ULBRA Gravata Biologia

Organizao dos genomas e regulao da expresso gnica

Profa. Ana Paula Magalhes Leboute

PROCARIOTOS e EUCARIOTOS

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE PROCARIOTOS

Ausncia de um complemento diplide de genes; DNA circular

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE PROCARIOTOS

Uso de quase todo o genoma na codificao e na regulao (superposio) ;

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE PROCARIOTOS

Colinearidade dos genes e seus produtos proticos ;

A partir da sequncia de
DNA pode-se ter a ordem dos aminocidos diretamente devido a ausncia de introns.

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE PROCARIOTOS

Tendncia de apresentar genes codificando funes relacionadas agrupados (operons) ;

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE PROCARIOTOS

Existncia de unidades genticas (plasmdios, bacterifagos e transposons).

acessrias

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE EUCARIOTOS
Cromossomos eucariticos so lineares e apresentam complemento diplide (excees so as leveduras e alguns fungos que apresentam fases haploides em seus ciclos de vida e alguns vegetais que so poliploides)

CARACTERSTICAS DE GENOMAS
DE EUCARIOTOS
Presena de sequncias codificadoras (introns). intervenientes no

Procariotos X Eucariotos
PROCARIOTOS DNA circular no associado a protenas DNA e mRNA so colineares genes arranjados sequencialmente no DNA maioria policistrnico transcrio no est fisicamente separada da traduo (simultnea) resposta direta as variaes ambientais EUCARIOTOS DNA linear associado com protenas (histonas) DNA e mRNA no so colineares genes contendo exons (codificantes) e introns (regies no codificantes) maioria monoscistrnico transcrio (ncleo) est fisicamente separada da traduo protica (citoplasma)

Limitaes na resposta direta (complexidade de organizao celular)

Regulao da expresso gnica em procariotos

Microrganismos possuem uma marcante capacidade em se adaptar a diversas condies experimentais. Capacidade de LIGAR (induo) e DESLIGAR (represso) a expresso de conjuntos especficos de genes em respostas a mudanas no ambiente.

Regulao da expresso gnica em procariotos

E. coli resposta rpida a mudanas ambientais Por exemplo, se um aminocido est ausente no meio, ela produz as enzimas necessrias para produzi-lo. Oportunistas nutricionais!

Regulao da expresso gnica em procariotos

A regulao da expresso gnica em nvel transcricional controlada por protenas reguladoras;

Estrutura do Operon

Estrutura do operon

Operon
As molculas efetoras controlam a
habilidade das protenas ativadora ou

repressora em se ligar ao DNA.

Operon indutvel

Operon repressvel

Operon indutvel

Operon desligado na
ausncia de molcula efetora (indutor)

Operon repressvel

Operon ligado na ausncia de molcula efetora (co-repressor)

Regulao positiva e negativa

Operon Lac
Jacob Franois Jacob e Jacques Monod, 1961- regulao da transcrio metabolismo da lactose em E.coli

Bactria em ambiente com lactose dever LIGAR genes que codificam enzimas para degradao da lactose

Enzimas que degradam a lactosegenes estruturais

-galactosidase (gene z): enzima que cataliza a hidrlise da lactose em glicose e galactose; Lactose permease (gene y): permite que a lactose do meio extra celular seja transportada para o interior da clula bacteriana. Transacetilase (gene a): papel fisiolgico indefinido
Genes transcritos ao mesmo tempo: Policistrnico: um nico RNAm expresso conjunta

Operon Lac regulao negativa

Gene repressor: Lac I codifica a protena repressora Regio do promotor: liga-se RNA polimerase Regio do operador: liga-se a molcula repressora

Lactose presente

Ausncia de Lactose

Repressor liga-se ao operador

OPERON est reprimido (1000x a transcrio)

RNA pol no pode transcrever os genes, mesmo se ligando ao promotor

Operon Lac represso catablica

Presena de glicose impede a induo do Operon Lac
Glicose usada preferencialmente como fonte de energia! A clula capta mais energia da degradao da glicose do que de outros acares. Mediada por uma protena reguladora CAP e molcula efetora cAMP;

 A concentrao intracelular de cAMP sensvel presena ou ausncia de glicose ( glicose cAMP). O cAMP liga-se CAP e estimula a ligao ao DNA. A CAP interage com a subunidade da RNA-pol., facilitando a ligao da enzima ao promotor, ativando a transcrio (ativa o operon).

Operon Lac - sem glicose

Ligao da CAP na ausncia de glicose aumenta em 50X a transcrio do operon Lac

Operon Lac
A induo do operon Lac requer os dois processos:

a presena de lactose (o indutor) inativa o repressor

a ausncia de glicose para aumentar a concentrao de

cAMP e permitir a ligao da protena CAP no DNA.
CAP um elemento regulador positivo, que responde aos nveis de glicose Repressor Lac um elemento regulador negativo, que responde aos nveis de lactose

Operon Triptofano
Os cinco genes que codificam as enzimas que sintetizam o triptofano esto dispostos em um nico operon;

Um repressor controla a sntese de TRP.

Operon do triptofano controle negativo

repressor inativo repressor ativo

Operon do triptofano controle negativo

Regulao da Expresso Gnica

Como uma nica clula fecundada pode originar um organismo complexo?

Diferenciao celular -produz tecidos especializados para determinadas tarefas

Regulao da Expresso Gnica

As clulas somticas de um organismo multicelular, geralmente, contm o mesmo DNA genmico; Como so to diferentes ?

Neurnio

Linfcito

Clulas Tronco
So clulas pluripotentes, relativamente indiferenciadas, que podem continuar se dividindo e/ou sofrer processos de diferenciao para originar tecidos especficos.
Obteno de um organismo a partir de uma clula somtica

Clulas Tronco
Retirada do ncleo de uma clula da glndula mamria e fundido a um vulo sem ncleo.

Clulas Tronco
Clulas tronco embrionrias

Totipotentes ou pluripotentes Podem se diferenciar em qualquer tecido

Clulas tronco adultas

Encontradas em diversos tecidos Capacidade de diferenciao limitada

Em plantas as clulas so totipotentes

Totipotncia: atributo da clula de se dividir e desenvolver uma estrutura nova e diferenciada ou um organismo complexo

Pontos de controle da expresso gnica em eucariotos

Separao fsica dos eventos de expresso gnica possibilita a regulao no ncleo (DNA e RNA) e no citoplasma (RNA e polipeptdeo)

Inclui disponibilidade do DNA

Adio do cap na extremidade 5 e cauda poliA na 3, remoo de ntrons

O DNA eucaritico est organizado na estrutura da cromatina

Acetilao do DNA

Metilao do DNA
Citosina metilao em citosinas adjacentes a guaninas: ilhas CpG O DNA metilado inibe a transcrio A metilao tambm est associada regulao a longo prazo inativao do cromossomo X

Regulao da expresso gnica

Genes estruturais: codificam protenas usadas no metabolismo, biossntese ou estrutura da clula. Genes de expresso regulada: expressos em resposta a sinais da clula.

Reprimveis Induzveis

Genes reguladores: codificam protenas ou RNA que interagem com outras seqncias de DNA e afetam sua transcrio ou traduo. Elementos reguladores: no so transcritos mas afetam a expresso das seqncias s quais esto ligados.

Controle transcricional
Regulao complexa: RNApol precisa de um conjunto de protenas (FATORES GERAIS DA TRANSCRIO) para iniciar a transcrio.

TFIID reconhece a seq TATABOX (stio promotor) e se liga recruta outros fatores de transcrio para formar o complexo RNApol II liberada para o incio da transcrio

Promotor

Elementos do promotor

Regulao da transcrio

Elementos de regulao transcricional

Promotor Acentuadores ou Realadores Fatores gerais de transcrio (TF)

Protenas de ligao ao DNA

Protenas reguladoras tm domnios de ligao ao DNA, os quais possuem de 60 a 90 aminocidos. Alguns aminocidos desses domnios formam pontes de hidrognio com as bases ou interagem com o acar-fosfato. Reconhecem seqncias de bases sem abrir a dupla fita do DNA.

Fatores de transcrio se ligam ao DNA

Dentro do domnio existem estruturas caractersticas chamadas motivos

Acentuadores
Servem como stios especficos de ligao de prot. regulatrias que ativam ou aumentam a taxa de trascrio. Entre o promotor e o acentuador forma-se de uma ala, de forma que protenas ligadas ao realador interajam diretamente com FGT e a RNA-pol.

Acentuadores

So seqncias nucleotdicas nas quais ligam diferentes protenas reguladoras Atuam distncia dos genes que regulam Ao independente da posio e orientao no DNA

Caractersticas:

Protenas regulatrias distantes

Controle no processamento do RNA

Adio de cap 7 metilguanosina na extremidade 5` Poliadenilao da extremidade 3 Retirada do ntrons

Processamento alternativo do RNAm

Processamento alternativo do RNAm

Diferentes combinaes de stios 5e 3RNA Diferentes combinaes de exons Diferentes protenas do mesmo pr-RNAm

Degradao do RNA
Longevidade do RNAm influenciada:

Tamanho da cauda poli-A Quanto maior mais estvel Estrutura da regio 3UTR Seqncias AUUUA levam a instabilidade do RNA

Silenciamento do mRNA
Os RNAs de interferncia levam a degradao do mRNA e a metilao do DNA, que afeta a transcrio

Silenciamento do mRNA