ENZYMES.

MECANISMES
MOLECULAIRES DE LA
CATALYSE
1. EFFET DE
POSITIONNEMENT ET DE
PROXIMITE
Lors la catalyse (transformation
de substrats en produits), on peut
imaginer que la transformation
est prcde par un effet de
positionnement et de proximit
o des molcules X et Y en se
fixant sur l'enzyme (E), se
trouvent proches l'un de l'autre
pour ragir et donner le produit
C. Tout se passe comme si:
- leurs concentrations taient
suffisament leves pour que
leur probabilit de rencontre soit
trs leve.
- Les groupements ractifs des
substrats activs
taient correctement
positionns pour ragir.

2. CATALYSE COVALENTE
Un simple attachement des
substrats sur le site actif par
l'intermdiaire d'une liaison faible
(L. hydrogne,...) ne peux pas
mettre en jeu des nergies
suffisantes pour fournir aux
molcules de substrats la totalit
de l'nergie d'activation de la

raction initiale. L'apport d'une

telle nergie peut tre ralis par
deux possibilits essentielles:
- Formation de liaisons
covalentes Enzyme-Substrat
- Formation de complexes
intermdiaires successifs o
chaque tape possde une
nergie d'activation relativement
faible.
Dmonstration du caractre
covalent de la liaison enzymesubstrat (ES):
Une fois le complexe ES stable
est isol, on le traite avec un
agent dnaturant des protines
(dtergents, ure, guanidine, pH
extrme,...). Si le substrat reste
fix la protine dnature, cela
signifie que la liaison E-S tait
covalente (QCM-liaisons)
Intermdiaire covalent de type
acyl-enzyme: exemple de la
Livre 'Sciences de la vie. Protines et Enzymes' (+
DVD), Baaziz, 2013: QCM corrigs, Exercices
chymotrypsine (protases):
corrigs, Contrles corrigs en Biologie cellulaire et
La chymotrypsine est une
Biochimie pour S1, S3, S4 et S5.
protase rencontre dans le
pancreas. Elle coupe les liaisons
peptidiques auxquelles participe
le carboxyle desacides amins
aromatiques (Phe, Try, Tyr). C'est
une endopeptidase. La raction
se droule en deux temps,
l'acylation et la dsacylation.
L'intervention d'une molcule
d'eau est iportante.
ETUDIER LA STRUCTURE DE
LA CHYMOYTRYPSINE:
1/ Tlcharger une molcule de
chymtrypsine partir du site
web: http://www.rcsb.org/pdb
2/ Etudier la structure de la
protine par leprogramme
RasMol
RAPPEL SUR LA
CLASSIFICATION DES

HYDROLASES:
PROTEASE
..........Exopeptidases
(Aminopeptidase,
Carboxypeptidase)
..........Endopeptidases (Trypsine,
Chymotrypsine)
ESTERASES
..........Phosphatase alcaline
(hydrolyse les monoesters)
..........Ribonuclase (hydrolyse
les diesters)
..........Lipase (hydrolyse les
esters triglycrides)
GLYCOSIDES HYDROLASES
..........Amylase, Cellulase
(hydrolysent les liaisons
osidiques)