Alex Rider apprend que son oncle, Ian Rider, a été tué dans un accident de voiture.

À l'insu
d'Alex et de sa gouvernante, Jack Starbright, la position d'Ian en tant que "banquier" était en fait
une couverture pour son rôle d'agent du MI6. Alex devient méfiant lorsqu'on lui dit que Ian ne
portait pas sa ceinture de sécurité et découvre que le bureau de Ian a été vidé. Il trouve la voiture
de son oncle dans un chantier de démolition et découvre que son oncle a été assassiné. Après
s'être presque échappé d'un broyeur de voiture, Alex est invité à rendre visite aux anciens
employeurs de Ian, une banque appelée "Royal & General". Il fait irruption dans le bureau de Ian,
découvrant la preuve de la double vie de son oncle avant qu'il ne soit assommé.
Au réveil, Alex rencontre le chef du MI6 Alan Blunt et son adjoint, Mme Jones. Ils révèlent la
vérité sur la carrière de son oncle et expliquent qu'ils ont envoyé Ian enquêter sur Herod Sayle,
un riche homme d'affaires Libanais qui a développé un nouvel ordinateur révolutionnaire, le
Stormbreaker. Sayle prévoit de donner un Stormbreaker gratuit à chaque école secondaire
du Royaume-Uni, accompagné d'une grande cérémonie d'activation au Science Museum , soi-
disant en guise de remerciement pour le pays qui l'a accueilli lorsqu'il était enfant. Dans sa
dernière communication avec eux, Ian avait averti le MI6 que les Stormbreakers ne pouvaient
pas être autorisés à quitter l'usine de fabrication de Sayle, mais avant qu'il ne puisse s'expliquer,
il a été assassiné par Yassen Gregorovich, un tueur professionnel apparemment employé par
Sayle, à son retour à Londres .
Dans l'intention de l'utiliser pour enquêter secrètement sur Sayle, le MI6 recrute Alex en le faisant
chanter ; s'il ne coopère pas, Jack sera déporté en Amérique, sa maison sera vendue et il
quittera son école et ses amis pour une académie jusqu'à sa majorité. Ils lui ont fait suivre un
programme de formation SAS épuisant, avant de le déployer sur la base d'Hérod Sayle
en Cornouailles, en utilisant le pseudonyme d'un autre garçon, Felix Lester, qui a remporté un
concours pour visiter l'usine et être le premier enfant à utiliser un Stormbreaker. Pour l'aider dans
sa mission, Alex reçoit un grappin déguisé en yo-yo, une crème contre l'acné capable de
dissoudre le métal et une Nintendo Gameboy qui fonctionne comme un émetteur, un écran de
fumée et un détecteur d'insectes, par l'agent du MI6 Smithers.
Quelque temps plus tard Sayle fait visiter à Alex son manoir, qui abrite un grand aquarium de
méduses contenant un géant portugais Man o 'War. Alex rencontre également M. Rictus, un
homme de main dont le nom dérive de son temps en tant qu'artiste de cirque, attrapant des
couteaux avec ses dents. Un accident l'a laissé sans langue et deux grandes cicatrices qui lui
donnent l'apparence d'un sourire constant.
Au départ, le voyage se passe bien, Alex trouvant un schéma cryptique réalisé par son oncle Ian
dans le baldaquin de son lit. Cependant, Sayle commence à détester Alex, après qu'Alex est
découvert dans une zone restreinte de la base, et bat plus tard Sayle dans un jeu de billard. En
enquêtant sur la base la nuit, Alex voit plusieurs agents de Sayle décharger avec grand soin des
caisses métalliques d'un sous-marin nucléaire, sous la supervision de Yassen. Lorsque l'un des
agents laisse tomber une caisse en métal, il est rapidement exécuté par Yassen. Le lendemain
après-midi, Alex se rend à la bibliothèque locale pour faire des recherches plus approfondies,
mais se retrouve attaqué par une paire de gardes armés sur des quads. Il survit en incitant les
gardes à s'écraser : l'un entre en collision avec une clôture électrique tandis que l'autre tombe
d'une falaise.
En cherchant dans la bibliothèque, Alex trouve une carte dans un livre sur l'extraction de l'étain
qui correspond au schéma laissé par Ian. Il apprend également que Ian a emprunté plusieurs
livres sur les virus et suppose que Sayle envisage d'utiliser le réseau Stormbreaker pour libérer
un virus informatique. Alex enquête sur la mine et, suivant le chemin laissé par son oncle,
découvre une grande usine de fabrication d'ordinateurs, où les ordinateurs Stormbreaker sont
remplis d'un fluide étrange. Alex se rend compte que les « virus » étudiés par Ian n'étaient pas
des virus informatiques, mais des armes biologiques. Alex est détecté et s'échappe presque mais
est finalement attrapé et tranquillisé. Quand il revient à lui, Hérod explique à Alex son plan.
Lorsque Sayle est allé à l'école, il a été victime d'intimidation à cause de son accent et de la
couleur de sa peau. Le pire des tyrans n'était autre que le futur Premier ministre, ce qui l'a
conduit à mépriser les enfants anglais en général. En conséquence, Sayle envisage de se
venger du Premier ministre et de la Grande-Bretagne avec sa « blague du poisson d'avril » ;
lorsque les ordinateurs seront activés par le Premier ministre, le virus, une puissante souche de
variole, sera libéré dans chaque école du pays, tuant tous les écoliers et enseignants
d'Angleterre ainsi que ceux d'Écosse, du Pays de Galles et d'Irlande du Nord.
Alex est ensuite menotté à une chaise, jusqu'à ce que Nadia Vole, une assistante de Sayle, le
libère, affirmant qu'elle est une autre espionne qui a travaillé avec Ian rider. Cependant, alors
qu'ils se dirigent vers un téléphone portable pour appeler le MI6 et les informer du plan de Sayle,
elle déclenche une trappe qui laisse tomber Alex dans le réservoir de Méduses et reste derrière
pour le regarder mourir. Alex finit par s'échapper en utilisant le gadget de la crème contre l'acné
pour endommager les poutres en fer du réservoir, provoquant sa rupture et envoyant des milliers
de gallons d'eau s'écraser dans la pièce. Quant à Vole, elle était directement devant le char
lorsqu'il a éclaté, libérant l'immense méduse et la faisant atterrir sur elle, la tuant. Saisissant un
fusil harpon, Alex se précipite dehors pour constater que l'hélicoptère privé de Sayle est déjà
parti, ne laissant qu'un avion cargo sur le tarmac. À l'aide de la poignée du fusil harpon, Alex
assomme un garde, détournant sa jeep et son pistolet. Alors qu'il démarre la jeep, plusieurs
autres jeeps commencent à le poursuivre alors que l'avion cargo commence à décoller. Grâce à
un peu de chance, Alex parvient à provoquer la destruction des jeeps hostiles. Attachant le
cordon en nylon du gadget yo-yo au harpon avec le yo-yo attaché à sa ceinture, Alex tire sur le
harpon qui s'accroche au ventre de l'avion en vol. À l'aide du gadget, il monte dans l'avion où il
affronte le pilote, qui n'est autre que M. Rictus. Alex avertit M. Rictus de s'envoler
pour Londres en le menaçant avec le pistolet.
Lorsqu'ils sont enfin arrivés à Londres, Alex se rend compte qu'il ne reste plus beaucoup de
temps avant midi. Il repère plusieurs parachutes et en utilise un pour sauter de l'avion. M. Rictus
fait demi-tour dans l'espoir de percuter Alex. Alex sort la Game Boy Color et active une cartouche
déguisée en un jeu appelé "Bomber Boy", qui active une bombe fumigène. Incapable de voir, M.
Grin perd le contrôle de l'avion et s'écrase mortellement sur un quai près de la Tamise. Alex
percute le toit du Musée des sciences et pend à son parachute qui s'est accroché à une poutre. Il
sort l'arme qu'il a prise d'un garde au manoir de Sayle et tire aveuglément sur l'ordinateur
Stormbreaker, l'un frappant accidentellement le Premier ministre et Sayle lui-même étant touché
par deux autres, bien qu'il disparaisse inexplicablement. Mme Jones sauve la vie d'Alex en
ordonnant à la sécurité de ne pas ouvrir le feu sur lui. Le MI6 rappelle immédiatement tous les
ordinateurs, citant des "problèmes de sécurité".
Plus tard, après un débriefing par Alan Blunt et Mme Jones, Alex monte dans un taxi. Le
chauffeur n'est autre que Sayle qui tient Alex sous la menace d'une arme. Il conduit Alex au
sommet d'un immeuble où il s'apprête à tirer sur Alex, mais est lui-même tué par Yassen
Gregorovich, qui atterrit dans un hélicoptère. Quand Alex interroge Yassen sur la raison pour
laquelle il a tiré sur Sayle, Yassen explique que Sayle était devenu une source d'embarras pour
les personnes pour lesquelles il (Yassen) travaillait, il a donc dû être éliminé. Sachant qu'il fait
face au tueur de son oncle, Alex dit à Yassen qu'il le tuera un jour, mais Yassen écarte le
commentaire et conseille à Alex d'abandonner l'affaire d'espionnage et de redevenir un écolier
normal, avant de partir dans l'hélicoptère.