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27/03/2020

L1 BCST – SV102
Écologie

Introduction à l’écologie

Nicolas Delpierre

nicolas.delpierre@u-psud.fr
Bâtiment 362, RDC

Nicolas Delpierre, MdC

 Laboratoire Ecologie, Systématique, Evolution (ESE)


 Université Paris Sud, CNRS et AgroParisTech

 Cycles des éléments (carbone, eau, nutriments) dans les


forêts
 Impact des changements globaux
 Croissance des forêts
 Modélisation basée sur les processus

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Niveaux d’organisation du vivant

« Macroscope »

L'écologie
 Ecologie : des mots grecs « oikos", maison / habitat, et
"logos", discours / étude

 Ecologie : « science des interactions entre les organismes


et leur environnement [biotique et abiotique]»
(adapté de Haeckel, 1866).

 Les niveaux d’organisation et d’interaction


considérés sont multiples

Ernst Haeckel
(1834-1919)

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L'écologie
 Ecologie : des mots grecs « oikos", maison / habitat, et
"logos", discours / étude

 Ecologie : « étude des interactions qui déterminent la


distribution et l’abondance des organismes»
(Krebs, 1972).

 Les niveaux d’organisation et d’interaction


considérés sont multiples

Ernst Haeckel
(1834-1919)

Niveaux d’organisation et
disciplines scientifiques

Ecophysiologie
Génétique des populations
Dynamique des populations
Ecologie des communautés
Biologie de la conservation

Etude de la biodiversité
Etude des changements globaux

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Les précurseurs de l’écologie

Peinture rupestre, grotte Chauvet

Paleolithique supérieur
- 40 000 ans

Calendrier lunaire (?)

Les précurseurs de l’écologie

« Quant au laboureur […] qu’il jette les yeux sur la terre,


qu’il regarde le moment où les feuilles seront tombées,
c’est le temps approprié pour les semailles.
C’est ainsi que l’on connaît la température de l’année,
plus tôt dans un endroit et plus tard dans un autre,
suivant les terrains et les climats.

L’avantage de cette méthode, c’est qu’elle s’applique à


tout le globe, comme à chaque pays en particulier. »
Pline l’ancien
(23-72) Histoire naturelle, Pline l’ancien

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Les précurseurs de l’écologie

Carl von Linné A.von Humboldt Charles Darwin


1707-1778 1769-1859 1809-1882

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Des approches distinctes…


 Ecologie fonctionnelle :
Le fonctionnement de l’organisme ou de l’écosystème
est le sujet de l’étude. Par « fonctionnement » on entend
en particulier les flux de matière et d’énergie.

 Ecologie évolutive :
Les mécanismes de l’évolution sont utilisés pour
comprendre les différences observées entre espèces.

Des approches distinctes…


 Ecologie fonctionnelle :
Le fonctionnement de l’organisme ou de l’écosystème
Comment marche
est le sujet de l’étude. Par « fonctionnement » on entend
l’écosystème?
en particulier les flux de matière et d’énergie.

 Ecologie évolutive :
Les mécanismes de l’évolutionPourquoi
sont utilisés pour
la sélection
naturelle aentre
comprendre les différences observées aboutiespèces.
à cet
écosystème?

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…qui reflètent deux définitions du


vivant

Quelles sont les


caractéristiques du vivant ? ?

…qui reflètent deux définitions du


vivant

 Un organisme vivant est une structure qui n’est


pas en équilibre thermodynamique avec le milieu
 Notion fonctionnelle du vivant

 Un organisme vivant se reproduit. La


descendance avec modification permet
l’évolution de l’espèce.
 Notion évolutive du vivant

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Ecologie Quand dit-on qu’une portion de la matière est vivante?


fonctionnelle Quand elle ne cesse de « faire quelque chose », de se
mouvoir, d’échanger des matériaux avec le milieu
environnant […]

Quand un système non vivant est isolé […] tout


mouvement cesse en général assez vite en conséquence
de diverses espèces de frictions […] un état permanent
est atteint où l’on n’observe plus aucun évènement
[…c’est] l’état d’équilibre thermodynamique ou
« d’entropie maxima ».

Comment l’organisme vivant retarde-t-il [l’atteinte de cet


état] ?

Ed. originale 1944

Ecologie Quand dit-on qu’une portion de la matière est vivante?


fonctionnelle Quand elle ne cesse de « faire quelque chose », de se
mouvoir, d’échanger des matériaux avec le milieu
environnant […]

Quand un système non vivant est isolé […] tout


mouvement cesse en général assez vite en conséquence
de diverses espèces de frictions […] un état permanent
est atteint où l’on n’observe plus aucun évènement
[…c’est] l’état d’équilibre thermodynamique ou
« d’entropie maxima ».

Comment l’organisme vivant retarde-t-il [l’atteinte de cet


état] ? La réponse est évidente : en mangeant, buvant,
respirant et (dans le cas des plantes) assimilant. Le terme
technique est métabolisme. Le mot grec metaballein
signifie « changer » ou « échanger ».
Ed. originale 1944

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Éon et Gaïa entourés de quatre enfants, les saisons personnifiées

L’hypothèse Gaïa
 L'hypothèse Gaïa, initialement avancée par l'écologue
anglais James Lovelock en 1970, est que la Terre serait
« un système physiologique dynamique qui inclut la
biosphère et maintient notre planète depuis plus de trois
milliards d'années en harmonie avec la vie ».

J. Lovelock
1919-

Ecologie “It is not the strongest of the species that survives, nor
évolutive the most intelligent that survives. It is the one that is
most adaptable to change.” (citation attribuée à C.
Darwin)

L’écologie évolutive traite principalement de deux


aspects:

• Comment les interactions (entre les espèces et


entre les espèces et leur environnement)
influencent les espèces par les processus de
sélection et d’adaptation,

• … et quelles sont les conséquences (évolutives et


fonctionnelles) de ces changements.

Ed. originale 1859

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Écologie scientifique vs.


Écologie politique
 L’écologie est une science mais aussi une
composante politique.

 Bien que possédant une dénomination commune,


ces deux activités sont séparées.

 Des passerelles existent, mais elles se situent au


niveau individuel. Les écologues (scientifiques) ne
se revendiquent pas nécessairement écologistes
(politiques).

Écologie scientifique vs.


Écologie politique

Publié en Novembre 2017 dans la revue BioScience

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16 mars 2019
36 000 manifestants à Paris
350 000 manifestants en France
> 1 200 000 manifestants dans le monde

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Pourquoi étudier l'écologie?


 Pour comprendre comment les systèmes naturels
fonctionnent

 Pour comprendre quel est l'impact des activités


humaines sur le fonctionnement des écosystèmes

 Pour permettre de mettre en


place des pratiques écologiquement
raisonnables

Comment étudier l'écologie?


 A l'aide de la méthode scientifique

Confirmation
de
l’hypothèse
Expérience
contrôlée ou
Comparer
naturelle
Observations Question Hypothèse Prédictions prédictions
et données
Collecte de
données
Rejet de
l’hypothèse

Aristote -384 -322, Ibn Al Haytham 965 - 1039, Roger Bacon 1220-1294, René Descartes 1596 - 1650

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 A l'aide de la méthode scientifique

Une hypothèse ne peut jamais être prouvée car il n’y aura jamais assez de données
pour le faire.
À l’inverse, il suffit d’une seule observation pour rejeter une hypothèse!

Par exemple, l’hypothèse selon laquelle “toutes les roses sont rouges” ne peut pas être
prouvée, même en observant 1000 roses… mais elle peut être rejetée sur la base de
l’observation d’une seule rose jaune ou blanche…

(C’est l’idée d’asymétrie entre vérification et falsification proposée par Karl Popper, dans les années 1970).

Aristote -384 -322, Ibn Al Haytham 965 - 1039, Roger Bacon 1220-1294, René Descartes 1596 - 1650

 Dynamique des populations

Vito Volterra, 1925

En temps de guerre: moins de


pêche, plus de poissons herbivores;
cela induit une augmentation des
carnivores après la guerre. Confirmation
de
l’hypothèse
Expérience
contrôlée ou
Comparer
naturelle
Observations Question Hypothèse Prédictions prédictions
et données
Collecte de
données
Rejet de
Augmentation des populations l’hypothèse
de poissons carnivores en mer
Adriatique après WW1 Les effectifs de poissons carnivores
dépendent des effectifs de poissons
herbivores, et réciproquement
(modèle mathématique). Expérience naturelle : populations
de lynx et lièvres

Aristote -384 -322, Ibn Al Haytham 965 - 1039, Roger Bacon 1220-1294, René Descartes 1596 - 1650

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Le modèle prédit bien les comportements généraux (cyclicité des effectifs)


… par contre il n’est pas très précis pour une année donnée.

 Dynamique des populations

Vito Volterra, 1925

Comportements généraux

Confirmation
de
l’hypothèse
Expérience
contrôlée ou
Comparer
naturelle
Observations Question Hypothèse Prédictions prédictions
et données
Collecte de
données
Rejet de
l’hypothèse
Prédictions pour une année donnée

Le modèle de relation proies-prédateurs de Vito Volterra et Alfred Lotka est une des
bases de l’Ecologie… Pourtant il n’est pas parfait !

Aristote -384 -322, Ibn Al Haytham 965 - 1039, Roger Bacon 1220-1294, René Descartes 1596 - 1650

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Observations et descriptions
 L’écologue de terrain va consigner ses
observations dans des carnets…

Carnet de Théodore Monod (1902-2000)

… parfois des « carnets » numériques !

www.barbeau.u-psud.fr/

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 L’analyse de nombreuses observations standardisées


peut amener à la formulation d’hypothèses testables…
2005 2006 2007

2008 2009 2010

Source: J-Y Pontailler, D. Berveiller, CNRS


2011 2012 2013

 L’analyse de nombreuses observations standardisées


peut amener à la formulation d’hypothèses testables…

Châtaigner

Gobe-mouche noir

Walther et al. 2002

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 La difficulté majeure en écologie est de pouvoir tester les


hypothèses au moyen d’expériences !

2011
Question
La température influence-t-
elle l’apparition des
feuilles?
Printemps chaud
Hypothèse
Les températures chaudes
2012 hâtent le développement
des bourgeons

Prédiction Groupe 1: plantes placées à T froide,


Groupe 2: plantes placées à T chaude
Si le printemps est chaud,
les feuilles apparaissent
Printemps frais
plus tôt Expérimentation
Observations

Tests des hypothèses


 Expériences à différentes échelles

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Tests des hypothèses

Tests des hypothèses

« écotron »

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Tests des hypothèses


 Expériences naturelles
 Les expériences naturelles consistent à identifier un groupe
témoin différent d’un groupe test à la suite d'un choc exogène
imprévu ou naturel.

 Le groupe assimilé au groupe test est celui qui a été atteint par
le choc tandis que le groupe témoin n'a pas été atteint.

 Pour s'assurer de la similitude des groupes, on devrait les


comparer avant l'évènement et ainsi s'assurer qu'ils ont les
mêmes comportements.

Le 26 avril 1986 (Tchernobyl, Ukraine)

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Effet des radiations à Møller et al., 2013, Radiation Research


Tchernobyl

Frequency of Albinism 111 cases


N = 1669 albinism
Ecologie des Populations et des

Frequency of Tumors

25 cases
Communautés

tumors

Radiation (mSv/h)

Modélisation
 L’écologie est un domaine des sciences du vivant
utilisant abondamment la modélisation
 Permet de représenter la grande complexité des
systèmes étudiés
 Permet de fabriquer des réplicats alors que l’on ne
dispose que d’une Terre

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