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Virologie
étude des virus et des agents
infectieux associés

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La virologie est la discipline scientifique s'attachant à l'étude, l'utilisation et la lutte contre les
virus et agents infectieux assimilés (viroïde, etc). La virologie est généralement considérée
comme une branche de la biologie (microbiologie, agronomie en particulier pour créer des
organismes génétiquement modifiés, évolution des espèces) ou de la médecine (pathologie,
thérapie génique, autres thérapies innovantes basées sur les virus (cancérologie, contrôle du
microbiote, etc)).

Dans un laboratoire de virologie (CHU de Rouen).

:
 Dans ce domaines, les recherches menées servent particulièrement :

à explorer pour un virus donné : sa structure et sa composition, les mécanismes lui permettant
d'infecter un hôte, quel est son tropisme, et sa position dans la classification des virus.

à décrire les maladies virales ainsi que retracer l'évolution des virus, notamment quand une
espèce virale mute ou change d'hôte.

à mettre à profit des techniques pour les isoler et les cultiver, dans une optique d'usages en
recherche et en thérapie.

Domaines étudiées par les virologues

la réplication virale

les pathologies virales

l'immunité antivirale

les vaccins viraux

les méthodes de diagnostic

la virothérapie et la phagothérapie

les mesures de contrôle d'une infection

les différents signes de manifestation du virus

Structure et classification des virus

Les virus ont une taille variant de 30 à 450 nm environ, ce qui implique que la plupart d'entre eux
ne puissent pas être observés par un microscope photonique. La forme et la structure des virus
peut cependant être étudiée en microscopie électronique, en spectroscopie de résonance
magnétique nucléaire, et, de façon très courante, par cristallographie aux rayons X.

Un courant majeur de la virologie se charge de classer les virus. Les virus peuvent être classés
selon le type de cellule hôte qu'ils infectent: zoovirus (cellule animale), phytovirus (cellule
végétale), fongivirus (cellule de champignon), et bactériophage (virus infectant des bactéries,
catégorie comprenant les virus les plus complexes). Une autre classification s'appuie sur la
forme géométrique de leur capside (souvent une hélice ou un icosaèdre) ou sur la structure du
virus (présence ou absence d'une enveloppe lipidique par exemple). Le système de classification
le plus largement utilisé distingue les virus selon le type d'acide nucléique qu'ils utilisent comme
matériel génétique et la méthode de réplication qu'ils emploient pour pousser la cellule hôte à
produire de nouvelles particules virales. On distingue:
:
 les virus à ADN (subdivisés en virus à ADN double brin, et les moins courants virus à ADN
simple brin) ;

les virus à ARN (subdivisés en virus à ARN simple brin à polarité positive, virus à ARN simple
brin à polarité négative, rétrovirus, et les moins courants virus à ARN double brin).

Et aussi :

la biologie moléculaire

des virus bactériophages

Techniques de virologie

Comme toute discipline scientifique, la virologie utilise des techniques communes à d'autres
domaines, comme la culture cellulaire, mais aussi des techniques spécifiques à la virologie.

Techniques appliquées aux cellules

…
Les lignées cellulaires sont aujourd'hui largement utilisées pour effectuer des tests de criblage,
ou pour obtenir des résultats préliminaires[1].

Titrage viral
…
Le titrage viral est une technique permettant de déterminer la concentration d'un virus dans un
milieu donné. Deux méthodes existent : la méthode des plages de lyse, et la méthode du DICT50
(équivalent de l'IC50 pour les produits toxiques). Dans les deux cas, le principe général est de
diluer en série une suspension de virus, et de l'administrer à des cultures cellulaires[2]. Après un
temps d'incubation variable, l'observation de cellules lysées par le virus (=plages de lyse), ou de
cellules modifiées par l'infection (=effet cytopathique) permet de quantifier les virus. Cette
méthode ne permet cependant pas de quantifier les virus non-infectieux présents.

Test d'activité antivirale

…
Cette méthode permet de vérifier si une molécule a, ou non, des propriétés antivirales. Le
produit à tester est administré aux cellules, ainsi que le virus. L'observation d'un effet
cytopathique, d'une mortalité cellulaire, ou de marqueurs viraux est ensuite utilisée pour évaluer
l'efficacité de la molécule.

Techniques de biologie moléculaire

…
Les techniques de biologie moléculaire utilisées en virologie sont générales aux autres
domaines. Les principales techniques sont la PCR, la RT-PCR et la PCR quantitative.

L'apport de la bioinformatique
…
:
 Les virus étant difficilement observables à cause de leur petite taille, la bio-informatique est de
plus en plus utilisée pour des mesures prédictives, notamment en ce qui concerne les
changements de conformation des virus[3].

Histoire

1898 : Découverte du virus de la mosaïque du tabac, alors nommé Contagium vivum fluidum

1898 à 1901 : Découvertes de premiers virus impliqués dans des zoonoses et maladies
humaines (fièvre aphteuse, fièvre jaune)

1917 : Premières découvertes de virus dits bactériophages (infectant des bactéries)

1931 : Première découverte d'un virus oncogène (induisant le cancer chez le poulet)

1939 : Première photographie au microscope électronique d'un virus

1957 : Définition « classique » des virus par Lwoff[4]

1983 : Identification du VIH, rétrovirus responsable du SIDA

1989 : Première évaluation du nombre des virus marins (4 à 10 millions dans chaque 1 ml
d'eau)

2003 : Première découverte d'un virus géant (le Mimivirus, dont le génome sera séquencé en
2004)

2008 : Découverte d'un virus encore plus gros, le Mamavirus, et découverte d'un virus
« virophage » capable d'infecter un autre virus

2013 : Découverte de deux espèces de Pandoravirus[5],[6]

Notes et références

1. Elsevier Masson, « Culture cellulaire et virologie. Intérêts et applications de la culture

cellulaire en virologie » (http://www.em-consulte.com/article/263914/culture-cellulaire-et-
virologie-interets-et-applic)  [archive], sur EM-Consulte (consulté le 27 mars 2018)

2. J. B. Brooksby et E. Wardle, « Titration of the virus of foot-and-mouth disease in culture »,

The Journal of Hygiene, vol. 52, no 1, mars 1954, p. 87–99 (ISSN 0022-1724 (https://www.w
orldcat.org/issn/0022-1724&lang=fr) ,
PMID 13152368 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/13152368) ,
PMCID PMC2217709 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2217709) , lire en
ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/13152368)  [archive], consulté le
27 mars 2018)

3. V. S. Reddy, H. A. Giesing, R. T. Morton et A. Kumar, « Energetics of quasiequivalence:

computational analysis of protein-protein interactions in icosahedral viruses », Biophysical
Journal, vol. 74, no 1, janvier 1998, p. 546–558 (ISSN 0006-3495 (https://www.worldcat.org
:
 /issn/0006-3495&lang=fr) ,
PMID 9449355 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9449355) ,
PMCID PMC1299407 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1299407) ,
DOI 10.1016/S0006-3495(98)77813-0 (https://dx.doi.org/10.1016/S0006-3495%2898%2977813-0)
, lire en ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9449355)  [archive], consulté le
27 mars 2018)

4. (en) André Lwoff, « The Concept of Virus », Journal of General Microbiology, vol. 17, no 2,
octobre 1957, p. 239-253
(DOI 10.1099/00221287-17-2-239 (https://dx.doi.org/10.1099/00221287-17-2-239) )

5. (en) Philippe N, Legendre M, Doutre G, Couté Y, Poirot O, Lescot M, Arslan D, Seltzer V,

Bertaux L, Bruley C, Garin J, Claverie JM, Abergel C., « Pandoraviruses: amoeba viruses
with genomes up to 2.5 Mb reaching that of parasitic eukaryotes », Science, vol. 341,
no 6143, 19 juillet 2013, p. 281-6.
(PMID 23869018 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23869018) ,
DOI 10.1126/science.1239181 (https://dx.doi.org/10.1126/science.1239181) , résumé (http:/
/www.sciencemag.org/content/341/6143/281.abstract)  [archive])

6. Pandoravirus : découverte d’un chaînon manquant entre le monde viral et le monde

cellulaire (http://www.cea.fr/le-cea/actualites/pandoravirus-114119)  [archive], article sur
le site du CEA, daté du 19 juillet 2013.

Voir aussi

Articles connexes
…
Virus

Pathogène

Interactions durables

épidémiologie, écoépidémiologie

aérobiologie

Virologie médicale

Antiviraux

Liste de maladies virales

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