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I Rouquette
Elles ont pour vocation de raliser les tests molculaires innovants pour lensemble des patients de la rgion, quel que soit ltablissement o ils sont pris en charge, CHU, CLCC, CH ou tablissement priv.
A Rangueil
2005 projet ligue: squenage de 100 patients acquisition dune expertise formation technicien Tenon
2007 demande dactivit nouvelle: acquisition dquipements et budget fonctionnement sur 2 ans pour commande ractifs 2009 : intgration plateforme biologie molculaire des cancers du CHU (E Delabesse) 2009 ORPAMIP: Structuration de la biologie molculaire.(Kras, EGFR, MSI, 1p19q). 2010: Subvention EGFR INCa: pas de facturation clinicien patient, remboursement dstockage 2011: subvention INCa biomarqueurs mergents
AUJOURDHUI
Une AMM premire ligne: gefitinib Une ATU: Crizotinib
Un seul examen aujourdhui indispensable pour guider la conduite thrapeutique: recherche des mutations activatrices dEGFR
GEFITINIB (IRESSA) is indicated for the treatment of adult patients with locally advanced or metastatic non small cell lung cancer (NSCLC) with activating mutations of EGFR.
3% 5% 3%
48%
Incidence of EGFR Exon 19 Deletions and L858R in Tumor Specimens From Men and Cigarette Smokers With Lung Adenocarcinomas
Indications
Financement INCa: Tous les patients atteints dun adnocarcinome du poumon devraient pouvoir avoir accs au test EGFR pour dterminer le statut mutationnel de leur tumeur.
Pathologiste de la plateforme
Nb patients 464 88
Nb examens 522 % mutations Dlai de rendu % Prescriptions secteur priv % Non interprtables 89 17,05 15 jours 37,5 2,27
115
149 12,17 15 jours 26,96 13,91
115
127 9,57 11 jours 45,22 6,96
147
157 11,56 9 jours 51,02 4,08
2010 422
% MUTES
23%
9,5 17%
7 11%
une altration molculaire peut tre identifie chez environ 40 % des patients atteints dun cancer du poumon non petites cellules.
20-30% 12-14%
5%
16
Translocation EML4-ALK
Activit de linhibiteur oral de ALK, le PF-02341066, dans une population de CBNPC positifs pour ALK (n = 82)
60 40 20 0 -20 -40 -60 -80 -100 -30 %
81
Progression
Stabilit Rponse partielle confirme Rponse complte confirme
20
FISH: examen de biologie molculaire: Problmes: Fixateur Echantillonnage Eosine Equipement spcifique Aide la lecture On nidentifie que la cassure dALK
Nb patients 180 30
Nb examens % Translocations Dlai de rendu % Prescriptions secteur priv % Non interprtables 30 20% 15 jours 20% 0%
64
62 6,4% 12 jours 20,3% 16,1%
27
24 4,2% 11 jours 14,8% 4,2%
Mutations de K-Ras
Exon 1
GGT Codon 12 Glycin GGC Codon 13 GCA
Codon 59
CCA Codon 61
Mutations activatrices en position 12,13 or 61 Mutuellement exclusives avec celles d EGFR Associes au tabac (transv. G en T ou C) 22% des ADC ( trs rares ds malpighiens) Mais chez 15% des non fumeurs (transition G en A)
BRAF
Marchetti et al J Clin Oncol 2011 1,046 NSCLCs BRAF mutations were present in 36 ADCs (4.9%) and one SCC (0.3%). Twenty-one of the mutations (56.8%) were V600E, and 16 (43.2%) were non-V600E. Paik et al J Clin Oncol 2011
BRAF mutations occur in 3% of patients with lung adenocarcinoma and occur more commonly in current and former smokers
BRAF mutations occur in approximately 5% of pulmonary adenocarcinomas, often with a papillary architecture, but in the micropapillary subgroup, the incidence rises to approximately 20%, similar to that seen in thyroid and ovarian papillary adenocarcinoma.
Rosane De Oliveira et al Micropapillary Lung AdenocarcinomaEGFR, K-ras, and BRAF Mutational Profile Am J Clin Pathol 2009
Shigematsu Cancer Res 2005; HER2 mutations were present in 1.6% (11 of 671) of NSCLC Pao Lancet Oncol 2011 HER2 mutations are present in 2% of NSCLC
PIK3CA
PIK3CA Mutations and Copy Number Gains in Human Lung Cancer Cancer Res 2008;68(17):691321] 1,6% de mutations. PIK3CA copy number gains occur at much higher frequencies in lung cancers than do activating mutations and the gains target squamous cell carcinomas.
Autres biomarqueurs
TECHNIQUE NB TOTAL + % MUT 2010 NB TOTAL + % MUT 2011
KRAS BRAF
HRM/SEQ PCR-ASO
HER2
PI3K (ICR)
HRM/SEQ
SEQ
201 20% -
Amliorations Techniques
EGFR: Passage techniques plus rapides et sensibles, redesign des amorces, sensibilisation fixateur: moins de prlvements non interprtables, dlais raccourcis FISH ALK: criblage IHC systmatique corrections osine acidit, contrle externalis des cas litigieux
Amliorations gestion
Interface cliniciens/plateforme: Mlanie Boussard Fiche modifie tlchargeable Dveloppements informatiques pour recueil de donnes et rendu rsultats (fiches complmentaires)
Tumeurs pulmonaires
PRESCRIPTION DE GENOTYPAGE
Numro INSC : Numro ONCOMIP :
Identification PATIENT Nom : . Nom de jeune fille : Prnom : .. Date de naissance : ././. Adresse : .
Identification A. PATHOLOGISTE REFERENT dtenteur du matriel tumoral (Nom et coordonnes dont tel et fax)
Identification du Patient
NOM : NOM DE JEUNE FILLE : PRENOM : DATE DE NAISSANCE : Homme Femme
/ 20.. Tabagisme :
Fumeur Non fumeur
Statut tabagique : Fumeur Non fumeur Nombre paquets/anne : Stade TNM : IIIB IV Indications (si autre) :
Autre :...
Biopsie bronchique Biopsie pulmonaire sous scanner Pice opratoire (lobectomie, pneumonectomie) Site mtastatique, prciser :
CADRE, A COMPLETER PAR LE PATHOLOGISTE, ACCOMPAGNEE : 1. Du prlvement tumoral (1 fragment de tumeur fixe et incluse en paraffine ou congele/ choisir un bloc riche en cellules tumorales). 2. Du compte-rendu anapath. ET A ENVOYER AU LABORATOIRE REALISANT LES GENOTYPAGES, A lADRESSE SUIVANTE :
Service dAnatomie Pathologique et Histologie Cytologie du Pr Delisle CHU Rangueil 1 avenue Jean-Poulhs TSA 50032 31059 TOULOUSE Cedex 9 Responsables : Dr Isabelle Rouquette, Mlanie Boussard tel Secrtariat 05 61 32 28 61 fax 05 61 32 21 27
Date du prlvement :
Remarques :
/ 20..
PAS DE FIXATION BOUIN, ni fixateur base dacide picrique. Eviter AFA. Matriel tumoral transmis:
FICHE complter par le mdecin prescripteur de lexamen et envoyer au mdecin pathologiste en possession du prlvement tumoral du patient.
Cette fiche sera secondairement envoye au laboratoire de gnotypage par le pathologiste avec le
NOM : ADRESSE :
Histologie :
Adnocarcinome Autre :
Epidermode/malpighien
Rangueil
Purpan
Formol
Glyoxal
RCL2
Autre
Date de rception au service dAnatomie Pathologique de Rangueil : .../.../.. Heure : Visa :..
Le rsultat du gnotypage sera renvoy au mdecin prescripteur et au mdecin anatomo-pathologiste. Version 23/11/2011
200
186 9,7% 5 jours 37,5% 1,6%
68
62 6,45% 5 jours 44,1% 0%
TRIM 2 113
TRIM 3 154
TRIM 4 174
FUMEUR
NON FUMEUR ANCIEN FUMEUR NON RENSEIGNE HOMME FEMME NON RENSEIGNE
14
14 9 65 53 50 3 TRIM 1
58
36 17 2 96 76 5 TRIM 2
54
37 20 43 83 63 10 TRIM 3
64
45 18 47 102 75 0 TRIM 4
ANNEE 2010
TOTAL FUMEUR NON FUMEUR ANCIEN FUMEUR NON RENSEIGNE HOMME FEMME NON RENSEIGNE
162 90 38 26 8 93 68 0
157 95 32 23 7 102 55 0
Aujourdhui
Un dossier enregistr le vendredi Rsultats exon 19/21/20 IHC ALK le mercredi Rsultats KRAS BRAF HER2 le vendredi Si demande PI3K transfert ICR si matriel restant
Dlais
Dlai de rendu des rsultats (en jours) TRIM 1 2010 2011 15 8 TRIM 2 15 5 TRIM 3 11 5 TRIM 4 9 5
Dlai dacheminement de la demande entre le prescripteur et le laboratoire de biologie molculaire (en jours)
TRIM 2 11 6
TRIM 3 11 7
TRIM 4 6 6
Augmentation du nombre de dossiers pour les diffrentes analyses depuis le dbut de lactivit
Reste amliorer
Dlai d acheminement Dlai de rponse (protinase K, DCC) volution continue des techniques Renseignements cliniques Projet IFCT de recueil des donnes
Le futur
ALK: algorithme IHC/FISH EGFR: place des anticorps? Marqueurs prdictifs de rponse (TS..): IHC