De la recherche bibliographique

à la lecture critique d’articles

Staff de santé publique
19 janvier 2010
Dr Marion ALBOUY-LLATY

Staff SP 19/01/2011 1
 Évolution des connaissances
Sackett DL. EBM 1996 ; Haynes RB. ACP J Club 1993 ; Shaneyfelt et al. JAMA 1999

• 80% des prescriptions concernent des médicaments

non vus en formation initiale
• 50% des connaissances se périment en 7 ans
• Pour un médecin interniste (20 journaux, 6000 articles/ an)
– Souhaitable : lecture de 19 articles / jour
– Observé : durée moyenne de lecture 2 h / sem
• 90% de la littérature publiée n’atteint pas les standards
minimum de qualité
• 50% des recommandations conformes aux standards
d’élaboration et de présentation
• Recommandations non connues des professionnelles
Staff SP 19/01/2011 2
 Évolution des connaissances
Sackett DL. EBM 1996 ; Haynes RB. ACP J Club 1993 ; Shaneyfelt et al. JAMA 1999

• 80% des prescriptions concernent des médicaments

non vus en formation initiale
• 50% des connaissances se périment en 7 ans
Recherche
• Pour un médecin interniste (20 journaux, 6000 articles/ an)
– Souhaitable : lecture de 19 articles / jour
bibliographique et LCA
– Observé : durée moyenne de lecture 2 h / sem
• 90% de la littérature publiée n’atteint pas les standards
de qualité obligatoires !!!!
minimum de qualité
• 50% des recommandations conformes aux standards
d’élaboration et de présentation
• Recommandations non connues des professionnelles
Staff SP 19/01/2011 3
 Recherche biblio =
savoir ce que l’on cherche
• des livres ou des thèses?
⇒ Catalogue de bibliothèque
• des informations?
⇒ Sites web
• des sites?
⇒ Moteurs de recherche
• des articles?
⇒ Bases de données (gratuites ou payantes)

Staff SP 19/01/2011 4
 2 types de littérature
• Littérature « blanche » = publiée ou éditée
– Articles de périodiques
– Livres
• Littérature « grise » = non commercialisée
– Thèses, mémoires
– Rapports
– Plaquettes, brochures, brevets, normes

Staff SP 19/01/2011 5
 Catalogues de bibliothèque

Staff SP 19/01/2011 6
http://www.bium.univ-paris5.fr/medecine/debut.htm
 Catalogues de bibliothèque

Staff SP 19/01/2011 7
http://scd.univ-poitiers.fr
Sites Web

Staff SP 19/01/2011 8
Sites Web ex-URCAM

Staff SP 19/01/2011 9
 Bases de données
• MEDLINE : articles de revues biomédicales
• Sciencedirect: articles de revues biomédicales
• BDSP (Banque de Données Santé Publique) : http://www.bdsp.tm.fr
• BIBLIOINSERM (INSERM) : sciences
• BIBLIOVIE (CNRS) : sciences
• PASCAL : sciences et techniques
• FRANCIS : Fichier de Recherches Bibliographiques Automatisées
sur les Nouveautés, la Communication et l'Information en Sciences
humaines et sociales
• PSYDOC : psychiatrie
TOXLINE: Toxicologie
• ……

Staff SP 19/01/2011 10
 MEDLINE
Comment accéder à MEDLINE?
Comment se faire aider ?
Comment faire une recherche libre ?
Comment faire une recherche par mot-clé ?
Comment faire le tri ?
Comment sauvegarder sa recherche ?
Comment accéder aux textes complets ?
Staff SP 19/01/2011 11
 PubMed
• Interface d’interrogation permettant de consulter
– la base MEDLINE
– les pré-citations de MEDLINE
– les bases spécialisées du NCBI
• Produit développé conjointement par
– le National Center for Biotechnology Information (NCBI)
– la National Library of Medicine (NLM, Bethesda, USA) :
The literature Selection technical review commitee sélectionne
>4800 revues à indexer
– les éditeurs de revues biomédicales
• http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez
Staff SP 19/01/2011 12
Staff SP 19/01/2011 13
 Recherche libre
• [ Text word ]
• Ecriture
– Opérateur booléen AND (par défaut), OR, NOT
– Ponctuation importante (Expression précise = « » )
– Troncature (*)
• 4 listes
– [MeSh Translation Table]
– [ Journals Translation Table ]
– [ Phrase List ]
– [ Author Index ]
• Avantage : repère les références pas encore indexées
• Inconvénient : nombreux résultats
Staff SP 19/01/2011 14
 Titre en lien
Premier auteur

Revue, année, volume

Staff SP 19/01/2011 15
Staff SP 19/01/2011 16
Staff SP 19/01/2011 17
Display settings : MEDLINE

Staff SP 19/01/2011 18
Différentes bases de données MEDLINE

Staff SP 19/01/2011 19
Staff SP 19/01/2011 20
Staff SP 19/01/2011 21
Comment faire une recherche par mot-clé ?

Staff SP 19/01/2011 22
http://www.nlm.nih.gov/bsd/viewlet/mesh/subheadings/mesh3.html
Staff SP 19/01/2011 23
Staff SP 19/01/2011 24
Comment sélectionner quelques articles ?

Presse papier qui regroupe les documents

sélectionnés par l’utilisateur
Mémorise temporairement (8h) 500 références
Staff SP 19/01/2011 25
Staff SP 19/01/2011 26
Comment sauvegarder sa recherche ?

Staff SP 19/01/2011 27
 S’inscrire sur NCBI +++

Staff SP 19/01/2011 28
http://www.nlm.nih.gov/bsd/viewlet/myncbi/saving_searches.html
Staff SP 19/01/2011 29
Comment faire le tri ?

Staff SP 19/01/2011 30
Staff SP 19/01/2011 31
Staff SP 19/01/2011 32
Comment accéder aux textes complets ?

Staff SP 19/01/2011 33
http://nnlm.gov/training/resources/fulltexttri.pdf
 Staff SP 19/01/2011 34
http://nnlm.gov/training/resources/fulltexttri.pdf
 Sélection des articles
• Comment récupérer les articles?
– Lien vers éditeur dans Pubmed
• Parfois gratuit
• Parfois disponible à partir de la fac ou en format papier
– Éditeurs accessibles par le SCD de l’université de
Poitiers (depuis la fac et de chez vous avec votre
compte fac):
• Sciencedirect (+ depuis le CHU)
• Springerlink
• PsycArticles
• …

Staff SP 19/01/2011 35
 Sélection des articles
• Ma stratégie:
1. Cliquez sur le lien vers l’éditeur
– Si gratuit
OK
– Si payant
2
2. Qui est l’éditeur ?
– = sciencedirect / springerlink
OK (direct depuis la fac /
identification depuis chez vous)
– ≠
3
3. Catalogue SCD Université
– Soit électronique
suivre instructions
– Soit papier
BU (médecine ou sciences)
– Si rien
prêt entre bibliothèque (payant): 05.49.45.43.74
ou Peb.Med.Phar@univ-poitiers.fr
Staff SP 19/01/2011 36
Staff SP 19/01/2011 37
Staff SP 19/01/2011 38
BIBLIOINSERM (codes)

Staff SP 19/01/2011 39
BIBLIOVIE (codes)

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Staff SP 19/01/2011 41
 TOXLINE

•effets sur la santé des produits chimiques et des médicaments

depuis 1965
périodiques et littérature grise+++
une adresse et >10 basesStaffdeSPdonnées
19/01/2011
de toxicologie 42
NOSOBASE

Staff SP 19/01/2011 43
BDSP

Staff SP 19/01/2011 44
Staff SP 19/01/2011 45
ENDNOTE

Staff SP 19/01/2011 46
 Début de la LCA
• Comment faire pour sélectionner les articles à
lire?
– Lire le titre
– Lire le résumé
– Les auteurs
– La langue de la revue
– L’Impact Factor de la revue
– Si intéressant, conservez la référence ou récupérer
l’article pour une lecture plus approfondie

Staff SP 19/01/2011 47
 Titre
• Court (15 mots)
• Informatif
– Thème
– Intervention évaluée
– Plan expérimental
– Population concernée

Staff SP 19/01/2011 48
 Résumé
• 150 (Vancouver)-300 mots
• Utilisable sorti du contexte de l’étude
• IMRAD
– pourquoi? Comment? Résultat principal? Conclusion?
– 1-2 phrases par partie. Chiffres et test stats dans résultats.
• Plus structurés si essais cliniques:
– but de l’étude
– protocole et méthodes de l’étude
– lieu et condition de réalisation de l’étude
– description de la population et des critères de sélection
– traitements ou méthodes d’intervention
– critères de jugement
– méthodes d’analyse et principaux résultats
– conclusions principales et applications pratiques
Staff SP 19/01/2011 49
 Auteurs
• 1er auteur : celui qui a réalisé ou dirigé le travail et rédigé
le manuscrit
• Dernier auteur: chef de service ou directeur de
recherche (caution)
• Lieu d’exercice : insertion hospitalière et/ou universitaire

• On ne cite tous les auteurs que si moins de 7 sinon les 6

premiers + et al

Staff SP 19/01/2011 50
Exemples de revues

Staff SP 19/01/2011 51
 Cas clinique et Article original

Exposé d’un travail

Observation de recherche
commentée d’un fondamentale,
patient clinique ou
épidémiologique

Staff SP 19/01/2011 52
Lettre à la rédaction et Éditorial

Résultats Opinion sur un sujet

préliminaires ou d’un expert,
critique de travaux commandité par
publiés comité rédaction

Staff SP 19/01/2011 53
 Revue et Méta-analyse

Analyse critique de Combinaison des

l’ensemble des résultats d’études
travaux sur un antérieures sur un
thème précis même sujet
(puissance)

Staff SP 19/01/2011 54
Analyse commentée et Article didactique

Résumé d’un article Article pédagogique

paru récemment + pour des lecteurs
critique de la naïfs du sujets
validité des
résultats

Staff SP 19/01/2011 55
Article original
2) Revue
3) Mots-clés
4) Titre
5) Auteurs

6) Résumé

1) Année
Staff SP 19/01/2011 56
 Structure de l’article
• IMRAD
Introduction
Matériel et méthodes
Résultats
And
Discussion
± conclusion
Staff SP 19/01/2011 57
 Introduction
1. Position du problème
• Mise au point sur les connaissances actuelles concernant le
problème étudié
• Fait appel à des références bibliographiques
2. Aspect particulier du problème – hypothèse
• Justification de l’étude mise en œuvre (pour combler les lacunes
dans le domaine)
3. Objectif du travail
• Dernière phrase de l’introduction
• Verbe à infinitif

• Temps des verbes :

– présent pour les données communément admises
– Passé pour rapporter des faits passés
Staff SP 19/01/2011 58
 Matériel et méthodes
1. Environnement de la recherche (Structures,
Périodes)
2. Population
3. Type d’étude
4. Schéma expérimental
5. Données recueillies
6. Analyse statistique

• Temps des verbes : passé

Staff SP 19/01/2011 59
 Matériel et méthodes
• Population
– Population cible = à laquelle on veut extrapoler les
résultats
– Population source = d’où on tire l’échantillon
– Échantillon = sur laquelle on fait l’étude
– Définir
• Critères d’éligibilité
• Critères d’inclusion
• Critères d’exclusion (définitions référentiels …)
• Méthodes de recrutement
• Choix des témoins

Staff SP 19/01/2011 60
 Matériel et méthodes
• Type d’étude = dépend de l’objectif
– Estimer un paramètre ou décrire un phénomène (étude
descriptive)
– Évaluer si certaines caractéristiques des individus ou de leur
environnement sont associés à un risque plus élevé de maladie
(étude de causalité)
– Évaluer l’effet d’une action de santé (prévention, dépistage,
traitement médicamenteux ou non…)
– Évaluer la performance d’un test diagnostique (étude
diagnostique)
– Évaluer si certaines caractéristiques des individus ou de leur
environnement sont associés à un risque plus élevé de
complications ou de séquelles (étude pronostique)
Staff SP 19/01/2011 61
 Matériel et méthodes
• Schéma expérimental
L’investigateur impose-t-il l’exposition à un facteur ?

Oui Non

Etude expérimentale Etude observationnelle

Randomisation ? Groupe comparateur ?

Oui Non Oui Non

Etude analytique ou Etude descriptive

étiologique

Essai contrôlé Etude non Etude transversale Etude transversale

randomisé randomisée comparative non comparative
(prévalence)
Cohorte exposés
non exposés (prospective Cohorte: étude
ou rétrospective) longitudinale (prospective
Staff SP 19/01/2011 ou historique), d’incidence 62
Cas-témoins
(rétrospective)
Tableau I : Grade des recommandations.

NIVEAU DE PREUVE SCIENTIFIQUE

FOURNI PAR LA LITTERATURE

Niveau 1
- Essais comparatifs randomisées de forte puissance
- Méta-analyses d’essais comparatifs randomisés
- Analyse de décision basée sur des études bien menées

Niveau 2
- Essais comparatifs randomisés de faible puissance
- Etudes comparatives non randomisées bien menées
- Etudes de cohorte

Niveau 3
- Etudes cas-témoins
Niveau 4
- Etudes comparatives comportant des biais importants
- Etudes rétrospectives
- Séries de cas
- Etudes épidémiologiques descriptives (transversale,
longitudinale)

Staff SP 19/01/2011 63
 Matériel et méthodes
• Données recueillies
– Critère de jugement principal =
• variable qui va permettre de tester l’hypothèse avancée
• Définition? Classifications

– Variables à expliquer
– Variables explicatives(facteurs d’exposition…)
– Variables d’ajustement
– Mesure – recueil des données ?
• Comment? Prise de sang - questionnaire
• Quand? A jeun
• Qui? Automate de laboratoire – attaché de recherche clinique
• Qui saisit les données?

Staff SP 19/01/2011 64
 Matériel et méthodes
• Analyse statistique
– Analyse uni(bi)variée
• Comparaison de moyennes (Student) ou % (chi2)
ou courbes de survie (logrank) au seuil α=5%
– Analyse multivariée
• régression logistiques, linéaire, analyse de
(co)variance, modèle de Cox au seuil α=20%
• Facteur de confusion à neutraliser = ajustement
– NSN
– Logiciel

Staff SP 19/01/2011 65
 Résultats
• Aucun résultat dans parties méthode et discussion
• Résultats sans discussion dans partie résultats
• Pas de redondance entre texte, tableaux et figures
• Lecture des tableaux ou figures indépendamment du texte
• Cohérence des chiffres (totaux)
• Temps: passé
• Étapes
1. Participants (Diagramme de flux,Raisons de non participation)
2. Description des données sociodémographiques
3. Description du critère de jugement
4. Présentation analyse univariée
5. Recherche de confusions ou d’interactions
6. Résultats de l’analyse multivariée
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Résultats : Tableaux et Figures
• Forme
– le type de représentation est-il adéquat ?
– (tableau ou histogramme, courbe de survie….)
• Fond
– quelle est l’information présentée?
• Interprétation
– que montre le tableau ou la figure, est-ce pertinent et
cohérent avec le texte ?

Staff SP 19/01/2011 67
 Discussion
• Objectif de l’étude atteint ou non =bref résumé des découvertes clé
• Critique de la qualité et validité des résultats:
– Estimation :
• précision (NSN)
• biais
– Comparaison:
• Non significatif
– Réalité?
– Biais?
– Puissance?
• Significatif
– Réalité?
– Biais de confusion?
• Comparaison avec la littérature
• Généralisation: discuter la validité externe et les implications du
travail pour la clinique et pour la recherche

Staff SP 19/01/2011 68
 Références bibliographiques
• Article = Références de Vancouver
• Dépend des recommandations aux auteurs des revues
• On ne cite tous les auteurs que si moins de 7 sinon les 6 premiers + et al

Staff SP 19/01/2011 69
Staff SP 19/01/2011 70
 Grilles de lecture
http://www.equator-network.org/resource-centre/library-of-health-research-reporting/
CONSORT Français : http://eb.medecine.univ-paris5.fr/ConsortVF

Grilles établies
par des
méthodologiques
pour
homogénéiser le
contenu des
articles
Scientifiques

STARD=
diagnostique

REMARK =
Staff SP 19/01/2011 pronostique
71
 STROBE

Staff SP 19/01/2011 72
http://www.equator-network.org/resource-centre/library-of-health-research-reporting/
 Références bibliographiques
• D. JOLLY. Lecture critique d’articles médicaux. 2005; Editions Masson.
• L.R. SALMI. Lecture critique et communication médicale scientifique, Comment lire,
présenter, rédiger et publier une étude clinique ou épidémiologique: 2002; Editions
scientifiques et médicales Elsevier.
• Altman DG, Schulz KF, Moher D, Egger M, Davidoff F, Elbourne D, Gotzsche PC,
Lang T; CONSORT GROUP (Consolidated Standards of Reporting Trials). The
revised CONSORT statement for reporting randomized trials: explanation and
elaboration. Ann Intern Med. 2001 Apr 17;134(8):663-94.
• Von Elm E, Altman DG, Egger M, Pocock SJ, Gøtzsche PC, Vandenbroucke JP;
STROBE Initiative. The Strengthening the Reporting of Observational Studies in
epidemiology (STROBE) statement: guidelines for reporting observational studies.
PLoS Med. 2007 Oct 16;4(10)
• Bossuyt PM, Reitsma JB, Bruns DE, et al. Towards complete and accurate reporting
of studies of diagnostic accuracy: The STARD Initiative. Ann Intern Med
2003;138:40-44.
• McShane LM, Altman DG, Sauerbrei W, et al. Reporting recommendations for tumor
marker prognostic studies (REMARK). J Natl Cancer Inst 2005;97:1180-1184.

Staff SP 19/01/2011 73
Comment s’en sortir avec l’anglais?

Staff SP 19/01/2011 74
Staff SP 19/01/2011 75