Billanou

THSE
En vue de lobtention du
DOCTORAT DE LUNIVERSIT DE TOULOUSE

Dlivr par lInstitut National Polytechnique de Toulouse
Spcialit : Dynamique des Fluides
Prsente et soutenue par Ian Billanou

Le 04/02/2010
Sujet de la thse :
MODLISATION EXPRIMENTALE ET THORIQUE POUR LA
QUANTIFICATION DU DBIT SANGUIN PAR TOMOGRAPHIE
EMISSION DE POSITRONS
JURY
P. Celsis Directeur de recherche, Inserm. Prsident du jury
A. Ahmadi-Senichault Professeur, Trefle. Rapporteur
V. Deplano Directeur de recherche, IRPHE. Rapporteur
A. Dellaleau Docteur, laboratoires Pierre Fabre. Examinateur
S. Lorthois Charge de recherche, IMFT Co-directeur de thse
M. Quintard Directeur de recherche, IMFT Directeur de thse
Ecole doctorale : Mcanique, Energtique, Gnie civil, Procds

Unit de recherche : Institut de Mcanique des Fluides de Toulouse
Directeurs de Thse : M. Quintard
Directeurs de Thse : S. Lorthois
Thse co-finance par le centre de recherche sur la Peau des
laboratoires Pierre Fabre et la rgion Midi-Pyrnes
ii
Remerciements
Ce travail, financ par le centre de recherche sur la peau des laboratoires

Pierre Fabre ainsi que par la rgion Midi-Pyrnes, a t effectu lInstitut de
Mcanique des Fluides de Toulouse. Je tiens donc remercier lensemble de ces
institutions pour leur soutien matriel et financier.
Je tiens galement adresser mes remerciements A. Ahmadi-Senichault et

V. Deplano pour leur travail de rapporteurs, ainsi qu P. Celsis et A. Dellaleau
qui ont accept de faire parti du jury de thse. Prsents galement dans le jury
mais galement tout au long de mon travail de thse, je tiens remercier Michel
Quintard et Sylvie Lorthois pour leur encadrement. Sylvie Lorthois, linitiative
de ce projet, a t dune trs grande disponibilit, et je la remercie tout parti-
culirement pour sa patience mais galement pour son exigence sur la rdaction
qui, je le crois, ma permis de progresser. Merci galement Paul Duru, pour sa
participation.
Outre la ncessit dun bon encadrement, et bien quen grande partie la thse
soit un travail personnel, son bon droulement ne saurait se faire sans le concours
dun grand nombre de personnes que je tiens remercier :
D. Black et J.M. Lagarde du centre de recherche sur la Peau de lInstitut Pierre
Fabre avec qui nous avons eu de multiples runions davancement.
A.D. Stroock et N.W. Choi Cornell University qui mont accueilli et form
llaboration des micro-canaux dans le gel dalginate.
H. Gros et G. Viallard, du centre TEP de lHpital Purpan, pour leur accueil et
le temps quils mont consacr.
M. Dilan, D. Bourrier du LAAS et F. Monti de lESPCI pour la fabrication des
moules en silicium.
J.M Sfedj, L. Mouneix et J.P. Escafit du service de conception mcanique pour
leur concours la fabrication des pices du dispositif exprimental.
S. Cazin du service signaux et images pour son expertise et ses conseils utiles
la mise au point de la technique de mesure optique.
F. Esteban, technicien au groupe GEMP, qui ma transmis toutes les comptences
iii
ncessaires llaboration de mon dispositif exprimental avant de prendre sa re-
traite.
Sur un plan moins professionnel mais nanmoins important, je tiens galement

remercier toutes les personnes que jai ctoyes et qui ont contribu de prs ou
de loin au bon droulement de cette tranche de vie.
Tout dabord un grand merci Y. Aspa, P. Assemat, O. Chapuis, D. Chenu, T.
Coquard, L. Risser les anciens du groupe GEMP, qui mont accueilli aux pauses
caf et rapidement intgr au groupe. Merci galement M. Reba et F. Chau-
vet puis plus tard, V. Sarrot, mes collgues de bureau. Initiateurs dune pause
parallle dans le bureau nous avons galement eu les visites quotidiennes de R.
Guibert, P. Horgue, S. Veran et plus ponctuellement de D. Bailly. Merci gale-
ment J. Albagnac et E. Florens du groupe OTE. A tous, merci pour tous les
bons moments que nous avons pu passer.
Enfin, je tiens terminer cette pages en remerciant tous mes proches, mes
parents et ma soeur.
iv
Rsum
La Tomographie Emission de Positrons (TEP) permet dobtenir une me-
sure dynamique et rsolue en espace de la concentration dun traceur radioactif
inject au patient. La quantification du dbit sanguin crbral par TEP repose
sur lutilisation dun modle cintique le reliant la variation spatio-temporelle
de la concentration du traceur dans le cerveau. Diffrents modles cintiques sont
proposs dans la littrature. Cependant, la majorit dentre eux repose sur une
modlisation compartimentale de lorgane observ. Dans ce cas, lorgane est sub-
divis en un compartiment capillaire changeant avec un compartiment tissulaire
par une cintique le plus souvent du premier ordre. Les rsultats obtenus avec
ce type de modle sous-estiment le dbit et ne permettent pas de prdire les
premiers instants de la dynamique de rpartition du traceur. Ces faiblesses ont
t confirmes suite lamlioration de la rsolution temporelle des tomographes,
conduisant llaboration de modles incorporant plus de ralit physiologique.
Cependant, tous ces modles sont dvelopps pour modliser les changes entre
la micro-circulation et le tissu environnant lchelle dun capillaire (chelle mi-
croscopique). Or la rsolution spatiale des tomographes utiliss en clinique ne
permet pas de distinguer la micro-circulation et le tissu. Lutilisation de ces mo-
dles cintiques avec des mesures de concentrations macroscopiques dpasse donc
leur cadre thorique de validit et peut introduire des rsultats fausss. Dans ce
contexte, nous proposons un modle cintique bas sur le changement dchelle
(utilisant la mthode de prise de moyenne volumique). Ce changement dchelle
permet de remplacer lensemble micro-circulation/tissu par un volume fictif, ho-
mogne, dont les proprits macroscopiques sont calcules partir des proprits
microscopiques dun Volume Elmentaire Reprsentatif (VER) du milieu. Dans
un premier temps, afin de pouvoir comparer les rsultats de ce modle avec ceux
du modle compartimental standard, le VER considr est constitu dun ca-
pillaire unique et de son enveloppe de tissu, puis une complexit gomtrique
supplmentaire est introduite en considrant un rseau de capillaire isotrope
lchelle de Darcy. Ces modles sont utiliss pour identifier le dbit laide dune
mthode inverse. Pour cela, lvolution temporelle du champ de concentration
dans notre gomtrie de rfrence, qui ne peut tre mesure par TEP en raison
de sa faible rsolution spatiale, est dtermine par des simulations numriques
ainsi que par des mesures in vitro laide dun modle exprimental, galement
dvelopp au cours de ce travail, permettant de reproduire lcoulement dans un
canal traversant une matrice diffusante (gel dalginate).
v
vi
Abstract
Positron Emission Tomography (PET) provides a dynamic and space-resolved
measurement of the concentration field of a radioactive tracer previously injected
to the patient. Quantification of cerebral blood flow by PET is based on the use of
a kinetic model linking cerebral blood flow to the spatial and temporal variations
of tracer concentration in the brain. Various kinetic models have been proposed
in the literature. However, most of them are based on a compartmental approach
of the observed organ. In this case, the organ is divided in two compartments, the
capillary and the tissue, and the exchanges between these two compartments are
often described by a first order kinetic model. Results obtained with this kind of
model underestimate the flow rate and are not able to predict the first instants of
the tracer dynamics distribution. With the continuous improvement of the tempo-
ral resolution of PET, these weaknesses have been confirmed, which led to the de-
velopment of models incorporating more physiological reality. However, all these
models have been developed to describe exchanges between micro-circulation and
surrounding tissue at the scale of capillary vessels (microscopic scale). Because
the spatial resolution of PET in clinical practice is insufficient to allow the dis-
tinction between micro-circulation and tissue, using of these models with kinetic
measurement of macroscopic concentrations exceeds their theoretical validity and
can introduce false results. In this context, we propose a kinetic model based on
up-scaling (using the method of volume averaging). This up-scaling technique
allows to replace the two previous compartments (tissue and micro-circulation)
by an homogeneous fictive volume, whose macroscopic properties are calculated
from the microscopic properties of a representative elementary volume (REV) of
the medium. First, in order to compare the results of this model with those of the
standard compartmental model, the considered REV consists of a single capillary
and its surrounding tissue. Second, additional geometric complexity is introduced
by considering an isotropic capillary network at the Darcy scale. These models
are used to identify the flow rate using an inverse method. For that purpose, the
temporal evolution of concentration field in a geometry of reference, which cant
be measured by PET due to its low spatial resolution, is determined by numerical
simulations and by in vitro measurements. These measurements are performed
using an experimental model developed during this work to reproduce the flow
in a channel passing through a diffusive matrix (alginate gel).
vii
viii
Table des matires
1 Introduction 1
1.1 Contexte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2 La circulation sanguine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 La circulation vasculaire crbrale . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4 La Tomographie Emission de Positrons . . . . . . . . . . . . . . 3
1.5 Objectif de ce travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
2 Quantification du dbit sanguin crbral : Etat de lart 7

2.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
2.2 Approche de type bote noire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.2.1 Hypothses de lapproche bote noire . . . . . . . . . . . . 10
2.2.2 Cas de linjection constante de traceur . . . . . . . . . . . 11
2.2.3 Cas de linjection constante avec flux diffusif . . . . . . . . 12
2.2.4 Cas de linjection de type bolus . . . . . . . . . . . . . . . 14
2.2.5 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
2.3 Approche compartimentale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.3.1 Le modle de Kety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.3.2 Mesure du dbit avec le modle de Kety . . . . . . . . . . 19
2.3.3 Le modle de Renkin-Crone . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
2.3.4 Limitations des modles de Kety et de Renkin-Crone . . . 25
2.3.5 Modle dhomognit tissulaire (Tissue homogeneity model) 26
2.3.6 Le modle de Goresky . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
2.3.7 Le modle microvasculaire (O.L. Munk). . . . . . . . . . . 31
2.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
3 Modlisation avec changement dchelle 39

3.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
3.2 Le changement dchelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
ix
TABLE DES MATIRES
3.2.1 Les diffrentes chelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

3.2.2 Lintrt du changement dchelle . . . . . . . . . . . . . . 43
3.2.3 Outils ncessaires la prise de moyenne . . . . . . . . . . 43
3.2.4 Principe du changement dchelle . . . . . . . . . . . . . . 45
3.3 Elaboration du modle cintique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
3.3.1 Equations et conditions limites lchelle locale . . . . . . 47
3.3.2 Ecriture des quations en fonction des grandeurs moyennes 48
3.3.3 Choix du modle pour le changement dchelle . . . . . . . 52
3.3.4 Fermeture du problme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
3.3.5 Problmes de fermeture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
3.3.6 Equations lchelle de Darcy . . . . . . . . . . . . . . . . 59
3.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
4 Identification du dbit 63
4.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2 Cintique de rfrence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2.1 Ordres de grandeurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2.2 Etude exprimentale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
4.2.3 Etude numrique pour le cylindre de Krogh . . . . . . . . 81
4.3 Mthode dvaluation du dbit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
4.3.1 Cas du modle de Renkin-Crone . . . . . . . . . . . . . . . 84
4.3.2 Cas du modle homognis . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
4.4 Comparaison des rsultats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
4.4.1 Cintiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
4.4.2 Dbits identifis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
4.4.3 Rsultats des mesures exprimentales . . . . . . . . . . . . 98
4.5 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
5 Changement dchelle appliqu une gomtrie plus raliste 103

5.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
5.2 Gomtrie tudie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
5.3 Simulations numriques directes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
5.3.1 Champ de vitesse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
5.3.2 Champs de concentration . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
5.3.3 Cintiques de concentration . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
5.4 Modle homognis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
5.4.1 Dtermination des paramtres effectifs . . . . . . . . . . . 113
5.4.2 Comparaison avec la simulation numrique directe . . . . . 113
5.5 Identification du dbit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
5.6 Conclusion et perspectives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118
6 Conclusion et perspectives 121
x
Table des matires
A Protocoles exprimentaux 125

A.1 Elaboration du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
A.1.1 Prparation des surfaces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
A.1.2 Assemblage et injection du gel liquide . . . . . . . . . . . . 126
A.1.3 Polymrisation du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
A.1.4 Prparation des couches de gel polymris avant leur as-
semblage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
A.1.5 Assemblage des deux couches de gel . . . . . . . . . . . . . 127
A.2 Droulement dune exprience . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
A.2.1 Injection de la solution de fluorescine . . . . . . . . . . . 128
A.2.2 Acquisition des images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
A.2.3 Rinage du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Liste des symboles 137
xi
xii
Introduction
Sommaire
1
1.1 Contexte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2 La circulation sanguine . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 La circulation vasculaire crbrale . . . . . . . . . . . 3
1.4 La Tomographie Emission de Positrons . . . . . . . 3
1.5 Objectif de ce travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1
Introduction
1.1 Contexte
Cette thse sinscrit dans le cadre dune collaboration entre le Centre de Re-
cherche sur la Peau (CRP) des laboratoires Pierre Fabre Dermo-cosmtique, le
CHU de Toulouse, lUniversit Paul Sabatier, lINSERM U825 et lInstitut de M-
canique des Fluides de Toulouse (IMFT). Lobjectif du projet initi par le CRP
est de dvelopper et de valider un modle exprimental de prurit1 permettant
de mettre en vidence les activations crbrales induites par le prurit au moyen
de techniques de neuro-imagerie fonctionnelle. Il sagit ici de stimuler un patient
et dobserver les aires crbrales qui sactivent pendant quil ressent les effets
dun prurit. La technique dobservation utilise est la Tomographie Emission
de Positrons (TEP). Notre participation dans ce projet porte sur la quantifica-
tion absolue du dbit sanguin dans lobjectif de permettre une valuation plus
rigoureuse de la ractivit crbrale au prurit.
1.2 La circulation sanguine

La circulation sanguine remplit un rle de transport des nutriments et du
dioxygne (via lhmoglobine) ncessaire au fonctionnement des organes et permet
lvacuation des dchets quils produisent.
Le systme permettant la circulation sanguine est compos dune pompe, le
cur, qui maintient un dbit suffisant pour que lensemble de lorganisme ait un
apport continu en oxygne et en nutriments, et dun rseau vasculaire complexe.
Ce rseau vasculaire est form par des artres et des veines, les artres condui-
sant le sang du cur vers les tissus et les veines des tissus vers le cur. Le rseau
artriel se divise en arborescence depuis laorte sortant du cur jusque aux ar-
trioles. Les capillaires, dun diamtre compris entre 4 et 10 m, sont le lieu des
changes avec les cellules. Ils relient les artrioles aux veinules qui convergent
jusquaux veines caves. Ainsi, les artres et les veines forment le rseau macro-
vasculaire tandis que les capillaires, les artrioles et les veinules forment le rseau
microvasculaire, cest dire la partie du rseau dont les diamtres sont infrieurs
100 m.
Lensemble de ce rseau permet galement damortir lcoulement sanguin
puisque, la sortie du cur, lcoulement est puls alors que, dans la micro-
circulation et en particulier dans le cerveau, il peut tre considr comme perma-
nent.
1
Le prurit est un symptme qui recouvre une sensation subjective de la peau, localise ou dif-
fuse, conduisant au dsir de grattage, le plus souvent en rapport avec des lsions dermatologiques
mais parfois sans cause connue. Il constitue le principal signe fonctionnel en dermatologie.
2
La circulation vasculaire crbrale
1.3 La circulation vasculaire crbrale

Le cerveau consomme environ 15% du dbit cardiaque et 20% du dioxygne
respir. Il est particulirement sensible aux privations puisque un arrt de lap-
port du dioxygne suprieur trois minutes entrane des liaisons crbrales ir-
rversibles. En effet, il ne dispose daucune rserve nergtique et dpend donc
totalement de la circulation sanguine. Cependant, le cerveau dispose dun mca-
nisme de rgulation trs performant qui permet de faire varier le dbit local en
fonction de lactivit crbrale. En effet, les aires crbrales actives consomment
plus dnergie et les dbits des branches du rseau qui les alimentent augmentent.
Cette rgulation, qui implique des processus biologiques complexes de signalisa-
tion entre les neurones et la vasculature, induit localement des variations actives
du diamtre des artrioles. La variation du dbit qui en rsulte est proportion-
nelle la puissance quatre de la variation du rayon. Par consquent, une faible
augmentation du diamtre permet un changement important du dbit. Cette r-
gulation est locale. Ainsi, lors dune tche cognitive, seuls les dbits des artrioles
alimentant les aires crbrales impliques sont impacts.
Pour tudier cette rponse hmodynamique crbrale, de nouvelles techniques
dimagerie fonctionnelle comme la TEP ou encore limagerie par rsonance ma-
gntique ont t dveloppes depuis une quarantaine dannes. Ces techniques
permettent de localiser qualitativement les zones crbrales.
1.4 La Tomographie Emission de Positrons

La tomographie mission de positrons est une mthode dimagerie mdicale
utilise en clinique, en pharmacologie et en neurologie qui repose sur linjection
dun traceur radioactif dans la circulation sanguine. Le traceur le plus couram-
ment utilis en TEP pour la mesure du dbit sanguin est leau radio-marque
(H2 O15 ). En effet, leau est particulirement intressante de par sa prsence en
grande quantit dans les tissus biologiques, de plus la demi-vie de lH2 O15 est
trs courte, de lordre de deux minutes. La technique consiste injecter H2 O15
au sujet, par voie intraveineuse. Ce traceur est transport par convection dans
les gros vaisseaux sanguins puis par convection-diffusion dans les organes (micro-
circulation et tissu environnant). Par ailleurs, ce traceur est instable : un de ses
protons se transforme rapidement en neutron, en mettant un positron et un neu-
trino. Or, quand un positron est libr, il se combine quasi-instantanment un
lectron du milieu et la raction libre deux photons gamma corrls, cest dire
deux photons se dplaant dans la mme direction mais en sens oppos. Ces pho-
tons, trs nergtiques, traversent en grande partie le cerveau et le crne et sont
dtects par une couronne de photo-dtecteurs en dehors de la bote crnienne.
Ces dtecteurs, placs autour de la tte du sujet, enregistrent cette mission et
un systme informatique reconstitue les images 2D ou 3D de la concentration du
traceur au niveau de la zone explore. Ainsi, plus le dbit sanguin est lev, plus
3
Introduction
lapport en eau radio-marque est important et plus la probabilit dmission de

photons gamma, proportionnelle la concentration du traceur, est grande. Selon
les systmes mdicaux, une rsolution spatiale denviron 10 mm3 pour les images
3D (4 7 mm2 pour les images 2D) et une rsolution temporelle maximale allant
de 10 40 acquisitions par minute est obtenue.
1.5 Objectif de ce travail

Lanalyse de la cintique de rpartition du traceur radioactif peut permettre
dvaluer quantitativement le dbit sanguin, condition de disposer dun modle
dcrivant cette cintique (Morris et al. (2004.)). Diffrents modles cintiques
sont proposs dans la littrature (Kety (1944.); Kety & Schmidt (1948.); Kety
(1949.), Renkin (1955., 1959.), Crone (1963.), St. Lawrence & Lee (1998.a,.)).
Cependant, la majorit dentre eux repose sur une modlisation compartimentale
de lorgane observ. Dans ce cas, lorgane est subdivis en un compartiment ca-
pillaire changeant avec un compartiment tissulaire par une cintique du premier
ordre. Les rsultats obtenus avec ce type de modles sous-estiment le dbit et ne
permettent pas de prdire les premiers instants de la dynamique de rpartition
du traceur. Ces faiblesses ont t confirmes suite lamlioration de la rsolution
temporelle des tomographes, conduisant llaboration de modles incorporant
plus de ralit physiologique (Goresky et al. (1970.) et Munk et al. (2003.a,.)).
Cependant, tous ces modles sont dvelopps pour modliser les changes entre
la micro-circulation et le tissu environnant lchelle dun capillaire (chelle mi-
croscopique). Or la rsolution spatiale des tomographes utiliss en clinique ne
permet pas de distinguer la micro-circulation et le tissu. Lutilisation de ces mo-
dles cintiques avec des mesures de concentrations macroscopiques dpasse donc
leur cadre thorique de validit et peut introduire des rsultats fausss.
Lobjectif de ce travail est donc de proposer un modle cintique prenant en
compte le passage de lchelle locale (l o scrit le modle) lchelle du voxel
(o se fait la mesure). Pour cela, nous avons fait le choix dune approche utilise
en mcanique des fluides dans les milieux poreux htrognes, qui fait appel la
thorie du changement dchelle. Dans toute la suite, nous allons envisager le cer-
veau comme un milieu poreux matrice diffusante. Les arguments en faveur de ce
choix seront discuts dans le chapitre ddi la thorie du changement dchelle
(Ch. 3.1, p.40). Lassimilation du cerveau un milieu poreux, nous permet de
mettre en oeuvre le savoir faire thorique du laboratoire et, en parallle, de d-
velopper un modle exprimental in vitro, permettant de reproduire lcoulement
dans un canal traversant une matrice diffusante (gel dalginate).
Ainsi, notre objectif est de proposer un modle cintique obtenu par la m-
thode de prise de moyenne volumique (Quintard & Whitaker (1994.a,., 1995.);
Whitaker (1999.); Quintard & Whitaker (2000.); Golfier (2001.); Kfoury (2004.);
Golfier et al. (2007.)) puis dutiliser ce modle pour identifier le dbit laide
4
Objectif de ce travail
dune mthode inverse. Pour cela, lvolution temporelle du champ de concentra-

tion lchelle microscopique, qui ne peut tre mesure par TEP en raison de
sa faible rsolution spatiale, est dtermine par des simulations numriques ainsi
que par des mesures in vitro.
5
6
Quantification du dbit sanguin crbral :
Etat de lart 2
Sommaire
2.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
2.2 Approche de type bote noire . . . . . . . . . . . . . 10
2.2.1 Hypothses de lapproche bote noire . . . . . . . . . . 10
2.2.2 Cas de linjection constante de traceur . . . . . . . . . 11
2.2.3 Cas de linjection constante avec flux diffusif . . . . . 12
2.2.3.1 Dfinitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.2.3.2 Estimation du dbit . . . . . . . . . . . . . . 14
2.2.4 Cas de linjection de type bolus . . . . . . . . . . . . . 14
2.2.4.1 Fonction de distribution des temps de transit
et fonctions associes . . . . . . . . . . . . . 15
2.2.4.2 Le temps de transit moyen . . . . . . . . . . 16
2.2.5 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
2.3 Approche compartimentale . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.3.1 Le modle de Kety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
2.3.2 Mesure du dbit avec le modle de Kety . . . . . . . . 19
2.3.3 Le modle de Renkin-Crone . . . . . . . . . . . . . . . 22
2.3.4 Limitations des modles de Kety et de Renkin-Crone . 25
2.3.5 Modle dhomognit tissulaire (Tissue homogeneity
model) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
2.3.6 Le modle de Goresky . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
2.3.7 Le modle microvasculaire (O.L. Munk). . . . . . . . . 31
2.3.7.1 Dmonstration de la limite des modles com-
partimentaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
2.3.7.2 Le modle microvasculaire . . . . . . . . . . 32
2.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
7
Quantification du dbit sanguin crbral : Etat de lart
2.1 Introduction
La TEP produit des mesures quantitatives, rsolues en espace et en temps,
de la concentration dun traceur radioactif dans le cerveau. Schmatiquement,
la concentration en traceur un endroit et un instant donns dpend de trois
facteurs : la concentration de traceur en entre du cerveau (fonction dentre),
larchitecture du rseau vasculaire crbral et la physiologie crbrale (incluant
les fonctions dchange et de rgulation, qui dterminent la fois les transferts
de traceur et le dbit sanguin crbral).
Un modle cintique est une description mathmatique (une ou plusieurs qua-
tions) reliant ces paramtres la concentration du traceur dans le cerveau, dont
linversion doit permettre dvaluer le dbit sanguin.
Un modle trs labor devrait permettre de parfaitement prdire cette con-
centration. Cependant, en pratique, un compromis doit tre fait entre la com-
plexit mathmatique du modle, qui est impose par les hypothses effectues
sur larchitecture vasculaire et les processus dchange, et les limites pratiques
imposes par la technique de mesure (rsolution spatiale et temporelle, rapport
signal sur bruit, ...) (St. Lawrence & Lee (1998.a)).
Fonction dentre : Le traceur radioactif est inject par voie intraveineuse,

puis transport par la macro-circulation jusqu lentre du cerveau. Lvolution
temporelle de la concentration en traceur lentre du cerveau peut donc tre
mesure en effectuant des prlvements dchantillons sanguins au niveau des ar-
tres carotides. Cette procdure traumatique de cathterisation artrielle est trs
contraignante aussi bien pour le patient que pour le praticien. Alternativement,
on peut maintenant envisager des procdures atraumatiques, telles que la d-
termination directe de la concentration artrielle laide des donnes TEP ou
lutilisation de sondes externes, par exemple places au niveau pulmonaire.
Architecture du rseau vasculaire crbral : Le rseau vasculaire cr-

bral est un rseau tridimensionnel complexe, bien dcrit qualitativement depuis
les travaux de Duvernoy et al. (1981.), mais dont une description quantitative a
ncessit le dveloppement de techniques spcifiques permettant une observation
forte rsolution spatiale (de lordre du m) sur de grands volumes (environ 10
mm3 ) (Cassot et al. (2006.); Risser et al. (2006.); Lauwers et al. (2008)). His-
toriquement, les premiers modles cintiques (Kety & Schmidt (1948.)) se sont
affranchis de cette difficult en adoptant une approche de type bote noire,
qui ne ncessite aucune hypothse sur larchitecture vasculaire. Cette simplifica-
tion a un cot, puisque pour dterminer le dbit en utilisant un modle de type
bote noire, il est ncessaire de connatre la concentration en sortie de lorgane,
imposant un second prlvement dchantillons sanguins au niveau dune veine.
Cest parce que leur utilisation permet de saffranchir de ce second prlvement
sanguin que les modles dit compartimentaux ont t dvelopps, sappuyant
8
Introduction
sur la description du rseau vasculaire musculaire propose antrieurement par

Krogh (1919.).
Physiologie : la physiologie crbrale est unique plus dun titre. Comme

nous lavons vu prcdemment, labsence de rserves nergtiques dans le tissu
crbral est compense par lexistence de mcanismes de contrles ajustant le d-
bit sanguin aux besoins mtaboliques. Dautre part, lendothlium vasculaire, i.e.,
les cellules constituant linterface entre le sang et le tissu, a des proprits sp-
cifiques permettant dtablir la barrire hmato-encphalique. Cette barrire,
dont la fonction principale est de protger les neurones de substances ventuel-
lement toxiques, restreint la diffusion dobjets microscopiques (bactries) et de
molcules de grande taille vers le liquide intersticiel crbral, mais permet la dif-
fusion de molcules de petite taille (H2 O, O2 , hormones, CO2 ). Elle permet aussi
le transport actif de produits mtaboliques, tels le glucose, grce des trans-
porteurs spcifiques. Lexistence de la barrire hmato-encphalique est lie la
structure particulire des capillaires crbraux, non poreux, dont les cellules en-
dothliales sont lies entre elles par des jonctions serres (tight junctions). Par
ailleurs, en conditions physiologiques, losmolarit des liquides extra-cellulaires
est la mme des deux cots de la barrire hmato-encphalique. Par consquent,
la pression osmotique est identique de part et dautre de lendothlium, et la loi
de Starling1 prdit un flux nul (Boulard (2001.)).
Les premiers modles cintiques ont fait lhypothse dune cintique dchange
du premier ordre entre deux compartiments parfaitement mlangs : un comparti-
ment intravasculaire et un compartiment extravasculaire, ngligeant la dispersion
du traceur dans le cerveau et les gradients de concentration qui en rsultent (va-
riations temporelles et spatiales) dans le tissu et la vasculature.
Les limites de cette approche compartimentale sont reconnues par les prati-
ciens et ont dailleurs t avances pour expliquer certains rsultats assez para-
doxaux obtenus en TEP (Larson et al. (1987.); St. Lawrence & Lee (1998.a,.)).
La formulation de modles distribus a cherch prendre en compte le trans-
port par diffusion et convection dans la vasculature et lespace extra-vasculaire
(Larson et al. (1987.); Sawada et al. (1989.)). Mais la plus grande finesse dans
la description obtenue avec ces modles a longtemps paru illusoire tant donn
la faible rsolution temporelle et spatiale des premiers scanners TEP, qui limi-
tait linformation pouvant tre tire des donnes exprimentales (Quarles et al.
1
La loi de Starling (quation de Starling) est une relation qui exprime le mouvement dun
fluide travers une membrane. Ce mouvement de fluide rsulte de deux processus : la diffusion
osmotique et la filtration. J = Kf (Pc Pt ) (c t ). Cette relation exprime le flux net de
fluide traversant la membrane comme une fonction de 6 variables, les pressions hydrostatiques
dans le capillaire et dans le tissu (Pc , Pt ), les pressions osmotiques (c , t ), le coefficient de
filtration (Kf ) et le coefficient de rflection ().
9
(1993.)). Pourtant, cette approche a vu un regain dintrt (St. Lawrence & Lee
(1998.a,.); Munk et al. (2003.a,.)) du fait des progrs continus de la technologie de
dtection des concidences du rayonnement gamma, qui permettent aujourdhui
datteindre une rsolution temporelle de lordre de 5 secondes (contre 2 minutes
pour les premires gnrations de TEP), avec une rsolution spatiale de lordre
du centimtre.
Dans la suite de ce chapitre, nous dcrirons ces diffrents types de modles
par ordre chronologique de complexit croissante (approche de type bote noire,
modles compartimentaux, modles distribus).
2.2 Approche de type bote noire
2.2.1 Hypothses de lapproche bote noire

Lapproche de type bote noire consiste envisager lorgane cible comme une
bote dont on ne connat pas les proprits, caractrise par une fonction de
transfert FT reliant la grandeur value en sortie Gout la grandeur dentre Gin
(Fig. 2.1). Le systme considr ne possde quune entre et quune sortie. La
structure du systme entre ces deux points nest pas connue et ne nous intresse
pas pour le moment.
Fig. 2.1 Modlisation de la zone dintrt par une bote noire de fonction de transfert
FT .
Gout
FT = (2.1)
Gin
Les grandeurs G intressantes pour ce systme sont les flux de traceur, le dbit et
la quantit de traceur. Les hypothses utilises pour tablir les quations rgissant
lvolution de ces grandeurs sont les suivantes :
Il y a conservation de la masse,
la diffrence des flux entrant et sortant du systme doit tre gale au taux
de rtention du systme.
Il ny a pas de recirculation,
cest dire quune unit de fluide sortant du systme ny retourne jamais.
10
Approche de type bote noire
Le systme est stationnaire,

en particulier, le dbit est suppos constant pendant toute la dure de la
mesure. Par ailleurs, cette hypothse implique que la distribution des temps
de transit est constante2 .
Le systme est linaire,
la somme de deux consignes imposes la mme entre du systme produit
une rponse quivalente la somme des deux rponses individuelles.
Les sections suivantes de ce chapitre prsenteront les liens entres les para-
mtres du systme avec le dbit pour diffrents cas avant dexprimer la fonction
de transfert impulsionnelle normalise de la bote noire.
2.2.2 Cas de linjection constante de traceur

Considrons que le fluide scoule dans la bote noire avec un dbit constant
Q. Nous navons pas la description de lintrieur de cette bote noire, cependant
elle modlise un lit capillaire o lon sait quil existe un processus mlangeur.
Le traceur est inject en amont de ce processus mlangeur avec un dbit Qi et
une concentration Ci . Le flux de traceur inject Ji peut tre exprim comme le
produit du dbit et de la concentration dinjection.
Ji = Ci Qi (2.2)
En sortie du systme, cause du processus mlangeur, la concentration est ho-

mogne. Des chantillons sont prlevs permettant de tracer lvolution de la
concentration Cout . Cette concentration, aprs une priode de croissance, se sta-
bilise un maximum Cout (). A cet instant, le flux de traceur sortant du systme
est gal la concentration multiplie par le dbit sortant du systme. Comme le
systme est indformable, le dbit sortant est gal la somme des dbits en-
trant (dbit sanguin Q et dbit dinjection Qi ) dans le systme ce qui nous donne
lexpression suivante du flux sortant :
Jout = Cout ()(Qi + Q) (2.3)
Dans le cas dun traceur inerte, il ny a pas de consommation ni de production

et le flux de traceur entrant dans le systme est gal au flux qui en ressort.
Ci Qi = Cout ()(Qi + Q) (2.4)
A partir de lquation 2.4, le dbit peut tre valu.

Ci Ci
Q = Qi ( 1) Qi (2.5)
Cout () Cout ()
2
Pour comprendre cette hypothse il faut se replacer dans un systme rel tel quun lit
capillaire. Lorsquun traceur est inject instantanment lentre dun lit capillaire, il met
un certain temps parvenir la sortie. Cest le temps de transit. Cependant le milieu tant
complexe, il existe une distribution des temps de transit. Si la frquence pour laquelle chaque
temps de transit apparat est constante, alors la distribution des temps de transit est constante.
11
Comme le traceur peut tre mesur pour de trs faibles doses, la concentration
injecte est choisie de sorte que le rapport Ci sur Cout () soit grand devant un.
Dans le cas dun traceur radioactif ayant une dcroissance naturelle indpendante
de tout vnement, il faut corriger le bilan et tenir compte de cette disparition
en introduisant un terme puits dans lquation 2.4.
2.2.3 Cas de linjection constante avec flux diffusif

On considre, prsent, un systme quivalent au systme prcdent mais
dans lequel le traceur peut saccumuler par change diffusif (flux Jd ) au sein de la
bote (2.2). Comme on ne sintresse plus au processus mlangeur, on considre
que le traceur entre de manire homogne dans le systme avec une concentration
Cin et le mme dbit que celui de lcoulement Q. Dans ces conditions, le flux
Fig. 2.2 Premier niveau de dtail de lintrieur de la bote noire. La bote est com-
pose dun rseau convectif et autorise la diffusion en son sein.
diffusif Jd scrit comme la diffrence des flux convectifs entrant et sortant du

systme,
Jd = Cin Q QCout (2.6)
et au bout dun certain temps ltat dquilibre est atteint, cest dire que la
concentration du systme devient constante.
2.2.3.1 Dfinitions
Nous allons introduire ci-dessous quatre termes trs frquemment utiliss dans
la littrature : extraction et clairance puis coefficient de partition et volume de
distribution.
Extraction et Clairance :
Lextraction est un coefficient qui correspond la quantit de traceur qui quitte
le systme par diffusion. Il est obtenu en divisant lquation 2.6 par le flux convec-
tif entrant.
Jd Cin Q QCout Cin Cout
E= = = (2.7)
Cin Q Cin Q Cin
La dfinition de lextraction implique ncessairement la dfinition de son compl-
ment, la transmission (T ), qui correspond la quantit de traceur transmise par
lcoulement.
T =1E (2.8)
12
La clairance Cl, donne une description du flux diffusif. Elle correspond au dbit de
fuite par diffusion ou encore au volume apparent de fluide dbarrass de traceur
par unit de temps. Cette dernire description tant lorigine du nom de ce
coefficient.
Jd
Cl = (2.9)
Cin
Coefficient de partition et volume de distribution :

Le coefficient de partition (d ) est dfini comme le rapport entre la concentra-
tion moyenne dans la bote noire lquilibre (y compris le sang) et la concen-
tration moyenne dans le sang lquilibre.
C bn ()
d = (2.10)
Cout ()
Ce coefficient est diffrent de un si laffinit chimique du traceur pour le sang est

diffrente de son affinit pour le tissu.
Le volume de distribution est un volume fictif reprsentant le volume de sang
quoccuperait la quantit de traceur prsente dans le systme lquilibre si cette
quantit de traceur tait la concentration dquilibre sanguine :
R()
d = (2.11)
Cout ()
avec la quantit de traceur prsente dans le systme R(t), appele le rsidu qui
peut tre exprime partir de la concentration moyenne et du volume du systme
ou partir de la concentration moyenne du sang et du volume de distribution.
R() = C bn ()bn = Cout ()d (2.12)
A partir des quations 2.11 et 2.12, il est possible dexprimer le coefficient de

partition comme le volume de distribution normalis.
C bn () d
d = = (2.13)
Cout () bn
Cette dfinition du coefficient de partition est lorigine de la confusion entre

coefficient de partition et volume de distribution normalis. En effet, dans la
littrature consacre la mesure du dbit sanguin en TEP, les units utilises
diffrent de celles couramment utilises en mcanique des fluides puisque les d-
bits sont en gnral normaliss par un volume (m3 .s1 .m3 ) ou par la masse
(m3 .s1 .g 1 ), la densit du cerveau tant proche de 1. Ainsi, les quations sont
normalises par le volume du systme et le coefficient de partition tant gal au
volume de distribution normalis, il est trs souvent abusivement nomm volume
de distribution.
Les travaux de Herscovitch & Raichle (1985.) fournissent diffrentes valeurs
rfrences de ce coefficient pour leau radio-marque :
13
Units du coefficient de partition

g/g ml/g ml/ml
d 0.96 0.90 0.95
gd 1.04 0.98 1.03
bd 0.87 0.82 0.86
Tab. 2.1 Coefficients de partition pour le cerveau dans son ensemble (d ), pour
la matire grise (gd ) et pour la matire blanche (bd ).
2.2.3.2 Estimation du dbit

Lvaluation du dbit peut se faire soit partir de la connaissance simultane
de la clairance et du coefficient dextraction puisque daprs les quations 2.7 et
2.9 on a :
Cl
Q= (2.14)
E
soit partir du rsidu R. En effet, le rsidu varie avec le temps et sa variation
est gale la diffrence des flux dentre et de sortie du systme.
dR(t)
= Q(Cin Cout ) (2.15)
dt
On peut donc exprimer le dbit en utilisant les relations 2.11 et 2.15 de la manire
suivante.
d Cout ()
Q = R (2.16)
0 (Cin Cout )dt
2.2.4 Cas de linjection de type bolus

Dans linjection de type bolus, une quantit de traceur (Ci i ) est injecte pen-
dant une priode restreinte (de lordre de la minute). Si lon considre un traceur
pour lequel il ny a pas de raction lors de son passage dans un organe, alors,
daprs le principe de conservation, ce traceur pourra tre totalement rcupr
la sortie de lorgane. Par consquent, il est possible dexprimer la quantit de
traceur inject en fonction du volume inject i , du dbit Q et de lintgrale de
la concentration la sortie du systme.
Z Z
i Ci = Cout (t)Qdt = Q Cout (t)dt (2.17)
0 0
Lquation 2.17 permet donc dexprimer le dbit

i Ci
Q = R (2.18)
0 Cout (t)dt
comme tant linverse de lintgrale de la concentration du traceur totalement

rcupr la sortie du systme, normalise par la quantit de traceur injecte.
14
Le dbit recherch est dans ce cas valu par la mesure de laire comprise sous
la courbe de la concentration Cout . Pour obtenir cette courbe, des chantillons
sanguins sont prlevs tout le long de lexamen. Notons que dans cette approche,
le dbit mesur dcrot lorsque la dure dacquisition augmente.
2.2.4.1 Fonction de distribution des temps de transit et fonctions as-

socies
Nous allons maintenant introduire la fonction de distribution (ou frquence)
des temps de transit h(t). Le dveloppement nous permettant dexprimer h(t) a
t propos par Zierler (1962., 1965.) et repris par Bassingthwaighte (1966.). Il
sous-entend quil ny a pas de recirculation du traceur, et que le traceur a t
introduit lentre, linstant t = 0 sous la forme dun Dirac (t). La fonction
h(t) traduit la proportion de traceur inject qui sort du systme par unit de
temps linstant t. On peut donc lexprimer comme le rapport du flux sortant
du systme sur la quantit de traceur injecte.
QCout (t)
h(t) = (2.19)
i Ci
Lquation 2.19, montre que la fonction h(t) correspond galement la fonction
de transfert impulsionnelle normalise de la bote noire. La particularit de cette
fonction est dtre comprise entre 0 et 1, et davoir une intgrale sur lensemble
des temps gale 1.
Z
0 h(t) 1 et h(t)dt = 1 (2.20)
0
En effet, la quantit sortante du systme ne peut pas tre ngative, ni suprieure

la quantit injecte. On a donc :
Z Z Cout (t) i Ci
h(t)dt = Q dt = =1 (2.21)
0 0 i Ci i Ci
La combinaison des quations 2.18 et 2.19 permet dcrire :
Cout (t)
h(t) = R (2.22)
0 Cout (t)dt
Lintroduction de la fonction h(t) permet de dfinir deux fonctions associes. La

fonction H(t) reprsente la fraction de traceur qui est sortie du systme depuis
linstant t = 0. Cest donc lintgrale de 0 t de h(t).
Z t
H(t) = h( )d (2.23)
0
La fonction rsidu R(t) dj prsente, reprsente la fraction de traceur toujours

dans le systme depuis linstant t = 0.
R(t) = 1 H(t) (2.24)
15
R(t) est donc le complment de H(t) et correspond au type de fonction mesure

en TEP.
Nous lavons not plus haut, la fonction h(t) est la fonction de transfert impul-
sionnelle normalise du systme, la concentration de sortie Cout (t) correspondant
une entre Cin (t) quelconque peut donc tre calcule par la convolution de
Cin (t) avec h(t).
Z t
Cout (t) = Cin (t) h(t) = Cin ( )h(t )d (2.25)
0
2.2.4.2 Le temps de transit moyen

Le temps de transit moyen dun traceur qui est totalement vacu du systme
par la convection peut tre exprim comme lintgrale du produit t h(t).
Z
T = t h(t)dt (2.26)
0
Cette expression du temps de transit moyen nest valide que dans le cas o il
ny a pas de recirculation du traceur dans le systme. Cependant, dautres dfi-
nitions sont quivalentes. En particulier, il peut tre exprim en fonction de la
concentration de sortie Cout ,
R
tCout (t)dt
T = R0 (2.27)
0 Cout (t)dt
ou encore en fonction du volume de distribution Vd et du dbit.

d
T = (2.28)
Q
2.2.5 Conclusion
Bien que lapproche de type bote noire relie le dbit de nombreux para-
mtres, son valuation en pratique nest ralisable que par la connaissance de
la quantit de traceur injecte et de la mesure de la concentration en sortie du
systme, puisque le coefficient dextraction ou la clairance sont des paramtres
difficilement accessibles sans la connaissance prcise du milieu.
Cette mthode nest donc pas idale en clinique, puisque la collecte dchan-
tillons sanguins reste un processus dlicat et ne permet pas denregistrer lvolu-
tion de la concentration de sortie pendant un temps infini. Une extrapolation est
donc ncessaire pour obtenir la fin de la courbe et, le plus souvent, sa dcrois-
sance est assimile une dcroissance de type exponentielle. Cela traduit un taux
dvacuation constant qui est alors dfini comme le rapport entre h(t) et R(t).
Ainsi, si cette mthode peut savrer fonctionnelle pour lvaluation du dbit
lchelle du cerveau complet, elle ne lest pas pour la mesure du dbit sanguin
crbral rgional, la mesure de la concentration en sortie de la zone observe
ntant pas accessible.
16
Approche compartimentale
2.3 Approche compartimentale

Dans cette partie, nous allons reprendre les concepts introduits par lana-
lyse de type bote noire, en fournissant un modle de lintrieur de la bote. Nous
verrons que cela permet dexprimer la concentration de sortie du systme en fonc-
tion de la concentration dentre et de paramtres physiologiques. Par consquent,
lutilisation du modle compartimental pour lvaluation du dbit sanguin ne re-
quiert plus la collecte dchantillons sanguins veineux et autorise lvaluation de
dbits rgionaux. Dans la suite de ce chapitre, nous prsenterons lvolution chro-
nologique du modle compartimental le plus utilis actuellement (Kety, Renkin-
Crone) ainsi que dautres modles plus rcents, faisant intervenir plus de ralit
physiologique (St Lawrence, Goresky, Munk). Bien que ces derniers modles com-
portent plus de ralit physiologique, ils partagent tous un point commun avec les
modles compartimentaux adoptant tous lhypothse dune cintique dchange
du premier ordre entre les deux compartiments.
2.3.1 Le modle de Kety

Le modle de Kety est historiquement le premier modle compartimental per-
mettant lvaluation du dbit sanguin crbral et a t longuement utilis en TEP
(Kety (1944.); Kety & Schmidt (1948.); Kety (1949.)).
Gomtrie et paramtres :
Ce modle dcrit les changes bidirectionnels dun compartiment vasculaire
avec un unique compartiment tissulaire par une cintique du premier ordre (Fig.2.3).
Les compartiments de ce modle sont considrs tout instant comme parfaite-
Fig. 2.3 Modle de Kety : ce modle compartimental dcrit les flux bidirectionnels
en traceur entre le sang (Ca ) et le tissu (Ct ). Le flux net entrant dans le tissu est gal
au flux entrant dans le tissu (K1 Ca ) moins le flux qui en ressort (k2 Ct ).
17
ment mlangs et la diffusion dans le compartiment vasculaire est totalement n-

glige. La concentration de chaque compartiment ne dpend donc que du temps.
Les paramtres sont les concentrations en traceur dans le tissu (Ct ), dans le
sang artriel (Ca ), le volume de tissu (t ) et les constantes dchanges K1 et k2
(Fig.2.3). Le flux de traceur allant du sang vers le tissu est dfini par le produit
de la constante K1 et de la concentration sanguine Ca (K1 Ca ), tandis que k2 Ct
reprsente le flux allant du tissu vers le sang par rtro-diffusion. La variation de
la quantit de traceur dans le tissu au cours du temps scrit :
dCt (t)
t = K1 Ca (t) k2 Ct (t) (2.29)
dt
Cette quation implique qu lquilibre Ca est diffrent de Ct ce qui est ty-
pique dun quilibre entre phases avec un coefficient de partitionnement. Pour
ce modle, le coefficient de partition d est dfini comme le rapport entre la
concentration moyenne lquilibre dans le systme (sans le sang donc C t ) et la
concentration moyenne lquilibre du sang.
C t ()
d = (2.30)
C c ()
Le modle compartimental stipule que la concentration dans le tissu est homo-
gne dans tout le compartiment tissulaire. La concentration moyenne tissulaire
et la concentration dans le tissu dsignent donc la mme quantit. Par cons-
quent, la rsolution de lquation 2.29 permet dexprimer la concentration dans
le tissu sous la forme dun produit de convolution entre la concentration sanguine
et un terme de dcroissance exponentielle. La concentration dans le tissu tant
initialement nulle, on a
K1 k
( 2 t)
Ct (t) = Ca (t) e t , (2.31)
t
permettant de dduire la fonction de transfert impulsionnelle normalise h(t)
associ ce modle : k K1 ( 2 t)
h(t) = e t . (2.32)
t
Nous avons vu dans lanalyse de type bote noire que la mesure obtenue par TEP
correspond la quantit de traceur prsente dans le systme, cest dire au rsidu
R(t). Or le traceur prsent dans le systme est situ dans le sang, mais galement
dans le tissu. Le volume de sang reprsentant environ 2% du volume total, Kety
nglige la contribution du traceur dans le sang au signal et assimile le rsidu la
quantit de traceur prsente dans le tissu.
R(t) = t Ct (t) (2.33)
La concentration tissulaire Ct est donc directement proportionnelle au rsidu

mesur par la TEP, tandis que Ca est obtenue en prlevant des chantillons de
sang durant la dure de lexamen. Lobtention de ces deux paramtres permet,
par lutilisation dune rgression non linaire avec lquation 2.31, destimer les
valeurs des coefficients dchange K1 et k2 .
18
2.3.2 Mesure du dbit avec le modle de Kety

Pour relier les coefficients K1 et k2 au dbit, le modle est complt par une
tude sur les flux entrant et sortant du compartiment vasculaire. Pour cela, le
problme est lgrement modifi, puisque dsormais le compartiment vasculaire
est apprhend dans son ensemble, cest dire quil part de lartriole et rejoint
une veinule. Le modle adopte donc comme paramtres, les concentrations ar-
trielle (Ca ), veineuse (Cv ) et tissulaire (Ct ), mais galement les flux de traceur
entrant dans le vaisseau (Ja ), sortant du vaisseau par convection (Jv ) et par dif-
fusion (Jt ) (Fig.2.4). Le systme est considr comme indformable, le principe
Fig. 2.4 Ecoulement du traceur le long dun capillaire. Ca et Cv sont les concentra-
tions artrielle et veineuse, Ct tant la concentration dans le tissu. Le flux de traceur
sortant Jv est gal au flux de traceur entrant Ja moins le flux diffusif Jt .
de conservation de la masse permet dcrire pour le compartiment vasculaire que

la somme des flux entrant et sortant est nulle et dexprimer le flux allant dans le
tissu par lquation suivante :
Jt = Ja Jv (2.34)
Le flux artriel est gal au produit du dbit par la concentration artrielle. De
mme, le flux veineux est le produit du dbit par la concentration veineuse. Le
flux diffusif peut donc scrire :
dCt
J t = t = Ja Jv = Q (Ca Cv ) (2.35)
dt
Nous avons vu prcdemment que le coefficient dextraction est gal au flux diffusif
de traceur divis par le flux convectif entrant (Eq. 2.7 p.12).
Ca Cv
E= (2.36)
Ca
Lutilisation de ce coefficient dans lquation 2.35 donne :
J t = Q E Ca (2.37)
19
Le dbit est contenu dans lexpression du flux diffusif de traceur. Pour relier cette
expression du flux celle dfinie prcdemment par K1 Ca , il faut envisager une
petite section dx du modle prcdent comme le montre la figure 2.5.
Fig. 2.5 Positionnement du modle de Kety par rapport au modle tenant compte
du gradient longitudinal de concentration dans le compartiment vasculaire. La concen-
tration Cc est ici la concentration du canal dans la petite section.
La concentration dans le canal Cc varie le long du canal de Ca Cv . Cependant

pour cette petite section, la concentration dans le compartiment vasculaire peut
tre envisage comme constante. La variation de concentration dans le tissu y est
donc galement dcrite par :
dCt (t)
t = K1 Cc (t) k2 Ct (t) (2.38)
dt
Cette quation est valable tout instant. Or, dans ce modle, K1 et k2 sont
considres comme indpendantes du temps. Elles peuvent donc tre values
des instants particuliers tels que linstant initial (t = 0) et lquilibre (t = ).
A t = 0, la concentration dans le tissu est nulle :
dCt (t)
t = K1 Cc (t) (2.39)
dt
20
Lutilisation des quations 2.35 et 2.37 donne lexpression suivante du flux de

traceur diffusif :
dCt
Jt = t = Q E Ca (2.40)
dt
Kety introduit alors lhypothse quil existe une sparation dchelle entre le temps
de diffusion et le temps de convection. Le temps de convection tant bien plus
petit que le temps de diffusion, la concentration dans le canal t = 0 peut tre
prise gale la concentration artrielle Ca . Ainsi, la constante dchange K1 peut
tre identifie comme tant gale au produit Q E.
K1 = Q E (2.41)
Pour dterminer k2 , on se place lquilibre, cest dire lorsque t tend vers

linfini. A lquilibre, dCdtt (t) = 0, on a donc daprs la relation 2.38 lgalit sui-
vante :
K1 Cc () = k2 Ct () (2.42)
Ce qui donne un coefficient dchange k2 gal :
Cc () Cc ()
k2 = K1 =QE (2.43)
Ct () Ct ()
Si lon remplace le rapport des concentrations par le coefficient de partition

d dfini par lquation 2.10 dans lquation 2.43, on obtient :
QE
k2 = . (2.44)
d
Ainsi, lquation 2.31 rgissant lvolution de la concentration dans le tissu, dfinie

par le modle de Kety, peut tre rcrite sous la forme suivante :
QE ( QE t)
Ct (t) = Ca (t) e d t . (2.45)
t
Dans la relation 2.45, les paramtres qui rgissent lvolution de la concentration

dans le tissu sont la concentration artrielle, le coefficient dextraction et le co-
efficient de partition. Daprs les relations 2.45 et 2.25, la fonction de transfert
impulsionnelle normalise du modle de Kety est donc :
QE
h(t) = e
d t (2.46)
Pour dterminer la valeur du coefficient dextraction (E), la collecte dchan-

tillons de sang reste ncessaire pour valuer la concentration veineuse (Cv ). Afin
de sen affranchir, Renkin (1955., 1959.) et Crone (1963.) ont propos une expres-
sion de ce coefficient. La dmarche utilise est prsente dans la section suivante.
21
2.3.3 Le modle de Renkin-Crone

Afin dexprimer le coefficient dextraction en fonction de paramtres physiolo-
giques et de saffranchir de la collecte dchantillons de sang au cours de lexamen,
Renkin (1955., 1959.) et Crone (1963.) ont modlis les changes entre un capil-
laire et le tissu prenant en compte les variations longitudinales de la concentration
dans le capillaire (contrairement au modle de Kety).
Paramtres et gomtrie du problme : le cylindre de Krogh.

A. Krogh tudiait la diffusion de loxygne dans les muscles. Cela la conduit
sintresser la micro-vascularisation de ces organes et mettre lhypothse
que chaque capillaire irrigue un cylindre de tissu qui lui est propre. En dautres
termes, cela signifie que chaque ensemble capillaire+tissu est isol et na pas
dchange avec ses voisins. Compte tenu de larrangement de la micro-circulation
dans les muscles (Fig.2.6), cette hypothse peut sembler acceptable. Cest pour-
Fig. 2.6 A. Krogh. The Journal of Physiology, 1919.
quoi Krogh a propos de modliser cet ensemble par deux cylindres coaxiaux de
longueur L. Le cylindre central reprsente le capillaire, tandis que le cylindre ex-
trieur reprsente son enveloppe de tissu. Dans cette gomtrie, trs proche de
la gomtrie du modle compartimental propos par Kety, lcoulement dans le
capillaire est permanent et indpendant de lespace et sa vitesse impose est V0 .
Le transport du traceur se fait par convection dans le capillaire et par diffusion
dans le tissu. Pour ce modle, lhypothse simplificatrice concernant labsence de
gradient dans les deux compartiments est relche pour le compartiment sanguin
(en partie, puisque seul le gradient longitudinal est pris en compte) mais demeure
pour le compartiment tissulaire. Par consquent, la concentration dans le capil-
laire Cc (x, t) dpend maintenant du temps et de la position en x tandis que la
concentration dans le tissu Ct (t) nest dpendante que du temps.
22
Expression du coefficient dextraction.

Pour dterminer lexpression du coefficient dextraction, une tude stationnaire
dune tranche radiale dpaisseur dx situe la position x sur laxe longitudinal est
ralise (Fig.2.7). La conservation de la masse sur cette tranche permet dcrire
Fig. 2.7 Bilan des flux.
lgalit suivante :
Z Z Z
j1 dS + j2 dS + j3 dS = 0 (2.47)
S1// S2// S3
avec :
j1 (x) = V0 Cc (x), (2.48)

j2 (x) = V0 Cc (x + dx) (2.49)
Ici, j1 et j2 sont les densits surfaciques de flux de traceur entrant et sortant

par convection de la tranche tandis que j3 est la densit surfacique de flux diffusif.
La loi de Fick dfinit le flux diffusif comme tant le produit du coefficient de
diffusion par le gradient de la concentration :

Cc
j3 (x) = D . (2.50)
r r=ro
Cependant dans la littrature (Renkin (1955., 1959.); Crone (1963.)), la dfini-

tion de ce flux est prfre lexpression suivante :
j3(x) = P (Cc (x) Ct ) (2.51)
o P est appel coefficient de permabilit3 . Ceci constitue une simplification de

la loi de Fick. En effet, si la paroi se comporte comme une membrane dpaisseur
3
Ce coefficient P qui est homogne une vitesse est abusivement appel "permabilit" dans
la littrature mais ne correspond pas la permabilit intrinsque dun milieu poreux (dont la
dimension est en m2 ). Il reprsente plutt un coefficient dchange.
23
e, que les concentrations sont faibles, alors on peut considrer que lvolution
de la concentration dans la membrane est linaire et que le gradient peut tre
linaris :
Cc (x) Ct

Cc
j3(x) = D = D . (2.52)
r r=ro e
Dans ce cas, P est gal au rapport entre le coefficient de diffusion et lpaisseur
de la membrane.
Les flux tant maintenant dfinis, la vitesse V0 tant invariante selon r, le
bilan devient
Ct PS
Q = (Cc Ct ). (2.53)
x L
o S reprsente la surface dchange entre le sang et le tissu. Aprs un changement
de variable appropri, x = Lx , dx = dx L
, et en utilisant la condition dentre
Cc (x = 0) = Ca , la solution sans second membre (instant initial, t = 0) de cette
quation diffrentielle est :
P S
x
Cc (x ) = Ca e Q (2.54)
Maintenant, si lon sintresse la rsolution dans le tissu, nous avons vu

avec lquation 2.40 que lvolution de la concentration dans le tissu dpend de
la concentration en entre, du dbit et du coefficient dextraction. Si dans cette
expression, on remplace le coefficient dextraction par sa dfinition (Eq. 2.36) on
obtient :
dCt
t = Q(Cc (0) Cc (L)) (2.55)
dt
Cette quation signifie que la variation de la concentration tissulaire au cours du
temps correspond la diffrence entre la concentration dentre et de sortie du
capillaire. A partir de la dfinition de E et de lquation 2.54
P S
Ca Cv Ca Ca e Q
E= = (2.56)
Ca Ca
il est possible dexprimer le coefficient dextraction pour la gomtrie de Krogh
par la relation suivante.
P S
E =1e Q (2.57)
Cette dernire quation est appele expression de Renkin-Crone. Lorsquelle est
r-injecte dans lquation 2.45, on obtient la relation principale du modle de
Renkin-Crone,
P S P S
Q(1e Q )
Q (1 e Q ) ( t)
Ct (t) = Ca (t) e d t
, (2.58)
t
utilise pour valuer le dbit puisque, comme le modle de Kety, il nglige la
contribution du traceur dans le sang au signal enregistr par le tomographe et
assimile le rsidu la quantit de traceur prsente dans le tissu :
R(t) = t Ct (t). (2.59)
24
Mesure du dbit.
Le modle de Renkin-Crone permet donc dexprimer la concentration dans le
tissu en fonction du dbit, de la concentration artrielle, de la surface dchange
et du coefficient de permabilit. Les deux derniers paramtres sont des donnes
physiologiques quantifiables, au moins lchelle globale4 , et la concentration
artrielle est impose lors de lexamen. Ainsi, lvaluation du dbit peut tre
ralise en ajustant les donnes exprimentales avec le modle de Kety, sans avoir
recours la collecte dchantillons sanguins veineux.
2.3.4 Limitations des modles de Kety et de Renkin-Crone
Lintroduction du coefficient dextraction dans lexpression de la concentra-

tion tissulaire pose un certain nombre de problmes. En effet, le dbit sanguin
crbral est dsormais coupl avec E et il est impossible dobtenir une mesure
du dbit sans la connaissance de ce paramtre (St. Lawrence & Lee (1998.a,.)).
Dans le modle de Renkin-Crone, ce paramtre dpend de la permabilit de la
membrane dont la mesure, effectue le plus souvent lchelle macroscopique et
discute dans la revue de Michel & Curry (1999.), pose problme. En supposant
ces paramtres constants, les valeurs de dbit mesures exprimentalement dimi-
nuent lorsque la dure dacquisition augmente (Larson et al. (1987.); St. Lawrence
& Lee (1998.b)). Selon St. Lawrence, ce phnomne est d la contribution au
signal du traceur situ dans le compartiment vasculaire qui est totalement n-
glige dans le modle de Renkin-Crone. Le volume de sang reprsentant environ
2% du volume total, lerreur engendre peut paratre faible. Cependant, pour
certains rgimes, lerreur peut devenir non ngligeable. En particulier, dans le
cas dun temps de transit faible devant le temps de diffusion, la concentration
sanguine volue peu entre lentre et la sortie, et le rseau vasculaire contient une
proportion importante de la quantit de traceur inject. Pour pallier le manque
dinformation dans les modles compartimentaux sur la contribution au signal de
la phase sanguine, dautres modles ont t proposs comme le modle dhomo-
gnit tissulaire (St. Lawrence & Lee (1998.a,.)).
4
Les paramtres physiologiques sont dtermins par la comparaison des rsultats obtenus
avec deux traceurs, lun tant diffusif et lautre confin la phase sang (E = 0). Le dbit tant
identique pour les deux expriences, cela permet de dterminer le coefficient dextraction E
puis le couple P S. Dans ce cas, les valeurs du couple P S sont values lchelle de lorgane
dans son ensemble. Diffrentes valeurs de ce couple existent dans la littrature, les travaux de
St. Lawrence & Lee (1998.b) et de Eichling et al. (1974.) proposent respectivement une valeur
de 150 ml/min/100g et de 138 ml/min/100g.
25
2.3.5 Modle dhomognit tissulaire (Tissue homoge-

neity model)
Ce modle introduit dans la littrature par Johnson & Wilson (1966.) uti-
lise comme les prcdents deux compartiments spars par la barrire hmato-
encphalique pour modliser le cerveau dans son ensemble. A la diffrence du mo-
dle de Kety, la concentration en traceur dans le compartiment vasculaire Cc (x, t)
est galement dpendante de la position longitudinale dans le capillaire. Le dia-
mtre du capillaire tant petit, le gradient de concentration radial est nglig.
Dans le compartiment tissulaire, la concentration Ct (t) est considre comme ho-
mogne (compartiment parfaitement mlang) et ne dpend que du temps. La
figure 2.8 prsente la gomtrie et les paramtres du problme.
Fig. 2.8 Modle dhomognit tissulaire : Compos dun compartiment vasculaire

et dun compartiment tissulaire, les paramtres de ce modle sont la longueur L du
capillaire, les surfaces des sections (St et Sc ), les volumes (Vt et Vc ) et les concentra-
tions (Ct (t)) et Cc (x, t)) de chaque compartiment. Enfin, les changes entre les deux
compartiments sont caractriss par le produit permabilit-surface P S.
A partir dun bilan de masse sur chacun des deux compartiments, il est pos-
sible de dfinir les quations qui dcrivent lvolution de la concentration dans
lensemble capillaire+tissu.
Dans le capillaire :
Cc (x, t) Cc (x, t) P S
Sc = Q [Cc (x, t) Ct (t)] . (2.60)
t x L
Dans le tissu :
Ct (t) PS
Z L
St = 2 [Cc (x, t) Ct (t)] . (2.61)
t L 0
Pour rsoudre ces quations, les conditions limites suivantes sont utilises :
Cc (x, t = 0) = Ct (t) = 0 (2.62)
Cc (x = 0, t > 0) = C0 (t) (2.63)

o correspond la fonction Dirac. Le systme dfini par les quations 2.60
et 2.61 na de solution analytique que dans le domaine de Laplace comme le
26
montrent St. Lawrence & Lee (1998.a). Cependant, la concentration dans le com-
partiment tissulaire change lentement devant celle du compartiment capillaire.
Cette diffrence dchelle de temps est suffisante pour estimer que, pendant la va-
riation de la concentration dans le capillaire, la concentration dans le tissu est
lquilibre (Lassen & Perl (1979.)). La traduction mathmatique de cet tat quasi-
statique est de considrer que pendant le pas de temps t, Cc (t) est constant.
Ainsi lexpression de Cc (t) devient discrte et sexprime de la manire suivante :
n1
X
Cc (t) = Cc (jt)u(t jt) (2.64)
j=0
o Cc (jt) correspond au saut discret de la concentration linstant jt et

u est la fonction de temps unit. Lutilisation de cette expression de Cc (t) dans
les quations 2.60 et 2.61 permet daboutir une solution. La solution de ce
modle, nomm Adiabatic homogeneity model dans la littrature, est propose
par St. Lawrence & Lee (1998.a). Elle permet dexprimer aprs simplification, la
concentration mesure en TEP (CT EP ) comme tant :
c Ca (t) EQ k

adb t
CT EP = + Ca (t) e t (2.65)
tot tot
avec kadb = E.Q le coefficient dchange du modle Adiabatic, c et t les vo-

lumes de la phase sang et de la phase tissu. Cette solution tient donc compte
de la contribution de la phase sanguine au signal. Cependant elle utilise tou-
jours comme paramtres le produit P S, le coefficient dextraction E et ncessite
lvaluation des volumes de distributions. Or, nous lavons voqu prcdemment,
ces paramtres sont valus lchelle macroscopique et demeurent difficilement
accessibles.
Validation de lestimation du dbit avec la solution de St Lawrence.

Pour vrifier la validit du modle dhomognit tissulaire, St. Lawrence & Lee
(1998.a) ont compar les rsultats obtenus par linversion de lquation 2.65 (dont
trois paramtres ont t ajusts pour que la concentration dfinie par cette qua-
tion corresponde celle mesure en TEP) avec le dbit obtenu par une mthode de
rfrence ncessitant le sacrifice de lanimal (mthode de Heymann et al. (1977.)).
Cette mthode de rfrence permet dobtenir le dbit partir du comptage de
micro-sphres radioactives non diffusives directement injectes dans lartre f-
morale. Le graphique 2.9 compare le dbit sanguin crbral estim par ce modle
avec le dbit de rfrence (mthode de Heymann) chez les lapins. Ce rsultat issu
des travaux de St. Lawrence & Lee (1998.b) montre clairement que le modle sous
estime les dbits suprieurs 60 mL.100g 1 .min1 puisque les valeurs du dbit
estim par rapport au dbit rel se trouvent sous la droite identit. La cause de
cette sous-estimation est impute lextraction limite de leau radio-marque
dans le tissu pour les coulements rapides.
27
Fig. 2.9 Comparaison du dbit sanguin crbral estim par le modle dhomognit
tissulaire adiabatique, CBFg avec les valeurs relles du dbit, CBFM . Les points donnent
les 36 valeurs obtenues et la courbe pleine reprsente la rgression. La ligne discontinue
est la droite identit. Cette figure provient des travaux de St. Lawrence & Lee (1998.b)
Conclusion.
Ce modle propose une expression de la concentration qui tient compte de la
contribution du rseau vasculaire au signal mesure en TEP. Cependant, il ne
rsout pas les problmes dobtention des coefficients physiologiques. Il permet de
diminuer la baisse du dbit mesur exprimentalement lorsque la dure dacqui-
sition augmente, sans pour autant totalement lliminer. Nanmoins, ce modle
permet de mettre en vidence la faiblesse des modles compartimentaux valuer
le dbit sur une large gamme et dmontre, que, pour mesurer le dbit sanguin
crbral sur toute la gamme physiologique de manire prcise, le modle com-
partimental doit tre abandonn au profit de modles plus proches de la ralit
physiologique. Ces modles sont regroups sous la dnomination de "modles
paramtres distribus" (Distributed-parameter models). Cependant, bien que plus
complets, ils reprennent en grande partie les hypothses des modles comparti-
mentaux (Kety, Renkin-Crone) mais cette fois, tiennent compte des gradients de
concentration dans le tissu. Dans la suite, nous expliciterons deux de ces mo-
dles : le modle de Goresky et al. (1970.) et le modle microvasculaire (Munk
et al. (2003.a,.)).
2.3.6 Le modle de Goresky

Dans ce modle, le seul mode de transport du traceur le long du capillaire
est la convection. On suppose que le capillaire appartient un organe dont la
28
densit capillaire est importante et quil y a un coulement dans chaque capil-

laire : lorgane est donc bien irrigu. Par consquent, la distance moyenne dun
capillaire un autre est suffisamment petite pour que le temps dquilibre de la
concentration dans le tissu soit ngligeable. En dautres termes, la concentration
en traceur dans le compartiment tissulaire est instantanment uniforme dans la
direction perpendiculaire au sens de lcoulement. Cest pourquoi le gradient de
concentration radiale du compartiment tissulaire est nglig. Lensemble de ces
hypothses implique selon Goresky et al. (1970.) que le modle nest valable que
pour des organes bien irrigus et par consquent ne peut tre appliqu la peau
ou aux muscles stris.
Dfinition des paramtres du modle.

Soit un capillaire de longueur L spar de son enveloppe de tissu par une
barrire permable de permabilit P . A partir de la concentration dans le
capillaire Cc (x, t), de la concentration dans le tissu Ct (x, t), des volumes de chaque
compartiment c et t , de la vitesse V0 du sang dans le capillaire et du volume
de distribution Vd , il est possible dcrire une quation diffrentielle (Eq. 2.66)
dcrivant lvolution des concentrations.
Mise en quation :
Cc (x, t) Cc (x, t) Ct (x, t)
c +Q + t =0 (2.66)
t x t
Pour modliser la cintique dchange du premier ordre, le modle utilise deux
constantes dchange K1 pour le flux sortant et k2 pour le flux entrant dans le
capillaire, permettant dcrire
Ct (x, t)
t = K1 Cc (x, t) k2 Ct (x, t) (2.67)
t
ou encore en utilisant le coefficient de partition :
Ct (x, t) K1
t = K1 Cc (x, t) Ct (x, t) (2.68)
t d
Ces quations sont rcrites sous la forme suivante :

Cc (x, t) Cc (x, t) t Ct (x, t)
+ V0 + =0 (2.69)
t x c t
K1 k2 t Ct (x, t)
Cc (x, t) Ct (x, t) =0 (2.70)
c c c t
dont la somme permet de ramener le problme une unique quation :
Cc (x, t) Cc (x, t) K1 k2
+ V0 + Cc (x, t) Ct (x, t) = 0 (2.71)
t x c c
29
Afin de faire disparatre la concentration tissulaire, cette quation est drive

par rapport au temps et la drive temporelle de la concentration tissulaire est
remplace par celle obtenue lquation 2.67.
2 Cc (x, t) 2 Cc (x, t) 1 t Cc (x, t) k2 Cc (x, t)

2
+ V0 + (K1 + k2 ) + V0 =0 (2.72)
t xt t c t t x
Pour obtenir la solution de cette quation, lquation est rcrite dans le domaine
de Laplace et une discussion a lieu sur les ordres de grandeurs des coefficients,
K1 et k2 .

st +k2 +K1 t
c
Vsx
Cc (x, s) = Cc (0, s)e 0 st +k2 (2.73)
Dans le cas o K1 = k2 = 0, cas dun traceur non diffusif, lquation devient
Vsx
Cc (x, s) = Cc (0, s)e 0 (2.74)
dont la solution temporelle est

x
Cc (x, t) = Cc (0, t)(t ) (2.75)
V0
ce qui dcrit un coulement le long du capillaire la vitesse V0 et une sortie

linstant T = VL0 = appel temps de transit du capillaire.
Dans le cas o K1 est fini et k2 tend vers 0, cest dire lorsque le traceur
ayant diffus dans le tissu ne retourne pas dans le capillaire5 lquation dans le
domaine de Laplace se simplifie de la manire suivante :
K
Vsx (1+ s1 )
Cc (x, s) = Cc (0, s)e 0 c (2.76)
La solution temporelle devient :

V
K1 x
x
Cc (x, t) = Cc (0, t)e 0 c (t ) (2.77)
V0
En particulier la sortie (x = L), on a

K1
Cc (L, t) = Cc (0, t)e c T (t T ) (2.78)
Si maintenant on exprime le coefficient K1 en fonction du produit P S en utilisant

la relation de Renkin-Crone,
PQS
K1 = Q E = Q (1 e ) (2.79)
5
Ce cas sapplique uniquement aux traceurs pour lesquels des modes de transport actifs
diffrents sont mis en jeu sur les faces basales et apicales des cellules de la membrane. Cependant,
en gnral les traceurs utiliss ne mettent pas en jeu ces modes de transport. Et en particulier
dans le cas de leau radio marque, il ny a pas de transport actif du traceur.
30
et comme pour ce cas prcis, lextraction E tend vers zro, on a :

PS
K1 = Q E Q = PS (2.80)
Q
On retrouve pour ce modle avec la notation utilisant le coefficient P S pour

une entre de type Dirac
PQS
Cc (L, t) = Cc (0, t)e (t T ) (2.81)
lexpression de la concentration sanguine en sortie du capillaire propose par

Renkin et Crone (Eq. 2.54) avec un dcalage du au temps de convection.
Nous ne traiterons pas ici les deux autres cas qui sont le cas o K1 et k2
tendent vers linfini, et lorsquils sont tous les deux finis, le premier ntant pas
raliste et le dernier nayant pas de solution analytique moins dmettre dautres
hypothses simplificatrices (St. Lawrence & Lee (1998.a)).
Conclusion.
Ce modle est donc plus complet que les modles prcdents, cependant, nayant
pas de solution analytique en dehors des cas particuliers prsents, il nest pas
dun point de vue clinique dun grand intrt. De plus il napporte pas dindica-
tion pour lvaluation du coefficient K1 ou du produit P S. Cependant, en nous
appuyant sur les travaux de Goresky et al. (1970.), il semble que les rponses
obtenues sur diffrents organes se situent entre les cas limites prsents ici.
2.3.7 Le modle microvasculaire (O.L. Munk).

Les travaux de Munk et al. (2003.a,.) dmontrent la faible capacit des mo-
dles prcdents dterminer le dbit et proposent un nouveau modle.
2.3.7.1 Dmonstration de la limite des modles compartimentaux

Nous reprendrons ici la dmarche permettant de montrer que les modles com-
partimentaux standards aboutissent des incohrences lorsque lon tient compte
de la contribution au signal de la quantit de traceur prsente dans les capillaires.
En effet, dans le modle de Kety puis de Renkin-Crone, cette contribution avait
t nglige. Or la concentration enregistre en TEP (CT EP (t)) est pilote par la
conservation de la masse dans le systme.
tot CT EP (t) = t Ct (t) + c Cc (t) = t Ct (t) + c Ci (t) (2.82)
Cette quation de conservation de la masse met en oeuvre la concentration din-

jection Ci (t). Le traceur inject avec la concentration Ci (t) se dilue dans le sang et
donne une concentration sanguine Cc (t) proportionnelle la concentration din-
jection : Cc (t) = Ci (t). tot , t et c sont respectivement les volumes, total,
tissulaire et capillaire tandis que Ct (t) est la concentration tissulaire. Nous avons
31
vu, que dans le modle compartimental, la concentration tissulaire peut tre ex-
prime en fonction dun produit de convolution de la concentration dinjection
k
2t
et de la fonction de distribution des temps de transit h(t) = Kt1 e t (Eq. 2.32).
Lquation 2.82 peut donc scrire de la manire suivante :
k
2 t
tot CT EP (t) = K1 Ci (t) e t + c Ci (t) (2.83)
Dautre part, si lon utilise la loi de Fick, on peut galement dfinir la drive
temporelle de la concentration dans le systme. Lcoulement tant stationnaire,
le systme indformable et isol, la variation de la quantit de traceur du systme
est gale la diffrence des flux de traceur entrant et sortant.
CT EP (t)
tot = QCi (t) QCOut (t) (2.84)
t
Si lon sintresse aux premiers instants du processus, cest dire pour un
instant t petit devant le temps de transit moyen T , et permettant de ngliger le
k
2 (t )
retour du traceur du tissu vers le capillaire (t t /k2 et donc e t ' 1), les
quations 2.84 et 2.83 se rduisent au systme suivant :
CT EP (t)
tot = QCi (t) (2.85)
t
Z t
tot CT EP (t) = K1 Ci ( )d + c Ci (t) (2.86)
0
En combinant lintgration de lquation 2.85 avec lquation 2.86 on obtient
lgalit suivante :
Z t Z t
Q Ci ( )d = K1 Ci ( )d + c Ci (t) (2.87)
0 0
Par consquent, si lon considre K1 comme une constante indpendante du

temps, le r-arrangement de lquation 2.87 dmontre lincohrence de ce mo-
dle Rt
c 0 Ci ( )d
= (2.88)
Q K1 Ci (t)
puisque le terme de droite de lquation 2.88 dpend du temps alors que celui de
gauche doit en tre indpendant.
2.3.7.2 Le modle microvasculaire

Pour remdier ce problme, dans le modle microvasculaire la variation de
la concentration dans le tissu est dcrite par lquation suivante :
Ct (t)
= P SCc (t) P 0 S + Q0 Ct (t)

t (2.89)
t
o Cc (t) est la moyenne spatiale de la concentration vasculaire, P S est le coef-
ficient permabilit-surface dj prsent dans les autres modles qui caractrise
32
lchange du capillaire vers le tissu, tandis que P 0 S caractrise de la mme ma-

nire lchange du tissu vers le sang, son introduction autorisant un dsquilibre
du transport au niveau de la membrane. De mme, le terme Q0 permet de prendre
en compte un flux sortant du tissu vers une zone non vasculaire situe en dehors
de la zone dintrt. t et Ct (t) sont le volume et la concentration tissulaires et
tot est le volume de la rgion dintrt. Il est alors possible didentifier k2 tel
que :
k2 = (P 0 S + Q0 ) (2.90)
K1 = P S (2.91)
et dcrire la place de lquation 2.83 lquation suivante :

Z t k2
(t )
tot CT EP (t) = P S Cc ( )e t d + c Cc (t) (2.92)
0
La rsolution de cette quation diffrentielle ncessite la connaissance de la moyen-

ne spatiale de la concentration vasculaire.
Evaluation de la moyenne spatiale de la concentration vasculaire, Cc .

Pour dterminer Cc , nous allons utiliser lhypothse quil ny a pas de rtro-
diffusion6 de la concentration du tissu vers le capillaire. Cette condition est vrifie
lorsque P S = 0 ou lorsque P 0 S = 0 mais galement lors des premiers instants
lorsque t k1 . Plaons nous dans lintervalle de temps suivant :
2
t T t0 t (2.93)
avec T = Qc , le temps de transit li la convection dans un capillaire unique de

longueur L. Considrons un volume lmentaire de sang de concentration Cc (t0 )
entrant dans le capillaire linstant t0 . Jusqu linstant t, cet lment de sang
0
a sjourn dans le capillaire une fraction du temps de transit T gale tt T
et a
S(tt0 )
rencontr une fraction de la surface dchange S gale T . Par consquent,
la concentration de ce volume lmentaire de sang (cc ) linstant t est gale :
(tt0 )
PQS
cc (t) = Ci (t0 )e T (2.94)
Tous les lments de volume de sang prsents dans le capillaire linstant t sont
entrs entre les instants tT et t. Ainsi, en faisant leur moyenne, on peut exprimer
la moyenne spatiale de la concentration dans le canal linstant t :
1 t (tt0 )
Z
PQS
Cc (t) = Ci (t0 )e T dt0 , T < t (2.95)
T tT
Si Cc (t < 0) = 0, alors lintgrale peut tre effectue sur lintervalle 0 t T .

1 t (tt0 )
Z
PQS
Cc (t) = Ci (t0 )e T dt0 , T < t (2.96)
T 0
6
Le terme de rtro-diffusion ici, signifie que le traceur ayant diffus du capillaire vers le tissu
retourne dans le capillaire.
33
Cette approche pour calculer la moyenne spatiale de la concentration dans le

capillaire permet daboutir dans le cas o la concentration dinjection (Ci (t)) est
exprime sous la forme dune somme finie de termes exponentiels
Ak ek t
X
Ci (t) = (2.97)
k
lexpression suivante de Cc (t) :

k Ak ek t
X
Cc (t) = (2.98)
k
avec
ebk t/T 1
k = , 0 t T,
bk
ebk /T 1
k = , T t.
bk
Disposant dsormais dune expression pour la moyenne spatiale de la concentra-
tion, lquation 2.92 est rcrite de sorte quelle fasse apparatre la concentration
dinjection.

" # " #
Cc (t)
Z t Cc (t) k2
(t )
tot CT EP (t) = c Ci (t) + PS Ci (t)( )e t d (2.99)
Ci (t) 0 Ci (t)
La comparaison des quations 2.83 et 2.99 permet didentifier les coefficients K1

et :
Cc (t)
= (2.100)
Ci (t)
Cc (t)
K1 = PS (2.101)
Ci (t)
La rvision de ces deux coefficients permet dviter le paradoxe obtenu avec
les modles de Kety ou de Renkin-Crone o lon constate une dpendance en
temps de ces paramtres pourtant dfinis comme constants dans ces modles.
Concernant le coefficient dchange k2 , cette modification nentrane pas de r-
interprtation, par contre Munk et al. (2003.a) revisitent le coefficient de partition
de la manire suivante :
!
K () PS Cc ()
d = 1 = 0 (2.102)
k2 () P S + Q0 Ci ()
Dans le cas dune concentration dinjection de forme mono-exponentielle,

Ci (t) = Aet , le coefficient K1 se rduit lexpression
d
( P S )(1 )
Cc (t) 1e Q PS
K1 = P S =Q (2.103)
Ci (t) 1
PS
d
qui, dans le cas stationnaire, cest dire lorsque tend vers zro, revient
lexpression de Renkin-Crone : K1 = Q(1 eP S/Q ). Ce point rvle un autre
34
paradoxe des modles compartimentaux prcdents. En effet, dans le cas dun

traceur fortement diffusif, comme leau radio-marque, P S est grand devant Q.
Si lon se rfre la relation de Renkin-Crone, cela implique un coefficient K1
suprieur au dbit. Les modles compartimentaux autorisent donc, en thorie, un
transfert de traceur du tissu vers le capillaire plus rapide que larrive du traceur
dans le capillaire via lcoulement.
Evaluation du dbit.
Lvaluation du dbit avec le modle microvasculaire ncessite comme pour les
modles prcdents la connaissance du produit permabilit-surface et lvalua-
tion de la concentration capillaire moyenne. Si ces paramtres sont correctement
valus, la rgression de la courbe de concentration obtenue en TEP suivant lex-
pression 2.99 permet laide de la rsolution dun problme inverse dvaluer le
dbit Q.
Conclusion.
Ce modle plus complet permet de saffranchir des incohrences lies aux mo-
dles compartimentaux comme par exemple la dpendance en temps des coeffi-
cients dchange. Cependant, ce modle ne rsout pas le problme de lvaluation
du coefficient P S, et ne remet pas en cause lhypothse dune cintique dchange
du premier ordre entre les compartiments.
35
2.4 Conclusion
Dans ce chapitre nous avons prsent les principaux modles cintiques com-
partimentaux utiliss en clinique. Le modle le plus simple propos par Kety, nest
pas capable destimer correctement le dbut de la phase de distribution du traceur
pendant laquelle le bolus dinjection est distribu dans les capillaires. Bien que la
qualit de lestimation du dbit saccroisse dautant plus que ltat dquilibre est
approch, les rsultats obtenus avec ce modle restent peu fiables et la ncessit
deffectuer des prlvements dchantillons sanguins tout le long de lexamen rend
son utilisation dlicate. Le modle de Renkin-Crone permet de saffranchir des
prlvements veineux en introduisant le produit permabilit-surface.
Cependant, le dbit valu avec ce modle diminue fortement lorsque la du-
re de lexprience augmente. Pour pallier ce problme, des modles plus proches
de la physiologie, qui prennent en compte des inhomognits de concentrations
dans les deux compartiments, ont t dvelopps (modle de Goresky). Mais leur
rsolution reste dlicate et ncessite des simplifications supplmentaires (modle
dhomognit tissulaire), qui conduisent finalement une sous estimation du d-
bit. Une approche alternative est propose par Munk et al. (2003.a) dans laquelle
la concentration moyenne vasculaire est value partir de la relation de Renkin-
Crone applique localement. Les rsultats semblent meilleurs que ceux obtenus
avec les modles compartimentaux pour lvaluation du dbit sanguin hpatique.
Cependant, ce modle utilise plus de paramtres physiologiques dont lobtention
est dlicate (chirurgie invasive). De ce fait, la mthode propose pour lvaluation
du dbit hpatique (Munk et al. (2003.a)) nest pas applicable lhumain.
Dautres type de modles (modles 3 compartiments ou plus) ont t pro-
poss dans la littrature mais nont pas t prsents dans ce chapitre. Le point
commun avec les modles prcdents est de modliser le flux diffusif par une
fonction faisant intervenir la diffrence des concentrations de part et dautre de
lendothlium et non le gradient de concentration (loi de Fick). Ainsi, mme si
ces modles semblent plus complets, en faisant intervenir plus de dtails (in-
homognits des concentrations dans les compartiments, existence de plusieurs
compartiments tissulaires, ...), ils conservent lapproche de base des modles com-
partimentaux prsents dans ce chapitre. Par consquent, ils ne peuvent apporter
de rponse aux faiblesses prsentes.
Cest pourquoi, nous souhaitons proposer un modle qui soit applicable direc-
tement lchelle du voxel. En effet, la rsolution spatiale des tomographes reste
faible, et, lchelle dun voxel (chelle macroscopique), il nest pas possible de
diffrencier la micro-circulation et le tissu. Le modle que nous proposons est bas
sur un changement dchelle partir des quations de convection-diffusion per-
mettant daboutir un compartiment homogne fictif reprsentatif de lensemble
tissu+micro-circulation, dans lequel le flux diffusif interfacial nest pas approxim
a priori laide dun coefficient dchange. Dans la suite, nous verrons que les
paramtres macroscopiques de cet ensemble peuvent tre calculs par prise de
36
Conclusion
moyenne volumique des paramtres de lchelle microscopique.
37
38
Modlisation avec changement dchelle
Sommaire
3
3.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
3.2 Le changement dchelle . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
3.2.1 Les diffrentes chelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
3.2.2 Lintrt du changement dchelle . . . . . . . . . . . . 43
3.2.3 Outils ncessaires la prise de moyenne . . . . . . . . 43
3.2.3.1 Moyennes volumiques . . . . . . . . . . . . . 44
3.2.3.2 Thormes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
3.2.4 Principe du changement dchelle . . . . . . . . . . . . 45
3.3 Elaboration du modle cintique . . . . . . . . . . . . 46
3.3.1 Equations et conditions limites lchelle locale . . . . 47
3.3.1.1 Equations de continuit . . . . . . . . . . . . 47
3.3.1.2 Equations de conservation de la masse . . . . 47
3.3.1.3 Equations du champ de vitesse . . . . . . . . 47
3.3.1.4 Conditions aux limites . . . . . . . . . . . . . 48
3.3.2 Ecriture des quations en fonction des grandeurs moyen-
nes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
3.3.2.1 Prise de moyenne pour lquation de continuit 49
3.3.2.2 Prise de moyenne pour lquation de conser-
vation de la masse . . . . . . . . . . . . . . . 49
3.3.2.3 Prise de moyenne pour le champ de vitesse . 52
3.3.3 Choix du modle pour le changement dchelle . . . . 52
3.3.4 Fermeture du problme . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
3.3.5 Problmes de fermeture . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
3.3.5.1 Problme I associ hC i : . . . . . . . . 57
3.3.5.2 Problme II associ hC i : . . . . . . . 58
3.3.5.3 Problme III associ hC i hC i : . . 59
3.3.6 Equations lchelle de Darcy . . . . . . . . . . . . . 59
3.4 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
39
3.1 Introduction
Ce chapitre a pour objectif de prsenter la mthode de changement dchelle
utilise pour laborer un modle cintique reprsentant la micro-circulation ca-
pillaire, valide lchelle dun voxel. Cette mthode permet de dcrire des pa-
ramtres macroscopiques partir des caractristiques microscopiques du cerveau
(densit vasculaire, longueurs et diamtres moyens des capillaires). Elle est bien
matrise en physique des milieux poreux htrognes mais na jamais t utilise
dans le cadre de notre tude. En effet, lassimilation du cerveau un milieu po-
reux nest pas immdiate. Pourtant, tout milieu possdant une structure physique
appele matrice contenant des petites cavits formant lespace des pores peut tre
assimil un milieu poreux. La matrice peut autoriser ou non la diffusion, tandis
que les cavits distribues au sein de la matrice peuvent permettre un coulement
ou non suivant quelles sont inter-connectes ou pas. Dans le cas du cerveau, le
tissu crbral (neurones, cellules gliales) constitue la matrice diffusante et le lit
vasculaire intra cortical, le rseau inter-connect des pores.
Une des difficults principales de la modlisation des transferts en milieux
poreux est lie, dune part, la complexit gomtrique de lespace des pores
et, dautre part, au trs grand nombre de pores. Ce trs grand nombre de pores
explique limpossibilit matrielle de rsoudre, lchelle du milieu dans son en-
semble, un problme de transport formul lchelle des pores : une telle rsolu-
tion nest pour le moment pas envisageable tant donn la puissance des machines
de calcul. De plus, elle est sans intrt dans le cadre de notre tude puisque la
rsolution spatiale de la TEP ne donne pas accs lchelle des pores.
Cest dans ce contexte que se rvle lintrt de la mthode de changement
dchelle, puisque les milieux poreux, bien que non homognes lchelle des
pores, ont, le plus souvent, un comportement homogne dans leur ensemble. Pour
caractriser ce comportement, le milieu dans son ensemble est subdivis en vo-
lumes lmentaires. Pour chacun de ces volumes lmentaires, le milieu est homo-
gnis, et dans notre tude nous utiliserons une mthode de prise de moyenne
volumique (Whitaker, 1999.), et les paramtres effectifs caractrisant le compor-
tement du milieu cette chelle sont valus. Pour que ces paramtres effectifs
aient un sens, il est ncessaire que le volume lmentaire dfini soit reprsentatif
du milieu, cest dire que ce volume soit suffisamment grand devant la taille
caractristique des htrognits lchelle des pores mais suffisamment petit
devant lchelle caractristique des htrognits lchelle du milieu.
3.2 Le changement dchelle

3.2.1 Les diffrentes chelles
Dans le cas du cerveau, la micro-circulation intra-corticale peut tre diffren-
cie en deux types de rseaux (Cassot et al., 2006.; Lorthois & Cassot, 2010.) :
40
Le changement dchelle
un rseau de type arborescent (fractal), typiquement constitu de lensemble

des vaisseaux sanguins, artrioles ou veinules, dont le diamtre est compris
entre 9 et 100 m,
un rseau maill, form par les vaisseaux capillaires de diamtres compris
entre 4 et 9 m, homogne au dessus dune longueur de coupure correspon-
dant la longueur caractristique de ces vaisseaux ( 50 m).
Le rseau maill de capillaires se prte trs bien au changement dchelle puisquil
est homogne grande chelle. Il est donc possible de dfinir un VER (volume
lmentaire reprsentatif) suffisamment grand (typiquement 10 fois la taille de
coupure, cest dire 500 m) pour que lensemble tissu+rseau capillaire puisse
tre assimil un milieu continu. Au contraire, il nest pas possible dhomogni-
ser la partie arborescente du rseau de par son caractre multi-chelle (fractal).
Cest pourquoi, lobtention dun modle lchelle macroscopique ncessite une
approche mixte couplant changement dchelle pour la partie maille et une ap-
proche de type rseau pour la partie arborescente. Dans ce travail, notre intrt
se porte principalement sur le changement dchelle qui consiste homogniser
lensemble tissu+rseau capillaire maill et les diffrentes chelles impliques sont
les suivantes :
Lchelle microscopique :
Cette chelle est la plus petite, elle est compose dune rgion fluide, le sang
contenu dans le rseau maill de vaisseaux capillaires formant les pores et dune
rgion solide, le tissu (cf Fig.3.1, droite). Les htrognits de cette chelle con-
cident avec le rseau capillaire maill, le tissu tant considr comme homogne.
Lchelle de Darcy :
Cest une chelle intermdiaire laquelle lensemble tissu+rseau capillaire
maill de lchelle microscopique est assimil un milieu continu homogne. A
cette chelle, les htrognits sont donc uniquement lies la prsence du r-
seau arborescent (cf Fig.3.1, centre).
Lchelle macroscopique :
Cest lchelle la plus grande, elle correspond lchelle laquelle les images
TEP sont obtenues (cf Fig.3.1, gauche). Cette chelle est caractrise par la pr-
sence de deux rgions distinctes : une rgion fluide (le sang contenu dans le rseau
arborescent) et une rgion formant la matrice poreuse (le tissu et le rseau ca-
pillaire maill). Les htrognits de cette chelle sont essentiellement lies la
prsence des plus gros vaisseaux du rseau arborescent (artres ou veines) mais
galement la densit du rseau vasculaire maill variant selon le type de tissu
(matire blanche ou matire grise).
41
Fig. 3.1 Les diffrentes chelles du milieu "cerveau". Le changement dchelle prsent
dans ce travail consiste modliser lensemble tissu+capillaires de lchelle microsco-
pique par un milieu homogne fictif lchelle de Darcy.
Cette prise en compte des diffrentes chelles na jamais t effectue lors de

lexploitation des images TEP puisque, nous lavons vu dans le chapitre prcdent,
les diffrents modles cintiques utiliss jusqu prsent sont dfinis lchelle mi-
croscopique.
Cependant, pour parvenir, plus long terme, une quantification du dbit

sanguin rgional, le couplage du changement dchelle et de lapproche de type
rseau sera ncessaire pour rsoudre le problme de la dfinition de la fonction
dentre puisque, nous lavons vu dans le chapitre consacr ltude de ltat de
lart, le dbit est directement li cette fonction. La fonction dentre donne la va-
riation de la concentration dentre au cours du temps or la rgion observe nest
pas directement alimente en traceur par une artre o la prise dchantillons
sanguins est ralisable. La concentration entrant dans cette rgion est donc diff-
rente de celle mesure en amont pourtant prise comme rfrence dans les modles
compartimentaux. Cependant, ce rseau tant de diamtre plus grand que celui
du rseau maill, la contribution de la diffusion reste faible devant le transport
convectif et la concentration volue peu. Par contre, la variation des temps de
transit dune rgion lautre ne peut pas tre nglige puisque, lors du transport
dans le rseau arborescent, si lon peut ngliger lvolution de la concentration,
on ne peut pas ngliger le dphasage de la fonction dentre.
42
3.2.2 Lintrt du changement dchelle

Dans le cadre de notre tude, lobjectif est de quantifier le dbit sanguin
crbral partir de mesures spatio-temporelles de la concentration dun traceur
par TEP. Pour cela, la possession dun modle cintique est ncessaire.
Comme la rsolution spatiale des tomographes est relativement faible et ne
donne pas accs aux htrognits de lchelle microscopique, les mesures de
concentration effectues par TEP correspondent aux valeurs des concentrations
microscopiques moyennes spatialement sur un voxel. Or, la mthode de change-
ment dchelle employe ici utilise un oprateur de prise de moyenne volumique
pour attribuer chaque maille une concentration calcule partir des concentra-
tions microscopiques. De plus, la cintique de rpartition du traceur obit aux
lois de transport, la simulation du champ de concentration sur tout le domaine
partir des quations de transport et des proprits microscopiques peut donc ap-
paratre comme la solution idale pour obtenir un modle cintique. Cependant,
nous lavons voqu dans lintroduction de ce chapitre, une telle simulation nest
pas ralisable un cot raisonnable et ncessite la description complte de la go-
mtrie du rseau vasculaire crbral de chaque patient. En revanche, le couplage
dune approche de type rseau et du changement dchelle permettant de rem-
placer lensemble rseau maill plus tissu permet daboutir la dfinition dun
modle cintique valide lchelle macroscopique un cot raisonnable. Ainsi,
lintrt de la mthode du changement dchelle est double puisquelle permet,
dune part la dtermination dquations de transport valides lchelle de Darcy,
et dautre part, de minimiser le temps de calcul ncessaire la dtermination du
champ de concentration lchelle de Darcy.
3.2.3 Outils ncessaires la prise de moyenne

Diverses mthodes de changement dchelle sont disponibles. On peut distin-
guer les mthodes dhomognisation asymptotiques (Bensoussan et al., 1978.;
Sanchez-Palencia, 1982.), des mthodes stochastiques (Dagan, 1989.) et des m-
thodes bases sur les moyennes spatiales (Marle, 1982.; Whitaker, 1999.). Le
problme qui nous occupe dans ce travail est typiquement un problme de trans-
port dans un systme double milieu. Ceci a fait lobjet de nombreux travaux et
diverses approches sont possibles, comme indiqu dans une review publie r-
cemment (Debenest & Quintard, 2008.). Compte tenu des chelles mises en jeu,
lapproche utilisant un modle deux quations semble la plus attractive. Celle-ci
a fait galement lobjet de nombreux travaux. En particulier, un modle deux
quations gnralis construit partir dune mthode de prise de moyenne volu-
mique a t dvelopp (Quintard & Whitaker, 1996.; Ahmadi et al., 1998.). Cest
ce modle que nous tendrons au cas de notre tude.
Cest pourquoi, les outils prsents ici utiliseront la notation classiquement
utilise pour ltude des milieux poreux. Les indices et dsigneront, respecti-
43
vement, lappartenance de la variable indice la phase liquide (sang) contenue

dans le rseau de pores et la matrice (tissu) alors que lindice reprsente indif-
fremment lappartenance lune ou lautre des deux phases. Les concentrations
seront notes C, les coefficients de diffusion D, les vitesses V et les volumes .
3.2.3.1 Moyennes volumiques

Le volume total est la somme du volume du capillaire et du volume de tissu :
= + (3.1)
La moyenne superficielle dune grandeur dfinie dans lune des deux phases, cor-
respond la moyenne de cette grandeur effectue sur le volume total :
1
Z
h i = d (3.2)

et sa moyenne intrinsque est la moyenne effectue sur le volume de la phase dans
laquelle cette grandeur est dfinie :
1
Z
h i = d (3.3)

Ces deux moyennes sont relies par la fraction volumique de suivant la rela-
tion :
h i = h i (3.4)
avec

= (3.5)

Notons, quen particulier, la moyenne superficielle dun terme constant est gale
au produit de cette constante et de la fraction volumique de la phase pour laquelle
ce terme est dfini.
3.2.3.2 Thormes
Les thormes 3.6 et 3.7 permettent dexprimer la moyenne dun gradient
ou dune divergence en fonction du gradient ou de la divergence de la moyenne
auxquels sont ajoute une intgrale de frontire (Whitaker, 1999.).
1
Z
h i = h i + n dA (3.6)
A
1
Z
h i = h i + n dA (3.7)
A
Ici, A reprsente la surface de linterface entre les deux phases, solide et liquide
contenues dans le volume moyenn. Il est noter, que dans la dfinition de ces
deux thormes, loprateur nabla de part et dautre de lgalit ne sapplique pas
la mme chelle, les variables et h i tant dfinies deux chelles distinctes.
En effet, dans les expressions h i et h i loprateur nabla sapplique
lchelle microscopique tandis que dans les expressions h i et h i ils
sappliquent lchelle de Darcy.
44
3.2.4 Principe du changement dchelle
Les outils utiliss par cette mthode tant dsormais dfinis, nous allons en
expliquer le principe. La mthode de prise de moyenne volumique (Quintard &
Whitaker, 1996.; Ahmadi et al., 1998.; Whitaker, 1999.; Golfier, 2001.; Golfier
et al., 2002.; Cherblanc et al., 2003.; Kfoury, 2004.; Cherblanc et al., 2007.; De-
benest & Quintard, 2008.) est base sur la dfinition dun oprateur de prise de
moyenne volumique appliqu aux quations de transport une chelle donne
(dans notre cas lchelle microscopique). Lapplication de cet oprateur permet
dobtenir des quations de transport valides lchelle suprieure. En effet, la
prise de moyenne permet la rcriture de ces quations en fonction des moyennes
des variables microscopiques (en particulier la concentration) ainsi que de nou-
veaux paramtres. Ces nouveaux paramtres sont appels coefficient effectifs et
correspondent aux proprits physiques (coefficient de diffusion, vitesse de lcou-
lement) du milieu homognis. Le processus permettant daboutir la rcriture
des quations ainsi qu la dfinition des coefficients effectifs commence par la d-
composition de chaque grandeur microscopique (la concentration ou la vitesse)
en la somme dune valeur moyenne et dune dviation spatiale comme lillustre
la figure 3.2.

= h i + (3.8)
Ici, reprsente indiffremment la concentration ou la vitesse. Cette moyenne

est value sur un VER dfini suffisamment grand pour lisser les htrognits
microscopiques mais suffisamment petit pour conserver lchelle macroscopique
un sens local. Ainsi, la longueur caractristique propre une chelle donne est
trs petite devant la longueur caractristique lchelle suprieure. Une fois les
quations rcrites en tenant compte de cette dcomposition, une analyse dimen-
sionnelle des quations permet dcrire les dviations spatiales en fonction des
termes moyens pondrs par des coefficients nomms variables de fermeture puis-
quils permettent de fermer les quations moyennes en remplaant les dvia-
tions par ces expressions. Ces fonctions permettant de relier les dviations et les
moyennes font intervenir des grandeurs scalaires, vectorielles, etc..., qui obissent
des problmes de fermeture ralisant une approximation acceptable des pro-
blmes pour les dviations. Ces problmes de fermeture sont obtenus par identifi-
cation des groupes faisant intervenir les termes moyens et leurs drives dans les
quations de transport crites suivant les deux dcompositions. La dcomposition
des variables microscopiques, la rcriture des quations puis la rsolution des pro-
blmes de fermeture permettent dobtenir les quations de transport uniquement
en fonction des moyennes intrinsques pondres par les coefficients effectifs du
milieu homognis. Le changement dchelle permet donc ici dobtenir des qua-
tions qui dcrivent le comportement du milieu homognis lchelle de Darcy
mettant en oeuvre les moyennes intrinsques ainsi que les proprits effectives du
milieu.
45
Fig. 3.2 Le changement dchelle permet de dcomposer une variable en une

valeur moyenne hi plus une dviation spatiale . Remarque : lchelle du cadre
reprsentant la dviation spatiale est 10 fois suprieure lchelle des deux autres
cadres et on remarque que la dviation spatiale est nulle en moyenne.
3.3 Elaboration du modle cintique

Dans ce chapitre, nous allons mettre en oeuvre la technique de prise de
moyenne volumique dans le cas de la gomtrie du cylindre de Krogh. Lintrt
Fig. 3.3 Dfinition de la gomtrie : reprsentation 2D axisymtrique du capil-

laire et de son enveloppe de tissu.
dutiliser cette gomtrie dans un premier temps, alors quelle nest vraisemblable-
ment pas adapte pour dcrire un volume lmentaire reprsentatif de lensemble
46
Elaboration du modle cintique
capillaires+tissu dans le cerveau, rside dans le fait que cette gomtrie extr-
mement simple permet de vrifier le comportement de notre modle. En effet,
la rsolution des problmes de fermeture pour cette gomtrie peut se faire, en
partie, de manire analytique et donc permet de valider le code numrique. De
plus, tous les modles compartimentaux sont bass sur cette gomtrie. Le dbit
obtenu par le modle utilisant la prise de moyenne volumique (modle homo-
gnis) est donc directement comparable celui obtenu par les modles de la
littrature. Dans la suite de ce chapitre, la mise en quations et leurs transforma-
tions successives pour les rendre valides lchelle de Darcy seront dveloppes.
3.3.1 Equations et conditions limites lchelle locale

Pour dfinir les quations lchelle locale, nous utilisons les quations et
conditions aux limites couramment utilises en mcanique des fluides et, notre
intrt se portant sur la concentration dun traceur radioactif (H2 O15 ), nous te-
nons compte, en outre, de la dcroissance radioactive. Pour cela, un terme puits
faisant intervenir la constante radioactive1 est ajout dans les quations de
transport.
3.3.1.1 Equations de continuit

Pour lcriture du modle, nous considrons que le fluide (ici le sang) est in-
compressible et newtonien, lquation de continuit se rsume alors lexpression
suivante :
V=0 (3.9)
3.3.1.2 Equations de conservation de la masse

Les quations de conservation de la masse permettent dobtenir une descrip-
tion de lvolution de la concentration en traceur radioactif dans chacune des
deux phases.
C
+ V C = (D C ) C (3.10)
t
C
= (D C ) C (3.11)
t
3.3.1.3 Equations du champ de vitesse

Pour crire lquation du champ de vitesse nous utilisons les hypothses sui-
vantes : la pression ne dpend que de la coordonne longitudinale (z sur la figure
1
La constante radioactive ou constante de proportionnalit possde la dimension de linverse
dun temps. Elle relie le nombre total de dsintgration dN pendant un petit intervalle de temps
dt linstant t au nombre N de radionuclides prsents : dN = N dt. Dans ce document,
nous avons exprim la quantit de traceur sous la forme dune concentration donnant la relation
suivante : dC = Cdt
47
3.3) et la vitesse ne dpend que du rayon courant (r sur la figure 3.3). Lcoule-
ment est permanent et le fluide newtonien. La ralisation dun bilan de quantit
de mouvement sur un volume lmentaire de fluide pour dterminer la rpartition
des vitesses dans le capillaire permet daboutir la loi de Poiseuille :
V = Vz ez
!
r2
Vz = Vmax 1 2 (3.12)
r0
3.3.1.4 Conditions aux limites
A linterface entre la phase liquide et la phase tissu r = r0 (arte 4 sur la

figure 3.3), on impose un saut de concentration li aux diffrences daffinit du
traceur pour les deux phases :
C = d C (3.13)
avec d le coefficient de partition. Dans la suite, ce coefficient sera pris gal 1.

Par ailleurs, la condition sur linterface lie au bilan de masse (3.10 et3.11)
scrit :
n D C = n D C (3.14)
A lentre du capillaire (z = z0 = 0, arte 2 sur la figure 3.3) la concentration est

impose :
C (t) = Ca (t) (3.15)
A la sortie du capillaire (z = L, arte 3 sur la figure 3.3) on considre une

condition de sortie convective, i.e :

C
=0 (3.16)
z z=L
dans lexpression du flux total.
3.3.2 Ecriture des quations en fonction des grandeurs

moyennes
Dans cette section, nous allons utiliser loprateur de prise de moyenne sur
les quations prsentes dans la section prcdente. Les thormes 3.6 et 3.7 sont
dfinis partir des moyennes superficielles. La finalit du changement dchelle
est dobtenir une quation lchelle de Darcy pour chacune des deux phases fai-
sant intervenir les moyennes intrinsques. Par consquent, bien que les thormes
conduisent lutilisation de moyennes superficielles, pour chaque quation, cest
la forme intrinsque qui sera donne.
48
3.3.2.1 Prise de moyenne pour lquation de continuit

Pour lquation de continuit, lapplication du thorme (3.7) la divergence
de la vitesse conduit :
1
Z
h Vi = hVi + n V dA = 0 (3.17)
A
Etant donn que lcoulement est uniquement longitudinal (Poiseuille), lintgrale

sur linterface du produit scalaire de la normale la surface avec la vitesse est nulle
et la moyenne superficielle de lquation de continuit sexprime de la manire
suivante :
hVi = hVi = 0 (3.18)
3.3.2.2 Prise de moyenne pour lquation de conservation de la masse

La moyenne superficielle de lquation 3.10 scrit :
1 C 1
Z Z
d + V C d
t
| {z } | {z }
accumulation convection
1 1
Z Z
= (D C ) d C d (3.19)

| {z } | {z }
dif f usion decroissance
Les termes de convection et de diffusion font intervenir des gradients. Par cons-
quent leur criture en terme de moyennes superficielles ncessite lutilisation du
thorme 3.6.
Application du thorme 3.6 au terme diffusif :

Appliqu D C , ce thorme donne :
1 1
Z Z
(D C ) d = hD C i + n (D C ) dA (3.20)
V | {z } A
Groupe 1 | {z }
Groupe 2
En faisant lhypothse que la variation du coefficient de diffusion microscopique

peut tre nglige lchelle du VER, le coefficient de diffusion peut tre sorti de
lintgrale ce qui donne pour le Groupe 1 la relation suivante :
" !#
1
Z
hD C i = D hC i + n C dA (3.21)
A
Dans cette relation, le dernier terme permet la reconnection la phase (tissu)

et nest pas nul.
Le terme diffusif est dsormais partiellement crit sous forme de moyenne,

cependant il reste dans son expression la concentration ponctuelle C . Cette
49
concentration ponctuelle est dcompose en la somme dun terme de moyenne

intrinsque et dune dviation spatiale (Ch.3.2.4, page 45).
C = hC i + C (3.22)
La prise en compte de cette dcomposition dans lexpression du Groupe 1

conduit :
h i
hD C i = D hC i + hC i
" !#
1
Z

+ D n hC i dA (3.23)
A
" !#
1
Z
+ D n C dA
A
Ici, les termes 2 et 3 du second membre de lquation 3.23 sannulent. Cette

quation se simplifie et le Groupe 1 devient :
" !#
1
Z

hD C i = D hC i + n C dA (3.24)
A
Dans le Groupe 2, la prise en compte de la dcomposition conduit lexpression

suivante :
1 1
Z Z
n (D C ) dA = n D hC i dA
A A
1
Z
+ n D C dA (3.25)
A
Dans lquation 3.25, le terme faisant intervenir lintgrale sur linterface de la

moyenne intrinsque de la concentration correspond une forme non locale en
terme de moyenne intrinsque puisque cette quantit est value linterface
la place du centre du VER. Si la contrainte sur la longueur caractristique des
diffrentes chelles du modle est valide, cest dire que la longueur caract-
ristique de chaque chelle est trs petite devant la longueur caractristique de
lchelle suprieure, alors la moyenne intrinsque peut tre sortie de lintgrale
(Quintard & Whitaker, 1994.b; Whitaker, 1999.). Lutilisation du thorme 3.6
et lhypothse dune bonne sparation des chelles, permettent alors de faire sor-
tir RD hC i de lintgrale, de reconnatre le gradient de la fraction volumique
( 1 A n dA = = 0) et finalement de rduire lexpression du Groupe 2
:
1 1
Z Z
n D C dA = n D C dA (3.26)
A A
Application du thorme 3.6 au terme de convection :

Appliqu VC , ce thorme donne :
1 1
Z Z
(VC ) d = hVC i + n VC dA (3.27)
A
50
De mme que prcdemment, lintgrale sur linterface est nulle (flux convectif
total nul car paroi impermable) et le terme de convection peut donc tre ramen
:
1
Z
(VC ) d = . hVC i (3.28)

Lutilisation de la dcomposition pour la concentration ponctuelle ainsi que pour

la vitesse (V = hVi + V) permet daboutir, en suivant le mme processus que
pour le terme diffusif, lexpression suivante du terme de convection :
D E
hVC i = hVi hC i + V
hC i + hVi C + V
C
D E
= hVi hC i + V
C (3.29)
La simplification permettant le passage de la premire ligne la seconde ligne dans

lquation prcdente est fonde sur les travaux de Whitaker (1999.) qui suggrent
que le premier et le dernier terme sont prpondrants. Les autres termes faisant
intervenir le produit dune moyenne et dune dviation (la moyenne de cette
dernire tant nulle dans lapproximation usuelle lie lhypothse de sparation
des chelles).
Rsultat du processus de prise de moyenne sur lquation de conserva-

tion de la masse :
Dsormais, toutes les composantes de lquation de conservation de la masse
ont t rcrites de sorte quelles sexpriment uniquement en fonction de termes
moyens et de dviations spatiales :
hC i
+ hVi hC i =
| t
{z } | {z }
convection
accumulation
" !#
1
Z

D hC i + n C dA
A
| {z }
dif f usion
C 1
E D Z
V n D C dA
| {z } A
dispersion
| {z }
f lux interf acial
hC i (3.30)
| {z }
decroissance
Notons que pour aboutir cette criture, la fraction volumique est suppose
constante sur le VER, permettant de la mettre en facteur (en particulier dans le
terme de convection).
Un processus analogue permet daboutir lquation de conservation de la masse
51
pour la phase :
hC i
" !#
1
Z

= D hC i + n C dA
| {zt } |

{z
A
}
accumulation
dif f usion
1
Z
n D C dA
A
| {z }
f lux interf acial
hC i (3.31)
| {z }
decroissance
La prsence de la moyenne intrinsque de la vitesse dans le terme convectif n-

cessite ltude de lquation de la quantit de mouvement.
3.3.2.3 Prise de moyenne pour le champ de vitesse

A partir de la loi de Poiseuille et des dfinitions des moyennes intrinsques, il
est possible de dterminer V, V, hVi :
!
r2
V = Vz ez = Vmax 1 2 ez (3.32)
r0
1
Z

hVi = Vz ez dV

!
1 r0 2 L r2
Z Z Z

hVi = Vmax 1 2 rdr d dz ez
0 0 0 r0
Vmax
hVi = ez (3.33)
2
!
= V hVi = Vmax 1 r2
V ez (3.34)
2 r02
3.3.3 Choix du modle pour le changement dchelle

La rcriture des quations sous la forme de moyennes spatiales et de fluctua-
tion est acheve. Cependant, afin de poursuivre le processus de prise de moyenne
sur les quations microscopiques, il faut prsent dterminer le modle qui sera
retenu pour le changement dchelle (Quintard & Whitaker, 1995., 2000.). Si on
considre les changes de concentration lchelle microscopique, plusieurs cas
peuvent tre dgags.
La figure 3.4 reprsente les diffrents cas existants ainsi que le modle associ
chacun deux. Ces diffrents modles peuvent scrire laide dune ou de deux
quations. Dans le cas des modles une quation, le modle dcrit lvolution
52
Fig. 3.4 Les diffrents modles pour le changement dchelle.
dune unique concentration moyenne dfinie sur le volume total tandis que le
modle deux quations conserve linformation pour chacune des deux phases en
utilisant les moyennes de la concentration de chaque phase.
Parmi les modles une quation, les cas utilisant lhypothse dun gradient
nul de concentration dans la phase fluide ou dans la phase tissu ne peuvent sap-
pliquer notre problme. En outre, le modle une quation asymptotique en
temps nest pas non plus un bon candidat, puisque lon sintresse aux change-
ments rapides de la concentration alors que ce modle dcrit lvolution de la
concentration aux temps longs. Il reste donc le modle une quation correspon-
dant au cas dquilibre local et le modle le plus gnral deux quations.
On parle dquilibre local lorsque hC i = d hC i Les simulations num-
riques de notre problme nindiquent pas une tendance lquilibre local. Cest
pourquoi nous avons opt pour le modle deux quations.
Cependant, ce stade, les deux quations contiennent toujours des termes de
fluctuation. Elles ne sont donc pas utilisables en ltat pour caractriser lvolution
des concentrations lchelle de Darcy. Pour cela, il faut faire disparatre les
termes de fluctuation ce qui est trait dans le paragraphe concernant la fermeture
du problme.
3.3.4 Fermeture du problme

Afin de faire disparatre les termes de fluctuation, nous devons les exprimer
en fonction des moyennes intrinsques. Pour cela, il est ncessaire dobtenir les
quations diffrentielles rgissant C et C . Ces quations sont obtenues partir
des quations microscopiques pour chaque phase, rcrites en introduisant les d-
viations dfinies par lquation 3.8 et simplifies laide des quations moyennes.
53
Plus prcisment, pour la phase , cette quation peut tre obtenue partir de
lquation 3.10 rgissant la concentration ponctuelle (microscopique) ainsi que de
lquation 3.30 rgissant hC i divise par rcrite ci-dessous.
hC i
+ hVi hC i =
t
| {z } | {z }
convection
accumulation
!
D
Z

D hC i + 1
n C dA
A
| {z }
dif f usion
1 Z
D E
1
VC + n D C dA
| {z } A
dispersion
| {z }
f lux interf acial
hC i (3.35)
| {z }
Decroissance
En soustrayant (3.35) (3.10), on obtient lquation diffrentielle gouvernant C :
C hC i =
+ V C + V
t !
D
Z
D C 1
n C dA
A
D E 1

Z
+1
VC n D C dA
A
C (3.36)
On peut simplifier ce rsultat en utilisant les restrictions suivantes :

!
D
Z
D C >> 1
n C dA (3.37)
A
D E
hC i >> 1 V
V C + V C (3.38)

Ces deux restrictions sont satisfaites lorsque la longueur caractristique de la

phase est trs petite devant la longueur caractristique du milieu lchelle de
Darcy (Whitaker, 1999.; Quintard & Whitaker, 2000.).
Ce qui donne :
C hC i =
+ V C + V
t
1

Z
D C n D C dA
A
C (3.39)
54
De la mme manire pour la phase , on obtient :

C 1
Z
= D C n D C dA C (3.40)
t A
Comme pour les quations, il est ncessaire dcrire les conditions aux limites
en termes de dviation.
A linterface A (cas d = 1) :

C = C C = C hC i hC i (3.41)
n D C = +n D C
n D hC i
+n D hC i (3.42)
Pour simplifier la fermeture, le problme est envisag comme stationnaire.

Cette simplification implique lhypothse que le temps caractristique de relaxa-
tion des dviations spatiales (chelle microscopique) est trs petit devant celui de
relaxation des moyennes intrinsques de concentration (chelle de Darcy). Cela
nous donne le systme suivant :
Phase :

hC i = D C C
V C + V (3.43)
| {z }
source
1

Z
n D C dA
A
Phase :
1
Z

D C C n D C dA = 0 (3.44)
A
Conditions aux limites :

C = C C = C hC i hC i (3.45)
n D C = +n D C
n D hC i (3.46)
| {z }
source
+ n D hC i
| {z }
source
55
Selon Quintard & Whitaker (1993.), les dviations spatiales des concentrations
peuvent tre exprimes en fonction des 3 sources de ce systme, soit sous la forme :

C = b hC i + b hC i s hC i hC i (3.47)

C = b hC i + b hC i + s hC i hC i (3.48)
o les nouvelles variables b , b , s , b , b , s sont les variables de fermeture.

Ces variables sont indpendantes du temps mais dpendent de lespace.
En remplaant les dviations spatiales des concentrations par leur expressions

dfinies aux quations 3.47 et 3.48 dans les quations 3.43 et 3.44, on obtient
respectivement :
pour la phase ,
h i
V b hC i + V [b hC i ]
h i
V s hC i hC i hC i
+V
h i
=

D b hC i + (D [b hC i ])
h i
D s hC i hC i
1
Z h i

n D b hC i dA
A
1
Z

n D [b hC i ] dA
A
1
Z h i
+
n D s hC i hC i dA
A

b hC i b hC i + s hC i hC i (3.49)
et pour la phase ,
h i
D b hC i + (D [b hC i ])
h i
D s hC i hC i
Z
1 h i
n D b hC i dA
A
Z
1

n D [b hC i ] dA
A
Z
1
h i
+
n D s hC i hC i dA
A

b hC i b hC i + s hC i hC i = 0 (3.50)
56
Lidentification dans les deux quations prcdentes des termes associs hC i ,

hC i et hC i hC i permet dcrire trois problmes de fermeture ncessaires
la rsolution des variables de fermeture. Les conditions aux limites sont obtenues
de la mme manire.
3.3.5 Problmes de fermeture

Parce que le modle choisi pour le changement dchelle est un modle deux
quations, chacun des problmes de fermeture est compos de deux quations
diffrentielles du second ordre, et de quatre conditions aux limites. Ces problmes
de fermeture sont obtenus partir des quations 3.49 et 3.50, dans lesquelles pour
chaque problme, sontidentifies les relations
factorisables par les termes sources
( hC i , hC i et hC i hC i ). Lors de lidentification de ces relations,
nous avons en premire approximation nglig la contribution de s et de s
pour les problmes de fermeture I et II. Cette simplification permet dobtenir
trois problmes de fermeture indpendants (non coupls) et donc den simplifier
la rsolution. Ainsi, certaines variables de fermeture peuvent tre values de
manire analytique et la bonne implmentation de la rsolution numrique du
systme a pu tre vrifie. Cependant, labsence de couplage entre les problmes
de fermeture diminue la capacit du modle homognis dterminer le dbit
lorsque celui-ci est faible. Notamment dans les cas avec une gomtrie simple
comme cela a t montr par Golfier et al. (2002.). Cest pourquoi, dans la suite
de ce document le modle propos sera formul en prenant en compte ce couplage.
3.3.5.1 Problme I associ hC i :

On pose :
1
Z
c = n D b dA (3.51)
A
Pour la phase :
s V = D 2 b 1 c b 2D s
V b + V
1

Z
+ n D s dA. (3.52)
A
Pour la phase :
0 = D 2 b + 1
c b + 2D s
1
Z

n D s dA (3.53)
A
Conditions aux limites ( linterface) :
b = b (3.54)
57
n D s + n D b = n D b n D s n D
(3.55)
hb i = 0 (3.56)
hb i = 0 (3.57)
Ici, nous utilisons lhypothse selon laquelle la moyenne de la dviation spatiale
est nulle. Cette hypothse est ncessaire la dtermination de la valeur de lin-
tgrale de surface prsente dans les quations 3.52 et 3.53. Lvaluation de cette
intgrale est dcrite par Quintard & Whitaker (1993.).
Une condition de priodicit portant sur la dviation spatiale de la concentra-

tion est galement impose. Ainsi, le problme de fermeture nest rsolu quune
fois sur un volume lmentaire reprsentatif, qui pourra tre envisag ensuite
comme la cellule unitaire dun modle spatialement priodique dun milieu po-
reux.
3.3.5.2 Problme II associ hC i :

On pose :
1
Z
c = (n D b ) dA (3.58)
A
Pour la phase :
V b + s V = D 2 b 1
c b + 2D s
1

Z
n D s dA (3.59)
A
Pour la phase :
0 = D 2 b + 1
c b 2D s
1
Z

+ n D s dA (3.60)
A
b = b (3.61)
n D s + n D b = n D b + n D s n D
(3.62)
hb i = hb i = 0 (3.63)
hb i = 0 (3.64)
58

3.3.5.3 Problme III associ hC i hC i :
On pose :
1
Z
av h = (n D s ) dA (3.65)
A
Pour la phase :
V s = D 2 s 1
av h s (3.66)
Pour la phase :
0 = D 2 s + 1
av h s (3.67)
s = s + 1 (3.68)
n D s = n D s (3.69)
hs i = 0 (3.70)
hs i = 0 (3.71)
3.3.6 Equations lchelle de Darcy

Pour obtenir les quations rgissant les moyennes intrinsques des concentra-
tions valides lchelle de Darcy, on remplace dans les quations 3.30 et 3.31 les
dviations par leurs expressions (Eq. 3.47 et Eq. 3.48) o, dsormais, grce la
rsolution des problmes de fermeture, les variables de fermeture sont connues.
On obtient alors pour la phase :
hC i
+ hVi . hC i u hC i u hC i
t
= K hC i + K hC i

av h hC i hC i hC i (3.72)
59
avec :
1
Z D E
u = n D b dA + V s (3.73)
A
D
Z
n s dA
A
1
Z D E
u = n D b dA V s (3.74)
A
D
Z
+ n s dA
A
D
Z D E
K = D I + n b dA V b (3.75)
A
D
Z D E
K = n b dA V b (3.76)
A
1
Z
av h = n D s dA (3.77)
A
Et de mme pour la phase :

hC i
u hC i u hC i
t
= K hC i + K hC i

avec :
1 D
Z Z
u = n D b dA n s dA (3.79)
A A
1 D
Z Z
u = n D b dA + n s dA (3.80)
A A
D
Z
K = n b dA (3.81)
A
D
Z
K = D I + n b dA (3.82)
A
1
Z
av h = n D s dA (3.83)
A
Les coefficients effectifs K et K sont les tenseurs effectifs de diffusion. Ils

tiennent compte de la diffusion mais galement dune partie de la convection
(dviation spatiale) de lchelle microscopique. Le premier est le tenseur dominant
et le second traduit le couplage entre les deux phases. Les coefficients effectifs u
et u , associs aux termes de transport convectif, sont les vitesses effectives. Le
60
Conclusion
coefficient av h caractrise lchange entre les deux phases. De la mme manire, les
coefficients effectifs de lquation pour la phase sont les tenseurs reprsentatifs
du transport diffusif (K pour le couplage et K le tenseur dominant) et les
vitesses effectives (u et u ).
3.4 Conclusion
Dans ce chapitre, lensemble de la mthode permettant dobtenir les qua-
tions rgissant lvolution des concentrations lchelle de Darcy (concentrations
moyennes) a t prsent. Cependant, notre objectif est de proposer un modle
cintique permettant dvaluer le dbit. Or, pour linstant, le dbit napparat pas
comme paramtre des quations. Le chapitre suivant dtaille donc une mthode
didentification du dbit toujours dans le cas simplifi de la gomtrie du cylindre
de Krogh, partir du modle homognis et on y compare les rsultats obtenus
avec les rsultats des modles compartimentaux.
61
62
Identification du dbit
Sommaire
4
4.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2 Cintique de rfrence . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2.1 Ordres de grandeurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.2.2 Etude exprimentale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
4.2.2.1 Dveloppement dun modle original . . . . . 65
4.2.2.2 Technique de mesure . . . . . . . . . . . . . 68
4.2.2.3 Dispositif exprimental et matriel . . . . . . 70
4.2.2.4 Champs de concentration et fonction dentre 75
4.2.3 Etude numrique pour le cylindre de Krogh . . . . . . 81
4.2.3.1 Dfinition du modle . . . . . . . . . . . . . 81
4.2.3.2 Champs et cintiques de concentration . . . 82
4.3 Mthode dvaluation du dbit . . . . . . . . . . . . . 84
4.3.1 Cas du modle de Renkin-Crone . . . . . . . . . . . . 84
4.3.1.1 Evaluation du coefficient de permabilit P . 85
4.3.1.2 Problme inverse pour lvaluation du dbit . 88
4.3.2 Cas du modle homognis . . . . . . . . . . . . . . . 89
4.3.2.1 Etude de la dpendance des paramtres effec-
tifs au dbit. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
4.3.2.2 Problme inverse pour lvaluation du dbit
avec le modle homognis . . . . . . . . . . 94
4.4 Comparaison des rsultats . . . . . . . . . . . . . . . . 94
4.4.1 Cintiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
4.4.2 Dbits identifis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
4.4.3 Rsultats des mesures exprimentales . . . . . . . . . 98
4.5 Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
63
4.1 Introduction
Dans ce chapitre, les modles cintiques prsents prcdemment sont utiliss
pour identifier le dbit sanguin. Ces modles, quil sagisse du modle compar-
timental de Renkin-Crone, la base de tous les modles compartimentaux ul-
trieurs, ou du modle homognis, relient la concentration en traceur dans le
cerveau la concentration dentre en simplifiant lextrme larchitecture du
rseau vasculaire crbral, pour en garder un unique composant lmentaire, le
cylindre de Krogh.
Cette gomtrie est, par nature, dfinie lchelle microscopique. Par cons-
quent, il est important, dans un premier temps, dvaluer la capacit de ces mo-
dles identifier le dbit, par inversion, lchelle laquelle ils ont t dfinis.
Or, la tomographie mission de positrons est, de par sa rsolution spatiale, une
technique qui mesure des concentrations moyennes, lchelle macroscopique. Il
faut donc utiliser dautres mthodes pour disposer de la concentration moyenne
lchelle microscopique.
Dans la suite de ce chapitre, nous prsenterons deux mthodes permettant
dobtenir la concentration lchelle microscopique (concentration de rfrence),
une mthode exprimentale puis une mthode numrique.
Nous prsenterons ensuite la mthode didentification du dbit partir des
deux modles, compartimental et homognis, avant de comparer les dbits va-
lus au dbit impos en entre dans le vaisseau.
4.2 Cintique de rfrence

4.2.1 Ordres de grandeurs
Pour obtenir une modlisation fine des phnomnes de transport reprsenta-
tive de ceux prsents dans le rseau de vaisseaux capillaires crbral, la nature
du rgime de lcoulement et limportance du transport convectif par rapport au
transport diffusif doivent tre comparables celles du rseau retenu (le cylindre
de Krogh).
Cest pourquoi, nous avons valu les nombres de Pclet1 et de Reynolds2
partir des donnes de la micro-circulation crbrale dont les ordres de grandeurs
1
Le nombre de Pclet permet la comparaison de limportance du transport convectif par
rapport au transport diffusif dune espce en solution. Deux nombres de Pclet sont dfinis
dans ce chapitre, le nombre de Pclet longitudinal (P el ) et le nombre de Pclet transversal
(radial) (P er ), suivant que lon compare le transport convectif au transport diffusif du traceur
ro2 V
paralllement ou perpendiculairement lcoulement. P el = LV D ou P er = DL , avec D le
coefficient de diffusion du traceur dans le sang et h la hauteur du canal.
2
Le nombre de Reynolds reprsente le rapport entre les forces dinertie et les forces vis-
queuses. Re = V L ou Re = VL , avec la masse volumique, V la vitesse moyenne, L la
longueur du canal, et les viscosits dynamique et cinmatique.
64
Cintique de rfrence
sont donns dans le tableau suivant (4.1).
Dfinitions Symboles Ordres de grandeurs Units

Viscosit cinmatique du sang 3.106 m2 /s
Distance extra-vasculaire X 20 m
Diamtre des vaisseaux Dmin 4 m
Dmax 9 m
Longueur moyenne des vaisseaux Lmoy 60 m
Coefficient de diffusion
de leau dans le sang D 2.103 mm2 /s
Dbit sanguin Qmin 0.1 nL/min
Qmax 1 nL/min
Nombre de Reynolds Re min 6.6 105
Re max 1.8 103
Nombre de Pclet P el min 1 1015
P el max 1 1014
P er min 9 1015
P er max 2.5 1013
Tab. 4.1 Ordres de grandeurs caractrisant la micro-circulation dans le rseau

capillaire crbral et nombres sans dimension associs.
4.2.2 Etude exprimentale

Pour obtenir la cintique de rfrence du champ de concentration dans la
gomtrie de Krogh, nous avons ralis un modle exprimental reproduisant
cette gomtrie et les diffrents modes de transport correspondants (convection-
diffusion dans le vaisseau et diffusion dans le tissu) en essayant de respecter au
mieux les dimensions des nombres de Pclet et de Reynolds de la micro-circulation
dans le rseau capillaire crbral.
Nous dtaillerons ci-dessous le dveloppement de ce modle, la technique de
mesure et le dispositif exprimental utilis pour, dune part, imposer un dbit
contrl et, dautre part, mesurer le champ de concentration.
4.2.2.1 Dveloppement dun modle original

La plupart des modles exprimentaux utiliss pour ltude des milieux poreux
sont constitus dune matrice impermable contenant le rseau de pores. Or, pour
le problme qui nous proccupe, la matrice doit modliser le tissu crbral, et
donc permettre la diffusion. Cest pourquoi, dans le but de reproduire les modes
de transport (et en particulier la diffusion) dune solution charge en traceur dans
65
la gomtrie de Krogh, nous avons dvelopp un modle exprimental original de

type double milieu en utilisant une matrice diffusive constitue de gel dalginate
dans laquelle un rseau de canaux modlise le rseau capillaire crbral.
Les alginates alcalins sont des polysaccharides obtenus partir dune famille
dalgues brunes : les laminaires. Ils forment dans leau des solutions collodales
visqueuses. Leur utilisation est rpandue dans lagro-alimentaire o lon sen sert
comme paississants, glifiants ou mulsifiants, mais ils sont galement prsents
dans de nombreux produits industriels (produits de beaut, peintures, encres ...).
Les gels que lon peut former avec lalginate sont translucides, thermostables et
inertes.
Dans notre cas, le gel formant la matrice est obtenu partir de Protanal
LF10/60 de marque FMCBiopolymer. Ce sel, dissout dans de leau distille, po-
lymrise par immersion dans une solution de chlorure de calcium (CaCl2 ) tandis
que sa dpolymrisation se fait par un apport de citrate de sodium. Le comporte-
ment diffusif du gel polymris est proche de celui de leau, puisque le coefficient
de diffusion de notre traceur (fluorescine, cf.4.2.2.3) dans le gel est de 51010
m2 /s alors quil est de 61010 m2 /s dans leau (Cabodi et al., 2005.). A titre
de comparaison, le coefficient de diffusion de leau dans le tissu crbral est de
0.75109 m2 /s (Thomas et al., 1999.).
Les proprits de ce gel en font un bon candidat pour notre tude, dautant
que son utilisation pour la fabrication de canaux de petite section (100 100 m)
a dj t effectue au Department of Chemical Engineering de lUniversit de
Cornell (USA) par lquipe du professeur A. D. Stroock. Nous avons donc adopt
le protocole mis au point (Cabodi et al., 2005.) la suite dune formation dune
semaine au sein de leur quipe.
Micro-canaux dans une matrice de gel dalginate.

La fabrication des micro-canaux utilise la technique de lithographie molle
(soft lithography) (McDonald et al., 2000.). Cette technique repose sur la fabrica-
tion de moules qui reproduisent, en ngatif, larchitecture dsire. Les moules que
nous utilisons ont t fabriqus au Laboratoire dAnalyse et dArchitecture des
Systmes (LAAS) ou lEcole Suprieure de Physique et de Chimie Industrielles
de la ville de Paris (ESPCI) selon le principe suivant : une rsine photosensible
(SU8) est dpose uniformment sur une galette de silicium puis un masque re-
produisant le ngatif du rseau y est superpos. Enfin, lensemble est soumis
un rayonnement UV, ce qui produit le durcissement de la rsine expose. Aprs
dissolution des parties protges du rayonnement par le masque, seule la structure
du rseau demeure (Fig.4.1.A.).
Dans la version classique de cette mthode, un polymre inorganique, le PDMS
(polydimthylsiloxane), mlang un durcisseur, est dpos sous forme liquide
dans le moule. Il est polymris en chauffant lensemble 60 o C pendant une
heure, puis dmoul (Fig.4.1.B.) Pour achever la fabrication des microcanaux en
PDMS, une couche lisse de PDMS obtenue par moulage sur une galette de sili-
66
Cintique de rfrence
cium lisse est utilise pour capoter la couche prcdemment obtenue (Fig.4.1.C.).
Le collage se fait par contact aprs un traitement plasma (Plasma cleaner, HAR-
RICK) des deux couches (Fig.4.1.C).
Fig. 4.1 Principe de la soft lithographie.
Dans notre cas, ce protocole nest pas adapt car le PDMS, qui dlimite les
canaux, ne permet pas la diffusion dun traceur en son sein. Cest pourquoi nous
avons fait le choix de remplacer ce matriau par un gel dalginate. Cependant,
il nest pas possible de transposer directement le protocole dcrit ci-dessus la
fabrication de micro-canaux en gel dalginate.
En effet, la polymrisation du gel dalginate est plus dlicate car lapport de
CaCl2 entrane une raction immdiate, transformant la solution dalginate en
gel solide. Cest pourquoi une membrane poreuse et une grille sont utilises pour
garantir un bon contrle de lpaisseur de la couche lors de lapport du chlorure
de calcium (Fig.4.2).
De plus, comme le gel dalginate polymris au contact de la rsine SU8 ne
se dmoule pas, le moulage du gel dalginate est effectu sur un moule en PDMS
labor suivant le protocole prsent prcdemment.
Enfin, le gel dalginate tant compos 96% deau, sa tenue mcanique est
assez faible. Cest pourquoi, les moules utiliss sont fabriqus de sorte que las-
semblage de la couche de gel grave et du capot puisse se faire avec un minimum
de manipulations (Fig.4.3 et dtails de lannexe A.1).
Cependant, malgr ces prcautions, la ralisation dexpriences compltes
dans la gomtrie du cylindre de Krogh, sest avre extrmement difficile, les
dimensions choisies (canal unique ou deux canaux parallles de section 100 100
m et de longueur denviron 1 centimtre) tant probablement trop ambitieuses
pour la ralisation en gel dalginate. Nous navons donc pas obtenu de mesures
satisfaisantes dans cette gomtrie, en particulier parce que nous navons pas
russi liminer les fuites entre les deux paisseurs de gel. Par contre, nous avons
utilis le dispositif exprimental dvelopp Cornell (les moules), comprenant 16
67
canaux parallles de section 100 100 m et de 9 mm de longueur, qui a per-

mis, avec succs, de raliser au sein de notre laboratoire des rseaux dans du gel
dalginate dans lesquels des exprimentations dcoulements contrls ont pu tre
obtenus. Cest pourquoi dans la suite, nous prsenterons cette dernire gomtrie
ainsi que les quelques rsultats exprimentaux obtenus en lutilisant. Il faut sou-
ligner ici lintrt gnral de la technique dveloppe car elle permet daborder
exprimentalement des problmes du type double milieu avec une connaissance
des champs de concentration internes, et ce de manire relativement simple et
efficace, par comparaison avec, par exemple, les scanners X.
4.2.2.2 Technique de mesure

Introduction.
La technique de mesure doit permettre lvaluation quantitative du champ de
concentration dans le modle exprimental.
Une tude bibliographique (Walker, 1987.; Didierjean et al., 1997.; Yavuz
et al., 1997.; Detwiler et al., 1999.; Zinn et al., 2004.) concernant les techniques
de mesure optique adaptes nos travaux nous a conduit adopter une mthode
utilisant les proprits dattnuation de la lumire plutt que celle mettant en
oeuvre la fluorescence du traceur. Ainsi, le matriel mis en oeuvre pour la dtec-
tion du traceur se rduit une camra CCD de grande sensibilit, dun clairage
et de filtres optiques adquats et utilise une solution colore moins contraignante
que le traceur radioactif utilis en TEP.
Mesure par attnuation de la lumire.

La mthode retenue consiste relier labsorption de la lumire aux proprits
du milieu quelle traverse en utilisant la loi de Beer-Lambert :
I() = I0 ()e lC (4.1)
I()
A = log = lC (4.2)
I0 ()
avec I0 () et I() les intensits de lumire monochromatique incidente et trans-
mise, le coefficient dabsorption, l la longueur du trajet optique, C la concen-
tration molaire de la solution, A labsorbance une longueur donde et

= (4.3)
2.303
le coefficient dextinction molaire.
Selon la littrature (Didierjean et al., 1997.; Detwiler et al., 1999.) et notre

propre vrification exprimentale, le niveau de gris Glvl enregistr par la camra
est proportionnel lintensit lumineuse :
Glvl = aI + b (4.4)
68
Cintique de rfrence
Fig. 4.2 Principe de fabrication du gel. a) PDMS avec le rseau en relief ; b) Ajout
dun lment pour crer un rservoir en volume au dessus du PDMS ; c) Remplissage
avec le gel dalginate non polymris ; d) Installation la surface dune membrane
poreuse (micropores) ; e) Mise en place dune grille pour empcher la dformation du
gel ; f) Ajout de CaCl2 : agent de polymrisation de lalginate ; g) Incubation (1h 20o
C), transport par diffusion de lagent de polymrisation ; h) On ritre lopration sur
un tampon vierge pour obtenir une couche de gel lisse ; i) La couche lisse est mise au
contact de la premire et vient capoter lensemble (collage).
Fig. 4.3 Support de fabrication du gel.
69
o b est loffset correspondant au signal enregistr par la camra dans le noir.

Une fois lvaluation de cet offset ralise, il est donc possible dvaluer, aprs
traitement des images, la transmittance ( II()
0 ()
) du milieu en retranchant loffset
toutes les images puis en les divisant toutes par la premire qui correspond ltat
initial o la concentration est nulle. A partir de la transmittance et connaissant
la gomtrie ainsi que le coefficient dabsorption du colorant, lutilisation de la loi
de Beer Lambert permet dobtenir le champ de concentration chaque instant.
Cependant, cette mthode nest valable que pour de faibles concentrations
en traceur, ou pour de faibles longueurs de trajet optique (lorsque ce dernier
devient trop important le phnomne de diffusion multiple rend invalide la loi de
Beer-Lambert).
En particulier lvolution linaire de labsorbance en fonction de la concen-
tration nest valide que lorsque le produit lC est suffisamment faible pour rester
dans un rgime de diffusion simple de la lumire, sans rfraction ni diffraction.
Par ailleurs, la mthode de Beer-Lambert permet de retrouver la concentra-
tion dune solution homogne lorsque le coefficient dextinction et la longueur
du trajet optique sont connus. Dans notre cas, la concentration dans le milieu
nest pas homogne, cependant, lapplication de cette mthode permet dobte-
nir la concentration moyenne. En effet, si lon considre un milieu compos de
n couches parallles homogne de concentration Ci et dpaisseur ei , et que lon
applique en srie la loi de Beer Lambert, alors on trouve que ce milieu a un
comportement quivalent une unique couche dpaisseur etot = n1 ei et de
P
concentration n1 eetot
P i
Ci , correspondant la concentration moyenne.
4.2.2.3 Dispositif exprimental et matriel

Dans cette sous-section, nous prsenterons le dispositif exprimental ainsi que
le matriel principal utilis. Le choix de ce dernier est important dans le cadre
dune quantification optique de la concentration car il peut introduire des erreurs
sur la mesure.
Dispositif exprimental.
Le dispositif exprimental labor au cours de ce travail permet, dune part, la
ralisation dun coulement dune solution dun traceur au sein dun double milieu
avec un dbit contrl et, dautre part, de filmer la cintique de la concentration
au sein de ce milieu. Ce double milieu, dj prsent, est le coeur du dispositif
exprimental, constitu dun rseau de canaux dans du gel dalginate (matrice
diffusive). Il permet de reproduire les modes de transport de la circulation cr-
brale. Autour de ce modle, un ensemble de matriel permet de contrler le dbit
et denregistrer lvolution de la cintique de concentration au cours du temps
(Fig.4.4).
70
Cintique de rfrence
Fig. 4.4 Dispositif exprimental : le modle exprimental permettant de reproduire

les modes de transport dun coulement capillaire crbral est aliment par deux pousse-
seringues. La vanne trois voies permet de choisir entre le traceur color ou une solution
de CaCl2 . Pour enregistrer la cintique de rpartition du traceur, le modle exprimen-
tal est film par une camra CCD. La lumire blanche mise par le panneau de DEL
est filtre par un filtre passe bande (de 21 nm centr autour de 482 nm ) situ juste
avant la camra.
71
Les pousse-seringues.
Ces derniers de marque HARVARD APPARATUS (PHD 2000) entranent les
solutions de fluorescine ou de CaCl2 dans le modle un dbit constant impos.
La gamme de dbit imposable stend du nanolitre par minute au millilitre par
minute. Associs une vanne trois voies et deux seringues, ils permettent de satu-
rer dans un premier temps le milieu par la solution de CaCl2 , puis, en modifiant
lalimentation au niveau de la vanne, denvoyer la concentration avec un signal
relativement propre, lobjectif tant dapprocher une forme de type Heaviside.
La fluorescine.
La fluorescine est actuellement lun des colorants le plus commun. Cest ga-
lement un fluorophore, qui met une radiation dune longueur donde de 514 nm
lorsquil est soumis une radiation proche de 490 nm, longueur donde qui cor-
respond son pic dabsorption. Cependant, en solution, sa forme ionique dpend
trs fortement du pH (Sjoback et al., 1995.), ce qui fait varier le coefficient dab-
sorption ainsi que la position du pic dabsorption. La gamme de concentrations
des solutions utilises pour les expriences varie de 0.015 0.05 mM . Elles sont
produites par dissolution puis dilution de sel de fluorescine (Sigma-Aldrich) dans
de leau distille. Nous navons pas pris de prcaution particulire concernant le
pH des solutions puisque, avant chaque utilisation, le coefficient dabsorption est
mesur laide dun spectrophotomtre.
Le spectrophotomtre.
Le spectrophotomtre de type Heios Gamma de marque ThermoSpectronic
nous permet de dterminer avec prcision le coefficient dabsorption. En effet, cet
appareil mesure directement labsorbance (Fig.4.5) de lchantillon en comparant
lintensit optique transmise par la cuve pleine de colorant celle transmise par la
cuve remplie du solvant (H2 O). Les cuves contenant la solution de colorant tant
de dimension calibre, le chemin optique est parfaitement matris et le coefficient
dabsorption se dduit directement de labsorbance en utilisant la loi de Beer-
Lambert. Deux types de cuves ont t utilises, des cuves standards en plastique
dont le trajet optique est de 1 cm, et des cuves en quartz dont le trajet optique
est de 1 mm. Ces dernires permettent de travailler avec des concentrations plus
importantes minimisant le risque derreur sur la concentration de lchantillon.
Le spectrophotomtre permet galement de vrifier le domaine de linarit
de la loi de Beer-Lambert en traant labsorbance obtenue pour la gamme de
concentration utilise la longueur du pic dabsorption (Fig.4.6).
Le panneau de Diodes Electro-Luminescentes (DEL).

La lumire blanche traversant le rseau provient dun panneau de DEL (Phl
72
Cintique de rfrence
Fig. 4.5 Trac de labsorbance en fonction de la longueur donde pour diffrentes

concentrations et une cuve dun centimtre. Pour cette srie, le pic dabsorption se situe
une longueur donde de 482 nm.
Fig. 4.6 Trac de labsorbance (courbe en trait fort) une longueur donde de 482 nm
en fonction de la concentration pour une cuve de 1 cm et trac de la rgression linaire
(courbe en trait fin). Remarque : on peut considrer que lvolution de la concentration
utilise est linaire jusqua 0.01 mM pour une cuve d1 cm de cot.
73
LEDW-BL-200x200 SQ -1R24) qui offre une bonne homognit spatiale et tem-

porelle et met une lumire que lon peut considrer comme parallle. Ce dernier
point a t vrifi en plaant le panneau diffrentes distances dun masque perc
dun orifice. La variation de lintensit lumineuse enregistre par la camra pour
les diffrentes positions sest rvle ngligeable devant le bruit de la camra ds
lors que la distance tait suprieure 30 cm. Le spectre de puissance du panneau
de DEL est prsent figure 4.7.
Fig. 4.7 La courbe reprsente la rponse en puissance du Panneau de DEL en

fonction de la longueur donde. La zone noire dmarque la puissance disponible aprs
le filtre.
Le filtre optique.
La source mettant de la lumire blanche, il est ncessaire dutiliser un filtre
centr sur le pic dabsorption pour viter toute rponse en fluorescence de la
solution. Le filtre utilis est de marque SEMROCK (FF01-482/21) ayant une
bande passante de 21 nm centre autour de 482 nm. Cette gamme de longueur
donde ne correspondant pas au pic de puissance du panneau de DEL, nous avons
choisi un filtre dont la transmission est leve (95%) dans cette bande (Fig : 4.8).
Ainsi, il reste en sortie du filtre environ 10% de la puissance lumineuse initialement
mise par le panneau de DEL, ce qui est suffisant compte tenu des caractristiques
optiques de la camra.
La camra CCD.
La camra (Sensicam, PCO) utilise lors des expriences est dote dune grande
sensibilit et encode le signal lumineux sur 12 bits (4096 niveaux de gris). La
rponse du capteur CCD est linaire, et son niveau de bruit dans le noir est faible
74
Cintique de rfrence
Fig. 4.8 Transmission du filtre en fonction de la longueur donde.
(en moyenne 6 niveaux de gris). Pour tester la linarit de la rponse de la camra,

6 tubes capillaires identiques de section circulaire et de 1 mm de diamtre intrieur
ont t films. Ces tubes remplis dune solution de concentration stalant sur une
gamme de 0.005 mM 0.035 mM ont t disposs de trois manires diffrentes
afin de sassurer de la constance de la rponse par rapport la position des
tubes dans le champ de vue. Les courbes prsentant lvolution de labsorbance
en fonction de la concentration pour les trois mesures sont prsentes sur la figure
4.9. Lvolution linaire et la superposition parfaite des trois courbes en fonction
de la concentration montrent clairement la linarit de la rponse de la camra
et sa constance spatiale.
4.2.2.4 Champs de concentration et fonction dentre

Champs de concentration.
La mesure des champs de concentration se fait partir des champs dabsorbance
obtenus aprs traitement des images brutes. Ce traitement consiste, pour la srie
dimages acquises lors dune exprience de remplissage, diviser toutes les images
par la premire image de la srie. En effet, sur la premire image dune srie de
remplissage, il ny a pas encore de colorant dans le milieu, et labsorption lie la
concentration en traceur est nulle. Limage initiale peut donc servir de rfrence
pour calculer labsorbance A . A partir des relations 4.2 et 4.4, chaque pixel
de limage en cours de traitement est associe la valeur de labsorbance (A pix )
calcule en fonction du rapport du niveau de gris du pixel de limage de rfrence
(Glvl (1)) et de celui de limage en cours de traitement (Glvl (n)) suivant la relation :
Glvl (n) b

A pix = log (4.5)
Glvl (1) b
75
Fig. 4.9 Evolution de labsorbance mesure par la camra CCD en fonction de la

concentration pour 3 sries de mesures (trajet optique : 1 mm).
Ce traitement des images est illustr par la figure 4.10.
Fig. 4.10 Dispositif de Cornell : rseau constitu de 16 canaux de section de 100

100 m et dune longueur de 1 cm. A : Image brute du rseau photographi dans le
dispositif exprimental avec le rseau de Cabodi lors de lcoulement de fluorescine
dans les canaux. B : Instantan de la transmittance ( A1 ) obtenu aprs traitement.
Pour lvaluation de la concentration moyenne, le trajet optique considrer

correspond lpaisseur du milieu (l = 2 mm). Dans la plupart des expriences, le
coefficient dextinction molaire de la solution de traceur inject est mesur ind-
pendamment laide du spectrophotomtre. Cependant, cette procdure na pas
t mise en oeuvre ds le dbut de la campagne de mesures exprimentales. Pour
les expriences effectues antrieurement, la mthode adopte pour valuer ce co-
efficient dextinction molaire est prsente la prochaine sous-section (Fonctions
dentre).
76
Cintique de rfrence
Aprs traitement, chaque pixel reprsente une valeur du champ de concen-

tration moyenne dans lpaisseur. Ce champ de concentration doit encore tre
moyenn sur lensemble du rseau pour obtenir la cintique de la concentration
moyenne dans le rseau.
Par ailleurs, la gomtrie du dispositif de Cornell prsente lavantage de pou-
voir tre subdivise en zones dans lesquelles, par conservation du dbit, le dbit
total entrant est gal au dbit impos en entre par la pompe (Fig.4.11). Cest
pourquoi, nous avons valu les cintiques des concentrations moyennes pour cha-
cune de ces zones.
Fig. 4.11 Reprsentation du rseau et des subdivisions sur lesquelles les moyennes
des concentrations ont t calcules.
Les variations de ces concentrations moyennes en fonction du temps sont pr-

sentes sur la figure 4.12.
Disposant de ces cintiques de concentration moyennes, la dtermination de

la fonction dentre est ncessaire pour valuer le dbit par un modle cintique.
Fonction dentre.
Lvaluation de la cintique de concentration entrant dans le systme est plus
dlicate que lvaluation de la concentration moyenne sur lpaisseur. En effet,
on sintresse prsent la concentration en traceur dans le canal qui alimente le
rseau. Or, mme si cette fonction dentre est directement lie la concentration
dinjection, le transport par convection-diffusion dans la connectique modifie sa
cintique, qui diffre donc du signal en crneau impos par lassociation dun
pousse-seringue et de la vanne 3 voies. Dans ce cas, on ne peut plus moyenner
le signal optique sur lpaisseur totale du dispositif mais sur lpaisseur du canal
corrige pour prendre en compte la diffusion du traceur dans le gel (Fig.4.13).
Le trajet optique considr est alors gal la somme de la hauteur du canal
(h) plus deux fois la longueur de diffusion (ld ).
q
l = h + 2 ld = h + 2 D t (4.6)
77
Fig. 4.12 Reprsentation des concentrations moyennes calcules pour le rseau de

Cabodi dans son ensemble ainsi que pour les 6 subdivisions (Fig.4.11) correspondant
lexprience prsente figure 4.10
Fig. 4.13 Reprsentation schmatique de lvolution au cours du temps du trajet

optique (attnuant la lumire), ici reprsent par la flche en traits pointills. Ce schma
prsente trois coupes dun canal de section h2 entour de gel correspondant 3 instants
diffrents (to , t1 , t2 avec to < t1 < t2 ). Le colorant reprsent est initialement prsent
(to = 0) dans tout le canal puis se diffuse dans le gel (t > 0).
78
Cintique de rfrence
La fonction dentre est dtermine (Fig.4.14) par un traitement identique celui

utilis pour lvaluation des concentrations moyennes en prenant comme longueur
du trajet optique la longueur dfinie par lquation 4.6. Dans le cas du dispositif de
Cornell, on constate que la concentration met un certain temps stablir. Cepen-
dant, on sait que sa valeur asymptotique est gale la concentration dinjection.
Cest pourquoi, pour les expriences pour lesquelles le coefficient dextinction na
pas pu tre mesur laide du spectrophotomtre, sa valeur a t obtenue par
ajustement de ce dernier pour faire concider la valeur de lasymptote la valeur
de la concentration dinjection.
Fig. 4.14 Cintique de la concentration entrant dans le rseau. Cette cintique

est obtenue avec un paramtre ajustable, le coefficient dextinction molaire (ici gal
= 53657 L mol1 cm1 ), de sorte que lasymptote de cette cintique concide avec
la concentration dinjection (CInj = 0.5 mM ).
En pratique, la campagne de mesure exprimentale sest avre dcevante3 ,

et lunique cas vritablement exploitable est le cas du remplissage du rseau de
Cornell avec un dbit de 30 L/min et une concentration de 0.5 mM .
3
Nayant pas exactement le mme matriel que celui utilis Cornell nous nous sommes
rendu compte de la grande sensibilit du protocole dlaboration des canaux dans le gel des
lments comme la taille de la grille maintenant la membrane et la gomtrie du rseau.
Enfin, malgr un protocole en constante volution, certaines tapes conditionnant le succs de
lexprience sont dlicates (Annexe A)
79
Avant de passer lvaluation des dbits, nous allons maintenant prsenter la

mthode permettant dobtenir la cintique de rfrence par simulation numrique.
80
Cintique de rfrence
4.2.3 Etude numrique pour le cylindre de Krogh

4.2.3.1 Dfinition du modle
Dfinition de la gomtrie.
La gomtrie est compose de deux cylindres coaxiaux, le cylindre intrieur
correspondant au vaisseau capillaire (phase , rayon ro , longueur L) et le cylindre
extrieur (phase , rayon R et de longueur L) reprsentant lenveloppe de tissu.
Pour tous les rayons ro envisags (2, 3 et 4 m), le rayon R sera valu en
2
conservant la fraction volumique de sang 2% du volume total ( Rro2 = 0.02). La
longueur L est constante pour tous les cas et gale la longueur moyenne des
vaisseaux capillaires (60 m).
La nature de la gomtrie et des symtries permet de simplifier ltude une
coupe 2D axisymtrique et dutiliser le systme de coordonnes cylindriques. Nous
allons donc utiliser exactement la mme gomtrie que celle du chapitre 3. Sur la
figure 4.15, larte 1 correspond laxe de symtrie, 2 et 3 sont respectivement
lentre et la sortie du sang, 4 est la surface dchange entre le capillaire et le
tissu et, enfin, 5, 6 et 7 sont les limites du tissu irrigu par le capillaire. Daprs
les hypothses de A. Krogh, le flux de concentration traversant ces surfaces est
nul.
Fig. 4.15 Dfinition de la gomtrie : reprsentation 2D axisymtrique du ca-

pillaire et de son enveloppe de tissu.
Dfinition des quations et des conditions limites.

Les quations implmentes dans le modle numrique ont t prsentes dans
le chapitre prcdent (Eq. 3.9 3.16). Lcoulement dans la gomtrie du cylindre
de Krogh est connu (Poiseuille), il nest donc pas utile de rsoudre le champ de
vitesse. Pour limplmentation des deux quations restantes (une quation de dif-
fusion et une quation de convection-diffusion), nous avons considr, dun point
de vue pratique, quil sagit de deux quations de convection-diffusion et nous
avons impos des vitesses nulles dans le domaine correspondant la phase solide
pour retrouver le cas de la diffusion. Le modle est donc compos dune unique
81
Domaines
Concentrations C C

r2
Vitesses (Vmax 1 ro2
) ez 0
Coeff. de diffusion 6 1010 m2 .s1 5 1010 m2 .s1

Ci
Equation t
+ Vi Ci = (Di Ci ) Ci
Conditions Flux nuls Egalit Continuit
aux limites n.(D C + V.C ) = 0 n.D C = 0 C = Co n.D C = n.D C
C = C
Frontires 3 5,6,7 2 4
Tab. 4.2 Modle de convection-diffusion : quation et conditions limites. Re-

marque, Co est la fonction dentre du traceur dans le milieu. Ici, cest une fonction
de type porte (Fig.4.17)
quation dont les paramtres dpendent de la phase sur laquelle elle sapplique
(Tab 4.2). Ici, nous utilisons les paramtres lis notre exprience in vitro. En
particulier, les coefficients de diffusion sont ceux de la fluorescine dans leau et
dans le gel dalginate.
Dans le cadre de cette tude, nous avons tudi numriquement 45 configu-
rations diffrentes correspondant 3 rayons du capillaire (2, 3 et 4 m) et 15
valeurs du nombre de Pclet radial (0.01, 0.0147, 0.05, 0.1, 0.147, 0.3, 0.5, 0.7368,
1, 1.25, 1.4737, 2.5, 5, 7.5 et 10). La fonction dentre sera dans toute la suite une
fonction de type porte identique pour tous les cas (Fig.4.17), avec une valeur de
crte 0.02 mM et une largeur de porte de 15 s.
4.2.3.2 Champs et cintiques de concentration

La simulation numrique directe sous lenvironnement Comsol Multiphy-
sics permet dobtenir le champ de concentration des deux phases chaque instant
pour diffrents nombres de Pclet, et diffrents rayons (Fig.4.16).
A partir du champ de concentration de chacune des deux phases, il est possible

dvaluer la cintique de concentration de rfrence lchelle de Darcy. Pour cela,
cette cintique est exprime comme la somme pondre des moyennes des deux
champs :
Cref (t) = hC (t)i + hC (t)i (4.7)
Ici, on considre que la concentration de rfrence correspond une concentration

totale (comprenant tissu et vaisseaux capillaires), cest dire la concentration
rellement mesur en TEP (Cf. Chap.I).
82
Cintique de rfrence
Fig. 4.16 Trois instantans du champ de concentration obtenu par simulation nu-
mrique pour un vaisseau capillaire de 8 m de diamtre et un Pclet radial gal
0.5.
83
La figure 4.17 donne un aperu de cette cintique dans le cas dun signal
dentre de type porte et dun nombre de Pclet gal 0.5, pour un rayon de 4
m.
Fig. 4.17 Cintique de concentration obtenue par prise de moyenne des champs de
concentration pour un capillaire de 8 m de diamtre et un Pclet radial de 0.5.
4.3 Mthode dvaluation du dbit

Quel que soit le modle cintique utilis, lvaluation du dbit partir de la
fonction dentre et de la cintique de concentration ncessite la rsolution dun
problme inverse. Cette section est consacre la dfinition et la rsolution des
problmes inverses associs, dune part, au modle de Renkin-Crone et, dautre
part, au modle homognis.
4.3.1 Cas du modle de Renkin-Crone

Comme nous lavons dcrit au Chapitre 2 (Eq. 2.57, 2.58 et 2.59), le modle de
Renkin-Crone utilise la cintique de la concentration mesure en TEP, assimile
la concentration tissulaire, pour valuer le dbit. Il exprime donc cette cintique de
concentration (Ct (t)) comme une fonction du dbit, de paramtres gomtriques
(surface dchange et volume total), de la fonction dentre et du coefficient de
permabilit P :
Ct (t) = kCo (t) ek.t (4.8)
avec
PQS
Q(1 e )
k= (4.9)
tot
Ici, les paramtres gomtriques et la fonction dentre sont aussi des donnes
connues. La concentration Ct (t) est la concentration de rfrence (Cref (t)) value
soit par simulation numrique soit exprimentalement par les mthodes dcrites
84
Mthode dvaluation du dbit
ci-dessus. Par contre, le coefficient de permabilit P est un paramtre qui ne peut

tre dtermin a priori. Cest pourquoi, dans un premier temps, nous proposons
de dterminer P par la rsolution dun problme inverse dans lequel le dbit est
fix sa valeur impose en entre du vaisseau. Dans un second temps, afin de
tester la capacit du modle de Renkin-Crone identifier le dbit, on traitera les
donnes en considrant le dbit comme une inconnue.
4.3.1.1 Evaluation du coefficient de permabilit P

La premire tape dans lvaluation du coefficient de permabilit consiste
dterminer le paramtre k. Lvaluation de ce paramtre est effectue par la
minimisation de la norme de la diffrence entre la concentration de rfrence et la
concentration obtenue par lquation 4.8 dans laquelle le seul paramtre ajustable
est le coefficient k :
k tq ||Cref (t, k) k.Co (t) ek.t ||2 soit minimum (4.10)
Par ailleurs, le coefficient k peut tre obtenu par la mme mthode partir des
rsultats des simulations numriques. La figure 4.18 prsente les rsultats obtenus
pour diffrents dbits et diffrents rayons du vaisseau capillaire, avec une mme
fonction dentre (fonction porte reprsente Fig.4.17).
Fig. 4.18 Coefficient k en fonction du dbit pour 3 rayons de capillaire diffrents.
A partir du coefficient k, il est alors possible dobtenir P par inversion de

lquation 4.9, ce qui conduit :
85
Q ktot
P = ln(1 ) (4.11)
S Q
Cette expression ne permet dobtenir une valeur relle de P , compatible avec la
modlisation de Renkin-Crone, que si le rapport kQtot est infrieur 1. Dans le
cas contraire, P est valeur complexe, ce qui na pas de sens. Cest pourquoi,
partir de la figure 4.18, on trace la variation du rapport kQtot avec le dbit
(Fig.4.19). Ce graphique dmontre limpossibilit de dterminer P dans la limite
des petits dbits, kQtot tendant vers linfini pour une valeur finie de dbit qui
dpend du rayon du vaisseau. Les rsultats obtenus partir de lquation 4.11
dans la gamme o kQtot < 1 sont prsents sur la figure 4.20
ktot
Fig. 4.19 Evolution de Q en fonction du dbit pour 3 rayons de capillaire diffrents.
La figure 4.20 rvle clairement une forte dpendance du coefficient P avec

le dbit et avec le rayon, ce qui illustre une difficult majeure lie au modle
compartimental : en effet, dans ce modle, le coefficient P reprsente un paramtre
physiologique qui devrait tre indpendant du dbit et du rayon. Cest pourquoi,
dans le but de dterminer le dbit partir des relations 4.8 et 4.9, nous devons
fixer une valeur de P dont le choix comporte ncessairement une part darbitraire.
Dans la suite, afin dvaluer linfluence du choix de P sur lidentification du dbit,
on fixera successivement la valeur de P trois niveaux : un niveau minimisant les
rsultats numriques, un niveau intermdiaire et un niveau symtrique du niveau
86
Fig. 4.20 Valeurs et volution du coefficient P dtermin partir du coefficient k.
minimal par rapport au niveau intermdiaire. Les valeurs numriques de ces trois
niveaux sont respectivement :
2
la valeur minimum obtenue pour un rayon ro = 2 m : Pmin = 5.32 105 m.s1 ,
4
la valeur minimum obtenue pour un rayon ro = 4 m : Pmin = 6.45 105 m.s1 ,
2 4 4 2
la valeur symtrique de Pmin par rapport Pmin : Pmax = 2 Pmin Pmin =
5 1
7.58 10 m.s .
Par ailleurs, partir de la fonction dentre exprimentale prsente la fi-

gure 4.14 et de lvolution de la concentration moyenne dans le rseau (Fig.4.12,
courbe C), les coefficients exprimentaux k et P sont estims k = 0.0016 s1 et
P = 5.37 106 m.s1 (S tant gal 2.17 105 m2 ). Lordre de grandeur de ce co-
efficient est dix fois plus faible que lordre de grandeur des rsultats numriques.
Afin de vrifier lordre de grandeur de ce rsultat, nous avons galement valu
un coefficient de permabilit partir de la simulation numrique dun unique
capillaire d1 cm de long et de 100 m de diamtre pour diffrents dbits (de
1.13 L/min 18.75 L/min). Cette simulation na pas la prtention de dter-
miner la valeur exacte du P correspondant lexprience puisquici le capillaire
simul est de section circulaire et que les canaux de lexprience sont de section
carre, cependant les ordres de grandeurs tant respects, lordre de grandeur du
coefficient sera comparable. Les valeurs du coefficient de permabilit obtenues
87
Fig. 4.21 La figure donne lvolution du coefficient P en fonction du dbit pour une
gomtrie comportant un capillaire unique de 1 cm de long et de 100 m de diamtre. La
valeur de P correspondant au dbit gal 1.875 L/min stablit P = 9.2 106 m/s
en fonction du dbit impos sont traces sur la figure 4.21 et, daprs ces rsul-
tats, la valeur de P correspondant au dbit dun canal du rseau exprimental
30
( 16 = 1.875 L/min) est gale P = 9.2 106 m/s dont lordre de grandeur
est effectivement comparable celui de la valeur du coefficient de permabilit
trouve exprimentalement.
4.3.1.2 Problme inverse pour lvaluation du dbit
Dsormais, lensemble des paramtres est connu, la fonction exprimant la

concentration dans le modle de Renkin-Crone peut tre utilise pour identifier le
dbit que lon considre alors comme une inconnue. Pour cela, il suffit de trouver
la valeur qui permet de minimiser la norme dfinie par lexpression suivante (Eq.
4.12) :
PQS PS
Q )
Q(1 e )
Q(1e
.t
Q tq ||Cref (t) .Co (t) e tot ||2 soit minimum. (4.12)
tot
La rsolution de ce problme inverse permet didentifier un dbit, que lon notera

QRK . La comparaison de sa valeur la valeur du dbit impose en entre du
vaisseau capillaire sera effectue ultrieurement (Section : 4.4.2). Par ailleurs, la
cintique identifie par cette mthode, cest dire la cintique de Renkin-Crone
88
correspondant QRK :
PS
QPS Q (1e
Q
RK )
1e RK RK .t
CRK (t) = QRK e tot (4.13)
tot
sera compare la cintique de rfrence (Section : 4.4.1).
Alternativement, on peut rsoudre le problme inverse prcdent (Eq. 4.10)
et obtenir la valeur de QRK partir de celle de k en inversant la relation 4.9.
Pour dterminer sous quelles conditions lquation 4.9 est inversible et tudier
linfluence du choix de P sur la valeur du dbit identifi par le modle de Renkin-
Crone, cette quation est rcrite sous la forme :
1 ktot = eP S , (4.14)
o = Q1 .
Les solutions correspondent aux intersections des courbes f () = 1 ktot
et g() = eP S (Fig.4.22). Quelle que soit la valeur des paramtres P S et ktot ,
= 0 est solution. Par ailleurs, une seconde solution valeur positive est
obtenue si et seulement si P S > ktot , cest dire si la pente lorigine de la
fonction g (g 0 (0) = ktot ) est suprieure la pente lorigine de la fonction f
(f 0 (0) = P S). Notons que cette solution est alors ncessairement incluse dans
lintervalle ]0; k1tot [, la fonction f devenant ngative au del de cet intervalle. On
montre galement que, si P augmente, alors augmente.
Par consquent, on peut prdire que si P est surestim, alors QRK sera sous-
estim par le modle de Renkin-Crone, tout en restant suprieur ktot . Si P est
sous-estim, alors, au contraire, QRK sera surestim.
4.3.2 Cas du modle homognis

Dans le cas du modle homognis, il est galement possible de calculer la
cintique de concentration partir de la concentration dentre et de divers pa-
ramtres, par rsolution dun systme dquations diffrentielles couples.
Plus prcisment, la cintique de concentration permettant dvaluer le dbit
doit correspondre celle que mesurerait la TEP, cest dire la concentration
moyenne lchelle de Darcy, qui peut tre exprime par la relation suivante :
Chomo (t) = . hC i + . hC i . (4.15)
Or, dans le chapitre 3, nous avons montr que les concentrations moyennes de
chaque phase hC i et hC i obissent toutes les deux une quation diffren-
tielle :
hC i
+ hVi . hC i u hC i u hC i
t
= K hC i + K hC i

89
Fig. 4.22 Reprsentation des fonctions dfinies par la droite 1 ktot et les courbes
eP S o la valeur de P S est plus grande que ktot pour la premire et plus petite
pour la seconde. Lintersection de la droite avec la courbe exponentielle, si elle existe,
correspond la solution de lquation 4.14.
90
et
hC i
u hC i u hC i
t
= K hC i + K hC i

Cependant, comme soulign en conclusion du chapitre consacr au change-

ment dchelle (Chap.3), le dbit napparat pas dans ces deux expressions. Pour
pouvoir identifier le dbit partir de ce modle, il est ncessaire dexprimer les
paramtres effectifs en fonction de cette variable. Pour cela, nous adoptons une
approche pragmatique en recherchant des lois simples permettant de dcrire le
comportement des paramtres effectifs calculs numriquement par rsolution des
problmes de fermeture en fonction du dbit.
4.3.2.1 Etude de la dpendance des paramtres effectifs au dbit.

Avant de poursuivre ltude de la dpendance des paramtres effectifs avec
le dbit, il est ncessaire de prciser que le paramtre pertinent pour tudier les
changes entre la phase sang et la phase tissu est la vitesse moyenne de lcoule-
ment. Cest dailleurs lun des paramtres dans lquation 4.16. Cependant, dans
le cadre de cette tude on sintresse lidentification du dbit. Dans la gomtrie
du modle de Krogh, la relation entre le dbit et la vitesse moyenne est triviale,
cest pourquoi nous avons directement tudi la dpendance des paramtres ef-
fectifs avec le dbit. Pour cela, nous avons trac la dpendance avec le dbit de
chacun des paramtres effectifs (K , K , K , K , u , u , u , u et av h)
calculs numriquement par la rsolution des problmes de fermeture (Eq. 3.51
3.71).
Le graphique 4.23 prsente cette volution rayon fix, et rvle que la dpen-
dance des coefficients effectifs avec le dbit est linaire (exception faite de K
dont la dpendance avec le dbit est quadratique et de K qui est nul.).
Cette dpendance permet dexprimer chacun des paramtres effectifs comme

un polynme du premier ou du second ordre en Q, dtermin par rgression. Les
coefficients (a, b et c) de ces polynmes sont prsents dans le tableau 4.3. Les
quations 4.16 et 4.17 sont alors rcrites en remplaant chacun des paramtres
par le polynme qui lui est associ.
Ainsi, le modle homognis permet de calculer la cintique de concentration

Chomo (t) partir du dbit, de la concentration dentre et des coefficients a, b et
c qui dpendent uniquement de la gomtrie du problme.
91
Fig. 4.23 Evolution des paramtres macroscopiques en fonction du dbit pour un

rayon de 2 m. Le coefficient K tant nul, il nest pas reprsent. Remarque : les
courbes obtenues pour les dimensions de rayon 3 et 4 m prsentent un comportement
identique celui des courbes prsentes ici.
92
Coefficients macroscopiques
a b c
K 1.59 1016 212.23 1.2 1011
K 0 212.21 1.78 1019
K 0 0 0
K 0 4.52 1013 4.9 1010
r1 U 0 7.02 107 1.53 106
U 0 7.44 107 1.00 106
U 0 4.25 106 1.8 107
U 0 0.021 2.085 106
av h 0 0.97 3.367
a b c
K 7.08 1015 141.47 1.2 1011
K 0 141.46 6.80 1020
K 0 0 0
K 0 4.52 1013 4.9 1010
r2 U 0 3.12 107 1.02 106
U 0 3.31 107 6.68 107
U 0 1.89 106 1.2 107
U 0 4.9 103 1.39 106
av h 0 0.33 1.497
a b c
K 3.98 1015
106.1 1.2 1011
K 0 106.09 1.05 1020
K 0 0 0
K 0 4.52 1013 4.9 1010
r3 U 0 1.75 107 7.69 107
U 0 1.86 107 5.01 107
U 0 1.065 106 9.03 108
U 0 7.26 104 1.042 106
av h 0 0.016 0.842
Tab. 4.3 Tableau des coefficients (donns en units SI) formant les polynmes
de la forme a Q2 + b Q + c associs chaque paramtre effectif. Les polynmes
sont donns pour les trois gomtries, r1 , r2 et r3 correspondant aux trois tailles
de rayon tudies numriquement (2, 3 et 4 m). Pour chaque rgression, le
coefficient de corrlation R est suprieur 0.99.
93
4.3.2.2 Problme inverse pour lvaluation du dbit avec le modle

homognis
Pour dterminer le dbit partir de la cintique de rfrence, il faut, de la
mme manire que pour le modle de Renkin-Crone, dterminer la valeur Qhomo
qui permet de minimiser la norme dfinie par lexpression suivante (Eq.4.18) :
Qhomo tq ||Cref (t, Q) Chomo (t)||2 soit minimum. (4.18)
Dans ce cas, la minimisation est effectue par une approche itrative o la

cintique Chomo (t) est calcule par rsolution numrique du systme (Eq. 4.16 et
4.17) avec pour condition en entre la fonction dentre du problme.
La comparaison de la valeur Qhomo ainsi obtenue la valeur du dbit impos
en entre du capillaire sera effectue ultrieurement (Section : 4.4.2).
4.4 Comparaison des rsultats

Dans cette section, les rsultats obtenus par les approches dcrites ci-dessus
sont prsents. Dans un premier temps, on compare les cintiques de rfrence
obtenues par la simulation numrique aux cintiques prdites par le modle ho-
mognis pour un mme dbit impos. Par ailleurs, on compare ces cintiques

de rfrence aux cintiques CRK (t) identifies par le modle de Renkin-Crone
(problme inverse Eq.4.9). En effet, contrairement au cas du modle homog-
nis, lindtermination de P discute prcdemment (.4.3.1.1) empche dutili-
ser lapproche directe. Dans ce cas, le seul paramtre ajustable est le paramtre
k.
Dans un second temps, on compare les dbits identifis par les deux problmes
inverses correspondant ces deux modles (Eq. 4.12 et 4.18) au dbit impos en
entre.
Finalement, on prsentera les rsultats du modle de Renkin-Crone appliqu
sur les cintiques obtenues avec le dispositif exprimental.
4.4.1 Cintiques
Les cintiques de rfrence obtenues par simulations numriques, les cin-
tiques prdites par le modle homognis et celles identifies par le modle de
Renkin-Crone sont prsentes sur la figure 4.24. Cette figure est compose de
deux colonnes prsentant les rsultats pour les deux rayons extrmes utiliss du-
rant cette tude, cest dire ro = 2 m (gauche) et ro = 4 m (droite). Chaque
ligne correspond une valeur diffrente du nombre de Pclet radial (de haut en
bas : P er = 0.01, P er = 0.1 et P er = 1)4 . Les cintiques obtenues pour P er > 1
4 ro2 V Q
P et = DL = DL . Par consquent, chaque ligne correspond une valeur constante du dbit.
94
Comparaison des rsultats
ne sont pas reprsentes car elles ne diffrent pas significativement des cintiques
obtenues pour P er = 1.
Sur cette figure, quel que soit le rayon ou le nombre de Pclet considr, le
comportement des cintiques de rfrence est conforme aux tendances attendues.
En effet, elles suivent le comportement du signal dentre impos (signal de type
porte simulant un remplissage puis un rinage du milieu), cest dire que logi-
quement elles commencent crotre puis dcrotre aux mmes instants que le
signal dentre. Pour cette gomtrie, les dimensions sont telles que, pour tous
les cas tudis, le temps de diffusion ncessaire pour atteindre la limite extrieure
du cylindre de tissu est toujours trs petit devant le temps dinjection, cest
dire que, pendant la dure dinjection tinjection = 15 s (correspondant la lar-
geur
q de la porte), le traceur parcourt dans le tissu une distance de lordre de
Dtissu tinjection = 86.6 m qui est suprieure la taille du rayon du cylindre de
tissu (Rmax = 28.3 m). Par consquent, le phnomne limitant lvolution de
la concentration dans le milieu est ici le transport par convection. Ainsi, lorsque
le dbit est faible, lapport en traceur par convection est insuffisant pour que
la concentration moyenne dans le milieu parvienne atteindre la valeur de la
concentration dinjection avant le rinage. Cependant, plus le dbit augmente et
plus la quantit de traceur entrant dans le tissu augmente. Par consquent, la
valeur maximale atteinte par la concentration moyenne crot avec le dbit et tend
vers la concentration dinjection. Cest pourquoi, lorsque le dbit est suffisamment
grand, lapport en traceur est suffisant pour saturer le milieu avant le rinage,
ce qui provoque une stabilisation de la valeur de la concentration moyenne la
valeur de la concentration dinjection, et qui se traduit au niveau de la cintique
par lapparition dun plateau.
Ces cintiques de rfrence sont en excellent accord avec les cintiques prdites
par le modle homognis dans toute la gamme de paramtres tudie. Il faut
encore souligner que cet accord est obtenu sans quaucun paramtre ajustable ne
soit utilis. Ce rsultat dmontre la validit de lapproche que nous avons conduite
pour homogniser le cylindre de Krogh par prise de moyenne volumique.
Au contraire, les cintiques identifies par le modle de Renkin-Crone ne sont

pas en accord avec les cintiques de rfrence sur toute la gamme tudie. En par-
ticulier, pour les dbits levs, cest dire lorsquun plateau apparat au niveau
de la cintique de rfrence, le modle de Renkin-Crone prdit une valeur maxi-
male de la concentration moyenne dans le milieu suprieure la concentration
dinjection. Cette incapacit prdire la cintique de la concentration moyenne
dans le milieu, malgr la prsence dun paramtre ajustable (k), dmontre que
les changes entre un capillaire et son enveloppe de tissu ne peuvent pas tre
modliss correctement par un modle du premier ordre ds lors que le rle de la
diffusion nest plus ngligeable devant la convection.
95
ro = 2m ro = 4m
P er = 0.01
P er = 0.1
P er = 1
Fig. 4.24 Cintiques de concentration du modle homognis (symbole o), du mo-

dle de Renkin-Crone (symbole ) et cintique de rfrence (symbole *) pour deux
rayons de capillaire et 3 P er .
96
4.4.2 Dbits identifis

Les dbits identifis par le modle homognis sont tracs sur la figure 4.25
en fonction des dbits imposs en entre. La colonne de gauche prsente les r-
sultats obtenus pour toute la gamme des dbits imposs, en coordonnes log-log,
tandis que celle de droite se limite la gamme des dbits physiologiques (de 0
10 nL/min), en coordonnes linaires.
On note, tout dabord, que la correspondance entre dbits identifis et dbits

imposs est tout fait satisfaisante, sur toute la gamme de dbits tudie et
pour les trois rayons du vaisseau capillaire puisque, lcart relatif moyen est de
17% pour les trois tailles de rayon (lcart relatif maximal tant de 35% et le
minimal de 1.7%). Enfin, les valeurs de dbit identifies sont indpendantes du
rayon. Ce rsultat est obtenu sans aucun paramtre ajustable, mais en utilisant
les paramtres a, b, et c (cf.4.3.2.1) correspondant la gomtrie tudie.
Toute la gamme de dbits Gamme de dbits physiologiques
Fig. 4.25 Modle homognis : les 2 figures prsentent lvolution du dbit valu
par le modle homognis. La colonne de gauche propose cette volution pour toute la
gamme des dbits envisags tandis que celle de droite se limite la gamme des dbits
physiologiques. Pour chaque point, labscisse correspond au dbit impos et lordonne
au dbit valu par le modle, ainsi, si le modle est performant, le point devrait se
situer sur la droite identit reprsente en trait plein.
Comme nous lavons largement discut prcdemment, lidentification du d-

bit par le modle de Renkin-Crone ncessite de fixer le coefficient de permabilit
P . Afin dillustrer limportance du choix de ce paramtre, nous avons prsent les
rsultats obtenus pour trois valeurs dfinies pages 87 (Fig.4.26). Suivant la mme
convention que la figure prcdente, cette figure prsente les rsultats en deux
colonnes correspondant aux deux gammes de dbits (gamme tudie et gamme
physiologique), les trois lignes prsentent les rsultats obtenus pour les trois va-
97
leurs de P , dans lordre de P croissant.

Le constat, qui peut tre fait immdiatement, est que le modle de Renkin-
Crone nest pas capable dvaluer le dbit de manire satisfaisante. En effet, on
constate une trs forte influence, non seulement du paramtre P , mais aussi du
rayon, produisant des dviations trs importantes la linarit des rsultats dans
certains cas.
Dans le dtail, on constate que, comme prdit par lanalyse prsente au para-
2
graphe 4.4.1, lorsque le coefficient P est sous-estim (ligne 1, Pmin ), le dbit iden-
tifi est systmatiquement survalu avec des diffrences pouvant atteindre 977%
pour la gamme des dbits physiologiques. Au contraire, lorsque P est survalu,
le dbit identifi est sous-valu. En particulier, sur la dernire ligne (P = Pmax )
la sous valuation du dbit peut atteindre 711% et les courbes obtenues pour la
gamme des dbits physiologiques prsentent une allure similaire celles obtenues
exprimentalement par St. Lawrence & Lee (1998.b) (Fig.2.9). Ceci suggre que
les valeurs de P disponibles dans la littrature et classiquement utilises pour va-
luer le dbit par les modles compartimentaux sont survalues. Notons que, dans
les travaux de St. Lawrence & Lee (1998.a), le modle utilis est le modle dho-
mognit tissulaire. Nanmoins, la comparaison de nos rsultats, obtenus par
le modle de Renkin-Crone avec leurs rsultats exprimentaux reste pertinente,
car, lchelle considre (chelle microscopique) les rsultats obtenus avec ces
deux modles sont identiques. Cest pourquoi nous ne prsenterons pas, dans ce
manuscrit, les rsultats obtenus pour le modle dhomognit tissulaire.
Par ailleurs, les rsultats obtenus confirment la dpendance au rayon du pa-
ramtre P . En effet, si lon observe la troisime ligne de la figure 4.26, les dbits
valus sont surestims pour les capillaires de rayon 3 et 4 m et sous-estims
pour le capillaire de 2 m de rayon. Cela signifie que la valeur du P adquat pour
4
permettre lidentification du dbit est suprieure Pmin pour les deux gomtries
de plus grand rayon et infrieure pour la troisime.
4.4.3 Rsultats des mesures exprimentales

Dans cette section, nous prsentons les rsultats obtenus par le modle de
Renkin-Crone et les mesures exprimentales effectues sur le rseau prsent
la figure 4.10 ainsi que pour les 6 subdivisions dfinies sur la figure 4.11. On
rappelle que, dans lexprience considre, le dbit impos en entre du rseau
est de 30 L/min et que lvaluation du paramtre P partir de la fonction
dentre et de la cintique de concentration, pour Q = 30 L/min, donne une
valeur gale 5.37 106 m/s (cf.4.3.1.1). Lvaluation du dbit se fait en utilisant
le modle de Renkin-Crone directement sur cette gomtrie, exactement comme
il serait utilis dans le cadre dune mesure de dbit en TEP, cest dire sans tenir
compte de lchelle laquelle il est dfini.
98
Toute la gamme de dbits Gamme de dbits physiologiques
Fig. 4.26 Modle de Renkin-Crone : les 6 figures prsentent lvolution du dbit

valu par le modle compartimental suivant les trois rgles utilises pour dfinir P
2
(Cf..4.3.1.1), Pmin = 5.32 105 m/s, Pmin4 = 6.45 105 m/s et Pmax = 7.58 105 m/s.
La colonne de gauche propose cette volution pour toute la gamme des dbits envisags
tandis que celle de droite se limite la gamme des dbits physiologiques. Pour chaque
point, labscisse correspond au dbit impos et lordonne au dbit valu par le mo-
dle, ainsi, si le modle est performant, le point devrait se situer sur la droite identit
reprsente en trait plein.
99
Dbit valu :
Rseau complet 30 L/min
Subdivision 1 7.02 L/min
Tab. 4.4 Dbits calculs pour le rseau complet et ses subdivisions avec un
dbit impos de 30 L/min, en utilisant la valeur de P obtenue par ajustement
du dbit identifi au dbit impos (P = 5.37 106 m/s).
Sans surprise, le modle de Renkin-Crone, bien que la gomtrie soit plus com-
plexe que le cylindre de Krogh, est capable de prdire un dbit global avec une
trs grande prcision lorsque P est ajust dans ce but (Tab.4.4). En revanche,
malgr cet ajustement, le dbit rgional estim dans chacune des zones tudies
est globalement fortement sous-estim (de 41% 84.8%) et une fois surestim de
9.3%. Par consquent, le modle de Renkin-Crone ne permet pas dvaluer des
valeurs de dbit une chelle infrieure de lchelle du systme complet. En ce
sens, il napporte pas non plus damlioration par rapport lapproche de type
bote noire.
4.5 Conclusion
Dans ce chapitre, les transferts entre un vaisseau capillaire cylindrique et son
enveloppe de tissu ont t tudis par deux mthodes : une simulation numrique
par lments finis et une mthode de mesure optique permettant lvaluation de
la cintique de concentration.
Les rsultats obtenus ont t traits, dune part, laide du modle de Renkin-
Crone, et, dautre part, laide dun nouveau modle, le modle homognis,
dans lobjectif de dterminer le dbit, considr comme une inconnue.
Nous avons mis en vidence une difficult majeure lie au modle de Renkin-
Crone, et par consquent lensemble des modles compartimentaux qui en sont
drivs : le coefficient de permabilit, qui est le paramtre central de ce mo-
dle, dans lequel il reprsente un paramtre physiologique indpendant du dbit
et du vaisseau capillaire, ne peut pas tre dtermin alors mme que la gom-
trie utilise dans ce chapitre correspond la gomtrie pour laquelle ce modle
est dfini. Cette impossibilit dmontre que lhypothse centrale du modle de
Renkin-Crone, dans lequel les flux de traceur la paroi sont proportionnels la
100
Conclusion
diffrence de concentration moyenne dans la phase sanguine et la phase tissulaire

(Eq. 2.51), est errone.
Au contraire, la comparaison des cintiques de concentration obtenues par
simulations numriques et laide du modle homognis, sans aucun para-
mtre ajustable, dmontre sa validit dans la gomtrie du cylindre de Krogh.
Par ailleurs, pour cette mme gomtrie, nous avons galement dmontr la capa-
cit du modle homognis valuer le dbit. Cependant, ainsi que nous lavons
voqu au chapitre 2, cette gomtrie nest pas adapte pour reprsenter le rseau
capillaire crbral, qui est un rseau maill.
Dans le chapitre suivant, nous gnraliserons la mthode dhomognisation
une gomtrie plus complexe. Nous prsenterons les rsultats prliminaires ob-
tenus, afin de dmontrer la pertinence de lapproche propose dans le cadre de la
modlisation du rseau capillaire crbral.
101
102
Changement dchelle appliqu une
gomtrie plus raliste 5
5.1 Introduction
Le travail prsent jusqu prsent dans ce mmoire a port sur une gomtrie
trs simple, reprsentant un capillaire cylindrique unique entour dun cylindre de
tissu isol. Or, nous lavons vu prcdemment (3.2), notre objectif est de proposer
un modle homognis de la partie maille (capillaire) du rseau micro-vasculaire
intra-cortical. En effet, cette partie maille devient homogne au dessus dune
longueur de coupure correspondant la longueur caractristique des vaisseaux
capillaires ( 50 m), et il est donc possible de dfinir un VER sur lequel
appliquer la technique de prise de moyenne volumique (Lorthois & Cassot, 2010.).
Dans ce chapitre, nous gnraliserons donc la mthode dhomognisation
dveloppe prcdemment une gomtrie maille modle, homogne au dessus
dune longueur de coupure.
5.2 Gomtrie tudie

Le rseau capillaire crbral est un rseau tridimensionnel complexe dont lor-
ganisation spatiale est encore mal connue (Fig.5.1), mme sil a t dmontr
rcemment quil devient homogne au dessus dune longueur de coupure lc cor-
respondant la longueur caractristique des vaisseaux capillaires. Une telle struc-
ture, qui remplit lespace, permet dalimenter efficacement chaque cellule de les-
pace interstitiel. En effet, en moyenne, la distance maximale entre un point du
tissu et le vaisseau le plus proche est infrieure 12 lc (Lorthois & Cassot, 2010.).
Dans ce chapitre, nous nous intresserons ici une gomtrie bidimensionnelle

modle possdant des proprits identiques. Plus prcisment, on tudie une go-
mtrie 2D alatoire maille, isotrope, prsentant une distribution gaussienne de
103
Changement dchelle appliqu une gomtrie plus raliste
Fig. 5.1 Images tridimensionnelle dune rgion dintrt du rseau capillaire intra-
cortical (Lorthois & Cassot, 2010.).
la surface des mailles, et une longueur de coupure lc gale la racine carre de la

surface moyenne.
Cette gomtrie modle est gnre en traant le diagramme de Vorono1
dun ensemble de points positionns alatoirement en respectant une contrainte
dhomognit au dessus de la longueur de coupure lc .
Pour cela, on construit tout dabord une grille rgulire mailles carres dont
le ct est gal lc . Le nombre de mailles n est choisi de sorte que lespace
couvert par la grille puisse servir de VER pour la prise de moyenne volumique,
cest dire que cet espace soit suffisamment grand pour que le milieu puisse tre
considr comme homogne. La taille caractristique de la grille lg = nlc doit
donc tre grande devant la longueur de coupure lc , mais petite devant la longueur
caractristique du milieu observ en TEP. Cest pourquoi, nous avons choisi une
longueur lg gale dix fois la longueur de coupure (lg = 10lc = 500 m), cette
longueur tant en dessous de la taille dun voxel en TEP.
Ensuite, on positionne de manire alatoire un point pi dans lespace form par
chaque maille i. Pour cela, chaque maille est subdivise en 1010 lments. Ainsi,
la matrice utilise pour la construction du diagramme de Vorono est une matrice
presque vide de 100 100 dans laquelle la valeur 1 est attribue 100 lments
choisis alatoirement avec comme contrainte de navoir dans chaque maille quun
seul lment ayant la valeur 1.
Cependant, le diagramme de Vorono obtenu avec cette matrice nest pas p-
riodique. Or, notre objectif est dhomogniser cette gomtrie en utilisant la
mthode de prise de moyenne volumique, qui, dans sa formulation la plus clas-
sique, utilise des conditions de priodicit. Cest pourquoi, nous avons modifi la
matrice en ajoutant 2 mailles par bord et altr le caractre alatoire du tirage
pour ces nouvelles mailles : le coin suprieur gauche, dont les points sont tirs
1
Un diagramme de Vorono est une dcomposition de lespace associe un ensemble discret
de points pi de lespace. Ce diagramme est compos dautant de rgions que de points pi et
chaque rgion i est dfinie comme tant lensemble des points de lespace plus proches du point
pi que de tout autre point pj .
104
Gomtrie tudie
alatoirement, est reproduit par symtrie sur les trois autres coins. Nous formons
ainsi une nouvelle matrice de 14 14 mailles (Fig.5.2) dont lutilisation permet la
gnration dun diagramme de Vorono priodique mais dont les 10 10 rgions
internes conservent un caractre alatoire.
Fig. 5.2 Tirage alatoire des points dans la grille (points rouges) et priodisation des
bords (points verts) permettant la gnration dun diagramme de Vorono priodique.
Cette priodicit de la gomtrie est obtenue en reproduisant par symtries les points
du motif suprieur gauche, dlimit par le contour noir, sur les 3 motifs dlimits par
le contour rouge.
La figure 5.3 prsente le diagramme de Vorono obtenu. Un post-traitement

de ce diagramme permet dobtenir la gomtrie bidimensionnelle devant servir
de VER pour la prise de moyenne volumique. Ce post-traitement consiste ,
premirement, dcouper les mailles des bords en deux pour garantir la priodicit,
et, deuximement, paissir les segments du diagramme pour former les canaux.
Pour cette gomtrie, nous avons choisi de fixer la largeur de tous les canaux
gale 6 m, cette taille correspondant au diamtre moyen des capillaires dans
le rseau crbral maill.
La gomtrie utilise (Fig.5.4) a donc, au final, une dimension de 650650 m
et chacun de ses cts mesure treize fois la longueur de coupure lc (50 m). Dans
la suite de ce chapitre, nous ferons rfrence cette gomtrie sous la dnomina-
tion gomtrie I.
Par ailleurs, une seconde gomtrie, gomtrie II, de taille infrieure est
utilise. Cette gomtrie a t obtenue partir de la slection de 3 3 mailles
de la gomtrie prcdente. Cependant, afin de la rendre priodique, nous avons
105
Fig. 5.3 Diagrame de Vorono permettant la gnration de la gomtrie reprsenta-

tive du rseau vasculaire maille.
Fig. 5.4 Gomtrie utilise pour reprsenter le rseau capillaire maill crbral :
gomtrie I.
106
Simulations numriques directes
modifi manuellement les bords. Par consquent, seules les 22 mailles intrieures
de cette gomtrie conservent les caractristiques de la gomtrie prcdente.
5.3 Simulations numriques directes

A partir de ces deux gomtries, nous avons, comme dans le chapitre prc-
dent, obtenu les champs de vitesse et de concentration par simulation numrique,
en utilisant le logiciel COMSOL, afin dobtenir la cintique de rfrence.
5.3.1 Champ de vitesse

Le champ de vitesse stationnaire (Fig.5.5) est obtenu par la rsolution des
quations de Navier-Stokes bidimensionnelles planes o le fluide considr est in-
compressible et les forces de gravit ngligeables.
En effet, le milieu tant ici htrogne, il nest pas pertinent dimposer un

dbit en entre. Par ailleurs, la relation entre gradient de pression et dbit ayant
une forme diffrente pour une gomtrie 3D et une gomtrie 2D plane, nous ne
pouvons estimer le gradient de pression imposer partir des valeurs physiolo-
giques. Cest pourquoi, nous avons impos le gradient de pression de sorte que les
vitesses moyennes dcoulement obtenues pour la gomtrie I concident avec
la gamme des vitesses physiologiques (de 0.005 0.5 mm.s1 dans les capillaires
de diamtre moyen). En effet, comme nous lavons vu au chapitre prcdent, cest
la vitesse moyenne qui est le paramtre pertinent dans les quations du modle
homognis (Eq. 4.16). Les figures 5.6 et 5.7 prsentent lvolution de la vitesse
moyenne obtenue pour les deux gomtries. Les diffrences de pression retenues
(de 1 400 P a) permettent dobtenir la gamme des vitesses physiologiques dans
la gomtrie I. Par contre, dans la gomtrie II, ils impliquent des vitesses
moyennes largement suprieures.
Concernant le dbit, il est proportionnel la vitesse moyenne (Fig. 5.8 et 5.9).
QI = I VI moy et QII = II VII moy (5.1)
avec I = 1.4 104 m et II = 3.8 105 m
Daprs la loi de Darcy2 dans un milieu poreux, le dbit est proportionel

au gradient de pression. Dans le cas ou la gomtrie II serait un volume re-
prsentatif de la gomtrie I, les deux milieux auraient la mme conductivit
hydraulique et pour une mme diffrence de pression le dbit total devrait tre
2
La loi de Darcy permet de relier le dbit au gradient de pression suivant la relation suivante :
Q = KSP o K est la conductivit hydraulique du milieu, S la section et P le gradient de
pression.
107
Fig. 5.5 Champ de vitesse dans la gomtrie I obtenu pour une diffrence de
pression de P = 400 P a entre les bords gauche et droit. Le dbit total est alors gal
Q = 1.4 107 m2 /s.
Fig. 5.6 Evolution de la vitesse moyenne en fonction de la diffrence de pression

exerce entre le bord gauche et le bord droit de la gomtrie I.
108
Fig. 5.7 Evolution de la vitesse moyenne en fonction de la diffrence de pression

exerce entre le bord gauche et le bord droit de la gomtrie II.
Fig. 5.8 Evolution du dbit en fonction de la vitesse moyenne pour la gomtrie I.

Coefficient de proportionnalit : 1 = 1.4 104 m.
Fig. 5.9 Evolution du dbit en fonction de la vitesse moyenne pour la gomtrie II.
Coefficient de proportionnalit : II = 3.8 105 m.
109
gal dans les deux gomtries. En effet, la gomtrie tant bidimentionnelle, on

a:
P P
QI = KSI = K(LI 1) = KP (5.2)
LI LI
P P
QII = KSII = K(LII 1) = KP (5.3)
LII LII
Par consquent, la valeur du rapport des deux coefficients de proportionnalit

( III
= 3.68) reliant le dbit la vitesse dans les deux gomtries devrait tre gal
au rapport des longueurs des deux gomtries ( llIII = 3.66). Le trs bon accord ici
entre les deux rapports suggre donc que la gomtrie II peut tre considre
comme un VER de la gomtrie I pour lcoulement et le coefficient 1 peut
tre valu partir du coefficient II et de la gomtrie.
lI
I = II (5.4)
lII
5.3.2 Champs de concentration

Les champs de concentration pour diverses valeurs du temps (Fig.5.10 et 5.11)
sont obtenus par rsolution des quations de transport dans les deux phases (Eq.
3.10 et 3.11) dans lesquelles la dcroissance radioactive est nglige3 . Les condi-
tions aux limites sont les mmes que dans le cas du cylindre de Krogh, cest
dire que le signal dentre est de type porte, avec une valeur maximale de la
concentration gale 0.02 mM , et une dure de 15 s. En sortie (cest dire
aux intersections des canaux avec un des cts autres que le ct gauche), une
condition de flux convectif est impose, il ny a pas de condition de priodicit
impose aux limites pour la concentration, la contrainte sur le champ de pression
tant suffisante.
5.3.3 Cintiques de concentration

Nous avons valu la cintique de la concentration pour les deux gomtries
en prenant la moyenne spatiale du champ de concentration pour chaque instant.
Les cintiques de concentration ainsi obtenues sont prsentes sur la figure 5.12.
3 r 2
Le nombre de Damkhler (Da = Do ), qui permet de comparer les temps caractristiques
de la diffusion et de la dcroissance radioactive, est, dans notre cas, trs petit, par consquent
la contribution de la dcroissance est ngligeable.
110
Fig. 5.10 Champs de concentration obtenus pour quatre instants avec la gomtrie
I (P = 400 P a, Q = 1.4 107 m2 /s).
Fig. 5.11 Champ de concentration obtenu t = 2.5 s avec la gomtrie II (P =

400 P a, Q = 4.7 107 m2 /s).
111
Fig. 5.12 Cintiques de rfrences (courbes en trait plein) obtenues pour la go-
mtrie I en haut, et la gomtrie II, en bas. Les courbes en trait discontinu corres-
pondent au signal de type porte. Pour les deux gomtries, la diffrence de pression
utilise est gale 400 P a
112
Modle homognis
5.4 Modle homognis

Nous disposons donc de tous les lments de rfrence pour lvaluation du
dbit avec le modle homognis. Cependant, pour pouvoir utiliser ce modle, il
reste rsoudre les problmes de fermeture afin dobtenir les paramtres effectifs.
5.4.1 Dtermination des paramtres effectifs

Dans le but dutiliser in fine un modle mixte comptant un modle homog-
nis pour le rseau capillaire et une approche de type rseau pour les artrioles
et les veinules, nous devrions homogniser la gomtrie reprsentant le rseau
capillaire maill, et, ainsi, produire un milieu homogne fictif bidimensionnel de
mme dimension. Dans ce cas, les vitesses effectives et les coefficients de diffusion
effectifs ne sont plus des scalaires mais des tenseurs.
Cependant, la gomtrie homognise tant isotrope, les tenseurs sont sph-
riques. Par consquent, lhomognisation unidimensionnelle du rseau est suffi-
sante pour valuer toutes les composantes des paramtres effectifs. Nous avons
donc utilis la mme mthode que pour la gomtrie de Krogh, qui consiste d-
terminer ces paramtres partir des variables de fermeture obtenues en rsolvant
les trois problmes de fermeture (Eq. 3.51 3.71). Cependant, les quations de ces
problmes font intervenir des intgrales de surface (variables de fermeture C ,
C et av h) qui, lorsque la gomtrie devient complexe, augmentent de manire
importante le cot de la rsolution numrique au point que ces calculs nont pas
abouti pour la gomtrie I sur les machines utilises. Nous avons donc cherch
minimiser le cot de ce calcul en ngligeant, dans les quations des problmes
de fermeture I et II, les termes faisant intervenir un couplage avec le problme III.
Ainsi, la gomtrie II tant plus petite, nous sommes parvenus avec ces sim-
plifications valuer les paramtres effectifs pour diffrentes vitesses moyennes
(Fig. 5.13).
A partir de ce rsultat, une rgression polynomiale a permis dassocier,
chaque paramtre effectif, un polynme traduisant sa dpendance avec la vitesse
moyenne. Les coefficients de ces polynmes sont donns dans le tableau 5.1.
5.4.2 Comparaison avec la simulation numrique directe

Afin de vrifier la validit du modle homognis dfini par les coefficients
effectifs calculs dans la gomtrie II, nous comparons les cintiques de rf-
rences obtenues par simulations numriques dans cette gomtrie et les cintiques
prdites par le modle homognis. En effet, nous nous attendons ce que les
nombreuses simplifications effectues afin dallger le cot de la rsolution num-
rique des problmes de fermeture entachent la prcision des rsultats. Dautant
113
Fig. 5.13 Evolution des paramtres effectifs macroscopiques en fonction de la vitesse

moyenne pour la gomtrie II.)
Coefficients
a b c
3
K 1.9 10 1.38 106 3.62 1012
K 1.65 107 6.71 1011 4.41 1015
K 0 0 4.0158 1010
U 9.6810 0.1062 2.8106 106
U 0 0.015 7.64 107
U 0 3.00 1010 3.46 1014
U 0 5.83 106 6.95 108
5
av h 1.63 10 821.96 0.573
Tab. 5.1 Tableau des coefficients (donns en units SI) formant les polynmes
2
de la forme aVmoy + bVmoy + c associs chacun des paramtres effectifs.
114
plus que nous avions observ sur la gomtrie du cylindre de Krogh que lutili-
sation de problmes de fermetures non coupls diminuait la capacit du modle
homognis prdire la cintique de concentration par rapport lutilisation
de problmes coupls. Nanmoins, cette diffrence restait ngligeable tant que le
dbit tait suffisant pour que la quantit de traceur entrant pendant lintervalle
de temps dinjection permette darriver la saturation du milieu.
Les rsultats obtenus pour diffrentes diffrences de pression sont prsents
sur la figure 5.14.
Nous avons simul numriquement une gamme de diffrences de pression com-
prises entre 1 P a et 500 P a. Cependant, nous avons privilgi la prsentation des
cintiques correspondant aux faibles dbits puisque les cintiques obtenues pour
les dbits suprieurs 5.8 109 m2 /s (> 20 P a) sont en trs bon accord avec les
cintiques de rfrences. Ces rsultats sont donc conformes nos attentes puisque
la suppression des termes de couplage dans les quations des problmes de fer-
meture nimpacte pas la capacit du modle prdire la cintique que pour les
faibles dbits, si lon se rfre aux observations faites pour la gomtrie de Krogh.
5.5 Identification du dbit

Comme nous lavons crit plusieurs reprises, le paramtre pertinent du mo-
dle homognis est la vitesse moyenne. La premire tape de lvaluation du
dbit consiste rsoudre un problme inverse, mais la diffrence du cas de
la gomtrie de Krogh, celui ci permet daboutir lidentification de la vitesse
moyenne (le dbit tant remplac par la vitesse moyenne dans le problme dfini
par lquation 4.18).

Vmoy tq ||Cref (t, Vmoy ) C( t)||2 soit minimum. (5.5)
Nous avons donc, dans un premier temps, rsolu ce problme inverse en utilisant
le modle homognis pour la gomtrie II. Cependant, afin de tester si la
gomtrie II est un bon candidat de volume lmentaire reprsentatif pour la
convection-diffusion, nous avons galement utilis ce modle pour la gomtrie
I en prenant en compte la diffrence entre la taille des deux gomtries. Les
rsultats obtenus partir de la fonction dentre et des cintiques de concentration
de rfrences obtenues dans les deux gomtries sont prsents sur la figure 5.15.
Comme nous avons utilis la mme gamme de diffrences de pression pour les
deux gomtries, la gamme des vitesses moyennes obtenues dans la gomtrie
II dpasse largement la gamme des vitesses moyennes physiologiques. Pour les
vitesses moyennes trs suprieures la valeur haute de la gamme physiologique
(0.5 mm/s), comme on pouvait sy attendre, le modle ne permet pas une identi-
fication correcte. En effet, si lon se rfre aux cintiques obtenues par simulation
numrique, on constate quau dessus dune diffrence de pression de 250 P a (cor-
respondant une vitesse moyenne denviron 2 mm/s dans la gomtrie II) les
115
p = 10 P a
p = 1 Pa
p = 20 P a
p = 4 Pa
p = 400 P a
p = 7 Pa
Fig. 5.14 Cintiques de concentration du modle homognis (symbole o) et ci-

ntique de rfrence (symbole *) pour la gomtrie II. Ces cintiques sont obtenues
pour des diffrences de pression, entre le bord gauche et le bord droit de la gomtrie,
stalant de 1 400 P a.
116
Fig. 5.15 Les deux figures prsentent lvolution de la vitesse moyenne identifie
en fonction de la vitesse moyenne impose. La figure de gauche prsente les rsultats
obtenus pour la gamme physiologique et celle de droite les prsente pour toute la
gamme simule. Les points correspondant aux valeurs identifies avec la gomtrie I,
sont tracs en noir, et avec la gomtrie II, en rouge. )
cintiques nvoluent plus. Par consquent il nest pas possible didentifier partir
des cintiques les vitesses moyennes au dessus de cette valeur (Fig. 5.15, droite).
Par contre, pour les deux gomtries et pour toute la gamme physiologique, les
vitesses moyennes identifies sont en bon accord avec les vitesses moyennes impo-
ses puisque lcart relatif mdian est gal 10.5% pour la gomtrie I sur toute
la gamme simule et infrieur 30% pour la gomtrie II sur la gamme phy-
siologique (Fig. 5.15, gauche). La gomtrie II, bien que son nombre de mailles
soit trs rduit, est donc, daprs ces rsultats, un volume lmentaire reprsen-
tatif pour le problme de convection-diffusion. Par ailleurs, nous avons montr
(5.3.1) que la gomtrie II est un VER de la gomtrie I pour lcoulement.
Par consquent, en utilisant les rsultats prcdents, il est possible dvaluer le
dbit pour la gomtrie I partir de la vitesse moyenne de rfrence (calcule
numriquement) et du coefficient I valu par lquation 5.4. Les dbits ainsi
identifis sont tracs sur la figure 5.16.
Ce dernier rsultat montre que les dbits valus par le modle homognis
pour la gomtrie II sont en trs bon accord avec les dbits imposs puisque
lerreur relative mdiane est ici gale 12% en tenant compte de tous les points
(sa valeur moyenne tant de 7.9% si lon fait abstraction des trois dbits les plus
petits).
117
Fig. 5.16 Dbits identifis sur la gomtrie I partir des paramtres effectifs
calculs sur la gomtrie II et des vitesses moyennes identifies.
5.6 Conclusion et perspectives

Dans ce chapitre, nous avons dmontr la capacit du modle homognis
prdire les cintiques de concentration et le dbit pour une gomtrie modle com-
plexe prsentant des caractristiques topologiques identiques aux caractristiques
connues du rseau capillaire intracortical. Ce rsultat a t obtenu malgr des
problmes de rsolution numrique qui nous ont contraint rduire le nombre de
mailles de la gomtrie et ngliger le couplage dans les problmes de fermeture
ce qui est encourageant au niveau de la robustesse de lapproche propose.
Cependant, les rsultats obtenus par le modle homognis sur cette go-
mtrie correspondent uniquement aux premires tapes de la validation de ce
modle pour la quantification du dbit sanguin. En effet, pour dterminer les pa-
ramtres effectifs valides pour le rseau capillaire intracortical, la gomtrie sur
laquelle les problmes de fermetures sont rsolus devra encore tre complexifie
pour tre considre comme reprsentative. Il faudra, par exemple, tenir compte
de la distribution des diamtres des vaisseaux capillaires et probablement tendre
la mthode une gomtrie tridimensionnelle.
Par consquent, le cot de calcul sera ncessairement augment et cest pour-
quoi, il est indispensable de trouver une solution permettant de le minimiser.
Lune des pistes permettant la rduction du cot de calcul consiste dcomposer
les variables de fermeture pour faire disparatre les termes faisant intervenir des
118
Conclusion et perspectives
intgrales de surface dans les problmes de fermeture.

La seconde piste envisage consiste effectuer un double changement dchelle
permettant de transformer les canaux en segments dans lesquels les quations de
transport sont intgres sur la largeur et rcrites en formulation faible (Ahmadi
et al., 2001.).
119
120
6
Dans ce manuscrit, des conclusions partielles ayant t prsentes dans chaque
chapitre, nous ne reprendrons, ici, que les points les plus importants de ce travail
et nous insisterons sur les perspectives suivre.
Nous avons commenc ce travail par une tude bibliographique concernant les
modles permettant lidentification du dbit partir de la cintique de concen-
tration mesure en TEP. Cette tude de la bibliographie a permis de mettre en
vidence que, pour lvaluation clinique du dbit sanguin crbral, le modle cin-
tique le plus souvent utilis est le modle de Renkin-Crone. Ce modle, comme la
grande majorit des modles cintiques existants, est un modle compartimental
bas sur la modlisation des changes entre un capillaire unique et son enveloppe
de tissu : la gomtrie de Krogh. Cependant, cette gomtrie est dfinie lchelle
microscopique alors que les modles cintiques sont utiliss une chelle sup-
rieure, lchelle du voxel. De plus, dans la littrature, il est admis que ces modles
sont peu performants.
Nous avons donc dvelopp un modle homognis, reposant sur la prise de

moyenne volumique des quations de transport de lchelle microscopique. Ce
changement dchelle permet de construire, partir de la gomtrie tudie, un
milieu fictif homogne dont les quations macroscopiques permettent de dcrire
lvolution de la concentration moyenne lchelle du voxel.
Pour tester la validit de la dmarche et la capacit du modle homognis

identifier le dbit, nous avons, dans le chapitre 4, compar les rsultats obtenus
par le modle de Renkin-Crone avec ceux obtenus par le modle homognis
appliqu la gomtrie de Krogh. Les rsultats ainsi obtenus ont dmontr que
le modle homognis permet non seulement didentifier le dbit de faon accep-
table mais galement de prdire la cintique de concentration. La comparaison
des rsultats entre les deux modles a donc permis, dune part, de valider la d-
marche que nous avons entreprise, et, dautre part, de rvler un problme majeur
121
des modles compartimentaux : ces derniers utilisent un paramtre, le coefficient

de permabilit P , dont lvaluation nest pas possible. En effet, nous avons mon-
tr que, pour obtenir des rsultats corrects avec le modle de Renkin-Crone, ce
paramtre doit tre une fonction du dbit alors quil reprsente une constante
physiologique.
Notre dmarche ayant t valide sur une gomtrie trs simple, nous avons,
dans un second temps, gnralis la mthode une gomtrie plus complexe et
test la capacit du modle homognis identifier le dbit pour une gomtrie
modle plus proche de la gomtrie du rseau capillaire crbral maill. Pour cela,
nous avons gnr une gomtrie base sur un diagramme de Vorono permettant
de reproduire certaines proprits du rseau capillaire maill. Ainsi, la gomtrie
obtenue correspond un rseau alatoire qui devient homogne au dessus dune
longueur de coupure identique celle identifie pour le rseau de capillaires.
Encore une fois, les rsultats obtenus par le modle homognis sont encou-
rageants. En effet, les dbits identifis et les cintiques prdites par le modle sont
en accord avec les rsultats des simulations numriques.
Le modle homognis semble donc un bon candidat pour lvaluation quanti-

tative du dbit sanguin par tomographie mission de positrons, cependant, avant
dobtenir les paramtres effectifs permettant cette valuation, dautres tapes
nous paraissent indispensables.
En effet, les gomtries utilises au cours de ce travail sont des gomtries mo-
dles encore trop simples pour tre reprsentatives du rseau capillaire crbral
maill. Cest pourquoi il faudra envisager des gomtries modles plus complexes,
tenant compte, par exemple, de la distribution connue des diamtres des capil-
laires (Cassot et al., 2006.). Dans ce cas, le caractre non newtonien du sang,
dont la viscosit est trs sensible aux variations de diamtre ne pourra plus tre
nglig (Pries et al., 1996.). Cest pourquoi, la viscosit devra tre dcompose
en la somme dune viscosit moyenne plus une dviation spatiale et une prise
de moyenne sur la loi de viscosit (Pries et al., 1990.; Kiani & Hudetz, 1991.)
devra tre effectue afin dobtenir une loi macroscopique dcrivant lvolution de
la viscosit moyenne.
Enfin, le modle devra tre tendu pour tenir compte du caractre tridimen-
sionnel du rseau capillaire maill. En plus des tudes sur des gomtries modles
telles que celle prsentes, des gomtries reconstruites partir des donnes ana-
tomiques (Fig. 5.1) pourront tre utilises, mais cela ncessitera de relaxer les
conditions de priodicit utilises dans les problmes de fermeture. Pour cela, des
pistes existent comme en tmoignent les travaux de Quintard & Whitaker (1990.).
Une fois lhomognisation dune structure relle effectue, il faudra tenir

compte du fait que la densit des vaisseaux capillaires dans le cerveau est variable
et spatialement rpartie lchelle macroscopique (Lauwers et al., 2008). Pour
122
cela, il sera ncessaire dappliquer le modle homognis sur plusieurs mailles
reprsentatives des diffrentes rgions du cerveau afin den dduire les relations
entre les paramtres effectifs et la densit vasculaire.
Enfin, lorsque ces paramtres effectifs auront t dtermins, ceux-ci pourront
tre utiliss dans un modle mixte, couplant le modle homognis prsent ici
avec une approche de type rseau pour tenir compte de la partie fractale du rseau
vasculaire (veinules et artrioles) (Fig. 6.1). Dans cette approche, les paramtres
effectifs seront distribus spatialement afin de prendre en compte les variations
de la densit connues, dans la profondeur par exemple.
Fig. 6.1 Images reprsentant deux artrioles (A) et une veinule (V) sur une zone
dpaisseur 300 m (F. Cassot).
En conclusion, nous avons au cours de ce travail pos les bases dun modle
prsentant des rsultats encourageants mais dont le dveloppement doit encore
tre poursuivi. En effet, bien quayant t dvelopp dans le cadre de lvaluation
du dbit crbral en TEP, qui utilise comme traceur de leau radiomarque, ce
modle est directement utilisable pour tout autre marqueur dissous dans la phase
sang puisque, selon les travaux de Guibert et al. (2009.), linfluence des htrog-
nits du taux dhmatocrite sur lcoulement (distribution de pression) est trs
faible. Par contre, si lon souhaite tudier, avec ce modle, la cintique de rpar-
tition dun traceur li au globules rouges comme loxygne, il faudra tenir compte
de leffet de sparation de phase se produisant chaque bifurcation du rseau.
En effet, on sait que les implications lies la distribution de loxygne dans le
cerveau sont importantes, tant du point de vue physiologique que pathologique
et que ce traceur endogne est la base de limagerie par rsonance magntique
fonctionnelle utilise en neuro-imagerie.
123
124
Protocoles exprimentaux
Sommaire
A
A.1 Elaboration du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
A.1.1 Prparation des surfaces . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
A.1.2 Assemblage et injection du gel liquide . . . . . . . . . 126
A.1.3 Polymrisation du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
A.1.4 Prparation des couches de gel polymris avant leur
assemblage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
A.1.5 Assemblage des deux couches de gel . . . . . . . . . . 127
A.2 Droulement dune exprience . . . . . . . . . . . . . 128
A.2.1 Injection de la solution de fluorescine . . . . . . . . . 128
A.2.2 Acquisition des images . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
A.2.3 Rinage du gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
125
Dans cette partie, nous allons voir en dtail le protocole utilis pour obtenir les
rseaux dans le gel dalginate. Bien que ce protocole ait t dvelopp initialement
par lquipe de A. D. Stroock Cabodi et al. (2005.), nous avons rencontr un
grand nombre de difficults nous conduisant le modifier. Dans cette section,
nous verrons donc le protocole, puis nous dtaillerons les points dlicats pouvant
conduire lchec de lexprience.
A.1 Elaboration du gel

Llaboration de microcanaux dans du gel dalginate ncessite au pralable de
disposer de lempreinte en PDMS du rseau, du wafer, dune solution 4% en
masse de gel dalginate, dune solution de CaCl2 60 mM et du support pour le
moulage.
A.1.1 Prparation des surfaces

Pour que le gel accroche sur le support, un traitement de surface est ncessaire.
Les entretoises, le moule en PDMS et la plaque de verre supportant les tubes
dalimentation sont donc nettoys avec de lthanol, schs lazote, passs dans
un four plasma pendant une minute puis, uniquement pour les entretoise et la
plaque de verre, une solution de trichlorosilane est dpose (environ 1000 L) sur
les surfaces qui seront en contact avec le gel. Cette solution est ensuite vapore
laissant un lger film de polymre sur les surfaces qui facilitera laccrochage du
gel.
A.1.2 Assemblage et injection du gel liquide

Les supports sont assembls dans le but dinjecter le gel liquide dans le vo-
lume form par les entretoises. Sur le premier support ce volume et ferm dun
cot par la plaque de verre supportant la connectique et de lautre cot par la
membrane et la grille. Pour le second support, le volume cr par lentretoise est
ferm par le moule en PDMS et de lautre cot par la membrane et la grille comme
le montre la photo A.2. Ltape dassemblage doit tre effectue de manire trs
minutieuse. En effet, le positionnement de la membrane par rapport lentretoise
doit tre correctement fait sous peine de dchirer le gel au moment du dmoulage.
La prparation du gel liquide introduit des bulles dair, il doit donc tre dgaz
dans une cloche vide. Le remplissage de la seringue peut galement faire appa-
ratre des bulles quil faut absolument viter dintroduire dans le support lors de
linjection. Le gel est inject laide dune seringue par le tube dinjection de la
grille aprs avoir clamp la connectique de la plaque de verre. Linjection doit se
faire doucement en inclinant le support pour bien mouiller les parois et le rseau
jusqu ce que le gel dbrde lgrement par le trou dvacuation de la grille.
126
Elaboration du gel
A.1.3 Polymrisation du gel

Initialement le protocole prvoyait de disposer la solution de CaCl2 dans les
rservoirs du support au dessus de la grille (Fig. A.2a). Cependant, nous nous
sommes rendus compte que la membrane trop souple permettait au gel dpouser
la forme de la grille, crant un lger relief au niveau de chaque trou de la grille.
Cest pourquoi nous avons remplac la grille par un poreux plus rigide. Cela sest
traduit par un allongement considrable du temps de diffusion (de 2h 10h) et
nous avons donc choisi dimmerger totalement les supports dans le CaCl2 .
A.1.4 Prparation des couches de gel polymris avant

leur assemblage
Cest ltape la plus dlicate du processus dlaboration du rseau. Elle consiste
retirer les supports de la solution de CaCl2 , dclamper la connectique, puis,
enlever le poreux (Fig. A.2b) et la membrane (Fig. A.2c) tout en veillant ce
quil y ait en permanence un film de CaCl2 sur le gel. Avant de retirer la mem-
brane qui reste colle au gel, il faut enlever laide dun scalpel le surplus de
gel qui sest plac au niveau des connectiques dinjection du gel. Si la premire
tape na pas t correctement effectue, la membrane ne se dcollera pas bien,
entranant une dtrioration soit du gel, soit de la membrane. Tous les lments
retirs sont plongs dans la solution de citrate de sodium pour les dbarrasser du
gel. A ce stade, pour finir la prparation des couches de gel, il faut dboucher la
connectique fixe la plaque de verre. En effet, bien quelle soit clampe lors de
linjection, une petite quantit de gel parvient sy introduire. Pour cela, on en-
fonce un emporte pice de diamtre lgrement infrieur au diamtre des tuyaux
travers le gel puis la connectique. Enfin, on injecte du CaCl2 dans chacun des
tuyaux pour vacuer les dbris et vrifier que tous sont bien dbouchants. Cette
manuvre peut, dans certains cas, entraner le dcollement du gel de la plaque de
verre, signifiant dans ce cas que lensemble du processus doit tre recommenc.
A.1.5 Assemblage des deux couches de gel

Une fois les deux couches de gel prtes pour lassemblage, une lamelle de verre
est installe sur le grand support, le rservoir permettant sa fixation sur le gel
(Fig. A.2d). Le moule en PDMS est retir (Fig. A.2e) et sa place, on introduit
le second support qui vient mettre les deux couches de gel en contact (Fig. A.2f).
Encore une fois, il faut viter au maximum lintroduction de bulle dair et le
desschement du gel lors de cette tape. Le rglage du serrage entre les deux
supports est galement source de problme puisquun trop fort serrage va craser
les couches de gel et le rseau alors que sil est trop faible, des fuites apparatront
entre les deux couches.
127
A.2 Droulement dune exprience

Le rseau confin dans son support est compris entre deux lamelles de verre. Il
autorise donc la mesure optique de la concentration. Pour cela il est plac entre le
panneau de LED et la camra. Le panneau de LED tant situ une trentaine de
centimtres pour que la lumire traversant le rseau soit le plus parallle possible.
Le filtre est situ sur lobjectif (60mm) de la camra, la position du filtre ayant
galement t teste la sortie du panneau de LED sans modification du signal
enregistr par la camra.
A.2.1 Injection de la solution de fluorescine

Pralablement linjection de fluorescine, un coulement de CaCl2 est im-
pos, ce qui permet dvacuer les bulles dair qui auraient pu tre introduites et
ainsi de saturer le rseau. Les entres des rseaux sont formes de branches en Y
qui permettent dinjecter la fluorescine sans avoir dbrancher la seringue de
CaCl2 . Le dbit de lcoulement est contrl par un pousse-seringue et la sortie
est laisse libre, la pression atmosphrique.
A.2.2 Acquisition des images

Lacquisition des images commence avant larrive du colorant dans le rseau
ce qui permet davoir une image de rfrence pour la mesure de lattnuation. Le
logiciel de la camra (CamWare) permet un rglage fin des paramtres dacqui-
sition (frquence dacquisition pilote par un GBF, temps dexposition...). Afin
que la temprature et les paramtres extrieurs ninfluent pas sur les rsultats,
lexprience est ralise dans une salle noire dont la temprature est rgule et
lallumage du panneau de LED est synchronis avec le GBF.
A.2.3 Rinage du gel

Une fois lacquisition du gel termine, la solution de CaCl2 est de nouveau
injecte pour chasser le colorant. Cette tape est longue car, le rinage de la
matrice ne se fait que par rtrodiffusion de la matrice vers le rseau.
128
Fig. A.1 Vue en coupe. Les surfaces traiter des entretoises (en bleu) sont mises en
vidence en orange. Au milieu : le PDMS dont le traitement se limite un nettoyage
lthanol suivi dun passage dans le four plasma.
129
Fig. A.2 Vue en coupe des assemblages en vue de : a) linjection du gel et de la
polymrisation, b, c, d) la prparation des couches de gel, et e) de lassemblage des
deux couches de gel.
130
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136
Liste des symboles
Oprateurs :
1 R
h i Moyenne superficielle : h i = V dV .
h i Moyenne intrinsque : h i = 1 R
V V dV .
Indices et exposants :
Lindice dsigne une grandeur appartenant la phase sang.
Lindice dsigne une grandeur appartenant la phase tissu.
Dviation spatiale pour la variable .
Variables :
A Surface de linterface entre les phases. et m2 .

av h Coefficient dchange.
Concentration artrielle. mol.m3 .

Ca
Concentration moyenne dans la bote noire. mol.m3 .

C bn
Concentration dans le capillaire. mol.m3 .

Cc
Concentration du traceur inject dans le systme. mol.m3 .

Ci
Concentration en traceur du sang entrant dans le systme. mol.m3 .

Cin
Concentration en traceur du sang sortant du systme. mol.m3 .

Cout
Concentration dans le tissu. mol.m3 .

Ct
CT EP Concentration mesure en TEP. mol.m3 .

Concentration veineuse. mol.m3 .

Cv
Clairance. m3 .s1 .

Cl
Coefficient de diffusion du traceur dans le tissu. m2 .s1 .

D
137
Liste des symboles
Coefficient de diffusion du traceur dans la phase . m2 .s1 .

D
Coefficient de diffusion du traceur dans la phase . m2 .s1 .

D
e Epaisseur de la membrane. [m].
E Coefficient dextraction.

Porosit de la phase : = .

Porosit de la phase : = .
Gin
FT Fonction de transfert de la bote noire. FT = Gout .
Gin Grandeur dentre de la bote noire (Dbits, quantit ou flux de traceur).

Gout Grandeur de sortie de la bote noire (Dbits, quantit ou flux de traceur).
h(t) Fonction de transfert impulsionnelle normalise.
H(t) Fraction de traceur sortie du systme linstant t depuis linstant t = 0. [mol].
Densit de flux de traceur entrant dans llment de volume dV . mol.s1 .m2 .

j1
Densit de flux de traceur sortant de llment de volume dV . mol.s1 .m2 .

j2
j3 Densit de traceur passant de llment de volume dV dans le tissu.
de flux
mol.s1 .m2 .

Flux de traceur provenant de lartre entrant dans le capillaire. mol.s1 .

Ja
Flux diffusif. mol.s1 .

Jd
Flux de traceur inject dans le systme. mol.s1 .

Ji
Flux du sang sortant du systme par convection. mol.s1 .

Jout
Flux traceur passant du capillaire dans le tissu. mol.s1 .

Jt
Flux traceur provenant du capillaire sortant dans la veine. mol.s1 .

Jv
Coefficient dchange du capillaire vers le tissu. m3 .s1 .

K1
Coefficient dchange du tissu vers le capillaire. m3 .s1 .

k2
kadb 3 1 dchange du tissu vers le capillaire du modle Adiabatic homogeneity.
Coefficient
m .s .
K Tenseur effectif de diffusion.
Constante de dcroissance radioactive de leau radio-marque. s1 .

L Longueur du capillaire. [m].

d Coefficient de partition.
n Vecteur unitaire normal la linterface entre et , orient de vers .
138
Liste des symboles
Coefficient de Permabilit de la membrane. m.s1 .

P
Dbit sanguin. m3 .s1 .

Q
Dbit dinjection du traceur dans le systme. m3 .s1 .

Qi
r0 Rayon du capillaire. [m].
R Rayon extrieur du cylindre de tissu. [m].
R(t) Rsidu : quantit de traceur prsente dans le systme linstant t. [mol].
Surface dchange entre le capillaire et le tissu. m2 .

S
t Variable dsignant le temps. [s].
T Coefficient de transmission.
T Temps de transit moyen. [s].
u Vitesse effective.
Vecteur vitesse de lcoulement dans la phase . m.s1 .

V
Vitesse (constante) du sang dans le capillaire. m.s1 .

V0
Vmax Vitesse maximum du dans la phase . m.s1 .

Volume total : = + m3 .

Volume de la bote nore. m3 .

bn
Volume de la phase . m3 .

Volume du capillaire. m3 .

c
Volume de distribution (volume fictif). m3 .

d
Volume de de traceur inject dans le systme. m3 .

i
Volume de la phase . m3 .

Volume de tissu. m3 .

t
Volume total. tot = c + t . m3 .

tot
139

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DOCTORAT DE LUNIVERSIT DE TOULOUSE

Prsente et soutenue par Ian Billanou

Ecole doctorale : Mcanique, Energtique, Gnie civil, Procds

Ce travail, financ par le centre de recherche sur la peau des laboratoires

Je tiens galement adresser mes remerciements A. Ahmadi-Senichault et

Sur un plan moins professionnel mais nanmoins important, je tiens galement

2 Quantification du dbit sanguin crbral : Etat de lart 7

3 Modlisation avec changement dchelle 39

3.2.1 Les diffrentes chelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

5 Changement dchelle appliqu une gomtrie plus raliste 103

6 Conclusion et perspectives 121

A Protocoles exprimentaux 125

Liste des symboles 137

1.2 La circulation sanguine

1.3 La circulation vasculaire crbrale

1.4 La Tomographie Emission de Positrons

lapport en eau radio-marque est important et plus la probabilit dmission de

1.5 Objectif de ce travail

dune mthode inverse. Pour cela, lvolution temporelle du champ de concentra-

Fonction dentre : Le traceur radioactif est inject par voie intraveineuse,

Architecture du rseau vasculaire crbral : Le rseau vasculaire cr-

sur la description du rseau vasculaire musculaire propose antrieurement par

Physiologie : la physiologie crbrale est unique plus dun titre. Comme

2.2 Approche de type bote noire

2.2.1 Hypothses de lapproche bote noire

Le systme est stationnaire,

2.2.2 Cas de linjection constante de traceur

En sortie du systme, cause du processus mlangeur, la concentration est ho-

Jout = Cout ()(Qi + Q) (2.3)

Dans le cas dun traceur inerte, il ny a pas de consommation ni de production

Ci Qi = Cout ()(Qi + Q) (2.4)

A partir de lquation 2.4, le dbit peut tre valu.

2.2.3 Cas de linjection constante avec flux diffusif

diffusif Jd scrit comme la diffrence des flux convectifs entrant et sortant du

Coefficient de partition et volume de distribution :

Ce coefficient est diffrent de un si laffinit chimique du traceur pour le sang est

R() = C bn ()bn = Cout ()d (2.12)

A partir des quations 2.11 et 2.12, il est possible dexprimer le coefficient de

Cette dfinition du coefficient de partition est lorigine de la confusion entre

Units du coefficient de partition

2.2.3.2 Estimation du dbit

2.2.4 Cas de linjection de type bolus

Lquation 2.17 permet donc dexprimer le dbit

comme tant linverse de lintgrale de la concentration du traceur totalement

2.2.4.1 Fonction de distribution des temps de transit et fonctions as-

En effet, la quantit sortante du systme ne peut pas tre ngative, ni suprieure

Lintroduction de la fonction h(t) permet de dfinir deux fonctions associes. La

La fonction rsidu R(t) dj prsente, reprsente la fraction de traceur toujours

R(t) est donc le complment de H(t) et correspond au type de fonction mesure

2.2.4.2 Le temps de transit moyen

ou encore en fonction du volume de distribution Vd et du dbit.

2.3 Approche compartimentale

2.3.1 Le modle de Kety

ment mlangs et la diffusion dans le compartiment vasculaire est totalement n-

La concentration tissulaire Ct est donc directement proportionnelle au rsidu

2.3.2 Mesure du dbit avec le modle de Kety

de conservation de la masse permet dcrire pour le compartiment vasculaire que

Lutilisation de ce coefficient dans lquation 2.35 donne :

La concentration dans le canal Cc varie le long du canal de Ca Cv . Cependant

Lutilisation des quations 2.35 et 2.37 donne lexpression suivante du flux de

Pour dterminer k2 , on se place lquilibre, cest dire lorsque t tend vers

Ce qui donne un coefficient dchange k2 gal :