QCM 1

A. La recherche de parent chez les vertbrs l tablissement de phylognies

` La comparaison de la squence de deux protines d espces diffrentes rvle, des positions donnes, des portions de squences identiques.
A Les acides amins qu elles ont en commun correspondent ceux de la protine ancestrale. Les acides amins qu elles ont de dirents correspondent pour chacune d elle un tat driv de caractre. Ces deux protines sont homologues. On peut construire une matrice des dissimilitudes partir des squences de ces deux protines. Une forte parent entre deux espces se traduit par de faibles dirences dans la squence de fragments d ADN homologues provenant de chacune de ces espces.

C D

La recherche de parent chez les vertbrs 9

A Vrai
Les portions de squences que deux protines ont en commun correspondent bien des portions de squences ancestrales. Et plus il y a de portions de squences identiques entre deux protines, plus les deux espces auxquelles elles appartiennent sont proches de leur anctre commun. Par contre, l inverse (plus il y a de portions de squences direntes entre deux protines et plus les deux espces auxquelles elles appartiennent sont loignes de leur anctre commun) n est pas forcment vrai : il se peut trs bien que l une des deux protines n ait pas subi de mutation et soit donc identique la protine ancestrale.

B Faux
Les acides amins qu elles ont de dirent correspondent pour au moins l une d elles un tat driv de caractre car se peut trs bien qu au niveau des portions de squences direntes l une des deux protines possde encore des caractres ancestraux, c est--dire des acides amins ancestraux. Il se peut mme qu au niveau de toutes les portions de squences direntes, l une des deux protines possde tous les acides amins ancestraux : en d autres termes, que l une des deux protines soit la protine ancestrale.

C Vrai
L homologie est la ressemblance hrite d un anctre commun. La ressemblance tient ici dans les portions de squences identiques.

QCM 1. Rponses

D Vrai
On peut construire une matrice des similitudes ou des dissimilitudes du moment que l on runit des lments de comparaison. Toutefois, des matrices construites partir de seulement deux espces ne sont pas intressantes car l tablissement de phylognies ncessite gnralement de comparer un grand nombre d espces.

Vrai

Plus les ADN de deux espces sont proches et plus les deux espces sont proches.
QCM 1. Rponses

10 Parent entre tres vivants actuels et fossiles Phylognie volution

QCM 2
` La cristallographie est une technique qui permet de dterminer le repliement des protines dans l espace.
A La similarit de structure de deux protines suggre qu elles peuvent driver de l expression d un mme gne ancestral. Des protines qui possdent une similarit de structure sont homologues. Des protines qui possdent une similarit de structure ont des fonctions semblables. Des protines qui possdent une similarit de structure sont produites par le mme type de cellules. E Si deux protines d espces direntes ont une structure proche, les deux espces appartiennent obligatoirement au mme groupe monophyltique.

B C

La recherche de parent chez les vertbrs 11

A Vrai
La structure (sous-entendu en trois dimensions) d une protine est intimement lie sa squence d acides amins. En eet, la liaison (pont disulfure covalent) s tablissant entre deux cystines (acide amin soufr) tord la chane peptidique. La disposition des cystines le long de la chane polypeptidique, et par consquent la squence des acides amins, dcide donc de la conformation spatiale de la molcule. Deux protines de structures voisines ont des squences d acides amins voisines et sont donc codes par deux gnes de squences nuclotidiques voisines. De tels gnes sont dits homologues et considrs comme drivant d un mme gne ancestral.

B Vrai
Comme nous venons de le voir (cf. rponse A), la similarit de structure sous-entend une similarit squence d acides amins. Ce qui signie que les protines drivent d une protine ancestrale commune, dnition mme de l homologie.

C Faux
Par exemple, une protine-signal de rat, la PDB 1ddv , reconnat un substrat de nature protique, alors que son homologue, une transfrase d homme, reconnat un substrat de nature glucidique. Leur fonction dire donc malgr leur homologie.

D Faux

QCM 2. Rponses

Si l on reprend l exemple prcdent, la PDB 1ddv est produite par les cellules de cerveau du rat, alors que la transfrase de l homme est produite par les lymphocytes B.

Faux

La similarit de structure de deux protines d espces direntes est interprte comme le rsultat de l volution d une mme protine ancestrale (cf. rponse B), et donc d un mme gne ancestral (cf. rponse A) appartenant l anctre commun aux deux espces. Cela ne veut pourtant pas signier que les deux espces appartiennent un mme groupe monophyltique : pour cela il faudrait qu elles possdent en commun un caractre homologue l tat driv.
QCM 2. Rponses

12 Parent entre tres vivants actuels et fossiles Phylognie volution

QCM 3
` La reprsentation de la parent d espces dans la phylognie se fait sous forme d une ramification dichotomique de branches, chaque branche partant d un nud.
A Les branches portent des espces connues actuelles mais pas d espces fossiles. Un nud reprsente un anctre commun aux espces qui en dcoulent. Lanctre commun d espces actuelles est toujours un fossile. Dans un arbre phylogntique, les espces partant d un mme nud sont celles qui partagent le plus de caractres en commun. Dans un arbre phylogntique, les espces drivant d un nud sont monophyltiques.

B C D

La recherche de parent chez les vertbrs 13

A Faux
Les branches peuvent porter aussi des espces fossiles dont on ne connat pas de faon certaine la descendance.

B Vrai
Un nud reprsente toujours un anctre commun aux espces qui en dcoulent, qu il s agisse des deux espces surs les plus proches du nud ou d espces descendantes de ces deux dernires.

C Faux
Lanctre commun n est jamais une espce connue. Il reste une abstraction, un organisme hypothtique compos d une mosaque de caractres composs partir des caractres retrouvs dans sa descendance. Il n est donc ni actuel, ni fossile.

D Vrai
partir d un nud partent toujours deux branches qui aboutissent leurs extrmits distales deux espces. Ces deux espces sont distinctes mais sont dites espces surs car de toutes les espces existantes ce moment prcis de l volution ce sont celles qui partagent le plus de caractres en commun.

Faux

QCM 3. Rponses

Des espces ne sont pas monophyltiques en tant que telles : elles constituent un ou appartiennent un groupe monophyltique. Ceci tant, toutes les espces qui drivent d un nud possdent forcment les mmes caractres homologues l tat driv (cf. rponse D), et constituent donc un groupe monophyltique.
QCM 3. Rponses

14 Parent entre tres vivants actuels et fossiles Phylognie volution

QCM 4
Caractres Genres Bec Membrane nictitante et Gosier + + cailles

Columba Rattus Lacerta Crocodylus

+ +

Columba (C) possde un bec alors que Rattus (R), Lacerta (L) et Crocodylus
(Cro) n en possdent pas. C et Cro ont une membrane nictitante et un gosier alors que L et R n en ont pas. Enfin, L et Cro ont des cailles alors que C et R n en ont pas (voir tableau).
A On peut, partir de ces quatre caractres, construire une matrice de caractres. Sur l arbre phylogntique construit partir de ces caractres, Cro et L sont regroups l extrmit de l arbre. L constitue l organisme rfrentiel de cet arbre. Lanctre commun hypothtique C et Cro possde un anctre commun hypothtique avec L. Cro et C appartiennent au mme groupe monophyltique.

C D

La recherche de parent chez les vertbrs 15

A Vrai
On peut eectivement (il est mme recommand de le faire) construire une matrice de caractres sur le mode binaire : 0 pour l absence du caractre, 1 pour sa prsence : Caractres Bec Membrane nictitante Gosier cailles C 1 1 1 0 Cro 0 1 1 1 L 0 0 0 1 R 0 0 0 0

B Faux
Ce sont C et Cro qui sont regroups l extrmit de l arbre car des quatre espces, ce sont celles qui possdent le plus de caractres en commun (deux : la membrane nictitante et le gosier).

C Faux
C est R qui constitue l organisme rfrentiel (ou racine) de l arbre car il est moins apparent aux autres que les autres ne le sont entre eux. En eet, L et Cro appartiennent la classe des Reptiles et sont donc proches, alors que R est un Mammifre. On sait par ailleurs que C est plus proche de Cro que de R (cf. rponse B), et que C drive des Dinosaures, qui sont eux-mmes plus proches des Reptiles et des Oiseaux que des Mammifres.

QCM 4. Rponses

D Vrai
R est situ au dbut de l arbre (cf. rponse C) et partage donc un anctre commun avec l ensemble L, C, Cro. C et Cro tant par ailleurs les plus proches entre eux (cf. rponse B), ils possdent donc un anctre commun partageant lui-mme un anctre commun avec L. Notons que les anctres communs sont toujours hypothtiques.

Vrai

Un groupe monophyltique est constitu d individus partageant tous un caractre homologue l tat driv, c est--dire un caractre volu (issu d un anctre commun) que ne possdent pas les autres individus. Cro et C possdent en commun les caractres membrane nictitante et gosier , que ne possdent pas L et R : ces deux derniers caractres sont donc des caractres homologues (entre Cro et C) l tat driv (prsents uniquement chez Cro et C).
QCM 4. Rponses

16 Parent entre tres vivants actuels et fossiles Phylognie volution