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OBJET: SYNTHESE DES PROTEINES

NIVEAU DTUDE: 1S

Du gnotype au phnotype
Comment passer dune suite dacides nucliques (ADN) une squence dacides amins: la synthse des protines
Les nuclotides qui composent lADN dirent par la nature des bases (Adnine -A-, cytosine -C-, thymine -T-, guanine -G-) qui entrent dans leur composition. Un gne correspond donc physiquement une squence de nuclotides. Nous avons vu que l'on peut associer un gne une protine, autrement dit, une squence (une suite) d'acides nucliques une squence d'acides amins. Mais comment s'eectue ce transfert d'information entre l'ordre nuclotidique et l'ordre protique ?
Pr. Dr. R. Raynal

Documentation
consulter avec prot
Les animations de lOpen University sur Itunes U (en particulier Transcription: writing the message et Translation: reading the message)
Le cours de lOpen University (do certaines illustrations de ce rsum sont tires) votre cours de seconde sur lADN le cours prcdent (Des phnotypes divers peuvent sexprimer des chelles direntes) Votre cour de troisime sur la gntique. (Vous ne lavez plus ? voir alors le manuel) Le site du NCCR frontiers in genetics (en franais malgr ce titre) Les animations du capitaine Kyrk.

Plan
1.

Une squence de nuclotides de l'ADN est transcrite en une squence d'un autre nuclotide plus petit et plus mobile, l'ARN

L'enzyme ARN polymrase droule localement l'ADN et en recopie un brin. Dans l'ARN, La thymine est remplace par l'uracile L'ARN fabriqu est le messager de l'ADN

2.

La squence de l'ARNm est traduite en suite d'acides amins par les ribosomes, ce qui implique l'existence d'un code gntique pour faire correspondre un acide amin une courte squence dARN

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1- La squence de nuclotides dun morceau dADN est transcrite en une squence d'un autre nuclotide plus petit et plus mobile, l'ARN
11 Une enzyme, l ARN polymrase, droule localement l'ADN et en recopie un brin.

Chez les eucaryotes, l'ADN est situ dans le noyau, et il y reste. Pour que linformation quil contient puisse tre transmise dans le reste de la cellule, elle doit tre recopie. Cest le rle de l'ARN polymrase (RNA pol pour les intimes), qui agit de la faon suivante: - droulement d'une rgion de l'ADN correspondant un gne. Chaque brin de lhlice dADN se spare alors. - recopiage d'un brin de l'ADN, que l'on appelle le brin transcrit, par assemblage de nuclotides complmentaires (voir 1.2). - remise en tat "enroul" de la molcule d'ADN (on est pri de laisser lADN dans ltat o on la trouv en arrivant) 12 Dans l'ARN, La thymine est remplace par l'uracile

Lorsque le brin transcrit dADN est recopi, lenzyme RNApol associe aux nuclotides de ce brin: - de la guanine de la cytosine (C/ADN--> G /ARN) - de la cytosine la guanine (G /ADN--> C/ARN) - de l'adnine la thymine (T/ADN--> A /ARN) - un nuclotide chimiquement voisin de la thymine, l'Uracile, l'adnine. (A /ADN --> U /ARN) Contrairement lADN, lARN ne contient donc pas de Thymine! Une squence ADN comme ..................... devient donc, une fois transcrite en ARN:
Jeux des sept erreurs: luracile gauche, la thymine droite: les diffrences sautent aux yeux, non? (vous navez pas connatre ces formules, ouf!)

ATTCGTTAA UAAGCAAUU.

Sur la BD de la page suivante, qui rsume ce processus, lenzyme RNA polymrase na pas t reprsente, car elle couvrirait une grande partie de limage!
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Images Open university

L'ADN se droule...

L'ARN se forme par copie du brin (remarquez Des nuclotides se lient au brin transcrit l'uracile, en rose)

Une fois form, l'ARN se dtache...

En route vers le cytoplasme !

Et l'ADN se renroule.

L'ARN messager est libre !

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13 L'ARN fabriqu est le messager de l'ADN

L'ARN* est une molcule constitue d'un seul brin de nuclotides. Bien plus court que l'ADN (sa longueur correspond peu prs un gne), il est mobile dans la cellule. Il va donc pouvoir transporter l'information gntique qu'il a recopie: on l'appelle donc ARN messager (ARNm en France, mRNA dans le reste du monde). Les ARNm traversent l'enveloppe nuclaire (qui limite le noyau cellulaire) au niveau de pores et exportent ainsi l'information gntique vers le cytoplasme, lieu de fabrication (synthse) des protines de la cellule.
* ARN = Acide Ribo Nuclique, car, contrairement lADN, le sucre qui entre dans la composition de ses nuclotides est du Ribose, et non pas du Dsoxyribose comme dans lADN.

2 - La squence de l'ARNm est traduite en suite d'acides amins par les ribosomes, ce qui implique l'existence d'un "code gntique"
21 La traduction de l'ARNm en protine ncessite un code faisant correspondre nuclotides et acides amins

ADN et l'ARN sont des molcules portant une information constitue par une squence de nuclotides: il y a 4 bases diffrentes. Les protines portent aussi une information, mais avec un "alphabet" vingt lettres (20 Acides amins diffrents). Le systme de correspondance entre ARNm et acides amins est le code gntique. Dans ce code, trois nuclotides, qui forment un codon, dterminent un acide amin. Comme certains AA peuvent tre "cods" par plusieurs codons diffrents, on dit que le code est redondant: toute mutation n'aura donc pas forcment de consquence sur la structure de la protine. 22 Les codons de l'ARNm sont lus par des organites complexes, les ribosomes

L'assemblage des AA dans le cytoplasme est localis au niveau d'organites cellulaires, les ribosomes qui ralisent la traduction de l'information gntique porte par les ARN messagers en squences ordonnes d'acides amins caractristiques d'une protine. Dans la BD suivante, les ribosomes nont pas t reprsents, car ils recouvriraient
lensemble du site. Ils contiennent et xent les ARN de transfert.
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une suite de 3 nuclotides de l'ARN m constitue un codon.

Un ARN de transfert portant l'acide amin... correspondant ce codon se lie celui ci.

Un autre ARN t...

Apporte un autre AA (ici la proline)..

Les 2 AA se lient chimiquement...

Formant le dbut d'une protine.

le premier ARN t se spare de son AA et se dtache de l'ARN m.

La protine s'allonge ainsi, AA aprs AA, au fil de la lecture des codons...

Elle sera "termine" lorsque qu'un codon "Stop" interrompra l'allongement de la chane d'acides amines.

Les ARN de transfert, petites molcules d'ARN, font le lien entre codons et AA, positionnent les AA dans le ribosome et permettent, l'aide
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d'enzymes et d'nergie, leur liaison dans une chane polypeptidique: une protine est ne. La traduction de l'ARNm en polypeptide demande: - un signal de dpart = codon d'initiation - une suite de codons correspondant la squence de la protine fabriquer - un signal de n = codon-stop. Le polypeptide obtenu est libr dans le rticulum endoplasmique granuleux (eucaryotes) ou dans le cytoplasme (procaryotes).
Le schma suivant (ralis par Guillaume Bokiau) rsume lensemble du processus.

LADN (double brin) voit un de ses brins tre transcrit en ARN par une enzyme, lARN polymrase. LARN obtenu, dit messager, se dplace vers le cytoplasme o il rencontre des ribosomes qui vont procder sa traduction en protines. Pour cela, chaque triplet de bases de lARN, constituant un codon, est associ un ARN particulier, lARN de transfert, qui est li un acide amin correspondant donc, en fait, au codon de lARN. Dans le ribosome, les acides amins successifs, positionns progressivement selon lordre dcrit par la suite des codons, sont lis entre eux pour former une chane: la protine code par lADN via lARN messager.
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Vocabulaire
ARN de transfert

Dnition : Petite molcule dARN permettant le transfert de linformation entre un ensemble de trois nuclotides, le codon, et un acide amin. Contexte : Un ARNt est une molcule portant la fois un anticodon, ensemble de trois nuclotides se xant sur son codon, et lacide amin correspondant ce codon. Les ARNt deviennent fonctionnels lintrieur dun organite, le ribosome. Il existe autant dARNt dirents quil existe dacides amins dirents, soit une vingtaine.
Codon

Dnition : Suite de trois nuclotides sur lARN. Chaque codon correspond un acide amin. Comme il existe 4 nuclotides, il existe 64 codons dirents, mais seulement 20 acides amins: certains codons dirents correspondent donc au mme acide amin (ainsi, lAA Leucine est cod par 6 codons alors quun seul correspond lAA tryptophane). Particularits Certains codons ne sassocient pas seulement un acide amin: ce sont des repres pour les ribosomes. Ainsi, le codon UGA est un codon stop qui interrompt la fabrication des protines. Un autre permet de commencer une protine (le codon dinitiation AUG).
Mutation

Dnition : Modication accidentelle dun ou plusieurs nuclotides dun ADN ou ARN, et amenant ainsi la fabrication dune protine incorrecte (pouvant ventuellement tre lorigine dun caractre nouveau, quil soit nocif, neutre ou bnque pour lindividu).
Nuclotide

Dnition: Molcule constituant lunit de base des acides nucliques comme lADN (appel DNA partout ailleurs dans le monde) et lARN. Rappel : 1 nuclotide = phosphate + un sucre + une base ( choisir parmi Adnine, Thymine, Cytosine et Guanine pour lADN, et rajoutons prsent la thymine de lARN)
Protine

Dnition: Molcule forme de l'enchanement daides amins. Les enzymes et les anticorps sont deux familles de molcules, que vous connaissez qui sont en fait des protines.
Ribosome

Dnition : Organite cellulaire spcialis dans la fabrication des protines, quil ralise en lisant les molcules dARNm. Dans le ribosome, mobile sur lARNm, se ralise lensemble du processus xation sur le codon/accrochage de son AA un autre acide amin/libration de lAA et dtachement de lARNm . Le ribosome, vritable tte de lecture de lARNm, positionne 2 ARNt en mme temps sur lARNm et joue un rle denzyme pour plusieurs ractions chimiques. Une cellule contient de nombreux ribosomes. Schma G. Bokiau, Wikimedia.
Squence

Dnition: Suite dlments, lesquels se succdent dans un ordre prcis Contexte: Cette ide a t rencontre en seconde lors de ltude de lADN: la suite des nuclotides constitue une squence qui correspond en fait une information. La squence dune protine, suite dacides amins, est aussi une information qui agit directement sur la forme, et donc sur les proprits, de la protine.
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