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Examen cytobactriologique
des urines (E.C.B.U.)

Plan du chapitre
Contextes identifis
Objectifs impartis lE.C.B.U.
Circonstances anatomo-cliniques
Recueil et acheminement
Micro-organismes responsables
Conduite mthodologique
Interprtation
Antibiogramme
Conclusion

2.

Procder en toute circonstance au recueil

asep- tique des urines et garantir leur
acheminement correct vers le laboratoire.
Connatre les principales espces microbiennes
responsables dinfections du tractus urinaire
(ITU) afin de mieux les identifier.
Savoir raliser lECBU dans ses diffrentes
tapes.
Etre capable dinterprter les rsultats de
lECBU en toute circonstance.
Connatre les diffrents antibiotiques utilisables
dans l'ITU afin de composer le meilleur antibiogramme.

3.

4.
5.

13

Linfection du tractus urinaire (ITU) est une

des infections les plus frquentes. Cela explique
que
lECBU
soit
une
des
analyses
microbiologiques les plus demandes. Son
apparente simplicit dexcu- tion ne doit pas
faire oublier quil convient de res- pecter en toute
circonstance une mthodologie rigou- reuse.

6.

1 Contextes

Certaines circonstances influenant le recueil et/ou

les instructions techniques et/ou l'interprtation
des rsultats microbiologiques doivent tre
connues du biologiste. Elles apparaissent dans le
schma ci- aprs.

Les principales circonstances amenant le clinicien

demander un ECBU sont consignes dans le tableau
ci-dessous.
Circonstances amenant demander un ECBU
Symptomatologie urinaire :
Symptomatologie urinaire :
prsente
absente
Patente
Trompeuse
Dysurie
Protinurie
Pollakiurie
Hyperthermie isole
Pesanteur vsicale
Personne ge
Hmaturie macroscopique Diabtique
Evocatrice
Systmatique
Incontinence urinaire
Femme enceinte
Douleurs lombaires
Pr-opratoire
Hyperthermie associe
urologique ou
un autre signe
gyncologique
Leucocyturie et/ou
Contrle
NO3 rductase (bandelette) post-thrapeutique

LECBU nest pas obligatoire en cas de cystite

aigu de la femme de moins de 65 ans sans
antcdents, en dehors de la grossesse.

3 Diffrentes circonstances
anatomo-cliniques influenant
la conduite mthodologique

Circonstances influenant le recueil et/ou les

instructions techniques et/ou linterprtation
des rsultats microbiologiques

Circonstances de lECBU
1

Cas gnral habituel

2
Patient
sonde demeure
3 Nourrisson

6
Immunodprim
5

Urtrostomie
no-vessie 4
(Bricker)

Recherche de
mycobactries
Circonstances
particulires
7

4 Recueil des urines

et acheminement

2 Objectifs impartis lECBU

1- Cas gnral habituel

La ralisation correcte de lECBU ncessite de

rpondre aux six objectifs suivants :
1. Connatre les diffrentes circonstances anatomocliniques prsidant la ralisation dun ECBU
et influenant la conduite mthodologique.

(recueil dit " la vole" ou" du milieu de

jet")
Aprs lavage hyginique des mains et toilette
soi- gneuse au savon ou antiseptique doux de la
rgion vulvaire chez la femme et du mat chez

l'homme suivi d'un rinage :

14

2 Examen cytobactriologique des urines

(E.C.B.U.)

* Eliminer le 1er jet (20 ml) d'urines pour ne

recueillir dans un flacon strile que les 20 ml
suivants au minimum en prenant soin de ne pas
tou- cher le bord suprieur du rcipient.
* Fermer hermtiquement le flacon, l'identifier
trs prcisment et le porter immdiatement au
laboratoire accompagn de sa presciption et de
lheure de prlvement. En cas dempchement
le placer pour quelques heures + 4C ou
utili- ser un tube "borat".
2- Patient sond demeure

Plutt que de dcoupler sonde et collecteur si on

ne pratique pas le drainage vsical clos, il est
prfrable aprs clampage en aval, de ponctionner
avec une seringue ou un systme daspiration sous
vide direc- tement la chambre de prlvement
pralablement dsinfecte puis de transvaser dans
un flacon strile.
3- Le nourrisson

Chez le petit enfant on doit utiliser un collecteur st

- rile spcifique. Ce dispositif usage unique adapt
l'anatomie se pose aprs dsinfection soigneuse et
ne peut tre laiss en place plus d'une heure.
Pass ce dlai, si l'enfant n'a pas urin, le dispositif
est limin et remplac par un collecteur neuf.
Ds la miction termine le collecteur est enlev
et les urines sont transvases soigneusement
dans un flacon strile puis achemines
rapidement vers le laboratoire. Lurine peut
galement tre saisie la vole au moment du
change.

recherche de Mycoplasma ou de Chlamydia tra

- chomatis par biologie molculaire.
Prlvement parponction sus-pubienne
(geste spcialis)
Aprs dsinfection soigneuse des tguments,
ponctionner directement l'urine dans la vessie
l'aide d'une seringue monte.

Prlvement par cathtrisme

urtral
Il permet l'obtention d'urine provenant sparment du rein droit ou du rein gauche.
Aprs dsinfection de l'extrmit de la
sonde, on recueille quelques millilitres d'urine
en deman- dant au patient, pralablement en
decubitus lat- ral, de tousser plusieurs
reprises.
Exceptionnellement chez la femme, aprs
chec du recueil classique, on peut tre
amen un
sondage vsical vise diagnostique.

5 Micro-organismes responsables
dinfections du tractus urinaire
La connaissance des principales espces
micro- biennes responsables d'ITU savre un
argument dcisif afin de mieux les identifier. Leur
frquence relative se rvle fonction des
diverses circons- tances anatomocliniques
prcdemment dcrites :
Connatre les principales espces microbiennes
responsables dITU : frquence des espces
partir de 20 000 souches conscutives sur 4
ans en milieu hospitalier
C. al bi
cans

4- Urtrostomie (sans sonde)

Aprs nettoyage soigneux de la stomie on met

en place un collecteur strile et l'on procde
comme pour le nourrisson.
5- Immunodprim

cf cas gnral habituel

6- Recherche de mycobactries

Cet examen de seconde intention excut sur

pres- cription spcifique ultrieure au vu des
premiers rsultats doit tre effectue sur la totalit
de la pre- mire miction du matin aprs
restriction hydrique, trois jours de suite .
7- Circonstances particulires

Urines du premier jet (aprs ventuel

massage prostatique)
Intressant en cas de suspicion d'infection ur-

S. epi der mi di s
2%
K. pneumoni ae 4%
S. aur eus 4%

E. cloacae
K. oxytoca

2% 2%

2%

1%

1%
1%

M. mor ganii
C. di ver
sus
P. stuar tii
Autres
8%

P. aer ugi nosa

5%

E. faecal i
s
7%

P. mi r abi l
is
8%

E . coli
53%

trale ou prostatique, utilisable aussi pour la

1- Circonstances 1 et 3

2 Examen cytobactriologique des urines

(E.C.B.U.)

Majoritairement Entrobactries (surtout : Escheri

- chia coli, Proteus mirabilis)
Plus rarement Enterococcus faecalis et Staphylococ
- cus aureus ou Staphylococcus saprophyticus (chez
la femme jeune).
2- Circonstances 2, 4 et 5

Idem 1 et 3 avec une attention particulire pour :

Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii,

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LECBU dans ses diffrentes tapes

Schma synoptique de ralisation

Prlvement durines
Examen
cytologique

J0
Quantitatif
Leucocyturie
Pyurie

Examen
bactriologique
Qualitatif
germes

J1 2

J2 4

Burkholderia cepacia , Stenotrophomonas maltophi

- lia, Staphylococcus "coagulase ngative", Coryne
- bacterium urealyticum (ancien groupe D 2),
Candida spp (albicans et glabrata) ; plus rarement
: Oligella urethralis, Aerococcus urinae,
Lactobacillus spp.

6 Conduite mthodologique
La ralisation de l'ECBU comprend les
diff- rentes tapes indiques dans le schma cidessus.
1- Examen cytologique

Aspect quantitatif
A l'aide d'un dispositif numration type
cellule de Malassez de prfrence usage
unique on dnombre les diffrents lments
figurs conte- nus dans un volume donn de
l'urine tudier. Leur nombre est rapport au
ml. A l'tat physio - logique, l'urine contient
moins de 10 000 leuco- cytes et 5 000 hmaties
par ml.
En cas d'infection urinaire, le processus inflammatoire se traduit le plus souvent par la
prsence de :
- > 50.000 leucocytes /ml, parfois en amas ;
- > 10.000 hmaties /ml tmoins de
micro- hmorragies ;
- cellules du revtement urothlial.
Si la prsence de cylindres leucocytaires s'avre
importante prendre en compte, la notion d'alt
- ration des leucocytes n'amne pas
d'lment smiologique supplmentaire.
Aspect qualitatif

Ensemencement
Dilution / Anse calibre
Lame immerge
Dnombrement Observation
des cultures Diffrenciation
des colonies
Eventuellement identification(s)
Antibiogramme(s)

L'examen du frottis ralis partir du culot

de centrifugation et color au Gram peut
conforter

les donnes prcdentes, permet d'observer les

ventuels micro-organismes prsents et oriente
le choix des milieux de culture selon leur(s)
morphologie(s) et
leur(s) affinit(s)
tinctoriale(s).
La prsence de cellules pithliales dorigine
vaginale signe une contamination et entrane le
rejet de lexamen.
2- Mise en culture

Dnombrement des micro-organismes

L'valuation quantitative de la bactriurie peut
s'oprer par dilution des urines ou par technique
de l'anse calibre ou par mthode de la lame
immerge.
Ensemensement : choix des gloses
Le milieu de type C.L.E.D. se prte bien la
cul- ture des urines. Certains milieux incorporant
des chromognes directs peuvent s'avrer
utiles au reprage des colonies. Selon les
rsultats de l'ob- servation microscopique, on
ensemence une glose au sang voire une
glose chocolat sous
10% de CO 2.
Aprs 24 h d'incubation voire 48 h si besoin, la poursuite de l'analyse microbiologique dpend de l'interprtation cyto-bactriologique, des renseignements
cliniques et d'ventuels examens antrieurs.
3- Identification(s)

Pour l'identification la technique utiliser dcoule

de la morphologie des colonies complte si besoin
d'une coloration de Gram et de la recherche de
l'oxy- dase et de la catalase. Le nombre limit
d'espces

16

2 Examen cytobactriologique des urines

(E.C.B.U.)

microbiennes impliques simplifie le choix de la

galerie commerciale utiliser.

les rsultats d'ECBU prcdents,

les conditions de prlvement.
Tableau 2 : Interprtation "bactrio-clinique"

7 Interprtation
En thorie les combinaisons des trois paramtres :
bactriurie, pyurie et symptmes urinaires dlimitent
cinq entits nosologiques (Tableau 1).
Depuis les travaux de KASS (en pratique et de
prime abord) l'interprtation des cultures s'effectuait de la manire suivante :
- Bactriurie < 103 CFU / ml : absence
d'infection
- Bactriurie > 105 CFU / ml : infection probable
- Entre 103 et 104 CFU / ml : zone d'incertitude
(valeurs contrler si besoin)
Le tableau 2 prcise les valeurs de ces critres
purement
microbiologiques
en
fonction
des
circonstances anatomo-cliniques comme le propose
STAMM.
Ces critres (condition ncessaire mais pas
suffi- sante) doivent tre interprts dans chaque
cas en fonction
d'autres
paramtres
indispensables prendre en compte :
- les donnes de l'examen
direct
- le caractre mono- ou pluri-microbien des
cultures,
- les renseignements cliniques fournis,

Catgories

Critres
microbiologiques
Infection urinaire aigu
10 000 GB / ml
non complique de la femme 103 UFC / ml
uropathognes reconnus
Pylonphrite aigu simple
10 000 GB / ml
10 4 UFC / ml
uropathognes reconnus
ITU risque ou complique 10 000 GB / ml
dont celle de lhomme
105 UFC / ml
uropathognes reconnus
Bactriurie asymptomatique 10 000 GB / ml
(contrle sur 2 ECBU)
105 UFC / ml

Le tableau 3 prend en compte l'ensemble des

paramtres significatifs et pertinents ncessaires
une interprtation de qualit. En toutes
circonstances, au del de deux types de colonies
diffrentes, l'analyse n'est plus poursuivie. Une
description sommaire est transmise.
Toutefois, chez le greff rnal, des critres
moins restrictifs dinterprtation peuvent tre
appliqus.

Tableau 1 : Interprtation des rsultats de lECBU

Bactriurie
Pyurie
Symptmes
Traitement
Colonisation
+

Infection asymptomatique
+
+

+*
Infection symptomatique
+
+
+
+
Tableau
3
:
Attitude
pratique
Inflammation sans infection

Critres
Eventualits
Symptmes
sanssignificatifs
infection de Stamm

+ Suites

Bactriurie Types de colonie

Interprtation
Conduite
*Leucocyturie
dans certaines circonstances
Non
Non
0
ECBU strile
Normal
Oui
Non
0
Traitement antibiotique A refaire et
adapter Bactrie exigeante (B.K.) les
techniques Leucocytes gnitaux
Non
Oui
Une sorte
Infection dbutante
Identification et antibiogramme
Infection aplasique
ou contrler
Contamination
Oui
Oui
Une sorte
Infection typique
Identification et antibiogramme
Non
Non
>1
Souillure
Aucune
Oui
Non
2
Infection sur sonde ?
A contrler
Non
Oui
2
Souillure
Aucune
Oui
Oui
2
Infection polymicrob. ?
A refaire

8 Antibiogramme
La ralisation de l'antibiogramme dans le cadre de
l'ITU ne diffre pas techniquement des mthodes
tra- ditionnelles de mesure in vitro de sensibilit
aux antibiotiques qu'elles soient manuelles ou
automati- ses. Le choix des molcules tester
rsulte d'un compromis entre le spectre attendu de
sensibilit de la bactrie incrimine et la diffusion
de l'antibiotique au site de l'infection .

9 Conclusion
L'ECBU est un examen bien codifi dont les
deux temps critiques sont :
- Le prlvement trop souvent "victime" de son
apparente simplicit,
- L'interprtation microbiologique qui doit s'appuyer sur des arguments dcisionnels irrprochables.
Cette analyse peut bnficier en amont d'une
mthode de criblage rapide consistant rechercher
"au lit du malade" simultanment une bactriurie
(nitrate-rductase) et une leucocyturie (leucocyteestrase). Correctement effectu, le dpistage
par bandelettes a un bon pouvoir prdictif
ngatif. D'autres techniques recommandables
utilisent au laboratoire une dtection rapide de
croissance en milieu liquide.

Bibliographie
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