule:  pi ; µG ; αi  ;  Ai

   
 Valor Reproductivo
 (Breeding Value)
• Valor reproductivo se simboliza por A
• Dado en términos de desviación del promedio
• A:  valor esperado según regresión entre G y N.
– Valor que se espera por sustitución alélica
• Si HWE:   E(A) = 0
• A:  genotipo aditivo
– Ganancia en alelos sin dominancia
• Var(A) es varianza aditiva

    Calcule A para: ++; +pg;  pgpg 
si p=0.4
 Desviación por Dominancia
• Dominancia complica postulados
• Se relaciona con actividad enzimática
– Cantidad de producto
• Mutaciones de gran efecto son negativas
• Silvestre domina siempre
• Más pequeña mutación, menor será nivel de dominancia

   
 Dominancia
• G = A + D

• D = G – A 

• Regresión b(G;N), dominancia es error

• Cálculo requiere que G se transforme a 
desviaciones del promedio:
– Pizarra!
   
 Desviación por Dominancia

A1A1 = −2q d2

A1A 2 = 2 pqd

A 2 A 2 = −2 p d2

   
 Valor Genotípico

d a
2pqd

­2p2d
­a

0                        1                        2
Número de copias del alelo 
(N)