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Caractérisation phénotypique et moléculaire d’isolats tunisiens de Salmonella

enterica non typhiques

Article · December 2009

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Rim DRISS Limam

Centre national des Sciences et Technologies Nucléaires
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 H .
91
"

Vol 21 - 0 62 - 12/09

Revue Multilingue

Publiée Pt .
l'A sociation Africaine de MicrabioJogie
er d'Hygiène Alimentaire

Directeur Scientifique Fon

Pro Mongi JEMMALI, Faculté de Médecine Ibn
 Caractérisation phénotypique et moléculaire d’isolats
tunisiens de Salmonella enterica non typhiques

R.Driss1*; A.Kerouanton2; M.Marault2; R.lailler2; R.Debaya1; A.Brisabois2; F.Thabti1; T.Karoui1; A.Ben

Hassen3; S.Hammami1
1
Institut de Recherche Vétérinaire de Tunisie (IRVT) ; 20 rue Djebel Lakdhar, La Rabta 1006 Tunis, Tunisie.
2
Aunité Caractérisation et Epidémiologie Bactérienne (CEB), Agence française de sécurité Sanitaire des Aliments (AFSSA
LERQAP) ; 23, avenue du Général de Gaulle 94706 Maisons-Alfort Cedex, France.
3
Centre National de Greffe de Moelle Osseuse de Tunis (CNGMO) ; 18 rue Djebel Lakdhar, Bab Saadoun 1006 Tunis, Tunisie.

RÉSUMÉ

L'augmentation de la résistance de souches de salmonelles constitue un véritable problème pour la santé publique et la
production animale. L’objectif de ce travail était de mettre en comparaison les caractères phénotypiques et génotypiques
des Salmonella Un total de 17 isolats de Salmonella enterica de nature non typhique, collectées à partir de la collection de
l’Institut de la Recherche Vétérinaire de Tunisie (IRVT) ont été étudiées. Une méthode phénotypique a été employée :
l’antibiotypage. Le typage moléculaire des isolats a été réalisé d’une part par la technique d’amplification aléatoire de
l’ADN bactérien (RAPD) et d’autre part par électrophorèse en champ pulsé (PFGE). Le sérotypage a montré que ces isolats
appartiennent à quatre sérovars différents : Salmonella enterica sérovar Enteritidis (9 souches), Salmonella enterica
sérovar Typhimurium (4 isolats), Salmonella enterica sérovar Anatum (2 isolats) et Salmonella enterica sérovar Agona (2
isolats). L’étude de la résistance aux antibiotiques a montré que les isolats appartenant au même sérovar présentent des
profils de résistance différents. L’analyse moléculaire par la technique RAPD a permis d’obtenir des profils RAPD
spécifiques de chacun des sérovars et identiques au sein d’un même sérovar. De plus, la technique PFGE a permis de
séparer les isolats et de distinguer des sous-types différents au sein des sérotypes identiques et de même profil RAPD.
Mots clés: Salmonella, profil, typage, Antibiotype, RAPD, PFGE..

ABSTRACT

The increase in the resistance of salmonella species constitutes nowadays a real threat for the public health and the animal
production. The principle objective of the present work was to compare the phenotypic and genotypic characters of
salmonella in Tunisia. A total of 17 salmonella enterica non typhic was collected from the bank of the Institute of Veterinary
Research of Tunisia (IRVT) and subjected to a phenotypic technique: the antibiotic typing. The molecular classification of the
isolates was realized with the random amplification of the DNA (RAPD) and with the pulse field gel electrophoresis (PFGE).
The serotyping showed 4 different serovars within the analyzed isolates: Salmonella enterica serovar Enteritidis (9 species),
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009

Salmonella enterica serovar Typhimurium (4 isolates), Salmonella enterica serovar Anatum (2 isolates) and Salmonella
enterica serovar Agona (2 isolates). The study conserning the resistance for the antibiotics showed that the isolates belonging
to the same serovar presented different resistance profiles. The molecular characterization by RAPD enabled us to obtain
RAPD profiles unique and specific for each serovar. Moreover, the results retrieved from the PFGE separated the isolates into
different sub types within the same serotype sharing the same RAPD profile.
Key words: Salmonella, profile, typing, Antibiotype, RAPD, PFGE.

INTRODUCTION dans d’autres pays (Ben Hassen et coll. 1993, Remi

Le genre Salmonella n’a cessé de présenter une
importance considérable dans le domaine
vétérinaire et médical (Dias de Olivera et coll.
2005). De ce fait, les infections à Salmonella non
typhoïdique constituent un problème de santé
publique (Soullié et coll. 2003). Par ailleurs,
l’émergence des souches de Salmonella résistantes,
est de plus en plus importante en Tunisie comme
et coll 2009). D’autre part, la prévention contre les
salmonelloses implique une surveillance au niveau
local (industrie, hôpital) et national (centre de
référence) s’appuyant sur un typage discriminant
des souches (Grimont 1992).
------------------------------------------------------------------------------------
*
Correspondance : DRISS Rim, Institut de Recherche Vétérinaire
de Tunisie (IRVT) ; 20 rue Djebel Lakdhar, La Rabta 1006 Tunis,
Tunisie (rim.driss@laposte.net). Téléphone: 0021622709007.
13
 L’identification des Salmonella au niveau de
l’espèce demeure insuffisante. Récemment, des
marqueurs moléculaires basés sur les variations de
séquence nucléotidiques ont été proposés pour la
caractérisation des souches de Salmonella
(Kerouanton et coll. 1996, Nanna et coll. 2007).
L’objectif de ce travail a été de comparer sur le plan
phénotypique et génomique des souches de
Salmonella non typhoïdique tunisiennes isolées de
différentes origines: humaine, animale et
alimentaire et appartenant à 4 sérotypes différents,
afin de préciser la variété des clones circulants en
Tunisie
MATERIEL ET METHODES
L’étude a été effectuée sur 14 isolats de Salmonella
spp isolées au laboratoire de Bactériologie de l’IRVT
et 03 souches de Salmonella spp isolées de milieu
clinique au laboratoire de Microbiologie de
CNGMO. Une souche de référence de E. coli ATCC
25922 a été utilisée comme contrôle de qualité
interne de l’antibiogramme. Une base de données
de profil PFGE de Salmonella de l’unité CEB de
l’AFSSA.
L’identification biochimique a été réalisée selon les
méthodes conventionnelles (LeMinor) par Api
system (BioMerieux) et la détermination de
sérotype a été effectuée par les sérums spécifiques
anti-O et anti-H (Sanofi Diagnostics Pasteur).
L’étude de la sensibilité aux antibiotiques a été
effectuée par la méthode de diffusion en milieu
gélosé (disques et gélose Muller Hinton Diagnostics
Pasteur) selon les recommandations du CA-SFM
2003. Les disques utilisés ont été, Amoxicilline
(30µg), Ampicilline (10µg), Amikacine (30µg), Acide
Nalidixique(30µg), Cefalexine (30µg), Ceftriaxone
(30µg), Céftazidime (30µg), Colistine (50µg),
Chloramphénicol (30µg), Doxycycline (30µg),
Fluméquine (30µg), Gentamicine (10U), Néomycine
(30UI), Nitrofurantoïne (300µg), Ofloxacine (5µg),
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009
Streptomycine (30UI), Sulfamide (20µg),
Tétracycline (30UI), Tobramycine (10µg),
Ticarcilline+acide clavulanique (75/10µg),
Triméthoprime+Sulfaméthoxazole (1.25/23.75µg).
L’amplification aléatoire de l’ADN Génomique
bactérien
Cette technique nécessite deux étapes : l’extraction
de l’ADN génomique bactérien et l’amplification de
cet ADN par une amorce non spécifique.
L’extraction de l’ADN a été effectuée chez 17 isolats
de Salmonella selon le protocole préalablement
décrit par un Kit commercialisé "Wizard Genomic
Purification Kit" (Promega). Au moment de
l’amplification, afin d’augmenter la reproductibilité
14
de la technique, un kit commercial "Ready to Go
RAPD" (Amersham) a été utilisé.
La séquence de l’amorce choisie, parmi les six
amorce livré par le kit, est la suivante : 5’-
GGTGCGGGAA-3’. Les conditions PCR ont été: un
cycle de dénaturation de 5 minutes à 95°C suivi de
45 cycles comportant chacun 1 min de dénaturation
à 95°C, 1 min d’hybridation à 36°C et 2 minutes
d’élongation à 72°C. Les produits d’amplifications
ont été individualisés par électrophorèse en gel
d’agarose à 1% après révélation par le BET à
10µg/ml, puis photographie par un système
d’imagerie (Bio-Rad).
L’électrophorèse en champ pulsé
Les isolats de Salmonella ont été mis en culture sur
gélose TSA-YE (trypcase soja) pendant 24 heures à
37°C. En utilisant un spectrophotomètre, la densité
optique d’une suspension bactérienne a été ajustée
entre 1,6 et 1,8 à 620 nm. Environ 400 µl de la
suspension bactérienne ont été mélangé avec 20µl
de protéinase K (20 mg/ml), 400µl de SDS 20% et
d’agarose 1% en 8 ml de Tris-EDTA. La solution ainsi
préparé a ensuite été distribuée dans des moules.
Les inserts obtenus ont été incubés 2 heures à 37°C
dans une solution de lyse composée de Tris 1 M à
pH 8; d’EDTA 0,25 M à PH 8 et de 1% de sarcosine
en présence de 25µl de protéinase K. Les inserts ont
été lavés 3 fois avec de l’eau distillée ultra pure et 4
fois avec du Tris-EDTA. La digestion enzymatique a
été réalisée à travers les mailles d’agarose avec
l’enzyme XbaI (0,8U/ml). Le marqueur de taille
utilisé pour l’analyse était une souche de référence
de Salmonella Branderup, préconisée par le projet
SalmGene (PUBLI eurosurveillance). La migration a
été réalisée dans du tampon TBE 0,5X en gel
d’agarose à 1%. La migration a été réalisée selon
deux programmes, le premier a été de 7-12 sec
pendant 8,5 heures et le deuxième a été de 20-40
sec pendant 10,5 heures à 6V/cm. Le gel a ensuite
été observé sous ultra-violet et photographié par un
système d’imagerie numérique (Bio-Rad). Un
logiciel d’analyse (Bionumerics, Applied Maths,
Belgique) a été couplé à la plate-forme de lecture
pour analyser les profils obtenus (Lailler et coll.
2002). Des pourcentages de similarité entre les
isolats ont pu être visualisés à partir de la création
de dendrogramme. L’indice de Dice permet la
création d’une matrice de similitude, après
comparaison deux à deux de tous les profils et la
représentation graphique sous forme de
dendrogramme est ensuite obtenue par la méthode
UPGMA (Unweighted Pair Group Method Using
Arithmetic Averages) basée sur le regroupement
suivant la distance moyenne.
 RESULTATS souches d’origine animale, 2 d’origine alimentaires
et 1 d’origine humaine (tableau 1). 4 souches de
Distribution par sérotypage Salmonella Typhimurium, 2 d’origine animale et 2
d’origine humaine. 2 souches de Salmonella Agona
Les salmonella étudiées se répartissent en 4 d’origine animale et 2 souches de Salmonella
sérotypes, Salmonella Enteritidis. 9 souches, 6 Anatum d’origine alimentaire et animale (tableau 1)

Tableau 1. Distribution par sérotype de 17 souches de Salmonella spp

Serovars Origine animale Origine alimentaire Origine humaine Total
S. Enteritidis 6 2 1 9
S. Typhimurium 2 - 2 4
S. Agona 2 - - 2
S. Anatum 1 1 - 2
Total 11 3 3 17

Sensibilité aux antibiotiques montré deux antibiotypes distincts. Deux

L’étude de la sensibilité aux antibiotiques a montré
une fréquence de la résistance élevée à la
tétracycline et aux nitrofurantoïnes. Les souches
sont réparties en 9 antibiotypes différents A1 à A9
(tableau 2). L’antibiotype A2 représente le 1/3 des
antibiotypes et il est observé parmi les souches
animales et alimentaires de Salmonella Enteritidis
et Agona.
Les 9 isolats de Salmonella enterica sérovar
Enteritidis sont répartis ont trois antibiotypes
distincts (Tableau 2). Un antibiotype différent a été
obtenu pour les isolats de Salmonella enterica
sérovar Typhimurium analysées (1999 et Z625). La
souche provenant d’un prélèvement ; à partir d’un
prélèvement de crocodile (364) ; a été sensible à
tous les antibiotiques testés. Les deux isolats de
Salmonella enterica sérovar Agona étudiés ont
antibiotypes différents ont également été observés
pour les deux isolats de Salmonella enterica sérovar
Anatum.
Analyse génomique par RAPD
Une réaction préliminaire a été réalisée avec 6
amorces différentes en utilisant l’ADN de la souche
de référence d’origine humaine (D13). Six profils
différents ont été obtenus, le profil obtenu avec
l’amorce 6 a été choisi pour la suite de l’étude car le
profil obtenu avec cette amorce a donné moins de
bandes parasites et il était plus facile à interpréter.
L’analyse des 9 isolats de Salmonella enterica
sérovar Enteritidis par la technique de RAPD a
permis d’obtenir 9 profils identiques
indépendamment de leur origine d’isolement
(figure 1).

Tableau 2. Profil de sensibilité aux antibiotiques des 17 souches de Salmonella spp

Serovar Profil Antibiotype

(nombre de souches)
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009

S. Enteritidis
- Animale (6) Fu, Té, Ni, Do A1
- Alimentaire (2) Ni, Fu A2
- Humaine (1) Fu, Té, Ni, Do, AN, ST A3
S. Typhimurium
- Animale (2) Sensible A4
Am, St, A.N A5
- Humaine (2) Té, Do, Ni, Fu, St, Am, Su, Ch, Ax, T+A.c A6
S. Agona
- Animale (2) Té, Do A7
Ni, Fu Té, Do, A1
S. Anatum
- Animale (1) Su, Ch A8
- Alimentaire (1) Su A9
Té : Tétracycline ; Do : Doxycycline ; Ni : Nitrofurantoïne ; Fu : Furane ; A.N : Acide Nalidixique ;
St : Streptomycine ; Am : Ampicilline ; Su : Sulfamide ; Ch : Chloramphénicol Ax : Amoxicilline ;
T+A.C : Ticarcilline+Acide Clavulinique

15
 M+ 2236 172 Z671 786 836 799 858 295 2122

1000 bp
600bp

200 bp

Figure 1: Profils génomiques des souches de Salmonella Enteritidis obtenus après RAPD avec l'amorce 6 (M+ = E.coli Bl2,
témoin positif et marqueur de taille)

Chaque profil est composé de 8 bandes de 200 à
1500 bp. Pour les isolats de Salmonella enterica
sérovar Typhimurium isolées de crocodile, d’ovin et
d’homme; les profils RAPD étaient identiques et
chaque profil comportait 8 bandes de 300 à 1500
bp (figure 2). Des profils identiques ont également
été obtenus pour les isolats de Salmonella enterica
sérovar Agona isolées de clovisse et de volaille,
chaque profil était composé de 6 bandes de taille
variant de 300 à 1100 bp (figure 3). Pour les 2
isolats de Salmonella enterica sérovar Anatum
isolés de viande et de poussin, deux profils de RAPD
identiques ont été obtenus (figure 3), chaque profil
comportait 5 bandes variant de 600 à 1100 bp.
M+ 364 1999
1000 bp
600bp
200 bp
Figure 2: Profils génomiques des souches de Salmonella
enterica sérovar Typhimurium obtenus après RAPD avec
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009
Analyse génomique par PFGE
La comparaison des profils par Bionumerics a
permis de déterminer le pourcentage de similitude
entre les isolats et d’attribuer un numéro de profil
PFGE à chacun des isolats selon une nomenclature
propre à l’unité CEB de l’AFSSA, suivant les
recommandations de SalmGene. Les profils
observés dans cette étude ont été comparés avec
ceux qui constituent la base de profils de l’unité CEB
de l’AFSSA.
L’analyse des isolats de Salmonella enterica sérovar
Enteritidis par PFGE a permis d’obtenir un seul
profil, nommé SENTXB0001, ce profil a été constitué
de 11 fragments dont les poids moléculaires varient
Z625 de 1150Kb à 40 Kb et correspond à celui le plus
fréquemment observé dans la base de profils de
l’AFSSA, pour des isolats provenant de
prélèvements de toutes origines. Ce profil semble
être relié aux souches de lysotype PT4. En ce qui
concerne les isolats de Salmonella enterica sérovar
Typhimurium trois profils différents ont été
observés. Les isolats obtenus à partir d’un
prélèvement d’ovin (1999) et de crocodile (364) ont
présenté un même profil nommé STYMXB0005 qui
comprend 14 fragments variant de 890 kb à 40 kb.

l'amorce 6 Ce profil a été observé à une seule reprise dans la

+
M : E.coli BL2 témoin positif et marqueur de taille base de profils de l’AFSSA. Une des deux souches
humaine (Z625) a permis d’observer le profil
M+ Cl88 Vo92 V3 1508 STYMXB0007, comportant 15 fragments de 890 à
40Kb qui se rapproche de profil animal
STYMXB0005 avec un pourcentage d’homologie
estimé à 87%. Le profil STYMXB0007 est fortement
représenté dans la base de profils de l’AFSSA et
1000 bp
associé à des souches de toutes origines porteuses
600 bp de la penta-résistance. Il est intéressant de noter
que cette souche humaine (D13) est également
200 bp
résistante à tous les antibiotiques testés sauf à
l’acide nalidixique. L’autre souche de Salmonella
Typhimurium prise comme souche de référence a
Figure 3 : Profils génomiques des souches des Salmonella montré un profil qui est tout à fait nouveau dans la
enterica sérovar Agona et Salmonella enterica sérovar base de profils de l’AFSSA et qui est constitué de 17
Anatum obtenus après RAPD avec l'amorce 6.
+ fragments variant entre 620 et 25 Kb. Pour les deux
M : E.coli BL2 témoin positif et marqueur de taille.

16
 souches de Salmonella enterica sérovar Agona, un
seul profil PFGE de 11 fragments (700 à 70 Kb) a été
obtenu. Les souches de Salmonella enterica sérovar
Anatum possédaient également deux profils PFGE
nouveaux : SANTXB0013 et SANTXB0014. Le
premier profil comportait 13 fragments variant
entre 1050 et 40 Kb et le second 14 fragment de
1100 à 40 Kb. Le pourcentage d’homologie entre
ces deux souches a été de 89% (figure 4, tableau 3).

Figure 4 : Dendrogramme obtenu après analyse des profils PFGE des 17 souches de Salmonella enterica

Tableau 3. Profils épidémiologiques des 17 souches de Salmonella spp

Souche Sérovar Origine Profil de Profil Profil
résistance RAPD PFGE
Cl88 Agona Clovisse A7 I SAGOXB0015
Vo92 Agona Volaille A1 I SAGOXB0015
V3 Anatum Viande A9 II SANTXB0013
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009

1508 Anatum Poussin A8 II SANTXB0014

2236 Enteritidis Dindonneau A1 III SENTXB0001
295 Enteritidis Duvet A1 III SENTXB0001
2122 Enteritidis Clovisse A2 III SENTXB0001
172 Enteritidis Flamand rose A1 III SENTXB0001
Z671 Enteritidis Humaine A3 III SENTXB0001
786 Enteritidis Lait A1 III SENTXB0001
863 Enteritidis Poussin A1 III SENTXB0001
799 Enteritidis Poulet A2 III SENTXB0001
858 Enteritidis Eau A1 III SENTXB0001
364 Typhimurium Crocodile A4 IV STYMXB0005
A ref Typhimurium Humaine réf ND IV STYMXB0049
1999 Typhimurium Ovin A5 IV STYMXB0005
Z625 Typhimurium Humaine A6 IV STYMXB0007

17
 DISCUSSION
L’analyse des résultats de diagnostic effectués à
l’Institut de la Recherche vétérinaire de Tunisie a
montré une incidence stable de nombre
d’isolement des souches de Salmonella inférieur à
1% en 1999, 2000 et 2002 et de 1,39% en 2001
(Debaya et coll. 1999, 2000, 2001, 2002).
Cependant, l’OMS a rapporté une augmentation
importante de l’incidence et de la gravité, des cas
de salmonellose humaine et animale Breuil et coll.
1998. Par ailleurs, la survenue de cas regroupés de
salmonelloses a développé et généralisé l’utilisation
des différents marqueurs génotypique dans le but
de compléter l’investigation épidémiologique pour
identifier l’origine alimentaire le plus souvent des
cas groupés. Dans cette étude, des isolats de
Salmonella de différents sérovars ayant été isolés
de plusieurs espèces hôtes ont été comparés.
Brisabois et coll. 1997 ont rapporté la possibilité de
diffusion des marqueurs de résistance des souches
de Salmonella par recombinaison et transfert. Ces
mêmes auteurs ont montré également que
certaines souches possèdent toute la génétique
nécessaire au transfert des gènes de résistance aux
antibiotiques par différents mécanismes. Casin et
coll. 1999 ont montré que l’expression de plusieurs
gènes de résistance chez les souches de Salmonella
enterica est réalisée par un transfert horizontal de
ces gènes, grâce aux plasmides et aux intégrons. Ce
transfert est contrôlé par des éléments de
régulation qui sont très conservés chez les bactéries
Gram-négatif. Cependant, les études phénotypiques
des gènes de résistance sont insuffisantes. Les
techniques de caractérisation moléculaire
employées pour cette étude, RAPD et PFGE, ont
permis d’aboutir à une meilleure distinction entre
les souches de Salmonella. D’après Athena et coll.
1996 la technique RAPD est considérée comme une
méthode d’analyse fortement sensible et spécifique
pour identifier et typer les bactéries pathogènes. De
Microbiol. Hyg. Alim.-Vol 21, N° 62 – Décembre 2009
même Soto et coll. 1999 ont montré que
l’amplification aléatoire de l’ADN est classée parmi
les méthodes de typage moléculaire les plus rapides
pour la caractérisation des souches de Salmonella.
La même étude a montré que le pourcentage de
concordance entre les résultats de typage par
l’amplification aléatoire d’ADN et les résultats de
classification par sérotypage a été de 100%. Les
résultats du présent travail ont confirmé ceux
obtenus par Soto et coll. 1999 puisque 4 profils
RAPD spécifiques de chaque sérovar
indépendamment de l’hôte d’origine ont été
obtenus au cours de notre étude. Cependant cette
méthode ne permet pas de différencier les sous-
types au sein de même sérovar. De plus, selon
Grimont et coll. 1996, la technique de RAPD est
tolérée pour un examen rapide de quelques isolats,
18
à condition de bien vérifier sa reproductibilité. La
méthode RAPD est difficilement standardisable
pour des comparaisons inter laboratoires, de plus
son manque de reproductibilité ne la rend pas
utilisable pour des études épidémiologiques de
longue durée.
La deuxième technique de typage moléculaire
utilisée dans cette étude est le PFGE, cette
technique a séparé des souches de Salmonella
enterica ayant des profils identiques par RAPD.
D’après Tenover et coll. 1995 et Pfaller et coll. 1996,
des souches possédant un nombre de bandes
différent, ne dépassant pas 3 bandes seraient
considérées comme identiques. Selon ces mêmes
auteurs deux souches seraient considérées comme
semblables si leur pourcentage de similitude est
compris entre 90% et 100%, elles seraient
considérées comme appartenant à 2 sous-types
différents si ce pourcentage est inférieur à 90%. Au
cours de cette étude, l’interprétation des résultats a
été effectuée en se basant sur le nombre et la taille
des bandes. Des profils de PFGE différents ont été
obtenus au sein de même sérotype. Les neuf isolats
de Salmonella enterica sérovar Enteritidis ont
présenté des profils identiques avec un
pourcentage de similitude de 100%. Les isolats de
Salmonella enterica sérovar Typhimurium
appartiennent à trois sous-types différents. Les
profils des isolats d’ovin et de crocodile étaient
identiques, cependant, ces deux isolats
présentaient un pourcentage d’homologie de 89%
avec une souche humaine de Sfax. La souche de
référence D13 isolée en 1988 a présenté un profil
très différent des trois autres isolats de Salmonella
enterica sérovar Typhimurium avec seulement 66%
d’homologie. Les deux isolats de Salmonella
enterica sérovar Agona ont présenté le même
profil. Cependant, les deux isolats de Salmonella
enterica sérovar Anatum avaient deux profils
différents avec une homologie de 89%. Ainsi, la
technique PFGE a montré que les souches de
Salmonella étudiées présentaient un
polymorphisme génomique relativement
important. En effet, les études de Corbett-feeney et
coll. 1998 et Ribot et coll. 2006, ont montré que
PFGE est une méthode très utile pour la subdivision
des souches de Salmonella. Jeffrey et coll. 2001, ont
constaté que la diversité des sous-types obtenus
par PFGE serait probablement due à la présence de
différentes sources de contamination. D’autre part,
Margaret et coll. 2002 et Tansy 2009 ont prouvé
que la PFGE est une approche très discriminante
avec laquelle les changements génétiques mineurs
peuvent être détectés au niveau des bandes. De
plus cette technique permet la détermination des
sources d’infection, d’où son intérêt dans les études
épidémiologique.
 REFERENCES
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