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Compte Rendu 

:
Dot Plot et Programmation dynamique :
Aller sur EMBOSS Explore et regarder les différents logiciels qui sont mis à disposition
(mode simple/avancé, manuel, options, ...). Préparer votre navigateur pour l'utilisation de ces
3 logiciels :
 EMBOSS DOTPATH : permet de dessiner un dotplot avec une taille de fenêtre fixée
(param.=window size)

 EMBOSS Matcher : pour l'alignement local.


 EMBOSS stretcher : pour l'alignement global

Introns / exons :
 Allignement des séquences nucléiques xl-actin-DNA.fa et xl-actin-mRNA.fa par le logiciel
Dotpath

 Allignement globale des séquences nucléiques xl-actin-DNA.fa et xl-actin-mRNA.fa par le


logiciel stretcher en fixant comme pénalité d'ouverture de gap 12 et comme pénalité
d'extension de gap 1.

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