Cours de chimie Organique - G.

Dupuis - Lycée Faidherbe Lille

Diastéréo-isomérie

Définitions

La configuration d'une entité moléculaire est la disposition spatiale des atomes ou des groupes
d'atomes de cette entité. Ce terme est propre aux stéréo-isomères dont l'isomérie n'est pas due
à des différences de conformation.
Des diastéréo-isomères sont, par définition, des stéréoisomères de configuration non
énantiomères.

Diastéréo-isomérie due à la présence d'une double liaison

Les configurations relatives autour d'une double liaison sont nommées en utilisant les
stéréodescripteurs Z, E obtenus à partir des règles de Cahn, Ingold et Prelog [1].

Double liaison carbone-carbone

La présence d'une liaison double entre deux atomes de carbone empêche la rotation des
groupes autour de l'axe de la liaison à la température ordinaire. Les acides (Z)-but-2-ène-1,4-
dioïque et (E)-but-2-ène-1,4-dioïque sont des diastéréo-isomères.

L'acide (E)-but-2-ène-1,4-dioïque ou fumarique existe à l'état naturel

dans certains végétaux (fumaria). On rencontre ses sels dans
plusieurs cycles biochimiques importants. Son hydratation en acide
L-malique sous l'action de l'enzyme fumarase constitue l'une des
étapes du cycle de Krebs. On rouve également ce composé dans le
cycle de l'acide citrique et celui de l'urée.
 L'acide (Z)-but-2-ène-1,4-dioïque ou maléïque peut être obtenu par
isomérisation thermique de l'acide fumarique à une température
supérieure à 200 °C.

Un autre exemple est celui des diastéréo-isomères du but-2-ène.

Le terme citral désigne deux composés diastéréo-isomères : le

géranial ou citral A (CA) et le néral ou citral B (CB). On les trouve
dans la citronelle de l'Inde (lemmon-grass) ainsi que dans les huiles
essentielles de citron et d'orange.

Double liaison carbone-azote

La même nomenclature s'applique aux composés comportant une liaison double entre un
atome de carbone et un atome d'azote notamment les imines et les oximes. Un doublet non
liant est classé comme dernier prioritaire.

Pour des raisons historiques, les composés de stéréochimie Z sont souvent appelés syn et ceux
de stéréochimie E sont appelés anti.

Diastéréo-isomérie due à la présence d'un cycle

Composés monocycliques
Le plan de référence est le plan moyen du cycle. Lorsque les substituants de plus grande
priorité sont du même côté de ce plan moyen, le composé est de stéréochimie Z ou cis.
Lorsque ces substituants sont situés de part et d'autre de ce plan, le composé est de
stéréochimie E ou trans.
Il existe deux diastéréo-isomères dans la famille des (1,4)-diméthylcyclohexane :

 dans l'isomère cis (conformations I et I'), les groupes méthyle sont du même côté du
plan moyen du cycle. Les conformations I et I' possèdent la même énergie ;

 dans l'isomère trans (conformations II et II'), les groupes méthyle sont de part et
d'autre du plan moyen du cycle. La conformation II dans laquelle les deux substituants
sont en position équatoriale possède une énergie plus petite que la conformation II'
dans laquelle ils sont en position axiale. La conformation II est donc favorisée par
rapport à II'.

Les molécules précédentes possèdent un plan de symétrie qui coupe le cycle en passant par les
groupes méthyle. Elles ne sont donc pas chirales.

Composés bicycliques pontés

Du fait de la rigidité du système bicyclique, plusieurs configurations ne peuvent pas exister.
Chez les dérivés monosubstitués, on utilise la nomenclature endo et exo. Les composés
suivants sont deux diastéréoisomères du 2-chlorobicyclo[2,2,1]heptane. Ils sont appelés
respectivement composé exo et endo.

Remarque : on trouve, par exemple, ce type de composés dans la chimie des dérivés du
camphre.

Les composés peuvent exister sous deux formes énantiomères ou bien être des composés
méso comme dans l'exemple du tropan-3-ol, obtenu par hydrolyse de l'atropine.
Remarque : un moyen classique de synthèse des composés bicycliques est la réaction de
Diels-Alder. Voir par exemple la synthèse du patchoulol.

Diastéréo-isomérie due à la présence de plusieurs centres chiraux

Absence de cycle
Puisqu'un atome de carbone asymétrique possède deux configurations, deux atomes de
carbone asymétriques conduiront au maximum à quatre stéréo-isomères. Les stéréoisomères
du 2-bromo-3-fluorobutane sont représentés ci-dessous. Ils sont nommés en utilisant les règles
de Cahn, Ingold et Prelog. Deux composés situés sur la même horizontale sont énantiomères.
Deux composés non situés sur la même horizontale sont diastéréo-isomères.

(2R, 3R)-2-bromo-3-fluorobutane (2S, 3S)-2-bromo-3-fluorobutane

(2R, 3S)-2-bromo-3-fluorobutane (2S, 3R)-2-bromo-3-fluorobutane

Le schéma ci-dessous précise les relations d'énantiomérie, symbolisées par E et de diastéréo-

isomérie, symbolisées par D.
  les énantiomères (R, R) et (S, S) forment le couple like ;
 les énantiomères (R, S) et (S, R) forment le couple unlike.

Lorsque deux atomes de carbone asymétriques sont substitués par des groupes identiques, le
nombre de stéréoisomères diminue car le nombre d'arrangements possible est plus petit.

Il n'existe que trois stéréoisomères de la famille des acides 2, 3-dihydroxybutanedioïque

(acides tartriques) :

 les composés (2R, 3R) et (2S, 3S) énantiomères ;

 un composé achiral de configuration absolue (2R, 3S) ou (2S, 3R), diastéréo-isomère
des deux précédents, appelé composé méso.

Dans la chimie des sucres, le décompte des stéréoisomères peut être facilité en utilisant la
projection de Fischer.

Epimères
Des diastéréo-isomères qui ne diffèrent que par la configuration absolue d'un seul centre
chiral sont appelés des épimères. Lorsque le centre chiral en question est formé lors de
l'hémiacétalisation d'un sucre, on appelle ces épimères particuliers des anomères (du grec ano,
en tête, et meros, partie.)

La testostérone (I) et l'épitestostérone (II) sont des stéroïdes épimères qui ne diffèrent l'un de
l'autre que par la configuration de l'atome de carbone portant le groupe OH.
Dans l'organisme humain, le rapport I/II entre ces deux diastéréo-isomères est d'environ 1.
L'administration de testostérone exogène chez un sportif, se traduit par une augmentation de
ce rapport car la quantité d'épitestostérone n'est pas modifiée. L'élévation anormale du rapport
I/II traduit donc un dopage.

L'épimérisation est un phénomène dynamique qui peut, ou non, s'accompagner d'une variation
du pouvoir rotatoire, selon que les diastéréo-isomères sont, ou non, chiraux.

Présence d'un cycle

Nous allons examiner le cas des stéréo-isomères du (1,2)-diméthylcyclohexane. La molécule
de cis-(1,2)-diméthylcyclohexane est a priori chirale. En effet si on la regarde comme une
structure figée, elle n'est pas superposable à son image dans un miroir plan.

Cependant, à la température ordinaire, le basculement conformationnel égalise les populations

des deux énantiomères.

Les molécules dessinées à droite sont identiques (amener 1 en coïncidence avec 2' et 2 en
coïncidence avec 1'). Le cis-(1,2)-diméthylcyclohexane est un composé méso. Il s'agit du (1R,
2S)-1,2-diméthylcyclohexane.

Il existe d'ailleurs des conformations achirales de ce composé. Cela apparaît plus nettement en
utilisant la représentation de Cram (I') de ce composé (plan de symétrie passant entre les
atomes 1 et 2.)
 La molécule de cis-(1,2)-diméthylcyclohexane considérée comme une structure
figée, est chirale. A la température ordinaire les deux énantiomères sont en
équilibre rapide et un échantillon à l'échelle macroscopique du du composé est
constitué d'un mélange racémique de molécules énantiomères.

Les dessins ci-dessous représentent le (1S, 2S)-1,2-diméthylcyclohexane (figure I) et son

énantiomère le (1R, 2R)-1,2-diméthylcyclohexane (figure II) en utilisant successivement la
représentation en perspective et la représentation de Cram.

Le basculement conformationnel ne permet pas de passer d'un énantiomère à l'autre.

Il existe deux énantiomères de la molécule de trans-(1,2)-diméthylcyclohexane.

Ces sont les énantiomères (1R, 2R) et (1S, 2S).
Le composé cis et le composé trans (S, S) sont des diastéréo-isomères. De même le composé
cis et le composé trans (R, R) sont également diastéréo-isomères.

Un problème un peu plus compliqué mais assez proche dans son principe du précédent est
celui de l'étude des décalines cis et trans.

Généralisation
Dans une molécule possédant n atomes de carbone asymétriques, on s'attend à un nombre
maximum de stéréoisomères de 2n. Ce nombre ne tient pas compte des isoméries
supplémentaires dues à d'autres causes comme l'existence de doubles liaisons. Le nombre de
stéréoisomères croit donc très vite avec n.

Le menthol possède 3 atomes de carbone asymétriques. Il y a 23 = 8 stéréoisomères.

Il existe de même 24 = 16 stéréoisomères possédant la même formule développée plane que le

glucose naturel (aldohexoses avec quatre atomes de carbone asymétriques.)

Dans certains cas, le nombre de stéréoisomères est inférieur au nombre total possible. Cela
peut venir du fait que certaines molécules sont achirales. C'est le cas de composés méso
comme l'acide mésotartrique. Il se peut aussi que certaines configurations soient rendues
impossibles du fait de la rigidité d'un système ponté. Un exemple est celui de la molécule de
camphre qui possède deux atomes de carbone asymétriques (les atomes 1 et 4) mais qui ne
présente que deux stéréoisomères : la molécule de camphre naturel (II) et son énantiomère (I).

De même, la molécule de quinine ayant quatre centres chiraux, on peut prévoir au maximum
16 stéréoisomères. Mais, du fait de la présence d'un système ponté, il n'en existe que huit. La
figure ci-dessous représente la quinine et l'un de ses diastéréo-isomères : la quinidine. Il y en a
deux autres : la cinchonine et la cinchonidine. Ces molécules étant chirales, elles ont à chaque
fois un énantiomère. Il y a donc bien 16 stéréo-isomères.
Ces alcaloïdes sont présents à l'état naturel dans l'écorce de quinquina.
Le cholestérol appartient à la famille des stéroïdes. La molécule est représentée
successivement en perspective puis en utilisant la représentation de Cram.

Il y a huit atomes de carbone asymétriques : C3, C8, C9, C10, C13, C14, C17, C20.

Le cholestérol est le représentant le plus connu d'une famille

de composés naturels très répandus dans le règne animal et
végétal : les stéroïdes .

La molécule possède 8 atomes de carbone asymétriques. On

peut donc prévoir 256 stéréoisomères au maximum pour
cette molécule. Seul le composé dessiné à gauche existe à
l'état naturel. Le chimiste allemand Adolf Windaus a reçu le
prix Nobel de chimie en 1928, pour ses travaux concernant
les stérols. Cependant, la structure qu'il proposa pour le
cholestérol était inexacte. La structure correcte de la
molécule a été établie à la suite des travaux de J. D. Bernal
relatifs à un dérivé du cholestérol : l'ergostérol (1932).
La synthèse totale du cholestérol a été réalisée par R. B.
Woodward en 1952 [2]

Propriétés des diastéréo-isomères

Propriétés physiques
Au sein de deux diastéréo-isomères, les distances interatomiques n'étant pas les mêmes, les
propriétés physiques seront donc en général différentes.

C'est la raison pour laquelle les propriétés physiques et chimiques des acides (Z) et (E)-but-2-
ène-1,4-dioïques avaient paru suffisamment éloignées l'une de l'autre aux chimistes du 19ème
siècle, pour qu'ils leurs donnent des noms différents.

Isomère Nom du composé TF (°C)

 Z maléique 131
E fumarique 287

Le cas des stéréoisomères de l'acide tartrique est également significatif.

Composé [ ] (°. dm1.g1.cm3) TF (°C) Densité d

()-(2S, 3S) 12 170 1,76
(+)-(2R, 3R) +12 170 1,76
(2R, 3S) 0 140 1,67

Propriétés chimiques
Des molécules ayant des groupes caractéristiques identiques dont les positions dans l'espace
ne sont pas les mêmes, auront des propriétés chimiques différentes :

 l'isomère (Z) dans lequel les fonctions acides sont assez proches, conduit, par
chauffage en présence d'un déshydratant à un anhydride ;

 l'isomère (E) dans lequel les fonctions acides sont éloignées n'en donne pas.

La jasmone, une cyclopentanone extraite du jasmin, possède une chaîne latérale de

stéréochimie Z. Son diastéréo-isomère ne possède pas la même odeur.

Spectroscopie

Spectroscopie ultraviolette
En spectroscopie UV-visible, la longueur d'onde du maximum d'absorption et le coefficient
d'absorbance sont très sensibles à l'orientation autour de la double liaison dans les systèmes
conjugués comme le montre l'exemple du (Z)-diphényl-1,1-éthène et du (E)-diphényl-1,1-
éthène.
La conjugaison est moins importante dans l'isomère Z car l'interaction entre les cycles
aromatiques empêche qu'ils soient coplanaires.

Composé Z E
 (nm) 280 296
 10 500 29 000

Ces résultats ont été généralisés sous forme règles par Woodward et Fieser. Elles permettent
de contribuer à la prévision de la stéréochimie de structures complexes.

Spectroscopie de RMN
La constante de couplage 3JHH entre deux protons vicinaux dépend de leur configuration
relative.

Composé Z E
3
JHH 10 Hz 16 Hz

La molécule de (cis)-1-chloro-2-cyanoéthène constitue un exemple.

La stéréochimie des jonctions de cycle peut parfois être précisée grâce à la présence ou à
l'absence d'effet Overhauser nucléaire (nOe).

Chimie de la vision
La vitamine A, ou rétinol est le composé parent des rétinoïdes.

Le rétinol est formé dans l'organisme par coupure de la provitamine A

ou -carotène.

Le rétinol est le précurseur biochimique d'une molécule importante dans

la chimie de la vision : le rétinal, représenté à gauche. Son transport
dans l'organisme est assuré par une proteine appelée 1 RBP. La carence
en vitamine A se traduit par des troubles oculaires.
La synthèse des rétinoïdes et des composés apparentés constitue une
application de l'oléfination de Wittig. Le rétinol peut être oxydé en
rétinal par un oxydant chimiosélectif comme le réactif de Dess-Martin.

Le rétinal qui possède une stéréochimie E, peut être isomérisé en néorétinal de stéréochimie
Z, sous l'action d'une enzyme de la famille des isomérases.
Le néorétinal forme avec une protéine appelée opsine, une imine ou base de Schiff : la (Z)-
rhodopsine. Cette dernière est l'un des principaux constituants du pourpre rétinien.

Sous l'action de la lumière, la (Z)-rhodopsine peut s'isomériser en 1012 s pour donner le

diastéréo-isomère (E). Ce dernier qui est instable, évolue en 109 s environ pour reformer le
rétinal. Cette cascade de réactions est à l'origine de l'influx nerveux transmis au cerveau par le
nerf optique [3].

Ouvrages théoriques
J. March - Advanced organic chemistry, Wiley Interscience.
F. A. Carey, R.J. Sundberg - Advanced organic chemistry, 3d edition (Plenum Press, 1990).
E. L. Eliel, S. H. Wilen, Stéréochimie des composés organiques (Tec et Doc).
H. Kagan - La stéréochimie organique (PUF, 1975).
J. L Pierre - Principes de stéréochimie organique statique (A. Colin, 1971).
A. Kirmann, J. Cantacuzène, P. Duhamel - Chimie organique T 1 (A. Colin, 1971).
K. Mislow - Introduction to stereochemistry (W. A Benjamin, New York, 1966).
J. Jacques - La molécule et son double (Hachette, 1992).
V. Pellegrin - Les représentations graphiques bidimensionnelles des molécules en chimie organique (Bulletin de
l'Union des Physiciens, février 1999).

Articles
[1] Unambiguous specification of stereoisomerism about a double bond , J. E. Blackwood et coll. J. am. Chem.
Soc., 1968, 90, 509.
[2] R. B. Woodward, F. Sondheimer, D. Taub, K. Heusler, W. M. MacLamore, J. Am. Chem. Soc., 1952

[3] Rando, R.,R. Angew. Chem. Int. Ed. Engl.1990, 29,461.

Liens
[20] Synthèse du cholesterol
[21] Stereochemistry Articles Une sélection d'articles de référence en stéréochimie (Jay Siegel Research Group.)
[22] Cycle de Krebs.

RETOUR AU MENU DU COURS

Vous pouvez, si vous le souhaitez, utiliser le contenu de cette page dans un but
pédagogique et non commercial.

Gérard Dupuis - Lycée Faidherbe - LILLE

novembre 2012