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BIOMOLECULE
L’extraction, la purification et l’analyse des biomolécules sont une discipline qui
connaissent à l’heure actuelle un essor et un regain d’intérêt dans les recherches
scientifiques, pour la simple raison, que la nature regorge de biomolécules qui
cohabitent depuis toujours dans une synergie et un équilibre minuté qui s’est opéré au
fil du temps, un équilibre résultant d’une alchimie entre les organismes vivants :
animaux , plantes et microorganismes. Ces biomolécules sont dotées d’activités
biologiques, qui sont souvent à l’origine de la survie et du bienfaits des organismes
vivants. Pour ne citer qu’une catégorie nous citerons les « Enzymes », qui sont des
composés appartenant à la famille des Protéines, tantôt modulateurs tantôt catalyseurs
ou encore inhibiteurs, ces biomolécules interviennent dans la quasi-totalité des réactions
biochimiques qui régissent les réactions du métabolisme et d’anabolisme, elles agissent
in-Situ et Ex-situ. La connaissance de leur action (effets) et leur mode opératoire,
permettra aux enzymes d’être utilisés dans diverses applications notamment le domaine
pharmaceutique, agro-alimentaire, cosmétologique.
- Indiquer le nom des constituants
minéraux* et organiques* du corps
humain
eau
7 NUTRIMENTS* :
eau, sels minéraux, protides, lipides, glucides, acides
nucléiques et vitamines
DEFINITION
En biochimie, une biomolécule, ou une molécule biologique, est une molécule des êtres
vivants. Les six éléments chimiques ou bioéléments les plus abondants dans les
organismes vivants sont le carbone, l'Hydrogène, l'Oxygène, l'azote, le phosphore et le
soufre, qui sont des biomolécules sous formes d’eau, de glucides, de lipides, de
protéines, d'acides nucléiques et de neurotransmetteurs. Ces six éléments
fondamentaux sont les principaux composants des biomolécules, le plus souvent des
macromoléculesnaturelles, parce qu’ils permettent la formation de liaisons covalentes
entre eux, le partage des électrons, en raison de leur faible différence d'électronégativité.
Ces liens sont de force à former des liaisons très stables est directement
proportionnelles à la masse des atomes ensembles; ils autorisent les atomes de carbone
à former un squelette tridimensionnel (-CCC-) pour former des composés avec des
nombres variables de; carbones ils permettent la formation de liaisons multiples
(doubles et triples) entre C et C, C et O, C et N. Les liaisons sont linéaires, ramifiées,
ramifiées, cycliques, hétérocycliques, etc.; ils offrent la possibilité que quelques
éléments d'une grande variété entrent dans des groupes fonctionnels (, cétones,
acidesalcools, aldéhydes, amines, acides aminés, etc.) avec des propriétés chimiques et
physiques différentes.
LES
BIOMOLECULES
L’EAU
L'eau (en latin aqua, qui a donné aquatique et en grec hydros, qui a
donné hydrique, hydrologie) est un élément sous forme liquide en
conditions standards (température et pression ambiante), composé
sous sa forme pure de molécules qui associent deux atomes
d'hydrogène et un atome d'oxygène sous la forme H2O
L’organisme humain comporte environ 70 % d’eau, le reste
étant de la matière sèche (fig. 2). La teneur en eau dépend de
l’âge (diminution avec le vieillissement et de l’importance du
tissu adipeux (plus il y en a, moins il y a d’eau) L’eau est
présente à l’intérieur et à l’extérieur des cellules.
.
- L’eau est une très petite molécule capable de franchir les
membranes biologiques.
- Les échanges d'eau sont régis par une loi physique :
l'osmose (du milieu hypotonique vers milieu hypertonique
jusqu'à égalité des concentrations).
- Elle joue également le rôle de solvant de la matière
vivante : dissout les biomolécules polaires (hydrophiles),
comme les minéraux, les glucides, et de nombreuses
protéines .
- permet ainsi la diffusion et le transport des substances
dissoutes dans l'organisme
Holosides
Grace à la liaison O-glycosidique entre un acétal formé
entre deux oses, on obtient la formation d’un disaccharide
(ou dioside) qui est un oligosaccharide formé de 2 oses ; d’un
trisaccharide (ou trioside) formé de 3 oses, ou encore
polysaccharide formé de plus de 10 oses. Leur hydrolyse
libère que des oses et on distingue parmi eux:
Disaccharides ou diholoside
Fructose 114
Glucose 69
Galactose 63
Maltose 46
Lactose 16
Ainsi, ses propriétés physico-chimiques, en particulier sa neutralité
électrochimique, son inertie chimique et sa grande solubilité en milieu
aqueux, en font un composé facilement exporté des feuilles où il est
produit vers les autres organes de la plante. Il constitue, en effet, de
loin, l’espèce moléculaire la plus abondante de la sève élaborée
transportée dans les cellules vivantes du phloème. Le Saccharose est le
seul diholoside non-réducteur qui revêt une importance industrielle (fig.)
2-Polysaccharides (Polyosides)
Ceux sont des polymères linéaires ou ramifiés, formés par la
condensation, avec élimination d’eau, d’un nombre élevé (de 10 à
plusieurs milliers) de molécules d’oses ou de dérivés liés généralement
par de liaisons glycosidiques entre le carbone C-1 (anomère) de l’un et
le carbone C-4 ou le carbone C-6 de l’autre molécule osidique. Deux
catégories d’hexosanes ont une grande importance dans la nature : les
amidons qui permettent aux plantes d’emmagasiner de l’énergie, ils
sont dit « glucides pariétaux » et la cellulose qui constitue le matériau
de base des parois cellulaire (pecto-cellulosiques, paroi secondaire)
ils sont dit « glucides pariétaux » de la majorité des végétaux. La
troisième catégorie de polysaccharides naturels est celle des
pentosanes renfermant les pentoses. Si ces oses sont des hexoses, le
polymère est appelé hexosane et si la condensation se fait entre des
pentoses (xylose, par exemple) ; on obtient des pentosanes.
:
L’Amidon et le glycogène
Les plus importants biopolymères polyosidiques qui permettent la mise en réserve
d’énergie sont l’amidon chez les végétaux et le glycogène chez les animaux où ils
apparaissent, au sein des cellules, sous la forme de gros granules. Le glycogène
(fig.) est particulièrement abondant dans les hépatocytes (10 % environ du poids
de l’organe) et les myocytes (1 à 2 % de la masse musculaire). L’amidon (fig.)
contient deux types de polymères du D-glucose : l’amylose et l’amylopectine. Dans
l’amylose, de longues chaînes non ramifiées sont constituées de résidus glucose
unis exclusivement par des liaisons (α1→4), comme dans le maltose; leur masse
moléculaire va de quelques milliers à plus d’un million. L’amylopectine est formée
de chaînes ramifiées où des résidus glucose sont unis par des liaisons (α1→4),
mais aussi par des liaisons (α1→6), (fig.) qui initient des ramifications tous les 20
à 30 résidus. La masse moléculaire de ces chaînes est très élevée ; elle peut
atteindre plus de 100 millions. Le glycogène, comme l’amylopectine, est un
polymère de résidus D-glucose avec des liaisons (α1→4), et des liaisons (α1→6) à
l’origine de ramifications, mais ces dernières y sont plus nombreuses, une tous les
8 à 12 résidus. Ici aussi, la masse moléculaire des chaînes est très grande. La
conformation des liaisons (α1→4) (Fig.) est à l’origine de la structure hélicoïdale
de l’amylose, de l’amylopectine et du glycogène (Fig.) ; cependant, la nature
ramifiée de l’amylopectine et du glycogène s’oppose la formation de longs
segments d’hélice.
Grain d'amidon
La Chitine
Présente dans l’exosquelette des Arthropodes (crustacés, insectes,
araignées, etc.). C’est un biopolymère non ramifié constitué de résidus
N-acétylglucosamine unis, exclusivement par des liaisons (β1→4) ;
elle forme aussi la paroi rigide des cellules des Mycètes
(champignons). Dans ce cas le polymère de glucoses aminés est lié à
un groupement NH2 et imprégné de CaCO3.
Les glycolipides constituent un groupe très hétérogène de glycoconjugués
définis par la liaison covalente de divers glycanes à différents groupes
prosthétiques lipidiques. Dans les organismes supérieurs, on en distingue
trois types principaux : les glycoglycérolipides, les glycosphingolipides et les
glycosyl-phosphoinositides. Ils sont essentiellement présents dans les
membranes des cellules eucaryotes où leurs têtes polaires constituées
d’oligosides plus ou moins complexes apparaissent au niveau de la surface
externe.
Les lipopolysaccharides (LPS)
sont des constituants de la
membrane externe des
bactéries gram négatives
(Figure 3.15). Ainsi, le LPS de
Salmonella typhimurium est
formé d’un lipide A, glycolipide
où six acides gras sont fixés
sur deux résidus glucosamine
dont l’un est lié à un oligoside
complexe. Ce dernier est lui-
même formé d’un oligoside basal
et d’une chaîne O-spécifique,
dont la composition chimique
varie d’une souche à l’autre.
Certains LPS sont toxiques pour
l’Homme et les animaux ; ils
peuvent alors être responsables
de leur mort,.
Les glucides sont des nutriments énergétiques de composition chimique
hétérogène. Ils sont généralement classés en fonction de leur degré de
polymérisation (DP) (Tableau ). On distingue les glucides digestibles et
les glucides non digestibles. *DP : degré de polymérisation.
2. Les acides aminés dans les protéines sont reliés entre eux
par une liaison peptidique,
CH3
Les acides aminés sont regroupés sur la base des :
Propriétés (polaires, et donc hydrophiles, non-polaires et
donc hydrophobes / chargés, et non- chargés)
3
sphyngosine
Influence de la saturation ou de l’insaturation sur la
consistance des corps gras
- un corps gras riche en AGS est solide (figé) à température
ambiante de 20°C ex : graisse de bœuf, beurre
- un corps gras riche en AGPI est fluide (liquide) à température
ambiante de 20°C ex : huile
Rôles des lipides
Rôle ENERGETIQUE : source la plus importante
d’énergie 1g de lipide équivaut à 38 kJ
HYDROSOLUBLES
LIPOSOLUBLES
K
Nature nom Source rôle si carence
alimentaire
sucre type
désoxyribose ribose
pentose
adénine (A), thymine (T), guanine adénine (A), thymine (U), uracile
base azotée
(G), cytosine (C) (U), cytosine (C)
SOURCE ALIMENTAIRE
EN CAS DE CARENCE
Légumes, fruits secs,
déshydratation viandes, poissons,
légumes, fruits frais
Sel de table,
charcuterie, fromage,
pain, conserve
ROLES
FIN…