2010

Rapport d‘activité
 Sommaire

4 Le mot du Directeur général

6 Temps forts 2010

10 Cellectis en bref

12 Notre métier

16 CellectiS en 2010

18 Notre science

22 Business development

24 Corporate development

27 Ressources Humaines - Communication

30 Filiales

31 Cellectis bioresearch

34 Cellectis plant sciences

36 Ectycell

38 Cellectis therapeutics

41 ElEments financiers

47 ANNEXES

 Sommaire

4 Le mot du Directeur général

6 Temps forts 2010

10 Cellectis en bref

12 Notre métier

16 CellectiS en 2010

18 Notre science

22 Business development

24 Corporate development

27 Ressources Humaines - Communication

30 Filiales

31 Cellectis bioresearch

34 Cellectis plant sciences

36 Ectycell

38 Cellectis therapeutics

41 ElEments financiers

47 ANNEXES

Le mot du Directeur général
2010 une année de construction
Nous vivons une époque où l’essence même de la biotechnologie se redéfinit. Le dogme
central de la biotechnologie repose sur l’utilisation du vivant pour transformer des produits
de façon industrielle. Cette notion a connu une révolution à la fin des années 1970 avec la
découverte de l’ADN recombinant et la production de protéines à visées thérapeutiques.
Cette révolution est basée sur la capacité de l’homme à modifier des fragments d’ADN dans
des tubes à essais et à réintroduire le produit de cette ingénierie dans des cellules dont le
programme génétique sera ainsi changé.
Aujourd’hui nous entamons une nouvelle étape de cette révolution biotechnologique.
Modifier le programme génétique des cellules ne se fait plus au hasard mais de façon
rationnelle. De manipulations génétiques résultant d’un « bricolage » du vivant, nous
sommes passés à une science d’ingénierie. La programmation de l’ADN résulte désormais
d’une connaissance parfaite de l’ensemble de la séquence du génome dans le but d’obtenir
un résultat prédictible, fiable et précis.
Une révolution silencieuse
Les projections dans le monde des biotechnologies sont souvent optimistes. Mais la vitesse
à laquelle l’homme a déchiffré l’ADN du génome humain, ainsi que l’ADN de toute espèce,
surpasse chaque fois toutes les prévisions. Nous sommes à la veille d’une nouvelle ère où
l’information génétique sera accessible à tous. On estime que d’ici 2013, le déchiffrage d’un
génome humain coûtera moins de 1 000 euros par personne et sera réalisé en moins de
quatre semaines. D’ici quelques années, des millions de personnes auront leur génome
déchiffré et disponible pour une médecine personnalisée. En aval de cette vague se trouve
l’ingénierie des génomes. C’est grâce aux technologies développées par Cellectis que les
défauts du génome, innés ou acquis, pourront être soignés. L’ingénierie des génomes
génèrera de nombreux produits novateurs et prendra le relais des ressources fossiles et
chimiques. Cette ressource, issue du vivant, est le gisement de croissance et de développe-
ment durable pour les prochaines décennies.
Chef de file en ingénierie des génomes
Cellectis détient une position forte dans ce secteur industriel en émergence. Nous dévelop-
pons de nouvelles classes de produits thérapeutiques qui auront le potentiel de transformer
la façon dont les maladies sont traitées et de guérir des maladies aujourd’hui incurables.
Nous mettons aussi au point des produits pour la recherche, la production de biopharma-
ceutiques, l’agriculture biotechnologique, les cellules souches induites et plus récemment
dans le domaine des carburants alternatifs. Notre approche de la biotechnologie est en passe
de changer la donne de cette industrie et d’apporter un relais d’innovation et de croissance
inépuisable pour notre société.
4 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l
Croissance et développement
En 2010, nous avons fait de nombreuses acquisitions qui nous apportent la promesse de
nouveautés technologiques et qui viennent ainsi enrichir notre portefeuille de propriété
intellectuelle. Par exemple, nous avons acheté en septembre les actifs de la société CytoPulse,
spécialisée dans les systèmes d’électroporation, une technique qui va nous permettre de faire
pénétrer les méganucléases, ou d’autres molécules, dans de nombreux types de cellules. Nous
avons également pris la décision de continuer les partenariats débutés par CytoPulse et béné-
ficions ainsi de l’octroi des licences d’exploitation de la technologie d’électroporation.
En effet, une partie de notre stratégie de développement repose sur l’acquisition de techno-
logies complémentaires de nos technologies d’ingénierie des génomes, et qui peuvent être
utilisées dans tous les domaines d’application, de la recherche au thérapeutique. Dans cette
dynamique nous avons aussi acquis des droits de licence non exclusifs qui nous donnent accès
à la technologie des cellules souches pluripotentes induites (iPS) découlant des travaux
du Professeur Shinya Yamanaka, de l’Université de Kyoto. Cellectis est la première société au
monde à bénéficier de licences pour des applications thérapeutiques ou prophylactiques
humaines sur ce portefeuille et mettra ces technologies au service de sa filiale Ectycell, afin
d’en faire un acteur mondial du domaine.
Innovation et performance
Cette année, nous avons fait des progrès considérables dans des secteurs clés de notre
activité, aussi bien concernant la science et l’avancement de nos produits, que la propriété
intellectuelle ou notre activité commerciale. Bien sûr il reste encore beaucoup à faire et tous
nos objectifs n’ont pas encore été atteints. Toutefois, nous sommes convaincus, plus que
jamais, que nous sommes au centre d’un modèle économique efficace et de technologies
maîtresses de rupture radicale. Notre réussite repose particulièrement sur les personnes qui
constituent notre groupe, nos ressources, notre culture de l’excellence et notre vision de
l’industrie des biotechnologies pour construire un groupe de taille mondiale.
Dr. André Choulika, Directeur général
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 5
Le mot du Directeur général
2010 une année de construction
Nous vivons une époque où l’essence même de la biotechnologie se redéfinit. Le dogme
central de la biotechnologie repose sur l’utilisation du vivant pour transformer des produits
de façon industrielle. Cette notion a connu une révolution à la fin des années 1970 avec la
découverte de l’ADN recombinant et la production de protéines à visées thérapeutiques.
Cette révolution est basée sur la capacité de l’homme à modifier des fragments d’ADN dans
des tubes à essais et à réintroduire le produit de cette ingénierie dans des cellules dont le
programme génétique sera ainsi changé.
Aujourd’hui nous entamons une nouvelle étape de cette révolution biotechnologique.
Modifier le programme génétique des cellules ne se fait plus au hasard mais de façon
rationnelle. De manipulations génétiques résultant d’un « bricolage » du vivant, nous
sommes passés à une science d’ingénierie. La programmation de l’ADN résulte désormais
d’une connaissance parfaite de l’ensemble de la séquence du génome dans le but d’obtenir
un résultat prédictible, fiable et précis.
Une révolution silencieuse
Les projections dans le monde des biotechnologies sont souvent optimistes. Mais la vitesse
à laquelle l’homme a déchiffré l’ADN du génome humain, ainsi que l’ADN de toute espèce,
surpasse chaque fois toutes les prévisions. Nous sommes à la veille d’une nouvelle ère où
l’information génétique sera accessible à tous. On estime que d’ici 2013, le déchiffrage d’un
génome humain coûtera moins de 1 000 euros par personne et sera réalisé en moins de
quatre semaines. D’ici quelques années, des millions de personnes auront leur génome
déchiffré et disponible pour une médecine personnalisée. En aval de cette vague se trouve
l’ingénierie des génomes. C’est grâce aux technologies développées par Cellectis que les
défauts du génome, innés ou acquis, pourront être soignés. L’ingénierie des génomes
génèrera de nombreux produits novateurs et prendra le relais des ressources fossiles et
chimiques. Cette ressource, issue du vivant, est le gisement de croissance et de développe-
ment durable pour les prochaines décennies.
Chef de file en ingénierie des génomes
Cellectis détient une position forte dans ce secteur industriel en émergence. Nous dévelop-
pons de nouvelles classes de produits thérapeutiques qui auront le potentiel de transformer
la façon dont les maladies sont traitées et de guérir des maladies aujourd’hui incurables.
Nous mettons aussi au point des produits pour la recherche, la production de biopharma-
ceutiques, l’agriculture biotechnologique, les cellules souches induites et plus récemment
dans le domaine des carburants alternatifs. Notre approche de la biotechnologie est en passe
de changer la donne de cette industrie et d’apporter un relais d’innovation et de croissance
inépuisable pour notre société.
4 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l
Croissance et développement
En 2010, nous avons fait de nombreuses acquisitions qui nous apportent la promesse de
nouveautés technologiques et qui viennent ainsi enrichir notre portefeuille de propriété
intellectuelle. Par exemple, nous avons acheté en septembre les actifs de la société CytoPulse,
spécialisée dans les systèmes d’électroporation, une technique qui va nous permettre de faire
pénétrer les méganucléases, ou d’autres molécules, dans de nombreux types de cellules. Nous
avons également pris la décision de continuer les partenariats débutés par CytoPulse et béné-
ficions ainsi de l’octroi des licences d’exploitation de la technologie d’électroporation.
En effet, une partie de notre stratégie de développement repose sur l’acquisition de techno-
logies complémentaires de nos technologies d’ingénierie des génomes, et qui peuvent être
utilisées dans tous les domaines d’application, de la recherche au thérapeutique. Dans cette
dynamique nous avons aussi acquis des droits de licence non exclusifs qui nous donnent accès
à la technologie des cellules souches pluripotentes induites (iPS) découlant des travaux
du Professeur Shinya Yamanaka, de l’Université de Kyoto. Cellectis est la première société au
monde à bénéficier de licences pour des applications thérapeutiques ou prophylactiques
humaines sur ce portefeuille et mettra ces technologies au service de sa filiale Ectycell, afin
d’en faire un acteur mondial du domaine.
Innovation et performance
Cette année, nous avons fait des progrès considérables dans des secteurs clés de notre
activité, aussi bien concernant la science et l’avancement de nos produits, que la propriété
intellectuelle ou notre activité commerciale. Bien sûr il reste encore beaucoup à faire et tous
nos objectifs n’ont pas encore été atteints. Toutefois, nous sommes convaincus, plus que
jamais, que nous sommes au centre d’un modèle économique efficace et de technologies
maîtresses de rupture radicale. Notre réussite repose particulièrement sur les personnes qui
constituent notre groupe, nos ressources, notre culture de l’excellence et notre vision de
l’industrie des biotechnologies pour construire un groupe de taille mondiale.
Dr. André Choulika, Directeur général
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 5
 TEMPS FORTS 2010
Cellectis et l’Institut National de la
janvier
Recherche Agronomique (INRA)
signent un accord de coopération.
Cellectis et l’INRA souhaitent collaborer
dans les domaines de la biologie
cellulaire et des biotechnologies végé- Thierry Morin, Président du Conseil
tales et animales. Ils souhaitent
favoriser à la fois la synergie entre leurs
compétences, lorsque cela est possible,
l’acquisition de connaissances scienti- Ces trophées, remis chaque année par
fiques nouvelles, la production
d’innovations technologiques ainsi que
la diffusion de ces résultats et connais-
sances et leur transfert technologique
vers les entreprises, notamment
les PME-PMI des secteurs de l’agro-
alimentaire, de l’agriculture et de
l’environnement.
6 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Cellectis reçoit le trophée national
janvier
mars
de l’Innovation 2009 de l’INPI.
Cellectis a reçu un trophée national de
l’Innovation décerné par l’Institut
National de la Propriété Industrielle (INPI).
d’administration de l’INPI a remis ce
prix à Michèle Paquier, responsable de
la Propriété Intellectuelle de Cellectis.
l’INPI depuis 1991, récompensent les
PME-PMI qui se développent grâce à
leur politique en matière d’innovation
et qui utilisent la propriété industrielle
comme levier de croissance. « Cellectis
représente un équilibre remarquable
entre des activités de recherche et une
gestion saine » a déclaré Thierry Morin.  
l l
Cellectis crée Cellectis plant sciences,
avril
une filiale dédiée aux applications de
l’ingénierie des génomes dans les plantes.
Cette filiale a pour principales missions
de généraliser et accélérer l’exploitation
des technologies de Cellectis en agro-
biologie, d’élargir les compétences de la
société afin de provoquer de nouvelles
opportunités, d’octroyer des licences
plus étendues et d’amorcer le dévelop-
pement de traits propriétaires pour des
applications choisies. Cellectis plant
sciences est implantée à Minneapolis
(Minnesota), aux Etats-Unis, dans des
laboratoires à proximité de l’Université
du Minnesota et de ses serres. Son
Directeur scientifique, le Professeur
Daniel Voytas, actuellement Directeur
du Centre d’ingénierie des génomes
de l’Université du Minnesota, est un
scientifique de renommée internationale
et un expert reconnu en ingénierie des
génomes de plantes.
Une nouvelle publication détaille
juin
l’activité in vivo de méganucléases
Cellectis dans des fibres musculaires.
Les chercheurs du Centre hospitalo-
universitaire de Laval, au Québec, ont
utilisé des méganucléases ingénierées
par Cellectis pour restaurer l’expression
de la microdystrophine in vitro, dans
des myoblastes humains, et in vivo,
dans des fibres musculaires. Ils ont ainsi utilisera ses méganucléases pour inac-
démontré le potentiel des méganuclé-
ases dans le traitement de la myopathie
de Duchenne, une maladie héréditaire
qui se caractérise par une dégénéres-
cence rapide du tissu musculaire
conduisant à terme à une perte de
mobilité et à la mort. Les résultats de
cette étude ont été publiés dans
la revue scientifique Gene Therapy.
Cellectis bioresearch et Lonza concluent
juillet
un accord de développement et de
commercialisation de lignées cellulaires.
Cellectis bioresearch et Lonza, un
leader mondial de la production bio-
technologique, ont signé un contrat
portant sur le développement et la
commercialisation de lignées cellulaires
bio-ingénierées. Cellectis bioresearch
tiver la glutamine synthétase (GS) dans
la lignée CHOK1SV, lignée hôte dont
Lonza est propriétaire. John Birch, CSO
de Lonza Biopharmaceuticals, a déclaré
« nous sommes ravis de travailler avec
Cellectis bioresearch. Cette collabora-
tion est logique et va booster GS, notre
technologie majeure, qui rencontre déjà
un fort succès ».  
Représentation stylisée
d’une méganucléase.
L’intégration ciblée induite par
les méganucléases via le kit cGPS®
CHO-K1 de Cellectis bioresearch
confirme ses avantages pour
la mise au point de médicaments.
Une étude scientifique portant sur une
méthode originale de génération de
lignées cellulaires stables utilisables pour
le criblage à haut débit (HTS) a été
publiée dans la revue Journal of
Biomolecular Screening. Cette étude
montre que la technologie mise au point
par Cellectis bioresearch, basée sur
l’intégration ciblée à l’aide de méga-
nucléases, s’avère un moyen plus
rapide, plus pratique et plus efficace
que les méthodes classiques pour
mettre au point des tests cellulaires
pour les études de HTS.
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 7
 TEMPS FORTS 2010
Cellectis et l’Institut National de la
janvier
Recherche Agronomique (INRA)
signent un accord de coopération.
Cellectis et l’INRA souhaitent collaborer
dans les domaines de la biologie
cellulaire et des biotechnologies végé- Thierry Morin, Président du Conseil
tales et animales. Ils souhaitent
favoriser à la fois la synergie entre leurs
compétences, lorsque cela est possible,
l’acquisition de connaissances scienti- Ces trophées, remis chaque année par
fiques nouvelles, la production
d’innovations technologiques ainsi que
la diffusion de ces résultats et connais-
sances et leur transfert technologique
vers les entreprises, notamment
les PME-PMI des secteurs de l’agro-
alimentaire, de l’agriculture et de
l’environnement.
6 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Cellectis reçoit le trophée national
janvier
mars
de l’Innovation 2009 de l’INPI.
Cellectis a reçu un trophée national de
l’Innovation décerné par l’Institut
National de la Propriété Industrielle (INPI).
d’administration de l’INPI a remis ce
prix à Michèle Paquier, responsable de
la Propriété Intellectuelle de Cellectis.
l’INPI depuis 1991, récompensent les
PME-PMI qui se développent grâce à
leur politique en matière d’innovation
et qui utilisent la propriété industrielle
comme levier de croissance. « Cellectis
représente un équilibre remarquable
entre des activités de recherche et une
gestion saine » a déclaré Thierry Morin.  
l l
Cellectis crée Cellectis plant sciences,
avril
une filiale dédiée aux applications de
l’ingénierie des génomes dans les plantes.
Cette filiale a pour principales missions
de généraliser et accélérer l’exploitation
des technologies de Cellectis en agro-
biologie, d’élargir les compétences de la
société afin de provoquer de nouvelles
opportunités, d’octroyer des licences
plus étendues et d’amorcer le dévelop-
pement de traits propriétaires pour des
applications choisies. Cellectis plant
sciences est implantée à Minneapolis
(Minnesota), aux Etats-Unis, dans des
laboratoires à proximité de l’Université
du Minnesota et de ses serres. Son
Directeur scientifique, le Professeur
Daniel Voytas, actuellement Directeur
du Centre d’ingénierie des génomes
de l’Université du Minnesota, est un
scientifique de renommée internationale
et un expert reconnu en ingénierie des
génomes de plantes.
Une nouvelle publication détaille
juin
l’activité in vivo de méganucléases
Cellectis dans des fibres musculaires.
Les chercheurs du Centre hospitalo-
universitaire de Laval, au Québec, ont
utilisé des méganucléases ingénierées
par Cellectis pour restaurer l’expression
de la microdystrophine in vitro, dans
des myoblastes humains, et in vivo,
dans des fibres musculaires. Ils ont ainsi utilisera ses méganucléases pour inac-
démontré le potentiel des méganuclé-
ases dans le traitement de la myopathie
de Duchenne, une maladie héréditaire
qui se caractérise par une dégénéres-
cence rapide du tissu musculaire
conduisant à terme à une perte de
mobilité et à la mort. Les résultats de
cette étude ont été publiés dans
la revue scientifique Gene Therapy.
Cellectis bioresearch et Lonza concluent
juillet
un accord de développement et de
commercialisation de lignées cellulaires.
Cellectis bioresearch et Lonza, un
leader mondial de la production bio-
technologique, ont signé un contrat
portant sur le développement et la
commercialisation de lignées cellulaires
bio-ingénierées. Cellectis bioresearch
tiver la glutamine synthétase (GS) dans
la lignée CHOK1SV, lignée hôte dont
Lonza est propriétaire. John Birch, CSO
de Lonza Biopharmaceuticals, a déclaré
« nous sommes ravis de travailler avec
Cellectis bioresearch. Cette collabora-
tion est logique et va booster GS, notre
technologie majeure, qui rencontre déjà
un fort succès ».  
Représentation stylisée
d’une méganucléase.
L’intégration ciblée induite par
les méganucléases via le kit cGPS®
CHO-K1 de Cellectis bioresearch
confirme ses avantages pour
la mise au point de médicaments.
Une étude scientifique portant sur une
méthode originale de génération de
lignées cellulaires stables utilisables pour
le criblage à haut débit (HTS) a été
publiée dans la revue Journal of
Biomolecular Screening. Cette étude
montre que la technologie mise au point
par Cellectis bioresearch, basée sur
l’intégration ciblée à l’aide de méga-
nucléases, s’avère un moyen plus
rapide, plus pratique et plus efficace
que les méthodes classiques pour
mettre au point des tests cellulaires
pour les études de HTS.
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 7
 Cellectis acquiert tous les actifs de Les produits Cellectis bioresearch sont Cellectis lance son nouveau site internet - Cellectis bioresearch annonce l’ouverture Cellectis obtient des licences pour Cellectis accorde à Harvard Bioscience
septembre

septembre

septembre

octobre

octobre

CytoPulse Sciences Inc.
CytoPulse est spécialisée dans le
développement, la fabrication et la
commercialisation de technologies
et d’instruments d’électroporation.
L’électroporation est une technique
particulièrement efficace d’introduction
de molécules, telles que des méga-
nucléases, dans n’importe quel type chercheurs académiques ou industriels.
de cellules. Elle présente de multiples
applications, de la recherche au
thérapeutique, en passant par la biopro-
duction et l’agriculture. « Les actifs de
CytoPulse représentent un acquis stra-
tégique pour Cellectis », a déclaré André
Choulika, Directeur général de Cellectis.
« Comme nous l’avions annoncé en
2009, une partie de notre stratégie de
développement repose sur l’acquisition
de technologies complémentaires de
notre plateforme de méganucléases, et
qui peuvent être utilisées dans tous les
domaines d’application. CytoPulse repré-
sente une telle opportunité et nous allons
rapidement valoriser cette acquisition. »
accessibles en ligne. Une nouvelle plate-
forme ouvre l’accès à la technologie et création d’un espace presse.
des méganucléases à tous les utilisateurs.
Cellectis bioresearch lance son e-store,
proposant à la vente en ligne, via
un nouveau site web performant et
intuitif, une centaine de produits prêts
à l’emploi et répondant aux besoins des
« Le lancement d’un site web offrant
la possibilité d’acheter en ligne était
une étape nécessaire pour favoriser
l’accès à la technologie des méganu-
cléases,» a déclaré Luc Selig, Directeur
Ventes et Marketing de Cellectis bio-
research. « Notre offre de produits s’est
élargie rapidement, nous commerciali-
sons aujourd’hui plus de cent produits
différents, sur nos trois marchés cibles. »
Partage de l’information, interactivité
Ce nouveau site web garantira à ses
visiteurs une utilisation et un partage
de contenus améliorés, avec un sera responsable de la promotion dans le domaine thérapeutique.
accès plus simple et plus pratique aux
informations sur la technologie et bioresearch sur le territoire américain.
les produits de Cellectis. Ce nouveau
site internet de Cellectis s’organise
autour de trois thèmes principaux :
recherche et technologie, business
development, relations investisseurs.
d’une filiale aux Etats-Unis.
Située au sein du Cambridge Innovation
Center à Cambridge (Massachussetts,
Etats-Unis), Cellectis bioresearch Inc.
des produits et services de Cellectis
décembre
l’utilisation des technologies de une licence sur les instruments
cellules souches pluripotentes induites d’électroporation de CytoPulse.
d’iPS Academia Japan. Cellectis et Harvard Apparatus, une
Premières licences délivrées à une société division de Harvard Bioscience Inc.
qui développe, manufacture et com-
La signature de deux accords de licence mercialise au niveau mondial une large
non exclusifs donnera à Cellectis, pour gamme d’outils pour la recherche en
le monde entier, un accès au portefeuille sciences de la vie et en médecine régé-
de brevets sur les cellules souches plu- nérative, ont signé un accord de licence
ripotentes induites (iPS ) découlant des qui octroie à Harvard Apparatus un
travaux du Professeur Shinya Yamanaka, droit exclusif mondial de fabrication
du Centre de recherche et d’application et de commercialisation, à des fins
des iPS (CiRA) de l’Université de Kyoto. de recherche, des instruments d’électro-
Cellectis est la première société au poration que Cellectis a acquis de
monde à bénéficier de licences pour CytoPulse en septembre 2010. Cellectis
des applications thérapeutiques ou conservera néanmoins tous les droits
prophylactiques humaines sur ce porte- d’utilisation de ces derniers dans le cadre
feuille d’iPS Academia Japan. Dans le de ses programmes de R&D, ainsi que
domaine des outils de recherche, cet pour les essais cliniques et procédures
accord est le premier avec une société prophylactiques ou thérapeutiques,
française, suivant des accords avec des à application humaine et animale.
sociétés américaines et allemandes.

8 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 9

 Cellectis acquiert tous les actifs de Les produits Cellectis bioresearch sont Cellectis lance son nouveau site internet - Cellectis bioresearch annonce l’ouverture Cellectis obtient des licences pour Cellectis accorde à Harvard Bioscience
septembre

septembre

septembre

octobre

octobre

CytoPulse Sciences Inc.
CytoPulse est spécialisée dans le
développement, la fabrication et la
commercialisation de technologies
et d’instruments d’électroporation.
L’électroporation est une technique
particulièrement efficace d’introduction
de molécules, telles que des méga-
nucléases, dans n’importe quel type chercheurs académiques ou industriels.
de cellules. Elle présente de multiples
applications, de la recherche au
thérapeutique, en passant par la biopro-
duction et l’agriculture. « Les actifs de
CytoPulse représentent un acquis stra-
tégique pour Cellectis », a déclaré André
Choulika, Directeur général de Cellectis.
« Comme nous l’avions annoncé en
2009, une partie de notre stratégie de
développement repose sur l’acquisition
de technologies complémentaires de
notre plateforme de méganucléases, et
qui peuvent être utilisées dans tous les
domaines d’application. CytoPulse repré-
sente une telle opportunité et nous allons
rapidement valoriser cette acquisition. »
accessibles en ligne. Une nouvelle plate-
forme ouvre l’accès à la technologie et création d’un espace presse.
des méganucléases à tous les utilisateurs.
Cellectis bioresearch lance son e-store,
proposant à la vente en ligne, via
un nouveau site web performant et
intuitif, une centaine de produits prêts
à l’emploi et répondant aux besoins des
« Le lancement d’un site web offrant
la possibilité d’acheter en ligne était
une étape nécessaire pour favoriser
l’accès à la technologie des méganu-
cléases,» a déclaré Luc Selig, Directeur
Ventes et Marketing de Cellectis bio-
research. « Notre offre de produits s’est
élargie rapidement, nous commerciali-
sons aujourd’hui plus de cent produits
différents, sur nos trois marchés cibles. »
Partage de l’information, interactivité
Ce nouveau site web garantira à ses
visiteurs une utilisation et un partage
de contenus améliorés, avec un sera responsable de la promotion dans le domaine thérapeutique.
accès plus simple et plus pratique aux
informations sur la technologie et bioresearch sur le territoire américain.
les produits de Cellectis. Ce nouveau
site internet de Cellectis s’organise
autour de trois thèmes principaux :
recherche et technologie, business
development, relations investisseurs.
d’une filiale aux Etats-Unis.
Située au sein du Cambridge Innovation
Center à Cambridge (Massachussetts,
Etats-Unis), Cellectis bioresearch Inc.
des produits et services de Cellectis
décembre
l’utilisation des technologies de une licence sur les instruments
cellules souches pluripotentes induites d’électroporation de CytoPulse.
d’iPS Academia Japan. Cellectis et Harvard Apparatus, une
Premières licences délivrées à une société division de Harvard Bioscience Inc.
qui développe, manufacture et com-
La signature de deux accords de licence mercialise au niveau mondial une large
non exclusifs donnera à Cellectis, pour gamme d’outils pour la recherche en
le monde entier, un accès au portefeuille sciences de la vie et en médecine régé-
de brevets sur les cellules souches plu- nérative, ont signé un accord de licence
ripotentes induites (iPS ) découlant des qui octroie à Harvard Apparatus un
travaux du Professeur Shinya Yamanaka, droit exclusif mondial de fabrication
du Centre de recherche et d’application et de commercialisation, à des fins
des iPS (CiRA) de l’Université de Kyoto. de recherche, des instruments d’électro-
Cellectis est la première société au poration que Cellectis a acquis de
monde à bénéficier de licences pour CytoPulse en septembre 2010. Cellectis
des applications thérapeutiques ou conservera néanmoins tous les droits
prophylactiques humaines sur ce porte- d’utilisation de ces derniers dans le cadre
feuille d’iPS Academia Japan. Dans le de ses programmes de R&D, ainsi que
domaine des outils de recherche, cet pour les essais cliniques et procédures
accord est le premier avec une société prophylactiques ou thérapeutiques,
française, suivant des accords avec des à application humaine et animale.
sociétés américaines et allemandes.

8 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 9

 CELLECTIS EN BREF

Cellectis améliore la vie des hommes en appliquant son expertise

en ingénierie des génomes à un large spectre d’applications incluant
la santé humaine, la recherche biologique et l’agriculture.
L’entreprise conçoit et commercialise des
outils innovants, des nucléases ou « ciseaux
à ADN » tels que les méganucléases,
permettant d’intervenir de façon maîtrisée
sur le génome, ainsi que des produits
résultant de cette ingénierie. Cellectis a pour
but d’exploiter tout le potentiel de cette
technologie en médecine et dans d’autres
secteurs de la recherche scientifique ou
industrielle.
Fondée en 2000 par André Choulika et
David Sourdive, docteurs en sciences, Cellectis
a acquis dès sa création des droits exclusifs
sur un portefeuille de brevets de l’Institut
Pasteur. Le professeur Rodney Rothstein
(Columbia University) préside son conseil
scientifique, composé de scientifiques de
renommée internationale.
A ce jour, Cellectis a conclu plus de 50 con-
trats avec des laboratoires pharmaceutiques,
des semenciers et des entreprises de biotech-
nologies du monde entier, et signé plus de
20 partenariats en recherche académique.
Cellectis est cotée depuis 2007 sur le marché
Alternext de NYSE-Euronext à Paris et a
levé plus de 70 millions d’euros de capitaux
depuis sa création. Tout en maintenant des
objectifs de croissance ambitieux, la société
bénéficie d’une trésorerie très solide grâce
à l’augmentation des revenus provenant
des ventes de produits, de la production
de méganucléases, des partenariats et des
accords de licences.
Travaillant depuis plus de 10 ans sur les
méganucléases, Cellectis a acquis une expéri-
ence inégalée dans le domaine de l’ingénierie
des génomes. Les équipes de R&D et de la
plateforme de méganucléases ont toutes les
qualités et compétences requises pour intégrer
de nouvelles technologies complémentaires
qui permettraient d’enrichir l’offre de Cellectis.
Pionnier de l’ingénierie des génomes
Fondée en 1999, cotée sur le marché
Alternext de NYSE-Euronext à Paris
depuis 2007 (ALCLS)
Chiffre d’affaires 2010 : 15,8 M   €
Personnel : 129 personnes dont 51 PhD
4 filiales : Cellectis bioresearch, Cellectis
therapeutics, Cellectis plant sciences,
Ectycell
Applications : recherche et bioproduction,
santé humaine, agriculture biotechnologique,
cellules souches
Technologies principales : ingénierie des
génomes, ingénierie des protéines (notam-
ment les nucléases ou ciseaux à ADN)
Propriété intellectuelle : 83 brevets attri-
bués et plus de 260 demandes de brevets
en cours
Localisations : Paris (France) ; Saint Paul,
Minnesota (Etats-Unis) ; Cambridge,
Massachusetts (Etats-Unis)
au 31 déc. 2010

CELLECTIS EN BREF

10 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 11

 CELLECTIS EN BREF

Cellectis améliore la vie des hommes en appliquant son expertise

en ingénierie des génomes à un large spectre d’applications incluant
la santé humaine, la recherche biologique et l’agriculture.
L’entreprise conçoit et commercialise des
outils innovants, des nucléases ou « ciseaux
à ADN » tels que les méganucléases,
permettant d’intervenir de façon maîtrisée
sur le génome, ainsi que des produits
résultant de cette ingénierie. Cellectis a pour
but d’exploiter tout le potentiel de cette
technologie en médecine et dans d’autres
secteurs de la recherche scientifique ou
industrielle.
Fondée en 2000 par André Choulika et
David Sourdive, docteurs en sciences, Cellectis
a acquis dès sa création des droits exclusifs
sur un portefeuille de brevets de l’Institut
Pasteur. Le professeur Rodney Rothstein
(Columbia University) préside son conseil
scientifique, composé de scientifiques de
renommée internationale.
A ce jour, Cellectis a conclu plus de 50 con-
trats avec des laboratoires pharmaceutiques,
des semenciers et des entreprises de biotech-
nologies du monde entier, et signé plus de
20 partenariats en recherche académique.
Cellectis est cotée depuis 2007 sur le marché
Alternext de NYSE-Euronext à Paris et a
levé plus de 70 millions d’euros de capitaux
depuis sa création. Tout en maintenant des
objectifs de croissance ambitieux, la société
bénéficie d’une trésorerie très solide grâce
à l’augmentation des revenus provenant
des ventes de produits, de la production
de méganucléases, des partenariats et des
accords de licences.
Travaillant depuis plus de 10 ans sur les
méganucléases, Cellectis a acquis une expéri-
ence inégalée dans le domaine de l’ingénierie
des génomes. Les équipes de R&D et de la
plateforme de méganucléases ont toutes les
qualités et compétences requises pour intégrer
de nouvelles technologies complémentaires
qui permettraient d’enrichir l’offre de Cellectis.
Pionnier de l’ingénierie des génomes
Fondée en 1999, cotée sur le marché
Alternext de NYSE-Euronext à Paris
depuis 2007 (ALCLS)
Chiffre d’affaires 2010 : 15,8 M   €
Personnel : 129 personnes dont 51 PhD
4 filiales : Cellectis bioresearch, Cellectis
therapeutics, Cellectis plant sciences,
Ectycell
Applications : recherche et bioproduction,
santé humaine, agriculture biotechnologique,
cellules souches
Technologies principales : ingénierie des
génomes, ingénierie des protéines (notam-
ment les nucléases ou ciseaux à ADN)
Propriété intellectuelle : 83 brevets attri-
bués et plus de 260 demandes de brevets
en cours
Localisations : Paris (France) ; Saint Paul,
Minnesota (Etats-Unis) ; Cambridge,
Massachusetts (Etats-Unis)
au 31 déc. 2010

CELLECTIS EN BREF

10 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 11

Notre métier : l’ingénierie des génomes

Le principe de l‘ingénierie des génomes est simple : intervenir sur de fixation par une suite d’acides nucléiques (les composants de l’ADN) de 12 à plus de 30
paires de bases, ce site étant statistiquement unique dans un génome. Une fois la cassure de
le patrimoine génétique d‘un individu ou d‘une espèce pour l’ADN réalisée, la cellule active son système de maintenance et de réparation (par exemple,
comprendre son fonctionnement, produire une protéine utile ou la recombinaison homologue). Ce système corrige la molécule d’ADN en se servant comme
soigner une maladie. modèle, par exemple, de sa copie jumelle (correction d’un gène) ou d’un fragment spécifique-
ment introduit dans la cellule (insertion ou « knock-in »). C’est l’équivalent du « copier-coller »
La génétique a mis en évidence le lien entre les caractères physiques d’espèces et leurs gènes d’un logiciel de traitement de texte. Lorsqu’il s’agit seulement d’inactiver un gène, et non de
et a ainsi démontré l’implication de gènes donnés dans certaines maladies ou caractères. le remplacer, l’ADN cassé est ligaturé et perd de l’information, le gène visé étant ainsi inactivé
L’ingénierie des génomes permet de modifier les gènes des espèces dans le but de modifier (principe du « knock-out »).
les différents caractères, de corriger une erreur ou d’apporter un trait d’intérêt économique
ou physiologique. Cette démarche n’est pas nouvelle. Le croisement de différentes plantes Cellectis crée des méganucléases qui coupent de nouvelles séquences, c’est à dire des
ou la sélection des meilleures bêtes pour la reproduction tient de ce principe : on améliore une méganucléases « à façon » pour des gènes d’intérêt. Cette ingénierie des méganucléases
espèce afin qu’elle ait les meilleures caractéristiques possibles comme des plantes plus permet de produire toute une panoplie d’outils spécifiques pour modifier les gènes ciblés.
tolérantes à la sécheresse ou résistantes aux maladies par exemple. C’est sur ce pari technologique qu’a été créée Cellectis il y a 11 ans. Ce pari a été gagné
L’approche ciblée de l’ingénierie des génomes est prédictible, plus fiable et plus efficace que lorsque l’équipe de la plateforme fut capable de produire des méganucléases sur mesure
les techniques précédemment utilisées, et peut être appliquée à l’homme. Aujourd’hui les spécifiques de n’importe quel gène d’intérêt, tout en gardant les mêmes caractéristiques
génomes de plus de 1 000 organismes ont été déchiffrés. Nous connaissons donc de mieux que les méganucléases sauvages (efficacité, spécificité, …). Cette maitrise de la production
en mieux la séquence ainsi que la localisation des gènes des êtres vivants, même si leur d’outils d’ingénierie des génomes permet aujourd’hui à Cellectis d’évoluer dans la chaine
fonctionnement recèle encore bien des mystères. Cet ensemble de connaissances permet des valeurs pour fournir des produits finis à forte valeur ajoutée.
d’agir directement sur les gènes. Trois stratégies différentes sont possibles :
• L’insertion permet l’ajout dans le génome d’un nouveau caractère, par exemple pour
produire un médicament biologique ou pallier un défaut génétique comme l’hémophilie. Méganuclease
• La correction permet de remplacer une séquence défectueuse existante (qui impacte la
Chromosome
fonction du gène) par une séquence fonctionnelle. Par exemple pour guérir
une maladie génétique grave comme la myopathie de Duchenne. Couper
• L’inactivation permet d’empêcher l’expression d’un gène. Cette approche peut être
utilisée pour guérir des infections virales persistantes telles que le SIDA ou l’herpès.

Insertion d’un gène CORRECTION Inactivation d’un gène

Notre outil : Les méganucléases KNOCK IN D’UN GENE KNOCK OUT
Le pouvoir effectif de l’ingénierie des génomes par rapport aux technologies précédemment
employées réside dans la capacité d’insérer le gène d’intérêt à un endroit choisi. Pendant
longtemps, les chercheurs ont « joué aux fléchettes les yeux bandés » en étudiant l’effet de
séquences insérées de façon aléatoire. Pourtant, les conséquences d’une mauvaise insertion Perte de
peuvent être délétères. Un gène peut s’insérer au milieu d’un autre et le désactiver, ou au quelques paires
Matrice d’insertion Matrice de réparation de bases
contraire activer des mécanismes cancéreux. C’est l’avantage concurrentiel de Cellectis.
Grâce à sa maîtrise des méganucléases, Cellectis est capable de cibler parfaitement un point Coller
précis du génome. Cellectis permet aux scientifiques d’obtenir la précision qui leur manquait.
Les méganucléases sont des protéines naturelles présentes dans de nombreux organismes Recombinaison Recombinaison Ligature non
monocellulaires. Ce sont des « ciseaux à ADN » très spécifiques. Elles reconnaissent leur site homologue homologue homologue (NHEJ)

12 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 13

Notre métier : l’ingénierie des génomes

Le principe de l‘ingénierie des génomes est simple : intervenir sur de fixation par une suite d’acides nucléiques (les composants de l’ADN) de 12 à plus de 30
paires de bases, ce site étant statistiquement unique dans un génome. Une fois la cassure de
le patrimoine génétique d‘un individu ou d‘une espèce pour l’ADN réalisée, la cellule active son système de maintenance et de réparation (par exemple,
comprendre son fonctionnement, produire une protéine utile ou la recombinaison homologue). Ce système corrige la molécule d’ADN en se servant comme
soigner une maladie. modèle, par exemple, de sa copie jumelle (correction d’un gène) ou d’un fragment spécifique-
ment introduit dans la cellule (insertion ou « knock-in »). C’est l’équivalent du « copier-coller »
La génétique a mis en évidence le lien entre les caractères physiques d’espèces et leurs gènes d’un logiciel de traitement de texte. Lorsqu’il s’agit seulement d’inactiver un gène, et non de
et a ainsi démontré l’implication de gènes donnés dans certaines maladies ou caractères. le remplacer, l’ADN cassé est ligaturé et perd de l’information, le gène visé étant ainsi inactivé
L’ingénierie des génomes permet de modifier les gènes des espèces dans le but de modifier (principe du « knock-out »).
les différents caractères, de corriger une erreur ou d’apporter un trait d’intérêt économique
ou physiologique. Cette démarche n’est pas nouvelle. Le croisement de différentes plantes Cellectis crée des méganucléases qui coupent de nouvelles séquences, c’est à dire des
ou la sélection des meilleures bêtes pour la reproduction tient de ce principe : on améliore une méganucléases « à façon » pour des gènes d’intérêt. Cette ingénierie des méganucléases
espèce afin qu’elle ait les meilleures caractéristiques possibles comme des plantes plus permet de produire toute une panoplie d’outils spécifiques pour modifier les gènes ciblés.
tolérantes à la sécheresse ou résistantes aux maladies par exemple. C’est sur ce pari technologique qu’a été créée Cellectis il y a 11 ans. Ce pari a été gagné
L’approche ciblée de l’ingénierie des génomes est prédictible, plus fiable et plus efficace que lorsque l’équipe de la plateforme fut capable de produire des méganucléases sur mesure
les techniques précédemment utilisées, et peut être appliquée à l’homme. Aujourd’hui les spécifiques de n’importe quel gène d’intérêt, tout en gardant les mêmes caractéristiques
génomes de plus de 1 000 organismes ont été déchiffrés. Nous connaissons donc de mieux que les méganucléases sauvages (efficacité, spécificité, …). Cette maitrise de la production
en mieux la séquence ainsi que la localisation des gènes des êtres vivants, même si leur d’outils d’ingénierie des génomes permet aujourd’hui à Cellectis d’évoluer dans la chaine
fonctionnement recèle encore bien des mystères. Cet ensemble de connaissances permet des valeurs pour fournir des produits finis à forte valeur ajoutée.
d’agir directement sur les gènes. Trois stratégies différentes sont possibles :
• L’insertion permet l’ajout dans le génome d’un nouveau caractère, par exemple pour
produire un médicament biologique ou pallier un défaut génétique comme l’hémophilie. Méganuclease
• La correction permet de remplacer une séquence défectueuse existante (qui impacte la
Chromosome
fonction du gène) par une séquence fonctionnelle. Par exemple pour guérir
une maladie génétique grave comme la myopathie de Duchenne. Couper
• L’inactivation permet d’empêcher l’expression d’un gène. Cette approche peut être
utilisée pour guérir des infections virales persistantes telles que le SIDA ou l’herpès.

Insertion d’un gène CORRECTION Inactivation d’un gène

Notre outil : Les méganucléases KNOCK IN D’UN GENE KNOCK OUT
Le pouvoir effectif de l’ingénierie des génomes par rapport aux technologies précédemment
employées réside dans la capacité d’insérer le gène d’intérêt à un endroit choisi. Pendant
longtemps, les chercheurs ont « joué aux fléchettes les yeux bandés » en étudiant l’effet de
séquences insérées de façon aléatoire. Pourtant, les conséquences d’une mauvaise insertion Perte de
peuvent être délétères. Un gène peut s’insérer au milieu d’un autre et le désactiver, ou au quelques paires
Matrice d’insertion Matrice de réparation de bases
contraire activer des mécanismes cancéreux. C’est l’avantage concurrentiel de Cellectis.
Grâce à sa maîtrise des méganucléases, Cellectis est capable de cibler parfaitement un point Coller
précis du génome. Cellectis permet aux scientifiques d’obtenir la précision qui leur manquait.
Les méganucléases sont des protéines naturelles présentes dans de nombreux organismes Recombinaison Recombinaison Ligature non
monocellulaires. Ce sont des « ciseaux à ADN » très spécifiques. Elles reconnaissent leur site homologue homologue homologue (NHEJ)

12 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 13

Notre métier : APPLICATIONS
L’universalité de l’ADN fait
que notre technologie est
applicable à toute espèce
(humaine, animale, végétale,
bactérienne ou virale) et à
tout gène d’intérêt. l’ingénierie des génomes peut également servir à lutter contre des virus comme l’herpès. Ces
Les technologies conçues et
maîtrisées par Cellectis
permettent de libérer ou de
restaurer le potentiel espoir dans la lutte contre ces maladies.
de l’ADN avec un très large
spectre d’applications.
14 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
En santé humaine
L’ingénierie des génomes est à la base de la thérapie génique. Souvent appelée «chirurgie
du génome», ce type de thérapie pourrait guérir une grande partie des maladies génétiques,
comme par exemple l’anémie falciforme (ou drépanocytose). Des recherches sont effectuées
dans ce sens en collaboration avec Cellectis au Memorial Sloan-Kettering Cancer Center à
New York, Etats-Unis. L’Inserm, le CNRS et l’AFM (Association française contre les myopa-
thies) participent aussi de près aux avancées de Cellectis dans le domaine thérapeutique. Mais
pathogènes insèrent leur ADN dans celui des cellules infectées, ce qui explique l’incapacité
du système immunitaire à s’en débarrasser de façon définitive. La capacité de Cellectis à cibler
des zones très précises du génome des virus pour les désactiver pourrait permettre de
débarrasser les cellules infectées du matériel génétique viral présent et représente donc un Les équipes de recherche
En agriculture biotechnologique
Les méganucléases peuvent être ingénieriées pour devenir spécifiques de tout gène de toute
espèce de plante. Cellectis utilise ses technologies et son expertise pour fournir aux semen-
ciers des méganucléases permettant de faire des modifications ciblées dans les génomes de
plantes et de développer la prochaine génération de plantes de culture de qualité. Aujourd’hui
Cellectis développe des accords de partenariat avec les grands acteurs du domaine de l’agri-
culture biotechnologique pour que ses approches d’ingénierie des génomes soient adoptées et
largement appliquées dans ce domaine. En 2010, Cellectis a créé Cellectis plant sciences, une
filiale dédiée aux applications de l’ingénierie des génomes dans les plantes. Cette filiale a pour
but de généraliser et d’accélérer l’exploitation de la technologie Cellectis en agrobiologie et de
produire ses propres traits pour des applications choisies.
En recherche et bioproduction
L’ingénierie des génomes est à la base de l’approche moderne de la recherche fondamentale L’équipe de la plateforme et ses robots
en biologie. La séquence de l’ensemble du génome humain est connue, ainsi que celle de plus
de mille autres espèces. Toutefois, les biologistes ignorent une grande partie du rôle des gènes
identifiés. Pour le découvrir, il est possible, grâce à des interventions ciblées sur l’ADN, d’em-
pêcher ou de réguler l’expression d’une séquence d’ADN précise. Les chercheurs comprennent
ainsi le rôle d’un gène en étudiant les effets de son absence, des variations de son expression
ou de sa structure. En bioproduction, les méganucléases présentent des avantages compétitifs
uniques dans les processus de production de protéines thérapeutiques et de réduction des
temps de cycle, mais aussi dans l’amélioration de la qualité des protéines obtenues. Des kits
sont commercialisés par Cellectis bioresearch permettant l’intégration ciblée d’un gène dans
diverses lignées cellulaires grâce à l’utilisation de méganucléases. Ils facilitent le travail des
chercheurs pour modifier l’ADN de l’espèce qu’ils étudient et permettent aux industriels de
cribler et d’évaluer l’efficacité de leur produits.
Robot Q pix, test de méganucléases sur cible Test pour la sélection de mutants Robot FX, production d’ADN en plaques
l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 15
Notre métier : APPLICATIONS
L’universalité de l’ADN fait
que notre technologie est
applicable à toute espèce
(humaine, animale, végétale,
bactérienne ou virale) et à
tout gène d’intérêt. l’ingénierie des génomes peut également servir à lutter contre des virus comme l’herpès. Ces
Les technologies conçues et
maîtrisées par Cellectis
permettent de libérer ou de
restaurer le potentiel espoir dans la lutte contre ces maladies.
de l’ADN avec un très large
spectre d’applications.
14 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
En santé humaine
L’ingénierie des génomes est à la base de la thérapie génique. Souvent appelée «chirurgie
du génome», ce type de thérapie pourrait guérir une grande partie des maladies génétiques,
comme par exemple l’anémie falciforme (ou drépanocytose). Des recherches sont effectuées
dans ce sens en collaboration avec Cellectis au Memorial Sloan-Kettering Cancer Center à
New York, Etats-Unis. L’Inserm, le CNRS et l’AFM (Association française contre les myopa-
thies) participent aussi de près aux avancées de Cellectis dans le domaine thérapeutique. Mais
pathogènes insèrent leur ADN dans celui des cellules infectées, ce qui explique l’incapacité
du système immunitaire à s’en débarrasser de façon définitive. La capacité de Cellectis à cibler
des zones très précises du génome des virus pour les désactiver pourrait permettre de
débarrasser les cellules infectées du matériel génétique viral présent et représente donc un Les équipes de recherche
En agriculture biotechnologique
Les méganucléases peuvent être ingénieriées pour devenir spécifiques de tout gène de toute
espèce de plante. Cellectis utilise ses technologies et son expertise pour fournir aux semen-
ciers des méganucléases permettant de faire des modifications ciblées dans les génomes de
plantes et de développer la prochaine génération de plantes de culture de qualité. Aujourd’hui
Cellectis développe des accords de partenariat avec les grands acteurs du domaine de l’agri-
culture biotechnologique pour que ses approches d’ingénierie des génomes soient adoptées et
largement appliquées dans ce domaine. En 2010, Cellectis a créé Cellectis plant sciences, une
filiale dédiée aux applications de l’ingénierie des génomes dans les plantes. Cette filiale a pour
but de généraliser et d’accélérer l’exploitation de la technologie Cellectis en agrobiologie et de
produire ses propres traits pour des applications choisies.
En recherche et bioproduction
L’ingénierie des génomes est à la base de l’approche moderne de la recherche fondamentale L’équipe de la plateforme et ses robots
en biologie. La séquence de l’ensemble du génome humain est connue, ainsi que celle de plus
de mille autres espèces. Toutefois, les biologistes ignorent une grande partie du rôle des gènes
identifiés. Pour le découvrir, il est possible, grâce à des interventions ciblées sur l’ADN, d’em-
pêcher ou de réguler l’expression d’une séquence d’ADN précise. Les chercheurs comprennent
ainsi le rôle d’un gène en étudiant les effets de son absence, des variations de son expression
ou de sa structure. En bioproduction, les méganucléases présentent des avantages compétitifs
uniques dans les processus de production de protéines thérapeutiques et de réduction des
temps de cycle, mais aussi dans l’amélioration de la qualité des protéines obtenues. Des kits
sont commercialisés par Cellectis bioresearch permettant l’intégration ciblée d’un gène dans
diverses lignées cellulaires grâce à l’utilisation de méganucléases. Ils facilitent le travail des
chercheurs pour modifier l’ADN de l’espèce qu’ils étudient et permettent aux industriels de
cribler et d’évaluer l’efficacité de leur produits.
Robot Q pix, test de méganucléases sur cible Test pour la sélection de mutants Robot FX, production d’ADN en plaques
l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 15
 Organisation

De 2008 à 2010, quatre filiales de Cellectis ont vu le jour. Leur mission est d’étendre le spectre des
applications de notre technologie dans le secteur industriel qui leur est attribué. La maison mère
concentre la direction des finances du groupe, la propriété intellectuelle, la direction juridique et
autres fonctions supports, ainsi que la recherche et le développement des technologies d’ingénierie
des génomes. En outre, la plateforme de production de nucléases restera le centre stratégique de
la société dans son ensemble et conservera sa place de moteur de l’activité du groupe.

Cellectis et ses filiales

CELLECTIS EN 2010 Cellectis

Développement des technologies, plateforme de production
de protéines, propriété intellectuelle, fonctions supports.

Cellectis bioresearch Cellectis therapeutics Cellectis plant sciences Ectycell

Fondée en 2008, Cellectis
bioresearch développe et
commercialise des kits de
recherche et de production
afin de rendre l’ingénierie
des génomes accessible aux
entreprises et aux
chercheurs en biologie à
l’échelle internationale.
Cette filiale propose des
solutions «clés en main»
permettant aux biologistes
de maîtriser la conception
de leurs outils de travail
quotidiens, mais aussi des
offres de services à façon.
Cellectis therapeutics, créée en
2008 sous le nom de Cellectis
genome surgery, est dédiée au
développement d’approches
thérapeutiques innovantes
utilisant les méganucléases
pour traiter des maladies
génétiques, des cancers et des
infections virales persistantes.
Cette filiale s‘emploie à déve-
lopper des traitements contre
des affections sévères résistant
aux traitements classiques. Sa
thérapie prospective cible la
séquence d’ADN responsable
de la maladie, qui peut
être d’origine innée (maladie
génétique) ou acquise
(infection virale, cancer).
Cellectis plant sciences,
créée en mars 2010,
est une filiale dédiée
aux applications des méga-
nucléases dans les plantes.
Cette filiale a pour principales
missions de généraliser et
accélérer l’exploitation de
la technologie Cellectis en
agrobiologie, d’élargir les
compétences de la société afin
de provoquer de nouvelles
opportunités, d’octroyer des
licences plus étendues et
d’amorcer le développement
de traits propriétaires
pour des applications choisies.
Ectycell a été inaugurée en
septembre 2009, elle est
dédiée à la recherche et à
la commercialisation à un
usage industriel, des cellules
souches.
Elle se consacre pour l’instant
au développement d’outils
de génération de cellules
souches pluripotentes induites
à partir de cellules adultes,
d’une différenciation
reproductible fiable de
cellules souches, et
de banques de cellules
pour le test de candidats
médicaments.

16 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 17

 Organisation

De 2008 à 2010, quatre filiales de Cellectis ont vu le jour. Leur mission est d’étendre le spectre des
applications de notre technologie dans le secteur industriel qui leur est attribué. La maison mère
concentre la direction des finances du groupe, la propriété intellectuelle, la direction juridique et
autres fonctions supports, ainsi que la recherche et le développement des technologies d’ingénierie
des génomes. En outre, la plateforme de production de nucléases restera le centre stratégique de
la société dans son ensemble et conservera sa place de moteur de l’activité du groupe.

Cellectis et ses filiales

CELLECTIS EN 2010 Cellectis

Développement des technologies, plateforme de production
de protéines, propriété intellectuelle, fonctions supports.

Cellectis bioresearch Cellectis therapeutics Cellectis plant sciences Ectycell

Fondée en 2008, Cellectis
bioresearch développe et
commercialise des kits de
recherche et de production
afin de rendre l’ingénierie
des génomes accessible aux
entreprises et aux
chercheurs en biologie à
l’échelle internationale.
Cette filiale propose des
solutions «clés en main»
permettant aux biologistes
de maîtriser la conception
de leurs outils de travail
quotidiens, mais aussi des
offres de services à façon.
Cellectis therapeutics, créée en
2008 sous le nom de Cellectis
genome surgery, est dédiée au
développement d’approches
thérapeutiques innovantes
utilisant les méganucléases
pour traiter des maladies
génétiques, des cancers et des
infections virales persistantes.
Cette filiale s‘emploie à déve-
lopper des traitements contre
des affections sévères résistant
aux traitements classiques. Sa
thérapie prospective cible la
séquence d’ADN responsable
de la maladie, qui peut
être d’origine innée (maladie
génétique) ou acquise
(infection virale, cancer).
Cellectis plant sciences,
créée en mars 2010,
est une filiale dédiée
aux applications des méga-
nucléases dans les plantes.
Cette filiale a pour principales
missions de généraliser et
accélérer l’exploitation de
la technologie Cellectis en
agrobiologie, d’élargir les
compétences de la société afin
de provoquer de nouvelles
opportunités, d’octroyer des
licences plus étendues et
d’amorcer le développement
de traits propriétaires
pour des applications choisies.
Ectycell a été inaugurée en
septembre 2009, elle est
dédiée à la recherche et à
la commercialisation à un
usage industriel, des cellules
souches.
Elle se consacre pour l’instant
au développement d’outils
de génération de cellules
souches pluripotentes induites
à partir de cellules adultes,
d’une différenciation
reproductible fiable de
cellules souches, et
de banques de cellules
pour le test de candidats
médicaments.

16 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 17

 Notre Science
Cette performance est avant tout la
conséquence de l’industrialisation de nos
procédés. Elle témoigne de l’évolution
globale de la société, de sa maturité et de son
efficacité à adapter ses structures à ses ambi-
tions. Cette capacité de production améliorée
nous donne aujourd’hui la possibilité de
positionner Cellectis en fournisseur d’outils
pour une très vaste gamme d’applications et
de produits.
Dr. Frédéric Pâques, Directeur scientifique Cependant, ces progrès dans les procédés
de fabrication ne doivent pas occulter les
L’année 2010 a été une année avancées obtenues dans l’utilisation de nos
produits. Parmi les principales, je citerai
particulièrement féconde l’implémentation de la chirurgie des génomes
en résultats et enseignements à une échelle que nous n’avions pas encore
connue. Plus de 15 collaborations avec des
dans notre cœur de métier.
laboratoires de recherche académiques à
Une des premières avancées travers le monde (HSR-TIGET à Milan, VIB
majeures a certainement été à Louvain, Children Hospital à Boston, …)
produisent à la fois des données in vitro et
la consolidation de notre
in vivo. Cette montée en puissance a deux
plateforme de production, dimensions : il s’agit d’une part du nombre
dans le but de fabriquer de méganucléases utilisées, et d’autre part
de la variété des modes d’application, et en
un nombre record de méga-
particulier des types cellulaires visés avec
nucléases (271 en 2010). succès. Les deux aspects sont en fait directe-
ment liés à l’accroissement de notre capacité
de production : au-delà de la performance,
celle-ci est capable de répondre à toute
demande, de nos clients, de nos
collaborateurs, et de nos activités internes
de recherche et développement.
18 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l
L’utilisation en 2010 de dizaines de méga-
nucléases dans des cellules immortalisées, des
plantes, des modèles animaux et des cellules
souches, est une des étapes cruciales vers la
réalisation du potentiel de la technologie de
Cellectis. L’accumulation de données par
des équipes différentes, internes ou externes,
est l’un des indicateurs de la robustesse de
cette technologie. Nombre de ces données
seront publiées tout au long de 2011.
Enfin, ces travaux nous ont permis de prendre l’efficacité du ciblage de gènes et de la
la mesure des défis qui nous attendent,
notamment en 2011, et c’est dans le
domaine thérapeutique que se situent
aujourd’hui certains des plus importants. Parmi
eux, la capacité d’apporter nos molécules
en quantité suffisante dans les cellules cibles
reste un des axes majeurs. Un autre facteur
clé est bien sûr l’innocuité de l’approche,
qui est directement liée à la spécificité de nos
méganucléases. C’est en effet dans les
applications thérapeutiques que les critères
de spécificité seront les plus stringents, et
que l’innocuité sera examinée de la façon la
plus rigoureuse.
Innocuité et vectorisation (c’est à dire le
moyen utilisé pour faire entrer la méganu-
cléase dans la cellule cible) seront donc deux
mots clés pour l’année 2011, une année que
nous voulons résolument axée sur les
applications de l’ingénierie des génomes,
que ce soit dans le domaine des outils, de
l’agriculture ou de la médecine.
Dr. Frédéric Pâques
Recherche & Développement
La compétence majeure de
l’équipe de R&D de Cellectis
est l’ingénierie de méga-
nucléases spécifiques d’une
cible ADN visée, c’est à
dire la capacité de créer des
méganucléases “sur mesure”
pour chaque gène d’intérêt.
Les équipes de Cellectis savent identifier les
parties responsables de l’activité de coupure
de l’ADN dans les méganucléases, ainsi que
les parties correspondant à la reconnaissance
de sites spécifiques de l’ADN. Elles sont donc
capables de modifier ces dernières afin de
générer de nouveaux variants qui adresse-
ront de nouvelles cibles dans un génome.
Grâce à ce travail de recherche, Cellectis
possède aujourd’hui une large banque de
protéines comprenant plus de 40 000 motifs
combinables pour obtenir des protéines
composites capables de se lier à des séquences
d’ADN extrêmement diversifiées.
Dans les laboratoires de Cellectis, la
recherche amont se répartit sur deux axes
majeurs. Une première équipe de chercheurs
travaille sur l’ingénierie des protéines et
plus particulièrement des méganucléases afin
d’améliorer leur activité et leur spécificité,
et d’élargir l’espace des séquences
atteignables par ces méganucléases «à
façon». Une seconde équipe s’intéresse
à l’activité des méganucléases dans une
cellule et tend en permanence à augmenter
recombinaison. Elle travaille également sur
les futures applications des méganucléases.
En 2010, le groupe de R&D a fait
d’important progrès, notamment sur
l’identification de nouvelles structures
de protéines pouvant être ingénierées
plus rapidement et offrant de nouvelles
propriétés. En ont alors découlé de
nouvelles méganucléases avec des
utilisations optimisées.
Une revue très complète décrivant les
différents outils d’ingénierie des génomes
et comparant leurs propriétés a été publiée
dans Current Gene Therapy par l’équipe de
recherche de Cellectis en fin d’année 2010.
Meganucleases and other Tools for
Targeted Genome Engineering: Perspectives
and Challenges for Gene Therapy
Silva G, Poirot L, Galetto R, Smith J,
Montoya G, Duchateau P, Pâques F.
Curr Gene Ther. 2010, Dec 24
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 19
 Notre Science
Cette performance est avant tout la
conséquence de l’industrialisation de nos
procédés. Elle témoigne de l’évolution
globale de la société, de sa maturité et de son
efficacité à adapter ses structures à ses ambi-
tions. Cette capacité de production améliorée
nous donne aujourd’hui la possibilité de
positionner Cellectis en fournisseur d’outils
pour une très vaste gamme d’applications et
de produits.
Dr. Frédéric Pâques, Directeur scientifique Cependant, ces progrès dans les procédés
de fabrication ne doivent pas occulter les
L’année 2010 a été une année avancées obtenues dans l’utilisation de nos
produits. Parmi les principales, je citerai
particulièrement féconde l’implémentation de la chirurgie des génomes
en résultats et enseignements à une échelle que nous n’avions pas encore
connue. Plus de 15 collaborations avec des
dans notre cœur de métier.
laboratoires de recherche académiques à
Une des premières avancées travers le monde (HSR-TIGET à Milan, VIB
majeures a certainement été à Louvain, Children Hospital à Boston, …)
produisent à la fois des données in vitro et
la consolidation de notre
in vivo. Cette montée en puissance a deux
plateforme de production, dimensions : il s’agit d’une part du nombre
dans le but de fabriquer de méganucléases utilisées, et d’autre part
de la variété des modes d’application, et en
un nombre record de méga-
particulier des types cellulaires visés avec
nucléases (271 en 2010). succès. Les deux aspects sont en fait directe-
ment liés à l’accroissement de notre capacité
de production : au-delà de la performance,
celle-ci est capable de répondre à toute
demande, de nos clients, de nos
collaborateurs, et de nos activités internes
de recherche et développement.
18 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l
L’utilisation en 2010 de dizaines de méga-
nucléases dans des cellules immortalisées, des
plantes, des modèles animaux et des cellules
souches, est une des étapes cruciales vers la
réalisation du potentiel de la technologie de
Cellectis. L’accumulation de données par
des équipes différentes, internes ou externes,
est l’un des indicateurs de la robustesse de
cette technologie. Nombre de ces données
seront publiées tout au long de 2011.
Enfin, ces travaux nous ont permis de prendre l’efficacité du ciblage de gènes et de la
la mesure des défis qui nous attendent,
notamment en 2011, et c’est dans le
domaine thérapeutique que se situent
aujourd’hui certains des plus importants. Parmi
eux, la capacité d’apporter nos molécules
en quantité suffisante dans les cellules cibles
reste un des axes majeurs. Un autre facteur
clé est bien sûr l’innocuité de l’approche,
qui est directement liée à la spécificité de nos
méganucléases. C’est en effet dans les
applications thérapeutiques que les critères
de spécificité seront les plus stringents, et
que l’innocuité sera examinée de la façon la
plus rigoureuse.
Innocuité et vectorisation (c’est à dire le
moyen utilisé pour faire entrer la méganu-
cléase dans la cellule cible) seront donc deux
mots clés pour l’année 2011, une année que
nous voulons résolument axée sur les
applications de l’ingénierie des génomes,
que ce soit dans le domaine des outils, de
l’agriculture ou de la médecine.
Dr. Frédéric Pâques
Recherche & Développement
La compétence majeure de
l’équipe de R&D de Cellectis
est l’ingénierie de méga-
nucléases spécifiques d’une
cible ADN visée, c’est à
dire la capacité de créer des
méganucléases “sur mesure”
pour chaque gène d’intérêt.
Les équipes de Cellectis savent identifier les
parties responsables de l’activité de coupure
de l’ADN dans les méganucléases, ainsi que
les parties correspondant à la reconnaissance
de sites spécifiques de l’ADN. Elles sont donc
capables de modifier ces dernières afin de
générer de nouveaux variants qui adresse-
ront de nouvelles cibles dans un génome.
Grâce à ce travail de recherche, Cellectis
possède aujourd’hui une large banque de
protéines comprenant plus de 40 000 motifs
combinables pour obtenir des protéines
composites capables de se lier à des séquences
d’ADN extrêmement diversifiées.
Dans les laboratoires de Cellectis, la
recherche amont se répartit sur deux axes
majeurs. Une première équipe de chercheurs
travaille sur l’ingénierie des protéines et
plus particulièrement des méganucléases afin
d’améliorer leur activité et leur spécificité,
et d’élargir l’espace des séquences
atteignables par ces méganucléases «à
façon». Une seconde équipe s’intéresse
à l’activité des méganucléases dans une
cellule et tend en permanence à augmenter
recombinaison. Elle travaille également sur
les futures applications des méganucléases.
En 2010, le groupe de R&D a fait
d’important progrès, notamment sur
l’identification de nouvelles structures
de protéines pouvant être ingénierées
plus rapidement et offrant de nouvelles
propriétés. En ont alors découlé de
nouvelles méganucléases avec des
utilisations optimisées.
Une revue très complète décrivant les
différents outils d’ingénierie des génomes
et comparant leurs propriétés a été publiée
dans Current Gene Therapy par l’équipe de
recherche de Cellectis en fin d’année 2010.
Meganucleases and other Tools for
Targeted Genome Engineering: Perspectives
and Challenges for Gene Therapy
Silva G, Poirot L, Galetto R, Smith J,
Montoya G, Duchateau P, Pâques F.
Curr Gene Ther. 2010, Dec 24
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 19
 La plateforme de production
Lorsqu’un projet nécessite
d’intervenir sur un nouveau site
du génome pour le modifier,
les équipes de Cellectis créent
une nouvelle méganucléase
à partir de l’Omégabase, une
collection de méganucléases à
spécificités modifiées, propriété
de Cellectis.
20 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Les scientifiques identifient les modules
protéiques dont les cibles ADN correspondent
à des fragments de la cible génomique visée
et les combinent afin de créer une nouvelle
méganucléase possédant la spécificité de
reconnaissance de la cible génomique finale.
L’activité de chacune des méganucléases
nouvellement créées est ensuite testée dans
le cadre d’une série d’essais fonctionnels
développés par Cellectis.
Tout ce travail de création et d’analyse est
effectué par la Plateforme de production qui
fabrique toutes les enzymes utilisées et
vendues par Cellectis. L’équipe de la Plateforme
va créer des méganucléases de qualité tout
en respectant un cahier des charges
spécifiques à chaque partenaire ou client,
interne ou externe. La Plateforme permet
d’assurer les commandes en offrant à chaque
client la solution qui lui est la mieux adaptée.
Grâce à son parc robotique, l’équipe de la
Plateforme peut mesurer l’activité d’un très
grand nombre de méganucléases. En effet,
elle a la capacité de faire jusqu’à un million
de tests par semaine. Ces données sont
ensuite traitées, analysées et utilisées pour
fabriquer les méganucléases pour chaque
projet. L’équipe de la Plateforme apporte
aux départements de recherche la possibilité
d’évaluer leurs hypothèses dans les condi-
tions de production standard en suivant des
procédures strictes qui garantissent qualité et
traçabilité totale des échantillons. L’activité
de la Plateforme est soutenue par une équipe
de bioinformatique qui apporte des données
essentielles aux équipes de recherche,
l l
permettant de prédire les bonnes structures
pour fabriquer des méganucléases efficaces
le plus rapidement possible.
Par son travail de recherche, l’équipe de la
Plateforme enrichit la banque de données,
et donc le savoir et les compétences
scientifiques de Cellectis. L’année 2010
aura été marquée pour la Plateforme par
la réduction et stabilisation du temps de
production, ce qui a permis une forte
augmentation du débit de production avec
271 méganucléases produites en 2010,
comparativement à 99 en 2009.
Un article décrivant le travail de Cellectis
sur les méganucléases et les techniques
utilisées pour créer et produire de nouvelles
protéines capables de couper de nouvelles
cibles a été publié en novembre dans
la revue Protein Engineering Design and
Selection. Cet article décrit également le
large spectre d’applications des méganuclé-
ases, du développement de lignées cellu-
laires permettant l’expression de protéines,
aux plantes et animaux modifiés ainsi que
les applications thérapeutiques comme
la thérapie génique ou la création d’une
nouvelle classe d’antiviraux.
The I-CreI meganuclease and its
engineered derivatives: applications from
cell modification to gene therapy
Arnould S, Delenda C, Grizot S, Desseaux C,
Pâques F, Silva GH, Smith J.
Protein Eng Des Sel. 2010, Nov 3
Print: 2011 Jan. 24(1-2) pp27-31
Biologie computationnelle
Au sein de Cellectis, la mission
de l’équipe de biologie compu-
tationnelle est de produire
des méganucléases ingénierées
par une approche rationnelle.
Aujourd’hui, les nouvelles méganucléases
sont essentiellement produites par une
approche dite semi-rationnelle : des banques
de variants de méganucléases sont produites
en faisant varier certaines régions de la pro-
téine, et ces banques sont triées sur la Plate-
forme, afin d’identifier les quelques variants
ayant les propriétés attendues. Tendre vers
une approche rationnelle, c’est déterminer
de façon plus précise quels variants ont
le plus de chances d’être fonctionnels, afin
de générer et tester un plus petit nombre
de ces variants.
Le programme de biologie computation-
nelle de Cellectis a pour but d’améliorer les
performances de la Plateforme en termes de
temps de production (de la conception à la
réalisation), de coût, de capacité, d’espace
de séquences atteignables et de qualité des
produits. Des avancées ont régulièrement
été observées ces dernières années, mais
le but même de la biologie computationnelle
est d’améliorer de façon significative ces
performances en utilisant de nouvelles
techniques innovantes, récemment mises
en place chez Cellectis.
Le design computationnel implique
l’utilisation de logiciels basés sur le calcul de
niveaux d’énergie, et dépend énormément
de la disponibilité de données structurales
(c’est-à-dire de structures tridimensionnelles
de méganucléases liées à leur cible ADN).
Cellectis a mis en place en 2009-2010 un
groupe dédié à la biologie computationnelle,
et a initié un programme extrêmement
conséquent de biologie structurale. Ce
programme est réalisé au CNIO (Madrid)
en collaboration avec le Dr. Guillermo Dr. George Silva, chef du département de
Montoya. L’accès exclusif à un grand
biologie computationnelle
nombre de données structurales est une
des clés qui permettra au groupe de biologie
computationnelle d’acquérir une meilleure Un article a été publié dans le revue
connaissance des mécanismes gouvernant scientifique Nucleic Acids Research, résultat
d’une collaboration entre Cellectis et le
les interactions méganucléase/ADN,
mais aussi d’optimiser le processus de
laboratoire du Dr. Guillermo Montoya, au
CNIO de Madrid, et décrivant la structure
modélisation moléculaire et de le substituer
d’une méganucléase liée à sa cible ADN.
peu à peu à la méthode expérimentale par
criblage à haut débit. Molecular basis of engineered mega-
nuclease targeting of the endogenous
human RAG1 locus.
Muñoz IG, Prieto J, Subramanian S,
Coloma J, Redondo P, Villate M, Merino N,
Marenchino M, D’Abramo M, Gervasio FL,
Grizot S, Daboussi F, Smith J, Chion-Sotinel I,
Pâques F, Duchateau P, Alibés A, Stricher F,
Serrano L, Blanco FJ, Montoya G.
Nucleic Acids Res. 2011, Sept 16
Print: 2011; 39:729-743
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 21
 La plateforme de production
Lorsqu’un projet nécessite
d’intervenir sur un nouveau site
du génome pour le modifier,
les équipes de Cellectis créent
une nouvelle méganucléase
à partir de l’Omégabase, une
collection de méganucléases à
spécificités modifiées, propriété
de Cellectis.
20 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Les scientifiques identifient les modules
protéiques dont les cibles ADN correspondent
à des fragments de la cible génomique visée
et les combinent afin de créer une nouvelle
méganucléase possédant la spécificité de
reconnaissance de la cible génomique finale.
L’activité de chacune des méganucléases
nouvellement créées est ensuite testée dans
le cadre d’une série d’essais fonctionnels
développés par Cellectis.
Tout ce travail de création et d’analyse est
effectué par la Plateforme de production qui
fabrique toutes les enzymes utilisées et
vendues par Cellectis. L’équipe de la Plateforme
va créer des méganucléases de qualité tout
en respectant un cahier des charges
spécifiques à chaque partenaire ou client,
interne ou externe. La Plateforme permet
d’assurer les commandes en offrant à chaque
client la solution qui lui est la mieux adaptée.
Grâce à son parc robotique, l’équipe de la
Plateforme peut mesurer l’activité d’un très
grand nombre de méganucléases. En effet,
elle a la capacité de faire jusqu’à un million
de tests par semaine. Ces données sont
ensuite traitées, analysées et utilisées pour
fabriquer les méganucléases pour chaque
projet. L’équipe de la Plateforme apporte
aux départements de recherche la possibilité
d’évaluer leurs hypothèses dans les condi-
tions de production standard en suivant des
procédures strictes qui garantissent qualité et
traçabilité totale des échantillons. L’activité
de la Plateforme est soutenue par une équipe
de bioinformatique qui apporte des données
essentielles aux équipes de recherche,
l l
permettant de prédire les bonnes structures
pour fabriquer des méganucléases efficaces
le plus rapidement possible.
Par son travail de recherche, l’équipe de la
Plateforme enrichit la banque de données,
et donc le savoir et les compétences
scientifiques de Cellectis. L’année 2010
aura été marquée pour la Plateforme par
la réduction et stabilisation du temps de
production, ce qui a permis une forte
augmentation du débit de production avec
271 méganucléases produites en 2010,
comparativement à 99 en 2009.
Un article décrivant le travail de Cellectis
sur les méganucléases et les techniques
utilisées pour créer et produire de nouvelles
protéines capables de couper de nouvelles
cibles a été publié en novembre dans
la revue Protein Engineering Design and
Selection. Cet article décrit également le
large spectre d’applications des méganuclé-
ases, du développement de lignées cellu-
laires permettant l’expression de protéines,
aux plantes et animaux modifiés ainsi que
les applications thérapeutiques comme
la thérapie génique ou la création d’une
nouvelle classe d’antiviraux.
The I-CreI meganuclease and its
engineered derivatives: applications from
cell modification to gene therapy
Arnould S, Delenda C, Grizot S, Desseaux C,
Pâques F, Silva GH, Smith J.
Protein Eng Des Sel. 2010, Nov 3
Print: 2011 Jan. 24(1-2) pp27-31
Biologie computationnelle
Au sein de Cellectis, la mission
de l’équipe de biologie compu-
tationnelle est de produire
des méganucléases ingénierées
par une approche rationnelle.
Aujourd’hui, les nouvelles méganucléases
sont essentiellement produites par une
approche dite semi-rationnelle : des banques
de variants de méganucléases sont produites
en faisant varier certaines régions de la pro-
téine, et ces banques sont triées sur la Plate-
forme, afin d’identifier les quelques variants
ayant les propriétés attendues. Tendre vers
une approche rationnelle, c’est déterminer
de façon plus précise quels variants ont
le plus de chances d’être fonctionnels, afin
de générer et tester un plus petit nombre
de ces variants.
Le programme de biologie computation-
nelle de Cellectis a pour but d’améliorer les
performances de la Plateforme en termes de
temps de production (de la conception à la
réalisation), de coût, de capacité, d’espace
de séquences atteignables et de qualité des
produits. Des avancées ont régulièrement
été observées ces dernières années, mais
le but même de la biologie computationnelle
est d’améliorer de façon significative ces
performances en utilisant de nouvelles
techniques innovantes, récemment mises
en place chez Cellectis.
Le design computationnel implique
l’utilisation de logiciels basés sur le calcul de
niveaux d’énergie, et dépend énormément
de la disponibilité de données structurales
(c’est-à-dire de structures tridimensionnelles
de méganucléases liées à leur cible ADN).
Cellectis a mis en place en 2009-2010 un
groupe dédié à la biologie computationnelle,
et a initié un programme extrêmement
conséquent de biologie structurale. Ce
programme est réalisé au CNIO (Madrid)
en collaboration avec le Dr. Guillermo Dr. George Silva, chef du département de
Montoya. L’accès exclusif à un grand
biologie computationnelle
nombre de données structurales est une
des clés qui permettra au groupe de biologie
computationnelle d’acquérir une meilleure Un article a été publié dans le revue
connaissance des mécanismes gouvernant scientifique Nucleic Acids Research, résultat
d’une collaboration entre Cellectis et le
les interactions méganucléase/ADN,
mais aussi d’optimiser le processus de
laboratoire du Dr. Guillermo Montoya, au
CNIO de Madrid, et décrivant la structure
modélisation moléculaire et de le substituer
d’une méganucléase liée à sa cible ADN.
peu à peu à la méthode expérimentale par
criblage à haut débit. Molecular basis of engineered mega-
nuclease targeting of the endogenous
human RAG1 locus.
Muñoz IG, Prieto J, Subramanian S,
Coloma J, Redondo P, Villate M, Merino N,
Marenchino M, D’Abramo M, Gervasio FL,
Grizot S, Daboussi F, Smith J, Chion-Sotinel I,
Pâques F, Duchateau P, Alibés A, Stricher F,
Serrano L, Blanco FJ, Montoya G.
Nucleic Acids Res. 2011, Sept 16
Print: 2011; 39:729-743
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 21
Business Development

La propriété intellectuelle innovante de En 2010, Cellectis a octroyé Accord de licence à Harvard Apparatus Accord sur la modification d’une lignée
Cellectis a de très larges applications qui Sur le plan de l’évolution de l’activité, Cet accord octroie à Harvard Apparatus cellulaire de production avec Lonza
vont de la santé à l’agriculture en passant 2010 a marqué le début d’une transition,
un accord de licence à la un droit exclusif mondial de fabrication et Cellectis bioresearch utilise ses méga-
par la recherche sur les cellules souches puisque nous passons de l’octroi de licences société Boehringer Ingelheim de commercialisation, à des fins de recher- nucléases pour inactiver (« knock-out »)
de propriété intellectuelle à la génération
et les énergies alternatives. L’équipe
de revenus issus de produits développés
pour l’obtention, l’élevage et che, de la ligne complète d’instruments la glutamine synthétase (GS) dans la lignée
du Business Development est également d’électroporation que Cellectis a acquis de CHOK1SV, lignée hôte dont Lonza est
en charge des contrats commerciaux
précisément par le biais de cette propriété l’utilisation de certains modèles CytoPulse. Cellectis conserve tous les droits propriétaire. La capacité de Lonza, leader
intellectuelle.
avec nos partenaires. La stratégie du animaux en recherche pharma- d’utilisation de ces derniers dans le cadre de mondial dans la production de protéines
Business Development se résume en cinq Bien que les licences sur des brevets de ceutique, en Europe, et a signé ses programmes de R&D, ainsi que pour les thérapeutiques, à maîtriser la production
points essentiels, qui amèneront Cellectis recombinaison homologue demeurent essais cliniques et procédures prophylactiques de lignées cellulaires de la meilleure
à devenir une référence en matière notre principale source de profits, la création
un accord avec Bayer Health- ou thérapeutiques, à application humaine qualité en fait le partenaire idéal pour
Dr. Dirk Pollet, Directeur commercial d’ingénierie des génomes : et l’intégration de Cellectis plant sciences, Care pour l’utilisation de ses et animale. Suite à cet accord, Harvard l’application de la technologie de Cellectis
l’expansion des activités d’Ectycell liées
brevets impliquant la recombi- Apparatus a versé $1,3M (960K €) à Cellec- et des méganucléases.
aux cellules souches grâce aux licences sur
La mission de l‘équipe du • La priorité mise sur les méganucléases
les iPS de Shinya Yamanaka et l’acquisition naison homologue. BASF plant tis. Cellectis continuera en outre à percevoir,
thérapeutiques pour soigner les maladies via sa filiale Cellectis bioresearch, les droits
Business Development est de la technologie d’électroporation de
sciences a, de son côté, élargi « Nous sommes ravis de
génétiques orphelines, traiter des infec- de licence annuels de certains clients.
de commercialiser la propriété tions virales, développer de nouveaux
CytoPulse formeront les pierres angulaires
sa collaboration avec Cellectis travailler avec Cellectis bio-
des produits basés sur les technologies
intellectuelle de Cellectis, produits contre les cancers et pour la greffe d’ingénierie des génomes de Cellectis mises
pour utiliser des méganucléases Licence pour l’utilisation des protéines research. Cette collaboration
allogénique (greffe entre deux personnes au point au cours des dernières années. fluorescentes d’Evrogen est logique et va booster GS,
d‘acquérir celle de tiers génétiquement différentes). à façon. L’accord non exclusif avec Evrogen (Moscou,
permettant de soutenir le Cette tendance se poursuivra en 2011, Russie) a permis à Cellectis bioresearch notre technologie majeure, qui
développement de nouvelles • La diffusion active de sa technologie com- année durant laquelle Cellectis compte tirer Acquisition des actifs de la société d’intégrer ces protéines à ses propres rencontre déjà un fort succès ».  
des bénéfices significatifs des licences CytoPulse Inc.
me outil de recherche auprès des plus grands produits et d’élargir sa gamme d’outils
technologies ou de produits laboratoires académiques et industriels.
accordées sur son portefeuille de propriété
L’électroporation est une technique d’ingénierie des génomes. La matrice
John Birch, Directeur scientifique de
Lonza Biopharmaceuticals
intellectuelle et conclure un nombre
et de constuire les partenariats croissant de partenariats visant le développe-
particulièrement efficace d’introduction de d’intégration est l’un des composants clés
commerciaux. • La signature d’accords commerciaux dans ses ment de solutions novatrices dans de molécules, telles que des méganucléases, des kits de Cellectis bioresearch. C’est elle Accord de licence avec Midwest Oilseeds
quatre domaines d’application principaux : nombreux domaines. dans n’importe quel type de cellules. Elle qui permet à l’utilisateur d’exprimer son pour l’utilisation d’une technologie per-
santé, biotechnologie, agriculture biotech- présente de multiples applications, de la gène d’intérêt. En élargissant le choix de formante de transformation des plantes
nologique et cellules souches. Dr. Dirk Pollet, Directeur commercial recherche au thérapeutique en passant par promoteurs et marqueurs disponibles dans Cet accord permet à Cellectis plant sciences
la bioproduction et l’agriculture. L’achat ses matrices, Cellectis bioresearch offre à ses d’utiliser la technologie Aerosol Beam
• Le renforcement de partenariats privilégiés des actifs de CytoPulse a permis l’acquisition clients une gamme complète de méthodes Injector (ABI) de Midwest Oilseeds, pour la
en agriculture biotechnologique mis en de trois autres technologies basées sur pour effectuer leurs constructions en une modification ciblée de génomes de plantes.
place avec les grands acteurs du domaine. l’électroporation développées par CytoPulse : seule étape, leur faisant ainsi gagner Cette technologie permet de faire pénétrer
Dermavax permet de faire de la vaccination un temps précieux sur leurs expériences. directement des méganucléases fonction-
• Et enfin la pérennisation de la position ADN transdermique, Oncovet a des appli- nelles dans des cellules de plantes, éliminant
concurrentielle de Cellectis en continuant cations de vaccination vétérinaire et Hybrim- ainsi le recours à des vecteurs ADN. Cette
d’enrichir son portefeuille de brevets et en mune permet de fabriquer des hybridomes approche permettra à Cellectis plant sciences
augmentant son avance technologique et pour la production d’anticorps monoclonaux. de modifier des génomes de plantes sans
son savoir faire pour valoriser ce portefeuille. La transaction a été conclue le 2 septembre introduire d’ADN dans la plante.
2010 pour un montant de $2,2M (1,6M €).

22 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 23

Business Development

La propriété intellectuelle innovante de En 2010, Cellectis a octroyé Accord de licence à Harvard Apparatus Accord sur la modification d’une lignée
Cellectis a de très larges applications qui Sur le plan de l’évolution de l’activité, Cet accord octroie à Harvard Apparatus cellulaire de production avec Lonza
vont de la santé à l’agriculture en passant 2010 a marqué le début d’une transition,
un accord de licence à la un droit exclusif mondial de fabrication et Cellectis bioresearch utilise ses méga-
par la recherche sur les cellules souches puisque nous passons de l’octroi de licences société Boehringer Ingelheim de commercialisation, à des fins de recher- nucléases pour inactiver (« knock-out »)
de propriété intellectuelle à la génération
et les énergies alternatives. L’équipe
de revenus issus de produits développés
pour l’obtention, l’élevage et che, de la ligne complète d’instruments la glutamine synthétase (GS) dans la lignée
du Business Development est également d’électroporation que Cellectis a acquis de CHOK1SV, lignée hôte dont Lonza est
en charge des contrats commerciaux
précisément par le biais de cette propriété l’utilisation de certains modèles CytoPulse. Cellectis conserve tous les droits propriétaire. La capacité de Lonza, leader
intellectuelle.
avec nos partenaires. La stratégie du animaux en recherche pharma- d’utilisation de ces derniers dans le cadre de mondial dans la production de protéines
Business Development se résume en cinq Bien que les licences sur des brevets de ceutique, en Europe, et a signé ses programmes de R&D, ainsi que pour les thérapeutiques, à maîtriser la production
points essentiels, qui amèneront Cellectis recombinaison homologue demeurent essais cliniques et procédures prophylactiques de lignées cellulaires de la meilleure
à devenir une référence en matière notre principale source de profits, la création
un accord avec Bayer Health- ou thérapeutiques, à application humaine qualité en fait le partenaire idéal pour
Dr. Dirk Pollet, Directeur commercial d’ingénierie des génomes : et l’intégration de Cellectis plant sciences, Care pour l’utilisation de ses et animale. Suite à cet accord, Harvard l’application de la technologie de Cellectis
l’expansion des activités d’Ectycell liées
brevets impliquant la recombi- Apparatus a versé $1,3M (960K €) à Cellec- et des méganucléases.
aux cellules souches grâce aux licences sur
La mission de l‘équipe du • La priorité mise sur les méganucléases
les iPS de Shinya Yamanaka et l’acquisition naison homologue. BASF plant tis. Cellectis continuera en outre à percevoir,
thérapeutiques pour soigner les maladies via sa filiale Cellectis bioresearch, les droits
Business Development est de la technologie d’électroporation de
sciences a, de son côté, élargi « Nous sommes ravis de
génétiques orphelines, traiter des infec- de licence annuels de certains clients.
de commercialiser la propriété tions virales, développer de nouveaux
CytoPulse formeront les pierres angulaires
sa collaboration avec Cellectis travailler avec Cellectis bio-
des produits basés sur les technologies
intellectuelle de Cellectis, produits contre les cancers et pour la greffe d’ingénierie des génomes de Cellectis mises
pour utiliser des méganucléases Licence pour l’utilisation des protéines research. Cette collaboration
allogénique (greffe entre deux personnes au point au cours des dernières années. fluorescentes d’Evrogen est logique et va booster GS,
d‘acquérir celle de tiers génétiquement différentes). à façon. L’accord non exclusif avec Evrogen (Moscou,
permettant de soutenir le Cette tendance se poursuivra en 2011, Russie) a permis à Cellectis bioresearch notre technologie majeure, qui
développement de nouvelles • La diffusion active de sa technologie com- année durant laquelle Cellectis compte tirer Acquisition des actifs de la société d’intégrer ces protéines à ses propres rencontre déjà un fort succès ».  
des bénéfices significatifs des licences CytoPulse Inc.
me outil de recherche auprès des plus grands produits et d’élargir sa gamme d’outils
technologies ou de produits laboratoires académiques et industriels.
accordées sur son portefeuille de propriété
L’électroporation est une technique d’ingénierie des génomes. La matrice
John Birch, Directeur scientifique de
Lonza Biopharmaceuticals
intellectuelle et conclure un nombre
et de constuire les partenariats croissant de partenariats visant le développe-
particulièrement efficace d’introduction de d’intégration est l’un des composants clés
commerciaux. • La signature d’accords commerciaux dans ses ment de solutions novatrices dans de molécules, telles que des méganucléases, des kits de Cellectis bioresearch. C’est elle Accord de licence avec Midwest Oilseeds
quatre domaines d’application principaux : nombreux domaines. dans n’importe quel type de cellules. Elle qui permet à l’utilisateur d’exprimer son pour l’utilisation d’une technologie per-
santé, biotechnologie, agriculture biotech- présente de multiples applications, de la gène d’intérêt. En élargissant le choix de formante de transformation des plantes
nologique et cellules souches. Dr. Dirk Pollet, Directeur commercial recherche au thérapeutique en passant par promoteurs et marqueurs disponibles dans Cet accord permet à Cellectis plant sciences
la bioproduction et l’agriculture. L’achat ses matrices, Cellectis bioresearch offre à ses d’utiliser la technologie Aerosol Beam
• Le renforcement de partenariats privilégiés des actifs de CytoPulse a permis l’acquisition clients une gamme complète de méthodes Injector (ABI) de Midwest Oilseeds, pour la
en agriculture biotechnologique mis en de trois autres technologies basées sur pour effectuer leurs constructions en une modification ciblée de génomes de plantes.
place avec les grands acteurs du domaine. l’électroporation développées par CytoPulse : seule étape, leur faisant ainsi gagner Cette technologie permet de faire pénétrer
Dermavax permet de faire de la vaccination un temps précieux sur leurs expériences. directement des méganucléases fonction-
• Et enfin la pérennisation de la position ADN transdermique, Oncovet a des appli- nelles dans des cellules de plantes, éliminant
concurrentielle de Cellectis en continuant cations de vaccination vétérinaire et Hybrim- ainsi le recours à des vecteurs ADN. Cette
d’enrichir son portefeuille de brevets et en mune permet de fabriquer des hybridomes approche permettra à Cellectis plant sciences
augmentant son avance technologique et pour la production d’anticorps monoclonaux. de modifier des génomes de plantes sans
son savoir faire pour valoriser ce portefeuille. La transaction a été conclue le 2 septembre introduire d’ADN dans la plante.
2010 pour un montant de $2,2M (1,6M €).

22 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 23

Corporate Development
Dr. David Sourdive, Vice président exécutif
Corporate Development
La principale mission pour
l’équipe du Corporate
Development en 2010 était de
concrétiser les opportunités
qui se présentaient dans le
domaine des cellules souches à
travers le lancement de projets
de plateformes de cellules pour
des études populationnelles
visant deux applications : financer et soutenir l’innovation et la crois-
les outils de recherche et la
thérapie cellulaire (greffons).
24 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
L’objectif est de constituer une collection Cellectis est la première société au monde à
de cellules représentatives de la physiologie,
de la pathologie et de la diversité génétique
humaine pour appréhender ces facteurs in
vitro. Un premier volet consiste à utiliser les
cellules souches pour mieux comprendre les
maladies et leurs mécanismes. Si l’on parvient
à collecter des échantillons de cellules gies d’ingénierie des génomes de Cellectis
de donneurs, sains ou malades, il sera alors
possible d’en faire des cellules souches
pluripotentes induites et d’étudier la maladie
sur des cellules qui en dériveront.
Le projet d’une plateforme CellMill a été
mis en place dans le but premier de faire des
iPS un objet industriel, robuste et sûr. 2010
aura permis de faire en sorte que tous ces
projets soient structurés et voient le jour en
leur donnant les ressources nécessaires pour
démarrer et espérer grandir.
Le projet CellMill a obtenu un engagement
de financement de la part des collectivités
territoriales, de la caisse des dépôts et
consignations et d’OSEO, une entreprise
publique qui se donne pour mission de
sance des entreprises. En outre, deux accords
de licence non exclusifs donnent à Cellectis,
pour le monde entier, un accès au porte-
feuille de brevets sur les cellules souches
pluripotentes induites (iPS) découlant des
travaux du Professeur Shinya Yamanaka, du
Centre de recherche et d’application des iPS
(CiRA) de l’Université de Kyoto.
l l
bénéficier de licences pour des applications
thérapeutiques ou prophylactiques humaines
sur ce portefeuille d’iPS Academia Japan.
De plus, Cellectis entre en collaboration avec
le CiRA dans le but d’associer les technolo-
à celles développées par le CiRA sur les
cellules souches pluripotentes induites, afin
d’améliorer les caractéristiques naturelles
de ces dernières pour les exploiter comme
outils cellulaires.
« Nous commençons 2011
avec toutes les clés en main.
C’est maintenant à nous d’agir
pour que nos projets dans le
domaine des cellules souches
pluripotentes induites dévoilent
tout leur potentiel. »
Dr. David Sourdive
Grâce aux méganucléases, une
nouvelle porte s’ouvre pour
le développement d’une alter-
native au pétrole. Les micro-
algues sont en effet considé-
rées comme une source très
prometteuse de substituts aux
dérivés pétroliers : carburants,
molécules chimiques ou
matériaux, et ce grâce, en
partie, à leur forte capacité
à produire des huiles et à leur
rendement efficace.
Zoom sur les substituts au pétrole
La technologie des méganucléases convien-
drait à l’optimisation de ces traits permettant
une industrialisation des procédés. On estime
qu’aujourd’hui, seules les algues pourraient,
en tant que composant naturel, être capables
de répondre à la demande de carburant de
façon efficace et sans faire concurrence à un
autre besoin comme la nourriture ou l’eau
douce. Les algues utilisent le processus de
photosynthèse. Elles ont de ce fait besoin de
lumière mais aussi d’eau de mer et de CO2, Dr. Alberto Amato, chef de projet ingénierie génomique
ce qui en ferait donc un carburant dans les micro-algues
« écologique ».
C’est dans cet objectif que Cellectis a mis en
place en 2010 une équipe de recherche
spécialement dédiée à l’étude des micro-
algues, plus particulièrement les diatomées,
comme potentiel substitut au pétrole.
Les diatomées ont déjà une importance
écologique car un quart de l’oxygène
produit annuellement sur terre vient des
seules diatomées.
Ce sont des algues unicellulaires qui se
Différents types de diatomées
trouvent dans la plupart des environnements
humides, peuplent les océans et présentent
une grande diversité, 100 000 espèces
étant déjà répertoriées. Un programme de
faisabilité a été mis en place chez Cellectis
afin d’obtenir des preuves de principe le
plus rapidement possible, notamment sur le
potentiel d’efficacité des méganucléases dans
ces algues.
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 25
Corporate Development
Dr. David Sourdive, Vice président exécutif
Corporate Development
La principale mission pour
l’équipe du Corporate
Development en 2010 était de
concrétiser les opportunités
qui se présentaient dans le
domaine des cellules souches à
travers le lancement de projets
de plateformes de cellules pour
des études populationnelles
visant deux applications : financer et soutenir l’innovation et la crois-
les outils de recherche et la
thérapie cellulaire (greffons).
24 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
L’objectif est de constituer une collection Cellectis est la première société au monde à
de cellules représentatives de la physiologie,
de la pathologie et de la diversité génétique
humaine pour appréhender ces facteurs in
vitro. Un premier volet consiste à utiliser les
cellules souches pour mieux comprendre les
maladies et leurs mécanismes. Si l’on parvient
à collecter des échantillons de cellules gies d’ingénierie des génomes de Cellectis
de donneurs, sains ou malades, il sera alors
possible d’en faire des cellules souches
pluripotentes induites et d’étudier la maladie
sur des cellules qui en dériveront.
Le projet d’une plateforme CellMill a été
mis en place dans le but premier de faire des
iPS un objet industriel, robuste et sûr. 2010
aura permis de faire en sorte que tous ces
projets soient structurés et voient le jour en
leur donnant les ressources nécessaires pour
démarrer et espérer grandir.
Le projet CellMill a obtenu un engagement
de financement de la part des collectivités
territoriales, de la caisse des dépôts et
consignations et d’OSEO, une entreprise
publique qui se donne pour mission de
sance des entreprises. En outre, deux accords
de licence non exclusifs donnent à Cellectis,
pour le monde entier, un accès au porte-
feuille de brevets sur les cellules souches
pluripotentes induites (iPS) découlant des
travaux du Professeur Shinya Yamanaka, du
Centre de recherche et d’application des iPS
(CiRA) de l’Université de Kyoto.
l l
bénéficier de licences pour des applications
thérapeutiques ou prophylactiques humaines
sur ce portefeuille d’iPS Academia Japan.
De plus, Cellectis entre en collaboration avec
le CiRA dans le but d’associer les technolo-
à celles développées par le CiRA sur les
cellules souches pluripotentes induites, afin
d’améliorer les caractéristiques naturelles
de ces dernières pour les exploiter comme
outils cellulaires.
« Nous commençons 2011
avec toutes les clés en main.
C’est maintenant à nous d’agir
pour que nos projets dans le
domaine des cellules souches
pluripotentes induites dévoilent
tout leur potentiel. »
Dr. David Sourdive
Grâce aux méganucléases, une
nouvelle porte s’ouvre pour
le développement d’une alter-
native au pétrole. Les micro-
algues sont en effet considé-
rées comme une source très
prometteuse de substituts aux
dérivés pétroliers : carburants,
molécules chimiques ou
matériaux, et ce grâce, en
partie, à leur forte capacité
à produire des huiles et à leur
rendement efficace.
Zoom sur les substituts au pétrole
La technologie des méganucléases convien-
drait à l’optimisation de ces traits permettant
une industrialisation des procédés. On estime
qu’aujourd’hui, seules les algues pourraient,
en tant que composant naturel, être capables
de répondre à la demande de carburant de
façon efficace et sans faire concurrence à un
autre besoin comme la nourriture ou l’eau
douce. Les algues utilisent le processus de
photosynthèse. Elles ont de ce fait besoin de
lumière mais aussi d’eau de mer et de CO2, Dr. Alberto Amato, chef de projet ingénierie génomique
ce qui en ferait donc un carburant dans les micro-algues
« écologique ».
C’est dans cet objectif que Cellectis a mis en
place en 2010 une équipe de recherche
spécialement dédiée à l’étude des micro-
algues, plus particulièrement les diatomées,
comme potentiel substitut au pétrole.
Les diatomées ont déjà une importance
écologique car un quart de l’oxygène
produit annuellement sur terre vient des
seules diatomées.
Ce sont des algues unicellulaires qui se
Différents types de diatomées
trouvent dans la plupart des environnements
humides, peuplent les océans et présentent
une grande diversité, 100 000 espèces
étant déjà répertoriées. Un programme de
faisabilité a été mis en place chez Cellectis
afin d’obtenir des preuves de principe le
plus rapidement possible, notamment sur le
potentiel d’efficacité des méganucléases dans
ces algues.
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 25
Propriete intellectuelle Ressources Humaines et Communication

Depuis, nous avons développé un porte-
feuille en propre particulièrement bien fourni.
Les brevets Cellectis relèvent de trois grandes
catégories : principes généraux, méganuclé-
ases et applications spécifiques, et fabrication
de méganucléases modifiées. Notre stratégie
consiste à élaborer un portefeuille de pro-
priété intellectuelle protégeant nos produits,
leurs applications et le corpus de connais-
sances technologiques associé. Nous avons
également poursuivi l’enrichissement de ce
L’équipe de propriété intellectuelle patrimoine au fil de nos acquisitions.
Fin 2010, Cellectis disposait de 83 brevets
Le patrimoine de Cellectis effectifs répartis à travers le monde, dont
35 aux Etats-Unis et Canada. Cela corres-
En passant de 5 employés
Evolution du portefeuille de propriété
intellectuelle de Cellectis en 2000 à 129 fin 2010,
Nombre de brevets attribués à Cellectis par le mot clé qui définit notre
année et zone géographique
entreprise est « croissance ».
100
Une évolution qui se perçoit aussi bien au
80 niveau de nos équipes et de leurs compé-
tences, qu’au niveau de notre technologie.
60
La politique de Cellectis est de permettre
40
l’évolution de notre personnel au fur et à
mesure du développement de l’entreprise.
20
Ainsi, toujours animés par la même volonté
0 de voir Cellectis devenir un des grands
Cette dynamique nous a aidés à attirer de
nouveaux talents et à maintenir une
cohésion au sein du personnel, ainsi qu’une
véritable identité d’entreprise, malgré
l’évolution constante. Cellectis se caractérise
par un fort esprit d’équipe et déploie des
moyens importants pour l’entretenir.
La cohésion des équipes passe aussi par des
séminaires et autres événements internes ré-
guliers mis en place par le service communi-
cation. C’est ce même service qui est chargé
de faire connaître au public la technologie et
le savoir faire de Cellectis.
Un des principaux outils mis en place par
Ce nouveau site internet s’organise autour
de trois principaux thèmes : Recherche,
et technologie, Business development,
Relations investisseurs.
En plus de ces grands axes cibles, le site web
fournit de nouvelles fonctionnalités ainsi que
de nouveaux contenus :
• Des flux RSS différenciés permettant
aux abonnés de suivre en temps réel les
activités de la société qui les intéressent.
• Le partage d’information via les réseaux
sociaux (notamment Facebook et Twitter)

en termes de propriété intellec-
tuelle constitue l’un de ses
actifs les plus précieux. L’activité
de notre entreprise s’est tout
d’abord fondée sur les familles
de brevets de l’Institut Pasteur
relatives à l’utilisation de la
recombinaison homologue
et des endonucléases de type
méganucléases pour induire
une recombinaison de l’ADN.
pond à 25 nouveaux brevets délivrés sur
une année. Plus de 260 demandes de brevet
sont également en cours d’examen. En
2010, Cellectis a racheté tous les actifs de la
société CytoPulse, spécialiste des systèmes
d’électroporation, et a par là même acquis
16 nouveaux brevets qui sont venus enrichir
le portefeuille de propriété intellectuelle.
Grâce à ces nouveaux brevets, Cellectis
recevra un revenu régulier (supérieur à
$600K (450K €) en 2009) tiré de l’octroi
des licences d’exploitation de la technologie
d’électrofusion HybrimuneTM de CytoPulse.
Cellectis accorde une importance toute
particulière à la valorisation et au respect de
la propriété intellectuelle qui lui a été confiée
par l’Institut Pasteur. Cellectis s’attache
également à promouvoir sa propre propriété
intellectuelle en assurant la défense de ses
droits, toujours dans le respect des droits
d’autrui.
2001
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
acteurs de la biotechnologie, des chefs de
projets sont maintenant à la tête de services le service communication en 2010 a été le • Des documents téléchargeables expliquant
USA/CA Europe Asie Australie et des techniciens supérieurs de laboratoire nouveau site internet corporate créé sur plu- la technologie de Cellectis.
ont par exemple pris des fonctions sieurs axes clés : le partage de l’information,
l’interactivité et l’espace presse. • Des vidéos explicatives et des focus
d’assistants ingénieurs. De plus, Cellectis
accompagne ceux qui le souhaitent dans réguliers sur diverses technologies de
leur formation d’ingénieurs. En effet, face à l’accroissement de son Cellectis pour permettre au public de
activité, Cellectis a choisi de proposer une mieux comprendre les avancées faites
nouvelle vitrine plus claire et accessible à en la matière.
tous ses utilisateurs, pour présenter ses ac-
tivités, produits et réalisations de la manière
la plus abordable possible. Ce nouveau site
web garantit à ses visiteurs une utilisation et
un partage d’information améliorés, avec un
accès plus simple et plus pratique aux infor-
mations sur les technologies et les produits
de Cellectis.

26 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 27

Propriete intellectuelle Ressources Humaines et Communication

Depuis, nous avons développé un porte-
feuille en propre particulièrement bien fourni.
Les brevets Cellectis relèvent de trois grandes
catégories : principes généraux, méganuclé-
ases et applications spécifiques, et fabrication
de méganucléases modifiées. Notre stratégie
consiste à élaborer un portefeuille de pro-
priété intellectuelle protégeant nos produits,
leurs applications et le corpus de connais-
sances technologiques associé. Nous avons
également poursuivi l’enrichissement de ce
L’équipe de propriété intellectuelle patrimoine au fil de nos acquisitions.
Fin 2010, Cellectis disposait de 83 brevets
Le patrimoine de Cellectis effectifs répartis à travers le monde, dont
35 aux Etats-Unis et Canada. Cela corres-
En passant de 5 employés
Evolution du portefeuille de propriété
intellectuelle de Cellectis en 2000 à 129 fin 2010,
Nombre de brevets attribués à Cellectis par le mot clé qui définit notre
année et zone géographique
entreprise est « croissance ».
100
Une évolution qui se perçoit aussi bien au
80 niveau de nos équipes et de leurs compé-
tences, qu’au niveau de notre technologie.
60
La politique de Cellectis est de permettre
40
l’évolution de notre personnel au fur et à
mesure du développement de l’entreprise.
20
Ainsi, toujours animés par la même volonté
0 de voir Cellectis devenir un des grands
Cette dynamique nous a aidés à attirer de
nouveaux talents et à maintenir une
cohésion au sein du personnel, ainsi qu’une
véritable identité d’entreprise, malgré
l’évolution constante. Cellectis se caractérise
par un fort esprit d’équipe et déploie des
moyens importants pour l’entretenir.
La cohésion des équipes passe aussi par des
séminaires et autres événements internes ré-
guliers mis en place par le service communi-
cation. C’est ce même service qui est chargé
de faire connaître au public la technologie et
le savoir faire de Cellectis.
Un des principaux outils mis en place par
Ce nouveau site internet s’organise autour
de trois principaux thèmes : Recherche,
et technologie, Business development,
Relations investisseurs.
En plus de ces grands axes cibles, le site web
fournit de nouvelles fonctionnalités ainsi que
de nouveaux contenus :
• Des flux RSS différenciés permettant
aux abonnés de suivre en temps réel les
activités de la société qui les intéressent.
• Le partage d’information via les réseaux
sociaux (notamment Facebook et Twitter)

en termes de propriété intellec-
tuelle constitue l’un de ses
actifs les plus précieux. L’activité
de notre entreprise s’est tout
d’abord fondée sur les familles
de brevets de l’Institut Pasteur
relatives à l’utilisation de la
recombinaison homologue
et des endonucléases de type
méganucléases pour induire
une recombinaison de l’ADN.
pond à 25 nouveaux brevets délivrés sur
une année. Plus de 260 demandes de brevet
sont également en cours d’examen. En
2010, Cellectis a racheté tous les actifs de la
société CytoPulse, spécialiste des systèmes
d’électroporation, et a par là même acquis
16 nouveaux brevets qui sont venus enrichir
le portefeuille de propriété intellectuelle.
Grâce à ces nouveaux brevets, Cellectis
recevra un revenu régulier (supérieur à
$600K (450K €) en 2009) tiré de l’octroi
des licences d’exploitation de la technologie
d’électrofusion HybrimuneTM de CytoPulse.
Cellectis accorde une importance toute
particulière à la valorisation et au respect de
la propriété intellectuelle qui lui a été confiée
par l’Institut Pasteur. Cellectis s’attache
également à promouvoir sa propre propriété
intellectuelle en assurant la défense de ses
droits, toujours dans le respect des droits
d’autrui.
2001
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
acteurs de la biotechnologie, des chefs de
projets sont maintenant à la tête de services le service communication en 2010 a été le • Des documents téléchargeables expliquant
USA/CA Europe Asie Australie et des techniciens supérieurs de laboratoire nouveau site internet corporate créé sur plu- la technologie de Cellectis.
ont par exemple pris des fonctions sieurs axes clés : le partage de l’information,
l’interactivité et l’espace presse. • Des vidéos explicatives et des focus
d’assistants ingénieurs. De plus, Cellectis
accompagne ceux qui le souhaitent dans réguliers sur diverses technologies de
leur formation d’ingénieurs. En effet, face à l’accroissement de son Cellectis pour permettre au public de
activité, Cellectis a choisi de proposer une mieux comprendre les avancées faites
nouvelle vitrine plus claire et accessible à en la matière.
tous ses utilisateurs, pour présenter ses ac-
tivités, produits et réalisations de la manière
la plus abordable possible. Ce nouveau site
web garantit à ses visiteurs une utilisation et
un partage d’information améliorés, avec un
accès plus simple et plus pratique aux infor-
mations sur les technologies et les produits
de Cellectis.

26 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 27


L’équipe Ectycell
« En tant que technicienne
informatique, j’apprécie de
travailler en collaboration avec
tout le personnel de Cellectis,
afin de les aider au mieux à
avancer dans leur recherche. »
Sandra Lapèze, technicienne systèmes
et réseaux
« J’ai choisi Cellectis tout
simplement parce que c’est
la biotech montante en France
et de plus, elle travaille sur
une technologie innovante
et est le leader dans l’ingénierie
des génomes. »
Julien Pontin, technicien supérieur de
laboratoire (plateforme)
28 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
« Cellectis représente pour
moi une entreprise dynamique
dans laquelle l’esprit d’équipe
et la forte motivation sont
les moteurs qui nous font
avancer chaque jour sur
des thématiques innovantes
et passionnantes. »
Christelle Rochon, chercheur en biologie
cellulaire et moléculaire chez Ectycell
« Cellectis est une entreprise
à taille humaine où la
communication entre équipes
et entre départements est
active et régulière. Travailler au
sein d’équipes aussi qualifiées
qu’ouvertes représente
à mes yeux une expérience
professionnelle et humaine
très enrichissante. »
Justin Eyquem, assistant ingénieur en
thèse chez Cellectis therapeutics
l l
Relations actionnaires
Evénement : premier R&D Day
Le 30 novembre 2010, Cellectis a organisé
Personnel de Cellectis
son premier Research & Development Day
Répartition par catégorie
et a reçu pour l’occasion des investisseurs,
des analystes ainsi que des journalistes. Cette
journée, première du genre, fut l’occasion
pour Cellectis de se rapprocher de ses
25% investisseurs, de les connaitre et d’échanger.
Les invités ont pu découvrir plus en détail
l’activité de Cellectis et de ses filiales tout en
4%
visitant les locaux, notamment les labora-
toires, et rencontrer les équipes qui font de
Cellectis l’entreprise qu’elle est aujourd’hui et
71% qui représentent les valeurs qu’elle défend.
Après une visite de sa plateforme technique
propriétaire, qui crée, produit et teste les
méganucléases, des membres de l’équipe de
Départements scientifique (DS) direction et des équipes scientifiques de
Business Development
Administration Lettres aux actionnaires Cellectis ont détaillé les activités dans chacun
de ses principaux domaines d’application :
Il tient à cœur à Cellectis de se rapprocher
ingénierie des méganucléases, outils de
Répartition par filiale
Total : 129 (dont 4 aux USA et 2 en Angleterre)
de ses actionnaires, c’est dans cet objectif
recherche, ingénierie des génomes de plantes
qu’a été mis en place en 2010 la Lettre aux
actionnaires. Un courrier trimestriel entière-
et programmes thérapeutiques. Le Dr. Serge Visite des laboratoires
Braun, de l’Association Française contre
ment dédié aux actionnaires de Cellectis
L’équipe de Communication de Cellectis
les Myopathies (AFM), a quant à lui fait le
reprenant et commentant l’information
point sur sa collaboration avec Cellectis gère de plus, avec la direction financière,
du moment. Par ce biais, André Choulika,
dans le domaine thérapeutique. Enfin, les tout ce qui a trait à l’annonce des résultats
le directeur général, peut s’adresser à ses
applications potentielles des cellules souches financiers, semestriels et annuels, et
actionnaires directement et de façon
pluripotentes induites (iPS), pour lesquelles organise les Assemblées générales présidées
régulière pour ainsi entretenir une relation
durable et de confiance. La lettre aux
Cellectis a récemment signé un accord par Christian Policard, président du conseil
de licence avec iPS Academia Japan, furent d’administration, auxquelles sont conviés les
Actionnaires offre de plus un entretien en
également décrites. actionnaires de la société.
trois questions avec l’un des acteurs princi-
paux de Cellectis sur un sujet correspondant
Les présentations sont disponibles sur Toutes les informations concernant les
Cellectis 71% DS à l’actualité de l’entreprise. Un Focus est
Cellectis bioresearch 71% DS www.cellectis.com/investisseurs. assemblées générales sont disponibles sur
aussi présenté sur l’une de nos activité, en
Cellectis therapeutics* 100% DS le site internet www.cellectis.com dans la
Cellectis plant sciences 100% DS constante évolution.
section Investisseurs.
Ectycell 100% DS
*ex genome surgery
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 29

L’équipe Ectycell
« En tant que technicienne
informatique, j’apprécie de
travailler en collaboration avec
tout le personnel de Cellectis,
afin de les aider au mieux à
avancer dans leur recherche. »
Sandra Lapèze, technicienne systèmes
et réseaux
« J’ai choisi Cellectis tout
simplement parce que c’est
la biotech montante en France
et de plus, elle travaille sur
une technologie innovante
et est le leader dans l’ingénierie
des génomes. »
Julien Pontin, technicien supérieur de
laboratoire (plateforme)
28 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
« Cellectis représente pour
moi une entreprise dynamique
dans laquelle l’esprit d’équipe
et la forte motivation sont
les moteurs qui nous font
avancer chaque jour sur
des thématiques innovantes
et passionnantes. »
Christelle Rochon, chercheur en biologie
cellulaire et moléculaire chez Ectycell
« Cellectis est une entreprise
à taille humaine où la
communication entre équipes
et entre départements est
active et régulière. Travailler au
sein d’équipes aussi qualifiées
qu’ouvertes représente
à mes yeux une expérience
professionnelle et humaine
très enrichissante. »
Justin Eyquem, assistant ingénieur en
thèse chez Cellectis therapeutics
l l
Relations actionnaires
Evénement : premier R&D Day
Le 30 novembre 2010, Cellectis a organisé
Personnel de Cellectis
son premier Research & Development Day
Répartition par catégorie
et a reçu pour l’occasion des investisseurs,
des analystes ainsi que des journalistes. Cette
journée, première du genre, fut l’occasion
pour Cellectis de se rapprocher de ses
25% investisseurs, de les connaitre et d’échanger.
Les invités ont pu découvrir plus en détail
l’activité de Cellectis et de ses filiales tout en
4%
visitant les locaux, notamment les labora-
toires, et rencontrer les équipes qui font de
Cellectis l’entreprise qu’elle est aujourd’hui et
71% qui représentent les valeurs qu’elle défend.
Après une visite de sa plateforme technique
propriétaire, qui crée, produit et teste les
méganucléases, des membres de l’équipe de
Départements scientifique (DS) direction et des équipes scientifiques de
Business Development
Administration Lettres aux actionnaires Cellectis ont détaillé les activités dans chacun
de ses principaux domaines d’application :
Il tient à cœur à Cellectis de se rapprocher
ingénierie des méganucléases, outils de
Répartition par filiale
Total : 129 (dont 4 aux USA et 2 en Angleterre)
de ses actionnaires, c’est dans cet objectif
recherche, ingénierie des génomes de plantes
qu’a été mis en place en 2010 la Lettre aux
actionnaires. Un courrier trimestriel entière-
et programmes thérapeutiques. Le Dr. Serge Visite des laboratoires
Braun, de l’Association Française contre
ment dédié aux actionnaires de Cellectis
L’équipe de Communication de Cellectis
les Myopathies (AFM), a quant à lui fait le
reprenant et commentant l’information
point sur sa collaboration avec Cellectis gère de plus, avec la direction financière,
du moment. Par ce biais, André Choulika,
dans le domaine thérapeutique. Enfin, les tout ce qui a trait à l’annonce des résultats
le directeur général, peut s’adresser à ses
applications potentielles des cellules souches financiers, semestriels et annuels, et
actionnaires directement et de façon
pluripotentes induites (iPS), pour lesquelles organise les Assemblées générales présidées
régulière pour ainsi entretenir une relation
durable et de confiance. La lettre aux
Cellectis a récemment signé un accord par Christian Policard, président du conseil
de licence avec iPS Academia Japan, furent d’administration, auxquelles sont conviés les
Actionnaires offre de plus un entretien en
également décrites. actionnaires de la société.
trois questions avec l’un des acteurs princi-
paux de Cellectis sur un sujet correspondant
Les présentations sont disponibles sur Toutes les informations concernant les
Cellectis 71% DS à l’actualité de l’entreprise. Un Focus est
Cellectis bioresearch 71% DS www.cellectis.com/investisseurs. assemblées générales sont disponibles sur
aussi présenté sur l’une de nos activité, en
Cellectis therapeutics* 100% DS le site internet www.cellectis.com dans la
Cellectis plant sciences 100% DS constante évolution.
section Investisseurs.
Ectycell 100% DS
*ex genome surgery
Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 29
 Cellectis bioresearch

Points clés 2010

2010 fut pour Cellectis bioresearch une année de consolidation du point de vue de la recherche
et du développement, qui nous amène aujourd’hui à la commercialisation de plus de 150
produits. Nous sommes particulièrement satisfaits de cette évolution, sachant que nous avons
lancé notre premier kit en décembre 2008, après avoir créé Cellectis bioresearch en juin de cette
même année. Non seulement nous proposons un nombre conséquent de nouveaux produits
mais ils représentent aussi une offre très variée répondant aux besoins des chercheurs. Nous
avons également déployé une nouvelle politique de marketing dans le but d’accroître notre
visibilité. Cette approche s’est effectuée à la fois de manière traditionnelle, via la publicité dans
les journaux et sur le web ainsi que via notre présence à une vingtaine de salons professionnels;
mais aussi de manière plus originale à travers la mise en place d’une plateforme web inter-
active à destination de la communauté scientifique utilisant les nouvelles techniques liées à la
génomique1 et d’un concours pour le financement d’un stage post-doctoral autour d’un projet
incluant la personnalisation de génomes. Du point de vue commercial, les résultats sont très
encourageants puisque nous avons plus que doublé le chiffre d’affaires. Nous avons également

FILIALES intégré la part de marché de CytoPulse dont Cellectis a acquis tous les actifs. Ces derniers com-
prennent une gamme complète d’instruments d’électroporation, déjà commercialisés, ainsi que
la propriété intellectuelle qui s’y rattache. Le chiffre d’affaires 2010 de Cellectis bioresearch cor-
respond aux attentes et objectifs que nous nous étions fixés. Dans le contexte actuel, c’est un
point dont nous pouvons être fiers. Ce succès a été obtenu grâce à nos équipes qui comptent Marc Le Bozec, Directeur financier de Cellectis et
Directeur général de Cellectis bioresearch
aujourd’hui 20 collaborateurs dont deux tiers en R&D, et un tiers en commercial et marketing.

Enjeux 2011
L’année à venir se déroulera sur trois axes pour nous mener à notre but, qui est de proposer
des milliers de produits. Le premier axe tournera autour de la technologie. Nous proposons
aujourd’hui essentiellement des outils d’intégration ciblée, notre but étant de proposer des
solutions pour l’invalidation et la modification ciblée de gènes. Notre second axe vise à étendre
nos gammes de produits à de nouvelles espèces, telles que les plantes avec Arabidopsis thaliana,
une plante modèle très utilisée, ou d’autres modèles animaux clés, comme le nématode
C. elegans. Il est prévu également en 2011 de faire passer tous les modèles clés en test par NHEJ 2
par méganucléase ou par TALEN3, une fois que cette nouvelle technologie sera entièrement
intégrée dans notre plateforme. Notre troisième champ d’action vise à agrandir notre champ
d’applications vers le test d’ADMET4 et la recherche contre les cancers en proposant une lignée
cellulaire plus proche de la réalité physiologique du patient. De manière générale, nous avons
comme objectif de maintenir notre progression et d’obtenir une profitabilité à court terme tout
en déployant une force commerciale sur le terrain à la fois en Europe et aux Etats-Unis. C’est 1
www.genome-engineering.com
dans cet objectif que la filiale américaine Cellectis bioresearch Inc. a été créée en octobre 2010. 2
ligature non homologue
Le but pour 2011 est de mettre en place des équipes aux Etats-Unis et en Europe, pour nous 3
Transcription Activator Like Effector Nuclease
placer à la même échelle que nos concurrents. Les deux prochaines années seront déterminantes 4
Absorption, Distribution, Métabolisme,
car elles définiront le type de profitabilité sur lequel nous nous plaçons. Excrétion et Toxicité

Marc Le Bozec

30 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 31

 Cellectis bioresearch

Points clés 2010

2010 fut pour Cellectis bioresearch une année de consolidation du point de vue de la recherche
et du développement, qui nous amène aujourd’hui à la commercialisation de plus de 150
produits. Nous sommes particulièrement satisfaits de cette évolution, sachant que nous avons
lancé notre premier kit en décembre 2008, après avoir créé Cellectis bioresearch en juin de cette
même année. Non seulement nous proposons un nombre conséquent de nouveaux produits
mais ils représentent aussi une offre très variée répondant aux besoins des chercheurs. Nous
avons également déployé une nouvelle politique de marketing dans le but d’accroître notre
visibilité. Cette approche s’est effectuée à la fois de manière traditionnelle, via la publicité dans
les journaux et sur le web ainsi que via notre présence à une vingtaine de salons professionnels;
mais aussi de manière plus originale à travers la mise en place d’une plateforme web inter-
active à destination de la communauté scientifique utilisant les nouvelles techniques liées à la
génomique1 et d’un concours pour le financement d’un stage post-doctoral autour d’un projet
incluant la personnalisation de génomes. Du point de vue commercial, les résultats sont très
encourageants puisque nous avons plus que doublé le chiffre d’affaires. Nous avons également

FILIALES intégré la part de marché de CytoPulse dont Cellectis a acquis tous les actifs. Ces derniers com-
prennent une gamme complète d’instruments d’électroporation, déjà commercialisés, ainsi que
la propriété intellectuelle qui s’y rattache. Le chiffre d’affaires 2010 de Cellectis bioresearch cor-
respond aux attentes et objectifs que nous nous étions fixés. Dans le contexte actuel, c’est un
point dont nous pouvons être fiers. Ce succès a été obtenu grâce à nos équipes qui comptent Marc Le Bozec, Directeur financier de Cellectis et
Directeur général de Cellectis bioresearch
aujourd’hui 20 collaborateurs dont deux tiers en R&D, et un tiers en commercial et marketing.

Enjeux 2011
L’année à venir se déroulera sur trois axes pour nous mener à notre but, qui est de proposer
des milliers de produits. Le premier axe tournera autour de la technologie. Nous proposons
aujourd’hui essentiellement des outils d’intégration ciblée, notre but étant de proposer des
solutions pour l’invalidation et la modification ciblée de gènes. Notre second axe vise à étendre
nos gammes de produits à de nouvelles espèces, telles que les plantes avec Arabidopsis thaliana,
une plante modèle très utilisée, ou d’autres modèles animaux clés, comme le nématode
C. elegans. Il est prévu également en 2011 de faire passer tous les modèles clés en test par NHEJ 2
par méganucléase ou par TALEN3, une fois que cette nouvelle technologie sera entièrement
intégrée dans notre plateforme. Notre troisième champ d’action vise à agrandir notre champ
d’applications vers le test d’ADMET4 et la recherche contre les cancers en proposant une lignée
cellulaire plus proche de la réalité physiologique du patient. De manière générale, nous avons
comme objectif de maintenir notre progression et d’obtenir une profitabilité à court terme tout
en déployant une force commerciale sur le terrain à la fois en Europe et aux Etats-Unis. C’est 1
www.genome-engineering.com
dans cet objectif que la filiale américaine Cellectis bioresearch Inc. a été créée en octobre 2010. 2
ligature non homologue
Le but pour 2011 est de mettre en place des équipes aux Etats-Unis et en Europe, pour nous 3
Transcription Activator Like Effector Nuclease
placer à la même échelle que nos concurrents. Les deux prochaines années seront déterminantes 4
Absorption, Distribution, Métabolisme,
car elles définiront le type de profitabilité sur lequel nous nous plaçons. Excrétion et Toxicité

Marc Le Bozec

30 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 31

 Cellectis bioresearch propose aux chercheurs en sciences du
vivant des outils faciles d’utilisation et prêts à l’emploi pour générer
des cellules et des organismes ayant les performances souhaitées.
Cellectis bioresearch développe et commercialise des produits de personnalisation des
cGPS
cGPS®® cGPS®®
génomes destinés à la génération de lignées cellulaires isogéniques stables, dont les caracté- Custom
Custom
ristiques et performances répondent aux besoins de trois marchés principaux : la mise au
Intégration d’un site de Ingénierie des
point de médicaments, l’étude du fonctionnement des gènes et la production de protéines. reconnaissance méganucléases

Kits cGPS® et cGPS® Custom

Les kits constituent un moyen simple et efficace d’utiliser les technologies Cellectis basées
sur les méganucléases. Ils permettent d’intégrer un gène en un site extrêmement précis
« L’enjeu vise à remplacer d’un génome.
les méthodes traditionnelles
d’ingénierie cellulaire A fin 2010, Cellectis bioresearch propose plus de 150 produits via sa boutique en ligne et
son réseau de distribution international (Inde, Canada). La société Cellectis bioresearch Inc.,
fondées sur la modification récemment implantée à Cambridge (Massachusetts, États-Unis), assure la promotion des
Méganucléase Matrice Méganucléase Matrice
sauvage d’intégration ingénierée d’intégration
aléatoire et d’imposer produits et services d’ingénierie de lignées cellulaires sur le continent américain.
la modification ciblée. »
Les kits de personnalisation du génome contiennent des réactifs et protocoles permettant
Marc Le Bozec
des modifications précises et ciblées de séquences d’ADN dans le génome d’intérêt,
qu’il s’agisse d’une lignée cellulaire ou même d’un organisme entier. L’intégration ciblée
correspond à un « copier – coller » effectué grâce à une méganucléase, une matrice Une étude démontre que la technologie mise au point par Cellectis bioresearch, basée sur
d‘intégration et au processus de recombinaison homologue. l’intégration ciblée à l’aide de méganucléases, s’avère un moyen plus rapide, plus fiable et *Meganuclease-Driven Targeted Integration
in CHO-K1 Cells for the Fast Generation
plus efficace que les méthodes classiques, pour mettre au point des tests cellulaires pour of HTS-Compatible Cell-Based Assays
Les kits d’intégration ciblée de Cellectis bioresearch sont simples d’utilisation, prêts à l’emploi les études en HTS (High Throughput Screening ou criblage à haut débit) qui permettent de Cabaniols J, Ouvry C, Lamamy V, Fery I,
Craplet M.L, Moulharat N, Guenin S.P,
et accompagnés d’un protocole complet. Chaque kit contient tous les éléments nécessaires cribler rapidement un nombre très important de nouvelles molécules. L’intégration ciblée Bedut S, Nosjean O, Ferry G, Devavry S,
pour effectuer une intégration ciblée : une méganucléase de séquence sauvage ou induite par les méganucléases via le kit cGPS® CHO-K1 de Cellectis bioresearch confirme Jacqmarcq C, Lebuhotel C, Mathis L,
Delenda C, Boutin J.A, Duchâteau P, Cogé F,
ingénierée, une matrice d’intégration et, dans le cas des kits cGPS®, une lignée cellulaire. ainsi ses avantages pour la mise au point de médicaments. and Pâques F
J. Biomol. Screen. Sept 2010 - vol 15 no 8
p. 956-967
L’offre «kits de recherche» comprend désormais 5 types cellulaires nouveaux, et l’offre Les résultats de cette étude scientifique portant sur une méthode originale de génération
produits inclut également un pIM Store, collection d’une centaine de matrices d’intégration de lignées cellulaires stables utilisables pour le criblage à haut débit ont été publiés en ligne
compatibles avec les différents kits. Cellectis bioresearch a ouvert en 2010 sa première offre le 12 juillet par la revue Journal of Biomolecular Screening.*
de service à façon pour livrer à ses clients des clones stables par intégration ciblée. 2010
aura également vu la mise en place d’un partenariat majeur avec la société Lonza, leader
mondial de la production biotechnologique, dans le but de modifier leur lignée cellulaire
propriétaire CHO-K1SV utilisée pour la production de médicaments biotechnologiques.

32 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 33

 Cellectis bioresearch propose aux chercheurs en sciences du
vivant des outils faciles d’utilisation et prêts à l’emploi pour générer
des cellules et des organismes ayant les performances souhaitées.
Cellectis bioresearch développe et commercialise des produits de personnalisation des
cGPS
cGPS®® cGPS®®
génomes destinés à la génération de lignées cellulaires isogéniques stables, dont les caracté- Custom
Custom
ristiques et performances répondent aux besoins de trois marchés principaux : la mise au
Intégration d’un site de Ingénierie des
point de médicaments, l’étude du fonctionnement des gènes et la production de protéines. reconnaissance méganucléases

Kits cGPS® et cGPS® Custom

Les kits constituent un moyen simple et efficace d’utiliser les technologies Cellectis basées
sur les méganucléases. Ils permettent d’intégrer un gène en un site extrêmement précis
« L’enjeu vise à remplacer d’un génome.
les méthodes traditionnelles
d’ingénierie cellulaire A fin 2010, Cellectis bioresearch propose plus de 150 produits via sa boutique en ligne et
son réseau de distribution international (Inde, Canada). La société Cellectis bioresearch Inc.,
fondées sur la modification récemment implantée à Cambridge (Massachusetts, États-Unis), assure la promotion des
Méganucléase Matrice Méganucléase Matrice
sauvage d’intégration ingénierée d’intégration
aléatoire et d’imposer produits et services d’ingénierie de lignées cellulaires sur le continent américain.
la modification ciblée. »
Les kits de personnalisation du génome contiennent des réactifs et protocoles permettant
Marc Le Bozec
des modifications précises et ciblées de séquences d’ADN dans le génome d’intérêt,
qu’il s’agisse d’une lignée cellulaire ou même d’un organisme entier. L’intégration ciblée
correspond à un « copier – coller » effectué grâce à une méganucléase, une matrice Une étude démontre que la technologie mise au point par Cellectis bioresearch, basée sur
d‘intégration et au processus de recombinaison homologue. l’intégration ciblée à l’aide de méganucléases, s’avère un moyen plus rapide, plus fiable et *Meganuclease-Driven Targeted Integration
in CHO-K1 Cells for the Fast Generation
plus efficace que les méthodes classiques, pour mettre au point des tests cellulaires pour of HTS-Compatible Cell-Based Assays
Les kits d’intégration ciblée de Cellectis bioresearch sont simples d’utilisation, prêts à l’emploi les études en HTS (High Throughput Screening ou criblage à haut débit) qui permettent de Cabaniols J, Ouvry C, Lamamy V, Fery I,
Craplet M.L, Moulharat N, Guenin S.P,
et accompagnés d’un protocole complet. Chaque kit contient tous les éléments nécessaires cribler rapidement un nombre très important de nouvelles molécules. L’intégration ciblée Bedut S, Nosjean O, Ferry G, Devavry S,
pour effectuer une intégration ciblée : une méganucléase de séquence sauvage ou induite par les méganucléases via le kit cGPS® CHO-K1 de Cellectis bioresearch confirme Jacqmarcq C, Lebuhotel C, Mathis L,
Delenda C, Boutin J.A, Duchâteau P, Cogé F,
ingénierée, une matrice d’intégration et, dans le cas des kits cGPS®, une lignée cellulaire. ainsi ses avantages pour la mise au point de médicaments. and Pâques F
J. Biomol. Screen. Sept 2010 - vol 15 no 8
p. 956-967
L’offre «kits de recherche» comprend désormais 5 types cellulaires nouveaux, et l’offre Les résultats de cette étude scientifique portant sur une méthode originale de génération
produits inclut également un pIM Store, collection d’une centaine de matrices d’intégration de lignées cellulaires stables utilisables pour le criblage à haut débit ont été publiés en ligne
compatibles avec les différents kits. Cellectis bioresearch a ouvert en 2010 sa première offre le 12 juillet par la revue Journal of Biomolecular Screening.*
de service à façon pour livrer à ses clients des clones stables par intégration ciblée. 2010
aura également vu la mise en place d’un partenariat majeur avec la société Lonza, leader
mondial de la production biotechnologique, dans le but de modifier leur lignée cellulaire
propriétaire CHO-K1SV utilisée pour la production de médicaments biotechnologiques.

32 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 33

Cellectis plant sciences

D’ici 2050, la population mondiale devrait passer de 6 milliards Forte de ces connaissances, Cellectis plant sciences se concentre désormais sur ses objectifs
commerciaux, à savoir proposer au secteur agricole des produits, des services, des licences,
d’individus environ actuellement à plus de 9 milliards. ainsi qu’un portefeuille de traits dans son domaine d’expertise – la mutagenèse ciblée dans
des espèces végétales choisies.
Cette croissance démographique, combinée au changement climatique et à la raréfaction
grandissante des ressources nécessaires à l’agriculture, compromettra sérieusement la
À court terme, Cellectis plant sciences souhaite s’écarter des plantes modèles (Arabidopsis
capacité de notre planète à fournir la nourriture, les combustibles et les fibres indispensables
et tabac) et appliquer sa technologie à des espèces commerciales. L’équipe de Cellectis plant
à la préservation de l’humanité. Dans ce scénario-catastrophe, une lueur d’espoir pourrait
sciences dispose déjà d’un savoir-faire en transformation de maïs, riz et soja, et ces compé-
émerger de l‘innovation technologique, et notamment de l’ingénierie des génomes, qui
tences seront essentielles dans le déploiement de la prochaine phase de la société. De plus,
donnera naissance à de nouvelles cultures dont les traits seront en mesure de répondre aux
le processus réglementaire nécessaire à l’introduction de plantes génétiquement modifiées
exigences agricoles futures.
dans l’environnement s’avère extrêmement coûteux. Dans le cadre de la mise en œuvre de
ses stratégies d’ingénierie génomique, l’équipe de scientifiques de Cellectis plant sciences Pr. Daniel Voytas, Directeur scientifique de
Fondée en mars 2010, Cellectis plant sciences est une filiale de Cellectis dédiée à l’applica-
s’assure que seules des modifications mineures sont apportées au génome des plantes. Cellectis plant sciences
tion de nucléases spécifiques de séquences dans les plantes dans le but de mettre au point
Il est à espérer que les génomes de plantes modifiés avec cette précision recevront un
de nouvelles espèces exprimant des traits à valeur ajoutée. Elle a pour principales missions
meilleur accueil sur le marché. « La biologie végétale connaît
de promouvoir et généraliser l’utilisation de la technologie propriétaire de Cellectis dans le
une période exaltante, et nos
domaine de l’agriculture biotechnologique, d’étendre son expertise afin de créer des
opportunités nouvelles et élargies d’octroi de licences et d’amorcer le développement de récentes découvertes en ingénierie
Le Professeur Daniel Voytas a rejoint Cellectis plant sciences dès sa création en tant
traits propriétaires.
que Directeur scientifique. Le Pr. Voytas est Professeur au département de génétique, des génomes marquent le début
biologie cellulaire et développement et Directeur du centre d’ingénierie des génomes d’une nouvelle ère. C’est fascinant
Cellectis plant sciences est dirigée par une équipe de scientifiques de renom. Ceux-ci ont
de l’Université du Minnesota à Minneapolis. Expert en génétique et en biologie de faire partie d’une entreprise
été les premiers à transposer l’ingénierie des génomes aux plantes, un domaine qui a fait la
moléculaire, le Pr. Voytas concentre ses recherches sur la modification du génome
réputation mondiale de l’un d’entre eux, Daniel Voytas, Directeur scientifique de Cellectis
des plantes par le biais de nucléases capables de reconnaître des séquences capable d’intervenir aussi
plant sciences. Le Pr. Voytas est également professeur à l’Université du Minnesota, où il
d’ADN spécifiques. directement sur la vie des Hommes
gère le Centre d’ingénierie des génomes. Le Dr Feng Zhang, Directeur de la recherche de
la filiale, bénéficie quant à lui d’une longue expérience de la modification des génomes de et le bien-être de la planète. »
Le Pr. Voytas est membre élu de l’Association américaine pour l’avancée de la science
maïs, riz et Arabidopsis. Cellectis plant sciences compte, en outre, deux autres éminents Pr. Daniel Voytas
(American Association for the Advancement of Science). Il est rédacteur en chef
scientifiques et deux associés de recherche.
associé du journal Genetics et rédacteur en chef du journal Mobile DNA.
Le Pr. Voytas est le cofondateur du Zing Finger Consortium, un regroupement de
Au cours de sa première année d’activité, Cellectis plant sciences a obtenu des résultats
scientifiques dédié à la promotion des applications des protéines à doigts de zinc
concluants en matière de modification de gènes de plantes grâce à des méganucléases
pour la modification du génome. Il est l’auteur ou le co-auteur de dizaines d’articles
ingénierées. Comme le souligne Luc Mathis, Directeur du Business Development de
scientifiques dans le domaine de l’ingénierie des génomes de plantes.
la filiale, quelques mois seulement après sa création en 2010, l’équipe de Cellectis plant
sciences a déjà réuni des preuves de concept. Ces données démontrent que les
méganucléases présentent, dans les cellules de plantes, des capacités similaires à celles
constatées dans les cellules humaines.

34 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 35

Cellectis plant sciences

D’ici 2050, la population mondiale devrait passer de 6 milliards Forte de ces connaissances, Cellectis plant sciences se concentre désormais sur ses objectifs
commerciaux, à savoir proposer au secteur agricole des produits, des services, des licences,
d’individus environ actuellement à plus de 9 milliards. ainsi qu’un portefeuille de traits dans son domaine d’expertise – la mutagenèse ciblée dans
des espèces végétales choisies.
Cette croissance démographique, combinée au changement climatique et à la raréfaction
grandissante des ressources nécessaires à l’agriculture, compromettra sérieusement la
À court terme, Cellectis plant sciences souhaite s’écarter des plantes modèles (Arabidopsis
capacité de notre planète à fournir la nourriture, les combustibles et les fibres indispensables
et tabac) et appliquer sa technologie à des espèces commerciales. L’équipe de Cellectis plant
à la préservation de l’humanité. Dans ce scénario-catastrophe, une lueur d’espoir pourrait
sciences dispose déjà d’un savoir-faire en transformation de maïs, riz et soja, et ces compé-
émerger de l‘innovation technologique, et notamment de l’ingénierie des génomes, qui
tences seront essentielles dans le déploiement de la prochaine phase de la société. De plus,
donnera naissance à de nouvelles cultures dont les traits seront en mesure de répondre aux
le processus réglementaire nécessaire à l’introduction de plantes génétiquement modifiées
exigences agricoles futures.
dans l’environnement s’avère extrêmement coûteux. Dans le cadre de la mise en œuvre de
ses stratégies d’ingénierie génomique, l’équipe de scientifiques de Cellectis plant sciences Pr. Daniel Voytas, Directeur scientifique de
Fondée en mars 2010, Cellectis plant sciences est une filiale de Cellectis dédiée à l’applica-
s’assure que seules des modifications mineures sont apportées au génome des plantes. Cellectis plant sciences
tion de nucléases spécifiques de séquences dans les plantes dans le but de mettre au point
Il est à espérer que les génomes de plantes modifiés avec cette précision recevront un
de nouvelles espèces exprimant des traits à valeur ajoutée. Elle a pour principales missions
meilleur accueil sur le marché. « La biologie végétale connaît
de promouvoir et généraliser l’utilisation de la technologie propriétaire de Cellectis dans le
une période exaltante, et nos
domaine de l’agriculture biotechnologique, d’étendre son expertise afin de créer des
opportunités nouvelles et élargies d’octroi de licences et d’amorcer le développement de récentes découvertes en ingénierie
Le Professeur Daniel Voytas a rejoint Cellectis plant sciences dès sa création en tant
traits propriétaires.
que Directeur scientifique. Le Pr. Voytas est Professeur au département de génétique, des génomes marquent le début
biologie cellulaire et développement et Directeur du centre d’ingénierie des génomes d’une nouvelle ère. C’est fascinant
Cellectis plant sciences est dirigée par une équipe de scientifiques de renom. Ceux-ci ont
de l’Université du Minnesota à Minneapolis. Expert en génétique et en biologie de faire partie d’une entreprise
été les premiers à transposer l’ingénierie des génomes aux plantes, un domaine qui a fait la
moléculaire, le Pr. Voytas concentre ses recherches sur la modification du génome
réputation mondiale de l’un d’entre eux, Daniel Voytas, Directeur scientifique de Cellectis
des plantes par le biais de nucléases capables de reconnaître des séquences capable d’intervenir aussi
plant sciences. Le Pr. Voytas est également professeur à l’Université du Minnesota, où il
d’ADN spécifiques. directement sur la vie des Hommes
gère le Centre d’ingénierie des génomes. Le Dr Feng Zhang, Directeur de la recherche de
la filiale, bénéficie quant à lui d’une longue expérience de la modification des génomes de et le bien-être de la planète. »
Le Pr. Voytas est membre élu de l’Association américaine pour l’avancée de la science
maïs, riz et Arabidopsis. Cellectis plant sciences compte, en outre, deux autres éminents Pr. Daniel Voytas
(American Association for the Advancement of Science). Il est rédacteur en chef
scientifiques et deux associés de recherche.
associé du journal Genetics et rédacteur en chef du journal Mobile DNA.
Le Pr. Voytas est le cofondateur du Zing Finger Consortium, un regroupement de
Au cours de sa première année d’activité, Cellectis plant sciences a obtenu des résultats
scientifiques dédié à la promotion des applications des protéines à doigts de zinc
concluants en matière de modification de gènes de plantes grâce à des méganucléases
pour la modification du génome. Il est l’auteur ou le co-auteur de dizaines d’articles
ingénierées. Comme le souligne Luc Mathis, Directeur du Business Development de
scientifiques dans le domaine de l’ingénierie des génomes de plantes.
la filiale, quelques mois seulement après sa création en 2010, l’équipe de Cellectis plant
sciences a déjà réuni des preuves de concept. Ces données démontrent que les
méganucléases présentent, dans les cellules de plantes, des capacités similaires à celles
constatées dans les cellules humaines.

34 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 35

ECTYCELL

Ectycell a été inaugurée en septembre 2009 pour appliquer les
avantages de la technologie de Cellectis aux développements
dans le domaine des cellules souches, et plus particulièrement
des cellules souches pluripotentes induites (iPS).
Cette filiale va utiliser ces technologies pour transformer les cellules souches en de vrais
outils de développement et de production, qui seront, robustes, reproductibles et utilisables
dans des expériences à haut débit.
Ectycell a démarré plusieurs programmes qui utilisent les avantages des méganucléases dans
l’ingénierie des génomes. Ces programmes concernent :
• Le développement d’iPS « propres » en générant des iPS à partir de cellules adultes par pourrait également ouvrir de nouvelles voies dans le domaine thérapeutique, notamment
En octobre Cellectis a obtenu des licences pour l’utilisation des technologies de cellules
souches pluripotentes induites d’iPS Academia Japan. La signature de deux accords de
licence non exclusifs donnent à Cellectis un accès au portefeuille de brevets sur les cellules
souches pluripotentes induites (iPS ) découlant des travaux du Professeur Shinya Yamanaka,
du Centre de recherche et d’application des iPS (CiRA) de l’Université de Kyoto.
Le Professeur Yamanaka et son équipe sont à l’origine de ce travail innovant et Cellectis
est la première société au monde à bénéficier de licences pour des applications
thérapeutiques ou prophylactiques humaines sur ce portefeuille d’iPS Academia Japan.
Ectycell a été créée sur la conviction que la mise au point de tests précoces de criblage à
haut débit permettra de mieux envisager l’effet d’une molécule sur l’organisme dans son
ensemble ou sur une population génétiquement variée et pourra ainsi réduire de manière
significative le taux élevé d’attrition dans le développement des médicaments. Ectycell
Comment faire une iPS

« Ectycell est en charge du
déploiement des technologies
intégration ciblée et excision de facteurs de reprogrammation. Ceci évitera l’utilisation de pour la médecine régénérative. 4 gènes
méthodes d’intégration virale aléatoire pour la production de cellules souches induites.
Qu’est-ce qu’une cellule souche pluripotente induite ?
• Le développement de nouvelles méthodes reproductibles pour la différenciation cellulaire Une cellule souche pluripotente induite (ou iPS) est une cellule adulte qui a été reprogram-
à partir d’iPS en utilisant des technologies d’ingénierie des génomes ciblée. mée pour se comporter comme une cellule souche embryonnaire. Après fécondation
d’un ovule, l’œuf se divise puis très vite apparaissent des cellules qui sont à l’origine de
• Le développement de méthodologies et processus fiables pour la production à grande tous les tissus du corps. C’est ce qu’on appelle une cellule souche embryonnaire, ces cellules
échelle de cellules iPS. sont dites pluripotentes et ont la capacité de générer tous les types cellulaires. Jusque
récemment, il était admis qu’il était impossible à une cellule de remonter la chaine de
une cellule adulte

d‘ingénierie des génomes • La création de banques de cellules iPS qui pourront être utilisées pour des applications différenciation pour redevenir immature.
de Cellectis dans le domaine de criblage à haut débit de candidats médicaments.
En 2006, l’équipe du Professeur Shinya Yamanaka, de l’Université de Kyoto, montre que
des cellules souches, pour l’on peut reprogrammer une cellule adulte, c’est-à-dire mature, pour lui faire retrouver les cellules souches pluripotentes

contribuer à en faire de véritables caractéristiques d’une cellule souche embryonnaire. Il suffit pour cela de lui faire exprimer
outils industriels, robustes, 4 gènes (non exprimés normalement dans les cellules adultes) pour qu’elle retrouve la
capacité de se différencier dans tous les types cellulaires. On appelle cette cellule une cellule
reproductibles et utilisables pour souche pluripotente induite ou iPS (pour induced Pluripotent Stem cell).
des expériences à haut débit. »
Dr. David Sourdive, Vice président Développement Types de cellules désirés tels que...
corporate et président d’Ectycell

...cellule ...cellule ...cellule

nerveuse sanguine cardiaque

36 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 37

ECTYCELL

Ectycell a été inaugurée en septembre 2009 pour appliquer les
avantages de la technologie de Cellectis aux développements
dans le domaine des cellules souches, et plus particulièrement
des cellules souches pluripotentes induites (iPS).
Cette filiale va utiliser ces technologies pour transformer les cellules souches en de vrais
outils de développement et de production, qui seront, robustes, reproductibles et utilisables
dans des expériences à haut débit.
Ectycell a démarré plusieurs programmes qui utilisent les avantages des méganucléases dans
l’ingénierie des génomes. Ces programmes concernent :
• Le développement d’iPS « propres » en générant des iPS à partir de cellules adultes par pourrait également ouvrir de nouvelles voies dans le domaine thérapeutique, notamment
En octobre Cellectis a obtenu des licences pour l’utilisation des technologies de cellules
souches pluripotentes induites d’iPS Academia Japan. La signature de deux accords de
licence non exclusifs donnent à Cellectis un accès au portefeuille de brevets sur les cellules
souches pluripotentes induites (iPS ) découlant des travaux du Professeur Shinya Yamanaka,
du Centre de recherche et d’application des iPS (CiRA) de l’Université de Kyoto.
Le Professeur Yamanaka et son équipe sont à l’origine de ce travail innovant et Cellectis
est la première société au monde à bénéficier de licences pour des applications
thérapeutiques ou prophylactiques humaines sur ce portefeuille d’iPS Academia Japan.
Ectycell a été créée sur la conviction que la mise au point de tests précoces de criblage à
haut débit permettra de mieux envisager l’effet d’une molécule sur l’organisme dans son
ensemble ou sur une population génétiquement variée et pourra ainsi réduire de manière
significative le taux élevé d’attrition dans le développement des médicaments. Ectycell
Comment faire une iPS

« Ectycell est en charge du
déploiement des technologies
intégration ciblée et excision de facteurs de reprogrammation. Ceci évitera l’utilisation de pour la médecine régénérative. 4 gènes
méthodes d’intégration virale aléatoire pour la production de cellules souches induites.
Qu’est-ce qu’une cellule souche pluripotente induite ?
• Le développement de nouvelles méthodes reproductibles pour la différenciation cellulaire Une cellule souche pluripotente induite (ou iPS) est une cellule adulte qui a été reprogram-
à partir d’iPS en utilisant des technologies d’ingénierie des génomes ciblée. mée pour se comporter comme une cellule souche embryonnaire. Après fécondation
d’un ovule, l’œuf se divise puis très vite apparaissent des cellules qui sont à l’origine de
• Le développement de méthodologies et processus fiables pour la production à grande tous les tissus du corps. C’est ce qu’on appelle une cellule souche embryonnaire, ces cellules
échelle de cellules iPS. sont dites pluripotentes et ont la capacité de générer tous les types cellulaires. Jusque
récemment, il était admis qu’il était impossible à une cellule de remonter la chaine de
une cellule adulte

d‘ingénierie des génomes • La création de banques de cellules iPS qui pourront être utilisées pour des applications différenciation pour redevenir immature.
de Cellectis dans le domaine de criblage à haut débit de candidats médicaments.
En 2006, l’équipe du Professeur Shinya Yamanaka, de l’Université de Kyoto, montre que
des cellules souches, pour l’on peut reprogrammer une cellule adulte, c’est-à-dire mature, pour lui faire retrouver les cellules souches pluripotentes

contribuer à en faire de véritables caractéristiques d’une cellule souche embryonnaire. Il suffit pour cela de lui faire exprimer
outils industriels, robustes, 4 gènes (non exprimés normalement dans les cellules adultes) pour qu’elle retrouve la
capacité de se différencier dans tous les types cellulaires. On appelle cette cellule une cellule
reproductibles et utilisables pour souche pluripotente induite ou iPS (pour induced Pluripotent Stem cell).
des expériences à haut débit. »
Dr. David Sourdive, Vice président Développement Types de cellules désirés tels que...
corporate et président d’Ectycell

...cellule ...cellule ...cellule

nerveuse sanguine cardiaque

36 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 37

Cellectis therapeutics

« L’année 2010 a été une année
d’apprentissage intensif tant
pour les équipes de Cellectis
therapeutics que pour les
instances et les partenaires de
l’industrie du médicament
biotechnologique avec lesquels
nous avons collaboré. En parallèle qui conduisent des essais cliniques nécessitant ce type de dispositif médical. Ce système,
des premières preuves de
concept, nous avons souvent Initialement développé pour un traitement vaccinal des cancers (prostate, colon), Dermavax
été précurseurs pour l’utilisation, est aujourd’hui également testé dans une approche prophylactique des infections au VIH.
la production et la validation
de technologies. »
Dr. Sylvain Arnould, chef de projet préclinique
chez Cellectis therapeutics
Cellectis therapeutics, créée en 2008 en tant que Cellectis 2010 fut une année charnière pour Cellectis therapeutics qui a
genome surgery, est dédiée au développement de thérapies obtenu des résultats très encourageants, notamment au niveau
innovantes utilisant les méganucléases pour traiter des maladies de preuves de concept de l’activité antivirale des méganucléases*.
génétiques (myopathies, hémophilies, …), des cancers et Cette année nous aura par ailleurs permis d’avancer de
des infections virales persistantes (kératite herpétique, Sida). manière conséquente sur nos projets de thérapie cellulaire.
Cette filiale, composée d’une équipe de 19 personnes dont 10 docteurs en sciences, a pour En effet, les équipes ont réussi à identifier de bonnes cibles pour l’approche dite
mission de répondre à des besoins médicaux non satisfaits à ce jour et s’emploie à trouver Safe Harbor. Cette approche consiste à caractériser un endroit du génome où un gène
des traitements pour soigner les patients atteints d’affections sévères résistant aux traitements d’intérêt thérapeutique peut être inséré et s’exprimer sans perturber le reste du
Dr. Carole Desseaux, directeur des opérations cliniques
classiques. Dans son approche de la chirurgie du génome, le traitement proposé par fonctionnement de la cellule. Nous avons également obtenu des premiers succès et précliniques
Cellectis therapeutics cible la séquence d’ADN responsable de la maladie, qui peut être dans la mise en place d’une approche de vectorisation des méganucléases n’utilisant
d’origine innée (maladie génétique) ou acquise (infection virale, cancers). pas de vecteurs viraux, basée sur le système d’électroporation de CytoPulse.
« Les méganucléases
La stratégie thérapeutique consiste de ce fait à s’attaquer à la cause de la maladie et Enfin, nous avons obtenu des résultats prometteurs en recombinaison homologue
à guérir le patient, plutôt qu’à en traiter simplement les symptômes. Depuis sa création, dans des cellules primaires, posant ainsi les jalons majeurs de notre développement résolvent le problème de
Cellectis therapeutics a collaboré avec des équipes académiques et des cliniciens du en thérapie cellulaire. l’insertion aléatoire. La
monde entier (CNRS, INSERM, Children Hospital à Boston, VIB, Institut de la Vision, précision de la technologie
et bien d’autres) pour que ses recherches aboutissent rapidement à des traitements En thérapie génique, les résultats publiés par nos collaborateurs canadiens sur la
médicaux efficaces. myopathie de Duchenne* sont une excellente illustration de la dynamique de Cellectis permet
de recherche sur les méganucléases à visée thérapeutique mise en œuvre chez nos d’amener le nouveau gène
Essais cliniques en cours partenaires académiques.
exactement où l’on veut,
Après le rachat des actifs de CytoPulse en septembre 2010, Cellectis a décidé de poursuivre
à une position précise et
le programme de partenariat, mis en place par cette société, pour l’utilisation des électro- En conclusion, l’année 2010 nous aura permis d’obtenir des preuves de concept
porateurs en stratégie vaccinale. La technologie de CytoPulse, l’électroporation, est importantes et de valider notre stratégie scientifique et réglementaire. Nous démarrons neutre pour la cellule.
une technique particulièrement efficace d’introduction de molécules, telles que des méga- 2011 avec l’objectif de confirmer ces résultats dans les pathologies clés, comme
On peut vraiment espérer
nucléases, dans n’importe quel type de cellules. l’hémophilie*.
qu’un jour ces programmes
Cellectis fournit ainsi des appareils d’électroporation dermique Dermavax aux laboratoires Dr. Carole Desseaux de recherche permettront
d’offrir des thérapies effi-
qui facilite la pénétration de petits fragments d’ADN dans les cellules par application d’un
caces pour améliorer la vie
champ électrique, potentialise l’effet de vaccins à ADN en stimulant la réponse immunitaire.
des patients hémophiles. »
Thierry VandenDriessche et Marinee Chuah,
Les essais cliniques, au nombre de trois, sont menés au Karolinska Institute et au Cancer VIB Vesalius Research Institute à l’Université
Catholique de Louvain
Center à Stockholm dans les laboratoires des Professeurs Britta Wahren et Eric Sandström
ainsi qu‘à Uppsala University, par le Professeur Totterman et le Docteur Yachnin.

* plus d’informations en page 40

38 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 39

Cellectis therapeutics

« L’année 2010 a été une année
d’apprentissage intensif tant
pour les équipes de Cellectis
therapeutics que pour les
instances et les partenaires de
l’industrie du médicament
biotechnologique avec lesquels
nous avons collaboré. En parallèle qui conduisent des essais cliniques nécessitant ce type de dispositif médical. Ce système,
des premières preuves de
concept, nous avons souvent Initialement développé pour un traitement vaccinal des cancers (prostate, colon), Dermavax
été précurseurs pour l’utilisation, est aujourd’hui également testé dans une approche prophylactique des infections au VIH.
la production et la validation
de technologies. »
Dr. Sylvain Arnould, chef de projet préclinique
chez Cellectis therapeutics
Cellectis therapeutics, créée en 2008 en tant que Cellectis 2010 fut une année charnière pour Cellectis therapeutics qui a
genome surgery, est dédiée au développement de thérapies obtenu des résultats très encourageants, notamment au niveau
innovantes utilisant les méganucléases pour traiter des maladies de preuves de concept de l’activité antivirale des méganucléases*.
génétiques (myopathies, hémophilies, …), des cancers et Cette année nous aura par ailleurs permis d’avancer de
des infections virales persistantes (kératite herpétique, Sida). manière conséquente sur nos projets de thérapie cellulaire.
Cette filiale, composée d’une équipe de 19 personnes dont 10 docteurs en sciences, a pour En effet, les équipes ont réussi à identifier de bonnes cibles pour l’approche dite
mission de répondre à des besoins médicaux non satisfaits à ce jour et s’emploie à trouver Safe Harbor. Cette approche consiste à caractériser un endroit du génome où un gène
des traitements pour soigner les patients atteints d’affections sévères résistant aux traitements d’intérêt thérapeutique peut être inséré et s’exprimer sans perturber le reste du
Dr. Carole Desseaux, directeur des opérations cliniques
classiques. Dans son approche de la chirurgie du génome, le traitement proposé par fonctionnement de la cellule. Nous avons également obtenu des premiers succès et précliniques
Cellectis therapeutics cible la séquence d’ADN responsable de la maladie, qui peut être dans la mise en place d’une approche de vectorisation des méganucléases n’utilisant
d’origine innée (maladie génétique) ou acquise (infection virale, cancers). pas de vecteurs viraux, basée sur le système d’électroporation de CytoPulse.
« Les méganucléases
La stratégie thérapeutique consiste de ce fait à s’attaquer à la cause de la maladie et Enfin, nous avons obtenu des résultats prometteurs en recombinaison homologue
à guérir le patient, plutôt qu’à en traiter simplement les symptômes. Depuis sa création, dans des cellules primaires, posant ainsi les jalons majeurs de notre développement résolvent le problème de
Cellectis therapeutics a collaboré avec des équipes académiques et des cliniciens du en thérapie cellulaire. l’insertion aléatoire. La
monde entier (CNRS, INSERM, Children Hospital à Boston, VIB, Institut de la Vision, précision de la technologie
et bien d’autres) pour que ses recherches aboutissent rapidement à des traitements En thérapie génique, les résultats publiés par nos collaborateurs canadiens sur la
médicaux efficaces. myopathie de Duchenne* sont une excellente illustration de la dynamique de Cellectis permet
de recherche sur les méganucléases à visée thérapeutique mise en œuvre chez nos d’amener le nouveau gène
Essais cliniques en cours partenaires académiques.
exactement où l’on veut,
Après le rachat des actifs de CytoPulse en septembre 2010, Cellectis a décidé de poursuivre
à une position précise et
le programme de partenariat, mis en place par cette société, pour l’utilisation des électro- En conclusion, l’année 2010 nous aura permis d’obtenir des preuves de concept
porateurs en stratégie vaccinale. La technologie de CytoPulse, l’électroporation, est importantes et de valider notre stratégie scientifique et réglementaire. Nous démarrons neutre pour la cellule.
une technique particulièrement efficace d’introduction de molécules, telles que des méga- 2011 avec l’objectif de confirmer ces résultats dans les pathologies clés, comme
On peut vraiment espérer
nucléases, dans n’importe quel type de cellules. l’hémophilie*.
qu’un jour ces programmes
Cellectis fournit ainsi des appareils d’électroporation dermique Dermavax aux laboratoires Dr. Carole Desseaux de recherche permettront
d’offrir des thérapies effi-
qui facilite la pénétration de petits fragments d’ADN dans les cellules par application d’un
caces pour améliorer la vie
champ électrique, potentialise l’effet de vaccins à ADN en stimulant la réponse immunitaire.
des patients hémophiles. »
Thierry VandenDriessche et Marinee Chuah,
Les essais cliniques, au nombre de trois, sont menés au Karolinska Institute et au Cancer VIB Vesalius Research Institute à l’Université
Catholique de Louvain
Center à Stockholm dans les laboratoires des Professeurs Britta Wahren et Eric Sandström
ainsi qu‘à Uppsala University, par le Professeur Totterman et le Docteur Yachnin.

* plus d’informations en page 40

38 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 39


Publications
Le virus de l’herpès
Meganuclease-mediated Inhibition of HSV1
Infection in Cultured Cells
Grosse S, Huot N, Mahiet C, Arnould S,
Barradeau S, Clerre DL, Chion-Sotinel I,
Jacqmarcq C, Chapellier B, Ergani A,
Desseaux C, Cédrone F, Conseiller E, Pâques F,
Labetoulle M, Smith J.
Molecular Therapy. 2011 Jan 11.
La myopathie de Duchenne
Meganucleases can restore the reading frame
of a mutated dystrophin
Chapdelaine P, Pichavant C, Rousseau J,
Pâques F and Tremblay J.P
Gene Therapy (2010) 17, 846–858;
40 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Le virus de l’herpès
Des scientifiques de Cellectis therapeutics, du CNRS et de l’Institut de la Vision (Paris) ont
utilisé la technologie des méganucléases de Cellectis pour prévenir avec succès l’infection
de cellules en culture par un virus de l’herpès (HSV-1). Ces résultats ont été publiés par la
revue Molecular Therapy. Il s’agit de la première preuve de concept démontrant la capacité
des méganucléases à empêcher une infection virale. L’article décrit comment ces scienti-
fiques sont parvenus, en utilisant des méganucléases spécifiques ingénierées par Cellectis,
à prévenir l’infection, par le HSV-1, de cellules humaines en culture.
L’analyse des cellules traitées par séquençage a montré que l’ADN viral avait bien été coupé
et dégradé par la méganucléase, entrainant son incapacité à se répliquer ou à se propager.
La myopathie de Duchenne
Les chercheurs du Centre hospitalo-universitaire de Laval, au Québec, ont utilisé des méga-
nucléases ingénieriées par Cellectis pour restaurer l’expression de la microdystrophine
in vitro, dans des cellules humaines, et in vivo, dans des fibres musculaires, démontrant
ainsi le potentiel des méganucléases dans le traitement de la myopathie de Duchenne.
Ces nouvelles données ont été publiées dans la revue scientifique Gene Therapy.
La thérapie génique au secours de l’hémophilie
VIB, un institut flamant de recherche en Sciences de la Vie et Cellectis collaborent sur de
nouvelles approches pour traiter l’hémophilie. Les chercheurs du VIB utilisent des méga-
nucléases pour remplacer les gènes codants pour des facteurs de coagulation sanguine
défectueux par des copies fonctionnelles. L’hémophilie est un ensemble de désordres
génétiques héréditaires récessifs liés à l’X qui perturbent la coagulation sanguine et la
formation de caillots. Les patients hémophiles souffrent à différents degrés d’hémorragies
internes ou externes car les saignements s’arrêtent difficilement lorsqu’un vaisseau est
endommagé. Dans des zones comme le cerveau ou à l’intérieur des articulations, cela peut
être fatal ou gravement invalidant.
ElEMENTS FINANCIERS
l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 41

Publications
Le virus de l’herpès
Meganuclease-mediated Inhibition of HSV1
Infection in Cultured Cells
Grosse S, Huot N, Mahiet C, Arnould S,
Barradeau S, Clerre DL, Chion-Sotinel I,
Jacqmarcq C, Chapellier B, Ergani A,
Desseaux C, Cédrone F, Conseiller E, Pâques F,
Labetoulle M, Smith J.
Molecular Therapy. 2011 Jan 11.
La myopathie de Duchenne
Meganucleases can restore the reading frame
of a mutated dystrophin
Chapdelaine P, Pichavant C, Rousseau J,
Pâques F and Tremblay J.P
Gene Therapy (2010) 17, 846–858;
40 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010
Le virus de l’herpès
Des scientifiques de Cellectis therapeutics, du CNRS et de l’Institut de la Vision (Paris) ont
utilisé la technologie des méganucléases de Cellectis pour prévenir avec succès l’infection
de cellules en culture par un virus de l’herpès (HSV-1). Ces résultats ont été publiés par la
revue Molecular Therapy. Il s’agit de la première preuve de concept démontrant la capacité
des méganucléases à empêcher une infection virale. L’article décrit comment ces scienti-
fiques sont parvenus, en utilisant des méganucléases spécifiques ingénierées par Cellectis,
à prévenir l’infection, par le HSV-1, de cellules humaines en culture.
L’analyse des cellules traitées par séquençage a montré que l’ADN viral avait bien été coupé
et dégradé par la méganucléase, entrainant son incapacité à se répliquer ou à se propager.
La myopathie de Duchenne
Les chercheurs du Centre hospitalo-universitaire de Laval, au Québec, ont utilisé des méga-
nucléases ingénieriées par Cellectis pour restaurer l’expression de la microdystrophine
in vitro, dans des cellules humaines, et in vivo, dans des fibres musculaires, démontrant
ainsi le potentiel des méganucléases dans le traitement de la myopathie de Duchenne.
Ces nouvelles données ont été publiées dans la revue scientifique Gene Therapy.
La thérapie génique au secours de l’hémophilie
VIB, un institut flamant de recherche en Sciences de la Vie et Cellectis collaborent sur de
nouvelles approches pour traiter l’hémophilie. Les chercheurs du VIB utilisent des méga-
nucléases pour remplacer les gènes codants pour des facteurs de coagulation sanguine
défectueux par des copies fonctionnelles. L’hémophilie est un ensemble de désordres
génétiques héréditaires récessifs liés à l’X qui perturbent la coagulation sanguine et la
formation de caillots. Les patients hémophiles souffrent à différents degrés d’hémorragies
internes ou externes car les saignements s’arrêtent difficilement lorsqu’un vaisseau est
endommagé. Dans des zones comme le cerveau ou à l’intérieur des articulations, cela peut
être fatal ou gravement invalidant.
ElEMENTS FINANCIERS
l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 41
Etats financiers

Bilan – Actif Bilan – Passif

Montants exprimés en milliers d’euros 31 décembre 2010 31 décembre 2009 Montants exprimés en milliers d’euros 31 décembre 2010 31 décembre 2009
Note :
Immobilisations incorporelles nettes 3 976 903 Capital social 584 582
Depuis 2010, la société a souhaité améliorer la
qualité de l’information financière qu’elle diffuse Immobilisations corporelles nettes 3 913 2 893 Primes et réserves 45 170 52 404
en établissant désormais des comptes complets
en normes IFRS. Cette démarche est en cours. Actifs financiers non courants 231 231 Résultat de l’exercice (8 063) (7 768)

Elle a conduit à affiner certains retraitements, Impôts Différés Actifs 8 169 5 133 Capitaux propres 37 691 45 218
notamment ceux concernant la reconnaissance
des revenus, les contrats de leasing, les impôts Total des actifs non courants 16 289 9 160 Provisions pour engagements envers les salariés 120 42
différés actifs et l’immobilisation de certains
frais de développement. Les chiffres présentés
Stocks 153 118 Emprunts 809 491
ici intègrent donc l’ensemble des
Clients et comptes rattachés 2 491 1 768 Autres passifs financiers 588 795
retraitements requis par les normes IFRS, mais à
la date de publication de ce rapport, les comptes
CIR et subventions 6 588 1 570 Provisions pour risques et charges 50 71
consolidés étaient encore en cours de révision
par les commissaires aux comptes.
Autres actifs courants 2 486 2 465 Total des passifs non courants 1 567 1 399

Trésorerie et équivalents de trésorerie 24 048 45 080 Emprunts 560 748

Total des actifs courants 35 766 51 001 Autres passifs financiers 257 107

TOTAL DE L’ACTIF 52 055 60 161 Fournisseurs et comptes rattachés 8 464 6 548

Produits constatés d‘avance 3 516 6 141

Les immobilisations incorporelles au 31 décembre 2010 comprennent 2,4 M € de frais de Total des passifs courants 12 797 13 544
développement et 1,5 M € de brevets acquis. Il s’agit d’une évolution sensible au regard des
TOTAL DU PASSIF 52 055 60 161
derniers exercices fiscaux dans la mesure où pour la première fois des frais de recherche et
développement des activités kits et plantes sont immobilisés. Cela correspond à la maturité
économique de ces deux activités, qui génèrent déjà des revenus récurrents. Le montant des Les immobilisations corporelles sont essentiellement constituées d’équipements de laboratoire.
immobilisations liées aux brevets augmente significativement à la faveur de l’acquisition des Le crédit d’impôt lié aux reports déficitaires de Cellectis et de ses filiales est activé compte tenu
actifs de Cytopulse, Inc. de ses perspectives de recouvrabilité.

La ligne “Emprunts” (courants et non courants) correspond essentiellement au retraitement

des contrats de leasing sur les équipements de laboratoire.

Les autres passifs financiers sont constitués des avances remboursables accordées au groupe
sur certains programmes de recherche. En clair, l’endettement financier de la société est proche
de zéro et cela est à mettre en regard de fonds propres à hauteur d’environ 38 M € fin 2010.

42 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 43

Etats financiers

Bilan – Actif Bilan – Passif

Montants exprimés en milliers d’euros 31 décembre 2010 31 décembre 2009 Montants exprimés en milliers d’euros 31 décembre 2010 31 décembre 2009
Note :
Immobilisations incorporelles nettes 3 976 903 Capital social 584 582
Depuis 2010, la société a souhaité améliorer la
qualité de l’information financière qu’elle diffuse Immobilisations corporelles nettes 3 913 2 893 Primes et réserves 45 170 52 404
en établissant désormais des comptes complets
en normes IFRS. Cette démarche est en cours. Actifs financiers non courants 231 231 Résultat de l’exercice (8 063) (7 768)

Elle a conduit à affiner certains retraitements, Impôts Différés Actifs 8 169 5 133 Capitaux propres 37 691 45 218
notamment ceux concernant la reconnaissance
des revenus, les contrats de leasing, les impôts Total des actifs non courants 16 289 9 160 Provisions pour engagements envers les salariés 120 42
différés actifs et l’immobilisation de certains
frais de développement. Les chiffres présentés
Stocks 153 118 Emprunts 809 491
ici intègrent donc l’ensemble des
Clients et comptes rattachés 2 491 1 768 Autres passifs financiers 588 795
retraitements requis par les normes IFRS, mais à
la date de publication de ce rapport, les comptes
CIR et subventions 6 588 1 570 Provisions pour risques et charges 50 71
consolidés étaient encore en cours de révision
par les commissaires aux comptes.
Autres actifs courants 2 486 2 465 Total des passifs non courants 1 567 1 399

Trésorerie et équivalents de trésorerie 24 048 45 080 Emprunts 560 748

Total des actifs courants 35 766 51 001 Autres passifs financiers 257 107

TOTAL DE L’ACTIF 52 055 60 161 Fournisseurs et comptes rattachés 8 464 6 548

Produits constatés d‘avance 3 516 6 141

Les immobilisations incorporelles au 31 décembre 2010 comprennent 2,4 M € de frais de Total des passifs courants 12 797 13 544
développement et 1,5 M € de brevets acquis. Il s’agit d’une évolution sensible au regard des
TOTAL DU PASSIF 52 055 60 161
derniers exercices fiscaux dans la mesure où pour la première fois des frais de recherche et
développement des activités kits et plantes sont immobilisés. Cela correspond à la maturité
économique de ces deux activités, qui génèrent déjà des revenus récurrents. Le montant des Les immobilisations corporelles sont essentiellement constituées d’équipements de laboratoire.
immobilisations liées aux brevets augmente significativement à la faveur de l’acquisition des Le crédit d’impôt lié aux reports déficitaires de Cellectis et de ses filiales est activé compte tenu
actifs de Cytopulse, Inc. de ses perspectives de recouvrabilité.

La ligne “Emprunts” (courants et non courants) correspond essentiellement au retraitement

des contrats de leasing sur les équipements de laboratoire.

Les autres passifs financiers sont constitués des avances remboursables accordées au groupe
sur certains programmes de recherche. En clair, l’endettement financier de la société est proche
de zéro et cela est à mettre en regard de fonds propres à hauteur d’environ 38 M € fin 2010.

42 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 43

 Compte de résultat Tableau des flux de trésorerie
2010 2009 2010 2009
Montants exprimés en milliers d’euros 12 mois 12 mois Montants exprimés en milliers d'euros 12 mois 12 mois

Chiffre d'affaires 8 166 7 613 Résultat net consolidé (8 063) (7 768)

Autres produits de l'activité 1
7 609 2 527 Amortissements et provisions 1 186 793
Produits des activités ordinaires 15 775 10 140 Plus-valus de cessions d‘actifs (61)
Coût des ventes (licensing-in) (1 445) (1 449) Impôts différés (3 036) (1 749)
Marge brute 14 330 8 691 Charges liées aux paiements sur base d’actions 435 1 045
Recherche et Développement (12 311) (7 971) Autres éléments non cash 144 (30)
Marketing et Administratif (13 457) (10 601) Marge brute d’autofinancement avant variation du besoin en fonds de roulement (9 334) (7 770)
Autres produits 0 78 (Augmentation) / diminution des créances clients et comptes rattachés (758) (893)
Autres charges (27) (Augmentation) / diminution du CIR et des subventions à recevoir (5 018) 1 321
Résultat opérationnel courant (11 465) (9 803) (Diminution) / augmentation des dettes fournisseurs et comptes rattachés 1 916 71
Produits financiers 485 463 Variation nette des autres actifs et passifs liés à l’activité (a) (2 672) 3 952
Charges financières (153) (173) Variation du besoin en fonds de roulement lié à l’activité (6 532) (4 451)
Autres produits et charges financiers 34 (4) FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ A L’ACTIVITÉ (15 866) (3 319)
Coût financier net 366 286 Acquisitions d’immobilisations incorporelles (b) (3 528) (1 017)
Impôts sur le résultat 3 036 1 749 Acquisitions d’immobilisations corporelles (1 477) (448)
Résultat net (8 063) (7 768) Acquisitions d’immobilisations financières
Produits de cession d’actifs corporels et incorporels 729 719
1
dont CIR 6 148 1 255 FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ AUX OPÉRATIONS D‘INVESTISSEMENT (4 276) (746)
Augmentation des passifs à long terme 0 0
Les produits de licence et les ventes de kits de recherche ont progressé de plus de 7% en 2010. Remboursement de passifs financiers à long terme (983) (1 079)
Cette évolution est importante dans un contexte 2010 très difficile pour la signature d’accords Encaissements provenants de l’émission d’instruments de capitaux propres 93 22 296
avec de grands groupes, en attente ou en restructuration, et dans un contexte de lancement FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ AUX OPÉRATIONS DE FINANCEMENT (890) 21 217
pour l’activité kits. Le prochain exercice devrait voir des progrès importants notamment dans le
domaine des ventes de kits et services associés.
VARIATION DE LA TRÉSORERIE (21 032) 17 152
Le Crédit d’Impôt Recherche a très fortement augmenté en 2010 (6,1 M € vs 1,3 M € en
2009) essentiellement du fait de l’augmentation des dépenses de recherche et développement Trésorerie nette à l’ouverture 45 080 27 928
(+54%) et de la baisse des subventions perçues en 2010. Au-delà, un travail de fond a été Trésorerie nette à la clôture 24 048 45 080
effectué au sein du groupe avec l’aide d’un conseil afin de mieux appréhender le Crédit AUGMENTATION (DIMINUTION) DE LA TRÉSORERIE (21 032) 17 152
d’Impôt Recherche.
L’augmentation des charges d’exploitation en 2010 traduit la mise en œuvre de la stratégie
L’augmentation du Crédit d’Impôt Recherche en 2010 se traduit par une forte augmentation
de forte croissance définie en 2009 et le renforcement des équipes de recherche amont, au
de cette créance au 31 décembre. Les investissements incorporels en 2010 correspondent à
niveau de Cellectis, ainsi que des plateformes de développement d’applications au niveau
1,9 M € de frais de développement immobilisés et à l’acquisition de brevets. La consommation
de chacune des filiales. Ces charges augmentent en recherche et développement d’environ
de cash de l’année a été impactée pour un tiers environ par une variation défavorable mais
50% en cohérence avec l’accroissement de l’effectif (+50% de fin 2009 à fin 2010).
temporaire du BFR (besoin en fonds de roulement). En 2011, la variation de trésorerie devrait
être proche du résultat net.
44 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 45
 Compte de résultat Tableau des flux de trésorerie
2010 2009 2010 2009
Montants exprimés en milliers d’euros 12 mois 12 mois Montants exprimés en milliers d'euros 12 mois 12 mois

Chiffre d'affaires 8 166 7 613 Résultat net consolidé (8 063) (7 768)

Autres produits de l'activité 1
7 609 2 527 Amortissements et provisions 1 186 793
Produits des activités ordinaires 15 775 10 140 Plus-valus de cessions d‘actifs (61)
Coût des ventes (licensing-in) (1 445) (1 449) Impôts différés (3 036) (1 749)
Marge brute 14 330 8 691 Charges liées aux paiements sur base d’actions 435 1 045
Recherche et Développement (12 311) (7 971) Autres éléments non cash 144 (30)
Marketing et Administratif (13 457) (10 601) Marge brute d’autofinancement avant variation du besoin en fonds de roulement (9 334) (7 770)
Autres produits 0 78 (Augmentation) / diminution des créances clients et comptes rattachés (758) (893)
Autres charges (27) (Augmentation) / diminution du CIR et des subventions à recevoir (5 018) 1 321
Résultat opérationnel courant (11 465) (9 803) (Diminution) / augmentation des dettes fournisseurs et comptes rattachés 1 916 71
Produits financiers 485 463 Variation nette des autres actifs et passifs liés à l’activité (a) (2 672) 3 952
Charges financières (153) (173) Variation du besoin en fonds de roulement lié à l’activité (6 532) (4 451)
Autres produits et charges financiers 34 (4) FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ A L’ACTIVITÉ (15 866) (3 319)
Coût financier net 366 286 Acquisitions d’immobilisations incorporelles (b) (3 528) (1 017)
Impôts sur le résultat 3 036 1 749 Acquisitions d’immobilisations corporelles (1 477) (448)
Résultat net (8 063) (7 768) Acquisitions d’immobilisations financières
Produits de cession d’actifs corporels et incorporels 729 719
1
dont CIR 6 148 1 255 FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ AUX OPÉRATIONS D‘INVESTISSEMENT (4 276) (746)
Augmentation des passifs à long terme 0 0
Les produits de licence et les ventes de kits de recherche ont progressé de plus de 7% en 2010. Remboursement de passifs financiers à long terme (983) (1 079)
Cette évolution est importante dans un contexte 2010 très difficile pour la signature d’accords Encaissements provenants de l’émission d’instruments de capitaux propres 93 22 296
avec de grands groupes, en attente ou en restructuration, et dans un contexte de lancement FLUX NET DE TRÉSORERIE LIÉ AUX OPÉRATIONS DE FINANCEMENT (890) 21 217
pour l’activité kits. Le prochain exercice devrait voir des progrès importants notamment dans le
domaine des ventes de kits et services associés.
VARIATION DE LA TRÉSORERIE (21 032) 17 152
Le Crédit d’Impôt Recherche a très fortement augmenté en 2010 (6,1 M € vs 1,3 M € en
2009) essentiellement du fait de l’augmentation des dépenses de recherche et développement Trésorerie nette à l’ouverture 45 080 27 928
(+54%) et de la baisse des subventions perçues en 2010. Au-delà, un travail de fond a été Trésorerie nette à la clôture 24 048 45 080
effectué au sein du groupe avec l’aide d’un conseil afin de mieux appréhender le Crédit AUGMENTATION (DIMINUTION) DE LA TRÉSORERIE (21 032) 17 152
d’Impôt Recherche.
L’augmentation des charges d’exploitation en 2010 traduit la mise en œuvre de la stratégie
L’augmentation du Crédit d’Impôt Recherche en 2010 se traduit par une forte augmentation
de forte croissance définie en 2009 et le renforcement des équipes de recherche amont, au
de cette créance au 31 décembre. Les investissements incorporels en 2010 correspondent à
niveau de Cellectis, ainsi que des plateformes de développement d’applications au niveau
1,9 M € de frais de développement immobilisés et à l’acquisition de brevets. La consommation
de chacune des filiales. Ces charges augmentent en recherche et développement d’environ
de cash de l’année a été impactée pour un tiers environ par une variation défavorable mais
50% en cohérence avec l’accroissement de l’effectif (+50% de fin 2009 à fin 2010).
temporaire du BFR (besoin en fonds de roulement). En 2011, la variation de trésorerie devrait
être proche du résultat net.
44 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 45
 Cours de bourse et structure du capital

Le cours de l’action Cellectis a subi une dégradation au cours de l’exercice fiscal 2010.
Evoluion du prix de l’action En effet, la première journée de cotation de l’année 2010 s’est conclue sur un cours à
Prix de l’action en euros 10,95 € par action et la dernière séance, celle du 31 décembre, s’est achevée sur un cours
12
Volumes échangés en milliers de titres
à 7,40 € par action soit une baisse nette de 32,4%. Plusieurs facteurs expliquent cette
100
11 dégradation : la poursuite de la sortie d’actionnaires historiques, investisseurs en capital
80
10 risque, la faiblesse des échanges quotidiens, la volatilité des marchés liées aux fortes
60
9 incertitudes macro-économiques.
8 40

7 20 Le capital a continué son évolution, tirée par la sortie des actionnaires en capital risque et
6 0 les mouvements consécutifs à l’augmentation de capital effectuée fin 2009. Le flottant
Avr Juil Oct
2010
2009

atteint désormais plus de 60% mais le « noyau dur » centré autour des deux fondateurs,
100 millions € de capitalisation boursière. Volume moyen de l’Institut Pasteur, du business angel présent depuis 2000 au capital et des industriels

ANNEXES
d‘échange : 10 000 titres.
entrés en 2008 (Regeneron) et 2009 (Monsanto) est resté inchangé.
NYSE-Euronext ACLS.PA

Structure du capital au 31 décembre 2010

1. Flottant 62% 2

2. Corporate Partners 4% 3

3. Fondateurs et salariés 15%

4. Business Angel 10%

1 4
5. Venture Capital 5%

6. Institut Pasteur 4%
5
6

46 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 47

 Cours de bourse et structure du capital

Le cours de l’action Cellectis a subi une dégradation au cours de l’exercice fiscal 2010.
Evoluion du prix de l’action En effet, la première journée de cotation de l’année 2010 s’est conclue sur un cours à
Prix de l’action en euros 10,95 € par action et la dernière séance, celle du 31 décembre, s’est achevée sur un cours
12
Volumes échangés en milliers de titres
à 7,40 € par action soit une baisse nette de 32,4%. Plusieurs facteurs expliquent cette
100
11 dégradation : la poursuite de la sortie d’actionnaires historiques, investisseurs en capital
80
10 risque, la faiblesse des échanges quotidiens, la volatilité des marchés liées aux fortes
60
9 incertitudes macro-économiques.
8 40

7 20 Le capital a continué son évolution, tirée par la sortie des actionnaires en capital risque et
6 0 les mouvements consécutifs à l’augmentation de capital effectuée fin 2009. Le flottant
Avr Juil Oct
2010
2009

atteint désormais plus de 60% mais le « noyau dur » centré autour des deux fondateurs,
100 millions € de capitalisation boursière. Volume moyen de l’Institut Pasteur, du business angel présent depuis 2000 au capital et des industriels

ANNEXES
d‘échange : 10 000 titres.
entrés en 2008 (Regeneron) et 2009 (Monsanto) est resté inchangé.
NYSE-Euronext ACLS.PA

Structure du capital au 31 décembre 2010

1. Flottant 62% 2

2. Corporate Partners 4% 3

3. Fondateurs et salariés 15%

4. Business Angel 10%

1 4
5. Venture Capital 5%

6. Institut Pasteur 4%
5
6

46 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 47

Gouvernance

Comité exécutif Conseil d’administration Conseil scientifique

Le Comité exécutif se compose de membres de la Direction de Cellectis. Ce comité fixe Le Conseil d’administration définit la Mis en place en 2002, le Conseil scientifique
les objectifs consolidés, pilote les projets stratégiques et décide des priorités. Ses membres stratégie de l’entreprise et surveille les comprend huit membres actifs nommés
mettent en oeuvre la stratégie de l’entreprise et décident de ses activités quotidiennes. Il est activités de Cellectis. Ses membres siègent pour un an. Il a pour mission de définir les
notamment composé d’André Choulika et David Sourdive, les co-fondateurs de la société. pendent une période de trois ans, et son grandes orientations scientifiques de
Président convoque des réunions lorsque Cellectis et se réunit deux fois par an. Il
André Choulika, PhD, Directeur Général cela s’avère nécessaire ou souhaitable. soumet à l’équipe de Direction de Cellectis
des méthodes et des stratégies visant à
Au 31 décembre 2010 :
André Choulika, docteur ès sciences, directeur général et fondateur de la société. Il est atteindre les objectifs technologiques de
l’un des pionniers pour l’analyse et les applications des méganucléases visant à modifier Christian Policard, PhD l’entreprise. Il évalue le travail réalisé dans
les génomes complexes. Il a obtenu son doctorat en virologie moléculaire à l’université Président, co-fondateur de Biotech l’année et les résultats obtenus.
Le Comité Exécutif de gauche à droite, et de Pierre et Marie Curie - Paris VI, avant d’entreprendre des études post-doctorales dans le Developpement Conseils
haut en bas : David Sourdive, André Choulika, Frédéric
Au 31 décembre 2010 :
département de génétique à la Harvard Medical School. Au sein du service de médecine
Pâques, Dirk Pollet, Sylvie Delassus, Marc Le Bozec Martin Bitsch, MD
moléculaire du Boston Children’s Hospital, il a mis au point les premières approches Pr. François Jacob, Président honoraire, PhD
Administrateur indépendant,
de l’application des méganucléases à la thérapeutique humaine. Il a également suivi une Collège de France, Paris
Consultant
formation d’HEC (Challenge +).
Pr. Rodney J. Rothstein, Président, PhD
André Choulika, PhD
Columbia University, New York, Etats-Unis
David Sourdive, PhD, Vice Président Development Corporate Administrateur, Directeur général
de Cellectis Pr. Frederick W. Alt, PhD
David Sourdive, docteur ès sciences, VP du Développement Corporate et co-fondateur de Howard Hughes Medical Institute,
Alain Godard
la société. Après un doctorat à l’Institut Pasteur en virologie moléculaire, il rejoint un des Chevy Chase, Etats-Unis, Harvard Medical
Administrateur indépendant,
laboratoires de pointe en immunologie anti-virale à l’université d’Emory (Atlanta, Etats-Unis) School, Boston, Etats-Unis
Ancien président du directoire
où ses travaux portent sur la mémoire immunologique. Avant de fonder la société, il a
d’Aventis Cropscience, Consultant Pr. Bernard Dujon, PhD
été directeur du laboratoire des biotechnologies du Centre d’études du Bouchet / DGA
Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) -
(Ministère de la défense) entre 1998 et 1999. Polytechnicien, il a également suivi une Roger J. Hajjar, MD
Institut Pasteur, Paris
formation d’HEC (Challenge +). Administrateur, Représentant
permanent de Kaminvest Pr. Alain Fischer, MD, PhD
Frédéric Pâques, PhD, Directeur Scientifique Hôpital Necker - Enfants Malades, Paris
Richard C. Mulligan, PhD
Administrateur indépendant, Pr. James E. Haber, PhD
Marc Le Bozec, Directeur Financier
titulaire de la chaire Mallinckrodt de Brandeis University, Waltham, Etats-Unis
Génétique à la Harvard Medical School
Dirk Pollet, PhD, Directeur Commercial Pr. Denis Pompon, PhD
et Directeur du programme sur
Centre de génétique moléculaire, CNRS,
la thérapie génique de Harvard
Sylvie Delassus, PhD, Directeur de la Communication Gif-sur-Yvette
David Sourdive, PhD
Pr. José-Alain Sahel, MD, PhD
Administrateur, Viceprésident
Hôpital des Quinze-Vingts, Paris
Développement Corporate de Cellectis
Pr. Luis Serrano, PhD
Pascale Altier
Centre pour la régulation génomique
Censeur, Représentant de l’Institut Pasteur
(CRG), Barcelone, Espagne

48 l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l l Cellectis l Rapport d‘activité 2010 l 49

Gouvernance

Comité exécutif Conseil d’administration Conseil scientifique

Le Comité exécutif se compose de membres de la Direction de Cellectis. Ce comité fixe Le Conseil d’administration définit la Mis en place en 2002, le Conseil scientifique
les objectifs consolidés, pilote les projets stratégiques et décide des priorités. Ses membres stratégie de l’entreprise et surveille les comprend huit membres actifs nommés
mettent en oeuvre la stratégie de l’entreprise et décident de ses activités quotidiennes. Il est activités de Cellectis. Ses membres siègent pour un an. Il a pour mission de définir les
notamment composé d’André Choulika et David Sourdive, les co-fondateurs de la société. pendent une période de trois ans, et son grandes orientations scientifiques de
Président convoque des réunions lorsque Cellectis et se réunit deux fois par an. Il
André Choulika, PhD, Directeur Général cela s’avère nécessaire ou souhaitable. soumet à l’équipe de Direction de Cellectis
des méthodes et des stratégies visant à
Au 31 décembre 2010 :
André Choulika, docteur ès sciences, directeur général et fondateur de la société. Il est atteindre les objectifs technologiques de
l’un des pionniers pour l’analyse et les applications des méganucléases visant à modifier Christian Policard, PhD l’entreprise. Il évalue le travail réalisé dans
les génomes complexes. Il a obtenu son doctorat en virologie moléculaire à l’université Président, co-fondateur de Biotech l’année et les résultats obtenus.
Le Comité Exécutif de gauche à droite, et de Pierre et Marie Curie - Paris VI, avant d’entreprendre des études post-doctorales dans le Developpement Conseils
haut en bas : David Sourdive, André Choulika, Frédéric
Au 31 décembre 2010 :
département de génétique à la Harvard Medical School. Au sein du service de médecine
Pâques, Dirk Pollet, Sylvie Delassus, Marc Le Bozec Martin Bitsch, MD
moléculaire du Boston Children’s Hospital, il a mis au point les premières approches Pr. François Jacob, Président honoraire, PhD
Administrateur indépendant,
de l’application des méganucléases à la thérapeutique humaine. Il a également suivi une Collège de France, Paris
Consultant
formation d’HEC (Challenge +).
Pr. Rodney J. Rothstein, Président, PhD
André Choulika, PhD
Columbia University, New York, Etats-Unis
David Sourdive, PhD, Vice Président Development Corporate Administrateur, Directeur général
de Cellectis Pr. Frederick W. Alt, PhD
David Sourdive, docteur ès sciences, VP du Développement Corporate et co-fondateur de Howard Hughes Medical Institute,
Alain Godard
la société. Après un doctorat à l’Institut Pasteur en virologie moléculaire, il rejoint un des Chevy Chase, Etats-Unis, Harvard Medical
Administrateur indépendant,
laboratoires de pointe en immunologie anti-virale à l’université d’Emory (Atlanta, Etats-Unis) School, Boston, Etats-Unis
Ancien président du directoire
où ses travaux portent sur la mémoire immunologique. Avant de fonder la société, il a
d’Aventis Cropscience, Consultant Pr. Bernard Dujon, PhD
été directeur du laboratoire des biotechnologies du Centre d’études du Bouchet / DGA
Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) -
(Ministère de la défense) entre 1998 et 1999. Polytechnicien, il a également suivi une Roger J. Hajjar, MD
Institut Pasteur, Paris
formation d’HEC (Challenge +). Administrateur, Représentant
permanent de Kaminvest Pr. Alain Fischer, MD, PhD
Frédéric Pâques, PhD, Directeur Scientifique Hôpital Necker - Enfants Malades, Paris
Richard C. Mulligan, PhD
Administrateur indépendant, Pr. James E. Haber, PhD
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Génétique à la Harvard Medical School
Dirk Pollet, PhD, Directeur Commercial Pr. Denis Pompon, PhD
et Directeur du programme sur
Centre de génétique moléculaire, CNRS,
la thérapie génique de Harvard
Sylvie Delassus, PhD, Directeur de la Communication Gif-sur-Yvette
David Sourdive, PhD
Pr. José-Alain Sahel, MD, PhD
Administrateur, Viceprésident
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Centre pour la régulation génomique
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(CRG), Barcelone, Espagne

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®
Cellectis

Contact:
Cellectis
102 avenue Gaston Roussel
93230 Romainville
France
Tel: +33 (0)1 41 83 99 00
investors@cellectis.com
www.cellectis.com

Crédits photos:
Ramon Martinez
Franck Beloncle
Cellectis
Tim Rummelhoff
Eric Merle
INRA Christophe Maitre
Cédric Porchez
iStockphoto

Graphiste:
Valentina Herrmann

Imprimeur:
GraphiCentre

Ce rapport a été imprimé avec des encres

végétales sur papier certifié PEFC

Note de mise en garde

Le présent document et les informations
qu’il contient, ne constituent ni une offre
de vente ou de souscription, ni la sollicitation
d’un ordre d’achat ou de souscription, des actions
Cellectis dans un quelconque pays. Ce document
contient des déclarations prospectives sur les
objectifs de la Société qui reposent sur les
estimations et anticipations actuelles des dirigeants
de la Société et sont soumises à des facteurs
de risques et incertitudes non prévisibles qui,
s’ils se révélaient, pourraient remettre en question
les objectifs ci avant évoqués.
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objectifs de la Société qui reposent sur les
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s’ils se révélaient, pourraient remettre en question
les objectifs ci avant évoqués.
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